vv/vvQDicomSeriesSelector.cxx

   1 /*=========================================================================
   2   Program:   vv                     http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv
   3
   4   Authors belong to:
   5   - University of LYON              http://www.universite-lyon.fr/
   6   - Léon Bérard cancer center       http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
   7   - CREATIS CNRS laboratory         http://www.creatis.insa-lyon.fr
   8
   9   This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  10   the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  11   PURPOSE.  See the copyright notices for more information.
  12
  13   It is distributed under dual licence
  14
  15   - BSD        See included LICENSE.txt file
  16   - CeCILL-B   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  17 ======================================================================-====*/
  18 #ifndef VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  19 #define VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  20 #include <itkGDCMImageIO.h>
  21 #include <itkGDCMSeriesFileNames.h>
  22 #include <gdcmFile.h>
  23 #include <gdcmDocEntry.h>
  24
  25 #include "vvQDicomSeriesSelector.h"
  26 //#include "vvUserConfig.h"
  27
  28 //====================================================================
  29 vvDicomSeriesSelector::vvDicomSeriesSelector(QWidget* parent)
  30         :QDialog(parent) {
  31     // Set GUI
  32     ui.setupUi(this);
  33     // Correct GUI for splitter ...
  34     //   QSplitter * splitter = new QSplitter(this);
  35     //   splitter->setOrientation(Qt::Horizontal);
  36     //   ui.gridLayout1->addWidget(splitter, 0, 0, 1, 1);
  37     //   ui.mFrameLeft->setParent(splitter);
  38     //   ui.mFrameRight->setParent(splitter);
  39     //  ui.toolBox->setCurrentIndex(0);
  40
  41
  42
  43     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(false);
  44
  45     connect(ui.mBrowseButton, SIGNAL(released()),
  46             this, SLOT(BrowseButtonRelease()));
  47     connect(ui.mSearchButton, SIGNAL(released()),
  48             this, SLOT(SearchButtonRelease()));
  49     connect(ui.mListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  50             this, SLOT(itemSelectionChanged()));
  51     connect(ui.mDicomDetailsListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  52             this, SLOT(itemDetailsSelectionChanged()));
  53
  54     // Initialization
  55     /*  if (config::get_current_path() != QString(0))
  56       mFoldername = config::get_current_path();
  57       else*/
  58     mFoldername = QFileInfo("./").absolutePath();
  59
  60     mPreviousPath = mFoldername;
  61     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  62     //  ui.mTableWidget->setRowCount(0);
  63 }
  64 //====================================================================
  65
  66 //====================================================================
  67 void vvDicomSeriesSelector::show() {
  68     QDialog::show();
  69     //grabKeyboard();
  70     // ui.mListWidget->grabKeyboard();
  71     //  ui.mDicomDetailsListWidget->grabKeyboard();
  72 }
  73 //====================================================================
  74
  75 //====================================================================
  76 void vvDicomSeriesSelector::close() {
  77     QDialog::close();
  78     // ui.mListWidget->releaseKeyboard()
  79     //releaseKeyboard();
  80 }
  81 //====================================================================
  82
  83 //====================================================================
  84 void vvDicomSeriesSelector::BrowseButtonRelease() {
  85     QFileDialog dialog(this);
  86     dialog.setFileMode(QFileDialog::AnyFile);
  87     dialog.setFilter("DICOM files (*.dcm); All files (*)");
  88     mFoldername = dialog.getExistingDirectory(this,
  89                   "Select a folder to find DICOM image",
  90                   mPreviousPath);
  91     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  92     mPreviousPath = QFileInfo(mFoldername).absolutePath();
  93     //  config::set_current_path(mPreviousPath);
  94 }
  95 //====================================================================
  96
  97 //====================================================================
  98 void vvDicomSeriesSelector::SearchButtonRelease() {
  99     typedef itk::GDCMSeriesFileNames NamesGeneratorType;
 100     NamesGeneratorType::Pointer nameGenerator = NamesGeneratorType::New();
 101     nameGenerator->SetUseSeriesDetails(true);
 102     //nameGenerator->SetDirectory(mFoldername.toStdString());
 103     nameGenerator->SetRecursive(ui.mIsRecursiveCheckBox->checkState() == Qt::Checked);
 104
 105     //ds gérer recursive moi-meme pour progress ...
