]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
0dbb37d0d44023d869fce6e0ec04bdcf08163782
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
3   * gdcmPython/gdcm.i:
4     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
5     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
6       NOT need to be wrapped anymore.
7   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
8     DicomDir::Method) new example added.
9
10 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
11   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
12     A DicomString can contain as many \0 as they want
13     and it is *always* of even length.
14     We only support odd length for very rare case. 
15     And in the near future this should be removed.
16
17 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
18   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
19     little endian. This should -heopfully- fix some tests
20
21 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
22   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default 
23     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
24     the one comiled into lib
25
26 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
27   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
28     This should definitely solve any leak problem, and we should be
29     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
30
31 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
32   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
33   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
34   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
35   
36 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
37   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
38   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
39     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
40   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
41   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
42     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
43     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
44       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
45       no longer exists.
46
47 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
48   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
49    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
50    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
51    the class.
52   
53 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
54   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
55     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
56     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
57
58 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
59   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
60   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
61     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
62     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
63     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
64       CloseFile() anymore.
65     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
66       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
67       into File::Pixel_Data.
68
69 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
70   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
71     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
72   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
73     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
74     method:
75     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
76     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
77       method to those classes.
78     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
79       -- Added a ::Print() method.
80       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
81       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
82          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
83
84 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
85   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
86     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
87     doxygen.
88   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
89   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
90     pointlessly wrapped (see
91     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
92   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
93     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
94     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
95     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
96     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
97       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
98            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
99       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
100          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
101
102 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
103   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
104     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
105
106 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
107   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
108     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
109     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
110   * TODO added new entry.
111   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
112     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
113     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
114     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
115       variable names for semantical coherence.
116
117 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
118   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
119   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
120   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
121   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
122   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
123   compilation time jpeg option.
124
125 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
126   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
127     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
128     reproduce at home.
129   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
130   Thanks dcmtk crew !
131
132 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
133   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
134   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
135     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
136   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
137   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
138   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
139   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
140     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
141     from File:: to PixelConvert::.
142
143 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
144   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
145     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
146      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
147      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
148
149 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
150   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
151   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
152   like this:
153     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
154   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
155   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
156   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
157
158 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
159   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
160     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
161     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
162     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
163     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
164       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
165       (for the time being this is better than having them attach to
166        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
167     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
168       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
169     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
170       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
171       gdcmPixelConvert::
172
173 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
174   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
175   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
176     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
177       clean up of RLE related code. 
178   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
179     - src/gdcmRLE.cxx removed
180     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
181     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
182     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
183   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
184     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
185       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
186       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
187
188 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
189   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
190     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
191       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
192       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
193       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
194       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
195       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
196       offsets.
197   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
198     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
199         with the retired Parse7Fe0().
200     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
201     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
202
203 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
204   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
205     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
206     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
207     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
208   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
209     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
210       to return an unused length.
211
212 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
213   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
214     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
215     to use to do simple stuff.
216
217 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
218   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
219     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
220     copying of the file within different directory, configure header file to
221     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
222     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
223
224 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
225   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
226      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
227        with it's binary name).
228      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
229        the Website to be more complete.
230      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
231        doxygenated documentation.
232      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
233        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
234                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
235   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
236   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
237    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
238
239 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
240   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
241    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
242
243 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
244   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
245     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
246     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
247     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
248     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
249   * GDCMHOME clean up:
250     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
251       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
252       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
253   * Autotools clean up:
254     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
255     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
256
257 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
258   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
259   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
260   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
261
262 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
263   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
264     describing TODO entries and used it for new entries.
265   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
266     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
267     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
268   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
269     documentation itself, but the website) moved to html and
270     placed in directory Doc/Website:
271     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
272     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
273     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
274   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
275   * CMakeLists.txt changed accordingly.
276   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
277     DeveloppersPython.html
278   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
279
280 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
281   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
282     of gdcm Web site.
283
284 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
285   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
286     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
287          we can now delete[] it safely  
288   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
289     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
290   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
291
292 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
293   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
294     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
295     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
296     pointed content.
297
298 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
299   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
300   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
301
302 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
303   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
304     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
305     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
306     an example of usage.
307     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
308       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
309     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
310       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
311     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
312     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
313     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
314
315 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
316   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
317     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
318     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
319     in class 
320     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
321       and associated accessors. Doxygenation of the class.
322     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
323       accessors added.
324     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
325       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
326     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
327     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
328
329 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
330   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
331     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
332       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
333            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
334            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
335            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
336            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
337            the same group and element all share the same (group, element)
338            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
339            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
340            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
341            consider the following definition of a TagKey:
342            - let Group, Element be the string representation of the
343              group and element dicom tag members,
344            - let ItemNumber be the string representation of the integer
345              index of the considered item number of a sequence,
346            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
347            the form:
348               /ItemNumber#Group|Element
349            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
350            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
351               Group|Element<SeqTag>
352            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
353            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
354            string e.g.
