]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
4e6982ee88b4a6bd7112e8a47e9e44620b83b6ff
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
3     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
4     doxygen.
5   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
6   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
7     pointlessly wrapped (see
8     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
9   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
10     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
11     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
12     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
13     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
14       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
15            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
16       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
17          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
18
19 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
20   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
21     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
22
23 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
24   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
25     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
26     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
27   * TODO added new entry.
28   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
29     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
30     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
31     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
32       variable names for semantical coherence.
33
34 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
35   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
36   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
37   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
38   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
39   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
40   compilation time jpeg option.
41
42 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
43   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
44     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
45     reproduce at home.
46   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
47   Thanks dcmtk crew !
48
49 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
50   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
51   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
52     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
53   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
54   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
55   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
56   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
57     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
58     from File:: to PixelConvert::.
59
60 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
61   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
62     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
63      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
64      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
65
66 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
67   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
68   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
69   like this:
70     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
71   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
72   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
73   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
74
75 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
76   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
77     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
78     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
79     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
80     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
81       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
82       (for the time being this is better than having them attach to
83        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
84     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
85       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
86     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
87       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
88       gdcmPixelConvert::
89
90 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
91   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
92   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
93     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
94       clean up of RLE related code. 
95   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
96     - src/gdcmRLE.cxx removed
97     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
98     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
99     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
100   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
101     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
102       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
103       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
104
105 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
106   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
107     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
108       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
109       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
110       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
111       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
112       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
113       offsets.
114   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
115     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
116         with the retired Parse7Fe0().
117     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
118     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
119
120 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
121   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
122     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
123     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
124     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
125   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
126     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
127       to return an unused length.
128
129 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
130   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
131     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
132     to use to do simple stuff.
133
134 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
135   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
136     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
137     copying of the file within different directory, configure header file to
138     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
139     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
140
141 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
142   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
143      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
144        with it's binary name).
145      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
146        the Website to be more complete.
147      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
148        doxygenated documentation.
149      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
150        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
151                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
152   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
153   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
154    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
155
156 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
157   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
158    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
159
160 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
161   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
162     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
163     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
164     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
165     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
166   * GDCMHOME clean up:
167     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
168       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
169       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
170   * Autotools clean up:
171     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
172     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
173
174 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
175   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
176   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
177   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
178
179 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
180   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
181     describing TODO entries and used it for new entries.
182   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
183     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
184     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
185   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
186     documentation itself, but the website) moved to html and
187     placed in directory Doc/Website:
188     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
189     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
190     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
191   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
192   * CMakeLists.txt changed accordingly.
193   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
194     DeveloppersPython.html
195   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
196
197 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
198   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
199     of gdcm Web site.
200
201 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
202   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
203     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
204          we can now delete[] it safely  
205   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
206     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
207   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
208
209 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
210   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
211     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
212     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
213     pointed content.
214
215 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
216   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
217   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
218
219 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
220   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
221     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
222     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
223     an example of usage.
224     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
225       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
226     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
227       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
228     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
229     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
230     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
231
232 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
233   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
234     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
235     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
236     in class 
237     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
238       and associated accessors. Doxygenation of the class.
239     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
240       accessors added.
241     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
242       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
243     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
244     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
245
246 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
247   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
248     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
249       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
250            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
251            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
252            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
253            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
254            the same group and element all share the same (group, element)
255            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
256            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
257            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
258            consider the following definition of a TagKey:
259            - let Group, Element be the string representation of the
260              group and element dicom tag members,
261            - let ItemNumber be the string representation of the integer
262              index of the considered item number of a sequence,
263            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
264            the form:
265               /ItemNumber#Group|Element
266            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
267            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
268               Group|Element<SeqTag>
269            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
270            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
271            string e.g.
272                0028|1201
273            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
274            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
275            string e.g.
276                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
277     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
278       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
279       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
280     - src/gdcmDocEntry.cxx:
281       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
282          Key member.
283       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
284     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
285     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
286       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
287       -- now has a new BaseTagKey member.
288       -- STYLE.
289   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
290     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
291     truly belongs.
292     This poses the problem with the semantics of the following lines
293        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
294        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
295        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
296     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
297     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
298     order to get things working the dicom dictionary was altered !
299     Please fix things urgently...
300   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
301     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
302     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
303     set to OW:
304       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
305       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
306       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
307   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
308     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
309   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
310
311 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
312   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
313
314 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
315   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
316     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
317   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
318   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
319
320 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
321   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
322     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
323   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
324     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
325   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
326     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
327   * TODO updated
328   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
329     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
330   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
331   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
332     exception_on_error parameter.
