]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
ENH: * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
3   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
4   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
5   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
6   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
7   compilation time jpeg option.
8
9 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
10   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
11     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
12     reproduce at home.
13   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
14   Thanks dcmtk crew !
15
16 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
17   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
18   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
19     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
20   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
21   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
22   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
23   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
24     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
25     from File:: to PixelConvert::.
26
27 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
28   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
29     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
30      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
31      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
32
33 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
34   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
35   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
36   like this:
37     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
38   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
39   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
40   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
41
42 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
43   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
44     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
45     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
46     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
47     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
48       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
49       (for the time being this is better than having them attach to
50        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
51     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
52       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
53     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
54       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
55       gdcmPixelConvert::
56
57 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
58   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
59   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
60     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
61       clean up of RLE related code. 
62   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
63     - src/gdcmRLE.cxx removed
64     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
65     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
66     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
67   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
68     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
69       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
70       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
71
72 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
73   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
74     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
75       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
76       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
77       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
78       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
79       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
80       offsets.
81   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
82     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
83         with the retired Parse7Fe0().
84     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
85     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
86
87 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
88   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
89     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
90     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
91     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
92   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
93     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
94       to return an unused length.
95
96 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
97   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
98     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
99     to use to do simple stuff.
100
101 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
102   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
103     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
104     copying of the file within different directory, configure header file to
105     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
106     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
107
108 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
109   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
110      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
111        with it's binary name).
112      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
113        the Website to be more complete.
114      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
115        doxygenated documentation.
116      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
117        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
118                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
119   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
120   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
121    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
122
123 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
124   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
125    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
126
127 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
128   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
129     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
130     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
131     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
132     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
133   * GDCMHOME clean up:
134     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
135       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
136       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
137   * Autotools clean up:
138     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
139     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
140
141 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
142   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
143   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
144   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
145
146 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
147   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
148     describing TODO entries and used it for new entries.
149   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
150     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
151     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
152   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
153     documentation itself, but the website) moved to html and
154     placed in directory Doc/Website:
155     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
156     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
157     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
158   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
159   * CMakeLists.txt changed accordingly.
160   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
161     DeveloppersPython.html
162   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
163
164 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
165   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
166     of gdcm Web site.
167
168 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
169   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
170     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
171          we can now delete[] it safely  
172   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
173     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
174   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
175
176 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
177   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
178     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
179     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
180     pointed content.
181
182 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
183   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
184   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
185
186 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
187   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
188     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
189     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
190     an example of usage.
191     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
192       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
193     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
194       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
195     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
196     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
197     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
198
199 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
200   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
201     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
202     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
203     in class 
204     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
205       and associated accessors. Doxygenation of the class.
206     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
207       accessors added.
208     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
209       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
210     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
211     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
212
213 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
214   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
215     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
216       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
217            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
218            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
219            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
220            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
221            the same group and element all share the same (group, element)
222            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
223            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
224            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
225            consider the following definition of a TagKey:
226            - let Group, Element be the string representation of the
227              group and element dicom tag members,
228            - let ItemNumber be the string representation of the integer
229              index of the considered item number of a sequence,
230            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
231            the form:
232               /ItemNumber#Group|Element
233            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
234            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
235               Group|Element<SeqTag>
236            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
237            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
238            string e.g.
239                0028|1201
240            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
241            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
242            string e.g.
243                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
244     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
245       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
246       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
247     - src/gdcmDocEntry.cxx:
248       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
249          Key member.
250       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
251     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
252     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
253       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
254       -- now has a new BaseTagKey member.
255       -- STYLE.
256   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
257     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
258     truly belongs.
259     This poses the problem with the semantics of the following lines
260        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
261        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
262        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
263     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
264     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
265     order to get things working the dicom dictionary was altered !
266     Please fix things urgently...
267   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
268     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
269     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
270     set to OW:
271       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
272       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
273       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
274   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
275     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
276   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
277
278 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
279   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
280
281 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
282   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
283     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
284   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
285   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
286
287 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
288   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
289     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
290   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
291     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
292   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
293     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
294   * TODO updated
295   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
296     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
297   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
298   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
299     exception_on_error parameter.
300     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
301     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
302     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
303
304 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
305   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
306   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
307     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
308   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
309   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
310   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
311     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
312   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
313
314 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
315   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
316     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
317
318 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
319   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
320        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
321                  
322 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
323   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
324         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
325
326 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
327    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
328    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
329      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
330      is now in static in the gdcmDebug class
331    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
332    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
333
334 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
335    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
336      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
337    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
338      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
339      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
340      that displays position and size).
341    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
342      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
343      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
344      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
345      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
346      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
347      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
348         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
349      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
350      commiting changes).