355                0028|1201
356            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
357            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
358            string e.g.
359                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
360     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
361       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
362       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
363     - src/gdcmDocEntry.cxx:
364       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
365          Key member.
366       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
367     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
368     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
369       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
370       -- now has a new BaseTagKey member.
371       -- STYLE.
372   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
373     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
374     truly belongs.
375     This poses the problem with the semantics of the following lines
376        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
377        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
378        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
379     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
380     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
381     order to get things working the dicom dictionary was altered !
382     Please fix things urgently...
383   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
384     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
385     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
386     set to OW:
387       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
388       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
389       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
390   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
391     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
392   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
393
394 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
395   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
396
397 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
398   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
399     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
400   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
401   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
402
403 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
404   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
405     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
406   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
407     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
408   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
409     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
410   * TODO updated
411   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
412     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
413   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
414   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
415     exception_on_error parameter.
416     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
417     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
418     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
419
420 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
421   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
422   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
423     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
424   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
425   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
426   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
427     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
428   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
429
430 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
431   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
432     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
433
434 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
435   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
436        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
437                  
438 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
439   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
440         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
441
442 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
443    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
444    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
445      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
446      is now in static in the gdcmDebug class
447    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
448    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
449
450 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
451    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
452      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
453    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
454      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
455      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
456      that displays position and size).
457    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
458      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
459      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
460      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
461      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
462      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
463      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
464         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
465      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
466      commiting changes).
467    * Test/CMakeLists.txt:
468       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
469       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
470         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
471         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
472    * TODO updated.
473
474 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
475    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
476      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
477      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
478      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
479      - removal of typedef duplication.
480      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
481      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
482    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
483       - printf polluting ctest removed.
484       - TAB removal for comminting
485    * Test:
486      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
487        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
488        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
489        this test creates them.
490        Note: we need to validate each reference image, but before that
491              I'd like to rename them with a more explicit name...
492      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
493    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
494      including each header needed).
495
496 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
497    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
498      test suite to the Example directory. Are concerned:
499      - PrintHeader.cxx
500      - TestDcm2Acr.cxx
501      - TestFindTags.cxx
502      - TestWrite.cxx was
503      - TestWriteSimple.cxx
504    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
505      image gdcmData/oldACR00001.ima
506
507 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
508    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
509      with removal from gdcmData):
510       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
511       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
512       - US.3405.1.dcm
513      Added the following because after last cvs update, they cause
514        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
515      to segfault:
516       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
517       - oldACR00001.ima
518    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
519      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
520      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
521      form of test...
522    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
523      we don't need to black list the following images anymore:
524       - 8BitsUncompressedColor.dcm
525       - OT-PAL-8-face.dcm
526       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
527    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
528      fixes and the beautified code ;-)
529      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
530      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
531      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
532            improve the test suite). The bug could be detected by using
533            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
534            or by using
535            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
536            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
537
538 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
539    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
540          - replace by uggly but working old code :-(
541                 A lot of things should be OK again.
542         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
543         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
544         (twice, withing a fortnigh ...)         
545
546 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
547    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
548      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
549    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
550      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
551      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
552                    - OT-PAL-8-face.dcm
553                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
554    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
555      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
556      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
557      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
558      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
559      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
560      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
561      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
562      image.
563    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
564      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
565      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
566      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
567    
568 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
569   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
570   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
571                           (instead of infinite loop)
572   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
573
574 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
575    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
576
577 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
578    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
579                     when SamplesPerPixel =3
580          - now Write is no longer confused by 
581                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
582          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
583                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
584    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
585                     (in order to split the job that has not to be done 
586                                         for gdcmDicomDir)
587
588 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
589    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
590      loop on the same image until memory went out. 
591      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
592    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
593      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
594
595 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
596    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
597             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
598                                 is added a the end, when necessary.
599             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
600                       now written correctly
601                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
602                                 (even for odd groups) 
603         Note : only Explicit Value Representation was checked.
604                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
605
606 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
607    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
608    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
609      coding style).
610
611 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
612    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
613      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
614    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
615
616 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
617    FIX : gdcmDocument.cxx
618       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
619         code 'beautyfication' :-(
620       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
621
622 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
623    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
624                  : to allow user to create his own Sequences
625         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
626
627 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
628         
629         - gdcmBinEntry
630           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
631           
632    - gdcmDocEntry
633           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
634           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
635           
636         - gdcmDocEntrySet
637           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
638           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
639      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
640      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
641      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
642      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
643                                             guint16 element,
644                                             std::string vr     = "unkn",
645                                             std::string fourth = "unkn",
646                                             std::string name   = "unkn"); 
647           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
648      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
649      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
650      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
651      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
652      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
653           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
654      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
655           
656         - gdcmDocument
657      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
658      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
659      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
660      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
661      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
662                                         FILE *_fp, FileType type);
663      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
664      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
665      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
666      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
667      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
668      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
669      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
670      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
671                                             guint16 element,
672                                             std::string vr     = "unkn",
673                                             std::string fourth = "unkn",
674                                             std::string name   = "unkn");
675      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
676      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
677      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
678      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
679                                                                                                                  
680         - gdcmElementSet
681           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
682           
683    - gdcmSeqEntry
684           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
685  
686    - gdcmSQItem
687      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
688      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
689      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
690      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
691
692    - gdcmValEntry
693          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
694                                   
695 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
696     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
697       The default constructor invoked by the line
698          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
699       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
700       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
701       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
702     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
703       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
704       Could anyone explain why ?
705     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
706       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
707       code related to gdcmBinEntry).