333     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
334     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
335     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
336
337 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
338   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
339   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
340     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
341   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
342   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
343   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
344     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
345   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
346
347 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
348   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
349     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
350
351 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
352   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
353        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
354                  
355 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
356   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
357         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
358
359 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
360    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
361    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
362      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
363      is now in static in the gdcmDebug class
364    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
365    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
366
367 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
368    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
369      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
370    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
371      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
372      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
373      that displays position and size).
374    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
375      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
376      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
377      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
378      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
379      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
380      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
381         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
382      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
383      commiting changes).
384    * Test/CMakeLists.txt:
385       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
386       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
387         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
388         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
389    * TODO updated.
390
391 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
392    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
393      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
394      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
395      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
396      - removal of typedef duplication.
397      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
398      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
399    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
400       - printf polluting ctest removed.
401       - TAB removal for comminting
402    * Test:
403      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
404        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
405        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
406        this test creates them.
407        Note: we need to validate each reference image, but before that
408              I'd like to rename them with a more explicit name...
409      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
410    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
411      including each header needed).
412
413 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
414    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
415      test suite to the Example directory. Are concerned:
416      - PrintHeader.cxx
417      - TestDcm2Acr.cxx
418      - TestFindTags.cxx
419      - TestWrite.cxx was
420      - TestWriteSimple.cxx
421    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
422      image gdcmData/oldACR00001.ima
423
424 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
425    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
426      with removal from gdcmData):
427       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
428       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
429       - US.3405.1.dcm
430      Added the following because after last cvs update, they cause
431        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
432      to segfault:
433       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
434       - oldACR00001.ima
435    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
436      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
437      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
438      form of test...
439    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
440      we don't need to black list the following images anymore:
441       - 8BitsUncompressedColor.dcm
442       - OT-PAL-8-face.dcm
443       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
444    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
445      fixes and the beautified code ;-)
446      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
447      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
448      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
449            improve the test suite). The bug could be detected by using
450            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
451            or by using
452            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
453            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
454
455 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
456    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
457          - replace by uggly but working old code :-(
458                 A lot of things should be OK again.
459         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
460         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
461         (twice, withing a fortnigh ...)         
462
463 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
464    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
465      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
466    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
467      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
468      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
469                    - OT-PAL-8-face.dcm
470                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
471    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
472      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
473      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
474      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
475      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
476      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
477      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
478      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
479      image.
480    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
481      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
482      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
483      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
484    
485 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
486   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
487   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
488                           (instead of infinite loop)
489   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
490
491 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
492    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
493
494 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
495    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
496                     when SamplesPerPixel =3
497          - now Write is no longer confused by 
498                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
499          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
500                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
501    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
502                     (in order to split the job that has not to be done 
503                                         for gdcmDicomDir)
504
505 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
506    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
507      loop on the same image until memory went out. 
508      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
509    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
510      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
511
512 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
513    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
514             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
515                                 is added a the end, when necessary.
516             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
517                       now written correctly
518                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
519                                 (even for odd groups) 
520         Note : only Explicit Value Representation was checked.
521                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
522
523 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
524    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
525    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
526      coding style).
527
528 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
529    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
530      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
531    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
532
533 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
534    FIX : gdcmDocument.cxx
535       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
536         code 'beautyfication' :-(
537       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
538
539 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
540    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
541                  : to allow user to create his own Sequences
542         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
543
544 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
545         
546         - gdcmBinEntry
547           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
548           
549    - gdcmDocEntry
550           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
551           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
552           
553         - gdcmDocEntrySet
554           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
555           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
556      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
557      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
558      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
559      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
560                                             guint16 element,
561                                             std::string vr     = "unkn",
562                                             std::string fourth = "unkn",
563                                             std::string name   = "unkn"); 
564           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
565      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
566      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
567      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
568      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
569      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
570           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
571      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
572           
573         - gdcmDocument
574      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
575      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
576      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
577      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
578      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
579                                         FILE *_fp, FileType type);
580      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
581      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
582      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
583      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
584      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
585      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
586      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
587      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
588                                             guint16 element,
589                                             std::string vr     = "unkn",
590                                             std::string fourth = "unkn",
591                                             std::string name   = "unkn");
592      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
593      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
594      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
595      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
596                                                                                                                  
597         - gdcmElementSet
598           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
599           
600    - gdcmSeqEntry
601           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
602  
603    - gdcmSQItem
604      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
605      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
606      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
607      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
608
609    - gdcmValEntry
610          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
611                                   
612 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
613     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
614       The default constructor invoked by the line
615          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
616       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
617       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
618       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
619     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
620       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
621       Could anyone explain why ?
622     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
623       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
624       code related to gdcmBinEntry).
625
626 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
627     * In order to fix memory leaks:
628      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
629        some delete calls.
630      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
631      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
632        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
633        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
634        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
635      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
636      - src/gdcmDocument.cxx:
637        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
638           from dynamic stores.
