]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
3     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
4   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
5     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
6   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
7     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
8   * TODO updated
9
10 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
11   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
12   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
13     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
14   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
15   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
16   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
17     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
18   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
19
20 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
21   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
22     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
23
24 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
25   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
26        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
27                  
28 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
29   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
30         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
31
32 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
33    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
34    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
35      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
36      is now in static in the gdcmDebug class
37    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
38    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
39
40 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
41    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
42      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
43    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
44      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
45      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
46      that displays position and size).
47    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
48      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
49      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
50      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
51      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
52      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
53      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
54         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
55      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
56      commiting changes).
57    * Test/CMakeLists.txt:
58       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
59       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
60         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
61         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
62    * TODO updated.
63
64 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
65    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
66      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
67      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
68      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
69      - removal of typedef duplication.
70      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
71      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
72    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
73       - printf polluting ctest removed.
74       - TAB removal for comminting
75    * Test:
76      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
77        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
78        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
79        this test creates them.
80        Note: we need to validate each reference image, but before that
81              I'd like to rename them with a more explicit name...
82      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
83    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
84      including each header needed).
85
86 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
87    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
88      test suite to the Example directory. Are concerned:
89      - PrintHeader.cxx
90      - TestDcm2Acr.cxx
91      - TestFindTags.cxx
92      - TestWrite.cxx was
93      - TestWriteSimple.cxx
94    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
95      image gdcmData/oldACR00001.ima
96
97 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
98    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
99      with removal from gdcmData):
100       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
101       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
102       - US.3405.1.dcm
103      Added the following because after last cvs update, they cause
104        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
105      to segfault:
106       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
107       - oldACR00001.ima
108    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
109      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
110      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
111      form of test...
112    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
113      we don't need to black list the following images anymore:
114       - 8BitsUncompressedColor.dcm
115       - OT-PAL-8-face.dcm
116       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
117    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
118      fixes and the beautified code ;-)
119      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
120      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
121      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
122            improve the test suite). The bug could be detected by using
123            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
124            or by using
125            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
126            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
127
128 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
129    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
130          - replace by uggly but working old code :-(
131                 A lot of things should be OK again.
132         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
133         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
134         (twice, withing a fortnigh ...)         
135
136 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
137    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
138      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
139    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
140      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
141      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
142                    - OT-PAL-8-face.dcm
143                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
144    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
145      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
146      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
147      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
148      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
149      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
150      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
151      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
152      image.
153    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
154      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
155      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
156      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
157    
158 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
159   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
160   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
161                           (instead of infinite loop)
162   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
163
164 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
165    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
166
167 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
168    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
169                     when SamplesPerPixel =3
170          - now Write is no longer confused by 
171                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
172          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
173                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
174    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
175                     (in order to split the job that has not to be done 
176                                         for gdcmDicomDir)
177
178 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
179    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
180      loop on the same image until memory went out. 
181      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
182    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
183      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
184
185 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
186    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
187             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
188                                 is added a the end, when necessary.
189             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
190                       now written correctly
191                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
192                                 (even for odd groups) 
193         Note : only Explicit Value Representation was checked.
194                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
195
196 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
197    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
198    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
199      coding style).
200
201 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
202    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
203      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
204    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
205
206 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
207    FIX : gdcmDocument.cxx
208       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
209         code 'beautyfication' :-(
210       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
211
212 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
213    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
214                  : to allow user to create his own Sequences
215         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
216
217 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
218         
219         - gdcmBinEntry
220           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
221           
222    - gdcmDocEntry
223           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
224           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
225           
226         - gdcmDocEntrySet
227           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
228           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
229      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
230      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
231      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
232      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
233                                             guint16 element,
234                                             std::string vr     = "unkn",
235                                             std::string fourth = "unkn",
236                                             std::string name   = "unkn"); 
237           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
238      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
239      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
240      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
241      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
242      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
243           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
244      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
245           
246         - gdcmDocument
247      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
248      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
249      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
250      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
251      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
252                                         FILE *_fp, FileType type);
253      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
254      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
255      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
256      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
257      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
258      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
259      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
260      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
261                                             guint16 element,
262                                             std::string vr     = "unkn",
263                                             std::string fourth = "unkn",
264                                             std::string name   = "unkn");
265      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
266      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
267      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
268      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
269                                                                                                                  
270         - gdcmElementSet
271           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
272           
273    - gdcmSeqEntry
274           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
275  
276    - gdcmSQItem
277      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
278      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
279      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
280      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
281
282    - gdcmValEntry
283          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
284                                   
285 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
286     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
287       The default constructor invoked by the line
288          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
289       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
290       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
291       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
292     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
293       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
294       Could anyone explain why ?
295     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
296       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
297       code related to gdcmBinEntry).
