]> Creatis software - creaToolsTools.git/commitdiff
#3118 creaToolsTools Feature New Normal - branch changestoITK3and4
authorEduardo DAVILA <davila@localhost.localdomain>
Wed, 30 Aug 2017 08:10:38 +0000 (10:10 +0200)
committerEduardo DAVILA <davila@localhost.localdomain>
Wed, 30 Aug 2017 08:10:38 +0000 (10:10 +0200)
Linux/scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
Linux/scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh-NEW_gdcm2 [new file with mode: 0644]

index d3ad3f55ee77599cf2a9f64dfb95d7d297ec1800..b1c1aa821a370dea4488a8cb0a1b2a12495a0275 100644 (file)
@@ -147,6 +147,7 @@ fi
   fi
 
   tar -xzvf $itkfile
+  
 
 
 #fi # JPR ------------1
@@ -171,7 +172,13 @@ then
   cmake -G"Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
   ##cmake -G"CodeBlocks - Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
   cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE:STRING=$buildType -D CMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=$installPrefixThird CMakeCache.txt
-  cmake -D BUILD_EXAMPLES:BOOL=OFF -D BUILD_TESTING:BOOL=OFF -D BUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -D ITK_USE_REVIEW:BOOL=ON CMakeCache.txt
+
+  cmake -D BUILD_EXAMPLES:BOOL=OFF -D BUILD_TESTING:BOOL=OFF CMakeCache.txt
+  if [ $ITKVersion = ITK3 ]
+  then
+    cmake -D BUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -D ITK_USE_REVIEW:BOOL=ON CMakeCache.txt
+  fi
+
   if [ $ITKVersion = ITK4 ]
   then
 
@@ -179,7 +186,8 @@ then
 #     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D ITKGroup_Nonunit:BOOL=ON -D  ITKGroup_IO:BOOL=ON  -D Module_ITK-Deprecated:BOOL=ON -D Module_ITK-Review:BOOL=ON  CMakeCache.txt        
 
 ##EED ITK4.12
-     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D Module_ITKReview:BOOL=ON -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM=ON CMakeCache.txt        
+# -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM=ON
+     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D Module_ITKReview:BOOL=ON  CMakeCache.txt        
 
   fi
   cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING=-std=${stdCompiler} CMakeCache.txt
diff --git a/Linux/scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh-NEW_gdcm2 b/Linux/scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh-NEW_gdcm2
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e2e8789
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,166 @@
+# ---------------------------------------------------------------------
+#
+# Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image 
+#                        pour la Santé)
+# Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
+#
+#  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and 
+#  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use, 
+#  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B 
+#  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL 
+#  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html 
+#  or in the file LICENSE.txt.
+#
+#  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
+#  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
+#  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
+#  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
+#  liability. 
+#
+#  The fact that you are presently reading this means that you have had
+#  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
+# ------------------------------------------------------------------------  
+
+
+#!/bin/bash
+
+ if [ ! -f $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh ]
+ then 
+   echo
+   echo "..ERROR.."
+   echo "==================================================="
+   echo "REMEMBER !"
+   echo ""
+   echo "YOU NEED TO RUN 'Configure' (0) First !"
+   echo "==================================================="
+   echo
+   echo
+   exit 0
+fi
+
+source $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
+#EED 2017-03-24
+  source $PWD/scripts/LocalFunctions.sh
+  if [ `getDistrib` == "CentOS" ] && [ `getKernelVersion` < "2.6.34" ]
+  then
+       stdCompiler=c++98
+  else
+       stdCompiler=c++03
+  fi
+
+
+   echo "------"
+   echo $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
+   echo --generationdir--
+   echo $generationdir
+   echo --docgeneration--
+   echo $docgeneration
+   echo --installPrefix--
+   echo $installPrefix
+   echo --installPrefixThird--
+   echo $installPrefixThird
+   echo --buildType--
+   echo $buildType
+   echo --gdcmVersion--
+   echo $gdcmVersion
+#   echo --sourcesFrom--
+#   echo $sourcesFrom
+#   echo --scriptDir--
+#   echo $scriptDir
+#   echo --start_point--
+#   echo $start_point
+   echo "------"
+
+
+scriptDir=$PWD
+sourcesDir=$generationdir/thirdparty_sources
+binDir=$generationdir/thirdparty_bin
+
+if [ ! -e $generationdir ]
+then
+   mkdir -p $generationdir
+   chown -R $loginUserName  $generationdir
+   chgrp -R $loginGroupName $generationdir
+
+fi
+if [ ! -e $sourcesDir ]
+then
+   mkdir -p $sourcesDir
+   #was : (pb on MacOS?)
+   #chown -R $loginUserName:$loginGroupName $sourcesDir
+   chown -R $loginUserName  $sourcesDir
+   chgrp -R $loginGroupName $sourcesDir
+fi
+
+if [ ! -e $binDir ]
+then
+   mkdir -p $binDir
+   chown -R $loginUserName  $binDir
+   chgrp -R $loginGroupName $binDir
+fi
+
+  echo "we remove old stuff"
+  rm -rf $sourcesDir/gdcm*
+  rm -rf $binDir/gdcm*
+
+  cd $sourcesDir
+
+  echo "we download new stuff"
+ if [ $OperatingSystem = "MacOS" ]
+ then
+  curl -O http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
+  # MacOS, clever enough to understand it *has* to uncompress, doesn't understand tar -z :-(
+  tar -xvf gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
+ else
+##19mai2015  
+#      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
+#EED 2017-08-29 itk3toitk4
+#      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
+#      tar -xvzf gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
+
+       wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm-2.8.2.tar.gz
+       tar -xvzf gdcm-2.8.2.tar.gz 
+
+ fi
+
+if [ $buildType = "Debug" ]
+then
+   debug="ON"
+else
+   debug="OFF"
+fi
+
+# the following stupid test is used at debug time; Please don't remove!
+#if [ true = false ]
+if [ true = true ]
+then
+  libname=gdcm-2.8.2
+  dirInstall=$binDir/$libname-Bin
+  export GDCM_DIR=$installPrefixThird/lib/gdcm/
+  mkdir -p $dirInstall
+  cd $dirInstall
+
+  cmake -G"Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
+  ##cmake -G"CodeBlocks - Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
+
+  cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE:STRING=$buildType -D CMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=$installPrefixThird CMakeCache.txt
+  cmake -D VTK_DIR:PATH=$VTK_DIR CMakeCache.txt
+  cmake -D GDCM_USE_VTK:BOOL=ON  CMakeCache.txt
+  cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING=-std=${stdCompiler} CMakeCache.txt
+
+  make -j $corenumber
+  make -j $corenumber install
+  cd ..
+fi
+
+#if [ true = false ]
+if [ true = true ]
+then
+  cd $sourcesDir
+  cp tth $installPrefixThird/bin
+fi
+
+
+# deal with create creatools_third_party_libraries_config.sh
+# is now done in ThirdParty-install-Finalize.sh
+