351    * Test/CMakeLists.txt:
352       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
353       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
354         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
355         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
356    * TODO updated.
357
358 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
359    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
360      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
361      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
362      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
363      - removal of typedef duplication.
364      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
365      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
366    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
367       - printf polluting ctest removed.
368       - TAB removal for comminting
369    * Test:
370      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
371        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
372        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
373        this test creates them.
374        Note: we need to validate each reference image, but before that
375              I'd like to rename them with a more explicit name...
376      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
377    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
378      including each header needed).
379
380 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
381    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
382      test suite to the Example directory. Are concerned:
383      - PrintHeader.cxx
384      - TestDcm2Acr.cxx
385      - TestFindTags.cxx
386      - TestWrite.cxx was
387      - TestWriteSimple.cxx
388    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
389      image gdcmData/oldACR00001.ima
390
391 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
392    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
393      with removal from gdcmData):
394       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
395       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
396       - US.3405.1.dcm
397      Added the following because after last cvs update, they cause
398        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
399      to segfault:
400       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
401       - oldACR00001.ima
402    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
403      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
404      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
405      form of test...
406    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
407      we don't need to black list the following images anymore:
408       - 8BitsUncompressedColor.dcm
409       - OT-PAL-8-face.dcm
410       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
411    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
412      fixes and the beautified code ;-)
413      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
414      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
415      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
416            improve the test suite). The bug could be detected by using
417            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
418            or by using
419            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
420            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
421
422 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
423    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
424          - replace by uggly but working old code :-(
425                 A lot of things should be OK again.
426         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
427         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
428         (twice, withing a fortnigh ...)         
429
430 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
431    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
432      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
433    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
434      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
435      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
436                    - OT-PAL-8-face.dcm
437                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
438    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
439      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
440      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
441      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
442      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
443      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
444      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
445      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
446      image.
447    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
448      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
449      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
450      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
451    
452 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
453   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
454   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
455                           (instead of infinite loop)
456   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
457
458 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
459    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
460
461 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
462    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
463                     when SamplesPerPixel =3
464          - now Write is no longer confused by 
465                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
466          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
467                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
468    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
469                     (in order to split the job that has not to be done 
470                                         for gdcmDicomDir)
471
472 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
473    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
474      loop on the same image until memory went out. 
475      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
476    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
477      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
478
479 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
480    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
481             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
482                                 is added a the end, when necessary.
483             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
484                       now written correctly
485                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
486                                 (even for odd groups) 
487         Note : only Explicit Value Representation was checked.
488                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
489
490 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
491    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
492    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
493      coding style).
494
495 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
496    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
497      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
498    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
499
500 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
501    FIX : gdcmDocument.cxx
502       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
503         code 'beautyfication' :-(
504       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
505
506 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
507    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
508                  : to allow user to create his own Sequences
509         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
510
511 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
512         
513         - gdcmBinEntry
514           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
515           
516    - gdcmDocEntry
517           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
518           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
519           
520         - gdcmDocEntrySet
521           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
522           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
523      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
524      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
525      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
526      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
527                                             guint16 element,
528                                             std::string vr     = "unkn",
529                                             std::string fourth = "unkn",
530                                             std::string name   = "unkn"); 
531           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
532      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
533      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
534      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
535      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
536      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
537           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
538      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
539           
540         - gdcmDocument
541      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
542      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
543      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
544      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
545      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
546                                         FILE *_fp, FileType type);
547      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
548      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
549      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
550      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
551      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
552      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
553      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
554      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
555                                             guint16 element,
556                                             std::string vr     = "unkn",
557                                             std::string fourth = "unkn",
558                                             std::string name   = "unkn");
559      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
560      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
561      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
562      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
563                                                                                                                  
564         - gdcmElementSet
565           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
566           
567    - gdcmSeqEntry
568           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
569  
570    - gdcmSQItem
571      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
572      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
573      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
574      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
575
576    - gdcmValEntry
577          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
578                                   
579 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
580     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
581       The default constructor invoked by the line
582          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
583       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
584       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
585       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
586     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
587       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
588       Could anyone explain why ?
589     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
590       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
591       code related to gdcmBinEntry).
592
593 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
594     * In order to fix memory leaks:
595      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
596        some delete calls.
597      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
598      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
599        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
600        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
601        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
602      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
603      - src/gdcmDocument.cxx:
604        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
605           from dynamic stores.
606        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
607           was causing memory leaks.
608      - src/gdcmSQItem.cxx:
609        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
610           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
611        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
612           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
613           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
614           This avoids SegFaulting.
615      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
616     * Conclusion:
617      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
618        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
619        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
620      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
621        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
622      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
623        segfaults).
