vv/vvQDicomSeriesSelector.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3 Program:   vv
   4 Module:    $RCSfile: vvQDicomSeriesSelector.cxx,v $
   5 Language:  C++
   6 Date:      $Date: 2010/01/06 13:31:57 $
   7 Version:   $Revision: 1.1 $
   8 Author :   Pierre Seroul (pierre.seroul@gmail.com)
   9
  10 Copyright (C) 2008
  11 Léon Bérard cancer center http://oncora1.lyon.fnclcc.fr
  12 CREATIS-LRMN http://www.creatis.insa-lyon.fr
  13
  14 This program is free software: you can redistribute it and/or modify
  15 it under the terms of the GNU General Public License as published by
  16 the Free Software Foundation, version 3 of the License.
  17
  18 This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 GNU General Public License for more details.
  22
  23 You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 along with this program.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  25
  26 =========================================================================*/
  27 #ifndef VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  28 #define VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX
  29
  30 // itk include
  31 #include <itkGDCMImageIO.h>
  32 #include <itkGDCMSeriesFileNames.h>
  33 #include <gdcmFile.h>
  34 #include <gdcmDocEntry.h>
  35
  36 #include "vvQDicomSeriesSelector.h"
  37 //#include "vvUserConfig.h"
  38
  39 //====================================================================
  40 vvDicomSeriesSelector::vvDicomSeriesSelector(QWidget* parent)
  41         :QDialog(parent) {
  42     // Set GUI
  43     ui.setupUi(this);
  44     // Correct GUI for splitter ...
  45     //   QSplitter * splitter = new QSplitter(this);
  46     //   splitter->setOrientation(Qt::Horizontal);
  47     //   ui.gridLayout1->addWidget(splitter, 0, 0, 1, 1);
  48     //   ui.mFrameLeft->setParent(splitter);
  49     //   ui.mFrameRight->setParent(splitter);
  50     //  ui.toolBox->setCurrentIndex(0);
  51
  52
  53
  54     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(false);
  55
  56     connect(ui.mBrowseButton, SIGNAL(released()),
  57             this, SLOT(BrowseButtonRelease()));
  58     connect(ui.mSearchButton, SIGNAL(released()),
  59             this, SLOT(SearchButtonRelease()));
  60     connect(ui.mListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  61             this, SLOT(itemSelectionChanged()));
  62     connect(ui.mDicomDetailsListWidget, SIGNAL(itemSelectionChanged()),
  63             this, SLOT(itemDetailsSelectionChanged()));
  64
  65     // Initialization
  66     /*  if (config::get_current_path() != QString(0))
  67       mFoldername = config::get_current_path();
  68       else*/
  69     mFoldername = QFileInfo("./").absolutePath();
  70
  71     mPreviousPath = mFoldername;
  72     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
  73     //  ui.mTableWidget->setRowCount(0);
  74 }
  75 //====================================================================
  76
  77 //====================================================================
  78 void vvDicomSeriesSelector::show() {
  79     QDialog::show();
  80     //grabKeyboard();
  81     // ui.mListWidget->grabKeyboard();
  82     //  ui.mDicomDetailsListWidget->grabKeyboard();
  83 }
  84 //====================================================================
  85
  86 //====================================================================
  87 void vvDicomSeriesSelector::close() {
  88     QDialog::close();
  89     // ui.mListWidget->releaseKeyboard()
  90     //releaseKeyboard();
  91 }
  92 //====================================================================
  93
  94 //====================================================================
  95 void vvDicomSeriesSelector::BrowseButtonRelease() {
  96     QFileDialog dialog(this);
  97     dialog.setFileMode(QFileDialog::AnyFile);
  98     dialog.setFilter("DICOM files (*.dcm); All files (*)");
  99     mFoldername = dialog.getExistingDirectory(this,
 100                   "Select a folder to find DICOM image",
 101                   mPreviousPath);
 102     ui.mFolderLineEdit->setText(mFoldername);
 103     mPreviousPath = QFileInfo(mFoldername).absolutePath();
 104     //  config::set_current_path(mPreviousPath);
 105 }
 106 //====================================================================
 107
 108 //====================================================================
 109 void vvDicomSeriesSelector::SearchButtonRelease() {
 110     typedef itk::GDCMSeriesFileNames NamesGeneratorType;
 111     NamesGeneratorType::Pointer nameGenerator = NamesGeneratorType::New();
 112     nameGenerator->SetUseSeriesDetails(true);
 113     //nameGenerator->SetDirectory(mFoldername.toStdString());
 114     nameGenerator->SetRecursive(ui.mIsRecursiveCheckBox->checkState() == Qt::Checked);
 115
 116     //ds gérer recursive moi-meme pour progress ...