639        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
640           was causing memory leaks.
641      - src/gdcmSQItem.cxx:
642        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
643           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
644        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
645           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
646           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
647           This avoids SegFaulting.
648      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
649     * Conclusion:
650      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
651        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
652        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
653      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
654        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
655      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
656        segfaults).
657     * Erroneous leading white fix:
658      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
659        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
660      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
661      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
662     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
663     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
664
665
666 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
667     * In order to fix writing of dicom files:
668      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
669      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
670      - src/gdcmDocument.cxx:
671        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
672        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
673        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
674           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
675           manner.
676        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
677           to only declared) and build on top of
678           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
679        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
680      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
681        for usage in destructor and treatement of promotion in
682        ::ReplaceOrCreateByNumber().
683      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
684       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
685     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
686       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
687       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
688       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
689
690 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
692       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
693       learned that:
694           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
695           soon as possible by globally disabling memory caching.
696           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
697           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
698       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
699       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
700       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
701     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
702       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
703       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
704       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
705         with 1.
706       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
707       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
708       understand why the list is empty...).
709     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
710     * Doc/License.txt added.
711
712 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
713     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
714       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
715         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
716         the padding problem.
717       - general clean up, simplification, and coding style.
718       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
719     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
720
721 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
722    *  gdcmSeqEntry.cxx
723            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
724                 - fix the display of SQItem ordinal number
725       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
726                 - remove some useless never written private methods     
727                 
728 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
729    * gdcmBinEntry.cxx 
730       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
731            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
732               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
733                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
734    * dcmDocument.cxx
735       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
736               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
737            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
738       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
739    * gdcmFile.cxx
740       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
741    * gdcmSQItem.h
742       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
743             a (relative) Item identier inside a given Sequence
744             \warning : some pb remaining around this number
745                                 will be solved asap
746       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
747    * gdcmValEntry.cxx 
748       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
749
750 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
751     * Memory leak hunt with the following command:
752       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
753                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
754       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
755       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
756       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
757           grep "MEMORY LEAK" src/*
758       Here are two typical examples which I can't help fixing:
759       -----
760           #include <string>
761           int main() {
762              std::string name;
763              char * test = "babo";
764              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
765                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
766              name.clear();   //// Doesn't help !
767              return 0;
768           }
769       -----
770           #include <string>
771           #include <iostream>
772           int main() {
773              std::string line;
774              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
775              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
776                                         //// of 1320 bytes in call to
777                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
778             return 0;
779           }
780       -----
781
782
783 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
784     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
785       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
786         and related, moved away to gdcmDocument.
787       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
788         the corresponding protected accessors of inherited class
789         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
790         declared friend of class gdcmDocument (see below).
791       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
792       - Clean up of undefined or unused methods.
793     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
794       account the changes to gdcmHeader.h).
795     * src/gdcmDocument.h:
796       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
797         changes to gdcmHeader.h).
798       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
799         (see changes to gdcmHeader.h).
800       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
801       - Clean up of undefined or unused methods.
802     * src/gdcmDocument.cxx:
803       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
804       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
805       - some std::string properly set to VRKey
806     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
807       references to gdcmDocument. 
808     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
809     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
810       cvs repository gdcmData.
811
812 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
813     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
814     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
815       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
816     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
817     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
818       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
819     * src/gdcmDocument.cxx: 
820       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
821         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
822       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
823         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
824         removed. Reverting to previous code segment with the proper
825         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
826         Note: this was (partially) breaking the python test suite
827               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
828               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
829     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
830     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
831       now taken into account.
832     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
833       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
834     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
835       on posix.
836     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
837       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
838     * .... alas, the python testSuite is still broken.
839
840 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
841     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
842       gdcmGlob
843     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
844     * src/gdcmUtil.h : export methods
845
846 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
847     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
848       to right behavior
849     * Initial addition of automatic python testing
850     * Initial addition of automatic image comparison
851
852 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
853     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
854       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
855
856 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
857      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
858      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
859      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
860
861 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
862      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
863        new concepts (and new classes) :
864        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
865         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
866         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
867        a Sequence is composed of Items.
868        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
869        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
870        (never taken into account)
871        Our unability to add a new 'entry' in the header
872        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
873        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
874        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
875        nothing is finished.
876        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
877
878 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
879      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
880      
881 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
882      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
883        file prefix (SetFilePrefix)
884
885 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
886      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
887        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
888        baseline.
889      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
890        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
891
892 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
893      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
894        dicom image
895
896 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
897      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
898      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
899        between the developper and user version.
900      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
901      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
902
903 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
904      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
905        when using cmake.
906
907 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
908      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
909                src directory, now generated in the build dir.
910             2. Tests as mentionned smarter
911             3. Some clean up
912             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
913           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
914           where we could set the institution name / patient name...