298
299 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300     * In order to fix memory leaks:
301      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
302        some delete calls.
303      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
304      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
305        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
306        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
307        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
308      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
309      - src/gdcmDocument.cxx:
310        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
311           from dynamic stores.
312        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
313           was causing memory leaks.
314      - src/gdcmSQItem.cxx:
315        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
316           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
317        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
318           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
319           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
320           This avoids SegFaulting.
321      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
322     * Conclusion:
323      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
324        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
325        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
326      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
327        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
328      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
329        segfaults).
330     * Erroneous leading white fix:
331      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
332        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
333      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
334      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
335     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
336     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
337
338
339 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
340     * In order to fix writing of dicom files:
341      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
342      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
343      - src/gdcmDocument.cxx:
344        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
345        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
346        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
347           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
348           manner.
349        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
350           to only declared) and build on top of
351           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
352        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
353      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
354        for usage in destructor and treatement of promotion in
355        ::ReplaceOrCreateByNumber().
356      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
357       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
358     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
359       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
360       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
361       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
362
363 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
364     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
365       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
366       learned that:
367           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
368           soon as possible by globally disabling memory caching.
369           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
370           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
371       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
372       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
373       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
374     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
375       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
376       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
377       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
378         with 1.
379       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
380       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
381       understand why the list is empty...).
382     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
383     * Doc/License.txt added.
384
385 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
386     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
387       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
388         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
389         the padding problem.
390       - general clean up, simplification, and coding style.
391       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
392     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
393
394 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
395    *  gdcmSeqEntry.cxx
396            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
397                 - fix the display of SQItem ordinal number
398       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
399                 - remove some useless never written private methods     
400                 
401 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
402    * gdcmBinEntry.cxx 
403       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
404            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
405               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
406                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
407    * dcmDocument.cxx
408       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
409               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
410            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
411       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
412    * gdcmFile.cxx
413       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
414    * gdcmSQItem.h
415       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
416             a (relative) Item identier inside a given Sequence
417             \warning : some pb remaining around this number
418                                 will be solved asap
419       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
420    * gdcmValEntry.cxx 
421       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
422
423 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
424     * Memory leak hunt with the following command:
425       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
426                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
427       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
428       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
429       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
430           grep "MEMORY LEAK" src/*
431       Here are two typical examples which I can't help fixing:
432       -----
433           #include <string>
434           int main() {
435              std::string name;
436              char * test = "babo";
437              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
438                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
439              name.clear();   //// Doesn't help !
440              return 0;
441           }
442       -----
443           #include <string>
444           #include <iostream>
445           int main() {
446              std::string line;
447              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
448              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
449                                         //// of 1320 bytes in call to
450                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
451             return 0;
452           }
453       -----
454
455
456 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
457     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
458       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
459         and related, moved away to gdcmDocument.
460       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
461         the corresponding protected accessors of inherited class
462         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
463         declared friend of class gdcmDocument (see below).
464       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
465       - Clean up of undefined or unused methods.
466     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
467       account the changes to gdcmHeader.h).
468     * src/gdcmDocument.h:
469       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
470         changes to gdcmHeader.h).
471       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
472         (see changes to gdcmHeader.h).
473       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
474       - Clean up of undefined or unused methods.
475     * src/gdcmDocument.cxx:
476       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
477       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
478       - some std::string properly set to VRKey
479     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
480       references to gdcmDocument. 
481     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
482     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
483       cvs repository gdcmData.
484
485 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
486     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
487     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
488       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
489     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
490     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
491       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
492     * src/gdcmDocument.cxx: 
493       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
494         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
495       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
496         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
497         removed. Reverting to previous code segment with the proper
498         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
499         Note: this was (partially) breaking the python test suite
500               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
501               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
502     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
503     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
504       now taken into account.
