tools/clitkSignalMeanPositionFilter.h

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   3   Program:   clitk
   4   Module:    $RCSfile: clitkSignalMeanPositionFilter.h,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2010/02/10 14:55:00 $
   7   Version:   $Revision: 1.4 $
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  17 =========================================================================*/
  18
  19 #ifndef CLITKSIGNALMEANPOSITIONFILTER_H
  20 #define CLITKSIGNALMEANPOSITIONFILTER_H
  21
  22 #include "clitkSignalMeanPositionTracking_ggo.h"
  23 #include "clitkSignal.h"
  24 #include "clitkEllipse.h"
  25 #include "itkVector.h"
  26 #include <math.h>
  27
  28 namespace clitk {
  29
  30   //---------------------------------------------------------------------
  31   class SignalMeanPositionFilter {
  32   public:
  33     typedef itk::Vector<double,2> Vector2d;
  34
  35     void SetParameters(args_info_clitkSignalMeanPositionTracking & args_info);
  36     void Update();
  37
  38   protected:
  39     args_info_clitkSignalMeanPositionTracking args_info;
  40     clitk::Signal mInput;
  41     clitk::Signal mAugmentedInputX;
  42     clitk::Signal mAugmentedInputY;
  43     int mAugmentationDelay;
  44     int mMaxIteration;
  45     double mEta;
  46     bool mEtaIsSet;
  47     bool mOutputFilenameIsSet;
  48     bool mOutputResidualFilenameIsSet;
  49     bool mOutputAugmentedFilenameIsSet;
  50     std::string mOutputFilename;
  51     std::string mOutputResidualFilename;
  52     std::string mOutputAugmentedFilename;
  53     bool mVerbose;
  54     bool mVerboseIteration;
  55     bool mIsAdaptiveMethod;
  56     std::vector<double> mCurrentResidual;
  57     int mWindowLength;
  58     std::vector<clitk::Ellipse*> mListOfEllipses;
  59
  60     bool mValidationWithRealPhase;
  61     std::string mInputPhaseFilename;
  62     clitk::Signal mInputPhase;
  63     std::vector<int> mCycles;
  64
  65     std::vector<int> mIsoPhaseIndex;
  66     std::vector<double> mIsoPhaseDelta;
  67     std::vector<int> mIsoPhaseDeltaNb;
  68     std::vector<double> mIsoPhaseRefAngle;
  69
  70     bool mUseLearnedDeltaPhase;
  71     clitk::Signal mLearnIsoPhaseDelta;
  72     int mNumberOfIsoPhase;
  73
  74     void FitEllipse(clitk::Ellipse & An);
  75     void AdaptiveFitEllipse(clitk::Ellipse & An);
  76
  77     void ComputeIsoPhase(std::vector<clitk::Ellipse*> & l,
  78                          std::vector<double> & phase,
  79                          std::vector<int> & cycles);
  80   };
  81   //---------------------------------------------------------------------
  82
  83 } // end namespace
  84
  85 #endif