]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
3a66c1681c2a0b5f8ace74ec8d55946a86080c59
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
3   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
4     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
5   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
6   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
7   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
8     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
9   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
10
11 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
12   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
13     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
14
15 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
16   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
17        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
18                  
19 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
20   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
21         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
22
23 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
24    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
25    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
26      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
27      is now in static in the gdcmDebug class
28    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
29    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
30
31 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
32    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
33      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
34    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
35      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
36      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
37      that displays position and size).
38    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
39      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
40      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
41      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
42      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
43      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
44      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
45         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
46      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
47      commiting changes).
48    * Test/CMakeLists.txt:
49       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
50       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
51         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
52         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
53    * TODO updated.
54
55 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
56    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
57      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
58      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
59      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
60      - removal of typedef duplication.
61      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
62      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
63    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
64       - printf polluting ctest removed.
65       - TAB removal for comminting
66    * Test:
67      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
68        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
69        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
70        this test creates them.
71        Note: we need to validate each reference image, but before that
72              I'd like to rename them with a more explicit name...
73      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
74    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
75      including each header needed).
76
77 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
78    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
79      test suite to the Example directory. Are concerned:
80      - PrintHeader.cxx
81      - TestDcm2Acr.cxx
82      - TestFindTags.cxx
83      - TestWrite.cxx was
84      - TestWriteSimple.cxx
85    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
86      image gdcmData/oldACR00001.ima
87
88 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
89    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
90      with removal from gdcmData):
91       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
92       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
93       - US.3405.1.dcm
94      Added the following because after last cvs update, they cause
95        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
96      to segfault:
97       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
98       - oldACR00001.ima
99    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
100      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
101      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
102      form of test...
103    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
104      we don't need to black list the following images anymore:
105       - 8BitsUncompressedColor.dcm
106       - OT-PAL-8-face.dcm
107       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
108    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
109      fixes and the beautified code ;-)
110      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
111      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
112      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
113            improve the test suite). The bug could be detected by using
114            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
115            or by using
116            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
117            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
118
119 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
120    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
121          - replace by uggly but working old code :-(
122                 A lot of things should be OK again.
123         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
124         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
125         (twice, withing a fortnigh ...)         
126
127 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
128    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
129      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
130    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
131      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
132      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
133                    - OT-PAL-8-face.dcm
134                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
135    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
136      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
137      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
138      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
139      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
140      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
141      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
142      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
143      image.
144    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
145      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
146      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
147      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
148    
149 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
150   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
151   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
152                           (instead of infinite loop)
153   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
154
155 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
156    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
157
158 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
159    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
160                     when SamplesPerPixel =3
161          - now Write is no longer confused by 
162                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
163          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
164                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
165    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
166                     (in order to split the job that has not to be done 
167                                         for gdcmDicomDir)
168
169 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
170    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
171      loop on the same image until memory went out. 
172      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
173    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
174      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
175
176 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
177    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
178             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
179                                 is added a the end, when necessary.
180             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
181                       now written correctly
182                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
183                                 (even for odd groups) 
184         Note : only Explicit Value Representation was checked.
185                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
186
187 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
188    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
189    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
190      coding style).
191
192 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
193    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
194      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
195    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
196
197 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
198    FIX : gdcmDocument.cxx
199       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
200         code 'beautyfication' :-(
201       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
202
203 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
204    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
205                  : to allow user to create his own Sequences
206         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
207
208 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
209         
210         - gdcmBinEntry
211           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
212           
213    - gdcmDocEntry
214           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
215           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
216           
217         - gdcmDocEntrySet
218           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
219           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
220      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
221      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
222      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
223      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
224                                             guint16 element,
225                                             std::string vr     = "unkn",
226                                             std::string fourth = "unkn",
227                                             std::string name   = "unkn"); 
228           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
229      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
230      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
231      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
232      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
233      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
234           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
235      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
236           
237         - gdcmDocument
238      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
239      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
240      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
241      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
242      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
243                                         FILE *_fp, FileType type);
244      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
245      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
246      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
247      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
248      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
249      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
250      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
251      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
252                                             guint16 element,
253                                             std::string vr     = "unkn",
254                                             std::string fourth = "unkn",
255                                             std::string name   = "unkn");
256      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
257      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
258      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
259      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
260                                                                                                                  
261         - gdcmElementSet
262           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
263           
264    - gdcmSeqEntry
265           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
266  
267    - gdcmSQItem
268      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
269      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
270      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
271      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
272
273    - gdcmValEntry
274          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
275                                   
276 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
277     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
278       The default constructor invoked by the line
279          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
280       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
281       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
282       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
283     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
284       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
285       Could anyone explain why ?
286     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
287       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
288       code related to gdcmBinEntry).
