]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
BUG: Remove demangle code this was seg faulting on some linux gcc 3.3.2 machine
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
3     little endian. This should -heopfully- fix some tests
4
5 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
6   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default 
7     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
8     the one comiled into lib
9
10 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
11   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
12     This should definitely solve any leak problem, and we should be
13     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
14
15 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
16   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
17   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
18   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
19   
20 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
21   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
22   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
23     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
24   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
25   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
26     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
27     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
28       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
29       no longer exists.
30
31 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
32   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
33    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
34    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
35    the class.
36   
37 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
38   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
39     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
40     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
41
42 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
43   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
44   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
45     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
46     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
47     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
48       CloseFile() anymore.
49     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
50       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
51       into File::Pixel_Data.
52
53 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
54   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
55     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
56   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
57     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
58     method:
59     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
60     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
61       method to those classes.
62     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
63       -- Added a ::Print() method.
64       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
65       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
66          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
67
68 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
69   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
70     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
71     doxygen.
72   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
73   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
74     pointlessly wrapped (see
75     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
76   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
77     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
78     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
79     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
80     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
81       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
82            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
83       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
84          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
85
86 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
87   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
88     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
89
90 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
91   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
92     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
93     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
94   * TODO added new entry.
95   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
96     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
97     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
98     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
99       variable names for semantical coherence.
100
101 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
102   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
103   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
104   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
105   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
106   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
107   compilation time jpeg option.
108
109 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
110   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
111     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
112     reproduce at home.
113   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
114   Thanks dcmtk crew !
115
116 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
117   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
118   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
119     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
120   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
121   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
122   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
123   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
124     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
125     from File:: to PixelConvert::.
126
127 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
128   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
129     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
130      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
131      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
132
133 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
134   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
135   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
136   like this:
137     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
138   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
139   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
140   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
141
142 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
143   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
144     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
145     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
146     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
147     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
148       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
149       (for the time being this is better than having them attach to
150        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
151     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
152       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
153     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
154       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
155       gdcmPixelConvert::
156
157 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
158   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
159   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
160     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
161       clean up of RLE related code. 
162   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
163     - src/gdcmRLE.cxx removed
164     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
165     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
166     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
167   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
168     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
169       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
170       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
171
172 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
173   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
174     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
175       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
176       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
177       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
178       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
179       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
180       offsets.
181   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
182     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
183         with the retired Parse7Fe0().
184     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
185     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
186
187 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
188   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
189     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
190     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
191     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
192   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
193     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
194       to return an unused length.
195
196 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
197   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
198     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
199     to use to do simple stuff.
200
201 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
202   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
203     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
204     copying of the file within different directory, configure header file to
205     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
206     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
207
208 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
209   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
210      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
211        with it's binary name).
212      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
213        the Website to be more complete.
214      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
215        doxygenated documentation.
216      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
217        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
218                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
219   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
220   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
221    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
222
223 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
224   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
225    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
226
227 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
228   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
229     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
230     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
231     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
232     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
233   * GDCMHOME clean up:
234     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
235       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
236       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
237   * Autotools clean up:
238     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
239     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
240
241 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
242   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
243   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
244   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
245
246 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
247   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
248     describing TODO entries and used it for new entries.
249   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
250     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
251     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
252   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
253     documentation itself, but the website) moved to html and
254     placed in directory Doc/Website:
255     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
256     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
257     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
258   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
259   * CMakeLists.txt changed accordingly.
260   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
261     DeveloppersPython.html
262   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
263
264 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
265   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
266     of gdcm Web site.
267
268 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
269   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
270     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
271          we can now delete[] it safely  
272   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
273     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
274   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
275
276 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
277   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
278     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
279     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
280     pointed content.
281
282 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
283   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
284   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
285
286 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
287   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
288     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
289     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
290     an example of usage.
291     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
292       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
293     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
294       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
295     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
296     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
297     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
298
299 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
301     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
302     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
303     in class 
304     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
305       and associated accessors. Doxygenation of the class.
306     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
307       accessors added.
308     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
309       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
310     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
311     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
312
313 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
314   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
315     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
316       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
317            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
318            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
319            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
320            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
321            the same group and element all share the same (group, element)
322            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
323            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
324            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
325            consider the following definition of a TagKey:
326            - let Group, Element be the string representation of the
327              group and element dicom tag members,
328            - let ItemNumber be the string representation of the integer
329              index of the considered item number of a sequence,
330            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
331            the form:
332               /ItemNumber#Group|Element
333            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
334            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
335               Group|Element<SeqTag>
336            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
337            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
338            string e.g.
339                0028|1201
340            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
341            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
342            string e.g.
343                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
344     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
345       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
346       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
347     - src/gdcmDocEntry.cxx:
348       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
349          Key member.
350       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
351     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
352     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
353       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
354       -- now has a new BaseTagKey member.
355       -- STYLE.
