]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
4993c111f7dc3e51114a05821c4965201ca6d87e
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
3 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
4       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
5 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
6       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
7 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
8       * Fix a few delete/delete[] mismatch
9 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
10       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
11       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
12       heuristics to get informations (look at different places).
13       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
14       sorting DICOM images based on different strategies.
15       * modified Makefiles accordingly.
16 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
17       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
18         when building in debug mode
19       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match 
20         src/win32/gdcmdll.dsp
21       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
22 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
23       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
24 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
25       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
26       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
27       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
28 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
29       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
30         the file
31       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
32       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
33         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
34       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
35         symbols... futur problem ?
36 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
37       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
38       * modified gdcm.dsw accordingly
39 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
40       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
41 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
42       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
43         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
44       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
45         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
46         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
47 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
48       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
49 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
50       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
51       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
52       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
53       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
54       * PACKAGER : adding all concerning windows
55 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
56       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
57         garbage debug code.
58       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
59       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
60         test suite reported error.
61       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
62         packaging a new release).
63       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
64       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
65       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
66         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
67         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
68 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
69       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
70       * src/gdcmHeader.h : formatting code
71 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
72       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
73         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
74         is made in an internal list to prevent this problem.
75         Bug fix when output is empty.
76         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
77         correction.
78       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
79 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
80       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
81       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
82         files. Added method to remove all files on the input
83         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
84         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
85 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
86       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
87         when using make instal.
88       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
89         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
90 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
91       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
92       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
93 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
94       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
95         linux and WINDOWS !
96       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
97       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
98 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
99       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
100         addon of the jpeg library)
101       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
102       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
103       * INSTALL now points to web documentation
104 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
105       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
106         gdcmUtil.h anymore.
107       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
108         clean target.
109       * src/gdcm*.[cxx|h] :
110         - to allow compilation with gcc 3.x
111           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
112           -- small fixes on exceptions.
113           Note: linking not tested !
114         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
115           building stage.
116       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
117         dependent convertion).
118 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
119       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
120         Changelog):
121         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
122         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
123           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
124         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
125 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
126       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to 
127         compile
128       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
129         (FileName -> Filename)
130 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
131       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
132         - UpdateProgress method should now be effective
133         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
134           to volumes),
135         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
136           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
137           accelerating things).
138         - when building a stack of images/volumes, files which are not
139           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
140           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
141           in the stack (for the caller to notice the problem).
142 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
143       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
144 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
145       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts 
146         between standard library (std) and vtk library (problems are found
147         under Windows... thanks Windows !)
148 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
149       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
150         debug stage).
151       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
152 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
153       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
154 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
155       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
156         called with different flags than the default ones (with automake).
157         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
158            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
159         and went for warning fixes:
160         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
161           up from unused variables.
162         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
163       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
164 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
165       * gdcmPython/gdcm.i:
166         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
167           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
168           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
169         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
170           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
171           exported to Python a as cvar.
172       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
173         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
174         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
175         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
176         C++ static methods).
177       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
178         with the above changes.
179 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
180       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
181 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
182       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
183         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
184         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
185          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
186          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
187            a wrapper
188          - Wrapper interface which wrap sources
189         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
190         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
191       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
192         files for compilation
193 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
194       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
195         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
196         - vtk/Makefile.am now builds a library
197         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
198           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
199           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
200           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
201           import library.
202         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
203           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
204           + vtk/vtkGdcmReader.so and
205           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
206           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
207         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
208           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
209         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
210           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
211       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
212       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
213         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
214         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
215         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
216         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
217         collision of various stl members (principally cout...).
218       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
219         file.
220       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
221          comply with above changes)
222 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
223       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
224       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
225         vtk data structure (an image Flip was required).
226       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
227       * cosmetic changes in documentation.
228 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
229       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
230         unexisting file is given as argument.
231       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
232         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
233         containing those images is now available at 
234           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
235         with the name gdcmData.
236         All the python scripts (including the package initialisation file
237         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
238         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
239 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
240       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
241         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
242         demo of the usage of this class.