289
290 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
291     * In order to fix memory leaks:
292      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
293        some delete calls.
294      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
295      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
296        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
297        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
298        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
299      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
300      - src/gdcmDocument.cxx:
301        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
302           from dynamic stores.
303        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
304           was causing memory leaks.
305      - src/gdcmSQItem.cxx:
306        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
307           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
308        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
309           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
310           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
311           This avoids SegFaulting.
312      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
313     * Conclusion:
314      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
315        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
316        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
317      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
318        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
319      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
320        segfaults).
321     * Erroneous leading white fix:
322      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
323        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
324      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
325      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
326     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
327     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
328
329
330 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
331     * In order to fix writing of dicom files:
332      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
333      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
334      - src/gdcmDocument.cxx:
335        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
336        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
337        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
338           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
339           manner.
340        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
341           to only declared) and build on top of
342           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
343        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
344      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
345        for usage in destructor and treatement of promotion in
346        ::ReplaceOrCreateByNumber().
347      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
348       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
349     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
350       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
351       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
352       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
353
354 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
355     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
356       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
357       learned that:
358           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
359           soon as possible by globally disabling memory caching.
360           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
361           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
362       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
363       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
364       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
365     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
366       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
367       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
368       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
369         with 1.
370       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
371       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
372       understand why the list is empty...).
373     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
374     * Doc/License.txt added.
375
376 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
377     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
378       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
379         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
380         the padding problem.
381       - general clean up, simplification, and coding style.
382       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
383     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
384
385 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
386    *  gdcmSeqEntry.cxx
387            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
388                 - fix the display of SQItem ordinal number
389       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
390                 - remove some useless never written private methods     
391                 
392 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
393    * gdcmBinEntry.cxx 
394       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
395            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
396               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
397                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
398    * dcmDocument.cxx
399       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
400               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
401            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
402       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
403    * gdcmFile.cxx
404       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
405    * gdcmSQItem.h
406       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
407             a (relative) Item identier inside a given Sequence
408             \warning : some pb remaining around this number
409                                 will be solved asap
410       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
411    * gdcmValEntry.cxx 
412       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
413
414 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
415     * Memory leak hunt with the following command:
416       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
417                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
418       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
419       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
420       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
421           grep "MEMORY LEAK" src/*
422       Here are two typical examples which I can't help fixing:
423       -----
424           #include <string>
425           int main() {
426              std::string name;
427              char * test = "babo";
428              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
429                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
430              name.clear();   //// Doesn't help !
431              return 0;
432           }
433       -----
434           #include <string>
435           #include <iostream>
436           int main() {
437              std::string line;
438              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
439              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
440                                         //// of 1320 bytes in call to
441                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
442             return 0;
443           }
444       -----
445
446
447 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
448     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
449       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
450         and related, moved away to gdcmDocument.
451       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
452         the corresponding protected accessors of inherited class
453         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
454         declared friend of class gdcmDocument (see below).
455       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
456       - Clean up of undefined or unused methods.
457     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
458       account the changes to gdcmHeader.h).
459     * src/gdcmDocument.h:
460       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
461         changes to gdcmHeader.h).
462       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
463         (see changes to gdcmHeader.h).
464       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
465       - Clean up of undefined or unused methods.
466     * src/gdcmDocument.cxx:
467       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
468       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
469       - some std::string properly set to VRKey
470     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
471       references to gdcmDocument. 
472     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
473     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
474       cvs repository gdcmData.
475
476 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
477     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
478     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
479       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
480     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
481     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
482       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
483     * src/gdcmDocument.cxx: 
484       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
485         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
486       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
487         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
488         removed. Reverting to previous code segment with the proper
489         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
490         Note: this was (partially) breaking the python test suite
491               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
492               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
493     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
494     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
495       now taken into account.