356   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
357     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
358     truly belongs.
359     This poses the problem with the semantics of the following lines
360        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
361        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
362        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
363     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
364     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
365     order to get things working the dicom dictionary was altered !
366     Please fix things urgently...
367   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
368     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
369     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
370     set to OW:
371       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
372       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
373       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
374   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
375     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
376   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
377
378 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
379   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
380
381 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
382   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
383     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
384   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
385   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
386
387 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
388   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
389     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
390   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
391     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
392   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
393     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
394   * TODO updated
395   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
396     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
397   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
398   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
399     exception_on_error parameter.
400     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
401     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
402     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
403
404 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
405   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
406   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
407     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
408   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
409   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
410   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
411     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
412   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
413
414 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
415   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
416     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
417
418 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
419   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
420        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
421                  
422 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
423   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
424         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
425
426 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
427    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
428    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
429      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
430      is now in static in the gdcmDebug class
431    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
432    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
433
434 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
435    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
436      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
437    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
438      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
439      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
440      that displays position and size).
441    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
442      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
443      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
444      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
445      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
446      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
447      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
448         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
449      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
450      commiting changes).
451    * Test/CMakeLists.txt:
452       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
453       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
454         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
455         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
456    * TODO updated.
457
458 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
459    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
460      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
461      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
462      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
463      - removal of typedef duplication.
464      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
465      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
466    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
467       - printf polluting ctest removed.
468       - TAB removal for comminting
469    * Test:
470      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
471        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
472        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
473        this test creates them.
474        Note: we need to validate each reference image, but before that
475              I'd like to rename them with a more explicit name...
476      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
477    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
478      including each header needed).
479
480 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
481    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
482      test suite to the Example directory. Are concerned:
483      - PrintHeader.cxx
484      - TestDcm2Acr.cxx
485      - TestFindTags.cxx
486      - TestWrite.cxx was
487      - TestWriteSimple.cxx
488    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
489      image gdcmData/oldACR00001.ima
490
491 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
492    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
493      with removal from gdcmData):
494       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
495       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
496       - US.3405.1.dcm
497      Added the following because after last cvs update, they cause
498        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
499      to segfault:
500       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
501       - oldACR00001.ima
502    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
503      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
504      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
505      form of test...
506    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
507      we don't need to black list the following images anymore:
508       - 8BitsUncompressedColor.dcm
509       - OT-PAL-8-face.dcm
510       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
511    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
512      fixes and the beautified code ;-)
513      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
514      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
515      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
516            improve the test suite). The bug could be detected by using
517            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
518            or by using
519            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
520            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
521
522 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
523    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
524          - replace by uggly but working old code :-(
525                 A lot of things should be OK again.
526         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
527         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
528         (twice, withing a fortnigh ...)         
529
530 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
531    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
532      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
533    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
534      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
535      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
536                    - OT-PAL-8-face.dcm
537                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
538    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
539      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
540      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
541      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
542      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
543      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
544      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
545      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
546      image.
547    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
548      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
549      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
550      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
551    
552 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
553   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
554   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
555                           (instead of infinite loop)
556   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
557
558 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
559    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
560
561 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
562    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
563                     when SamplesPerPixel =3
564          - now Write is no longer confused by 
565                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
566          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
567                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
568    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
569                     (in order to split the job that has not to be done 
570                                         for gdcmDicomDir)
571
572 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
573    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
574      loop on the same image until memory went out. 
575      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
576    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
577      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
578
579 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
580    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
581             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
582                                 is added a the end, when necessary.
583             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
584                       now written correctly
585                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
586                                 (even for odd groups) 
587         Note : only Explicit Value Representation was checked.
588                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
589
590 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
591    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
592    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
593      coding style).
594
595 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
596    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
597      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
598    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
599
600 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
601    FIX : gdcmDocument.cxx
602       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
603         code 'beautyfication' :-(
604       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
605
606 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
607    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
608                  : to allow user to create his own Sequences
609         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
610
611 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
612         
613         - gdcmBinEntry
614           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
615           
616    - gdcmDocEntry
617           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
618           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
619           
620         - gdcmDocEntrySet
621           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
622           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
623      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
624      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
625      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
626      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
627                                             guint16 element,
628                                             std::string vr     = "unkn",
629                                             std::string fourth = "unkn",
630                                             std::string name   = "unkn"); 
631           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
632      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
633      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
634      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
635      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
636      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
637           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
638      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
639           
640         - gdcmDocument
641      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
642      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
643      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
644      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
645      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
646                                         FILE *_fp, FileType type);
647      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
648      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
649      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
650      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
651      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
652      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
653      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
654      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
655                                             guint16 element,
656                                             std::string vr     = "unkn",
657                                             std::string fourth = "unkn",
658                                             std::string name   = "unkn");
659      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
660      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
661      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
662      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
663                                                                                                                  
664         - gdcmElementSet
665           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
666           
667    - gdcmSeqEntry
668           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
669  
670    - gdcmSQItem
671      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
672      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
673      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
674      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
675
676    - gdcmValEntry
677          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
678                                   
679 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
681       The default constructor invoked by the line
682          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
683       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
684       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
685       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
686     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
687       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
688       Could anyone explain why ?
689     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
690       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
691       code related to gdcmBinEntry).
