]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> 
2      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
3        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
4
5 2004-02-11 Benoit Regrain
6      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
7        when using from python
8
9 2004-02-10 Benoit Regrain
10      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
11      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
12      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
13        directory parsing
14
15 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
16      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
17              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
18              - class gdcmMeta created
19      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
20             'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
21      * REM  : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
22
23 2004-02-05 Benoit Regrain
24      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
25        header entries
26      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
27      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
28
29 2004-02-04 Benoit Regrain
30      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
31      * FIX : sort the images in the dicom dir
32      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
33      * ADD : a python demo
34
35 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
36      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
37      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
38              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
39              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
40              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
41      * ENH  add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
42             to make full checking easier
43              
44 2004-02-04 Benoit Regrain
45      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
46      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
47
48 2004-02-03 Benoit Regrain
49      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
50      * gdcmDicomDir : add the load of directory
51      * Bug fix and print add-on
52
53 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
54      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
55      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
56      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
57      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
58            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
59         
60 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
61      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
62                   iterator on last
63              of the last synonym :-(
64      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
65                   for DICOMDIR ;-)
66      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
67      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
68      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
69            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
70            ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
71
72 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
73      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
74                        no longer writes 'Un' on disk
75      * FIX  SQ elements with actual length are now dealt with corectly
76      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
77                      the length (for Palette expanded omages) 
78                      and Raw Length (non expanded image + Palette)
79       * FIX  Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
80                      (that broke Write). Replaced by UL.
81                      Aware user will reload the field if he 
82                      thinks it's necesssary
83                        
84 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
85      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
86        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
87        IsReadable() methods.
88        
89      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
90       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
91       but so usefull for people that miss them ;-)
92       
93      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
94        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
95
96 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
97      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
98
99 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
100      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
101              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
102              The TRUE value for this param has to be used 
103              with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
104              ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
105      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
106              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
107              element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
108              
109      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
110              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
111              Fixed
112                      
113      * gdcmHeader add the method
114              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
115              to get *all* the Header Entries with the same tag.
116              GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
117              (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
118
119 2004-01-26 Benoit Regrain
120      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
121        in the print and add a third level of print to print them
122
123 2004-01-23 Benoit Regrain
124      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
125      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
126      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
127        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
128
129 2004-01-22 Benoit Regrain
130      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
131      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
132
133 2004-01-19 Benoit Regrain
134      * Add the use of shadow dictionaries
135      * bug fix and coding style
136
137 2004-01-19 Benoit Regrain
138      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
139      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
140      * Add the update of header entries using the shadow library
141
142 2004-01-19 Benoit Regrain
143     * removal of file gdcmHeader2.cxx
144     * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
145       inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
146       of dicom dir parsing
147     * bug fix under python
148
149 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
150     * removal of class gdcmHeaderEntrySet
151     * removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
152     * add file gdcmHeader2.cxx 
153     * add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
154
155 2004-01-15 Benoit Regrain
156      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
157        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
158        when the gdcmDictSet will be destroyed
159      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
160        gdcmDictSet
161
162 2004-01-15 Benoit Regrain
163      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
164        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
165        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
166        some memory and vtk seems to have some problems with that.
167      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
168
169 2004-01-14 Benoit Regrain
170      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
171      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
172      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
173      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
174
175 2004-01-13 Benoit Regrain
176      * src/*.[h|cxx] : coding style
177      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
178
179 2004-01-13 Benoit Regrain
180      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
181      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
182        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
183      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
184
185 2004-01-12 Benoit Regrain
186      * src/*.h : add comments
187      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
188      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
189        directly setted in the source code
190      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
191        gdcmTS and gdcmVR
192
193 2004-01-09 Benoit Regrain
194      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
195      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
196
197 2004-01-07 Benoit Regrain
198      * Modification to compile with the distutils.
199      * Bug fix in code
200
201 2003-12-10 Benoit Regrain
202      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
203        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
204      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
205        made in the source code
206
207 2003-12-10 Benoit Regrain
208      * Update Windows projects and .cvsignore files
209
210 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
211      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
212            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
213            if he wants to.
214            gdcmElValSet:Print takes it into account
215
216 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
217      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
218      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
219      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
220
221 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
222       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
223              on the ListTag listElem member,
224              not longer on the TagElValueHT tagHt member
225       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
226              with the tagHt member and the listElem member.