624     * Erroneous leading white fix:
625      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
626        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
627      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
628      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
629     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
630     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
631
632
633 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
634     * In order to fix writing of dicom files:
635      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
636      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
637      - src/gdcmDocument.cxx:
638        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
639        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
640        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
641           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
642           manner.
643        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
644           to only declared) and build on top of
645           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
646        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
647      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
648        for usage in destructor and treatement of promotion in
649        ::ReplaceOrCreateByNumber().
650      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
651       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
652     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
653       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
654       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
655       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
656
657 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
659       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
660       learned that:
661           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
662           soon as possible by globally disabling memory caching.
663           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
664           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
665       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
666       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
667       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
668     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
669       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
670       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
671       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
672         with 1.
673       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
674       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
675       understand why the list is empty...).
676     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
677     * Doc/License.txt added.
678
679 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
681       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
682         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
683         the padding problem.
684       - general clean up, simplification, and coding style.
685       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
686     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
687
688 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
689    *  gdcmSeqEntry.cxx
690            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
691                 - fix the display of SQItem ordinal number
692       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
693                 - remove some useless never written private methods     
694                 
695 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
696    * gdcmBinEntry.cxx 
697       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
698            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
699               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
700                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
701    * dcmDocument.cxx
702       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
703               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
704            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
705       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
706    * gdcmFile.cxx
707       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
708    * gdcmSQItem.h
709       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
710             a (relative) Item identier inside a given Sequence
711             \warning : some pb remaining around this number
712                                 will be solved asap
713       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
714    * gdcmValEntry.cxx 
715       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
716
717 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
718     * Memory leak hunt with the following command:
719       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
720                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
721       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
722       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
723       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
724           grep "MEMORY LEAK" src/*
725       Here are two typical examples which I can't help fixing:
726       -----
727           #include <string>
728           int main() {
729              std::string name;
730              char * test = "babo";
731              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
732                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
733              name.clear();   //// Doesn't help !
734              return 0;
735           }
736       -----
737           #include <string>
738           #include <iostream>
739           int main() {
740              std::string line;
741              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
742              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
743                                         //// of 1320 bytes in call to
744                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
745             return 0;
746           }
747       -----
748
749
750 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
751     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
752       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
753         and related, moved away to gdcmDocument.
754       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
755         the corresponding protected accessors of inherited class
756         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
757         declared friend of class gdcmDocument (see below).
758       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
759       - Clean up of undefined or unused methods.
760     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
761       account the changes to gdcmHeader.h).
762     * src/gdcmDocument.h:
763       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
764         changes to gdcmHeader.h).
765       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
766         (see changes to gdcmHeader.h).
767       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
768       - Clean up of undefined or unused methods.
769     * src/gdcmDocument.cxx:
770       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
771       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
772       - some std::string properly set to VRKey
773     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
774       references to gdcmDocument. 
775     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
776     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
777       cvs repository gdcmData.
778
779 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
780     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
781     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
782       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
783     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
784     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
785       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
786     * src/gdcmDocument.cxx: 
787       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
788         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
789       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
790         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
791         removed. Reverting to previous code segment with the proper
792         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
793         Note: this was (partially) breaking the python test suite
794               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
795               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
796     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
797     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
798       now taken into account.
799     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
800       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
801     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
802       on posix.
803     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
804       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
805     * .... alas, the python testSuite is still broken.
806
807 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
808     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
809       gdcmGlob
810     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
811     * src/gdcmUtil.h : export methods
812
813 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
814     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
815       to right behavior
816     * Initial addition of automatic python testing
817     * Initial addition of automatic image comparison
818
819 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
820     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
821       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
822
823 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
824      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
825      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
826      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
827
828 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
829      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
830        new concepts (and new classes) :
831        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
832         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
833         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
834        a Sequence is composed of Items.
835        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
836        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
837        (never taken into account)
838        Our unability to add a new 'entry' in the header
839        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
840        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
841        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
842        nothing is finished.
843        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
844
845 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
846      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
847      
848 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
849      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
850        file prefix (SetFilePrefix)
851
852 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
853      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
854        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
855        baseline.
856      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
857        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
858
859 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
860      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
861        dicom image
862
863 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
864      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
865      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
866        between the developper and user version.
867      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
868      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
869
870 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
871      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
872        when using cmake.
873
874 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
875      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
876                src directory, now generated in the build dir.
877             2. Tests as mentionned smarter
878             3. Some clean up
879             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
880           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
881           where we could set the institution name / patient name...
882
883        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
884               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
885                  (this was not true before)
886
887 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
888      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
889            SeQuence indented printing of Dicom Header.
890      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
891            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
892            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
893      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
894            tree-like structure of a Dicom Header.