708
709 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
710     * In order to fix memory leaks:
711      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
712        some delete calls.
713      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
714      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
715        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
716        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
717        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
718      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
719      - src/gdcmDocument.cxx:
720        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
721           from dynamic stores.
722        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
723           was causing memory leaks.
724      - src/gdcmSQItem.cxx:
725        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
726           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
727        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
728           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
729           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
730           This avoids SegFaulting.
731      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
732     * Conclusion:
733      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
734        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
735        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
736      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
737        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
738      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
739        segfaults).
740     * Erroneous leading white fix:
741      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
742        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
743      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
744      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
745     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
746     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
747
748
749 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
750     * In order to fix writing of dicom files:
751      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
752      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
753      - src/gdcmDocument.cxx:
754        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
755        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
756        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
757           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
758           manner.
759        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
760           to only declared) and build on top of
761           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
762        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
763      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
764        for usage in destructor and treatement of promotion in
765        ::ReplaceOrCreateByNumber().
766      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
767       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
768     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
769       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
770       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
771       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
772
773 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
774     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
775       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
776       learned that:
777           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
778           soon as possible by globally disabling memory caching.
779           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
780           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
781       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
782       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
783       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
784     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
785       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
786       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
787       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
788         with 1.
789       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
790       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
791       understand why the list is empty...).
792     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
793     * Doc/License.txt added.
794
795 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
796     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
797       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
798         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
799         the padding problem.
800       - general clean up, simplification, and coding style.
801       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
802     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
803
804 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
805    *  gdcmSeqEntry.cxx
806            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
807                 - fix the display of SQItem ordinal number
808       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
809                 - remove some useless never written private methods     
810                 
811 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
812    * gdcmBinEntry.cxx 
813       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
814            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
815               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
816                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
817    * dcmDocument.cxx
818       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
819               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
820            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
821       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
822    * gdcmFile.cxx
823       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
824    * gdcmSQItem.h
825       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
826             a (relative) Item identier inside a given Sequence
827             \warning : some pb remaining around this number
828                                 will be solved asap
829       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
830    * gdcmValEntry.cxx 
831       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
832
833 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
834     * Memory leak hunt with the following command:
835       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
836                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
837       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
838       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
839       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
840           grep "MEMORY LEAK" src/*
841       Here are two typical examples which I can't help fixing:
842       -----
843           #include <string>
844           int main() {
845              std::string name;
846              char * test = "babo";
847              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
848                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
849              name.clear();   //// Doesn't help !
850              return 0;
851           }
852       -----
853           #include <string>
854           #include <iostream>
855           int main() {
856              std::string line;
857              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
858              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
859                                         //// of 1320 bytes in call to
860                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
861             return 0;
862           }
863       -----
864
865
866 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
867     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
868       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
869         and related, moved away to gdcmDocument.
870       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
871         the corresponding protected accessors of inherited class
872         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
873         declared friend of class gdcmDocument (see below).
874       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
875       - Clean up of undefined or unused methods.
876     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
877       account the changes to gdcmHeader.h).
878     * src/gdcmDocument.h:
879       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
880         changes to gdcmHeader.h).
881       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
882         (see changes to gdcmHeader.h).
883       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
884       - Clean up of undefined or unused methods.
885     * src/gdcmDocument.cxx:
886       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
887       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
888       - some std::string properly set to VRKey
889     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
890       references to gdcmDocument. 
891     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
892     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
893       cvs repository gdcmData.
894
895 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
896     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
897     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
898       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
899     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
900     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
901       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
902     * src/gdcmDocument.cxx: 
903       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
904         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
905       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
906         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
907         removed. Reverting to previous code segment with the proper
908         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
909         Note: this was (partially) breaking the python test suite
910               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
911               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
912     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
913     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
914       now taken into account.
915     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
916       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
917     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
918       on posix.
919     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
920       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
921     * .... alas, the python testSuite is still broken.
922
923 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
924     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
925       gdcmGlob
926     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
927     * src/gdcmUtil.h : export methods
928
929 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
930     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
931       to right behavior
932     * Initial addition of automatic python testing
933     * Initial addition of automatic image comparison
934
935 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
936     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
937       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
938
939 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
940      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
941      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
942      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
943
944 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
945      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
946        new concepts (and new classes) :
947        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
948         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
949         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
950        a Sequence is composed of Items.
