ChangeLog

   1 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
   3         looks like we can move back to original usage of exception within
   4         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
   5         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
   6       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
   7         README file for usage added.
   8       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
   9         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  10         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  11         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  12       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  13       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  14         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  15           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  16           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  17           instance of class gdcmHeader.
  18         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  19           require no instances at all to be invocated.
  20         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  21           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  22           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  23       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  24         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  25       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  26         the above to be effective.
  27       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  28         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  29       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  30         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  31         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  32         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  33         (for python dectection).
  34       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  35         now avoids publishing the empty entries.
  36
  37 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  38       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  39         ExtraPath reused :-P
  40       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
  41
  42 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  43       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
  44       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
  45       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
  46         and links
  47
  48 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  49       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
  50         method. Doxygenation.
  51       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
  52
  53 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  54       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
  55         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
  56         when using "python setup.py install".
  57       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
  58         reexports the working classes.
  59       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
  60         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
  61         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
  62         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
  63         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
  64         subdir (see the README file). This problem probably due to
  65         an combination of g++ and dynamic loading.
  66       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
  67
  68 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  69       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
  70         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
  71         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
  72         again in a python subdir, but the package itself is now in
  73         python/gdcmPython.
  74       * setup.py was cleaned up:
  75         - pythonIncludePath removed
  76         - python setup.py bdist target is now functional.
  77       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
  78         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
  79         accordingly.
  80 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  81       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
  82       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
  83         distutils installer is operational.
  84       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
  85           shadow classes (from gdcm.py).
  86         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
  87           instead of gdcmPython/demo/load.py.
  88         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
  89
  90
  91 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  92       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
  93         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
  94         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
  95         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
  96         dictionary.
  97         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
  98           are now in the "???" group.
  99         - python/gdcm.i changed accordingly,
 100         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 101           of the above new functionalities in Python.
 102
 103 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 104       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 105         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 106           were definitively removed.
 107         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 108       * src/gdcmElValSet.cxx:
 109         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 110         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 111         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 112         - Added GetElementByName(string).
 113       * src/gdcmHeader.cxx: added
 114         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 115         - GetPubElValRepByName(string)
 116         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 117         - GetShaElValRepByName(string)
 118         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 119         - GetShaElValRepByName(string)
 120         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 121         - GetElValRepByName(string)
 122         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 123         - GetElValRepByName(string)
 124       * Doc/requirements.txt added.
 125
 126 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 127       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 128       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 129         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 130         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 131         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 132       * python/testSuite.py changed accordingly.
 133
 134 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 135       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 136         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 137              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 138               cannot be exported. [...]
 139               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 140               be exported. [...]
 141               This is caused by a designed limitation that once a template
 142               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 143               exported."
 144         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 145         limitation" of VC++ is a pitfall.
 146         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 147         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 148         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 149         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 150         library.
 151         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 152       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 153          dll under windows !!!!)
 154       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 155       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 156         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 157       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 158         (one) of image(s).
 159       * removed glib references
 160       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 161
 162 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 163       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 164         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 165         the files of the testsuite without using unittest.
 166       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 167       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 168       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 169         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 170
 171 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 172       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 173         values, but limits itself to values which are below a user specified
 174         size (by default 1024 bytes).
 175       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 176         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 177         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 178         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 179       * python/testSuite.py
 180         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 181         - two new examples added.
 182       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 183
 184 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 185       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 186         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 187       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 188       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 189       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 190
 191 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 192       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 193         the vr was also RET.
 194       * python/testSuite.py more tests added.
 195
 196 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 197       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 198       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 199       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 200         7.18 Integer types (see stdint.h)
 201         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 202       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 203         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 204         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 205         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 206         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 207         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 208         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 209         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 210
 211 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 212       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 213         VR files.
 214       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 215
 216 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 217       * Adaptation for porting to VC++:
 218         - src/gdcm.h
 219           o forced to use std namespace (for string to be known)
 220           o all class use __declspec export style on WIN32
 221         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 222           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 223       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 224         variable GDCM_DICT_PATH.
 225       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 226
 227 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 228       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 229         to native Python dictionary.
 230       * python/demo/test.py:
 231         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 232         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 233       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 234         PubElVals hashing table.
 235       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 236
 237 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 238       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 239         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 240       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 241       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 242       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 243         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 244       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 245
 246 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 247       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 248         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 249         that we can import de shadow classes without errors].
 250
 251 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 252       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 253       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 254       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 255       * src/Makefile prepared for python wrapping
 256
 257 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 258       * src/gdcmHeader.cxx :
 259         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 260           (see gdcmHeader::LoadElements).
 261         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 262           ReadInt16 and ReadInt32)
 263
 264 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 265       * src/gdcmHeader.cxx :
 266         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 267           method.
 268         - SetLgrElem renamed to SetLength
 269         - GetLgrElem renamed to GetLength
 270         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 271       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 272       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 273         due to IdoDude was cleaned out.
 274
 275 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 276       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 277         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 278         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 279         returning the unecessary skL (skipped length).
 280         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 281         it was redundant with the File position internals (by using
 282         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 283         jajun.
 284       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 285         on the libido specificities which are handled through class
 286         inheritance.
 287       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 288         added.
 289
 290 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 291       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 292         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 293
 294 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 295       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 296
 297 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 298       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 299         and _IdDcmSWAP_LONG.
 300
 301 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 302       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 303         May 23 2002. Needless to say we are running late...
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