895      * FIX Test code cleaning     
896            
897 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
898      * ENH: Adding automatic testing
899        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
900        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
901        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
902        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
903           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
904           too many projects
905      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
906      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
907        one file instead of seven + some small cleanup
908
909 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
910      * ENH Minor changes to the Print() methods.
911      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
912            Header printing. Example given with :
913            > PrintHeader fileName  2 new
914           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
915            
916 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
917      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
918          1. I have added some unsigned where needed
919          2. Some function parameter not used -> (void)
920          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
921          4. g++ don't like character '\' in comment
922          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
923                     this really need to be fixed
924          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
925          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
926                     this also really need to be fixed
927          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
928                     remove compression file 
929                     (as we only do decompression, right ?)     
930      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
931
932 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
933      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
934            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
935            defaulted to yspacing
936            
937 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
938      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
939      * ENH add parameters :
940                bool  exception_on_error = false, 
941                bool  enable_sequences   = false,
942                bool  ignore_shadow      = false
943            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
944      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
945            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
946               
947 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
948      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
949      
950 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
951      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
952      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
953              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
954              
955 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
956      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
957          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
958
959 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
960      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
961        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
962        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
963        in gdcmHeader.
964      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
965        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
966        already does the job.
967      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
968        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
969
970 2004-03-30 Benoit Regrain
971      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
972        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
973        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
974
975 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
976      * ENH : Check on file type to be written moved
977              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
978      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
979              when end-of-list is reached
980            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
981
982 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
983      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
984      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
985      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
986        equivalent to ExplicitVR in existing code).
987
988 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
989      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
990        now contains all the gdcmGlobal related code.
991      * minor coding style and doxygenation changes.
992
993 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
994      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
995        now contains all the Debug related code.
996      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
997      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
998        CreateCleanString) removed.
999      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1000      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1001      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1002      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1003        src/gdcmDirList.cxx)
1004
1005 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1006      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1007
1008 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1009      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1010            big endian made volumes
1011      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1012            end user to instanciate class gdcmParser
1013           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1014
1015 2004-03-22 Benoit Regrain
1016      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1017      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1018              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1019
1020 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1021      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1022            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1023            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1024            or build from the files held (recursively) in a Directory
1025            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1026            gdcmObject::SetBoundaries() added
1027
1028 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1029      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1030                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1031      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1032            DICOMDIR
1033      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1034            about the name
1035
1036 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1037      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1038                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1039
1040 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1041      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1042            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1043            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1044            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1045            to allow making gdcDicomDir object.
1046      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1047           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1048
1049 2004-02-11 Benoit Regrain
1050      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1051              when using from python
1052
1053 2004-02-10 Benoit Regrain
1054      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1055      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1056      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1057              directory parsing
1058
1059 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1060      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1061              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1062              - class gdcmMeta created
1063      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1064              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1065      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1066
1067 2004-02-05 Benoit Regrain
1068      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1069              header entries
1070      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1071      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1072
1073 2004-02-04 Benoit Regrain
1074      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1075      * FIX : sort the images in the dicom dir
1076      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1077      * ADD : a python demo
1078
1079 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1080      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1081      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1082              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1083              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1084              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1085      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1086            to make full checking easier
1087         
1088 2004-02-04 Benoit Regrain
1089      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1090      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1091
1092 2004-02-03 Benoit Regrain
1093      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1094      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1095      * Bug fix and print add-on
1096
1097 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1098      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1099      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1100      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1101      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1102            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1103         
1104 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1105      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1106              iterator on last
1107              of the last synonym :-(
1108      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1109              for DICOMDIR ;-)
1110      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1111      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1112      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1113            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1114       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1115
1116 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1117      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1118            no longer writes 'Un' on disk
1119      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1120      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1121            the length (for Palette expanded images)
1122            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1123      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1124            (that broke Write). Replaced by UL.
1125            Aware user will reload the field if he 
1126            thinks it's necesssary
1127              
1128 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1129      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1130        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1131        IsReadable() methods.