951        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
952        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
953        (never taken into account)
954        Our unability to add a new 'entry' in the header
955        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
956        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
957        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
958        nothing is finished.
959        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
960
961 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
962      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
963      
964 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
965      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
966        file prefix (SetFilePrefix)
967
968 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
969      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
970        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
971        baseline.
972      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
973        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
974
975 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
976      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
977        dicom image
978
979 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
980      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
981      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
982        between the developper and user version.
983      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
984      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
985
986 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
987      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
988        when using cmake.
989
990 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
991      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
992                src directory, now generated in the build dir.
993             2. Tests as mentionned smarter
994             3. Some clean up
995             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
996           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
997           where we could set the institution name / patient name...
998
999        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1000               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1001                  (this was not true before)
1002
1003 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1004      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1005            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1006      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1007            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1008            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1009      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1010            tree-like structure of a Dicom Header.
1011      * FIX Test code cleaning     
1012            
1013 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1014      * ENH: Adding automatic testing
1015        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1016        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1017        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1018        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1019           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1020           too many projects
1021      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1022      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1023        one file instead of seven + some small cleanup
1024
1025 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1026      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1027      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1028            Header printing. Example given with :
1029            > PrintHeader fileName  2 new
1030           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1031            
1032 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1033      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1034          1. I have added some unsigned where needed
1035          2. Some function parameter not used -> (void)
1036          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1037          4. g++ don't like character '\' in comment
1038          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1039                     this really need to be fixed
1040          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1041          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1042                     this also really need to be fixed
1043          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1044                     remove compression file 
1045                     (as we only do decompression, right ?)     
1046      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1047
1048 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1049      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1050            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1051            defaulted to yspacing
1052            
1053 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1054      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1055      * ENH add parameters :
1056                bool  exception_on_error = false, 
1057                bool  enable_sequences   = false,
1058                bool  ignore_shadow      = false
1059            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1060      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1061            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1062               
1063 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1064      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1065      
1066 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1067      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1068      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1069              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1070              
1071 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1072      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1073          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1074
1075 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1076      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1077        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1078        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1079        in gdcmHeader.
1080      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1081        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1082        already does the job.
1083      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1084        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1085
1086 2004-03-30 Benoit Regrain
1087      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1088        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1089        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1090
1091 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1092      * ENH : Check on file type to be written moved
1093              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1094      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1095              when end-of-list is reached
1096            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1097
1098 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1099      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1100      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1101      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1102        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1103
1104 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1105      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1106        now contains all the gdcmGlobal related code.
1107      * minor coding style and doxygenation changes.
1108
1109 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1110      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1111        now contains all the Debug related code.
1112      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1113      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1114        CreateCleanString) removed.
1115      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1116      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1117      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1118      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1119        src/gdcmDirList.cxx)
1120
1121 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1122      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1123
1124 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1125      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1126            big endian made volumes
1127      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1128            end user to instanciate class gdcmParser
1129           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1130
1131 2004-03-22 Benoit Regrain
1132      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1133      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1134              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1135
1136 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1137      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1138            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1139            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1140            or build from the files held (recursively) in a Directory
1141            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1142            gdcmObject::SetBoundaries() added
1143
1144 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1145      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1146                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1147      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1148            DICOMDIR
1149      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1150            about the name
1151
1152 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1153      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1154                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1155
1156 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1157      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1158            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1159            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1160            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1161            to allow making gdcDicomDir object.
1162      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1163           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1164
1165 2004-02-11 Benoit Regrain
1166      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1167              when using from python
1168
1169 2004-02-10 Benoit Regrain
1170      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1171      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1172      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1173              directory parsing
1174
1175 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1176      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1177              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1178              - class gdcmMeta created
1179      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1180              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1181      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1182
1183 2004-02-05 Benoit Regrain
1184      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1185              header entries
1186      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1187      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1188
1189 2004-02-04 Benoit Regrain
1190      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1191      * FIX : sort the images in the dicom dir
1192      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1193      * ADD : a python demo
1194
1195 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1196      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1197      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1198              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1199              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1200              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1201      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1202            to make full checking easier
1203         
1204 2004-02-04 Benoit Regrain
1205      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1206      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1207
1208 2004-02-03 Benoit Regrain
1209      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1210      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1211      * Bug fix and print add-on
1212
1213 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1214      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1215      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1216      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1217      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1218            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1219         
1220 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1221      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1222              iterator on last
1223              of the last synonym :-(
1224      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1225              for DICOMDIR ;-)
1226      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1227      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1228      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1229            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1230       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1231
1232 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1233      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1234            no longer writes 'Un' on disk
1235      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1236      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1237            the length (for Palette expanded images)
1238            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1239      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1240            (that broke Write). Replaced by UL.
1241            Aware user will reload the field if he 
1242            thinks it's necesssary
1243              
1244 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1245      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1246        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1247        IsReadable() methods.
