ChangeLog

   1 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
   3         ExtraPath reused :-P
   4       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
   5
   6 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   7       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
   8       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
   9       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
  10         and links
  11
  12 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  13       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
  14         method. Doxygenation.
  15       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
  16
  17 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  18       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
  19         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
  20         when using "python setup.py install".
  21       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
  22         reexports the working classes.
  23       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
  24         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
  25         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
  26         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
  27         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
  28         subdir (see the README file). This problem probably due to
  29         an combination of g++ and dynamic loading.
  30       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
  31
  32 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  33       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
  34         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
  35         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
  36         again in a python subdir, but the package itself is now in
  37         python/gdcmPython.
  38       * setup.py was cleaned up:
  39         - pythonIncludePath removed
  40         - python setup.py bdist target is now functional.
  41       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
  42         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
  43         accordingly.
  44 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  45       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
  46       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
  47         distutils installer is operational.
  48       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
  49           shadow classes (from gdcm.py).
  50         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
  51           instead of gdcmPython/demo/load.py.
  52         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
  53
  54
  55 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  56       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
  57         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
  58         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
  59         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
  60         dictionary.
  61         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
  62           are now in the "???" group.
  63         - python/gdcm.i changed accordingly,
  64         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
  65           of the above new functionalities in Python.
  66
  67 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  68       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
  69         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
  70           were definitively removed.
  71         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
  72       * src/gdcmElValSet.cxx:
  73         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
  74         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
  75         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
  76         - Added GetElementByName(string).
  77       * src/gdcmHeader.cxx: added
  78         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
  79         - GetPubElValRepByName(string)
  80         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
  81         - GetShaElValRepByName(string)
  82         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
  83         - GetShaElValRepByName(string)
  84         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
  85         - GetElValRepByName(string)
  86         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
  87         - GetElValRepByName(string)
  88       * Doc/requirements.txt added.
  89
  90 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  91       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
  92       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
  93         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
  94         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
  95         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
  96       * python/testSuite.py changed accordingly.
  97
  98 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
  99       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 100         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 101              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 102               cannot be exported. [...]
 103               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 104               be exported. [...]
 105               This is caused by a designed limitation that once a template
 106               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 107               exported."
 108         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 109         limitation" of VC++ is a pitfall.
 110         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 111         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 112         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 113         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 114         library.
 115         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 116       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 117          dll under windows !!!!)
 118       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 119       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 120         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 121       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 122         (one) of image(s).
 123       * removed glib references
 124       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 125
 126 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 127       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 128         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 129         the files of the testsuite without using unittest.
 130       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 131       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 132       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 133         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 134
 135 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 136       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 137         values, but limits itself to values which are below a user specified
 138         size (by default 1024 bytes).
 139       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 140         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 141         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 142         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 143       * python/testSuite.py
 144         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 145         - two new examples added.
 146       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 147
 148 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 149       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 150         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 151       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 152       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 153       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 154
 155 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 156       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 157         the vr was also RET.
 158       * python/testSuite.py more tests added.
 159
 160 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 161       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 162       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 163       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 164         7.18 Integer types (see stdint.h)
 165         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 166       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 167         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 168         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 169         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 170         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 171         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 172         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 173         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 174
 175 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 176       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 177         VR files.
 178       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 179
 180 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 181       * Adaptation for porting to VC++:
 182         - src/gdcm.h
 183           o forced to use std namespace (for string to be known)
 184           o all class use __declspec export style on WIN32
 185         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 186           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 187       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 188         variable GDCM_DICT_PATH.
 189       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 190
 191 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 192       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 193         to native Python dictionary.
 194       * python/demo/test.py:
 195         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 196         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 197       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 198         PubElVals hashing table.
 199       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 200
 201 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 202       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 203         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 204       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 205       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 206       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 207         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 208       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 209
 210 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 211       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 212         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 213         that we can import de shadow classes without errors].
 214
 215 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 216       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 217       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 218       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 219       * src/Makefile prepared for python wrapping
 220
 221 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 222       * src/gdcmHeader.cxx :
 223         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 224           (see gdcmHeader::LoadElements).
 225         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 226           ReadInt16 and ReadInt32)
 227
 228 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 229       * src/gdcmHeader.cxx :
 230         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 231           method.
 232         - SetLgrElem renamed to SetLength
 233         - GetLgrElem renamed to GetLength
 234         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 235       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 236       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 237         due to IdoDude was cleaned out.
 238
 239 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 240       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 241         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 242         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 243         returning the unecessary skL (skipped length).
 244         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 245         it was redundant with the File position internals (by using
 246         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 247         jajun.
 248       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 249         on the libido specificities which are handled through class
 250         inheritance.
 251       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 252         added.
 253
 254 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 255       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 256         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 257
 258 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 259       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 260
 261 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 262       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 263         and _IdDcmSWAP_LONG.
 264
 265 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 266       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 267         May 23 2002. Needless to say we are running late...
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