1132        
1133      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1134       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1135       but so usefull for people that miss them ;-)
1136       
1137      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1138        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1139
1140 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1141      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1142
1143 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1144      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1145              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1146         The TRUE value for this param has to be used 
1147         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1148         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1149      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1150              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1151         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1152         
1153      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1154              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1155              Fixed
1156
1157      * gdcmHeader add the method
1158              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1159         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1160         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1161         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1162
1163 2004-01-26 Benoit Regrain
1164      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1165        in the print and add a third level of print to print them
1166
1167 2004-01-23 Benoit Regrain
1168      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1169      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1170      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1171        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1172
1173 2004-01-22 Benoit Regrain
1174      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1175      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1176
1177 2004-01-19 Benoit Regrain
1178      * Add the use of shadow dictionaries
1179      * bug fix and coding style
1180
1181 2004-01-19 Benoit Regrain
1182      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1183      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1184      * Add the update of header entries using the shadow library
1185
1186 2004-01-19 Benoit Regrain
1187      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1188      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1189        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1190        of dicom dir parsing
1191      * bug fix under python
1192
1193 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1194     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1195     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1196     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1197     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1198
1199 2004-01-15 Benoit Regrain
1200      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1201        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1202        when the gdcmDictSet will be destroyed
1203      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1204        gdcmDictSet
1205
1206 2004-01-15 Benoit Regrain
1207      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1208        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1209        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1210        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1211      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1212
1213 2004-01-14 Benoit Regrain
1214      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1215      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1216      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1217      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1218
1219 2004-01-13 Benoit Regrain
1220      * src/*.[h|cxx] : coding style
1221      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1222
1223 2004-01-13 Benoit Regrain
1224      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1225      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1226        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1227      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1228
1229 2004-01-12 Benoit Regrain
1230      * src/*.h : add comments
1231      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1232      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1233        directly setted in the source code
1234      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1235        gdcmTS and gdcmVR
1236
1237 2004-01-09 Benoit Regrain
1238      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1239      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1240
1241 2004-01-07 Benoit Regrain
1242      * Modification to compile with the distutils.
1243      * Bug fix in code
1244
1245 2003-12-10 Benoit Regrain
1246      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1247        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1248      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1249        made in the source code
1250
1251 2003-12-10 Benoit Regrain
1252      * Update Windows projects and .cvsignore files
1253
1254 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1255      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1256            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1257            if he wants to.
1258            gdcmElValSet:Print takes it into account
1259
1260 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1261      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1262      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1263      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1264
1265 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1266       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1267              on the ListTag listElem member,
1268              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1269       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1270              with the tagHt member and the listElem member.
1271              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1272
1273       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1274              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1275                             if bug fixing is necessary), for internal
1276                             use only
1277              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1278                             or to allow Parser going on.
1279              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1280              with a length (not 0000) is found
1281       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1282                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1283                 (to be written)
1284
1285 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1286      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1287      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1288           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1289      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1290
1291 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1292      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1293
1294 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1295      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1296           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1297
1298 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1299      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1300      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1301              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1302              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1303
1304 2003-11-05 Benoit Regrain
1305      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1306                        : Explicit error messages
1307      * in __init__.py  : Related modif
1308
1309 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1310      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1311            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1312            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1313      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1314                     (vtkGdcmReader compliant)           
1315       
1316 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1317      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1318        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1319        
1320 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1321      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1322            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1323
1324 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1325      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1326                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1327              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1328              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1329              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1330              such an image :
1331              After gdcmHeader :
1332               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1333               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1334               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1335      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1336              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1337
1338 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1339      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1340              
1341 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1342      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1343            being coherents dicom files.
1344      
1345 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1346      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1347            from medcon lib !
1348      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1349      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1350      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1351      * ENH: Add include dir to medcon lib
1352      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1353            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1354             
1355 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1356       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1357         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1358           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1359       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1360
1361 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1362       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1363         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1364         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1365       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1366       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1367
1368 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1369       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1370                                                
1371 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1372       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1373       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1374       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1375       
1376 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1377       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1378       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1379       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1380       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1381       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1382       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1383              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1384         But it fasten debug compilation time.
1385             
1386 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1387       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1388         (they are compressed as 2 planes images, 
1389          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1390
1391 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1392       * Now CheckRead takes into account :
1393          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1394          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1395       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1396        (breaks DicomWorks)
1397
1398 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1399       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1400              one should remove the '\'
1401         
1402 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1403       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1404         (wrong lengths in header)
1405         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1406       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1407         (breaks DicomWorks)
1408
1409 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1410       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1411         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1412
1413 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1414       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1415       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1416
1417 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1418       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1419      
1420 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1421       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1422         (the patch is easy to remove)
1423       * cosmetic changes to avoid warnings
1424       
1425 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1426       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1427         no need to press 'r' now.
1428    
1429 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1430       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1431         to new Jpeg Lossless decompressor
1432       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1433       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1434       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1435                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1436 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1437       * general anonymisation in gdcmData
1438       * adding the 'color files' from
1439         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1440       * adding some well knowed bugged-header images
1441       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1442         waiting for their inclusion in Python testsuite
1443
1444 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1445     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1446       no longer seg faults when file is not found
1447
1448 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1449      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1450        MultiFrame images
1451
1452 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1453      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1454
1455 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1456      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1457         OpenFile takes it into account
1458      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1459      * Missing elements added in dicomV3.dic
1460       (just to be affraid : have a look at
1461        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1462        and do it again next year ;->
1463
1464 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1465      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1466        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1467        But there are NOT. It's fixed !