1248        
1249      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1250       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1251       but so usefull for people that miss them ;-)
1252       
1253      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1254        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1255
1256 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1257      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1258
1259 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1260      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1261              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1262         The TRUE value for this param has to be used 
1263         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1264         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1265      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1266              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1267         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1268         
1269      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1270              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1271              Fixed
1272
1273      * gdcmHeader add the method
1274              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1275         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1276         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1277         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1278
1279 2004-01-26 Benoit Regrain
1280      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1281        in the print and add a third level of print to print them
1282
1283 2004-01-23 Benoit Regrain
1284      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1285      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1286      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1287        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1288
1289 2004-01-22 Benoit Regrain
1290      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1291      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1292
1293 2004-01-19 Benoit Regrain
1294      * Add the use of shadow dictionaries
1295      * bug fix and coding style
1296
1297 2004-01-19 Benoit Regrain
1298      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1299      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1300      * Add the update of header entries using the shadow library
1301
1302 2004-01-19 Benoit Regrain
1303      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1304      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1305        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1306        of dicom dir parsing
1307      * bug fix under python
1308
1309 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1310     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1311     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1312     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1313     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1314
1315 2004-01-15 Benoit Regrain
1316      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1317        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1318        when the gdcmDictSet will be destroyed
1319      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1320        gdcmDictSet
1321
1322 2004-01-15 Benoit Regrain
1323      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1324        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1325        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1326        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1327      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1328
1329 2004-01-14 Benoit Regrain
1330      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1331      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1332      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1333      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1334
1335 2004-01-13 Benoit Regrain
1336      * src/*.[h|cxx] : coding style
1337      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1338
1339 2004-01-13 Benoit Regrain
1340      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1341      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1342        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1343      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1344
1345 2004-01-12 Benoit Regrain
1346      * src/*.h : add comments
1347      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1348      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1349        directly setted in the source code
1350      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1351        gdcmTS and gdcmVR
1352
1353 2004-01-09 Benoit Regrain
1354      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1355      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1356
1357 2004-01-07 Benoit Regrain
1358      * Modification to compile with the distutils.
1359      * Bug fix in code
1360
1361 2003-12-10 Benoit Regrain
1362      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1363        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1364      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1365        made in the source code
1366
1367 2003-12-10 Benoit Regrain
1368      * Update Windows projects and .cvsignore files
1369
1370 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1371      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1372            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1373            if he wants to.
1374            gdcmElValSet:Print takes it into account
1375
1376 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1377      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1378      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1379      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1380
1381 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1382       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1383              on the ListTag listElem member,
1384              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1385       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1386              with the tagHt member and the listElem member.
1387              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1388
1389       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1390              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1391                             if bug fixing is necessary), for internal
1392                             use only
1393              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1394                             or to allow Parser going on.
1395              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1396              with a length (not 0000) is found
1397       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1398                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1399                 (to be written)
1400
1401 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1402      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1403      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1404           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1405      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1406
1407 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1408      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1409
1410 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1411      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1412           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1413
1414 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1415      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1416      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1417              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1418              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1419
1420 2003-11-05 Benoit Regrain
1421      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1422                        : Explicit error messages
1423      * in __init__.py  : Related modif
1424
1425 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1426      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1427            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1428            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1429      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1430                     (vtkGdcmReader compliant)           
1431       
1432 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1433      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1434        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1435        
1436 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1437      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1438            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1439
1440 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1441      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1442                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1443              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1444              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1445              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1446              such an image :
1447              After gdcmHeader :
1448               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1449               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1450               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1451      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1452              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1453
1454 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1455      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1456              
1457 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1458      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1459            being coherents dicom files.
1460      
1461 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1462      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1463            from medcon lib !
1464      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1465      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1466      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1467      * ENH: Add include dir to medcon lib
1468      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1469            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1470             
1471 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1472       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1473         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1474           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1475       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1476
1477 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1478       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1479         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1480         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1481       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1482       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1483
1484 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1485       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1486                                                
1487 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1488       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1489       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1490       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1491       
1492 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1493       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1494       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1495       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1496       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1497       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1498       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1499              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1500         But it fasten debug compilation time.
1501             
1502 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1503       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1504         (they are compressed as 2 planes images, 
1505          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1506
1507 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1508       * Now CheckRead takes into account :
1509          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1510          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1511       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1512        (breaks DicomWorks)
1513
1514 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1515       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1516              one should remove the '\'
1517         
1518 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1519       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1520         (wrong lengths in header)
1521         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1522       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1523         (breaks DicomWorks)
1524
1525 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1526       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1527         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1528
1529 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1530       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1531       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1532
1533 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1534       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1535      
1536 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1537       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1538         (the patch is easy to remove)
1539       * cosmetic changes to avoid warnings
1540       
1541 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1542       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1543         no need to press 'r' now.