505     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
506       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
507     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
508       on posix.
509     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
510       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
511     * .... alas, the python testSuite is still broken.
512
513 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
514     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
515       gdcmGlob
516     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
517     * src/gdcmUtil.h : export methods
518
519 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
520     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
521       to right behavior
522     * Initial addition of automatic python testing
523     * Initial addition of automatic image comparison
524
525 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
526     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
527       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
528
529 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
530      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
531      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
532      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
533
534 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
535      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
536        new concepts (and new classes) :
537        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
538         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
539         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
540        a Sequence is composed of Items.
541        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
542        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
543        (never taken into account)
544        Our unability to add a new 'entry' in the header
545        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
546        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
547        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
548        nothing is finished.
549        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
550
551 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
552      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
553      
554 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
555      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
556        file prefix (SetFilePrefix)
557
558 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
559      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
560        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
561        baseline.
562      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
563        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
564
565 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
566      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
567        dicom image
568
569 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
570      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
571      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
572        between the developper and user version.
573      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
574      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
575
576 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
577      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
578        when using cmake.
579
580 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
581      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
582                src directory, now generated in the build dir.
583             2. Tests as mentionned smarter
584             3. Some clean up
585             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
586           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
587           where we could set the institution name / patient name...
588
589        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
590               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
591                  (this was not true before)
592
593 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
594      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
595            SeQuence indented printing of Dicom Header.
596      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
597            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
598            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
599      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
600            tree-like structure of a Dicom Header.
601      * FIX Test code cleaning     
602            
603 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
604      * ENH: Adding automatic testing
605        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
606        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
607        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
608        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
609           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
610           too many projects
611      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
612      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
613        one file instead of seven + some small cleanup
614
615 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
616      * ENH Minor changes to the Print() methods.
617      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
618            Header printing. Example given with :
619            > PrintHeader fileName  2 new
620           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
621            
622 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
623      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
624          1. I have added some unsigned where needed
625          2. Some function parameter not used -> (void)
626          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
627          4. g++ don't like character '\' in comment
628          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
629                     this really need to be fixed
630          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
631          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
632                     this also really need to be fixed
633          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
634                     remove compression file 
635                     (as we only do decompression, right ?)     
636      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
637
638 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
639      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
640            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
641            defaulted to yspacing
642            
643 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
644      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
645      * ENH add parameters :
646                bool  exception_on_error = false, 
647                bool  enable_sequences   = false,
648                bool  ignore_shadow      = false
649            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
650      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
651            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
652               
653 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
654      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
655      
656 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
657      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
658      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
659              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
660              
661 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
662      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
663          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
664
665 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
667        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
668        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
669        in gdcmHeader.
670      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
671        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
672        already does the job.
673      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
674        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
675
676 2004-03-30 Benoit Regrain
677      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
678        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
679        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
680
681 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
682      * ENH : Check on file type to be written moved
683              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
684      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
685              when end-of-list is reached
686            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
687
688 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
689      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
690      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
691      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
692        equivalent to ExplicitVR in existing code).
693
694 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
695      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
696        now contains all the gdcmGlobal related code.
697      * minor coding style and doxygenation changes.
698
699 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
700      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
701        now contains all the Debug related code.
702      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
703      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
704        CreateCleanString) removed.
705      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
706      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
707      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
708      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
709        src/gdcmDirList.cxx)
710
711 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
712      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
713
714 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
715      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
716            big endian made volumes
717      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
718            end user to instanciate class gdcmParser
719           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
720
721 2004-03-22 Benoit Regrain
722      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
723      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
724              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
725
726 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
727      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
728            an already existing DICOMDIR file is consistent with
729            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
730            or build from the files held (recursively) in a Directory
731            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
732            gdcmObject::SetBoundaries() added
733
734 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
735      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
736                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
737      * FIX now file names and directory name are written properly in the
738            DICOMDIR
739      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
740            about the name
741
742 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
743      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
744                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
745
746 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
747      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
748            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
749            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
750            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
751            to allow making gdcDicomDir object.