496     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
497       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
498     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
499       on posix.
500     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
501       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
502     * .... alas, the python testSuite is still broken.
503
504 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
505     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
506       gdcmGlob
507     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
508     * src/gdcmUtil.h : export methods
509
510 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
511     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
512       to right behavior
513     * Initial addition of automatic python testing
514     * Initial addition of automatic image comparison
515
516 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
517     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
518       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
519
520 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
521      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
522      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
523      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
524
525 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
526      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
527        new concepts (and new classes) :
528        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
529         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
530         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
531        a Sequence is composed of Items.
532        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
533        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
534        (never taken into account)
535        Our unability to add a new 'entry' in the header
536        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
537        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
538        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
539        nothing is finished.
540        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
541
542 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
543      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
544      
545 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
546      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
547        file prefix (SetFilePrefix)
548
549 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
550      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
551        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
552        baseline.
553      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
554        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
555
556 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
557      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
558        dicom image
559
560 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
561      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
562      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
563        between the developper and user version.
564      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
565      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
566
567 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
568      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
569        when using cmake.
570
571 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
572      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
573                src directory, now generated in the build dir.
574             2. Tests as mentionned smarter
575             3. Some clean up
576             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
577           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
578           where we could set the institution name / patient name...
579
580        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
581               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
582                  (this was not true before)
583
584 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
585      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
586            SeQuence indented printing of Dicom Header.
587      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
588            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
589            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
590      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
591            tree-like structure of a Dicom Header.
592      * FIX Test code cleaning     
593            
594 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
595      * ENH: Adding automatic testing
596        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
597        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
598        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
599        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
600           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
601           too many projects
602      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
603      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
604        one file instead of seven + some small cleanup
605
606 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
607      * ENH Minor changes to the Print() methods.
608      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
609            Header printing. Example given with :
610            > PrintHeader fileName  2 new
611           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
612            
613 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
614      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
615          1. I have added some unsigned where needed
616          2. Some function parameter not used -> (void)
617          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
618          4. g++ don't like character '\' in comment
619          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
620                     this really need to be fixed
621          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
622          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
623                     this also really need to be fixed
624          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
625                     remove compression file 
626                     (as we only do decompression, right ?)     
627      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
628
629 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
630      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
631            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
632            defaulted to yspacing
633            
634 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
635      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
636      * ENH add parameters :
637                bool  exception_on_error = false, 
638                bool  enable_sequences   = false,
639                bool  ignore_shadow      = false
640            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
641      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
642            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
643               
644 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
645      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
646      
647 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
648      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
649      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
650              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
651              
652 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
653      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
654          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
655
656 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
657      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
658        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
659        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
660        in gdcmHeader.
661      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
662        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
663        already does the job.
664      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
665        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
666
667 2004-03-30 Benoit Regrain
668      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
669        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
670        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
671
672 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
673      * ENH : Check on file type to be written moved
674              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
675      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
676              when end-of-list is reached
677            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
678
679 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
681      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
682      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
683        equivalent to ExplicitVR in existing code).
684
685 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
686      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
687        now contains all the gdcmGlobal related code.
688      * minor coding style and doxygenation changes.
689
690 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
692        now contains all the Debug related code.
693      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
694      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
695        CreateCleanString) removed.
696      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
697      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
698      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
699      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
700        src/gdcmDirList.cxx)
701
702 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
703      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
704
705 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
706      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
707            big endian made volumes
708      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
709            end user to instanciate class gdcmParser
710           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
711
712 2004-03-22 Benoit Regrain
713      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
714      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
715              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
716
717 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
718      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
719            an already existing DICOMDIR file is consistent with
720            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
721            or build from the files held (recursively) in a Directory
722            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
723            gdcmObject::SetBoundaries() added
724
725 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
726      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
727                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
728      * FIX now file names and directory name are written properly in the
729            DICOMDIR
730      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
731            about the name
732
733 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
734      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
735                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
736
737 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
738      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
739            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
740            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
741            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
742            to allow making gdcDicomDir object.