227              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
228
229       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
230              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
231                             if bug fixing is necessary), for internal
232                             use only
233              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
234                             or to allow Parser going on.
235              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
236              with a length (not 0000) is found
237       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
238                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
239                 (to be written)
240
241 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
242      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
243      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
244           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
245           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
246
247 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
248      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
249
250 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
251      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
252           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
253
254 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
255      * in testSuite.py : new files names for checking the package
256      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
257              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
258              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
259
260 2003-11-05 Benoit Regrain
261      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
262                        : Explicit error messages
263      * in __init__.py  : Related modif
264
265 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
266      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
267            to be used by aware (vtk) users that want to manage
268            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
269      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
270                     (vtkGdcmReader compliant)              
271            
272 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
273      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
274        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
275        
276 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
277      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
278            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
279            
280 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
281      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
282                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
283              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
284              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
285              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
286              such an image : 
287              After gdcmHeader :
288                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
289                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
290                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
291      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
292              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
293
294 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
295      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
296              
297 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
298      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
299            being coherents dicom files.
300      
301 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
302      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
303            from medcon lib !
304      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
305      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
306      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
307      *ENH: Add include dir to medcon lib
308      *FIX: only one function is being exported for now ! 
309            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
310             
311 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
312       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
313                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
314                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
315       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
316       
317 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
318       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
319  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
320                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
321        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
322        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
323            
324 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
325       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
326                                                
327 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
328       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
329       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
330       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
331       
332 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
333       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
334       * ENH: Try adding a search script for python site-package
335       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
336       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
337       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
338       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
339              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
340              But it fasten debug compilation time.
341             
342 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
343       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
344         (they are compressed as 2 planes images, 
345          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
346
347 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
348      * Now CheckRead takes into account :
349             the bugged 'Leonardo' Siemens images
350             the XA images, sent thru the burning VPRO station
351      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
352      (breaks DicomWorks)
353
354 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
355       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
356              one should remove the '\'
357              
358 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
359       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
360         (wrong lengths in header)
361         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
362       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
363         (breaks DicomWorks)
364
365 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
366       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
367         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
368
369 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
370       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
371       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
372
373 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
374       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
375      
376 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
377       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
378         (the patch is easy to remove)
379       * cosmetic changes to avoid warnings
380       
381 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
382       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
383         no need to press 'r' now.
384         
385 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
386       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
387         to new Jpeg Lossless decompressor
388        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
389        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
390        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
391                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
392 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
393       * general anonymisation in gdcmData
394       * adding the 'color files' from
395          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
396       * adding some well knowed bugged-header images
397       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
398          waiting for their inclusion in Python testsuite
399
400 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
401     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
402       no longer seg faults when file is not found
403
404 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
405      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
406
407 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
408      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
409
410 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
411      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
412         OpenFile takes it into account
413      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
414      * Missing elements added in dicomV3.dic
415       (just to be affraid : have a look at
416        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
417        and do it again next year ;->
418
419 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
420      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
421        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
422        But there are NOT. It's fixed !
423        
424 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
425      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
426      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
427          
428 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
429      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
430              an ACR-NEMA / DICOM one.
431      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
432              is not gdcm Readable
433      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
434              is now decoded.
435              
436 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
437      * FIX: CMake generate now documentation
438      * ENH: out of source doc build !
439      * ENH: Generate both user and dev documentation
440      * ENH: Should work on windows too
441      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
442      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
443      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
444      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
445                      
446 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
447      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
448      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
449      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
450         window level & window width
451
452 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
453      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
454      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
455      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
456      
457 2003-10-06  Emanuel Ollart
458      * FIX : compilation process wad broken.
459              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
460              
461 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
462      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
463      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
464      
465 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
466      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
467            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
468                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
469       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
470
471 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
472       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
473         to remain compliant with already defined strings, 
474         like Transfert Syntax UID and others)
475
476 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
477       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
478              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
479              
480 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
481       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
482       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
483
484 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
485       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
486         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
487               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
488       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
489
490 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
491       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
492
493 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
494       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
495         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
496
497 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
498       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
499          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
500          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
501          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
502           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
503           (no sample found :-(
504
505 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
506       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
507         Two reasons: - clear things
508                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
509                      suffer anymore VC++ complains
510 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
511       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
512       * removed leaks
513                      
514 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
515       * The lines are now eigthy characters long.for 
516         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
517
518 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
519       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
520         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
521         previous commis of Malaterre)
522       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
523         before the last Malaterre's commit.
