ChangeLog

   1 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
   3         linux and WINDOWS !
   4       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
   5       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
   6
   7 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   8       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
   9         addon of the jpeg library)
  10       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
  11       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
  12       * INSTALL now points to web documentation
  13
  14 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  15       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
  16         gdcmUtil.h anymore.
  17       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
  18         clean target.
  19       * src/gdcm*.[cxx|h] :
  20         - to allow compilation with gcc 3.x
  21           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
  22           -- small fixes on exceptions.
  23           Note: linking not tested !
  24         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
  25           building stage.
  26       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
  27         dependent convertion).
  28
  29 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  30       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
  31         Changelog):
  32         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
  33         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
  34           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
  35         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
  36
  37 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  38       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
  39         compile
  40       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
  41         (FileName -> Filename)
  42
  43 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  44       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
  45         - UpdateProgress method should now be effective
  46         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
  47           to volumes),
  48         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
  49           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
  50           accelerating things).
  51         - when building a stack of images/volumes, files which are not
  52           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
  53           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
  54           in the stack (for the caller to notice the problem).
  55
  56 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  57       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
  58
  59 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  60       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
  61         between standard library (std) and vtk library (problems are found
  62         under Windows... thanks Windows !)
  63
  64 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  65       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
  66         debug stage).
  67       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
  68
  69 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  70       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
  71
  72 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  73       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
  74         called with different flags than the default ones (with automake).
  75         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
  76            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
  77         and went for warning fixes:
  78         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
  79           up from unused variables.
  80         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
  81       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
  82
  83 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  84       * gdcmPython/gdcm.i:
  85         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
  86           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
  87           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
  88         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
  89           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
  90           exported to Python a as cvar.
  91       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
  92         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
  93         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
  94         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
  95         C++ static methods).
  96       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
  97         with the above changes.
  98
  99 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 100       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
 101
 102 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 103       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
 104         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
 105         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
 106          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
 107          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
 108            a wrapper
 109          - Wrapper interface which wrap sources
 110         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
 111         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
 112       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
 113         files for compilation
 114
 115 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
 116       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
 117         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
 118         - vtk/Makefile.am now builds a library
 119         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
 120           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
 121           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
 122           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
 123           import library.
 124         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
 125           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
 126           + vtk/vtkGdcmReader.so and
 127           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
 128           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
 129         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
 130           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
 131         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
 132           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
 133       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
 134       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
 135         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
 136         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
 137         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
 138         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
 139         collision of various stl members (principally cout...).
 140       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
 141         file.
 142       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
 143          comply with above changes)
 144
 145 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 146       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
 147       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
 148         vtk data structure (an image Flip was required).
 149       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
 150       * cosmetic changes in documentation.
 151
 152 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 153       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
 154         unexisting file is given as argument.
 155       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
 156         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
 157         containing those images is now available at
 158           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
 159         with the name gdcmData.
 160         All the python scripts (including the package initialisation file
 161         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
 162         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
 163
 164 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 165       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
 166         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
 167         demo of the usage of this class.
 168         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
 169         at configure (or autogen.sh) stage.
 170
 171 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 172       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
 173         Notes on valgrind:
 174           - maximum info is obtained with a command of the form:
 175             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
 176                    --show-reachable=yes PrintHeader
 177           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
 178             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
 179             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
 180             (in fact further invocation to the STL would recollect the
 181              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
 182       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
 183         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
 184         Note: some images don't seem to work e.g.
 185             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
 186       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
 187         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
 188         make gdcm more thread friendly.
 189
 190 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 191       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
 192           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
 193         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
 194           gdcmHeader::_dicom_vr.
 195         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
 196         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
 197           VRHT*.
 198         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
 199
 200 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 201       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
 202         make install stage.
