ChangeLog

   1 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
   3       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
   4       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
   5         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
   6         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
   7
   8 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   9       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
  10         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
  11         gdcmHeader.h
  12       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
  13         (as opposed to gdcm.h)
  14       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
  15       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
  16         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
  17       * autogen.sh removed history related references to crea package.
  18
  19 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  20       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
  21         bug.
  22
  23 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  24       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
  25         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
  26         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
  27         of hidding away the python related distutils specific files
  28         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
  29         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
  30         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
  31         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
  32
  33 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  34       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
  35       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
  36         among the list of sources.
  37
  38 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  39       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
  40       * modifications in MSVC projects
  41
  42 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  43       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
  44         looks like we can move back to original usage of exception within
  45         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
  46         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
  47       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
  48         README file for usage added.
  49       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
  50         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  51         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  52         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  53       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  54       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  55         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  56           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  57           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  58           instance of class gdcmHeader.
  59         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  60           require no instances at all to be invocated.
  61         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  62           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  63           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  64       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  65         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  66       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  67         the above to be effective.
  68       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  69         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  70       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  71         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  72         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  73         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  74         (for python dectection).
  75       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  76         now avoids publishing the empty entries.
  77
  78 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  79       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  80         ExtraPath reused :-P
  81       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
  82
  83 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  84       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
  85       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
  86       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
  87         and links
  88
  89 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  90       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
  91         method. Doxygenation.
  92       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
  93
  94 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  95       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
  96         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
  97         when using "python setup.py install".
  98       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
  99         reexports the working classes.
 100       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 101         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 102         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 103         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 104         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 105         subdir (see the README file). This problem probably due to
 106         an combination of g++ and dynamic loading.
 107       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 108
 109 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 110       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 111         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 112         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 113         again in a python subdir, but the package itself is now in
 114         python/gdcmPython.
 115       * setup.py was cleaned up:
 116         - pythonIncludePath removed
 117         - python setup.py bdist target is now functional.
 118       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 119         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 120         accordingly.
 121 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 122       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 123       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 124         distutils installer is operational.
 125       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 126           shadow classes (from gdcm.py).
 127         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 128           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 129         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 130
 131
 132 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 133       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 134         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 135         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 136         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 137         dictionary.
 138         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 139           are now in the "???" group.
 140         - python/gdcm.i changed accordingly,
 141         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 142           of the above new functionalities in Python.
 143
 144 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 145       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 146         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 147           were definitively removed.
 148         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 149       * src/gdcmElValSet.cxx:
 150         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 151         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 152         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 153         - Added GetElementByName(string).
 154       * src/gdcmHeader.cxx: added
 155         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 156         - GetPubElValRepByName(string)
 157         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 158         - GetShaElValRepByName(string)
 159         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 160         - GetShaElValRepByName(string)
 161         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 162         - GetElValRepByName(string)
 163         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 164         - GetElValRepByName(string)
 165       * Doc/requirements.txt added.
 166
 167 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 168       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 169       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 170         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 171         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 172         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 173       * python/testSuite.py changed accordingly.
 174
 175 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 176       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 177         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 178              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 179               cannot be exported. [...]
 180               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 181               be exported. [...]
 182               This is caused by a designed limitation that once a template
 183               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 184               exported."
 185         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 186         limitation" of VC++ is a pitfall.
 187         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 188         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 189         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 190         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 191         library.
 192         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 193       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 194          dll under windows !!!!)
 195       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 196       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 197         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 198       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 199         (one) of image(s).
 200       * removed glib references
 201       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 202
 203 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 204       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 205         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 206         the files of the testsuite without using unittest.
 207       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 208       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 209       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 210         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 211
 212 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 213       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 214         values, but limits itself to values which are below a user specified
 215         size (by default 1024 bytes).
 216       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 217         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 218         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 219         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 220       * python/testSuite.py
 221         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 222         - two new examples added.
 223       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 224
 225 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 226       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 227         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 228       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 229       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 230       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 231
 232 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 233       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 234         the vr was also RET.
 235       * python/testSuite.py more tests added.
 236
 237 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 238       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 239       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 240       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 241         7.18 Integer types (see stdint.h)
 242         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 243       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 244         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 245         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 246         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 247         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 248         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 249         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 250         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 251
 252 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 253       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 254         VR files.
 255       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 256
 257 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 258       * Adaptation for porting to VC++:
 259         - src/gdcm.h
 260           o forced to use std namespace (for string to be known)
 261           o all class use __declspec export style on WIN32
 262         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 263           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 264       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 265         variable GDCM_DICT_PATH.
 266       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 267
 268 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 269       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 270         to native Python dictionary.
 271       * python/demo/test.py:
 272         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 273         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 274       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 275         PubElVals hashing table.
 276       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 277
 278 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 279       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 280         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 281       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 282       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 283       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 284         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 285       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 286
 287 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 288       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 289         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 290         that we can import de shadow classes without errors].
 291
 292 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 293       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 294       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 295       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 296       * src/Makefile prepared for python wrapping
 297
 298 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 299       * src/gdcmHeader.cxx :
 300         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 301           (see gdcmHeader::LoadElements).
 302         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 303           ReadInt16 and ReadInt32)
 304
 305 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 306       * src/gdcmHeader.cxx :
 307         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 308           method.
 309         - SetLgrElem renamed to SetLength
 310         - GetLgrElem renamed to GetLength
 311         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 312       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 313       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 314         due to IdoDude was cleaned out.
 315
 316 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 317       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 318         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 319         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 320         returning the unecessary skL (skipped length).
 321         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 322         it was redundant with the File position internals (by using
 323         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 324         jajun.
 325       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 326         on the libido specificities which are handled through class
 327         inheritance.
 328       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 329         added.
 330
 331 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 332       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 333         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 334
 335 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 336       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 337
 338 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 339       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 340         and _IdDcmSWAP_LONG.
 341
 342 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 343       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 344         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 345