 106     nameGenerator->SetInputDirectory(mFoldername.toStdString());
 107
 108     // insert in table
 109     typedef std::vector<std::string> SeriesIdContainer;
 110     const SeriesIdContainer & seriesUID = nameGenerator->GetSeriesUIDs();
 111
 112     for (unsigned int i=0; i<seriesUID.size(); i++) {
 113         // std::cout << seriesUID[i] << std::endl; //ds verif existe pas déja
 114
 115         if (mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]]) {
 116             std::cout << seriesUID[i] << " exist" << std::endl;
 117         }
 118         else {
 119             // store filenames
 120             std::vector<std::string> * filenames = new std::vector<std::string>;
 121             const std::vector<std::string> & temp = nameGenerator->GetFileNames(seriesUID[i]);
 122             for (unsigned int j=0; j<temp.size(); j++) {
 123                 filenames->push_back(temp[j]);
 124             }
 125             mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]] = filenames;
 126
 127             // store first header
 128             gdcm::File *header = new gdcm::File();
 129             header->SetFileName((*filenames)[0]);
 130             header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 131             header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 132             header->Load();
 133
 134
 135             //
 136             DD(header->GetEntryValue(0x0028,0x0030).c_str());
 137
 138             //DS TEST DAVID
 139             DD(header->GetXSize());
 140             DD(header->GetYSize());
 141             DD(header->GetZSize());
 142             DD(header->GetXSpacing());
 143             DD(header->GetYSpacing());
 144             DD(header->GetZSpacing());
 145             DD(header->GetXOrigin());
 146             DD(header->GetYOrigin());
 147             DD(header->GetZOrigin());
 148             DD("\n");
 149             /*
 150               QString size = QString("%1x%2x%3")
 151               .arg(header->GetXSize())
 152               .arg(header->GetYSize())
 153               .arg(header->GetZSize());
 154               QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 155               .arg(header->GetXSpacing())
 156               .arg(header->GetYSpacing())
 157               .arg(header->GetZSpacing());
 158               QString origin = QString("%1x%2x%3")
 159               .arg(header->GetXOrigin())
 160               .arg(header->GetYOrigin())
 161               .arg(header->GetZOrigin());
 162             */
 163
 164
 165             mDicomHeader[seriesUID[i]] = header;
 166
 167             // new item
 168             QListWidgetItem *newItem = new QListWidgetItem;
 169             newItem->setText(seriesUID[i].c_str());
 170             ui.mListWidget->insertItem(i, newItem);
 171
 172             //AddSerieToTheTable(i, *filenames);
 173         }
 174     }
 175 }
 176 //====================================================================
 177
 178 //====================================================================
 179 void vvDicomSeriesSelector::itemSelectionChanged() {
 180     //  mLabelSelected.setText(
 181     mCurrentSerie = ui.mListWidget->selectedItems()[0]->text().toStdString();
 182     mFilenames = mListOfSeriesFilenames[mCurrentSerie];
 183     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(true);
 184
 185     if (mDicomInfo[mCurrentSerie] == "") {
 186         //      QString m;
 187         //      m = QString("Patient : <font color=\"blue\">%1</font><br>").arg(mDicomHeader[s]->GetEntryValue(0x0010,0x0010).c_str()); // Patient's name
 188         mDicomInfo[mCurrentSerie] = MakeDicomInfo(mCurrentSerie, mDicomHeader[mCurrentSerie]);
 189     }
 190     ui.mDicomInfoPanel->setText(mDicomInfo[mCurrentSerie]);
 191
 192     // Detail tab
 193     ui.mDicomDetailsListWidget->clear();
 194     for (unsigned int i=0; i<mFilenames->size(); i++) {
 195         QListWidgetItem * newItem = new QListWidgetItem;
 196         newItem->setText(QFileInfo((*mFilenames)[i].c_str()).fileName());
 197         ui.mDicomDetailsListWidget->insertItem(i, newItem);
 198     }
 199
 200 }
 201 //====================================================================
 202
 203 //====================================================================
 204 void vvDicomSeriesSelector::itemDetailsSelectionChanged() {
 205     unsigned int i = ui.mDicomDetailsListWidget->currentRow();
 206     if (i<mFilenames->size()) {
 207         if (mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] == "") {
