ChangeLog

   1 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
   3         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
   4         value of GDCM_DICT_PATH.
   5       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
   6
   7 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   8       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
   9       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
  10       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
  11         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
  12         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
  13
  14 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  15       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
  16         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
  17         gdcmHeader.h
  18       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
  19         (as opposed to gdcm.h)
  20       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
  21       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
  22         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
  23       * autogen.sh removed history related references to crea package.
  24
  25 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  26       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
  27         bug.
  28
  29 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  30       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
  31         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
  32         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
  33         of hidding away the python related distutils specific files
  34         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
  35         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
  36         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
  37         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
  38
  39 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  40       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
  41       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
  42         among the list of sources.
  43
  44 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  45       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
  46       * modifications in MSVC projects
  47
  48 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  49       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
  50         looks like we can move back to original usage of exception within
  51         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
  52         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
  53       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
  54         README file for usage added.
  55       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
  56         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  57         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  58         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  59       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  60       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  61         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  62           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  63           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  64           instance of class gdcmHeader.
  65         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  66           require no instances at all to be invocated.
  67         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  68           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  69           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  70       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  71         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  72       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  73         the above to be effective.
  74       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  75         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  76       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  77         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  78         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  79         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  80         (for python dectection).
  81       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  82         now avoids publishing the empty entries.
  83
  84 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  85       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  86         ExtraPath reused :-P
  87       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
  88
  89 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  90       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
  91       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
  92       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
  93         and links
  94
  95 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  96       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
  97         method. Doxygenation.
  98       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
  99
 100 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 101       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 102         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 103         when using "python setup.py install".
 104       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 105         reexports the working classes.
 106       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 107         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 108         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 109         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 110         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 111         subdir (see the README file). This problem probably due to
 112         an combination of g++ and dynamic loading.
 113       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 114
 115 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 116       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 117         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 118         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 119         again in a python subdir, but the package itself is now in
 120         python/gdcmPython.
 121       * setup.py was cleaned up:
 122         - pythonIncludePath removed
 123         - python setup.py bdist target is now functional.
 124       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 125         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 126         accordingly.
 127 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 128       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 129       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 130         distutils installer is operational.
 131       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 132           shadow classes (from gdcm.py).
 133         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 134           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 135         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 136
 137
 138 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 139       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 140         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 141         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 142         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 143         dictionary.
 144         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 145           are now in the "???" group.
 146         - python/gdcm.i changed accordingly,
 147         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 148           of the above new functionalities in Python.
 149
 150 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 151       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 152         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 153           were definitively removed.
 154         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 155       * src/gdcmElValSet.cxx:
 156         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 157         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 158         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 159         - Added GetElementByName(string).
 160       * src/gdcmHeader.cxx: added
 161         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 162         - GetPubElValRepByName(string)
 163         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 164         - GetShaElValRepByName(string)
 165         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 166         - GetShaElValRepByName(string)
 167         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 168         - GetElValRepByName(string)
 169         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 170         - GetElValRepByName(string)
 171       * Doc/requirements.txt added.
 172
 173 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 174       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 175       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 176         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 177         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 178         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 179       * python/testSuite.py changed accordingly.
 180
 181 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 182       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 183         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 184              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 185               cannot be exported. [...]
 186               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 187               be exported. [...]
 188               This is caused by a designed limitation that once a template
 189               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 190               exported."
 191         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 192         limitation" of VC++ is a pitfall.
 193         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 194         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 195         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 196         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 197         library.
 198         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 199       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 200          dll under windows !!!!)
 201       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 202       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 203         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 204       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 205         (one) of image(s).
 206       * removed glib references
 207       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 208
 209 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 210       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 211         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 212         the files of the testsuite without using unittest.
 213       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 214       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 215       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 216         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 217
 218 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 219       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 220         values, but limits itself to values which are below a user specified
 221         size (by default 1024 bytes).
 222       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 223         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 224         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 225         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 226       * python/testSuite.py
 227         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 228         - two new examples added.
 229       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 230
 231 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 232       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 233         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 234       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 235       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 236       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 237
 238 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 239       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 240         the vr was also RET.
 241       * python/testSuite.py more tests added.
 242
 243 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 244       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 245       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 246       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 247         7.18 Integer types (see stdint.h)
 248         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 249       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 250         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 251         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 252         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 253         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 254         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 255         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 256         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 257
 258 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 259       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 260         VR files.
 261       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 262
 263 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 264       * Adaptation for porting to VC++:
 265         - src/gdcm.h
 266           o forced to use std namespace (for string to be known)
 267           o all class use __declspec export style on WIN32
 268         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 269           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 270       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 271         variable GDCM_DICT_PATH.
 272       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 273
 274 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 275       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 276         to native Python dictionary.
 277       * python/demo/test.py:
 278         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 279         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 280       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 281         PubElVals hashing table.
 282       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 283
 284 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 285       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 286         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 287       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 288       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 289       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 290         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 291       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 292
 293 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 294       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 295         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 296         that we can import de shadow classes without errors].
 297
 298 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 299       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 300       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 301       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 302       * src/Makefile prepared for python wrapping
 303
 304 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 305       * src/gdcmHeader.cxx :
 306         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 307           (see gdcmHeader::LoadElements).
 308         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 309           ReadInt16 and ReadInt32)
 310
 311 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 312       * src/gdcmHeader.cxx :
 313         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 314           method.
 315         - SetLgrElem renamed to SetLength
 316         - GetLgrElem renamed to GetLength
 317         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 318       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 319       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 320         due to IdoDude was cleaned out.
 321
 322 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 323       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 324         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 325         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 326         returning the unecessary skL (skipped length).
 327         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 328         it was redundant with the File position internals (by using
 329         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 330         jajun.
 331       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 332         on the libido specificities which are handled through class
 333         inheritance.
 334       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 335         added.
 336
 337 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 338       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 339         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 340
 341 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 342       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 343
 344 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 345       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 346         and _IdDcmSWAP_LONG.
 347
 348 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 349       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 350         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 351