1544    
1545 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1546       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1547         to new Jpeg Lossless decompressor
1548       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1549       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1550       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1551                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1552 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1553       * general anonymisation in gdcmData
1554       * adding the 'color files' from
1555         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1556       * adding some well knowed bugged-header images
1557       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1558         waiting for their inclusion in Python testsuite
1559
1560 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1561     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1562       no longer seg faults when file is not found
1563
1564 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1565      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1566        MultiFrame images
1567
1568 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1569      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1570
1571 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1572      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1573         OpenFile takes it into account
1574      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1575      * Missing elements added in dicomV3.dic
1576       (just to be affraid : have a look at
1577        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1578        and do it again next year ;->
1579
1580 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1581      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1582        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1583        But there are NOT. It's fixed !
1584        
1585 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1586      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1587      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1588          
1589 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1590      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1591              an ACR-NEMA / DICOM one.
1592      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1593              is not gdcm Readable
1594      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1595              is now decoded.
1596         
1597 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1598      * FIX: CMake generate now documentation
1599      * ENH: out of source doc build !
1600      * ENH: Generate both user and dev documentation
1601      * ENH: Should work on windows too
1602      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1603      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1604      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1605      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1606                      
1607 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1608      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1609      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1610      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1611         window level & window width
1612
1613 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1614      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1615      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1616      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1617      
1618 2003-10-06  Emanuel Ollart
1619      * FIX : compilation process wad broken.
1620              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1621         
1622 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1623      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1624      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1625      
1626 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1627      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1628            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1629                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1630       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1631
1632 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1633       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1634         to remain compliant with already defined strings, 
1635         like Transfert Syntax UID and others)
1636
1637 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1638       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1639              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1640         
1641 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1642       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1643       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1644
1645 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1646       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1647         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1648               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1649       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1650
1651 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1652       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1653
1654 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1655       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1656         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1657
1658 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1659       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1660          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1661          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1662          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1663           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1664                                             YBR_RCT files.
1665           (no sample found :-(
1666
1667 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1669         Two reasons: - clear things
1670                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1671                        suffer anymore VC++ complains
1672
1673 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1675       * removed leaks
1676
1677 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1678       * The lines are now eigthy characters long.for 
1679         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1680
1681 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1682       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1683         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1684         previous commis of Malaterre)
1685       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1686         before the last Malaterre's commit.
1687
1688 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1689       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1690         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1691       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1692         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1693
1694 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1695       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1696         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1697         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1698
1699 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1700       * Cosmetic changes:
1701         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1702           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1703           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1704           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1705         - PACKAGER corrected
1706         - DEVELOPPER added.
1707         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1708       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1709
1710 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1711       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1712
1713 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1714       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1715
1716 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1717       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1718
1719 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1720       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1721
1722 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1723       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1724         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1725         heuristics to get informations (look at different places).
1726       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1727         sorting DICOM images based on different strategies.
1728       * modified Makefiles accordingly.
1729
1730 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1731       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1732         when building in debug mode
1733       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1734         src/win32/gdcmdll.dsp
1735       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1736
1737 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1738       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1739             to valgrind.
1740
1741 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1742       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1743       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1744                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1745       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1746
1747 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1748       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1749         the file
1750       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1751       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1752         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1753       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1754         symbols... future problem ?
1755
1756 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1757       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1758       * modified gdcm.dsw accordingly
1759
1760 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1761       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1762
1763 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1764       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1765         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1766       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1767         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1768         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1769
1770 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1771       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1772
1773 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1774       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1775       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1776       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1777       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1778       * PACKAGER : adding all concerning windows
1779
1780 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1781       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1782         garbage debug code.
1783       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1784       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1785         test suite reported error.
1786       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1787         packaging a new release).
1788       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1789       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1790       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1791         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1792         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1793
1794 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1795       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1796       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1797
1798 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1800         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1801         is made in an internal list to prevent this problem.
1802         Bug fix when output is empty.
1803         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1804         correction.
1805       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1806
1807 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1808       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1809       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1810         files. Added method to remove all files on the input
1811         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1812         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1813
1814 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1815       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1816         when using make instal.
1817       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1818         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1819
1820 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1821       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1822       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1823
1824 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1825       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1826         linux and WINDOWS !
1827       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1828       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1829
1830 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1831       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1832         addon of the jpeg library)
1833       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1834       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1835       * INSTALL now points to web documentation
1836
1837 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1838       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1839         gdcmUtil.h anymore.
1840       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1841         clean target.
1842       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1843         - to allow compilation with gcc 3.x
1844           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1845           -- small fixes on exceptions.
1846           Note: linking not tested !
1847         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1848           building stage.
1849       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1850         dependent convertion).
1851
1852 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1853       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1854         Changelog):
1855         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1856         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1857           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1858         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1859
1860 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1861       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1862         compile
1863       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1864         (FileName -> Filename)
1865
1866 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1867       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1868         - UpdateProgress method should now be effective
1869         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1870           to volumes),
1871         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1872           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1873           accelerating things).