 203
 204 2003-04-9 JPR
 205       * UpdateGroupLength replaced by new one
 206
 207 2003-04-7 JPR
 208       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
 209         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
 210
 211 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 212       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 213       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
 214       * src:
 215         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
 216         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
 217           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
 218         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
 219           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
 220           carried the same semantics.
 221           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
 222         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
 223           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
 224         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
 225       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
 226       * gdcmGetXSize added
 227       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
 228       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
 229
 230 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 231       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
 232         (to avoid double call by end user).
 233       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
 234         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
 235
 236 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 237       * gdcm/Doc many doxygen changes:
 238         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
 239           the html.users end users oriented documentation and
 240           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
 241           oriented documentation.
 242         - README changed accordingly
 243         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
 244         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
 245           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
 246         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
 247           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
 248           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
 249       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
 250         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
 251       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
 252         ill-formed documentation sections.
 253       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
 254
 255 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 256       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
 257       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
 258         un*ces with sh-utils test utility.
 259       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
 260       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
 261       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
 262       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
 263       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
 264
 265 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 266       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
 267       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
 268
 269 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 270       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
 271       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
 272       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
 273       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
 274         compilation work.
 275       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
 276       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
 277
 278 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 279       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
 280         hence the user doesn't need this explicit call.
 281         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
 282           i.e. LoadElements() call removed.
 283       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
 284         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
 285       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
 286         for adding user defined new tags.
 287         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
 288         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
 289           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
 290
 291 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
 292       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
 293    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
 294    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
 295    with the autotools, included the python wrappers part.
 296       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
 297
 298 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 299       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
 300
 301 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 302       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
 303         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
 304         for usage).
 305       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
 306         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
 307         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
 308       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
 309         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
 310
 311 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 312       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
 313         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
 314         value of GDCM_DICT_PATH.
 315       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
 316
 317 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 318       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
 319       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
 320       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
 321         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
 322         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
 323
 324 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 325       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
 326         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
 327         gdcmHeader.h
 328       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
 329         (as opposed to gdcm.h)
 330       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
 331       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
 332         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
 333       * autogen.sh removed history related references to crea package.
 334
 335 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 336       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
 337         bug.
 338
 339 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 340       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
 341         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
 342         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
 343         of hidding away the python related distutils specific files
 344         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
 345         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
 346         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
 347         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
 348
 349 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 350       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
 351       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
 352         among the list of sources.
 353
 354 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 355       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
 356       * modifications in MSVC projects
 357
 358 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 359       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
 360         looks like we can move back to original usage of exception within
 361         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
 362         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
 363       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
 364         README file for usage added.
 365       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
 366         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
 367         testing the proper parsing of a Dicom related file.
 368         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
 369       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
 370       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
 371         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
 372           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
 373           Dicom public dictionnary were not accessible without an
 374           instance of class gdcmHeader.
 375         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
 376           require no instances at all to be invocated.
 377         - within gdcmDictSet this change required to change some method
 378           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
 379           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
 380       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
 381         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
 382       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
 383         the above to be effective.
 384       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
 385         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
 386       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
 387         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
 388         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
 389         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
 390         (for python dectection).
 391       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
 392         now avoids publishing the empty entries.
 393
 394 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 395       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
 396         ExtraPath reused :-P
 397       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 398
 399 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 400       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 401       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 402       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 403         and links
 404
 405 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 406       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 407         method. Doxygenation.
 408       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 409
 410 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 411       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 412         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 413         when using "python setup.py install".
 414       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 415         reexports the working classes.
 416       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 417         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 418         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 419         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 420         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 421         subdir (see the README file). This problem probably due to
 422         an combination of g++ and dynamic loading.
 423       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 424
 425 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 426       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 427         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 428         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 429         again in a python subdir, but the package itself is now in
 430         python/gdcmPython.
 431       * setup.py was cleaned up:
 432         - pythonIncludePath removed
 433         - python setup.py bdist target is now functional.
 434       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 435         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 436         accordingly.
 437 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 438       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 439       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 440         distutils installer is operational.
