ChangeLog

   1 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
   3
   4 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   5       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
   6       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
   7       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
   8       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
   9       * PACKAGER : adding all concerning windows
  10
  11 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  12       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
  13         garbage debug code.
  14       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
  15       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
  16         test suite reported error.
  17       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
  18         packaging a new release).
  19       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
  20       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
  21       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
  22         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
  23         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
  24
  25 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  26       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
  27       * src/gdcmHeader.h : formatting code
  28
  29 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  30       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
  31         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
  32         is made in an internal list to prevent this problem.
  33         Bug fix when output is empty.
  34         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
  35         correction.
  36       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
  37
  38 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  39       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
  40       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
  41         files. Added method to remove all files on the input
  42         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
  43         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
  44
  45 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  46       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
  47         when using make instal.
  48       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
  49         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
  50
  51 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  52       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
  53       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
  54
  55 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  56       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
  57         linux and WINDOWS !
  58       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
  59       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
  60
  61 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  62       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
  63         addon of the jpeg library)
  64       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
  65       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
  66       * INSTALL now points to web documentation
  67
  68 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  69       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
  70         gdcmUtil.h anymore.
  71       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
  72         clean target.
  73       * src/gdcm*.[cxx|h] :
  74         - to allow compilation with gcc 3.x
  75           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
  76           -- small fixes on exceptions.
  77           Note: linking not tested !
  78         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
  79           building stage.
  80       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
  81         dependent convertion).
  82
  83 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  84       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
  85         Changelog):
  86         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
  87         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
  88           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
  89         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
  90
  91 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  92       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
  93         compile
  94       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
  95         (FileName -> Filename)
  96
  97 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  98       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
  99         - UpdateProgress method should now be effective
 100         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
 101           to volumes),
 102         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
 103           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
 104           accelerating things).
 105         - when building a stack of images/volumes, files which are not
 106           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
 107           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
 108           in the stack (for the caller to notice the problem).
 109
 110 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 111       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
 112
 113 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 114       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
 115         between standard library (std) and vtk library (problems are found
 116         under Windows... thanks Windows !)
 117
 118 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 119       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
 120         debug stage).
 121       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
 122
 123 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 124       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
 125
 126 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 127       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
 128         called with different flags than the default ones (with automake).
 129         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
 130            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
 131         and went for warning fixes:
 132         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
 133           up from unused variables.
 134         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
 135       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
 136
 137 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 138       * gdcmPython/gdcm.i:
 139         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
 140           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
 141           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
 142         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
 143           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
 144           exported to Python a as cvar.
 145       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
 146         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
 147         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
 148         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
 149         C++ static methods).
 150       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
 151         with the above changes.
 152
 153 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 154       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
 155
 156 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 157       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
 158         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
 159         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
 160          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
 161          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
 162            a wrapper
 163          - Wrapper interface which wrap sources
 164         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
 165         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
 166       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
 167         files for compilation
 168
 169 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
 170       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
 171         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
 172         - vtk/Makefile.am now builds a library
 173         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
 174           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
 175           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
 176           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
 177           import library.
 178         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
 179           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
 180           + vtk/vtkGdcmReader.so and
 181           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
 182           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
 183         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
 184           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
 185         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
 186           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
 187       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
 188       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
 189         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
 190         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
 191         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
 192         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
 193         collision of various stl members (principally cout...).
 194       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
 195         file.
 196       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
 197          comply with above changes)
 198
 199 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 200       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
 201       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
 202         vtk data structure (an image Flip was required).
 203       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
 204       * cosmetic changes in documentation.
 205
 206 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 207       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
 208         unexisting file is given as argument.
 209       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
 210         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
 211         containing those images is now available at
 212           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
 213         with the name gdcmData.
 214         All the python scripts (including the package initialisation file
 215         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
 216         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
 217
 218 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 219       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
 220         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
 221         demo of the usage of this class.
 222         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
 223         at configure (or autogen.sh) stage.
 224
 225 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 226       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
 227         Notes on valgrind:
 228           - maximum info is obtained with a command of the form:
 229             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
 230                    --show-reachable=yes PrintHeader
 231           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
 232             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
 233             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
 234             (in fact further invocation to the STL would recollect the
 235              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
 236       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
 237         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
 238         Note: some images don't seem to work e.g.
 239             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
 240       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
 241         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
 242         make gdcm more thread friendly.