743      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
744           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
745
746 2004-02-11 Benoit Regrain
747      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
748              when using from python
749
750 2004-02-10 Benoit Regrain
751      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
752      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
753      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
754              directory parsing
755
756 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
757      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
758              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
759              - class gdcmMeta created
760      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
761              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
762      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
763
764 2004-02-05 Benoit Regrain
765      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
766              header entries
767      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
768      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
769
770 2004-02-04 Benoit Regrain
771      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
772      * FIX : sort the images in the dicom dir
773      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
774      * ADD : a python demo
775
776 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
777      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
778      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
779              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
780              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
781              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
782      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
783            to make full checking easier
784         
785 2004-02-04 Benoit Regrain
786      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
787      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
788
789 2004-02-03 Benoit Regrain
790      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
791      * gdcmDicomDir : add the load of directory
792      * Bug fix and print add-on
793
794 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
795      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
796      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
797      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
798      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
799            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
800         
801 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
802      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
803              iterator on last
804              of the last synonym :-(
805      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
806              for DICOMDIR ;-)
807      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
808      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
809      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
810            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
811       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
812
813 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
814      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
815            no longer writes 'Un' on disk
816      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
817      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
818            the length (for Palette expanded images)
819            and Raw Length (non expanded image + Palette)
820      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
821            (that broke Write). Replaced by UL.
822            Aware user will reload the field if he 
823            thinks it's necesssary
824              
825 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
826      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
827        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
828        IsReadable() methods.
829        
830      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
831       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
832       but so usefull for people that miss them ;-)
833       
834      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
835        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
836
837 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
838      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
839
840 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
841      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
842              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
843         The TRUE value for this param has to be used 
844         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
845         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
846      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
847              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
848         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
849         
850      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
851              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
852              Fixed
853
854      * gdcmHeader add the method
855              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
856         to get *all* the Header Entries with the same tag.
857         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
858         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
859
860 2004-01-26 Benoit Regrain
861      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
862        in the print and add a third level of print to print them
863
864 2004-01-23 Benoit Regrain
865      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
866      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
867      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
868        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
869
870 2004-01-22 Benoit Regrain
871      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
872      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
873
874 2004-01-19 Benoit Regrain
875      * Add the use of shadow dictionaries
876      * bug fix and coding style
877
878 2004-01-19 Benoit Regrain
879      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
880      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
881      * Add the update of header entries using the shadow library
882
883 2004-01-19 Benoit Regrain
884      * removal of file gdcmHeader2.cxx
885      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
886        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
887        of dicom dir parsing
888      * bug fix under python
889
890 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
891     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
892     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
893     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
894     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
895
896 2004-01-15 Benoit Regrain
897      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
898        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
899        when the gdcmDictSet will be destroyed
900      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
901        gdcmDictSet
902
903 2004-01-15 Benoit Regrain
904      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
905        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
906        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
907        some memory and vtk seems to have some problems with that.
908      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
909
910 2004-01-14 Benoit Regrain
911      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
912      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
913      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
914      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
915
916 2004-01-13 Benoit Regrain
917      * src/*.[h|cxx] : coding style
918      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
919
920 2004-01-13 Benoit Regrain
921      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
922      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
923        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
924      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
925
926 2004-01-12 Benoit Regrain
927      * src/*.h : add comments
928      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
929      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
930        directly setted in the source code
931      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
932        gdcmTS and gdcmVR
933
934 2004-01-09 Benoit Regrain
935      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
936      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
937
938 2004-01-07 Benoit Regrain
939      * Modification to compile with the distutils.
940      * Bug fix in code
941
942 2003-12-10 Benoit Regrain
943      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
944        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
945      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
946        made in the source code
947
948 2003-12-10 Benoit Regrain
949      * Update Windows projects and .cvsignore files
950
951 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
952      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
953            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
954            if he wants to.
955            gdcmElValSet:Print takes it into account
956
957 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
958      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
959      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
960      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
961
962 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
963       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
964              on the ListTag listElem member,
965              not longer on the TagElValueHT tagHt member
966       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
967              with the tagHt member and the listElem member.
968              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
969
970       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
971              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
972                             if bug fixing is necessary), for internal
973                             use only
974              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
975                             or to allow Parser going on.