692
693 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
694     * In order to fix memory leaks:
695      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
696        some delete calls.
697      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
698      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
699        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
700        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
701        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
702      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
703      - src/gdcmDocument.cxx:
704        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
705           from dynamic stores.
706        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
707           was causing memory leaks.
708      - src/gdcmSQItem.cxx:
709        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
710           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
711        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
712           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
713           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
714           This avoids SegFaulting.
715      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
716     * Conclusion:
717      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
718        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
719        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
720      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
721        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
722      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
723        segfaults).
724     * Erroneous leading white fix:
725      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
726        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
727      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
728      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
729     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
730     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
731
732
733 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
734     * In order to fix writing of dicom files:
735      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
736      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
737      - src/gdcmDocument.cxx:
738        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
739        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
740        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
741           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
742           manner.
743        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
744           to only declared) and build on top of
745           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
746        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
747      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
748        for usage in destructor and treatement of promotion in
749        ::ReplaceOrCreateByNumber().
750      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
751       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
752     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
753       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
754       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
755       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
756
757 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
758     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
759       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
760       learned that:
761           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
762           soon as possible by globally disabling memory caching.
763           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
764           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
765       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
766       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
767       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
768     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
769       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
770       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
771       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
772         with 1.
773       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
774       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
775       understand why the list is empty...).
776     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
777     * Doc/License.txt added.
778
779 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
780     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
781       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
782         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
783         the padding problem.
784       - general clean up, simplification, and coding style.
785       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
786     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
787
788 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
789    *  gdcmSeqEntry.cxx
790            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
791                 - fix the display of SQItem ordinal number
792       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
793                 - remove some useless never written private methods     
794                 
795 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
796    * gdcmBinEntry.cxx 
797       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
798            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
799               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
800                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
801    * dcmDocument.cxx
802       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
803               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
804            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
805       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
806    * gdcmFile.cxx
807       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
808    * gdcmSQItem.h
809       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
810             a (relative) Item identier inside a given Sequence
811             \warning : some pb remaining around this number
812                                 will be solved asap
813       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
814    * gdcmValEntry.cxx 
815       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
816
817 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
818     * Memory leak hunt with the following command:
819       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
820                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
821       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
822       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
823       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
824           grep "MEMORY LEAK" src/*
825       Here are two typical examples which I can't help fixing:
826       -----
827           #include <string>
828           int main() {
829              std::string name;
830              char * test = "babo";
831              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
832                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
833              name.clear();   //// Doesn't help !
834              return 0;
835           }
836       -----
837           #include <string>
838           #include <iostream>
839           int main() {
840              std::string line;
841              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
842              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
843                                         //// of 1320 bytes in call to
844                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
845             return 0;
846           }
847       -----
848
849
850 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
851     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
852       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
853         and related, moved away to gdcmDocument.
854       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
855         the corresponding protected accessors of inherited class
856         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
857         declared friend of class gdcmDocument (see below).
858       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
859       - Clean up of undefined or unused methods.
860     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
861       account the changes to gdcmHeader.h).
862     * src/gdcmDocument.h:
863       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
864         changes to gdcmHeader.h).
865       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
866         (see changes to gdcmHeader.h).
867       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
868       - Clean up of undefined or unused methods.
869     * src/gdcmDocument.cxx:
870       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
871       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
872       - some std::string properly set to VRKey
873     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
874       references to gdcmDocument. 
875     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
876     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
877       cvs repository gdcmData.
878
879 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
880     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
881     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
882       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
883     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
884     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
885       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
886     * src/gdcmDocument.cxx: 
887       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
888         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
889       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
890         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
891         removed. Reverting to previous code segment with the proper
892         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
893         Note: this was (partially) breaking the python test suite
894               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
895               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
896     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
897     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
898       now taken into account.
899     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
900       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
901     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
902       on posix.
903     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
904       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
905     * .... alas, the python testSuite is still broken.
906
907 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
908     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
909       gdcmGlob
910     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
911     * src/gdcmUtil.h : export methods
912
913 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
914     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
915       to right behavior
916     * Initial addition of automatic python testing
917     * Initial addition of automatic image comparison
918
919 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
920     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
921       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
922
923 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
924      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
925      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
926      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
927
928 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
929      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
930        new concepts (and new classes) :
931        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
932         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
933         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
934        a Sequence is composed of Items.
935        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
936        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
937        (never taken into account)
938        Our unability to add a new 'entry' in the header
939        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
940        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
941        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
942        nothing is finished.