1468        
1469 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1470      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1471      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1472          
1473 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1474      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1475              an ACR-NEMA / DICOM one.
1476      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1477              is not gdcm Readable
1478      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1479              is now decoded.
1480         
1481 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1482      * FIX: CMake generate now documentation
1483      * ENH: out of source doc build !
1484      * ENH: Generate both user and dev documentation
1485      * ENH: Should work on windows too
1486      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1487      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1488      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1489      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1490                      
1491 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1492      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1493      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1494      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1495         window level & window width
1496
1497 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1498      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1499      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1500      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1501      
1502 2003-10-06  Emanuel Ollart
1503      * FIX : compilation process wad broken.
1504              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1505         
1506 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1507      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1508      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1509      
1510 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1511      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1512            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1513                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1514       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1515
1516 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1517       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1518         to remain compliant with already defined strings, 
1519         like Transfert Syntax UID and others)
1520
1521 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1522       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1523              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1524         
1525 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1526       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1527       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1528
1529 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1530       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1531         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1532               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1533       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1534
1535 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1536       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1537
1538 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1539       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1540         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1541
1542 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1543       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1544          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1545          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1546          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1547           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1548                                             YBR_RCT files.
1549           (no sample found :-(
1550
1551 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1552       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1553         Two reasons: - clear things
1554                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1555                        suffer anymore VC++ complains
1556
1557 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1558       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1559       * removed leaks
1560
1561 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1562       * The lines are now eigthy characters long.for 
1563         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1564
1565 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1566       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1567         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1568         previous commis of Malaterre)
1569       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1570         before the last Malaterre's commit.
1571
1572 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1573       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1574         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1575       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1576         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1577
1578 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1579       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1580         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1581         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1582
1583 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1584       * Cosmetic changes:
1585         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1586           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1587           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1588           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1589         - PACKAGER corrected
1590         - DEVELOPPER added.
1591         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1592       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1593
1594 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1595       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1596
1597 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1598       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1599
1600 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1601       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1602
1603 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1604       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1605
1606 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1607       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1608         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1609         heuristics to get informations (look at different places).
1610       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1611         sorting DICOM images based on different strategies.
1612       * modified Makefiles accordingly.
1613
1614 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1615       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1616         when building in debug mode
1617       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1618         src/win32/gdcmdll.dsp
1619       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1620
1621 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1622       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1623             to valgrind.
1624
1625 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1626       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1627       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1628                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1629       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1630
1631 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1632       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1633         the file
1634       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1635       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1636         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1637       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1638         symbols... future problem ?
1639
1640 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1641       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1642       * modified gdcm.dsw accordingly
1643
1644 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1645       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1646
1647 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1648       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1649         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1650       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1651         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1652         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1653
1654 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1655       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1656
1657 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1658       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1659       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1660       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1661       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1662       * PACKAGER : adding all concerning windows
1663
1664 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1665       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1666         garbage debug code.
1667       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1668       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1669         test suite reported error.
1670       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1671         packaging a new release).
1672       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1673       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1674       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1675         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1676         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1677
1678 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1679       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1680       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1681
1682 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1683       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1684         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1685         is made in an internal list to prevent this problem.
1686         Bug fix when output is empty.
1687         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1688         correction.
1689       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1690
1691 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1692       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1693       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1694         files. Added method to remove all files on the input
1695         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1696         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1697
1698 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1699       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1700         when using make instal.
1701       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1702         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1703
1704 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1705       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1706       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1707
1708 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1709       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1710         linux and WINDOWS !
1711       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1712       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1713
1714 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1715       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1716         addon of the jpeg library)
1717       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1718       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1719       * INSTALL now points to web documentation
1720
1721 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1722       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1723         gdcmUtil.h anymore.
1724       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1725         clean target.
1726       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1727         - to allow compilation with gcc 3.x
1728           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1729           -- small fixes on exceptions.
1730           Note: linking not tested !
1731         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1732           building stage.
1733       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1734         dependent convertion).
1735
1736 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1737       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1738         Changelog):
1739         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1740         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1741           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1742         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1743
1744 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1745       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1746         compile
1747       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1748         (FileName -> Filename)
1749
1750 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1751       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1752         - UpdateProgress method should now be effective
1753         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1754           to volumes),
1755         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1756           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1757           accelerating things).
1758         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1759           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1760           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1761           in the stack (for the caller to notice the problem).
1762
1763 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1764       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1765
1766 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1767       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1768         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1769         under Windows... thanks Windows !)
1770
1771 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1772       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1773         debug stage).
1774       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1775
1776 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1777       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1778
1779 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1780       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1781         called with different flags than the default ones (with automake).