 441       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 442           shadow classes (from gdcm.py).
 443         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 444           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 445         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 446
 447
 448 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 449       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 450         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 451         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 452         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 453         dictionary.
 454         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 455           are now in the "???" group.
 456         - python/gdcm.i changed accordingly,
 457         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 458           of the above new functionalities in Python.
 459
 460 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 461       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 462         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 463           were definitively removed.
 464         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 465       * src/gdcmElValSet.cxx:
 466         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 467         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 468         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 469         - Added GetElementByName(string).
 470       * src/gdcmHeader.cxx: added
 471         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 472         - GetPubElValRepByName(string)
 473         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 474         - GetShaElValRepByName(string)
 475         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 476         - GetShaElValRepByName(string)
 477         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 478         - GetElValRepByName(string)
 479         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 480         - GetElValRepByName(string)
 481       * Doc/requirements.txt added.
 482
 483 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 484       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 485       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 486         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 487         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 488         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 489       * python/testSuite.py changed accordingly.
 490
 491 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 492       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 493         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 494              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 495               cannot be exported. [...]
 496               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 497               be exported. [...]
 498               This is caused by a designed limitation that once a template
 499               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 500               exported."
 501         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 502         limitation" of VC++ is a pitfall.
 503         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 504         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 505         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 506         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 507         library.
 508         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 509       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 510          dll under windows !!!!)
 511       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 512       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 513         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 514       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 515         (one) of image(s).
 516       * removed glib references
 517       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 518
 519 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 520       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 521         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 522         the files of the testsuite without using unittest.
 523       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 524       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 525       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 526         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 527
 528 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 529       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 530         values, but limits itself to values which are below a user specified
 531         size (by default 1024 bytes).
 532       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 533         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 534         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 535         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 536       * python/testSuite.py
 537         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 538         - two new examples added.
 539       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 540
 541 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 542       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 543         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 544       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 545       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 546       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 547
 548 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 549       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 550         the vr was also RET.
 551       * python/testSuite.py more tests added.
 552
 553 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 554       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 555       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 556       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 557         7.18 Integer types (see stdint.h)
 558         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 559       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 560         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 561         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 562         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 563         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 564         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 565         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 566         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 567
 568 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 569       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 570         VR files.
 571       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 572
 573 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 574       * Adaptation for porting to VC++:
 575         - src/gdcm.h
 576           o forced to use std namespace (for string to be known)
 577           o all class use __declspec export style on WIN32
 578         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 579           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 580       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 581         variable GDCM_DICT_PATH.
 582       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 583
 584 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 585       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 586         to native Python dictionary.
 587       * python/demo/test.py:
 588         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 589         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 590       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 591         PubElVals hashing table.
 592       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 593
 594 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 595       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 596         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 597       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 598       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 599       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 600         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 601       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 602
 603 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 604       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 605         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 606         that we can import de shadow classes without errors].
 607
 608 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 609       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 610       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 611       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 612       * src/Makefile prepared for python wrapping
 613
 614 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 615       * src/gdcmHeader.cxx :
 616         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 617           (see gdcmHeader::LoadElements).
 618         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 619           ReadInt16 and ReadInt32)
 620
 621 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 622       * src/gdcmHeader.cxx :
 623         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 624           method.
 625         - SetLgrElem renamed to SetLength
 626         - GetLgrElem renamed to GetLength
 627         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 628       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 629       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 630         due to IdoDude was cleaned out.
 631
 632 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 633       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 634         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 635         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 636         returning the unecessary skL (skipped length).
 637         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 638         it was redundant with the File position internals (by using
 639         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 640         jajun.
 641       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 642         on the libido specificities which are handled through class
 643         inheritance.
 644       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 645         added.
 646
 647 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 648       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 649         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 650
 651 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 652       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 653
 654 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 655       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 656         and _IdDcmSWAP_LONG.
 657
 658 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 659       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 660         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 661