943        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
944
945 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
946      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
947      
948 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
949      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
950        file prefix (SetFilePrefix)
951
952 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
953      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
954        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
955        baseline.
956      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
957        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
958
959 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
960      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
961        dicom image
962
963 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
964      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
965      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
966        between the developper and user version.
967      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
968      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
969
970 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
971      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
972        when using cmake.
973
974 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
975      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
976                src directory, now generated in the build dir.
977             2. Tests as mentionned smarter
978             3. Some clean up
979             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
980           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
981           where we could set the institution name / patient name...
982
983        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
984               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
985                  (this was not true before)
986
987 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
988      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
989            SeQuence indented printing of Dicom Header.
990      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
991            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
992            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
993      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
994            tree-like structure of a Dicom Header.
995      * FIX Test code cleaning     
996            
997 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
998      * ENH: Adding automatic testing
999        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1000        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1001        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1002        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1003           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1004           too many projects
1005      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1006      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1007        one file instead of seven + some small cleanup
1008
1009 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1010      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1011      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1012            Header printing. Example given with :
1013            > PrintHeader fileName  2 new
1014           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1015            
1016 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1017      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1018          1. I have added some unsigned where needed
1019          2. Some function parameter not used -> (void)
1020          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1021          4. g++ don't like character '\' in comment
1022          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1023                     this really need to be fixed
1024          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1025          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1026                     this also really need to be fixed
1027          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1028                     remove compression file 
1029                     (as we only do decompression, right ?)     
1030      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1031
1032 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1033      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1034            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1035            defaulted to yspacing
1036            
1037 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1038      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1039      * ENH add parameters :
1040                bool  exception_on_error = false, 
1041                bool  enable_sequences   = false,
1042                bool  ignore_shadow      = false
1043            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1044      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1045            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1046               
1047 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1048      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1049      
1050 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1051      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1052      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1053              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1054              
1055 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1056      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1057          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1058
1059 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1060      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1061        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1062        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1063        in gdcmHeader.
1064      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1065        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1066        already does the job.
1067      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1068        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1069
1070 2004-03-30 Benoit Regrain
1071      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1072        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1073        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1074
1075 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1076      * ENH : Check on file type to be written moved
1077              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1078      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1079              when end-of-list is reached
1080            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1081
1082 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1083      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1084      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1085      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1086        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1087
1088 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1089      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1090        now contains all the gdcmGlobal related code.
1091      * minor coding style and doxygenation changes.
1092
1093 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1094      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1095        now contains all the Debug related code.
1096      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1097      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1098        CreateCleanString) removed.
1099      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1100      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1101      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1102      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1103        src/gdcmDirList.cxx)
1104
1105 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1106      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1107
1108 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1109      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1110            big endian made volumes
1111      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1112            end user to instanciate class gdcmParser
1113           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1114
1115 2004-03-22 Benoit Regrain
1116      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1117      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1118              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1119
1120 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1121      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1122            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1123            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1124            or build from the files held (recursively) in a Directory
1125            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1126            gdcmObject::SetBoundaries() added
1127
1128 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1129      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1130                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1131      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1132            DICOMDIR
1133      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1134            about the name
1135
1136 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1137      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1138                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1139
1140 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1141      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1142            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1143            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1144            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1145            to allow making gdcDicomDir object.
1146      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1147           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1148
1149 2004-02-11 Benoit Regrain
1150      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1151              when using from python
1152
1153 2004-02-10 Benoit Regrain
1154      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1155      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1156      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1157              directory parsing
1158
1159 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1160      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1161              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1162              - class gdcmMeta created
1163      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1164              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1165      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1166
1167 2004-02-05 Benoit Regrain
1168      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1169              header entries
1170      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1171      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1172
1173 2004-02-04 Benoit Regrain
1174      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1175      * FIX : sort the images in the dicom dir
1176      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1177      * ADD : a python demo
1178
1179 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1180      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1181      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1182              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1183              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1184              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1185      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1186            to make full checking easier
1187         
1188 2004-02-04 Benoit Regrain
1189      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1190      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1191
1192 2004-02-03 Benoit Regrain
1193      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1194      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1195      * Bug fix and print add-on
1196
1197 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1198      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1199      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1200      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1201      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1202            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1203         
1204 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1205      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1206              iterator on last
1207              of the last synonym :-(
1208      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1209              for DICOMDIR ;-)
1210      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1211      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1212      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1213            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1214       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1215
1216 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1217      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1218            no longer writes 'Un' on disk
1219      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1220      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1221            the length (for Palette expanded images)
1222            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1223      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1224            (that broke Write). Replaced by UL.
1225            Aware user will reload the field if he 
1226            thinks it's necesssary
1227              
1228 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1229      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1230        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1231        IsReadable() methods.