243         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
244         at configure (or autogen.sh) stage.
245 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
246       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
247         Notes on valgrind:
248           - maximum info is obtained with a command of the form:
249             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
250                    --show-reachable=yes PrintHeader
251           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
252             allocation scheme through the usage of map and list. It looks 
253             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
254             (in fact further invocation to the STL would recollect the
255              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
256       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
257         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
258         Note: some images don't seem to work e.g.
259             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
260       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
261         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
262         make gdcm more thread friendly.
263 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
264       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
265           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
266         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
267           gdcmHeader::_dicom_vr.
268         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
269         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
270           VRHT*.
271         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
272 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
273       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
274         make install stage.
275 2003-04-9 JPR
276       * UpdateGroupLength replaced by new one
277 2003-04-7 JPR
278       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
279         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
280       
281 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
282       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
283       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
284       * src:
285         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
286         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
287           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
288         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
289           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
290           carried the same semantics.
291           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
292         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
293           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
294         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
295       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
296       * gdcmGetXSize added
297       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
298       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
299 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
301         (to avoid double call by end user).
302       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
303         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
304 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
305       * gdcm/Doc many doxygen changes:
306         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
307           the html.users end users oriented documentation and
308           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
309           oriented documentation.
310         - README changed accordingly
311         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
312         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
313           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
314         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
315           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying 
316           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
317       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
318         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
319       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
320         ill-formed documentation sections.
321       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
322 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
323       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
324       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
325         un*ces with sh-utils test utility.
326       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
327       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
328       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
329       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
330       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
331 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
332       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
333       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
334 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
335       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
336       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
337       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
338       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
339         compilation work.
340       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
341       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
342 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
343       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
344         hence the user doesn't need this explicit call.
345         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
346           i.e. LoadElements() call removed.
347       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
348         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
349       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
350         for adding user defined new tags.
351         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
352         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
353           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
354 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
355       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
356    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am, 
357    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
358    with the autotools, included the python wrappers part. 
359       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
360 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
361       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
362 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
363       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
364         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
365         for usage).
366       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
367         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
368         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
369       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
370         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
371 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
372       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
373         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
374         value of GDCM_DICT_PATH.
375       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
376 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
377       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
378       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
379       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
380         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
381         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
382 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
383       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
384         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
385         gdcmHeader.h
386       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
387         (as opposed to gdcm.h)
388       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
389       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
390         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
391       * autogen.sh removed history related references to crea package.
392 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
393       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
394         bug.
395 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
396       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
397         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
398         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
399         of hidding away the python related distutils specific files
400         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
401         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
402         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
403         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
404 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
405       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
406       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
407         among the list of sources.
408       
409 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
410       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
411       * modifications in MSVC projects
412 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
413       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
414         looks like we can move back to original usage of exception within
415         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
416         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
417       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
418         README file for usage added.
419       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
420         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
421         testing the proper parsing of a Dicom related file.
422         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
423       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
424       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
425         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
426           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
427           Dicom public dictionnary were not accessible without an
428           instance of class gdcmHeader.
429         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
430           require no instances at all to be invocated.
431         - within gdcmDictSet this change required to change some method
432           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
433           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
434       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
435         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
436       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
437         the above to be effective.
438       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
439         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
440       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
441         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
442         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
443         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
444         (for python dectection).
445       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
446         now avoids publishing the empty entries.
447 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
448       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
449         ExtraPath reused :-P
450       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
451 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
452       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
453       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
454       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
455         and links
456 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
457       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
458         method. Doxygenation.
459       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
460 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
461       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
462         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
463         when using "python setup.py install".
464       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
465         reexports the working classes.
466       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
467         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
468         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
469         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
470         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
471         subdir (see the README file). This problem probably due to
472         an combination of g++ and dynamic loading.
473       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
474 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
475       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
476         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
477         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
478         again in a python subdir, but the package itself is now in
479         python/gdcmPython.
480       * setup.py was cleaned up:
481         - pythonIncludePath removed
482         - python setup.py bdist target is now functional.
