common/clitkDicomRT_ROI.h

   1 /*=========================================================================
   2   Program:         vv http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3   Main authors :   XX XX XX
   4
   5   Authors belongs to:
   6   - University of LYON           http://www.universite-lyon.fr/
   7   - Léon Bérard cancer center    http://www.centreleonberard.fr
   8   - CREATIS CNRS laboratory      http://www.creatis.insa-lyon.fr
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  11   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
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  13
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  15   - BSD       http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php
  16   - CeCILL-B  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
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  18   =========================================================================*/
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  20 #ifndef CLITKDICOMRT_ROI_H
  21 #define CLITKDICOMRT_ROI_H
  22
  23 #include "clitkDicomRT_Contour.h"
  24 #include "vvImage.h"
  25
  26 namespace clitk {
  27
  28 //--------------------------------------------------------------------
  29 class DicomRT_ROI : public itk::LightObject
  30 {
  31
  32 public:
  33   typedef DicomRT_ROI Self;
  34   typedef itk::SmartPointer<Self> Pointer;
  35   itkNewMacro(Self);
  36
  37   void Print(std::ostream & os = std::cout) const;
  38 #if GDCM_MAJOR_VERSION == 2
  39   void Read(std::map<int, std::string> & rois, gdcm::Item const & item);
  40 #else
  41   void Read(std::map<int, std::string> & rois, gdcm::SQItem * item);
  42 #endif
  43   void SetFromBinaryImage(vvImage * image, int n,
  44         std::string name,
  45         std::vector<double> color,
  46         std::string filename);
  47
  48   int GetROINumber() const;
  49   const std::string & GetName() const;
  50   const std::string & GetFilename() const;
  51   const std::vector<double> & GetDisplayColor() const;
  52   vtkPolyData * GetMesh();
  53   vvImage * GetImage() const;
  54
  55   void SetDisplayColor(double r, double v, double b);
  56   std::vector<double> & GetDisplayColor() { return mColor; }
  57
  58   double GetBackgroundValueLabelImage() const;
  59   void SetBackgroundValueLabelImage(double bg);
  60
  61   double GetForegroundValueLabelImage() const;
  62   void SetForegroundValueLabelImage(double bg);
  63
  64   void SetImage(vvImage * im);
  65   DicomRT_Contour* GetContour(int n);
  66
  67   double GetContourSpacing() const {return mZDelta;}
  68
  69 protected:
  70   void ComputeMesh();
  71   std::string mName;
  72   std::string mFilename;
  73   int mNumber;
  74   std::vector<double> mColor;
  75   std::vector<DicomRT_Contour::Pointer> mListOfContours;
  76   vtkSmartPointer<vtkPolyData> mMesh;
  77   bool mMeshIsUpToDate;
  78   vvImage::Pointer mImage;
  79   double mBackgroundValue;
  80   double mForegroundValue;
  81   ///Spacing between two contours
  82   double mZDelta;
  83
  84 private:
  85   DicomRT_ROI();
  86   ~DicomRT_ROI();
  87 };
  88 //--------------------------------------------------------------------
  89
  90 } // end namespace clitk
  91 #endif // CLITKDICOMRT_ROI_H
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