752      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
753           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
754
755 2004-02-11 Benoit Regrain
756      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
757              when using from python
758
759 2004-02-10 Benoit Regrain
760      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
761      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
762      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
763              directory parsing
764
765 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
766      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
767              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
768              - class gdcmMeta created
769      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
770              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
771      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
772
773 2004-02-05 Benoit Regrain
774      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
775              header entries
776      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
777      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
778
779 2004-02-04 Benoit Regrain
780      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
781      * FIX : sort the images in the dicom dir
782      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
783      * ADD : a python demo
784
785 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
786      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
787      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
788              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
789              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
790              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
791      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
792            to make full checking easier
793         
794 2004-02-04 Benoit Regrain
795      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
796      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
797
798 2004-02-03 Benoit Regrain
799      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
800      * gdcmDicomDir : add the load of directory
801      * Bug fix and print add-on
802
803 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
804      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
805      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
806      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
807      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
808            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
809         
810 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
811      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
812              iterator on last
813              of the last synonym :-(
814      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
815              for DICOMDIR ;-)
816      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
817      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
818      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
819            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
820       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
821
822 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
823      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
824            no longer writes 'Un' on disk
825      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
826      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
827            the length (for Palette expanded images)
828            and Raw Length (non expanded image + Palette)
829      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
830            (that broke Write). Replaced by UL.
831            Aware user will reload the field if he 
832            thinks it's necesssary
833              
834 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
835      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
836        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
837        IsReadable() methods.
838        
839      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
840       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
841       but so usefull for people that miss them ;-)
842       
843      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
844        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
845
846 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
847      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
848
849 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
850      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
851              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
852         The TRUE value for this param has to be used 
853         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
854         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
855      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
856              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
857         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
858         
859      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
860              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
861              Fixed
862
863      * gdcmHeader add the method
864              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
865         to get *all* the Header Entries with the same tag.
866         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
867         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
868
869 2004-01-26 Benoit Regrain
870      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
871        in the print and add a third level of print to print them
872
873 2004-01-23 Benoit Regrain
874      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
875      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
876      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
877        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
878
879 2004-01-22 Benoit Regrain
880      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
881      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
882
883 2004-01-19 Benoit Regrain
884      * Add the use of shadow dictionaries
885      * bug fix and coding style
886
887 2004-01-19 Benoit Regrain
888      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
889      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
890      * Add the update of header entries using the shadow library
891
892 2004-01-19 Benoit Regrain
893      * removal of file gdcmHeader2.cxx
894      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
895        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
896        of dicom dir parsing
897      * bug fix under python
898
899 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
900     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
901     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
902     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
903     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
904
905 2004-01-15 Benoit Regrain
906      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
907        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
908        when the gdcmDictSet will be destroyed
909      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
910        gdcmDictSet
911
912 2004-01-15 Benoit Regrain
913      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
914        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
915        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
916        some memory and vtk seems to have some problems with that.
917      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
918
919 2004-01-14 Benoit Regrain
920      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
921      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
922      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
923      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
924
925 2004-01-13 Benoit Regrain
926      * src/*.[h|cxx] : coding style
927      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
928
929 2004-01-13 Benoit Regrain
930      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
931      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
932        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
933      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
934
935 2004-01-12 Benoit Regrain
936      * src/*.h : add comments
937      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
938      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
939        directly setted in the source code
940      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
941        gdcmTS and gdcmVR
942
943 2004-01-09 Benoit Regrain
944      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
945      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
946
947 2004-01-07 Benoit Regrain
948      * Modification to compile with the distutils.
949      * Bug fix in code
950
951 2003-12-10 Benoit Regrain
952      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
953        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
954      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
955        made in the source code
956
957 2003-12-10 Benoit Regrain
958      * Update Windows projects and .cvsignore files
959
960 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
961      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
962            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
963            if he wants to.
964            gdcmElValSet:Print takes it into account
965
966 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
967      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
968      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
969      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
970
971 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
972       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
973              on the ListTag listElem member,
974              not longer on the TagElValueHT tagHt member
975       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
976              with the tagHt member and the listElem member.
977              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
978
979       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
980              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
981                             if bug fixing is necessary), for internal
982                             use only
983              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
984                             or to allow Parser going on.