524
525 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
526       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
527         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
528       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
529         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
530
531 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
532       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
533         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
534         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
535
536 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
537       * Cosmetic changes:
538         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
539           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
540           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
541           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
542         - PACKAGER corrected
543         - DEVELOPPER added.
544         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
545       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
546
547 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
548       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
549
550 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
551       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
552
553 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
554       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
555
556 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
557       * Fix a few delete/delete[] mismatch
558
559 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
560       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
561       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
562       heuristics to get informations (look at different places).
563       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
564       sorting DICOM images based on different strategies.
565       * modified Makefiles accordingly.
566
567 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
568       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
569         when building in debug mode
570       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
571         src/win32/gdcmdll.dsp
572       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
573
574 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
575       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
576
577 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
578       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
579       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
580       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
581
582 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
583       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
584         the file
585       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
586       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
587         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
588       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
589         symbols... future problem ?
590
591 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
592       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
593       * modified gdcm.dsw accordingly
594
595 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
596       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
597
598 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
599       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
600         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
601       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
602         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
603         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
604
605 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
606       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
607
608 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
609       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
610       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
611       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
612       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
613       * PACKAGER : adding all concerning windows
614
615 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
616       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
617         garbage debug code.
618       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
619       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
620         test suite reported error.
621       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
622         packaging a new release).
623       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
624       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
625       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
626         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
627         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
628
629 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
630       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
631       * src/gdcmHeader.h : formatting code
632
633 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
634       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
635         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
636         is made in an internal list to prevent this problem.
637         Bug fix when output is empty.
638         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
639         correction.
640       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
641
642 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
643       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
644       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
645         files. Added method to remove all files on the input
646         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
647         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
648
649 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
650       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
651         when using make instal.
652       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
653         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
654
655 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
656       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
657       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
658
659 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
660       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
661         linux and WINDOWS !
662       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
663       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
664
665 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
667         addon of the jpeg library)
668       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
669       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
670       * INSTALL now points to web documentation
671
672 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
673       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
674         gdcmUtil.h anymore.
675       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
676         clean target.
677       * src/gdcm*.[cxx|h] :
678         - to allow compilation with gcc 3.x
679           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
680           -- small fixes on exceptions.
681           Note: linking not tested !
682         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
683           building stage.
684       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
685         dependent convertion).
686
687 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
688       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
689         Changelog):
690         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
691         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
692           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
693         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
694
695 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
696       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
697         compile
698       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
699         (FileName -> Filename)
700
701 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
702       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
703         - UpdateProgress method should now be effective
704         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
705           to volumes),
706         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
707           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
708           accelerating things).
709         - when building a stack of images/volumes, files which are not
710           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
711           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
712           in the stack (for the caller to notice the problem).
713
714 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
715       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
716
717 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
718       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
719         between standard library (std) and vtk library (problems are found
720         under Windows... thanks Windows !)
721
722 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
723       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
724         debug stage).
725       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
726
727 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
728       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
729
730 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
731       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
732         called with different flags than the default ones (with automake).
733         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
734            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
735         and went for warning fixes:
736         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
737           up from unused variables.
738         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
739       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
740
741 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
742       * gdcmPython/gdcm.i:
743         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
744           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
745           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
746         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
747           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
748           exported to Python a as cvar.
749       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
750         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
751         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
752         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
753         C++ static methods).
754       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
755         with the above changes.
756
757 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
758       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
759
760 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
761       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
762         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
763         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
764          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
765          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
766            a wrapper
767          - Wrapper interface which wrap sources
768         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
769         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
770       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
771         files for compilation
772
773 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
774       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
775         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
776         - vtk/Makefile.am now builds a library
777         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
778           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
779           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
780           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
781           import library.
782         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
783           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
784           + vtk/vtkGdcmReader.so and
785           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
786           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
787         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
788           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
789         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
790           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
791       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
792       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
793         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
794         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
795         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
796         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
797         collision of various stl members (principally cout...).
798       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
799         file.