 117     nameGenerator->SetInputDirectory(mFoldername.toStdString());
 118
 119     // insert in table
 120     typedef std::vector<std::string> SeriesIdContainer;
 121     const SeriesIdContainer & seriesUID = nameGenerator->GetSeriesUIDs();
 122
 123     for (unsigned int i=0; i<seriesUID.size(); i++) {
 124         // std::cout << seriesUID[i] << std::endl; //ds verif existe pas déja
 125
 126         if (mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]]) {
 127             std::cout << seriesUID[i] << " exist" << std::endl;
 128         }
 129         else {
 130             // store filenames
 131             std::vector<std::string> * filenames = new std::vector<std::string>;
 132             const std::vector<std::string> & temp = nameGenerator->GetFileNames(seriesUID[i]);
 133             for (unsigned int j=0; j<temp.size(); j++) {
 134                 filenames->push_back(temp[j]);
 135             }
 136             mListOfSeriesFilenames[seriesUID[i]] = filenames;
 137
 138             // store first header
 139             gdcm::File *header = new gdcm::File();
 140             header->SetFileName((*filenames)[0]);
 141             header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 142             header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 143             header->Load();
 144
 145
 146             //
 147             DD(header->GetEntryValue(0x0028,0x0030).c_str());
 148
 149             //DS TEST DAVID
 150             DD(header->GetXSize());
 151             DD(header->GetYSize());
 152             DD(header->GetZSize());
 153             DD(header->GetXSpacing());
 154             DD(header->GetYSpacing());
 155             DD(header->GetZSpacing());
 156             DD(header->GetXOrigin());
 157             DD(header->GetYOrigin());
 158             DD(header->GetZOrigin());
 159             DD("\n");
 160             /*
 161               QString size = QString("%1x%2x%3")
 162               .arg(header->GetXSize())
 163               .arg(header->GetYSize())
 164               .arg(header->GetZSize());
 165               QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 166               .arg(header->GetXSpacing())
 167               .arg(header->GetYSpacing())
 168               .arg(header->GetZSpacing());
 169               QString origin = QString("%1x%2x%3")
 170               .arg(header->GetXOrigin())
 171               .arg(header->GetYOrigin())
 172               .arg(header->GetZOrigin());
 173             */
 174
 175
 176             mDicomHeader[seriesUID[i]] = header;
 177
 178             // new item
 179             QListWidgetItem *newItem = new QListWidgetItem;
 180             newItem->setText(seriesUID[i].c_str());
 181             ui.mListWidget->insertItem(i, newItem);
 182
 183             //AddSerieToTheTable(i, *filenames);
 184         }
 185     }
 186 }
 187 //====================================================================
 188
 189 //====================================================================
 190 void vvDicomSeriesSelector::itemSelectionChanged() {
 191     //  mLabelSelected.setText(
 192     mCurrentSerie = ui.mListWidget->selectedItems()[0]->text().toStdString();
 193     mFilenames = mListOfSeriesFilenames[mCurrentSerie];
 194     ui.mButtonBox->button(QDialogButtonBox::Open)->setEnabled(true);
 195
 196     if (mDicomInfo[mCurrentSerie] == "") {
 197         //      QString m;
 198         //      m = QString("Patient : <font color=\"blue\">%1</font><br>").arg(mDicomHeader[s]->GetEntryValue(0x0010,0x0010).c_str()); // Patient's name
 199         mDicomInfo[mCurrentSerie] = MakeDicomInfo(mCurrentSerie, mDicomHeader[mCurrentSerie]);
 200     }
 201     ui.mDicomInfoPanel->setText(mDicomInfo[mCurrentSerie]);
 202
 203     // Detail tab
 204     ui.mDicomDetailsListWidget->clear();
 205     for (unsigned int i=0; i<mFilenames->size(); i++) {
 206         QListWidgetItem * newItem = new QListWidgetItem;
 207         newItem->setText(QFileInfo((*mFilenames)[i].c_str()).fileName());
 208         ui.mDicomDetailsListWidget->insertItem(i, newItem);
 209     }
 210
 211 }
 212 //====================================================================
 213
 214 //====================================================================
 215 void vvDicomSeriesSelector::itemDetailsSelectionChanged() {
 216     unsigned int i = ui.mDicomDetailsListWidget->currentRow();
 217     if (i<mFilenames->size()) {
