]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
794a35e92100976be53e36ba877aea7f2abcdd01
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
4         among the list of sources.
5       
6 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
7       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
8       * modifications in MSVC projects
9
10 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
11       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
12         looks like we can move back to original usage of exception within
13         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
14         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
15       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
16         README file for usage added.
17       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
18         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
19         testing the proper parsing of a Dicom related file.
20         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
21       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
22       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
23         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
24           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
25           Dicom public dictionnary were not accessible without an
26           instance of class gdcmHeader.
27         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
28           require no instances at all to be invocated.
29         - within gdcmDictSet this change required to change some method
30           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
31           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
32       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
33         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
34       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
35         the above to be effective.
36       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
37         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
38       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
39         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
40         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
41         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
42         (for python dectection).
43       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
44         now avoids publishing the empty entries.
45
46 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
47       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
48         ExtraPath reused :-P
49       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
50
51 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
52       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
53       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
54       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
55         and links
56
57 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
58       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
59         method. Doxygenation.
60       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
61
62 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
63       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
64         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
65         when using "python setup.py install".
66       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
67         reexports the working classes.
68       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
69         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
70         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
71         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
72         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
73         subdir (see the README file). This problem probably due to
74         an combination of g++ and dynamic loading.
75       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
76
77 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
78       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
79         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
80         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
81         again in a python subdir, but the package itself is now in
82         python/gdcmPython.
83       * setup.py was cleaned up:
84         - pythonIncludePath removed
85         - python setup.py bdist target is now functional.
86       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
87         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
88         accordingly.
89 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
90       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
91       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
92         distutils installer is operational.
93       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
94           shadow classes (from gdcm.py).
95         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
96           instead of gdcmPython/demo/load.py.
97         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
98         
99
100 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
101       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
102         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
103         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
104         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
105         dictionary.
106         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
107           are now in the "???" group.
108         - python/gdcm.i changed accordingly,
109         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
110           of the above new functionalities in Python.
111
112 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
113       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
114         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
115           were definitively removed.
116         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
117       * src/gdcmElValSet.cxx:
118         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
119         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
120         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
121         - Added GetElementByName(string).
122       * src/gdcmHeader.cxx: added
123         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
124         - GetPubElValRepByName(string)
125         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
126         - GetShaElValRepByName(string)
127         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
128         - GetShaElValRepByName(string)
129         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
130         - GetElValRepByName(string)
131         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
132         - GetElValRepByName(string)
133       * Doc/requirements.txt added.
134
135 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
136       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
137       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
138         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of 
139         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
140         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
141       * python/testSuite.py changed accordingly.
142
143 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
144       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
145         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
146              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
147               cannot be exported. [...]
148               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
149               be exported. [...]
150               This is caused by a designed limitation that once a template
151               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
152               exported."
153         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
154         limitation" of VC++ is a pitfall.
155         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked 
156         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
157         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
158         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
159         library. 
160         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
161       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
162          dll under windows !!!!)
163       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
164       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
165         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
166       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set 
167         (one) of image(s).
168       * removed glib references
169       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
170
171 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
172       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
173         that only displays required tags and testAll.py that parses all
174         the files of the testsuite without using unittest.
175       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
176       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
177       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
178         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
179
180 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
181       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
182         values, but limits itself to values which are below a user specified
183         size (by default 1024 bytes).
184       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
185         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
186         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
187         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
188       * python/testSuite.py
189         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
190         - two new examples added.
191       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
192
193 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
194       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
195         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
196       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
197       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
198       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
199
200 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
201       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
202         the vr was also RET.
203       * python/testSuite.py more tests added.
204
205 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
206       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
207       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
208       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
209         7.18 Integer types (see stdint.h)
210         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
211       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
212         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
213         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
214         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
215         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
216         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
217         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
218         The rest of the changes we the necessary adaptations.
219
220 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
221       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
222         VR files.
223       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
224
225 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
226       * Adaptation for porting to VC++:
227         - src/gdcm.h
228           o forced to use std namespace (for string to be known)
229           o all class use __declspec export style on WIN32
230         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
231           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
232       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
233         variable GDCM_DICT_PATH.
234       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
235
236 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
237       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
238         to native Python dictionary.
239       * python/demo/test.py:
240         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
241         - takes an optional filename argument (the file to parse).
242       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
243         PubElVals hashing table. 
244       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
245
246 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
247       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
248         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
249       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
250       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
251       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
252         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
253       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
254
255 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
256       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
257         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
258         that we can import de shadow classes without errors].
259
260 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
261       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
262       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
263       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
264       * src/Makefile prepared for python wrapping
265
266 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
267       * src/gdcmHeader.cxx :
268         - Parsing of header is now separated from loading of element values
269           (see gdcmHeader::LoadElements).
270         - general clean up of hopefully all file access (creation of
271           ReadInt16 and ReadInt32)
272
273 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
274       * src/gdcmHeader.cxx :
275         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
276           method.
277         - SetLgrElem renamed to SetLength
278         - GetLgrElem renamed to GetLength
279         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
280       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
281       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
282         due to IdoDude was cleaned out.
283
284 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
285       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
286         concentrates on finding the value representation (when it exists).
287         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
288         returning the unecessary skL (skipped length).
289         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
290         it was redundant with the File position internals (by using
291         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
292         jajun.
293       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
294         on the libido specificities which are handled through class 
295         inheritance.
296       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
297         added. 
298
299 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
301         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
302
303 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
304       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
305
306 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
307       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
308         and _IdDcmSWAP_LONG.
309
310 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
311       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
312         May 23 2002. Needless to say we are running late...
313