1232        
1233      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1234       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1235       but so usefull for people that miss them ;-)
1236       
1237      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1238        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1239
1240 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1241      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1242
1243 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1244      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1245              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1246         The TRUE value for this param has to be used 
1247         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1248         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1249      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1250              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1251         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1252         
1253      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1254              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1255              Fixed
1256
1257      * gdcmHeader add the method
1258              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1259         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1260         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1261         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1262
1263 2004-01-26 Benoit Regrain
1264      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1265        in the print and add a third level of print to print them
1266
1267 2004-01-23 Benoit Regrain
1268      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1269      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1270      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1271        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1272
1273 2004-01-22 Benoit Regrain
1274      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1275      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1276
1277 2004-01-19 Benoit Regrain
1278      * Add the use of shadow dictionaries
1279      * bug fix and coding style
1280
1281 2004-01-19 Benoit Regrain
1282      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1283      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1284      * Add the update of header entries using the shadow library
1285
1286 2004-01-19 Benoit Regrain
1287      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1288      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1289        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1290        of dicom dir parsing
1291      * bug fix under python
1292
1293 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1294     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1295     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1296     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1297     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1298
1299 2004-01-15 Benoit Regrain
1300      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1301        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1302        when the gdcmDictSet will be destroyed
1303      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1304        gdcmDictSet
1305
1306 2004-01-15 Benoit Regrain
1307      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1308        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1309        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1310        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1311      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1312
1313 2004-01-14 Benoit Regrain
1314      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1315      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1316      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1317      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1318
1319 2004-01-13 Benoit Regrain
1320      * src/*.[h|cxx] : coding style
1321      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1322
1323 2004-01-13 Benoit Regrain
1324      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1325      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1326        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1327      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1328
1329 2004-01-12 Benoit Regrain
1330      * src/*.h : add comments
1331      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1332      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1333        directly setted in the source code
1334      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1335        gdcmTS and gdcmVR
1336
1337 2004-01-09 Benoit Regrain
1338      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1339      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1340
1341 2004-01-07 Benoit Regrain
1342      * Modification to compile with the distutils.
1343      * Bug fix in code
1344
1345 2003-12-10 Benoit Regrain
1346      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1347        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1348      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1349        made in the source code
1350
1351 2003-12-10 Benoit Regrain
1352      * Update Windows projects and .cvsignore files
1353
1354 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1355      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1356            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1357            if he wants to.
1358            gdcmElValSet:Print takes it into account
1359
1360 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1361      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1362      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1363      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1364
1365 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1366       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1367              on the ListTag listElem member,
1368              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1369       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1370              with the tagHt member and the listElem member.
1371              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1372
1373       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1374              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1375                             if bug fixing is necessary), for internal
1376                             use only
1377              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1378                             or to allow Parser going on.
1379              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1380              with a length (not 0000) is found
1381       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1382                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1383                 (to be written)
1384
1385 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1386      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1387      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1388           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1389      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1390
1391 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1392      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1393
1394 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1395      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1396           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1397
1398 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1399      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1400      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1401              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1402              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1403
1404 2003-11-05 Benoit Regrain
1405      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1406                        : Explicit error messages
1407      * in __init__.py  : Related modif
1408
1409 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1410      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1411            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1412            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1413      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1414                     (vtkGdcmReader compliant)           
1415       
1416 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1417      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1418        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1419        
1420 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1421      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1422            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1423
1424 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1425      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1426                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1427              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1428              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1429              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1430              such an image :
1431              After gdcmHeader :
1432               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1433               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1434               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1435      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1436              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1437
1438 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1439      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1440              
1441 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1442      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1443            being coherents dicom files.
1444      
1445 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1446      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1447            from medcon lib !
1448      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1449      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1450      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1451      * ENH: Add include dir to medcon lib
1452      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1453            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1454             
1455 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1456       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1457         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1458           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1459       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1460
1461 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1462       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1463         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1464         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1465       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1466       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1467
1468 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1469       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1470                                                
1471 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1472       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1473       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1474       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1475       
1476 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1477       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1478       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1479       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1480       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1481       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1482       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1483              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1484         But it fasten debug compilation time.
1485             
1486 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1487       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1488         (they are compressed as 2 planes images, 
1489          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1490
1491 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1492       * Now CheckRead takes into account :
1493          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1494          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1495       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1496        (breaks DicomWorks)
1497
1498 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1499       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1500              one should remove the '\'
1501         
1502 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1503       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1504         (wrong lengths in header)
1505         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1506       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1507         (breaks DicomWorks)
1508
1509 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1510       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1511         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1512
1513 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1514       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1515       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1516
1517 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1518       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1519      
1520 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1521       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1522         (the patch is easy to remove)
1523       * cosmetic changes to avoid warnings
1524       
1525 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1526       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1527         no need to press 'r' now.