915
916        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
917               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
918                  (this was not true before)
919
920 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
921      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
922            SeQuence indented printing of Dicom Header.
923      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
924            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
925            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
926      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
927            tree-like structure of a Dicom Header.
928      * FIX Test code cleaning     
929            
930 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
931      * ENH: Adding automatic testing
932        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
933        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
934        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
935        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
936           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
937           too many projects
938      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
939      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
940        one file instead of seven + some small cleanup
941
942 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
943      * ENH Minor changes to the Print() methods.
944      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
945            Header printing. Example given with :
946            > PrintHeader fileName  2 new
947           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
948            
949 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
950      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
951          1. I have added some unsigned where needed
952          2. Some function parameter not used -> (void)
953          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
954          4. g++ don't like character '\' in comment
955          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
956                     this really need to be fixed
957          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
958          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
959                     this also really need to be fixed
960          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
961                     remove compression file 
962                     (as we only do decompression, right ?)     
963      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
964
965 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
966      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
967            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
968            defaulted to yspacing
969            
970 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
971      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
972      * ENH add parameters :
973                bool  exception_on_error = false, 
974                bool  enable_sequences   = false,
975                bool  ignore_shadow      = false
976            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
977      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
978            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
979               
980 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
981      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
982      
983 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
984      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
985      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
986              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
987              
988 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
989      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
990          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
991
992 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
993      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
994        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
995        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
996        in gdcmHeader.
997      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
998        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
999        already does the job.
1000      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1001        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1002
1003 2004-03-30 Benoit Regrain
1004      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1005        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1006        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1007
1008 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1009      * ENH : Check on file type to be written moved
1010              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1011      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1012              when end-of-list is reached
1013            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1014
1015 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1016      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1017      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1018      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1019        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1020
1021 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1022      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1023        now contains all the gdcmGlobal related code.
1024      * minor coding style and doxygenation changes.
1025
1026 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1027      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1028        now contains all the Debug related code.
1029      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1030      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1031        CreateCleanString) removed.
1032      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1033      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1034      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1035      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1036        src/gdcmDirList.cxx)
1037
1038 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1039      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1040
1041 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1042      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1043            big endian made volumes
1044      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1045            end user to instanciate class gdcmParser
1046           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1047
1048 2004-03-22 Benoit Regrain
1049      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1050      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1051              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1052
1053 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1054      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1055            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1056            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1057            or build from the files held (recursively) in a Directory
1058            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1059            gdcmObject::SetBoundaries() added
1060
1061 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1062      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1063                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1064      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1065            DICOMDIR
1066      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1067            about the name
1068
1069 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1070      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1071                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1072
1073 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1074      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1075            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1076            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1077            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1078            to allow making gdcDicomDir object.
1079      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1080           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1081
1082 2004-02-11 Benoit Regrain
1083      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1084              when using from python
1085
1086 2004-02-10 Benoit Regrain
1087      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1088      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1089      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1090              directory parsing
1091
1092 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1093      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1094              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1095              - class gdcmMeta created
1096      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1097              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1098      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1099
1100 2004-02-05 Benoit Regrain
1101      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1102              header entries
1103      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1104      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1105
1106 2004-02-04 Benoit Regrain
1107      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1108      * FIX : sort the images in the dicom dir
1109      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1110      * ADD : a python demo
1111
1112 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1113      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1114      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1115              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1116              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1117              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1118      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1119            to make full checking easier
1120         
1121 2004-02-04 Benoit Regrain
1122      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1123      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1124
1125 2004-02-03 Benoit Regrain
1126      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1127      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1128      * Bug fix and print add-on
1129
1130 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1131      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1132      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1133      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1134      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1135            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1136         
1137 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1138      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1139              iterator on last
1140              of the last synonym :-(
1141      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1142              for DICOMDIR ;-)
1143      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1144      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1145      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1146            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1147       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1148
1149 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1150      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1151            no longer writes 'Un' on disk
1152      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1153      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1154            the length (for Palette expanded images)
1155            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1156      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1157            (that broke Write). Replaced by UL.
1158            Aware user will reload the field if he 
1159            thinks it's necesssary
1160              
1161 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1162      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1163        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1164        IsReadable() methods.