976              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
977              with a length (not 0000) is found
978       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
979                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
980                 (to be written)
981
982 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
983      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
984      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
985           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
986      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
987
988 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
989      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
990
991 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
992      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
993           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
994
995 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
996      * in testSuite.py : new files names for checking the package
997      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
998              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
999              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1000
1001 2003-11-05 Benoit Regrain
1002      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1003                        : Explicit error messages
1004      * in __init__.py  : Related modif
1005
1006 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1007      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1008            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1009            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1010      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1011                     (vtkGdcmReader compliant)           
1012       
1013 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1014      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1015        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1016        
1017 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1018      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1019            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1020
1021 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1022      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1023                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1024              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1025              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1026              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1027              such an image :
1028              After gdcmHeader :
1029               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1030               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1031               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1032      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1033              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1034
1035 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1036      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1037              
1038 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1039      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1040            being coherents dicom files.
1041      
1042 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1043      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1044            from medcon lib !
1045      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1046      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1047      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1048      * ENH: Add include dir to medcon lib
1049      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1050            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1051             
1052 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1053       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1054         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1055           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1056       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1057
1058 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1059       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1060         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1061         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1062       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1063       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1064
1065 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1066       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1067                                                
1068 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1069       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1070       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1071       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1072       
1073 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1074       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1075       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1076       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1077       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1078       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1079       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1080              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1081         But it fasten debug compilation time.
1082             
1083 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1084       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1085         (they are compressed as 2 planes images, 
1086          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1087
1088 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1089       * Now CheckRead takes into account :
1090          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1091          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1092       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1093        (breaks DicomWorks)
1094
1095 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1096       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1097              one should remove the '\'
1098         
1099 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1100       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1101         (wrong lengths in header)
1102         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1103       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1104         (breaks DicomWorks)
1105
1106 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1107       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1108         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1109
1110 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1111       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1112       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1113
1114 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1115       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1116      
1117 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1118       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1119         (the patch is easy to remove)
1120       * cosmetic changes to avoid warnings
1121       
1122 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1123       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1124         no need to press 'r' now.
1125    
1126 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1127       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1128         to new Jpeg Lossless decompressor
1129       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1130       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1131       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1132                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1133 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1134       * general anonymisation in gdcmData
1135       * adding the 'color files' from
1136         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1137       * adding some well knowed bugged-header images
1138       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1139         waiting for their inclusion in Python testsuite
1140
1141 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1142     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1143       no longer seg faults when file is not found
1144
1145 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1146      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1147        MultiFrame images
1148
1149 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1150      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1151
1152 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1153      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1154         OpenFile takes it into account
1155      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1156      * Missing elements added in dicomV3.dic
1157       (just to be affraid : have a look at
1158        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1159        and do it again next year ;->
1160
1161 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1162      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1163        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1164        But there are NOT. It's fixed !
1165        
1166 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1167      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1168      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1169          
1170 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1171      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1172              an ACR-NEMA / DICOM one.
1173      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1174              is not gdcm Readable
1175      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1176              is now decoded.
1177         
1178 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1179      * FIX: CMake generate now documentation
1180      * ENH: out of source doc build !
1181      * ENH: Generate both user and dev documentation
1182      * ENH: Should work on windows too
1183      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1184      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1185      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1186      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1187                      
1188 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1189      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1190      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1191      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1192         window level & window width
1193
1194 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1195      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1196      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1197      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1198      
1199 2003-10-06  Emanuel Ollart
1200      * FIX : compilation process wad broken.
1201              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1202         
1203 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1204      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1205      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1206      
1207 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1208      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1209            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1210                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1211       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1212
1213 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1214       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1215         to remain compliant with already defined strings, 
1216         like Transfert Syntax UID and others)
1217
1218 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1219       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1220              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1221         
1222 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1223       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1224       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1225
1226 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1227       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1228         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1229               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1230       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1231
1232 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1233       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1234
1235 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1236       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1237         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1238
1239 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1240       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1241          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1242          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1243          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1244           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1245                                             YBR_RCT files.
1246           (no sample found :-(
1247
1248 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1249       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1250         Two reasons: - clear things
1251                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1252                        suffer anymore VC++ complains
1253
1254 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1255       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1256       * removed leaks
1257
1258 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1259       * The lines are now eigthy characters long.for 
1260         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1261
1262 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1263       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1264         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1265         previous commis of Malaterre)
1266       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1267         before the last Malaterre's commit.