1874         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1875           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1876           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1877           in the stack (for the caller to notice the problem).
1878
1879 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1880       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1881
1882 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1883       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1884         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1885         under Windows... thanks Windows !)
1886
1887 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1888       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1889         debug stage).
1890       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1891
1892 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1893       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1894
1895 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1896       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1897         called with different flags than the default ones (with automake).
1898         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1899            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1900         and went for warning fixes:
1901         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1902           up from unused variables.
1903         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1904       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1905
1906 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1907       * gdcmPython/gdcm.i:
1908         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1909           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1910           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1911         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1912           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1913           exported to Python a as cvar.
1914       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1915         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1916         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1917         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1918         C++ static methods).
1919       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1920         with the above changes.
1921
1922 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1923       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1924
1925 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1926       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1927         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1928         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1929          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1930          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1931            a wrapper
1932          - Wrapper interface which wrap sources
1933         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1934         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1935       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1936         files for compilation
1937
1938 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1939       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1940         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1941         - vtk/Makefile.am now builds a library
1942         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1943           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1944           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1945           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1946           import library.
1947         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1948           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1949           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1950           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1951           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1952         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1953           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1954         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1955           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1956       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1957       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1958         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1959         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1960         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1961         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1962         collision of various stl members (principally cout...).
1963       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1964         file.
1965       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1966         comply with above changes)
1967
1968 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1969       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1970       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1971         vtk data structure (an image Flip was required).
1972       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1973       * cosmetic changes in documentation.
1974
1975 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1976       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1977         unexisting file is given as argument.
1978       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1979         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1980         containing those images is now available at
1981           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1982         with the name gdcmData.
1983         All the python scripts (including the package initialisation file
1984         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1985         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1986
1987 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1988       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1989         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1990         demo of the usage of this class.
1991         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1992         at configure (or autogen.sh) stage.
1993
1994 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1995       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1996         Notes on valgrind:
1997           - maximum info is obtained with a command of the form:
1998             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1999                      --show-reachable=yes PrintHeader
2000           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2001             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2002             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2003             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2004              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2005       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2006         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2007         Note: some images don't seem to work e.g.
2008             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2009       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2010         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2011         make gdcm more thread friendly.
2012
2013 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2014       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2015           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2016         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2017           gdcmHeader::_dicom_vr.
2018         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2019         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2020           VRHT*.
2021         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2022
2023 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2024       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2025         make install stage.
2026
2027 2003-04-9 JPR
2028       * UpdateGroupLength replaced by new one
2029
2030 2003-04-7 JPR
2031       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2032         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2033
2034 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2035       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2036       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2037       * src:
2038         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2039         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2040           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2041         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2042           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2043           carried the same semantics.
2044           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2045         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2046           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2047         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2048       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2049       * gdcmGetXSize added
2050       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2051       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2052
2053 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2054       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2055         (to avoid double call by end user).
2056       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2057         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2058
2059 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2060       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2061         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2062           the html.users end users oriented documentation and
2063           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2064           oriented documentation.
2065         - README changed accordingly
2066         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2067         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2068           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2069         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2070           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2071           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2072       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2073         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2074       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2075         ill-formed documentation sections.
2076       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2077
2078 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2079       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2080       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2081         un*ces with sh-utils test utility.
2082       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2083       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2084       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2085       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2086       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2087
2088 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2089       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2090       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2091
2092 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2093       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2094       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2095       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2096       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2097         compilation work.
2098       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2099       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2100
2101 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2102       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2103         hence the user doesn't need this explicit call.
2104         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2105           i.e. LoadElements() call removed.
2106       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2107         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2108       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2109         for adding user defined new tags.
2110         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2111         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2112           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2113
2114 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2115       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2116         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2117         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2118         with the autotools, included the python wrappers part.
2119       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2120
2121 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2122       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2123
2124 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2125       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2126         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2127         for usage).
2128       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2129         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2130         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2131       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2132         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2133
2134 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2135       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2136         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2137         value of GDCM_DICT_PATH.
2138       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2139
2140 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2141       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2142       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2143       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2144         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2145         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2146
2147 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2148       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2149         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2150         gdcmHeader.h
2151       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2152         (as opposed to gdcm.h)
2153       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2154       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2155         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2156       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2157
2158 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2159       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2160         bug.
2161
2162 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2163       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2164         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2165         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2166         of hidding away the python related distutils specific files
2167         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2168         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2169         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2170         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2171
2172 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2173       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2174       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2175         among the list of sources.
2176
2177 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2178       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2179       * modifications in MSVC projects
2180
2181 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2182       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2183         looks like we can move back to original usage of exception within
2184         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2185         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2186       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2187         README file for usage added.
2188       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2189         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2190         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2191         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2192       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2193       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2194         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2195           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2196           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2197           instance of class gdcmHeader.
2198         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2199           require no instances at all to be invocated.