1782         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1783            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1784         and went for warning fixes:
1785         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1786           up from unused variables.
1787         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1788       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1789
1790 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1791       * gdcmPython/gdcm.i:
1792         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1793           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1794           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1795         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1796           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1797           exported to Python a as cvar.
1798       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1799         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1800         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1801         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1802         C++ static methods).
1803       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1804         with the above changes.
1805
1806 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1807       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1808
1809 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1810       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1811         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1812         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1813          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1814          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1815            a wrapper
1816          - Wrapper interface which wrap sources
1817         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1818         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1819       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1820         files for compilation
1821
1822 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1823       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1824         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1825         - vtk/Makefile.am now builds a library
1826         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1827           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1828           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1829           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1830           import library.
1831         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1832           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1833           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1834           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1835           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1836         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1837           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1838         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1839           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1840       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1841       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1842         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1843         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1844         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1845         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1846         collision of various stl members (principally cout...).
1847       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1848         file.
1849       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1850         comply with above changes)
1851
1852 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1853       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1854       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1855         vtk data structure (an image Flip was required).
1856       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1857       * cosmetic changes in documentation.
1858
1859 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1860       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1861         unexisting file is given as argument.
1862       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1863         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1864         containing those images is now available at
1865           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1866         with the name gdcmData.
1867         All the python scripts (including the package initialisation file
1868         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1869         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1870
1871 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1872       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1873         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1874         demo of the usage of this class.
1875         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1876         at configure (or autogen.sh) stage.
1877
1878 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1879       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1880         Notes on valgrind:
1881           - maximum info is obtained with a command of the form:
1882             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1883                      --show-reachable=yes PrintHeader
1884           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1885             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1886             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1887             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1888              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1889       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1890         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1891         Note: some images don't seem to work e.g.
1892             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1893       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1894         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1895         make gdcm more thread friendly.
1896
1897 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1898       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1899           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1900         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1901           gdcmHeader::_dicom_vr.
1902         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1903         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1904           VRHT*.
1905         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1906
1907 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1908       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1909         make install stage.
1910
1911 2003-04-9 JPR
1912       * UpdateGroupLength replaced by new one
1913
1914 2003-04-7 JPR
1915       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1916         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1917
1918 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1919       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1920       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1921       * src:
1922         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1923         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1924           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1925         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1926           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1927           carried the same semantics.
1928           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1929         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1930           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1931         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1932       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1933       * gdcmGetXSize added
1934       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1935       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1936
1937 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1938       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1939         (to avoid double call by end user).
1940       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1941         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1942
1943 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1944       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1945         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1946           the html.users end users oriented documentation and
1947           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1948           oriented documentation.
1949         - README changed accordingly
1950         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1951         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1952           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1953         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1954           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1955           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1956       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1957         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1958       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1959         ill-formed documentation sections.
1960       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1961
1962 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1963       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1964       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1965         un*ces with sh-utils test utility.
1966       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1967       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1968       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1969       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1970       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1971
1972 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1973       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1974       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1975
1976 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1977       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1978       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1979       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1980       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1981         compilation work.
1982       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1983       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1984
1985 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1986       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1987         hence the user doesn't need this explicit call.
1988         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1989           i.e. LoadElements() call removed.
1990       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1991         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1992       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1993         for adding user defined new tags.
1994         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1995         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1996           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1997
1998 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1999       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2000         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2001         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2002         with the autotools, included the python wrappers part.
2003       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2004
2005 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2006       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2007
2008 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2009       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2010         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2011         for usage).
2012       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2013         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2014         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2015       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2016         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2017
2018 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2019       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2020         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2021         value of GDCM_DICT_PATH.
2022       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2023
2024 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2025       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2026       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2027       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2028         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2029         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2030
2031 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2032       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2033         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2034         gdcmHeader.h
2035       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2036         (as opposed to gdcm.h)
2037       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2038       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2039         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2040       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2041
2042 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2043       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2044         bug.
2045
2046 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2047       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2048         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2049         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2050         of hidding away the python related distutils specific files
2051         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2052         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2053         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2054         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2055
2056 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2057       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2058       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2059         among the list of sources.
2060
2061 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2062       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2063       * modifications in MSVC projects
2064
2065 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2066       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2067         looks like we can move back to original usage of exception within
2068         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2069         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2070       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2071         README file for usage added.
2072       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2073         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2074         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2075         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2076       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2077       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2078         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2079           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2080           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2081           instance of class gdcmHeader.
2082         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2083           require no instances at all to be invocated.
2084         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2085           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2086           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2087       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2088         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2089       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2090         the above to be effective.
2091       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2092         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2093       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2094         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2095         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2096         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2097         (for python dectection).
2098       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2099         now avoids publishing the empty entries.