 243
 244 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 245       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
 246           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
 247         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
 248           gdcmHeader::_dicom_vr.
 249         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
 250         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
 251           VRHT*.
 252         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
 253
 254 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 255       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
 256         make install stage.
 257
 258 2003-04-9 JPR
 259       * UpdateGroupLength replaced by new one
 260
 261 2003-04-7 JPR
 262       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
 263         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
 264
 265 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 266       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 267       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
 268       * src:
 269         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
 270         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
 271           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
 272         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
 273           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
 274           carried the same semantics.
 275           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
 276         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
 277           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
 278         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
 279       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
 280       * gdcmGetXSize added
 281       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
 282       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
 283
 284 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 285       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
 286         (to avoid double call by end user).
 287       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
 288         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
 289
 290 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 291       * gdcm/Doc many doxygen changes:
 292         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
 293           the html.users end users oriented documentation and
 294           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
 295           oriented documentation.
 296         - README changed accordingly
 297         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
 298         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
 299           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
 300         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
 301           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
 302           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
 303       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
 304         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
 305       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
 306         ill-formed documentation sections.
 307       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
 308
 309 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 310       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
 311       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
 312         un*ces with sh-utils test utility.
 313       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
 314       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
 315       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
 316       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
 317       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
 318
 319 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 320       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
 321       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
 322
 323 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 324       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
 325       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
 326       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
 327       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
 328         compilation work.
 329       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
 330       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
 331
 332 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 333       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
 334         hence the user doesn't need this explicit call.
 335         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
 336           i.e. LoadElements() call removed.
 337       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
 338         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
 339       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
 340         for adding user defined new tags.
 341         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
 342         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
 343           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
 344
 345 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
 346       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
 347    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
 348    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
 349    with the autotools, included the python wrappers part.
 350       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
 351
 352 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 353       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
 354
 355 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 356       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
 357         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
 358         for usage).
 359       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
 360         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
 361         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
 362       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
 363         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
 364
 365 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 366       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
 367         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
 368         value of GDCM_DICT_PATH.
 369       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
 370
 371 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 372       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
 373       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
 374       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
 375         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
 376         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
 377
 378 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 379       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
 380         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
 381         gdcmHeader.h
 382       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
 383         (as opposed to gdcm.h)
 384       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
 385       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
 386         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
 387       * autogen.sh removed history related references to crea package.
 388
 389 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 390       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
 391         bug.
 392
 393 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 394       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
 395         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
 396         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
 397         of hidding away the python related distutils specific files
 398         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
 399         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
 400         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
 401         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
 402
 403 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 404       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
 405       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
 406         among the list of sources.
 407
 408 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 409       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
 410       * modifications in MSVC projects
 411
 412 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 413       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
 414         looks like we can move back to original usage of exception within
 415         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
 416         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
 417       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
 418         README file for usage added.
 419       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
 420         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
 421         testing the proper parsing of a Dicom related file.
 422         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
 423       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
 424       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
 425         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
 426           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
 427           Dicom public dictionnary were not accessible without an
 428           instance of class gdcmHeader.
 429         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
 430           require no instances at all to be invocated.
 431         - within gdcmDictSet this change required to change some method
 432           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
 433           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
 434       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
 435         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
 436       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
 437         the above to be effective.
 438       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
 439         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
 440       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
 441         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
 442         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
 443         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
 444         (for python dectection).
 445       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
 446         now avoids publishing the empty entries.
 447
 448 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 449       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
 450         ExtraPath reused :-P
 451       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 452
 453 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 454       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 455       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 456       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 457         and links
 458
 459 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 460       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 461         method. Doxygenation.
 462       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 463
 464 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 465       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 466         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 467         when using "python setup.py install".
 468       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 469         reexports the working classes.
 470       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 471         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 472         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 473         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 474         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 475         subdir (see the README file). This problem probably due to
 476         an combination of g++ and dynamic loading.
 477       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 478
 479 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 480       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 481         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 482         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 483         again in a python subdir, but the package itself is now in
 484         python/gdcmPython.