1268
1269 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1270       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1271         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1272       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1273         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1274
1275 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1276       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1277         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1278         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1279
1280 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1281       * Cosmetic changes:
1282         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1283           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1284           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1285           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1286         - PACKAGER corrected
1287         - DEVELOPPER added.
1288         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1289       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1290
1291 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1292       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1293
1294 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1295       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1296
1297 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1298       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1299
1300 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1301       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1302
1303 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1304       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1305         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1306         heuristics to get informations (look at different places).
1307       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1308         sorting DICOM images based on different strategies.
1309       * modified Makefiles accordingly.
1310
1311 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1312       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1313         when building in debug mode
1314       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1315         src/win32/gdcmdll.dsp
1316       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1317
1318 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1319       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1320             to valgrind.
1321
1322 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1323       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1324       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1325                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1326       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1327
1328 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1329       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1330         the file
1331       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1332       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1333         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1334       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1335         symbols... future problem ?
1336
1337 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1338       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1339       * modified gdcm.dsw accordingly
1340
1341 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1342       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1343
1344 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1345       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1346         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1347       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1348         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1349         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1350
1351 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1352       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1353
1354 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1355       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1356       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1357       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1358       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1359       * PACKAGER : adding all concerning windows
1360
1361 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1362       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1363         garbage debug code.
1364       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1365       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1366         test suite reported error.
1367       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1368         packaging a new release).
1369       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1370       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1371       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1372         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1373         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1374
1375 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1376       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1377       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1378
1379 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1380       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1381         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1382         is made in an internal list to prevent this problem.
1383         Bug fix when output is empty.
1384         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1385         correction.
1386       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1387
1388 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1389       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1390       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1391         files. Added method to remove all files on the input
1392         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1393         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1394
1395 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1396       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1397         when using make instal.
1398       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1399         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1400
1401 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1402       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1403       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1404
1405 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1406       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1407         linux and WINDOWS !
1408       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1409       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1410
1411 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1412       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1413         addon of the jpeg library)
1414       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1415       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1416       * INSTALL now points to web documentation
1417
1418 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1419       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1420         gdcmUtil.h anymore.
1421       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1422         clean target.
1423       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1424         - to allow compilation with gcc 3.x
1425           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1426           -- small fixes on exceptions.
1427           Note: linking not tested !
1428         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1429           building stage.
1430       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1431         dependent convertion).
1432
1433 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1434       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1435         Changelog):
1436         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1437         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1438           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1439         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1440
1441 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1442       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1443         compile
1444       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1445         (FileName -> Filename)
1446
1447 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1448       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1449         - UpdateProgress method should now be effective
1450         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1451           to volumes),
1452         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1453           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1454           accelerating things).
1455         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1456           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1457           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1458           in the stack (for the caller to notice the problem).
1459
1460 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1461       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1462
1463 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1464       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1465         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1466         under Windows... thanks Windows !)
1467
1468 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1469       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1470         debug stage).
1471       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1472
1473 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1474       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1475
1476 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1477       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1478         called with different flags than the default ones (with automake).
1479         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1480            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1481         and went for warning fixes:
1482         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1483           up from unused variables.
1484         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1485       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1486
1487 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1488       * gdcmPython/gdcm.i:
1489         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1490           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1491           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1492         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1493           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1494           exported to Python a as cvar.
1495       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1496         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1497         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1498         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1499         C++ static methods).
1500       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1501         with the above changes.
1502
1503 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1504       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1505
1506 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1507       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1508         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1509         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1510          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1511          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1512            a wrapper
1513          - Wrapper interface which wrap sources
1514         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1515         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1516       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1517         files for compilation
1518
1519 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1520       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1521         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1522         - vtk/Makefile.am now builds a library
1523         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1524           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1525           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1526           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1527           import library.
1528         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1529           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1530           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1531           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1532           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1533         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1534           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1535         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1536           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1537       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1538       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1539         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1540         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1541         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1542         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1543         collision of various stl members (principally cout...).
1544       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1545         file.
1546       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1547         comply with above changes)
1548
1549 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1550       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1551       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1552         vtk data structure (an image Flip was required).