800       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
801         comply with above changes)
802
803 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
804       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
805       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
806         vtk data structure (an image Flip was required).
807       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
808       * cosmetic changes in documentation.
809
810 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
811       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
812         unexisting file is given as argument.
813       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
814         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
815         containing those images is now available at
816           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
817         with the name gdcmData.
818         All the python scripts (including the package initialisation file
819         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
820         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
821
822 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
823       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
824         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
825         demo of the usage of this class.
826         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
827         at configure (or autogen.sh) stage.
828
829 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
830       * More memory link related corrections and documentation fixes.
831         Notes on valgrind:
832           - maximum info is obtained with a command of the form:
833             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
834                    --show-reachable=yes PrintHeader
835           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
836             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
837             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
838             (in fact further invocation to the STL would recollect the
839              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
840       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
841         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
842         Note: some images don't seem to work e.g.
843             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
844       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
845         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
846         make gdcm more thread friendly.
847
848 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
849       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
850           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
851         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
852           gdcmHeader::_dicom_vr.
853         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
854         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
855           VRHT*.
856         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
857
858 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
859       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
860         make install stage.
861
862 2003-04-9 JPR
863       * UpdateGroupLength replaced by new one
864
865 2003-04-7 JPR
866       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
867         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
868
869 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
870       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
871       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
872       * src:
873         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
874         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
875           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
876         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
877           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
878           carried the same semantics.
879           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
880         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
881           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
882         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
883       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
884       * gdcmGetXSize added
885       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
886       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
887
888 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
889       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
890         (to avoid double call by end user).
891       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
892         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
893
894 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
895       * gdcm/Doc many doxygen changes:
896         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
897           the html.users end users oriented documentation and
898           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
899           oriented documentation.
900         - README changed accordingly
901         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
902         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
903           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
904         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
905           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
906           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
907       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
908         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
909       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
910         ill-formed documentation sections.
911       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
912
913 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
914       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
915       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
916         un*ces with sh-utils test utility.
917       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
918       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
919       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
920       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
921       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
922
923 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
924       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
925       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
926
927 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
928       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
929       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
930       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
931       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
932         compilation work.
933       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
934       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
935
936 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
937       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
938         hence the user doesn't need this explicit call.
939         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
940           i.e. LoadElements() call removed.
941       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
942         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
943       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
944         for adding user defined new tags.
945         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
946         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
947           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
948
949 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
950       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
951         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
952         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
953         with the autotools, included the python wrappers part.
954       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
955
956 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
957       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
958
959 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
960       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
961         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
962         for usage).
963       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
964         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
965         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
966       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
967         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
968
969 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
970       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
971         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
972         value of GDCM_DICT_PATH.
973       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
974
975 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
976       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
977       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
978       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
979         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
980         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
981
982 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
983       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
984         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
985         gdcmHeader.h
986       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
987         (as opposed to gdcm.h)
988       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
989       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
990         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
991       * autogen.sh removed history related references to crea package.
992
993 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
994       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
995         bug.
996
997 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
998       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
999         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1000         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1001         of hidding away the python related distutils specific files
1002         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1003         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1004         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1005         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1006
1007 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1008       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1009       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1010         among the list of sources.
1011
1012 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1013       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1014       * modifications in MSVC projects
1015
1016 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1017       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1018         looks like we can move back to original usage of exception within
1019         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1020         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1021       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1022         README file for usage added.
1023       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1024         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1025         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1026         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1027       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1028       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1029         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1030           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1031           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1032           instance of class gdcmHeader.
1033         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1034           require no instances at all to be invocated.
1035         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1036           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1037           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1038       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1039         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1040       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1041         the above to be effective.
1042       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1043         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1044       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1045         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1046         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1047         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1048         (for python dectection).
1049       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1050         now avoids publishing the empty entries.
1051
1052 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1053       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1054         ExtraPath reused :-P
1055       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1056
1057 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1058       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1059       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1060       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1061         and links
1062
1063 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1064       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1065         method. Doxygenation.
1066       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1067
1068 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1069       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1070         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1071         when using "python setup.py install".
1072       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1073         reexports the working classes.
1074       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1075         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1076         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1077         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1078         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1079         subdir (see the README file). This problem probably due to
1080         an combination of g++ and dynamic loading.