 485       * setup.py was cleaned up:
 486         - pythonIncludePath removed
 487         - python setup.py bdist target is now functional.
 488       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 489         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 490         accordingly.
 491 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 492       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 493       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 494         distutils installer is operational.
 495       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 496           shadow classes (from gdcm.py).
 497         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 498           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 499         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 500
 501
 502 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 503       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 504         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 505         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 506         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 507         dictionary.
 508         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 509           are now in the "???" group.
 510         - python/gdcm.i changed accordingly,
 511         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 512           of the above new functionalities in Python.
 513
 514 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 515       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 516         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 517           were definitively removed.
 518         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 519       * src/gdcmElValSet.cxx:
 520         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 521         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 522         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 523         - Added GetElementByName(string).
 524       * src/gdcmHeader.cxx: added
 525         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 526         - GetPubElValRepByName(string)
 527         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 528         - GetShaElValRepByName(string)
 529         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 530         - GetShaElValRepByName(string)
 531         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 532         - GetElValRepByName(string)
 533         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 534         - GetElValRepByName(string)
 535       * Doc/requirements.txt added.
 536
 537 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 538       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 539       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 540         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 541         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 542         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 543       * python/testSuite.py changed accordingly.
 544
 545 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 546       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 547         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 548              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 549               cannot be exported. [...]
 550               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 551               be exported. [...]
 552               This is caused by a designed limitation that once a template
 553               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 554               exported."
 555         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 556         limitation" of VC++ is a pitfall.
 557         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 558         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 559         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 560         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 561         library.
 562         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 563       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 564          dll under windows !!!!)
 565       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 566       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 567         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 568       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 569         (one) of image(s).
 570       * removed glib references
 571       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 572
 573 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 574       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 575         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 576         the files of the testsuite without using unittest.
 577       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 578       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 579       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 580         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 581
 582 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 583       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 584         values, but limits itself to values which are below a user specified
 585         size (by default 1024 bytes).
 586       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 587         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 588         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 589         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 590       * python/testSuite.py
 591         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 592         - two new examples added.
 593       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 594
 595 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 596       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 597         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 598       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 599       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 600       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 601
 602 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 603       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 604         the vr was also RET.
 605       * python/testSuite.py more tests added.
 606
 607 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 608       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 609       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 610       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 611         7.18 Integer types (see stdint.h)
 612         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 613       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 614         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 615         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 616         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 617         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 618         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 619         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 620         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 621
 622 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 623       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 624         VR files.
 625       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 626
 627 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 628       * Adaptation for porting to VC++:
 629         - src/gdcm.h
 630           o forced to use std namespace (for string to be known)
 631           o all class use __declspec export style on WIN32
 632         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 633           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 634       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 635         variable GDCM_DICT_PATH.
 636       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 637
 638 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 639       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 640         to native Python dictionary.
 641       * python/demo/test.py:
 642         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 643         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 644       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 645         PubElVals hashing table.
 646       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 647
 648 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 649       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 650         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 651       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 652       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 653       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 654         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 655       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 656
 657 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 658       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 659         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 660         that we can import de shadow classes without errors].
 661
 662 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 663       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 664       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 665       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 666       * src/Makefile prepared for python wrapping
 667
 668 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 669       * src/gdcmHeader.cxx :
 670         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 671           (see gdcmHeader::LoadElements).
 672         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 673           ReadInt16 and ReadInt32)
 674
 675 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 676       * src/gdcmHeader.cxx :
 677         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 678           method.
 679         - SetLgrElem renamed to SetLength
 680         - GetLgrElem renamed to GetLength
 681         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 682       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 683       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 684         due to IdoDude was cleaned out.
 685
 686 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 687       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 688         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 689         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 690         returning the unecessary skL (skipped length).
 691         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 692         it was redundant with the File position internals (by using
 693         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 694         jajun.
 695       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 696         on the libido specificities which are handled through class
 697         inheritance.
 698       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 699         added.
 700
 701 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 702       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 703         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 704
 705 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 706       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 707
 708 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 709       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 710         and _IdDcmSWAP_LONG.
 711
 712 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 713       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 714         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 715