1553       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1554       * cosmetic changes in documentation.
1555
1556 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1557       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1558         unexisting file is given as argument.
1559       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1560         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1561         containing those images is now available at
1562           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1563         with the name gdcmData.
1564         All the python scripts (including the package initialisation file
1565         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1566         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1567
1568 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1569       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1570         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1571         demo of the usage of this class.
1572         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1573         at configure (or autogen.sh) stage.
1574
1575 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1576       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1577         Notes on valgrind:
1578           - maximum info is obtained with a command of the form:
1579             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1580                      --show-reachable=yes PrintHeader
1581           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1582             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1583             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1584             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1585              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1586       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1587         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1588         Note: some images don't seem to work e.g.
1589             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1590       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1591         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1592         make gdcm more thread friendly.
1593
1594 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1595       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1596           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1597         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1598           gdcmHeader::_dicom_vr.
1599         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1600         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1601           VRHT*.
1602         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1603
1604 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1605       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1606         make install stage.
1607
1608 2003-04-9 JPR
1609       * UpdateGroupLength replaced by new one
1610
1611 2003-04-7 JPR
1612       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1613         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1614
1615 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1616       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1617       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1618       * src:
1619         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1620         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1621           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1622         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1623           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1624           carried the same semantics.
1625           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1626         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1627           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1628         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1629       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1630       * gdcmGetXSize added
1631       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1632       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1633
1634 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1635       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1636         (to avoid double call by end user).
1637       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1638         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1639
1640 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1641       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1642         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1643           the html.users end users oriented documentation and
1644           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1645           oriented documentation.
1646         - README changed accordingly
1647         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1648         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1649           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1650         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1651           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1652           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1653       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1654         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1655       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1656         ill-formed documentation sections.
1657       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1658
1659 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1660       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1661       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1662         un*ces with sh-utils test utility.
1663       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1664       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1665       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1666       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1667       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1668
1669 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1670       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1671       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1672
1673 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1675       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1676       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1677       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1678         compilation work.
1679       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1680       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1681
1682 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1683       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1684         hence the user doesn't need this explicit call.
1685         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1686           i.e. LoadElements() call removed.
1687       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1688         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1689       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1690         for adding user defined new tags.
1691         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1692         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1693           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1694
1695 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1696       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1697         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1698         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1699         with the autotools, included the python wrappers part.
1700       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1701
1702 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1703       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1704
1705 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1706       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1707         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1708         for usage).
1709       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1710         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1711         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1712       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1713         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1714
1715 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1716       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1717         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1718         value of GDCM_DICT_PATH.
1719       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1720
1721 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1722       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1723       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1724       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1725         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1726         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1727
1728 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1729       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1730         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1731         gdcmHeader.h
1732       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1733         (as opposed to gdcm.h)
1734       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1735       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1736         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1737       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1738
1739 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1740       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1741         bug.
1742
1743 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1744       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1745         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1746         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1747         of hidding away the python related distutils specific files
1748         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1749         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1750         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1751         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1752
1753 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1754       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1755       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1756         among the list of sources.
1757
1758 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1759       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1760       * modifications in MSVC projects
1761
1762 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1763       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1764         looks like we can move back to original usage of exception within
1765         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1766         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1767       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1768         README file for usage added.
1769       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1770         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1771         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1772         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1773       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1774       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1775         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1776           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1777           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1778           instance of class gdcmHeader.
1779         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1780           require no instances at all to be invocated.
1781         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1782           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1783           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1784       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1785         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1786       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1787         the above to be effective.
1788       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1789         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1790       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1791         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1792         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1793         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1794         (for python dectection).
1795       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1796         now avoids publishing the empty entries.
1797
1798 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1800         ExtraPath reused :-P
1801       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1802
1803 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1804       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1805       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1806       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1807         and links
1808
1809 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1810       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1811         method. Doxygenation.
1812       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1813
1814 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1815       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1816         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1817         when using "python setup.py install".
1818       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1819         reexports the working classes.
1820       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1821         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1822         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1823         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1824         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1825         subdir (see the README file). This problem probably due to
1826         an combination of g++ and dynamic loading.