985              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
986              with a length (not 0000) is found
987       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
988                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
989                 (to be written)
990
991 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
992      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
993      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
994           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
995      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
996
997 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
998      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
999
1000 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1001      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1002           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1003
1004 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1005      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1006      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1007              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1008              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1009
1010 2003-11-05 Benoit Regrain
1011      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1012                        : Explicit error messages
1013      * in __init__.py  : Related modif
1014
1015 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1016      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1017            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1018            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1019      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1020                     (vtkGdcmReader compliant)           
1021       
1022 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1023      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1024        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1025        
1026 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1027      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1028            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1029
1030 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1031      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1032                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1033              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1034              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1035              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1036              such an image :
1037              After gdcmHeader :
1038               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1039               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1040               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1041      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1042              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1043
1044 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1045      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1046              
1047 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1048      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1049            being coherents dicom files.
1050      
1051 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1052      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1053            from medcon lib !
1054      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1055      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1056      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1057      * ENH: Add include dir to medcon lib
1058      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1059            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1060             
1061 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1062       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1063         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1064           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1065       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1066
1067 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1068       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1069         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1070         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1071       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1072       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1073
1074 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1075       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1076                                                
1077 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1078       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1079       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1080       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1081       
1082 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1083       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1084       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1085       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1086       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1087       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1088       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1089              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1090         But it fasten debug compilation time.
1091             
1092 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1093       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1094         (they are compressed as 2 planes images, 
1095          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1096
1097 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1098       * Now CheckRead takes into account :
1099          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1100          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1101       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1102        (breaks DicomWorks)
1103
1104 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1105       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1106              one should remove the '\'
1107         
1108 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1109       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1110         (wrong lengths in header)
1111         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1112       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1113         (breaks DicomWorks)
1114
1115 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1116       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1117         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1118
1119 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1120       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1121       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1122
1123 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1124       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1125      
1126 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1127       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1128         (the patch is easy to remove)
1129       * cosmetic changes to avoid warnings
1130       
1131 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1132       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1133         no need to press 'r' now.
1134    
1135 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1136       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1137         to new Jpeg Lossless decompressor
1138       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1139       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1140       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1141                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1142 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1143       * general anonymisation in gdcmData
1144       * adding the 'color files' from
1145         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1146       * adding some well knowed bugged-header images
1147       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1148         waiting for their inclusion in Python testsuite
1149
1150 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1151     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1152       no longer seg faults when file is not found
1153
1154 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1155      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1156        MultiFrame images
1157
1158 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1159      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1160
1161 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1162      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1163         OpenFile takes it into account
1164      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1165      * Missing elements added in dicomV3.dic
1166       (just to be affraid : have a look at
1167        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1168        and do it again next year ;->
1169
1170 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1171      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1172        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1173        But there are NOT. It's fixed !
1174        
1175 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1176      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1177      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1178          
1179 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1180      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1181              an ACR-NEMA / DICOM one.
1182      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1183              is not gdcm Readable
1184      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1185              is now decoded.
1186         
1187 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1188      * FIX: CMake generate now documentation
1189      * ENH: out of source doc build !
1190      * ENH: Generate both user and dev documentation
1191      * ENH: Should work on windows too
1192      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1193      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1194      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1195      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1196                      
1197 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1198      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1199      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1200      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1201         window level & window width
1202
1203 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1204      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1205      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1206      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1207      
1208 2003-10-06  Emanuel Ollart
1209      * FIX : compilation process wad broken.
1210              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1211         
1212 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1213      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1214      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1215      
1216 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1217      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1218            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1219                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1220       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1221
1222 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1223       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1224         to remain compliant with already defined strings, 
1225         like Transfert Syntax UID and others)
1226
1227 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1228       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1229              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1230         
1231 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1232       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1233       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1234
1235 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1236       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1237         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1238               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1239       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1240
1241 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1242       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1243
1244 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1245       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1246         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1247
1248 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1249       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1250          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1251          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1252          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1253           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1254                                             YBR_RCT files.
1255           (no sample found :-(
1256
1257 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1258       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1259         Two reasons: - clear things
1260                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1261                        suffer anymore VC++ complains
1262
1263 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1264       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1265       * removed leaks
1266
1267 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1268       * The lines are now eigthy characters long.for 
1269         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1270
1271 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1272       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1273         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1274         previous commis of Malaterre)
1275       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1276         before the last Malaterre's commit.