2200         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2201           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2202           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2203       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2204         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2205       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2206         the above to be effective.
2207       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2208         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2209       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2210         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2211         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2212         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2213         (for python dectection).
2214       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2215         now avoids publishing the empty entries.
2216
2217 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2218       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2219         ExtraPath reused :-P
2220       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2221
2222 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2223       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2224       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2225       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2226         and links
2227
2228 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2229       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2230         method. Doxygenation.
2231       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2232
2233 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2234       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2235         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2236         when using "python setup.py install".
2237       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2238         reexports the working classes.
2239       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2240         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2241         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2242         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2243         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2244         subdir (see the README file). This problem probably due to
2245         an combination of g++ and dynamic loading.
2246       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2247
2248 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2249       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2250         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2251         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2252         again in a python subdir, but the package itself is now in
2253         python/gdcmPython.
2254       * setup.py was cleaned up:
2255         - pythonIncludePath removed
2256         - python setup.py bdist target is now functional.
2257       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2258         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2259         accordingly.
2260
2261 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2262       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2263       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2264         distutils installer is operational.
2265       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2266           shadow classes (from gdcm.py).
2267         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2268           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2269         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2270
2271 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2272       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2273         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2274         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2275         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2276         dictionary.
2277         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2278           are now in the "???" group.
2279         - python/gdcm.i changed accordingly,
2280         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2281           of the above new functionalities in Python.
2282
2283 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2284       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2285         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2286           were definitively removed.
2287         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2288       * src/gdcmElValSet.cxx:
2289         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2290         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2291         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2292         - Added GetElementByName(string).
2293       * src/gdcmHeader.cxx: added
2294         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2295         - GetPubElValRepByName(string)
2296         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2297         - GetShaElValRepByName(string)
2298         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2299         - GetShaElValRepByName(string)
2300         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2301         - GetElValRepByName(string)
2302         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2303         - GetElValRepByName(string)
2304       * Doc/requirements.txt added.
2305
2306 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2307       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2308       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2309         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2310         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2311         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2312       * python/testSuite.py changed accordingly.
2313
2314 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2315       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2316         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2317              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2318               cannot be exported. [...]
2319               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2320               be exported. [...]
2321               This is caused by a designed limitation that once a template
2322               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2323               exported."
2324         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2325         limitation" of VC++ is a pitfall.
2326         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2327         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2328         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2329         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2330         library.
2331         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2332       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2333          dll under windows !!!!)
2334       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2335       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2336         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2337       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2338         (one) of image(s).
2339       * removed glib references
2340       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2341
2342 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2343       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2344         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2345         the files of the testsuite without using unittest.
2346       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2347       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2348       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2349         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2350
2351 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2352       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2353         values, but limits itself to values which are below a user specified
2354         size (by default 1024 bytes).
2355       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2356         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2357         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2358         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2359       * python/testSuite.py
2360         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2361         - two new examples added.
2362       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2363
2364 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2365       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2366         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2367       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2368       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2369       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2370
2371 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2372       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2373         the vr was also RET.
2374       * python/testSuite.py more tests added.
2375
2376 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2378       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2379       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2380         7.18 Integer types (see stdint.h)
2381         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2382       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2383         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2384         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2385         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2386         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2387         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2388         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2389         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2390
2391 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2392       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2393         VR files.
2394       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2395
2396 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2397       * Adaptation for porting to VC++:
2398         - src/gdcm.h
2399           o forced to use std namespace (for string to be known)
2400           o all class use __declspec export style on WIN32
2401         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2402           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2403       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2404         variable GDCM_DICT_PATH.
2405       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2406
2407 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2408       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2409         to native Python dictionary.
2410       * python/demo/test.py:
2411         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2412         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2413       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2414         PubElVals hashing table.
2415       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2416
2417 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2418       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2419         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2420       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2421       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2422       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2423         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2424       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2425
2426 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2427       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2428         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2429         that we can import de shadow classes without errors].
2430
2431 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2432       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2433       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2434       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2435       * src/Makefile prepared for python wrapping
2436
2437 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2438       * src/gdcmHeader.cxx :
2439         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2440           (see gdcmHeader::LoadElements).
2441         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2442           ReadInt16 and ReadInt32)
2443
2444 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2445       * src/gdcmHeader.cxx :
2446         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2447           method.
2448         - SetLgrElem renamed to SetLength
2449         - GetLgrElem renamed to GetLength
2450         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2451       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2452       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2453         due to IdoDude was cleaned out.
2454
2455 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2456       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2457         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2458         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2459         returning the unecessary skL (skipped length).
2460         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2461         it was redundant with the File position internals (by using
2462         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2463         jajun.
2464       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2465         on the libido specificities which are handled through class
2466         inheritance.
2467       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2468         added.
2469
2470 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2471       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2472         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2473
2474 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2475       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2476
2477 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2478       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2479         and _IdDcmSWAP_LONG.
2480
2481 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2482       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2483         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2484