Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

just removed some debugging messages

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

fix crash due to clicking the reload button when we have a cropTool popup opened

solved bug 316

- also refactored the code a bit...

solved bug 317

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

migration gdcm 2.0

- Rewrite the RT_Struct reader using gdcm 2.0

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Fix error when cropping.
The mean was computed with a minus operator...
New problem identified : when SetImage is called after the crop, the SliceOrientation is always 2!

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

fix the crash when we crop on an image that had been cropped.
short remove of dupplication code
It still gives an error when we crop on the Z dimension

Check on VTK_USE_FFMPEG_ENCODER in case vtkFFMPEGWriter.h is not
included

Change current image when using tab key

Fixed bug #472: unchecking of slicer was disabled by resetting the
Qt::CheckStateRole of the checkbox but the tree state was not updated. A
recursive call seems to do the trick.

bad fix for vvToolCropImage. The seg occurs (also) on the mReducedExtent array

just a test

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disable tools at startup of vv
tools are enabled when a ImageInfosChanged is triggered.

Merge branch 'mesh-test' of ../clitk3.withdata

fix segfault when accessing vvToolCropImage in toolMenu when no image are opened.
This case should not happen if tools are disabled (see issue #461) when no image are opened.

itkv4 migration

- Add call to SetDirectionCollapseToSubmatrix needed by the
  ExtractImageFilter.

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Replace || by &&

- I commited my last patch a bit too fast.

SkipComment also skip empty lines

Revert previous patch on CTestConfig.cmake

- CTestConfig.cmake is used to send result on the Insight Dashboard:
  http://www.cdash.org/CDash/index.php?project=Insight

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Increment patch version number

add vvToolStructureSetManager

Further increased the width of the registration form for the static
versions

Reflect in gui what is actually sent

Added adressing information because architecture does not provide this
information on Windows

Changed text reference to button from "No, thanks" to "Cancel"

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

change form width

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Changed register form title

Remove doublons for qt macros

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Increment patch version number for release preparation

php file for vv registration

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correction of data test path
adding some trivial test

Added compilation date to track whether this is a released binary or a
manually compiled version

Added header to configuration files

Merged globals.h.in in clitkConfiguration.h.in

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Rename vvCommon.h.in in vvConfiguration.h.in to be consistent with
clitkConfiguration.h.in

send the processor architecture when registering

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

cmake_minimum_required back to 2.4
cmake_policy 5 new for add_definitions in tests

Dirty work around to force instantiation of auto tools with shared
library: list them in an automatically generated header and include it
in vv.cxx

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

text justified in registerform popup
workaround for the fail of margin+float in QTextBrowser; the weNeedYou icon gets a transparent margin

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Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Force cross redrawing after changes view mode

- Add calls to NO and SO Slicers to redraw the cross.

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Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

text modifications for registering vv

Resolve #285

- Add a call to UpdateRenderWindows after resizing splitters in
  ChangeViewMode. Use relative sizes when resizing splitters.

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Remove strange useless loop

- Remove a loop that computes the sum of a list + 1 just after a loop
  that computes the sum of the same list.

textBrowser for registration is not set with a transparent background

itk4 migration

- BinaryFunctorImageFilters taking constant were removed from itk by
  adding SetConstant method to their Image x Image counterpart.

itk4 migration

- Remove unused include and unused typedef on types removed in itk4

tests are back
new entry for registering in the help menubar

Remove useless splashscreen code

Changed entry point of application on Windows to remove background console

Use vvLib for compiling vv to avoid double compilation of vv files

Always file for vv settings instead of registry for Windows

Put registration on a public web page

Use vvLib also without testing activated

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

tests with google tests coupled with cdash reporting

itk4 migration

- Function namespace renamed into Functor in itkMinimumImageFilter.h

clitkMeshViewer

- GGO file

clitkMeshViewer

- adjustments in command line options

clitkMeshViewer

- adjusted frame rate issues

parameterizing settings path and settings format in constructor

adding subdirectory for the tests

the dialog is filled with previous settings if the user was already registered

The Qdialog is now shown in front of the mainWindow (it was behind)

Message for registering vv's user information

enabling cdash with a localhost server

factorising parameters for QSettings
we propose the popup only if it is a new version

When an image is opened it is now added to the recently opened files menu

- version of vv in vvCommon.h
- register form being launched at every application launch
- calling a local server if the user agrees to send the register form
- writing qtSettings instead of a plain file. if a non QtSettings saved file is present at the same location, it is written over.

passing OS name in globals.h

Adding cdash with a single option setted to OFF by default

Add Opening and SliceBySliceKeepMainCCL

Add filter to reconstruct labeled images with successive dilatation. Dilatation only occurs into BG pixels (no fusion between label objects)

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

remove unused transfert_patients.sh script

transfert patients to iRODS is now managed with the
transfert_patients_to_irods.sh script from clitk-test

works with the new create_mhd_4D.sh

Add new ConditionalGrayscaleDilateImageFilter -> like GrayscaleGeodesicErodeImageFilter but only dilate inside BG (preserve other label)

Add SetRadius(int)

remove duplicated file

Merge branch 'master' of /home/dsarrut/clitk3.server

Factorize time sequence reader code

* Factorize code introduce in previous patch.