]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
3         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
4         is made in an internal list to prevent this problem. 
5         Bug fix when output is empty.
6         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
7         correction.
8
9 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
10       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
11       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
12         files. Added method to remove all files on the input
13         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
14         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
15
16 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
17       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
18         when using make instal.
19       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
20         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
21
22 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
23       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
24       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
25
26 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
27       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
28         linux and WINDOWS !
29       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
30       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
31
32 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
33       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
34         addon of the jpeg library)
35       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
36       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
37       * INSTALL now points to web documentation
38
39 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
40       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
41         gdcmUtil.h anymore.
42       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
43         clean target.
44       * src/gdcm*.[cxx|h] :
45         - to allow compilation with gcc 3.x
46           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
47           -- small fixes on exceptions.
48           Note: linking not tested !
49         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
50           building stage.
51       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
52         dependent convertion).
53
54 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
55       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
56         Changelog):
57         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
58         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
59           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
60         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
61
62 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
63       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to 
64         compile
65       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
66         (FileName -> Filename)
67
68 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
69       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
70         - UpdateProgress method should now be effective
71         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
72           to volumes),
73         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
74           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
75           accelerating things).
76         - when building a stack of images/volumes, files which are not
77           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
78           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
79           in the stack (for the caller to notice the problem).
80
81 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
82       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
83
84 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
85       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts 
86         between standard library (std) and vtk library (problems are found
87         under Windows... thanks Windows !)
88
89 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
90       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
91         debug stage).
92       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
93
94 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
95       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
96
97 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
98       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
99         called with different flags than the default ones (with automake).
100         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
101            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
102         and went for warning fixes:
103         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
104           up from unused variables.
105         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
106       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
107
108 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
109       * gdcmPython/gdcm.i:
110         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
111           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
112           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
113         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
114           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
115           exported to Python a as cvar.
116       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
117         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
118         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
119         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
120         C++ static methods).
121       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
122         with the above changes.
123
124 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
125       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
126
127 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
128       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
129         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
130         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
131          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
132          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
133            a wrapper
134          - Wrapper interface which wrap sources
135         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
136         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
137       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
138         files for compilation
139
140 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
141       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
142         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
143         - vtk/Makefile.am now builds a library
144         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
145           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
146           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
147           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
148           import library.
149         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
150           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
151           + vtk/vtkGdcmReader.so and
152           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
153           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
154         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
155           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
156         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
157           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
158       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
159       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
160         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
161         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
162         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
163         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
164         collision of various stl members (principally cout...).
165       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
166         file.
167       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
168          comply with above changes)
169
170 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
171       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
172       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
173         vtk data structure (an image Flip was required).
174       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
175       * cosmetic changes in documentation.
176
177 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
178       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
179         unexisting file is given as argument.
180       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
181         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
182         containing those images is now available at 
183           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
184         with the name gdcmData.
185         All the python scripts (including the package initialisation file
186         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
187         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
188
189 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
190       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
191         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
192         demo of the usage of this class.
193         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
194         at configure (or autogen.sh) stage.
195
196 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
197       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
198         Notes on valgrind:
199           - maximum info is obtained with a command of the form:
200             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
201                    --show-reachable=yes PrintHeader
202           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
203             allocation scheme through the usage of map and list. It looks 
204             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
205             (in fact further invocation to the STL would recollect the
206              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
207       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
208         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
209         Note: some images don't seem to work e.g.
210             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
211       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
212         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
213         make gdcm more thread friendly.
214
215 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
216       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
217           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
218         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
219           gdcmHeader::_dicom_vr.
220         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
221         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
222           VRHT*.
223         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
224
225 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
226       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
227         make install stage.
228
229 2003-04-9 JPR
230       * UpdateGroupLength replaced by new one
231
232 2003-04-7 JPR
233       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
234         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
235       
236 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
237       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
238       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
239       * src:
240         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
241         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
242           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
243         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
244           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
245           carried the same semantics.
246           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
247         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
248           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
249         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
250       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
251       * gdcmGetXSize added
252       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
253       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
254
255 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
256       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
257         (to avoid double call by end user).
258       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
259         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
260
261 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
262       * gdcm/Doc many doxygen changes:
263         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
264           the html.users end users oriented documentation and
265           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
266           oriented documentation.
267         - README changed accordingly
268         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
269         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
270           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
271         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
272           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying 
273           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
274       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
275         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
276       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
277         ill-formed documentation sections.
278       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
279
280 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
281       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
282       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
283         un*ces with sh-utils test utility.
284       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
285       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
286       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
287       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
288       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
289
290 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
291       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
292       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
293
294 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
295       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
296       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
297       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
298       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
299         compilation work.
300       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
301       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
302
303 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
304       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
305         hence the user doesn't need this explicit call.
306         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
307           i.e. LoadElements() call removed.
308       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
309         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
310       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
311         for adding user defined new tags.
312         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
313         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
314           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
315
316 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
317       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
318    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am, 
319    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
320    with the autotools, included the python wrappers part. 
321       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
322
323 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
324       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
325
326 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
327       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
328         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
329         for usage).
330       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
331         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
332         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
333       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
334         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
335
336 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
337       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
338         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
339         value of GDCM_DICT_PATH.
340       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
341
342 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
343       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
344       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
345       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
346         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
347         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
348
349 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
350       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
351         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
352         gdcmHeader.h
353       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
354         (as opposed to gdcm.h)
355       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
356       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
357         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
358       * autogen.sh removed history related references to crea package.
359
360 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
361       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
362         bug.