 218         if (mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] == "") {
 219             std::ostringstream s;
 220             mDicomHeader[mCurrentSerie]->Print(s);
 221
 222             QString l;
 223             gdcm::File * header = mDicomHeader[mCurrentSerie];
 224             gdcm::DocEntry * e = header->GetFirstEntry();
 225             while (e) {
 226                 if (e->GetName() != "gdcm::Unknown") {
 227                     l += QString("%1 : %2\n")
 228                          .arg(e->GetName().c_str())
 229                          .arg((header->GetEntryValue(e->GetGroup(), e->GetElement())).c_str());
 230                 }
 231                 e = header->GetNextEntry();
 232             }
 233
 234             mDicomDetails[(*mFilenames)[i]] = l.toStdString();
 235         }
 236         ui.mDicomDetailsLabel->setText(mDicomDetails[(*mFilenames)[i]].c_str());
 237     }
 238 }
 239 //====================================================================
 240
 241 //====================================================================
 242 QString vvDicomSeriesSelector::MakeDicomInfo(std::string & s, gdcm::File *header) {
 243     QString n = QString("%1").arg(mListOfSeriesFilenames[s]->size());
 244     QString size = QString("%1x%2x%3")
 245                    .arg(header->GetXSize())
 246                    .arg(header->GetYSize())
 247                    .arg(header->GetZSize());
 248     QString spacing = QString("%1x%2x%3")
 249                       .arg(header->GetXSpacing())
 250                       .arg(header->GetYSpacing())
 251                       .arg(header->GetZSpacing());
 252     QString origin = QString("%1x%2x%3")
 253                      .arg(header->GetXOrigin())
 254                      .arg(header->GetYOrigin())
 255                      .arg(header->GetZOrigin());
 256     QString ss =
 257         //AddInfo(        "Serie ID   : ", s)+
 258         AddInfo(header, "Patient : ", 0x0010,0x0010)+
 259         AddInfo(        "Folder : ", QFileInfo((*mFilenames)[0].c_str()).canonicalPath().toStdString())+
 260         AddInfo(header, "Series Description : ", 0x0008,0x103e)+
 261         AddInfo(header, "Modality : ", 0x0008,0x0060)+
 262         AddInfo(header, "# images : ", 0x0020,0x0013)+
 263         AddInfo(        "# files : ", n.toStdString())+
 264         AddInfo(        "Size : ", size.toStdString())+
 265         AddInfo(        "Spacing : ", spacing.toStdString())+
 266         AddInfo(        "Origin : ", origin.toStdString())+
 267         AddInfo(header, "Pixel size : ", 0x0028,0x0100)+
 268         AddInfo(        "Pixel type : ", header->GetPixelType());
 269     return ss;
 270 }
 271 //====================================================================
 272
 273 //====================================================================
 274 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(gdcm::File *header, QString n, uint16_t group, uint16_t elem) {
 275     return AddInfo(n.toStdString(), header->GetEntryValue(group, elem));
 276 }
 277 //====================================================================
 278
 279 //====================================================================
 280 QString vvDicomSeriesSelector::AddInfo(std::string n, std::string m) {
 281     QString s = QString("%1 <font color=\"blue\">%2</font><br>").
 282                 arg(n.c_str()).arg(m.c_str());
 283     return s;
 284 }
 285 //====================================================================
 286
 287 //====================================================================
 288 void vvDicomSeriesSelector::AddSerieToTheTable(int i, std::vector<std::string> & filenames) {
 289     gdcm::File *header = new gdcm::File();
 290     header->SetFileName(filenames[0]);
 291     header->SetMaxSizeLoadEntry(16384);
 292     header->SetLoadMode(gdcm::LD_NOSHADOW);// don't load shadow tags (in order to save memory)
 293     header->Load();
 294     //header->Print(cout);
 295     // ->GetValEntry
 296     //  mDicomHeader[] = header;
 297
 298     /*
 299
 300     QTableWidgetItem *newItem = new
 301     QTableWidgetItem(QString("# images = %1").arg(header->GetImageNumber()));
 302     //  newItem->setCheckState(Qt::Checked);
 303     //newItem->setFlags(!Qt::ItemIsEditable);
 304     DD(ui.mTableWidget->rowCount());
 305     ui.mTableWidget->setItem(i, 0, newItem);
 306     */
 307 }
 308 //====================================================================
 309
 310 #endif // VVDICOMSERIESSELECTOR_CXX