1528    
1529 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1530       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1531         to new Jpeg Lossless decompressor
1532       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1533       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1534       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1535                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1536 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1537       * general anonymisation in gdcmData
1538       * adding the 'color files' from
1539         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1540       * adding some well knowed bugged-header images
1541       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1542         waiting for their inclusion in Python testsuite
1543
1544 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1545     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1546       no longer seg faults when file is not found
1547
1548 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1549      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1550        MultiFrame images
1551
1552 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1553      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1554
1555 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1556      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1557         OpenFile takes it into account
1558      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1559      * Missing elements added in dicomV3.dic
1560       (just to be affraid : have a look at
1561        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1562        and do it again next year ;->
1563
1564 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1565      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1566        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1567        But there are NOT. It's fixed !
1568        
1569 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1570      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1571      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1572          
1573 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1574      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1575              an ACR-NEMA / DICOM one.
1576      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1577              is not gdcm Readable
1578      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1579              is now decoded.
1580         
1581 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1582      * FIX: CMake generate now documentation
1583      * ENH: out of source doc build !
1584      * ENH: Generate both user and dev documentation
1585      * ENH: Should work on windows too
1586      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1587      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1588      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1589      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1590                      
1591 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1592      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1593      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1594      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1595         window level & window width
1596
1597 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1598      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1599      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1600      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1601      
1602 2003-10-06  Emanuel Ollart
1603      * FIX : compilation process wad broken.
1604              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1605         
1606 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1607      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1608      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1609      
1610 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1611      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1612            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1613                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1614       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1615
1616 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1617       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1618         to remain compliant with already defined strings, 
1619         like Transfert Syntax UID and others)
1620
1621 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1622       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1623              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1624         
1625 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1626       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1627       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1628
1629 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1630       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1631         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1632               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1633       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1634
1635 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1636       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1637
1638 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1639       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1640         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1641
1642 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1643       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1644          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1645          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1646          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1647           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1648                                             YBR_RCT files.
1649           (no sample found :-(
1650
1651 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1652       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1653         Two reasons: - clear things
1654                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1655                        suffer anymore VC++ complains
1656
1657 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1658       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1659       * removed leaks
1660
1661 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1662       * The lines are now eigthy characters long.for 
1663         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1664
1665 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1666       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1667         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1668         previous commis of Malaterre)
1669       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1670         before the last Malaterre's commit.
1671
1672 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1673       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1674         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1675       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1676         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1677
1678 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1679       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1680         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1681         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1682
1683 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1684       * Cosmetic changes:
1685         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1686           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1687           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1688           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1689         - PACKAGER corrected
1690         - DEVELOPPER added.
1691         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1692       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1693
1694 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1695       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1696
1697 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1698       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1699
1700 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1701       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1702
1703 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1704       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1705
1706 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1707       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1708         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1709         heuristics to get informations (look at different places).
1710       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1711         sorting DICOM images based on different strategies.
1712       * modified Makefiles accordingly.
1713
1714 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1715       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1716         when building in debug mode
1717       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1718         src/win32/gdcmdll.dsp
1719       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1720
1721 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1722       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1723             to valgrind.
1724
1725 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1726       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1727       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1728                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1729       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1730
1731 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1732       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1733         the file
1734       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1735       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1736         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1737       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1738         symbols... future problem ?
1739
1740 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1741       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1742       * modified gdcm.dsw accordingly
1743
1744 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1745       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1746
1747 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1748       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1749         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1750       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1751         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1752         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1753
1754 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1755       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1756
1757 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1758       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1759       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1760       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1761       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1762       * PACKAGER : adding all concerning windows
1763
1764 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1766         garbage debug code.
1767       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1768       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1769         test suite reported error.
1770       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1771         packaging a new release).
1772       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1773       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1774       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1775         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1776         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1777
1778 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1779       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1780       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1781
1782 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1783       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1784         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1785         is made in an internal list to prevent this problem.
1786         Bug fix when output is empty.
1787         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1788         correction.
1789       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1790
1791 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1792       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1793       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1794         files. Added method to remove all files on the input
1795         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1796         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1797
1798 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1800         when using make instal.
1801       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1802         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1803
1804 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1805       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1806       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1807
1808 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1809       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1810         linux and WINDOWS !
1811       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1812       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1813
1814 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1815       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1816         addon of the jpeg library)
1817       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1818       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1819       * INSTALL now points to web documentation
1820
1821 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1822       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1823         gdcmUtil.h anymore.
1824       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1825         clean target.
1826       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1827         - to allow compilation with gcc 3.x
1828           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1829           -- small fixes on exceptions.
1830           Note: linking not tested !
1831         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1832           building stage.
1833       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1834         dependent convertion).
1835
1836 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1837       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1838         Changelog):
1839         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1840         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1841           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1842         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1843
1844 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1845       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1846         compile
1847       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1848         (FileName -> Filename)
1849
1850 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1851       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1852         - UpdateProgress method should now be effective
1853         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1854           to volumes),
1855         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1856           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1857           accelerating things).
1858         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1859           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1860           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1861           in the stack (for the caller to notice the problem).