1165        
1166      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1167       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1168       but so usefull for people that miss them ;-)
1169       
1170      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1171        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1172
1173 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1174      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1175
1176 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1177      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1178              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1179         The TRUE value for this param has to be used 
1180         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1181         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1182      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1183              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1184         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1185         
1186      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1187              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1188              Fixed
1189
1190      * gdcmHeader add the method
1191              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1192         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1193         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1194         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1195
1196 2004-01-26 Benoit Regrain
1197      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1198        in the print and add a third level of print to print them
1199
1200 2004-01-23 Benoit Regrain
1201      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1202      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1203      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1204        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1205
1206 2004-01-22 Benoit Regrain
1207      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1208      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1209
1210 2004-01-19 Benoit Regrain
1211      * Add the use of shadow dictionaries
1212      * bug fix and coding style
1213
1214 2004-01-19 Benoit Regrain
1215      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1216      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1217      * Add the update of header entries using the shadow library
1218
1219 2004-01-19 Benoit Regrain
1220      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1221      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1222        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1223        of dicom dir parsing
1224      * bug fix under python
1225
1226 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1227     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1228     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1229     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1230     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1231
1232 2004-01-15 Benoit Regrain
1233      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1234        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1235        when the gdcmDictSet will be destroyed
1236      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1237        gdcmDictSet
1238
1239 2004-01-15 Benoit Regrain
1240      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1241        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1242        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1243        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1244      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1245
1246 2004-01-14 Benoit Regrain
1247      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1248      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1249      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1250      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1251
1252 2004-01-13 Benoit Regrain
1253      * src/*.[h|cxx] : coding style
1254      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1255
1256 2004-01-13 Benoit Regrain
1257      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1258      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1259        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1260      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1261
1262 2004-01-12 Benoit Regrain
1263      * src/*.h : add comments
1264      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1265      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1266        directly setted in the source code
1267      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1268        gdcmTS and gdcmVR
1269
1270 2004-01-09 Benoit Regrain
1271      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1272      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1273
1274 2004-01-07 Benoit Regrain
1275      * Modification to compile with the distutils.
1276      * Bug fix in code
1277
1278 2003-12-10 Benoit Regrain
1279      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1280        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1281      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1282        made in the source code
1283
1284 2003-12-10 Benoit Regrain
1285      * Update Windows projects and .cvsignore files
1286
1287 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1288      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1289            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1290            if he wants to.
1291            gdcmElValSet:Print takes it into account
1292
1293 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1294      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1295      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1296      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1297
1298 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1299       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1300              on the ListTag listElem member,
1301              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1302       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1303              with the tagHt member and the listElem member.
1304              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1305
1306       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1307              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1308                             if bug fixing is necessary), for internal
1309                             use only
1310              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1311                             or to allow Parser going on.
1312              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1313              with a length (not 0000) is found
1314       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1315                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1316                 (to be written)
1317
1318 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1319      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1320      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1321           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1322      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1323
1324 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1325      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1326
1327 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1328      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1329           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1330
1331 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1332      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1333      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1334              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1335              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1336
1337 2003-11-05 Benoit Regrain
1338      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1339                        : Explicit error messages
1340      * in __init__.py  : Related modif
1341
1342 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1343      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1344            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1345            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1346      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1347                     (vtkGdcmReader compliant)           
1348       
1349 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1350      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1351        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1352        
1353 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1354      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1355            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1356
1357 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1358      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1359                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1360              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1361              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1362              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1363              such an image :
1364              After gdcmHeader :
1365               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1366               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1367               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1368      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1369              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1370
1371 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1372      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1373              
1374 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1375      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1376            being coherents dicom files.
1377      
1378 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1379      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1380            from medcon lib !
1381      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1382      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1383      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1384      * ENH: Add include dir to medcon lib
1385      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1386            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1387             
1388 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1389       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1390         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1391           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1392       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1393
1394 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1395       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1396         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1397         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1398       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1399       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1400
1401 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1402       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1403                                                
1404 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1405       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1406       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1407       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1408       
1409 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1410       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1411       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1412       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1413       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1414       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1415       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1416              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1417         But it fasten debug compilation time.
1418             
1419 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1420       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1421         (they are compressed as 2 planes images, 
1422          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1423
1424 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1425       * Now CheckRead takes into account :
1426          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1427          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1428       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1429        (breaks DicomWorks)
1430
1431 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1432       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1433              one should remove the '\'
1434         
1435 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1436       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1437         (wrong lengths in header)
1438         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1439       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1440         (breaks DicomWorks)
1441
1442 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1443       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1444         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1445
1446 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1447       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1448       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1449
1450 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1451       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1452      
1453 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1454       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1455         (the patch is easy to remove)
1456       * cosmetic changes to avoid warnings
1457       
1458 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1459       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1460         no need to press 'r' now.
1461    
1462 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1463       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1464         to new Jpeg Lossless decompressor
1465       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1466       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1467       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1468                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1469 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1470       * general anonymisation in gdcmData
1471       * adding the 'color files' from
1472         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1473       * adding some well knowed bugged-header images
1474       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1475         waiting for their inclusion in Python testsuite
1476
1477 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1478     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1479       no longer seg faults when file is not found
1480
1481 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1482      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1483        MultiFrame images
1484
1485 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1486      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1487
1488 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1489      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1490         OpenFile takes it into account
1491      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1492      * Missing elements added in dicomV3.dic
1493       (just to be affraid : have a look at
1494        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1495        and do it again next year ;->
1496
1497 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1498      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1499        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1500        But there are NOT. It's fixed !