2100
2101 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2102       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2103         ExtraPath reused :-P
2104       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2105
2106 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2107       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2108       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2109       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2110         and links
2111
2112 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2113       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2114         method. Doxygenation.
2115       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2116
2117 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2119         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2120         when using "python setup.py install".
2121       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2122         reexports the working classes.
2123       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2124         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2125         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2126         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2127         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2128         subdir (see the README file). This problem probably due to
2129         an combination of g++ and dynamic loading.
2130       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2131
2132 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2133       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2134         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2135         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2136         again in a python subdir, but the package itself is now in
2137         python/gdcmPython.
2138       * setup.py was cleaned up:
2139         - pythonIncludePath removed
2140         - python setup.py bdist target is now functional.
2141       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2142         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2143         accordingly.
2144
2145 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2146       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2147       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2148         distutils installer is operational.
2149       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2150           shadow classes (from gdcm.py).
2151         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2152           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2153         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2154
2155 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2156       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2157         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2158         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2159         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2160         dictionary.
2161         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2162           are now in the "???" group.
2163         - python/gdcm.i changed accordingly,
2164         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2165           of the above new functionalities in Python.
2166
2167 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2168       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2169         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2170           were definitively removed.
2171         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2172       * src/gdcmElValSet.cxx:
2173         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2174         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2175         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2176         - Added GetElementByName(string).
2177       * src/gdcmHeader.cxx: added
2178         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2179         - GetPubElValRepByName(string)
2180         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2181         - GetShaElValRepByName(string)
2182         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2183         - GetShaElValRepByName(string)
2184         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2185         - GetElValRepByName(string)
2186         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2187         - GetElValRepByName(string)
2188       * Doc/requirements.txt added.
2189
2190 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2191       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2192       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2193         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2194         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2195         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2196       * python/testSuite.py changed accordingly.
2197
2198 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2199       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2200         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2201              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2202               cannot be exported. [...]
2203               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2204               be exported. [...]
2205               This is caused by a designed limitation that once a template
2206               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2207               exported."
2208         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2209         limitation" of VC++ is a pitfall.
2210         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2211         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2212         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2213         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2214         library.
2215         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2216       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2217          dll under windows !!!!)
2218       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2219       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2220         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2221       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2222         (one) of image(s).
2223       * removed glib references
2224       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2225
2226 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2227       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2228         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2229         the files of the testsuite without using unittest.
2230       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2231       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2232       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2233         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2234
2235 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2236       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2237         values, but limits itself to values which are below a user specified
2238         size (by default 1024 bytes).
2239       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2240         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2241         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2242         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2243       * python/testSuite.py
2244         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2245         - two new examples added.
2246       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2247
2248 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2249       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2250         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2251       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2252       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2253       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2254
2255 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2256       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2257         the vr was also RET.
2258       * python/testSuite.py more tests added.
2259
2260 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2261       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2262       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2263       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2264         7.18 Integer types (see stdint.h)
2265         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2266       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2267         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2268         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2269         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2270         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2271         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2272         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2273         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2274
2275 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2276       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2277         VR files.
2278       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2279
2280 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2281       * Adaptation for porting to VC++:
2282         - src/gdcm.h
2283           o forced to use std namespace (for string to be known)
2284           o all class use __declspec export style on WIN32
2285         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2286           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2287       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2288         variable GDCM_DICT_PATH.
2289       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2290
2291 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2292       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2293         to native Python dictionary.
2294       * python/demo/test.py:
2295         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2296         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2297       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2298         PubElVals hashing table.
2299       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2300
2301 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2302       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2303         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2304       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2305       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2306       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2307         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2308       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2309
2310 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2311       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2312         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2313         that we can import de shadow classes without errors].
2314
2315 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2316       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2317       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2318       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2319       * src/Makefile prepared for python wrapping
2320
2321 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2322       * src/gdcmHeader.cxx :
2323         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2324           (see gdcmHeader::LoadElements).
2325         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2326           ReadInt16 and ReadInt32)
2327
2328 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2329       * src/gdcmHeader.cxx :
2330         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2331           method.
2332         - SetLgrElem renamed to SetLength
2333         - GetLgrElem renamed to GetLength
2334         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2335       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2336       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2337         due to IdoDude was cleaned out.
2338
2339 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2341         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2342         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2343         returning the unecessary skL (skipped length).
2344         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2345         it was redundant with the File position internals (by using
2346         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2347         jajun.
2348       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2349         on the libido specificities which are handled through class
2350         inheritance.
2351       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2352         added.
2353
2354 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2355       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2356         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2357
2358 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2359       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2360
2361 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2362       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2363         and _IdDcmSWAP_LONG.
2364
2365 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2366       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2367         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2368