1862
1863 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1864       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1865
1866 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1867       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1868         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1869         under Windows... thanks Windows !)
1870
1871 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1872       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1873         debug stage).
1874       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1875
1876 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1877       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1878
1879 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1880       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1881         called with different flags than the default ones (with automake).
1882         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1883            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1884         and went for warning fixes:
1885         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1886           up from unused variables.
1887         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1888       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1889
1890 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1891       * gdcmPython/gdcm.i:
1892         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1893           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1894           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1895         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1896           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1897           exported to Python a as cvar.
1898       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1899         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1900         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1901         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1902         C++ static methods).
1903       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1904         with the above changes.
1905
1906 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1907       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1908
1909 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1910       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1911         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1912         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1913          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1914          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1915            a wrapper
1916          - Wrapper interface which wrap sources
1917         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1918         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1919       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1920         files for compilation
1921
1922 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1923       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1924         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1925         - vtk/Makefile.am now builds a library
1926         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1927           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1928           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1929           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1930           import library.
1931         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1932           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1933           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1934           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1935           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1936         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1937           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1938         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1939           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1940       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1941       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1942         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1943         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1944         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1945         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1946         collision of various stl members (principally cout...).
1947       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1948         file.
1949       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1950         comply with above changes)
1951
1952 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1953       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1954       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1955         vtk data structure (an image Flip was required).
1956       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1957       * cosmetic changes in documentation.
1958
1959 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1960       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1961         unexisting file is given as argument.
1962       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1963         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1964         containing those images is now available at
1965           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1966         with the name gdcmData.
1967         All the python scripts (including the package initialisation file
1968         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1969         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1970
1971 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1972       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1973         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1974         demo of the usage of this class.
1975         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1976         at configure (or autogen.sh) stage.
1977
1978 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1979       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1980         Notes on valgrind:
1981           - maximum info is obtained with a command of the form:
1982             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1983                      --show-reachable=yes PrintHeader
1984           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1985             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1986             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1987             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1988              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1989       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1990         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1991         Note: some images don't seem to work e.g.
1992             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1993       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1994         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1995         make gdcm more thread friendly.
1996
1997 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1998       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1999           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2000         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2001           gdcmHeader::_dicom_vr.
2002         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2003         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2004           VRHT*.
2005         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2006
2007 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2008       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2009         make install stage.
2010
2011 2003-04-9 JPR
2012       * UpdateGroupLength replaced by new one
2013
2014 2003-04-7 JPR
2015       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2016         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2017
2018 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2019       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2020       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2021       * src:
2022         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2023         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2024           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2025         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2026           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2027           carried the same semantics.
2028           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2029         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2030           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2031         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2032       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2033       * gdcmGetXSize added
2034       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2035       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2036
2037 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2038       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2039         (to avoid double call by end user).
2040       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2041         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2042
2043 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2044       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2045         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2046           the html.users end users oriented documentation and
2047           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2048           oriented documentation.
2049         - README changed accordingly
2050         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2051         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2052           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2053         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2054           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2055           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2056       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2057         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2058       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2059         ill-formed documentation sections.
2060       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2061
2062 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2063       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2064       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2065         un*ces with sh-utils test utility.
2066       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2067       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2068       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2069       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2070       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2071
2072 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2073       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2074       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2075
2076 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2077       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2078       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2079       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2080       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2081         compilation work.
2082       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2083       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2084
2085 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2086       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2087         hence the user doesn't need this explicit call.
2088         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2089           i.e. LoadElements() call removed.
2090       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2091         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2092       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2093         for adding user defined new tags.
2094         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2095         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2096           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2097
2098 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2099       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2100         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2101         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2102         with the autotools, included the python wrappers part.
2103       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2104
2105 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2107
2108 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2109       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2110         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2111         for usage).
2112       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2113         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2114         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2115       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2116         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2117
2118 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2119       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2120         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2121         value of GDCM_DICT_PATH.
2122       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2123
2124 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2125       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2126       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2127       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2128         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2129         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2130
2131 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2132       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2133         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2134         gdcmHeader.h
2135       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2136         (as opposed to gdcm.h)
2137       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2138       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2139         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2140       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2141
2142 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2143       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2144         bug.
2145
2146 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2147       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2148         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2149         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2150         of hidding away the python related distutils specific files
2151         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2152         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2153         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2154         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2155
2156 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2157       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2158       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2159         among the list of sources.
2160
2161 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2162       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2163       * modifications in MSVC projects
2164
2165 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2166       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2167         looks like we can move back to original usage of exception within
2168         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2169         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2170       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2171         README file for usage added.
2172       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2173         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2174         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2175         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2176       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2177       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2178         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2179           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2180           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2181           instance of class gdcmHeader.
2182         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2183           require no instances at all to be invocated.
2184         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2185           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2186           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2187       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2188         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2189       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2190         the above to be effective.