1501        
1502 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1503      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1504      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1505          
1506 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1507      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1508              an ACR-NEMA / DICOM one.
1509      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1510              is not gdcm Readable
1511      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1512              is now decoded.
1513         
1514 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1515      * FIX: CMake generate now documentation
1516      * ENH: out of source doc build !
1517      * ENH: Generate both user and dev documentation
1518      * ENH: Should work on windows too
1519      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1520      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1521      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1522      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1523                      
1524 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1525      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1526      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1527      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1528         window level & window width
1529
1530 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1531      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1532      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1533      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1534      
1535 2003-10-06  Emanuel Ollart
1536      * FIX : compilation process wad broken.
1537              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1538         
1539 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1540      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1541      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1542      
1543 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1544      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1545            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1546                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1547       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1548
1549 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1550       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1551         to remain compliant with already defined strings, 
1552         like Transfert Syntax UID and others)
1553
1554 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1555       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1556              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1557         
1558 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1559       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1560       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1561
1562 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1563       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1564         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1565               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1566       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1567
1568 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1569       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1570
1571 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1572       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1573         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1574
1575 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1576       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1577          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1578          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1579          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1580           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1581                                             YBR_RCT files.
1582           (no sample found :-(
1583
1584 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1585       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1586         Two reasons: - clear things
1587                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1588                        suffer anymore VC++ complains
1589
1590 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1591       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1592       * removed leaks
1593
1594 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1595       * The lines are now eigthy characters long.for 
1596         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1597
1598 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1599       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1600         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1601         previous commis of Malaterre)
1602       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1603         before the last Malaterre's commit.
1604
1605 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1607         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1608       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1609         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1610
1611 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1612       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1613         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1614         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1615
1616 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1617       * Cosmetic changes:
1618         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1619           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1620           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1621           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1622         - PACKAGER corrected
1623         - DEVELOPPER added.
1624         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1625       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1626
1627 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1628       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1629
1630 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1631       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1632
1633 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1634       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1635
1636 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1637       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1638
1639 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1640       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1641         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1642         heuristics to get informations (look at different places).
1643       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1644         sorting DICOM images based on different strategies.
1645       * modified Makefiles accordingly.
1646
1647 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1648       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1649         when building in debug mode
1650       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1651         src/win32/gdcmdll.dsp
1652       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1653
1654 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1655       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1656             to valgrind.
1657
1658 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1660       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1661                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1662       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1663
1664 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1665       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1666         the file
1667       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1668       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1669         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1670       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1671         symbols... future problem ?
1672
1673 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1675       * modified gdcm.dsw accordingly
1676
1677 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1678       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1679
1680 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1681       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1682         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1683       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1684         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1685         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1686
1687 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1688       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1689
1690 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1691       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1692       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1693       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1694       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1695       * PACKAGER : adding all concerning windows
1696
1697 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1698       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1699         garbage debug code.
1700       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1701       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1702         test suite reported error.
1703       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1704         packaging a new release).
1705       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1706       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1707       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1708         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1709         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1710
1711 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1713       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1714
1715 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1716       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1717         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1718         is made in an internal list to prevent this problem.
1719         Bug fix when output is empty.
1720         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1721         correction.
1722       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1723
1724 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1725       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1726       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1727         files. Added method to remove all files on the input
1728         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1729         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1730
1731 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1732       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1733         when using make instal.
1734       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1735         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1736
1737 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1738       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1739       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1740
1741 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1742       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1743         linux and WINDOWS !
1744       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1745       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1746
1747 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1748       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1749         addon of the jpeg library)
1750       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1751       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1752       * INSTALL now points to web documentation
1753
1754 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1755       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1756         gdcmUtil.h anymore.
1757       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1758         clean target.
1759       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1760         - to allow compilation with gcc 3.x
1761           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1762           -- small fixes on exceptions.
1763           Note: linking not tested !
1764         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1765           building stage.
1766       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1767         dependent convertion).
1768
1769 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1770       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1771         Changelog):
1772         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1773         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1774           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1775         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1776
1777 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1778       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1779         compile
1780       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1781         (FileName -> Filename)
1782
1783 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1784       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1785         - UpdateProgress method should now be effective
1786         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1787           to volumes),
1788         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1789           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1790           accelerating things).
1791         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1792           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1793           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1794           in the stack (for the caller to notice the problem).
1795
1796 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1797       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1798
1799 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1800       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1801         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1802         under Windows... thanks Windows !)
1803
1804 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1805       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1806         debug stage).
