tools/clitkFilter.ggo

   1 #File clitkFilter.ggo
   2 package "clitkFilter"
   3 version "1.0"
   4 purpose ""
   5
   6 option "config"         -       "Config file"                     string        no
   7 option "verbose"        v       "Verbose"                         flag          off
   8
   9 option "input"          i       "Input image filename"            string        yes
  10 option "output"         o       "Output image filename"           string        yes
  11 option "mask"                   m       "Mask in which the filter should be applied"    string          no
  12
  13 option "float"                  -       "Convert to float first "                  flag         off
  14
  15 section "Filter"
  16
  17 option "type"                   t       "Type of filter: 0=derivative, 1= gradient magnitude, 2= projection, 3= intensity windowing, 4=BSplineDownsampling with factor 2, 5=normalize intensities (mean=0 ,SD=1), 6=anisotropic diffusion, 7=gradient anisotropic diffusion, 8=curvature anisotropic diffusion, 9= curvature flow"        int           no      default="0"
  18 option "order"                  -       "0: what order"            int          no      default="1"
  19 option "direction"              -       "0-2: what direction"      int          no      default="0"
  20 option "projection"             -       "2: what accumulation (0=sum, 1=max, 2=min) "     int           no      default="0"
  21 option "inputMin"               -       "3: set window minimum"   float         no      default="0"
  22 option "inputMax"               -       "3: set window maximum"   float         no      default="100"
  23 option "outputMin"              -       "3: set output minimum"   float         no      default="0"
  24 option "outputMax"              -       "3: set output maximum"   float         no      default="255"
  25 option "resamplerType"          -       "4: Resampler type to use for the downsampling (0=Standard, 1=Centered, 2=L2, 3=L2Centered) "     int           no      default="0"
  26 option "splineOrder"            -       "4: SplineOrder to use for the downsampling (0-5, some resamplers only odd) "     int           no      default="3"
  27 option "cond"                   -       "6-8: conductance parameter"                    double no       default="3.0"
  28 option "time"                   -       "6-9: Time step (6,7: 0.25 for 2D and 0.125 for 3D; 8,9:0.125 for 2D and 0.0625 for 3D)"        double no       default="0.125"
  29 option "iter"                   -       "6-9: Iterations (6-8=5; 9=10)"                                 double no       default="5"
  30 option "radius"                 -       "9: radius"     double no       default="1"