483       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
484         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
485         accordingly.
486 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
487       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
488       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
489         distutils installer is operational.
490       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
491           shadow classes (from gdcm.py).
492         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
493           instead of gdcmPython/demo/load.py.
494         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
495         
496 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
497       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
498         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
499         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
500         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
501         dictionary.
502         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
503           are now in the "???" group.
504         - python/gdcm.i changed accordingly,
505         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
506           of the above new functionalities in Python.
507 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
508       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
509         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
510           were definitively removed.
511         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
512       * src/gdcmElValSet.cxx:
513         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
514         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
515         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
516         - Added GetElementByName(string).
517       * src/gdcmHeader.cxx: added
518         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
519         - GetPubElValRepByName(string)
520         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
521         - GetShaElValRepByName(string)
522         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
523         - GetShaElValRepByName(string)
524         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
525         - GetElValRepByName(string)
526         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
527         - GetElValRepByName(string)
528       * Doc/requirements.txt added.
529 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
530       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
531       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
532         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of 
533         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
534         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
535       * python/testSuite.py changed accordingly.
536 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
537       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
538         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
539              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
540               cannot be exported. [...]
541               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
542               be exported. [...]
543               This is caused by a designed limitation that once a template
544               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
545               exported."
546         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
547         limitation" of VC++ is a pitfall.
548         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked 
549         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
550         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
551         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
552         library. 
553         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
554       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
555          dll under windows !!!!)
556       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
557       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
558         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
559       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set 
560         (one) of image(s).
561       * removed glib references
562       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
563 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
564       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
565         that only displays required tags and testAll.py that parses all
566         the files of the testsuite without using unittest.
567       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
568       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
569       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
570         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
571 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
572       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
573         values, but limits itself to values which are below a user specified
574         size (by default 1024 bytes).
575       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
576         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
577         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
578         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
579       * python/testSuite.py
580         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
581         - two new examples added.
582       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
583 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
584       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
585         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
586       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
587       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
588       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
589 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
590       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
591         the vr was also RET.
592       * python/testSuite.py more tests added.
593 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
594       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
595       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
596       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
597         7.18 Integer types (see stdint.h)
598         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
599       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
600         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
601         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
602         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
603         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
604         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
605         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
606         The rest of the changes we the necessary adaptations.
607 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
608       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
609         VR files.
610       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
611 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
612       * Adaptation for porting to VC++:
613         - src/gdcm.h
614           o forced to use std namespace (for string to be known)
615           o all class use __declspec export style on WIN32
616         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
617           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
618       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
619         variable GDCM_DICT_PATH.
620       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
621 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
622       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
623         to native Python dictionary.
624       * python/demo/test.py:
625         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
626         - takes an optional filename argument (the file to parse).
627       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
628         PubElVals hashing table. 
629       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
630 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
631       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
632         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
633       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
634       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
635       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
636         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
637       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
638 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
639       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
640         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
641         that we can import de shadow classes without errors].
642 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
643       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
644       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
645       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
646       * src/Makefile prepared for python wrapping
647 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
648       * src/gdcmHeader.cxx :
649         - Parsing of header is now separated from loading of element values
650           (see gdcmHeader::LoadElements).
651         - general clean up of hopefully all file access (creation of
652           ReadInt16 and ReadInt32)
653 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
654       * src/gdcmHeader.cxx :
655         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
656           method.
657         - SetLgrElem renamed to SetLength
658         - GetLgrElem renamed to GetLength
659         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
660       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
661       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
662         due to IdoDude was cleaned out.
663 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
664       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
665         concentrates on finding the value representation (when it exists).
666         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
667         returning the unecessary skL (skipped length).
668         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
669         it was redundant with the File position internals (by using
670         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
671         jajun.
672       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
673         on the libido specificities which are handled through class 
674         inheritance.
675       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
676         added. 
677 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
678       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
679         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
680 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
681       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
682 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
683       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
684         and _IdDcmSWAP_LONG.
685 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
686       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
687         May 23 2002. Needless to say we are running late...
688