1807       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1808
1809 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1810       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1811
1812 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1813       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1814         called with different flags than the default ones (with automake).
1815         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1816            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1817         and went for warning fixes:
1818         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1819           up from unused variables.
1820         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1821       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1822
1823 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1824       * gdcmPython/gdcm.i:
1825         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1826           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1827           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1828         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1829           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1830           exported to Python a as cvar.
1831       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1832         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1833         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1834         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1835         C++ static methods).
1836       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1837         with the above changes.
1838
1839 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1840       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1841
1842 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1843       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1844         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1845         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1846          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1847          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1848            a wrapper
1849          - Wrapper interface which wrap sources
1850         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1851         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1852       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1853         files for compilation
1854
1855 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1856       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1857         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1858         - vtk/Makefile.am now builds a library
1859         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1860           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1861           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1862           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1863           import library.
1864         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1865           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1866           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1867           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1868           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1869         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1870           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1871         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1872           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1873       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1874       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1875         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1876         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1877         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1878         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1879         collision of various stl members (principally cout...).
1880       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1881         file.
1882       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1883         comply with above changes)
1884
1885 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1886       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1887       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1888         vtk data structure (an image Flip was required).
1889       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1890       * cosmetic changes in documentation.
1891
1892 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1893       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1894         unexisting file is given as argument.
1895       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1896         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1897         containing those images is now available at
1898           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1899         with the name gdcmData.
1900         All the python scripts (including the package initialisation file
1901         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1902         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1903
1904 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1905       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1906         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1907         demo of the usage of this class.
1908         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1909         at configure (or autogen.sh) stage.
1910
1911 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1912       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1913         Notes on valgrind:
1914           - maximum info is obtained with a command of the form:
1915             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1916                      --show-reachable=yes PrintHeader
1917           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1918             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1919             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1920             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1921              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1922       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1923         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1924         Note: some images don't seem to work e.g.
1925             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1926       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1927         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1928         make gdcm more thread friendly.
1929
1930 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1931       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1932           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1933         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1934           gdcmHeader::_dicom_vr.
1935         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1936         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1937           VRHT*.
1938         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1939
1940 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1941       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1942         make install stage.
1943
1944 2003-04-9 JPR
1945       * UpdateGroupLength replaced by new one
1946
1947 2003-04-7 JPR
1948       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1949         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1950
1951 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1952       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1953       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1954       * src:
1955         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1956         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1957           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1958         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1959           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1960           carried the same semantics.
1961           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1962         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1963           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1964         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1965       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1966       * gdcmGetXSize added
1967       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1968       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1969
1970 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1971       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1972         (to avoid double call by end user).
1973       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1974         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1975
1976 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1977       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1978         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1979           the html.users end users oriented documentation and
1980           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1981           oriented documentation.
1982         - README changed accordingly
1983         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1984         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1985           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1986         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1987           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1988           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1989       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1990         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1991       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1992         ill-formed documentation sections.
1993       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1994
1995 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1996       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1997       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1998         un*ces with sh-utils test utility.
1999       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2000       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2001       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2002       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2003       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2004
2005 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2006       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2007       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2008
2009 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2010       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2011       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2012       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2013       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2014         compilation work.
2015       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2016       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2017
2018 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2019       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2020         hence the user doesn't need this explicit call.
2021         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2022           i.e. LoadElements() call removed.
2023       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2024         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2025       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2026         for adding user defined new tags.
2027         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2028         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2029           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2030
2031 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2032       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2033         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2034         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2035         with the autotools, included the python wrappers part.
2036       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2037
2038 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2039       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2040
2041 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2042       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2043         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2044         for usage).
2045       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2046         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2047         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2048       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2049         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2050
2051 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2052       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2053         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2054         value of GDCM_DICT_PATH.
2055       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2056
2057 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2058       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2059       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2060       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2061         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2062         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2063
2064 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2065       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2066         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2067         gdcmHeader.h
2068       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2069         (as opposed to gdcm.h)
2070       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2071       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2072         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2073       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2074
2075 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2076       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2077         bug.
2078
2079 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2080       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2081         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2082         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2083         of hidding away the python related distutils specific files
2084         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2085         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2086         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2087         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2088
2089 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2090       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2091       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2092         among the list of sources.
2093
2094 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2095       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2096       * modifications in MSVC projects
2097
2098 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2099       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2100         looks like we can move back to original usage of exception within
2101         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2102         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2103       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2104         README file for usage added.
2105       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2106         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2107         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2108         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2109       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2110       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2111         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2112           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2113           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2114           instance of class gdcmHeader.
2115         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2116           require no instances at all to be invocated.
2117         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2118           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2119           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2120       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2121         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2122       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2123         the above to be effective.
2124       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2125         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2126       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2127         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2128         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2129         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2130         (for python dectection).