1277
1278 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1279       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1280         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1281       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1282         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1283
1284 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1285       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1286         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1287         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1288
1289 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1290       * Cosmetic changes:
1291         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1292           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1293           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1294           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1295         - PACKAGER corrected
1296         - DEVELOPPER added.
1297         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1298       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1299
1300 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1301       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1302
1303 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1304       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1305
1306 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1307       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1308
1309 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1310       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1311
1312 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1313       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1314         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1315         heuristics to get informations (look at different places).
1316       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1317         sorting DICOM images based on different strategies.
1318       * modified Makefiles accordingly.
1319
1320 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1321       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1322         when building in debug mode
1323       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1324         src/win32/gdcmdll.dsp
1325       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1326
1327 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1328       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1329             to valgrind.
1330
1331 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1332       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1333       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1334                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1335       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1336
1337 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1338       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1339         the file
1340       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1341       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1342         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1343       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1344         symbols... future problem ?
1345
1346 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1347       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1348       * modified gdcm.dsw accordingly
1349
1350 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1351       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1352
1353 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1354       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1355         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1356       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1357         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1358         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1359
1360 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1361       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1362
1363 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1364       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1365       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1366       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1367       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1368       * PACKAGER : adding all concerning windows
1369
1370 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1371       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1372         garbage debug code.
1373       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1374       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1375         test suite reported error.
1376       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1377         packaging a new release).
1378       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1379       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1380       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1381         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1382         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1383
1384 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1385       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1386       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1387
1388 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1389       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1390         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1391         is made in an internal list to prevent this problem.
1392         Bug fix when output is empty.
1393         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1394         correction.
1395       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1396
1397 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1398       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1399       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1400         files. Added method to remove all files on the input
1401         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1402         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1403
1404 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1405       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1406         when using make instal.
1407       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1408         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1409
1410 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1411       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1412       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1413
1414 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1415       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1416         linux and WINDOWS !
1417       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1418       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1419
1420 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1421       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1422         addon of the jpeg library)
1423       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1424       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1425       * INSTALL now points to web documentation
1426
1427 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1428       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1429         gdcmUtil.h anymore.
1430       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1431         clean target.
1432       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1433         - to allow compilation with gcc 3.x
1434           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1435           -- small fixes on exceptions.
1436           Note: linking not tested !
1437         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1438           building stage.
1439       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1440         dependent convertion).
1441
1442 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1443       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1444         Changelog):
1445         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1446         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1447           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1448         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1449
1450 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1451       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1452         compile
1453       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1454         (FileName -> Filename)
1455
1456 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1457       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1458         - UpdateProgress method should now be effective
1459         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1460           to volumes),
1461         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1462           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1463           accelerating things).
1464         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1465           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1466           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1467           in the stack (for the caller to notice the problem).
1468
1469 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1470       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1471
1472 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1473       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1474         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1475         under Windows... thanks Windows !)
1476
1477 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1478       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1479         debug stage).
1480       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1481
1482 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1483       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1484
1485 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1486       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1487         called with different flags than the default ones (with automake).
1488         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1489            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1490         and went for warning fixes:
1491         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1492           up from unused variables.
1493         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1494       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1495
1496 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1497       * gdcmPython/gdcm.i:
1498         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1499           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1500           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1501         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1502           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1503           exported to Python a as cvar.
1504       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1505         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1506         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1507         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1508         C++ static methods).
1509       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1510         with the above changes.
1511
1512 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1513       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1514
1515 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1516       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1517         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1518         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1519          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1520          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1521            a wrapper
1522          - Wrapper interface which wrap sources
1523         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1524         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1525       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1526         files for compilation
1527
1528 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1529       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1530         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1531         - vtk/Makefile.am now builds a library
1532         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1533           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1534           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1535           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1536           import library.
1537         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1538           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1539           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1540           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1541           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1542         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1543           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1544         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1545           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1546       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1547       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1548         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1549         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1550         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1551         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1552         collision of various stl members (principally cout...).
1553       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1554         file.
1555       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1556         comply with above changes)
1557
1558 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1559       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1560       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1561         vtk data structure (an image Flip was required).