363
364 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
365       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
366         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
367         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
368         of hidding away the python related distutils specific files
369         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
370         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
371         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
372         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
373
374 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
375       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
376       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
377         among the list of sources.
378       
379 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
380       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
381       * modifications in MSVC projects
382
383 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
384       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
385         looks like we can move back to original usage of exception within
386         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
387         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
388       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
389         README file for usage added.
390       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
391         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
392         testing the proper parsing of a Dicom related file.
393         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
394       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
395       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
396         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
397           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
398           Dicom public dictionnary were not accessible without an
399           instance of class gdcmHeader.
400         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
401           require no instances at all to be invocated.
402         - within gdcmDictSet this change required to change some method
403           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
404           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
405       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
406         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
407       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
408         the above to be effective.
409       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
410         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
411       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
412         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
413         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
414         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
415         (for python dectection).
416       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
417         now avoids publishing the empty entries.
418
419 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
420       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
421         ExtraPath reused :-P
422       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
423
424 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
425       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
426       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
427       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
428         and links
429
430 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
431       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
432         method. Doxygenation.
433       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
434
435 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
436       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
437         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
438         when using "python setup.py install".
439       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
440         reexports the working classes.
441       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
442         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
443         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
444         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
445         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
446         subdir (see the README file). This problem probably due to
447         an combination of g++ and dynamic loading.
448       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
449
450 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
451       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
452         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
453         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
454         again in a python subdir, but the package itself is now in
455         python/gdcmPython.
456       * setup.py was cleaned up:
457         - pythonIncludePath removed
458         - python setup.py bdist target is now functional.
459       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
460         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
461         accordingly.
462 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
463       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
464       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
465         distutils installer is operational.
466       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
467           shadow classes (from gdcm.py).
468         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
469           instead of gdcmPython/demo/load.py.
470         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
471         
472
473 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
474       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
475         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
476         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
477         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
478         dictionary.
479         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
480           are now in the "???" group.
481         - python/gdcm.i changed accordingly,
482         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
483           of the above new functionalities in Python.
484
485 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
486       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
487         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
488           were definitively removed.
489         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
490       * src/gdcmElValSet.cxx:
491         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
492         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
493         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
494         - Added GetElementByName(string).
495       * src/gdcmHeader.cxx: added
496         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
497         - GetPubElValRepByName(string)
498         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
499         - GetShaElValRepByName(string)
500         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
501         - GetShaElValRepByName(string)
502         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
503         - GetElValRepByName(string)
504         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
505         - GetElValRepByName(string)
506       * Doc/requirements.txt added.
507
508 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
509       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
510       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
511         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of 
512         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
513         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
514       * python/testSuite.py changed accordingly.
515
516 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
517       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
518         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
519              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
520               cannot be exported. [...]
521               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
522               be exported. [...]
523               This is caused by a designed limitation that once a template
524               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
525               exported."
526         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
527         limitation" of VC++ is a pitfall.
528         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked 
529         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
530         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
531         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
532         library. 
533         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
534       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
535          dll under windows !!!!)
536       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
537       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
538         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
539       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set 
540         (one) of image(s).
541       * removed glib references
542       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
543
544 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
545       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
546         that only displays required tags and testAll.py that parses all
547         the files of the testsuite without using unittest.
548       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
549       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
550       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
551         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
552
553 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
554       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
555         values, but limits itself to values which are below a user specified
556         size (by default 1024 bytes).
557       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
558         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
559         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
560         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
561       * python/testSuite.py
562         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
563         - two new examples added.
564       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
565
566 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
567       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
568         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
569       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
570       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
571       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
572
573 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
574       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
575         the vr was also RET.
576       * python/testSuite.py more tests added.
577
578 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
579       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
580       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
581       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
582         7.18 Integer types (see stdint.h)
583         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
584       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
585         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
586         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
587         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
588         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
589         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
590         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
591         The rest of the changes we the necessary adaptations.
592
593 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
594       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
595         VR files.
596       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
597
598 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
599       * Adaptation for porting to VC++:
600         - src/gdcm.h
601           o forced to use std namespace (for string to be known)
602           o all class use __declspec export style on WIN32
603         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
604           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
605       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
606         variable GDCM_DICT_PATH.
607       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
608
609 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
610       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
611         to native Python dictionary.
612       * python/demo/test.py:
613         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
614         - takes an optional filename argument (the file to parse).
615       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
616         PubElVals hashing table. 
617       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
618
619 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
620       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
621         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
622       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
623       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
624       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
625         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
626       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
627
628 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
629       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
630         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
631         that we can import de shadow classes without errors].
632
633 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
634       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
635       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
636       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
637       * src/Makefile prepared for python wrapping
638
639 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
640       * src/gdcmHeader.cxx :
641         - Parsing of header is now separated from loading of element values
642           (see gdcmHeader::LoadElements).
643         - general clean up of hopefully all file access (creation of
644           ReadInt16 and ReadInt32)
645
646 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
647       * src/gdcmHeader.cxx :
648         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
649           method.
650         - SetLgrElem renamed to SetLength
651         - GetLgrElem renamed to GetLength
652         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
653       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
654       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
655         due to IdoDude was cleaned out.
656
657 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
659         concentrates on finding the value representation (when it exists).
660         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
661         returning the unecessary skL (skipped length).
662         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
663         it was redundant with the File position internals (by using
664         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
665         jajun.
666       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
667         on the libido specificities which are handled through class 
668         inheritance.
669       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
670         added. 
671
672 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
673       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
674         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
675
676 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
677       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
678
679 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
681         and _IdDcmSWAP_LONG.
682
683 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
684       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
685         May 23 2002. Needless to say we are running late...
686