2191       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2192         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2193       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2194         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2195         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2196         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2197         (for python dectection).
2198       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2199         now avoids publishing the empty entries.
2200
2201 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2202       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2203         ExtraPath reused :-P
2204       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2205
2206 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2207       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2208       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2209       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2210         and links
2211
2212 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2213       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2214         method. Doxygenation.
2215       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2216
2217 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2218       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2219         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2220         when using "python setup.py install".
2221       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2222         reexports the working classes.
2223       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2224         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2225         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2226         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2227         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2228         subdir (see the README file). This problem probably due to
2229         an combination of g++ and dynamic loading.
2230       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2231
2232 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2233       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2234         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2235         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2236         again in a python subdir, but the package itself is now in
2237         python/gdcmPython.
2238       * setup.py was cleaned up:
2239         - pythonIncludePath removed
2240         - python setup.py bdist target is now functional.
2241       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2242         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2243         accordingly.
2244
2245 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2246       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2247       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2248         distutils installer is operational.
2249       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2250           shadow classes (from gdcm.py).
2251         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2252           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2253         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2254
2255 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2256       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2257         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2258         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2259         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2260         dictionary.
2261         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2262           are now in the "???" group.
2263         - python/gdcm.i changed accordingly,
2264         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2265           of the above new functionalities in Python.
2266
2267 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2268       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2269         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2270           were definitively removed.
2271         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2272       * src/gdcmElValSet.cxx:
2273         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2274         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2275         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2276         - Added GetElementByName(string).
2277       * src/gdcmHeader.cxx: added
2278         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2279         - GetPubElValRepByName(string)
2280         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2281         - GetShaElValRepByName(string)
2282         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2283         - GetShaElValRepByName(string)
2284         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2285         - GetElValRepByName(string)
2286         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2287         - GetElValRepByName(string)
2288       * Doc/requirements.txt added.
2289
2290 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2291       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2292       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2293         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2294         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2295         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2296       * python/testSuite.py changed accordingly.
2297
2298 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2299       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2300         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2301              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2302               cannot be exported. [...]
2303               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2304               be exported. [...]
2305               This is caused by a designed limitation that once a template
2306               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2307               exported."
2308         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2309         limitation" of VC++ is a pitfall.
2310         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2311         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2312         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2313         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2314         library.
2315         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2316       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2317          dll under windows !!!!)
2318       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2319       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2320         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2321       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2322         (one) of image(s).
2323       * removed glib references
2324       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2325
2326 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2327       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2328         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2329         the files of the testsuite without using unittest.
2330       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2331       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2332       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2333         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2334
2335 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2336       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2337         values, but limits itself to values which are below a user specified
2338         size (by default 1024 bytes).
2339       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2340         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2341         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2342         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2343       * python/testSuite.py
2344         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2345         - two new examples added.
2346       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2347
2348 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2349       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2350         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2351       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2352       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2353       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2354
2355 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2356       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2357         the vr was also RET.
2358       * python/testSuite.py more tests added.
2359
2360 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2361       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2362       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2363       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2364         7.18 Integer types (see stdint.h)
2365         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2366       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2367         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2368         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2369         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2370         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2371         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2372         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2373         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2374
2375 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2376       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2377         VR files.
2378       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2379
2380 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2381       * Adaptation for porting to VC++:
2382         - src/gdcm.h
2383           o forced to use std namespace (for string to be known)
2384           o all class use __declspec export style on WIN32
2385         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2386           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2387       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2388         variable GDCM_DICT_PATH.
2389       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2390
2391 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2392       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2393         to native Python dictionary.
2394       * python/demo/test.py:
2395         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2396         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2397       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2398         PubElVals hashing table.
2399       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2400
2401 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2402       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2403         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2404       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2405       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2406       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2407         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2408       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2409
2410 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2411       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2412         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2413         that we can import de shadow classes without errors].
2414
2415 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2416       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2417       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2418       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2419       * src/Makefile prepared for python wrapping
2420
2421 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2422       * src/gdcmHeader.cxx :
2423         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2424           (see gdcmHeader::LoadElements).
2425         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2426           ReadInt16 and ReadInt32)
2427
2428 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2429       * src/gdcmHeader.cxx :
2430         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2431           method.
2432         - SetLgrElem renamed to SetLength
2433         - GetLgrElem renamed to GetLength
2434         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2435       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2436       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2437         due to IdoDude was cleaned out.
2438
2439 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2440       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2441         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2442         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2443         returning the unecessary skL (skipped length).
2444         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2445         it was redundant with the File position internals (by using
2446         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2447         jajun.
2448       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2449         on the libido specificities which are handled through class
2450         inheritance.
2451       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2452         added.
2453
2454 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2455       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2456         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2457
2458 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2459       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2460
2461 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2462       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2463         and _IdDcmSWAP_LONG.
2464
2465 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2466       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2467         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2468