1562       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1563       * cosmetic changes in documentation.
1564
1565 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1566       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1567         unexisting file is given as argument.
1568       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1569         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1570         containing those images is now available at
1571           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1572         with the name gdcmData.
1573         All the python scripts (including the package initialisation file
1574         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1575         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1576
1577 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1578       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1579         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1580         demo of the usage of this class.
1581         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1582         at configure (or autogen.sh) stage.
1583
1584 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1585       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1586         Notes on valgrind:
1587           - maximum info is obtained with a command of the form:
1588             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1589                      --show-reachable=yes PrintHeader
1590           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1591             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1592             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1593             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1594              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1595       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1596         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1597         Note: some images don't seem to work e.g.
1598             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1599       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1600         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1601         make gdcm more thread friendly.
1602
1603 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1604       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1605           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1606         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1607           gdcmHeader::_dicom_vr.
1608         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1609         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1610           VRHT*.
1611         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1612
1613 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1614       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1615         make install stage.
1616
1617 2003-04-9 JPR
1618       * UpdateGroupLength replaced by new one
1619
1620 2003-04-7 JPR
1621       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1622         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1623
1624 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1625       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1626       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1627       * src:
1628         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1629         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1630           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1631         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1632           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1633           carried the same semantics.
1634           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1635         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1636           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1637         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1638       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1639       * gdcmGetXSize added
1640       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1641       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1642
1643 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1644       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1645         (to avoid double call by end user).
1646       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1647         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1648
1649 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1650       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1651         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1652           the html.users end users oriented documentation and
1653           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1654           oriented documentation.
1655         - README changed accordingly
1656         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1657         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1658           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1659         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1660           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1661           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1662       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1663         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1664       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1665         ill-formed documentation sections.
1666       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1667
1668 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1669       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1670       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1671         un*ces with sh-utils test utility.
1672       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1673       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1674       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1675       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1676       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1677
1678 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1679       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1680       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1681
1682 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1683       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1684       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1685       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1686       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1687         compilation work.
1688       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1689       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1690
1691 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1692       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1693         hence the user doesn't need this explicit call.
1694         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1695           i.e. LoadElements() call removed.
1696       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1697         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1698       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1699         for adding user defined new tags.
1700         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1701         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1702           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1703
1704 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1705       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1706         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1707         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1708         with the autotools, included the python wrappers part.
1709       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1710
1711 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1713
1714 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1715       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1716         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1717         for usage).
1718       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1719         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1720         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1721       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1722         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1723
1724 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1725       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1726         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1727         value of GDCM_DICT_PATH.
1728       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1729
1730 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1731       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1732       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1733       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1734         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1735         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1736
1737 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1738       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1739         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1740         gdcmHeader.h
1741       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1742         (as opposed to gdcm.h)
1743       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1744       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1745         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1746       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1747
1748 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1749       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1750         bug.
1751
1752 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1753       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1754         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1755         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1756         of hidding away the python related distutils specific files
1757         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1758         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1759         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1760         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1761
1762 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1763       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1764       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1765         among the list of sources.
1766
1767 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1768       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1769       * modifications in MSVC projects
1770
1771 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1772       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1773         looks like we can move back to original usage of exception within
1774         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1775         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1776       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1777         README file for usage added.
1778       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1779         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1780         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1781         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1782       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1783       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1784         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1785           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1786           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1787           instance of class gdcmHeader.
1788         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1789           require no instances at all to be invocated.
1790         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1791           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1792           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1793       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1794         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1795       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1796         the above to be effective.
1797       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1798         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1799       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1800         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1801         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1802         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1803         (for python dectection).
1804       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1805         now avoids publishing the empty entries.
1806
1807 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1808       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1809         ExtraPath reused :-P
1810       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1811
1812 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1813       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1814       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1815       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1816         and links
1817
1818 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1819       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1820         method. Doxygenation.
1821       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1822
1823 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1824       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1825         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1826         when using "python setup.py install".
1827       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1828         reexports the working classes.
1829       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1830         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1831         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1832         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1833         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1834         subdir (see the README file). This problem probably due to
1835         an combination of g++ and dynamic loading.
