tools/clitkRelativePositionAnalyzer.ggo

   1 #File clitkRelativePositionAnalyzer.ggo
   2 package "clitkRelativePositionAnalyzer"
   3 version "1.0"
   4 purpose "Analyze relative position of a target according to structures"
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   6 section "General options"
   7 option "config"         -       "Config file"                     string        no
   8 option "verbose"        v       "Verbose"                         flag          off
   9 option "imagetypes"     -       "Display allowed image types"     flag          off
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  11 section "Input/Output"
  12 option "support"        i       "Input mask support"      string        yes
  13 option "object"         j       "Input mask object"       string        yes
  14 option "target"         t       "Input mask target"       string        yes
  15 option "output"         o       "Output image "                         string yes
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  17 section "Options for building the relative positions"
  18 option "bins"           -       "Number of histo bins for fuzzy map"      int default="100" no
  19 option "tol"            -       "Target area loss tolerance (|0-1])"      double default="0.01" no
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  21 option "angle1"         a       "Angle 1 (deg)"                    double       no      default="0"
  22 option "angle2"         b       "Angle 2 (deg)"                    double       no      default="0"
  23 option "inverse"        n       "Not flag : inverse of the orientation"     flag   off
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  26 section "Compute some statistic on afdb"
  27 option "afdb"           -       "Input Anatomical Feature DB"           string no multiple
  28 option "afdb_path"      -       "Path to search image in afdb"          string no multiple
  29 option "station"        -       "Station name"                          string no
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