1827       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1828
1829 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1830       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1831         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1832         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1833         again in a python subdir, but the package itself is now in
1834         python/gdcmPython.
1835       * setup.py was cleaned up:
1836         - pythonIncludePath removed
1837         - python setup.py bdist target is now functional.
1838       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1839         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1840         accordingly.
1841
1842 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1843       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1844       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1845         distutils installer is operational.
1846       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1847           shadow classes (from gdcm.py).
1848         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1849           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1850         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1851
1852 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1853       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1854         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1855         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1856         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1857         dictionary.
1858         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1859           are now in the "???" group.
1860         - python/gdcm.i changed accordingly,
1861         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1862           of the above new functionalities in Python.
1863
1864 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1865       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1866         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1867           were definitively removed.
1868         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1869       * src/gdcmElValSet.cxx:
1870         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1871         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1872         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1873         - Added GetElementByName(string).
1874       * src/gdcmHeader.cxx: added
1875         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1876         - GetPubElValRepByName(string)
1877         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1878         - GetShaElValRepByName(string)
1879         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1880         - GetShaElValRepByName(string)
1881         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1882         - GetElValRepByName(string)
1883         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1884         - GetElValRepByName(string)
1885       * Doc/requirements.txt added.
1886
1887 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1888       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1889       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1890         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1891         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1892         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1893       * python/testSuite.py changed accordingly.
1894
1895 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1896       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1897         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1898              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1899               cannot be exported. [...]
1900               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1901               be exported. [...]
1902               This is caused by a designed limitation that once a template
1903               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1904               exported."
1905         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1906         limitation" of VC++ is a pitfall.
1907         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1908         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1909         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1910         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1911         library.
1912         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1913       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1914          dll under windows !!!!)
1915       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1916       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1917         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1918       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1919         (one) of image(s).
1920       * removed glib references
1921       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1922
1923 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1924       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1925         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1926         the files of the testsuite without using unittest.
1927       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1928       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1929       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1930         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1931
1932 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1933       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1934         values, but limits itself to values which are below a user specified
1935         size (by default 1024 bytes).
1936       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1937         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1938         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1939         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1940       * python/testSuite.py
1941         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1942         - two new examples added.
1943       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1944
1945 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1946       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1947         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1948       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1949       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1950       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1951
1952 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1953       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1954         the vr was also RET.
1955       * python/testSuite.py more tests added.
1956
1957 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1958       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1959       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1960       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1961         7.18 Integer types (see stdint.h)
1962         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1963       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1964         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1965         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1966         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1967         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1968         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1969         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1970         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1971
1972 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1973       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1974         VR files.
1975       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1976
1977 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1978       * Adaptation for porting to VC++:
1979         - src/gdcm.h
1980           o forced to use std namespace (for string to be known)
1981           o all class use __declspec export style on WIN32
1982         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1983           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1984       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1985         variable GDCM_DICT_PATH.
1986       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1987
1988 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1989       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1990         to native Python dictionary.
1991       * python/demo/test.py:
1992         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1993         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1994       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1995         PubElVals hashing table.
1996       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1997
1998 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1999       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2000         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2001       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2002       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2003       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2004         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2005       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2006
2007 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2008       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2009         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2010         that we can import de shadow classes without errors].
2011
2012 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2013       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2014       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2015       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2016       * src/Makefile prepared for python wrapping
2017
2018 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2019       * src/gdcmHeader.cxx :
2020         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2021           (see gdcmHeader::LoadElements).
2022         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2023           ReadInt16 and ReadInt32)
2024
2025 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2026       * src/gdcmHeader.cxx :
2027         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2028           method.
2029         - SetLgrElem renamed to SetLength
2030         - GetLgrElem renamed to GetLength
2031         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2032       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2033       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2034         due to IdoDude was cleaned out.
2035
2036 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2037       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2038         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2039         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2040         returning the unecessary skL (skipped length).
2041         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2042         it was redundant with the File position internals (by using
2043         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2044         jajun.
2045       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2046         on the libido specificities which are handled through class
2047         inheritance.
2048       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2049         added.
2050
2051 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2052       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2053         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2054
2055 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2056       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2057
2058 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2059       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2060         and _IdDcmSWAP_LONG.
2061
2062 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2063       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2064         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2065