1081       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1082
1083 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1084       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1085         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1086         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1087         again in a python subdir, but the package itself is now in
1088         python/gdcmPython.
1089       * setup.py was cleaned up:
1090         - pythonIncludePath removed
1091         - python setup.py bdist target is now functional.
1092       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1093         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1094         accordingly.
1095
1096 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1097       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1098       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1099         distutils installer is operational.
1100       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1101           shadow classes (from gdcm.py).
1102         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1103           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1104         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1105
1106 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1107       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1108         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1109         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1110         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1111         dictionary.
1112         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1113           are now in the "???" group.
1114         - python/gdcm.i changed accordingly,
1115         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1116           of the above new functionalities in Python.
1117
1118 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1119       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1120         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1121           were definitively removed.
1122         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1123       * src/gdcmElValSet.cxx:
1124         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1125         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1126         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1127         - Added GetElementByName(string).
1128       * src/gdcmHeader.cxx: added
1129         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1130         - GetPubElValRepByName(string)
1131         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1132         - GetShaElValRepByName(string)
1133         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1134         - GetShaElValRepByName(string)
1135         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1136         - GetElValRepByName(string)
1137         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1138         - GetElValRepByName(string)
1139       * Doc/requirements.txt added.
1140
1141 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1142       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1143       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1144         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1145         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1146         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1147       * python/testSuite.py changed accordingly.
1148
1149 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1150       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1151         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1152              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1153               cannot be exported. [...]
1154               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1155               be exported. [...]
1156               This is caused by a designed limitation that once a template
1157               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1158               exported."
1159         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1160         limitation" of VC++ is a pitfall.
1161         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1162         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1163         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1164         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1165         library.
1166         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1167       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1168          dll under windows !!!!)
1169       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1170       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1171         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1172       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1173         (one) of image(s).
1174       * removed glib references
1175       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1176
1177 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1178       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1179         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1180         the files of the testsuite without using unittest.
1181       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1182       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1183       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1184         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1185
1186 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1187       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1188         values, but limits itself to values which are below a user specified
1189         size (by default 1024 bytes).
1190       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1191         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1192         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1193         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1194       * python/testSuite.py
1195         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1196         - two new examples added.
1197       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1198
1199 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1200       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1201         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1202       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1203       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1204       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1205
1206 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1207       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1208         the vr was also RET.
1209       * python/testSuite.py more tests added.
1210
1211 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1212       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1213       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1214       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1215         7.18 Integer types (see stdint.h)
1216         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1217       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1218         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1219         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1220         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1221         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1222         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1223         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1224         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1225
1226 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1227       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1228         VR files.
1229       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1230
1231 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1232       * Adaptation for porting to VC++:
1233         - src/gdcm.h
1234           o forced to use std namespace (for string to be known)
1235           o all class use __declspec export style on WIN32
1236         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1237           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1238       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1239         variable GDCM_DICT_PATH.
1240       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1241
1242 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1243       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1244         to native Python dictionary.
1245       * python/demo/test.py:
1246         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1247         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1248       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1249         PubElVals hashing table.
1250       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1251
1252 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1253       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1254         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1255       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1256       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1257       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1258         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1259       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1260
1261 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1262       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1263         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1264         that we can import de shadow classes without errors].
1265
1266 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1267       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1268       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1269       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1270       * src/Makefile prepared for python wrapping
1271
1272 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1273       * src/gdcmHeader.cxx :
1274         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1275           (see gdcmHeader::LoadElements).
1276         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1277           ReadInt16 and ReadInt32)
1278
1279 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1280       * src/gdcmHeader.cxx :
1281         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1282           method.
1283         - SetLgrElem renamed to SetLength
1284         - GetLgrElem renamed to GetLength
1285         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1286       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1287       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1288         due to IdoDude was cleaned out.
1289
1290 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1291       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1292         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1293         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1294         returning the unecessary skL (skipped length).
1295         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1296         it was redundant with the File position internals (by using
1297         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1298         jajun.
1299       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1300         on the libido specificities which are handled through class
1301         inheritance.
1302       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1303         added.
1304
1305 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1306       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1307         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1308
1309 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1310       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1311
1312 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1313       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1314         and _IdDcmSWAP_LONG.
1315
1316 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1317       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1318         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1319