common/old/clitkIOCommon.txx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef CLITKIOCOMMON_TXX
  19 #define CLITKIOCOMMON_TXX
  20 /**
  21    =================================================
  22    * @file   clitkIOCommon.txx
  23    * @author David Sarrut <david.sarrut@creatis.insa-lyon.fr>
  24    * @date   04 Jul 2006 08:34:11
  25    *
  26    * @brief
  27    *
  28    *
  29    =================================================*/
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  31 //====================================================================
  32 // To short the code for reading an image
  33 template<typename ImageType>
  34 typename ImageType::Pointer readImage(const std::string & filename, const bool verbose) {
  35   typedef itk::ImageFileReader<ImageType> ReaderType;
  36   typename ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
  37   reader->SetFileName(filename.c_str());
  38   if (verbose) {
  39     std::cout << "Reading " << filename << " ..." << std::endl;
  40   }
  41   try {
  42     reader->Update();
  43   }
  44   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  45     std::cerr << "Error while reading " << filename
  46               << " " << err << std::endl;
  47     exit(0);
  48   }
  49   return reader->GetOutput();
  50 }
  51 //====================================================================
  52
  53 //====================================================================
  54 // To short the code for reading an image from several files
  55 template<typename ImageType>
  56 typename ImageType::Pointer readImage(const std::vector<std::string> & filenames,
  57                                       const bool verbose) {
  58   if (filenames.size() == 1) return readImage<ImageType>(filenames[0], verbose);
  59   typedef itk::ImageSeriesReader<ImageType> ReaderType;
  60   typename ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
  61   reader->SetFileNames(filenames);
  62   if (verbose) {
  63     std::cout << "Reading " << filenames[0] << " and others ..." << std::endl;
  64   }
  65   try {
  66     reader->Update();
  67   }
  68   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  69     std::cerr << "Error while reading " << filenames[0]
  70               << " or other files ..." << err << std::endl;
  71     exit(0);
  72   }
  73   return reader->GetOutput();
  74 }
  75 //====================================================================
  76
  77 //====================================================================
  78 // To short the code for writing an image
  79 template<typename ImageType>
  80 void writeImage(const typename ImageType::Pointer image,
  81                 const std::string & filename,
  82                 const bool verbose) {
  83   typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;
  84   typename WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
  85   writer->SetFileName(filename.c_str());
  86   writer->SetInput(image);
  87   if (verbose) {
  88     std::cout << "Writing " << filename << "." << std::endl;
  89   }
  90   try {
  91     writer->Update();
  92   }
  93   catch( itk::ExceptionObject & err ) {
  94     std::cerr << "Error while writing " << filename
  95               << ", the error is : " << err << std::endl;
  96     exit(0);
  97   }
  98 }
  99 //====================================================================
 100
 101 #endif /* end #define CLITKIOCOMMON_TXX */
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