2131       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2132         now avoids publishing the empty entries.
2133
2134 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2135       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2136         ExtraPath reused :-P
2137       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2138
2139 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2140       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2141       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2142       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2143         and links
2144
2145 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2146       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2147         method. Doxygenation.
2148       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2149
2150 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2151       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2152         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2153         when using "python setup.py install".
2154       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2155         reexports the working classes.
2156       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2157         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2158         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2159         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2160         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2161         subdir (see the README file). This problem probably due to
2162         an combination of g++ and dynamic loading.
2163       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2164
2165 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2166       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2167         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2168         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2169         again in a python subdir, but the package itself is now in
2170         python/gdcmPython.
2171       * setup.py was cleaned up:
2172         - pythonIncludePath removed
2173         - python setup.py bdist target is now functional.
2174       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2175         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2176         accordingly.
2177
2178 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2179       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2180       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2181         distutils installer is operational.
2182       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2183           shadow classes (from gdcm.py).
2184         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2185           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2186         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2187
2188 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2189       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2190         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2191         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2192         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2193         dictionary.
2194         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2195           are now in the "???" group.
2196         - python/gdcm.i changed accordingly,
2197         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2198           of the above new functionalities in Python.
2199
2200 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2201       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2202         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2203           were definitively removed.
2204         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2205       * src/gdcmElValSet.cxx:
2206         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2207         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2208         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2209         - Added GetElementByName(string).
2210       * src/gdcmHeader.cxx: added
2211         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2212         - GetPubElValRepByName(string)
2213         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2214         - GetShaElValRepByName(string)
2215         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2216         - GetShaElValRepByName(string)
2217         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2218         - GetElValRepByName(string)
2219         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2220         - GetElValRepByName(string)
2221       * Doc/requirements.txt added.
2222
2223 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2224       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2225       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2226         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2227         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2228         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2229       * python/testSuite.py changed accordingly.
2230
2231 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2232       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2233         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2234              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2235               cannot be exported. [...]
2236               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2237               be exported. [...]
2238               This is caused by a designed limitation that once a template
2239               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2240               exported."
2241         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2242         limitation" of VC++ is a pitfall.
2243         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2244         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2245         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2246         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2247         library.
2248         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2249       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2250          dll under windows !!!!)
2251       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2252       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2253         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2254       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2255         (one) of image(s).
2256       * removed glib references
2257       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2258
2259 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2260       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2261         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2262         the files of the testsuite without using unittest.
2263       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2264       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2265       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2266         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2267
2268 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2269       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2270         values, but limits itself to values which are below a user specified
2271         size (by default 1024 bytes).
2272       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2273         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2274         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2275         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2276       * python/testSuite.py
2277         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2278         - two new examples added.
2279       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2280
2281 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2282       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2283         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2284       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2285       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2286       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2287
2288 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2289       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2290         the vr was also RET.
2291       * python/testSuite.py more tests added.
2292
2293 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2294       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2295       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2296       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2297         7.18 Integer types (see stdint.h)
2298         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2299       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2300         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2301         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2302         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2303         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2304         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2305         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2306         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2307
2308 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2309       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2310         VR files.
2311       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2312
2313 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2314       * Adaptation for porting to VC++:
2315         - src/gdcm.h
2316           o forced to use std namespace (for string to be known)
2317           o all class use __declspec export style on WIN32
2318         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2319           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2320       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2321         variable GDCM_DICT_PATH.
2322       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2323
2324 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2325       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2326         to native Python dictionary.
2327       * python/demo/test.py:
2328         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2329         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2330       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2331         PubElVals hashing table.
2332       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2333
2334 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2335       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2336         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2337       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2338       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2339       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2340         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2341       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2342
2343 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2344       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2345         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2346         that we can import de shadow classes without errors].
2347
2348 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2349       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2350       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2351       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2352       * src/Makefile prepared for python wrapping
2353
2354 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2355       * src/gdcmHeader.cxx :
2356         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2357           (see gdcmHeader::LoadElements).
2358         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2359           ReadInt16 and ReadInt32)
2360
2361 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2362       * src/gdcmHeader.cxx :
2363         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2364           method.
2365         - SetLgrElem renamed to SetLength
2366         - GetLgrElem renamed to GetLength
2367         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2368       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2369       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2370         due to IdoDude was cleaned out.
2371
2372 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2373       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2374         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2375         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2376         returning the unecessary skL (skipped length).
2377         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2378         it was redundant with the File position internals (by using
2379         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2380         jajun.
2381       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2382         on the libido specificities which are handled through class
2383         inheritance.
2384       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2385         added.
2386
2387 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2388       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2389         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2390
2391 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2392       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2393
2394 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2395       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2396         and _IdDcmSWAP_LONG.
2397
2398 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2399       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2400         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2401