1836       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1837
1838 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1839       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1840         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1841         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1842         again in a python subdir, but the package itself is now in
1843         python/gdcmPython.
1844       * setup.py was cleaned up:
1845         - pythonIncludePath removed
1846         - python setup.py bdist target is now functional.
1847       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1848         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1849         accordingly.
1850
1851 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1852       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1853       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1854         distutils installer is operational.
1855       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1856           shadow classes (from gdcm.py).
1857         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1858           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1859         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1860
1861 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1862       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1863         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1864         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1865         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1866         dictionary.
1867         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1868           are now in the "???" group.
1869         - python/gdcm.i changed accordingly,
1870         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1871           of the above new functionalities in Python.
1872
1873 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1874       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1875         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1876           were definitively removed.
1877         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1878       * src/gdcmElValSet.cxx:
1879         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1880         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1881         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1882         - Added GetElementByName(string).
1883       * src/gdcmHeader.cxx: added
1884         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1885         - GetPubElValRepByName(string)
1886         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1887         - GetShaElValRepByName(string)
1888         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1889         - GetShaElValRepByName(string)
1890         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1891         - GetElValRepByName(string)
1892         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1893         - GetElValRepByName(string)
1894       * Doc/requirements.txt added.
1895
1896 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1897       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1898       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1899         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1900         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1901         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1902       * python/testSuite.py changed accordingly.
1903
1904 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1905       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1906         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1907              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1908               cannot be exported. [...]
1909               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1910               be exported. [...]
1911               This is caused by a designed limitation that once a template
1912               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1913               exported."
1914         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1915         limitation" of VC++ is a pitfall.
1916         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1917         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1918         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1919         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1920         library.
1921         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1922       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1923          dll under windows !!!!)
1924       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1925       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1926         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1927       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1928         (one) of image(s).
1929       * removed glib references
1930       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1931
1932 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1933       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1934         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1935         the files of the testsuite without using unittest.
1936       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1937       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1938       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1939         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1940
1941 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1942       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1943         values, but limits itself to values which are below a user specified
1944         size (by default 1024 bytes).
1945       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1946         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1947         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1948         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1949       * python/testSuite.py
1950         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1951         - two new examples added.
1952       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1953
1954 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1955       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1956         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1957       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1958       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1959       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1960
1961 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1962       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1963         the vr was also RET.
1964       * python/testSuite.py more tests added.
1965
1966 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1967       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1968       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1969       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1970         7.18 Integer types (see stdint.h)
1971         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1972       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1973         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1974         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1975         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1976         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1977         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1978         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1979         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1980
1981 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1982       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1983         VR files.
1984       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1985
1986 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1987       * Adaptation for porting to VC++:
1988         - src/gdcm.h
1989           o forced to use std namespace (for string to be known)
1990           o all class use __declspec export style on WIN32
1991         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1992           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1993       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1994         variable GDCM_DICT_PATH.
1995       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1996
1997 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1998       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1999         to native Python dictionary.
2000       * python/demo/test.py:
2001         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2002         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2003       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2004         PubElVals hashing table.
2005       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2006
2007 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2008       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2009         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2010       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2011       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2012       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2013         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2014       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2015
2016 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2017       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2018         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2019         that we can import de shadow classes without errors].
2020
2021 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2022       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2023       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2024       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2025       * src/Makefile prepared for python wrapping
2026
2027 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2028       * src/gdcmHeader.cxx :
2029         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2030           (see gdcmHeader::LoadElements).
2031         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2032           ReadInt16 and ReadInt32)
2033
2034 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2035       * src/gdcmHeader.cxx :
2036         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2037           method.
2038         - SetLgrElem renamed to SetLength
2039         - GetLgrElem renamed to GetLength
2040         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2041       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2042       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2043         due to IdoDude was cleaned out.
2044
2045 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2046       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2047         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2048         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2049         returning the unecessary skL (skipped length).
2050         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2051         it was redundant with the File position internals (by using
2052         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2053         jajun.
2054       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2055         on the libido specificities which are handled through class
2056         inheritance.
2057       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2058         added.
2059
2060 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2061       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2062         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2063
2064 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2065       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2066
2067 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2068       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2069         and _IdDcmSWAP_LONG.
2070
2071 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2072       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2073         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2074