 208             std::ostringstream s;
 209             mDicomHeader[mCurrentSerie]->Print(s);
 210
 211             QString l;
 212             gdcm::File * header = mDicomHeader[mCurrentSerie];
 213             gdcm::DocEntry * e = header->GetFirstEntry();
 214             while (e) {
 215                 if (e->GetName() != "gdcm::Unknown") {
 216                     l += QString("%1 : %2\n")
 217                          .arg(e->GetName().c_str())
 218                          .arg((header->GetEntryValue(e->GetGroup(), e->GetElement())).c_str());
 219                 }
 220                 e = header->GetNextEntry();
 221             }
 222
 223             mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] = l.toStdString();
 224         }
 225         ui.mDicomDetailsLabel->setText(mDicomDetails[(*mFilenames)[i]].c_str());
 226     }
 227 }
 228 //====================================================================
 229
 230 //====================================================================
 231 QString vvDicomSeriesSelector::MakeDicomInfo(std::string & s, gdcm::File *header) {
 232     QString n = QString("%1").arg(mListOfSeriesFilenames[s]->size());
 233     QString size = QString("%1x%2x%3")
 234                    .arg(header->GetXSize())
 235                    .arg(header->GetYSize())
 236                    .arg(header->GetZSize());
 237     QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 238                       .arg(header->GetXSpacing())
 239                       .arg(header->GetYSpacing())
 240                       .arg(header->GetZSpacing());
 241     QString origin = QString("%1x%2x%3")
 242                      .arg(header->GetXOrigin())
 243                      .arg(header->GetYOrigin())
 244                      .arg(header->GetZOrigin());
 245     QString ss =
 246         //AddInfo(        "Serie ID   : ", s)+
 247         AddInfo(header, "Patient : ", 0x0010,0x0010)+
 248         AddInfo(        "Folder : ", QFileInfo((*mFilenames)[0].c_str()).canonicalPath().toStdString())+
 249         AddInfo(header, "Series Description : ", 0x0008,0x103e)+
 250         AddInfo(header, "Modality : ", 0x0008,0x0060)+
 251         AddInfo(header, "# images : ", 0x0020,0x0013)+
 252         AddInfo(        "# files : ", n.toStdString())+
 253         AddInfo(        "Size : ", size.toStdString())+
 254         AddInfo(        "Spacing : ", spacing.toStdString())+
 255         AddInfo(        "Origin : ", origin.toStdString())+
 256         AddInfo(header, "Pixel size : ", 0x0028,0x0100)+
 257         AddInfo(        "Pixel type : ", header->GetPixelType());
 258     return ss;
 259 }
 260 //====================================================================
 261
 262 //====================================================================
 263 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(gdcm::File *header, QString n, uint16_t group, uint16_t elem) {
 264     return AddInfo(n.toStdString(), header->GetEntryValue(group, elem));
 265 }
 266 //====================================================================
 267
 268 //====================================================================
 269 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(std::string n, std::string m) {
 270     QString s = QString("%1 <font color=\"blue\">%2</font><br>").
 271                 arg(n.c_str()).arg(m.c_str());
 272     return s;
 273 }
 274 //====================================================================
 275
 276 //====================================================================
 277 void vvDicomSeriesSelector::AddSerieToTheTable(int i, std::vector<std::string> & filenames) {
 278     gdcm::File *header = new gdcm::File();
 279     header->SetFileName(filenames[0]);
 280     header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 281     header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 282     header->Load();
 283     //header->Print(cout);
 284     // ->GetValEntry
 285     //  mDicomHeader[] = header;
 286
 287     /*
 288
 289     QTableWidgetItem *newItem = new
 290     QTableWidgetItem(QString("# images = %1").arg(header->GetImageNumber()));
 291     //  newItem->setCheckState(Qt::Checked);
 292     //newItem->setFlags(!Qt::ItemIsEditable);
 293     DD(ui.mTableWidget->rowCount());
 294     ui.mTableWidget->setItem(i, 0, newItem);
 295     */
 296 }
 297 //====================================================================
 298
 299 #endif // VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX