]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
3     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
4     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
5   * TODO added new entry.
6   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
7     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
8     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
9     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
10       variable names for semantical coherence.
11
12 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
13   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
14   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
15   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
16   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
17   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
18   compilation time jpeg option.
19
20 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
21   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
22     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
23     reproduce at home.
24   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
25   Thanks dcmtk crew !
26
27 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
28   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
29   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
30     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
31   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
32   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
33   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
34   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
35     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
36     from File:: to PixelConvert::.
37
38 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
39   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
40     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
41      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
42      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
43
44 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
45   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
46   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
47   like this:
48     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
49   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
50   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
51   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
52
53 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
54   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
55     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
56     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
57     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
58     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
59       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
60       (for the time being this is better than having them attach to
61        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
62     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
63       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
64     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
65       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
66       gdcmPixelConvert::
67
68 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
69   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
70   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
71     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
72       clean up of RLE related code. 
73   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
74     - src/gdcmRLE.cxx removed
75     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
76     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
77     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
78   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
79     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
80       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
81       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
82
83 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
84   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
85     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
86       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
87       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
88       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
89       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
90       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
91       offsets.
92   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
93     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
94         with the retired Parse7Fe0().
95     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
96     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
97
98 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
99   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
100     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
101     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
102     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
103   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
104     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
105       to return an unused length.
106
107 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
108   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
109     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
110     to use to do simple stuff.
111
112 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
113   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
114     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
115     copying of the file within different directory, configure header file to
116     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
117     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
118
119 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
120   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
121      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
122        with it's binary name).
123      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
124        the Website to be more complete.
125      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
126        doxygenated documentation.
127      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
128        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
129                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
130   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
131   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
132    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
133
134 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
135   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
136    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
137
138 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
139   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
140     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
141     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
142     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
143     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
144   * GDCMHOME clean up:
145     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
146       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
147       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
148   * Autotools clean up:
149     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
150     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
151
152 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
153   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
154   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
155   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
156
157 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
158   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
159     describing TODO entries and used it for new entries.
160   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
161     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
162     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
163   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
164     documentation itself, but the website) moved to html and
165     placed in directory Doc/Website:
166     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
167     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
168     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
169   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
170   * CMakeLists.txt changed accordingly.
171   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
172     DeveloppersPython.html
173   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
174
175 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
176   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
177     of gdcm Web site.
178
179 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
180   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
181     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
182          we can now delete[] it safely  
183   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
184     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
185   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
186
187 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
188   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
189     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
190     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
191     pointed content.
192
193 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
194   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
195   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
196
197 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
198   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
199     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
200     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
201     an example of usage.
202     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
203       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
204     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
205       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
206     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
207     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
208     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
209
210 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
211   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
212     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
213     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
214     in class 
215     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
216       and associated accessors. Doxygenation of the class.
217     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
218       accessors added.
219     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
220       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
221     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
222     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
223
224 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
225   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
226     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
227       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
228            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
229            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
230            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
231            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
232            the same group and element all share the same (group, element)
233            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
234            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
235            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
236            consider the following definition of a TagKey:
237            - let Group, Element be the string representation of the
238              group and element dicom tag members,
239            - let ItemNumber be the string representation of the integer
240              index of the considered item number of a sequence,
241            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
242            the form:
243               /ItemNumber#Group|Element
244            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
245            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
246               Group|Element<SeqTag>
247            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
248            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
249            string e.g.
250                0028|1201
251            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
252            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
253            string e.g.
254                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
255     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
256       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
257       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
258     - src/gdcmDocEntry.cxx:
259       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
260          Key member.
261       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
262     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
263     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
264       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
265       -- now has a new BaseTagKey member.
266       -- STYLE.
267   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
268     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
269     truly belongs.
270     This poses the problem with the semantics of the following lines
271        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
272        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
273        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
274     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
275     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
276     order to get things working the dicom dictionary was altered !
277     Please fix things urgently...
278   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
279     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
280     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
281     set to OW:
282       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
283       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
284       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
285   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
286     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
287   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
288
289 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
290   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
291
292 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
293   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
294     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
295   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
296   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
297
298 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
299   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
300     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
301   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
302     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
303   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
304     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
305   * TODO updated
306   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
307     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
308   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
309   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
310     exception_on_error parameter.
311     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
312     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
313     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
314
315 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
316   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
317   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
318     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
319   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
320   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
321   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
322     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
323   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
324
325 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
326   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
327     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
328
329 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
330   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
331        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
332                  
333 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
334   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
335         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
336
337 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
338    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
339    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
340      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
341      is now in static in the gdcmDebug class
342    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
343    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
344
345 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
346    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
347      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
348    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
349      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
350      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
351      that displays position and size).
352    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
353      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
354      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
355      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
356      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
357      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
358      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
359         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
360      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
361      commiting changes).
362    * Test/CMakeLists.txt:
363       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
364       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
365         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
366         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
367    * TODO updated.
368
369 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
370    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
371      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
372      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
373      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
374      - removal of typedef duplication.
375      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
376      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
377    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
378       - printf polluting ctest removed.
379       - TAB removal for comminting
380    * Test:
381      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
382        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
383        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
384        this test creates them.
385        Note: we need to validate each reference image, but before that
386              I'd like to rename them with a more explicit name...
387      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
388    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
389      including each header needed).
390
391 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
392    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
393      test suite to the Example directory. Are concerned:
394      - PrintHeader.cxx
395      - TestDcm2Acr.cxx
396      - TestFindTags.cxx
397      - TestWrite.cxx was
398      - TestWriteSimple.cxx
399    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
400      image gdcmData/oldACR00001.ima
401
402 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
403    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
404      with removal from gdcmData):
405       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
406       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
407       - US.3405.1.dcm
408      Added the following because after last cvs update, they cause
409        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
410      to segfault:
411       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
412       - oldACR00001.ima
413    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
414      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
415      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
416      form of test...
417    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
418      we don't need to black list the following images anymore:
419       - 8BitsUncompressedColor.dcm
420       - OT-PAL-8-face.dcm
421       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
422    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
423      fixes and the beautified code ;-)
424      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
425      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
426      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
427            improve the test suite). The bug could be detected by using
428            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
429            or by using
430            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
431            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
432
433 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
434    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
435          - replace by uggly but working old code :-(
436                 A lot of things should be OK again.
437         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
438         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
439         (twice, withing a fortnigh ...)         
440
441 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
442    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
443      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
444    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
445      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
446      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
447                    - OT-PAL-8-face.dcm
448                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
449    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
450      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
451      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
452      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
453      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
454      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
455      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
456      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
457      image.
458    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
459      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
460      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
461      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
462    
463 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
464   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
465   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
466                           (instead of infinite loop)
467   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
468
469 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
470    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
471
472 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
473    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
474                     when SamplesPerPixel =3
475          - now Write is no longer confused by 
476                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
477          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
478                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
479    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
480                     (in order to split the job that has not to be done 
481                                         for gdcmDicomDir)
482
483 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
484    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
485      loop on the same image until memory went out. 
486      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
487    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
488      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
489
490 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
491    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
492             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
493                                 is added a the end, when necessary.
494             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
495                       now written correctly
496                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
497                                 (even for odd groups) 
498         Note : only Explicit Value Representation was checked.
499                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
500
501 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
502    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
503    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
504      coding style).
505
506 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
507    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
508      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
509    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
510
511 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
512    FIX : gdcmDocument.cxx
513       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
514         code 'beautyfication' :-(
515       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
516
517 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
518    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
519                  : to allow user to create his own Sequences
520         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
521
522 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
523         
524         - gdcmBinEntry
525           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
526           
527    - gdcmDocEntry
528           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
529           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
530           
531         - gdcmDocEntrySet
532           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
533           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
534      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
535      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
536      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
537      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
538                                             guint16 element,
539                                             std::string vr     = "unkn",
540                                             std::string fourth = "unkn",
541                                             std::string name   = "unkn"); 
542           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
543      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
544      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
545      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
546      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
547      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
548           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
549      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
550           
551         - gdcmDocument
552      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
553      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
554      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
555      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
556      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
557                                         FILE *_fp, FileType type);
558      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
559      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
560      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
561      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
562      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
563      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
564      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
565      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
566                                             guint16 element,
567                                             std::string vr     = "unkn",
568                                             std::string fourth = "unkn",
569                                             std::string name   = "unkn");
570      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
571      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
572      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
573      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
574                                                                                                                  
575         - gdcmElementSet
576           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
577           
578    - gdcmSeqEntry
579           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
580  
581    - gdcmSQItem
582      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
583      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
584      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
585      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
586
587    - gdcmValEntry
588          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
589                                   
590 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
591     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
592       The default constructor invoked by the line
593          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
594       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
595       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
596       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
597     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
598       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
599       Could anyone explain why ?
600     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
601       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
602       code related to gdcmBinEntry).
603
604 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
605     * In order to fix memory leaks:
606      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
607        some delete calls.
608      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
609      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
610        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
611        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
612        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
613      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
614      - src/gdcmDocument.cxx:
615        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
616           from dynamic stores.
617        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
618           was causing memory leaks.
619      - src/gdcmSQItem.cxx:
620        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
621           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
622        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
623           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
624           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
625           This avoids SegFaulting.
626      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
627     * Conclusion:
628      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
629        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
630        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
631      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
632        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
633      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
634        segfaults).
635     * Erroneous leading white fix:
636      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
637        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
638      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
639      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
640     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
641     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
642
643
644 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
645     * In order to fix writing of dicom files:
646      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
647      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
648      - src/gdcmDocument.cxx:
649        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
650        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
651        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
652           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
653           manner.
654        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
655           to only declared) and build on top of
656           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
657        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
658      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
659        for usage in destructor and treatement of promotion in
660        ::ReplaceOrCreateByNumber().
661      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
662       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
663     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
664       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
665       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
666       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
667
668 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
669     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
670       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
671       learned that:
672           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
673           soon as possible by globally disabling memory caching.
674           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
675           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
676       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
677       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
678       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
679     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
680       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
681       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
682       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
683         with 1.
684       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
685       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
686       understand why the list is empty...).
687     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
688     * Doc/License.txt added.
689
690 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
692       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
693         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
694         the padding problem.
695       - general clean up, simplification, and coding style.
696       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
697     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
698
699 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
700    *  gdcmSeqEntry.cxx
701            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
702                 - fix the display of SQItem ordinal number
703       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
704                 - remove some useless never written private methods     
705                 
706 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
707    * gdcmBinEntry.cxx 
708       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
709            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
710               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
711                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
712    * dcmDocument.cxx
713       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
714               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
715            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
716       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
717    * gdcmFile.cxx
718       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
719    * gdcmSQItem.h
720       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
721             a (relative) Item identier inside a given Sequence
722             \warning : some pb remaining around this number
723                                 will be solved asap
724       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
725    * gdcmValEntry.cxx 
726       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
727
728 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
729     * Memory leak hunt with the following command:
730       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
731                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
732       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
733       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
734       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
735           grep "MEMORY LEAK" src/*
736       Here are two typical examples which I can't help fixing:
737       -----
738           #include <string>
739           int main() {
740              std::string name;
741              char * test = "babo";
742              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
743                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
744              name.clear();   //// Doesn't help !
745              return 0;
746           }
747       -----
748           #include <string>
749           #include <iostream>
750           int main() {
751              std::string line;
752              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
753              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
754                                         //// of 1320 bytes in call to
755                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
756             return 0;
757           }
758       -----
759
760
761 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
762     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
763       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
764         and related, moved away to gdcmDocument.
765       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
766         the corresponding protected accessors of inherited class
767         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
768         declared friend of class gdcmDocument (see below).
769       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
770       - Clean up of undefined or unused methods.
771     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
772       account the changes to gdcmHeader.h).
773     * src/gdcmDocument.h:
774       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
775         changes to gdcmHeader.h).
776       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
777         (see changes to gdcmHeader.h).
778       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
779       - Clean up of undefined or unused methods.
780     * src/gdcmDocument.cxx:
781       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
782       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
783       - some std::string properly set to VRKey
784     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
785       references to gdcmDocument. 
786     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
787     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
788       cvs repository gdcmData.
789
790 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
791     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
792     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
793       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
794     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
795     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
796       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
797     * src/gdcmDocument.cxx: 
798       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
799         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
800       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
801         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
802         removed. Reverting to previous code segment with the proper
803         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
804         Note: this was (partially) breaking the python test suite
805               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
806               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
807     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
808     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
809       now taken into account.
810     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
811       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
812     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
813       on posix.
814     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
815       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
816     * .... alas, the python testSuite is still broken.
817
818 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
819     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
820       gdcmGlob
821     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
822     * src/gdcmUtil.h : export methods
823
824 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
825     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
826       to right behavior
827     * Initial addition of automatic python testing
828     * Initial addition of automatic image comparison
829
830 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
831     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
832       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
833
834 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
835      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
836      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
837      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
838
839 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
840      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
841        new concepts (and new classes) :
842        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
843         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
844         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
845        a Sequence is composed of Items.
846        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
847        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
848        (never taken into account)
849        Our unability to add a new 'entry' in the header
850        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
851        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
852        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
853        nothing is finished.
854        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
855
856 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
857      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
858      
859 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
860      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
861        file prefix (SetFilePrefix)
862
863 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
864      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
865        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
866        baseline.
867      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
868        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
869
870 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
871      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
872        dicom image
873
874 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
875      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
876      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
877        between the developper and user version.
878      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
879      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
880
881 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
882      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
883        when using cmake.
884
885 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
886      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
887                src directory, now generated in the build dir.
888             2. Tests as mentionned smarter
889             3. Some clean up
890             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
891           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
892           where we could set the institution name / patient name...
893
894        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
895               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
896                  (this was not true before)
897
898 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
899      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
900            SeQuence indented printing of Dicom Header.
901      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
902            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
903            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
904      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
905            tree-like structure of a Dicom Header.
906      * FIX Test code cleaning     
907            
908 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
909      * ENH: Adding automatic testing
910        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
911        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
912        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
913        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
914           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
915           too many projects
916      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
917      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
918        one file instead of seven + some small cleanup
919
920 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
921      * ENH Minor changes to the Print() methods.
922      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
923            Header printing. Example given with :
924            > PrintHeader fileName  2 new
925           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
926            
927 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
928      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
929          1. I have added some unsigned where needed
930          2. Some function parameter not used -> (void)
931          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
932          4. g++ don't like character '\' in comment
933          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
934                     this really need to be fixed
935          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
936          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
937                     this also really need to be fixed
938          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
939                     remove compression file 
940                     (as we only do decompression, right ?)     
941      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
942
943 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
944      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
945            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
946            defaulted to yspacing
947            
948 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
949      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
950      * ENH add parameters :
951                bool  exception_on_error = false, 
952                bool  enable_sequences   = false,
953                bool  ignore_shadow      = false
954            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
955      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
956            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
957               
958 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
959      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
960      
961 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
962      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
963      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
964              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
965              
966 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
967      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
968          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
969
970 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
971      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
972        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
973        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
974        in gdcmHeader.
975      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
976        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
977        already does the job.
978      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
979        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
980
981 2004-03-30 Benoit Regrain
982      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
983        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
984        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
985
986 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
987      * ENH : Check on file type to be written moved
988              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
989      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
990              when end-of-list is reached
991            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
992
993 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
994      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
995      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
996      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
997        equivalent to ExplicitVR in existing code).
998
999 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1000      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1001        now contains all the gdcmGlobal related code.
1002      * minor coding style and doxygenation changes.
1003
1004 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1005      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1006        now contains all the Debug related code.
1007      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1008      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1009        CreateCleanString) removed.
1010      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1011      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1012      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1013      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1014        src/gdcmDirList.cxx)
1015
1016 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1017      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1018
1019 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1020      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1021            big endian made volumes
1022      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1023            end user to instanciate class gdcmParser
1024           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1025
1026 2004-03-22 Benoit Regrain
1027      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1028      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1029              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1030
1031 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1032      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1033            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1034            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1035            or build from the files held (recursively) in a Directory
1036            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1037            gdcmObject::SetBoundaries() added
1038
1039 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1040      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1041                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1042      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1043            DICOMDIR
1044      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1045            about the name
1046
1047 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1048      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1049                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1050
1051 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1052      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1053            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1054            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1055            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1056            to allow making gdcDicomDir object.
1057      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1058           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1059
1060 2004-02-11 Benoit Regrain
1061      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1062              when using from python
1063
1064 2004-02-10 Benoit Regrain
1065      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1066      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1067      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1068              directory parsing
1069
1070 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1071      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1072              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1073              - class gdcmMeta created
1074      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1075              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1076      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1077
1078 2004-02-05 Benoit Regrain
1079      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1080              header entries
1081      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1082      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1083
1084 2004-02-04 Benoit Regrain
1085      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1086      * FIX : sort the images in the dicom dir
1087      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1088      * ADD : a python demo
1089
1090 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1091      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1092      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1093              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1094              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1095              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1096      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1097            to make full checking easier
1098         
1099 2004-02-04 Benoit Regrain
1100      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1101      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1102
1103 2004-02-03 Benoit Regrain
1104      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1105      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1106      * Bug fix and print add-on
1107
1108 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1109      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1110      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1111      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1112      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1113            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1114         
1115 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1116      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1117              iterator on last
1118              of the last synonym :-(
1119      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1120              for DICOMDIR ;-)
1121      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1122      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1123      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1124            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1125       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1126
1127 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1128      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1129            no longer writes 'Un' on disk
1130      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1131      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1132            the length (for Palette expanded images)
1133            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1134      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1135            (that broke Write). Replaced by UL.
1136            Aware user will reload the field if he 
1137            thinks it's necesssary
1138              
1139 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1140      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1141        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1142        IsReadable() methods.
1143        
1144      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1145       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1146       but so usefull for people that miss them ;-)
1147       
1148      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1149        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1150
1151 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1152      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1153
1154 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1155      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1156              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1157         The TRUE value for this param has to be used 
1158         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1159         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1160      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1161              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1162         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1163         
1164      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1165              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1166              Fixed
1167
1168      * gdcmHeader add the method
1169              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1170         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1171         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1172         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1173
1174 2004-01-26 Benoit Regrain
1175      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1176        in the print and add a third level of print to print them
1177
1178 2004-01-23 Benoit Regrain
1179      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1180      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1181      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1182        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1183
1184 2004-01-22 Benoit Regrain
1185      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1186      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1187
1188 2004-01-19 Benoit Regrain
1189      * Add the use of shadow dictionaries
1190      * bug fix and coding style
1191
1192 2004-01-19 Benoit Regrain
1193      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1194      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1195      * Add the update of header entries using the shadow library
1196
1197 2004-01-19 Benoit Regrain
1198      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1199      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1200        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1201        of dicom dir parsing
1202      * bug fix under python
1203
1204 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1205     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1206     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1207     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1208     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1209
1210 2004-01-15 Benoit Regrain
1211      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1212        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1213        when the gdcmDictSet will be destroyed
1214      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1215        gdcmDictSet
1216
1217 2004-01-15 Benoit Regrain
1218      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1219        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1220        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1221        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1222      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1223
1224 2004-01-14 Benoit Regrain
1225      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1226      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1227      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1228      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1229
1230 2004-01-13 Benoit Regrain
1231      * src/*.[h|cxx] : coding style
1232      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1233
1234 2004-01-13 Benoit Regrain
1235      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1236      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1237        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1238      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1239
1240 2004-01-12 Benoit Regrain
1241      * src/*.h : add comments
1242      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1243      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1244        directly setted in the source code
1245      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1246        gdcmTS and gdcmVR
1247
1248 2004-01-09 Benoit Regrain
1249      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1250      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1251
1252 2004-01-07 Benoit Regrain
1253      * Modification to compile with the distutils.
1254      * Bug fix in code
1255
1256 2003-12-10 Benoit Regrain
1257      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1258        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1259      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1260        made in the source code
1261
1262 2003-12-10 Benoit Regrain
1263      * Update Windows projects and .cvsignore files
1264
1265 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1266      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1267            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1268            if he wants to.
1269            gdcmElValSet:Print takes it into account
1270
1271 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1272      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1273      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1274      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1275
1276 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1277       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1278              on the ListTag listElem member,
1279              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1280       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1281              with the tagHt member and the listElem member.
1282              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1283
1284       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1285              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1286                             if bug fixing is necessary), for internal
1287                             use only
1288              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1289                             or to allow Parser going on.
1290              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1291              with a length (not 0000) is found
1292       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1293                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1294                 (to be written)
1295
1296 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1297      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1298      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1299           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1300      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1301
1302 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1303      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1304
1305 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1306      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1307           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1308
1309 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1310      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1311      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1312              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1313              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1314
1315 2003-11-05 Benoit Regrain
1316      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1317                        : Explicit error messages
1318      * in __init__.py  : Related modif
1319
1320 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1321      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1322            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1323            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1324      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1325                     (vtkGdcmReader compliant)           
1326       
1327 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1328      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1329        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1330        
1331 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1332      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1333            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1334
1335 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1336      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1337                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1338              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1339              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1340              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1341              such an image :
1342              After gdcmHeader :
1343               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1344               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1345               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1346      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1347              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1348
1349 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1350      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1351              
1352 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1353      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1354            being coherents dicom files.
1355      
1356 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1357      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1358            from medcon lib !
1359      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1360      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1361      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1362      * ENH: Add include dir to medcon lib
1363      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1364            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1365             
1366 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1367       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1368         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1369           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1370       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1371
1372 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1373       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1374         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1375         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1376       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1377       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1378
1379 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1380       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1381                                                
1382 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1383       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1384       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1385       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1386       
1387 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1388       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1389       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1390       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1391       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1392       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1393       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1394              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1395         But it fasten debug compilation time.
1396             
1397 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1398       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1399         (they are compressed as 2 planes images, 
1400          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1401
1402 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1403       * Now CheckRead takes into account :
1404          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1405          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1406       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1407        (breaks DicomWorks)
1408
1409 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1410       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1411              one should remove the '\'
1412         
1413 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1414       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1415         (wrong lengths in header)
1416         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1417       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1418         (breaks DicomWorks)
1419
1420 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1421       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1422         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1423
1424 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1425       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1426       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1427
1428 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1429       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1430      
1431 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1432       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1433         (the patch is easy to remove)
1434       * cosmetic changes to avoid warnings
1435       
1436 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1437       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1438         no need to press 'r' now.
1439    
1440 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1441       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1442         to new Jpeg Lossless decompressor
1443       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1444       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1445       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1446                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1447 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1448       * general anonymisation in gdcmData
1449       * adding the 'color files' from
1450         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1451       * adding some well knowed bugged-header images
1452       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1453         waiting for their inclusion in Python testsuite
1454
1455 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1456     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1457       no longer seg faults when file is not found
1458
1459 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1460      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1461        MultiFrame images
1462
1463 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1464      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1465
1466 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1467      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1468         OpenFile takes it into account
1469      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1470      * Missing elements added in dicomV3.dic
1471       (just to be affraid : have a look at
1472        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1473        and do it again next year ;->
1474
1475 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1476      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1477        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1478        But there are NOT. It's fixed !
1479        
1480 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1481      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1482      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1483          
1484 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1485      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1486              an ACR-NEMA / DICOM one.
1487      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1488              is not gdcm Readable
1489      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1490              is now decoded.
1491         
1492 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1493      * FIX: CMake generate now documentation
1494      * ENH: out of source doc build !
1495      * ENH: Generate both user and dev documentation
1496      * ENH: Should work on windows too
1497      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1498      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1499      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1500      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1501                      
1502 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1503      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1504      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1505      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1506         window level & window width
1507
1508 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1509      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1510      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1511      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1512      
1513 2003-10-06  Emanuel Ollart
1514      * FIX : compilation process wad broken.
1515              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1516         
1517 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1518      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1519      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1520      
1521 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1522      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1523            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1524                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1525       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1526
1527 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1528       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1529         to remain compliant with already defined strings, 
1530         like Transfert Syntax UID and others)
1531
1532 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1533       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1534              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1535         
1536 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1537       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1538       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1539
1540 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1541       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1542         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1543               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1544       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1545
1546 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1547       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1548
1549 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1550       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1551         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1552
1553 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1554       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1555          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1556          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1557          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1558           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1559                                             YBR_RCT files.
1560           (no sample found :-(
1561
1562 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1563       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1564         Two reasons: - clear things
1565                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1566                        suffer anymore VC++ complains
1567
1568 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1569       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1570       * removed leaks
1571
1572 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1573       * The lines are now eigthy characters long.for 
1574         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1575
1576 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1577       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1578         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1579         previous commis of Malaterre)
1580       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1581         before the last Malaterre's commit.
1582
1583 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1584       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1585         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1586       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1587         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1588
1589 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1590       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1591         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1592         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1593
1594 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1595       * Cosmetic changes:
1596         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1597           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1598           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1599           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1600         - PACKAGER corrected
1601         - DEVELOPPER added.
1602         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1603       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1604
1605 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1607
1608 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1609       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1610
1611 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1613
1614 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1615       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1616
1617 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1618       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1619         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1620         heuristics to get informations (look at different places).
1621       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1622         sorting DICOM images based on different strategies.
1623       * modified Makefiles accordingly.
1624
1625 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1626       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1627         when building in debug mode
1628       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1629         src/win32/gdcmdll.dsp
1630       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1631
1632 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1633       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1634             to valgrind.
1635
1636 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1637       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1638       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1639                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1640       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1641
1642 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1643       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1644         the file
1645       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1646       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1647         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1648       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1649         symbols... future problem ?
1650
1651 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1652       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1653       * modified gdcm.dsw accordingly
1654
1655 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1656       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1657
1658 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1659       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1660         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1661       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1662         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1663         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1664
1665 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1666       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1667
1668 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1669       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1670       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1671       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1672       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1673       * PACKAGER : adding all concerning windows
1674
1675 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1676       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1677         garbage debug code.
1678       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1679       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1680         test suite reported error.
1681       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1682         packaging a new release).
1683       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1684       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1685       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1686         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1687         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1688
1689 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1691       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1692
1693 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1694       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1695         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1696         is made in an internal list to prevent this problem.
1697         Bug fix when output is empty.
1698         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1699         correction.
1700       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1701
1702 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1703       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1704       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1705         files. Added method to remove all files on the input
1706         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1707         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1708
1709 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1710       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1711         when using make instal.
1712       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1713         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1714
1715 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1716       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1717       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1718
1719 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1720       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1721         linux and WINDOWS !
1722       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1723       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1724
1725 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1726       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1727         addon of the jpeg library)
1728       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1729       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1730       * INSTALL now points to web documentation
1731
1732 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1733       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1734         gdcmUtil.h anymore.
1735       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1736         clean target.
1737       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1738         - to allow compilation with gcc 3.x
1739           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1740           -- small fixes on exceptions.
1741           Note: linking not tested !
1742         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1743           building stage.
1744       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1745         dependent convertion).
1746
1747 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1748       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1749         Changelog):
1750         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1751         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1752           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1753         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1754
1755 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1756       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1757         compile
1758       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1759         (FileName -> Filename)
1760
1761 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1762       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1763         - UpdateProgress method should now be effective
1764         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1765           to volumes),
1766         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1767           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1768           accelerating things).
1769         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1770           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1771           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1772           in the stack (for the caller to notice the problem).
1773
1774 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1775       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1776
1777 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1778       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1779         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1780         under Windows... thanks Windows !)
1781
1782 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1783       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1784         debug stage).
1785       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1786
1787 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1788       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1789
1790 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1791       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1792         called with different flags than the default ones (with automake).
1793         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1794            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1795         and went for warning fixes:
1796         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1797           up from unused variables.
1798         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1799       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1800
1801 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1802       * gdcmPython/gdcm.i:
1803         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1804           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1805           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1806         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1807           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1808           exported to Python a as cvar.
1809       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1810         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1811         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1812         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1813         C++ static methods).
1814       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1815         with the above changes.
1816
1817 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1818       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1819
1820 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1821       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1822         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1823         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1824          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1825          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1826            a wrapper
1827          - Wrapper interface which wrap sources
1828         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1829         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1830       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1831         files for compilation
1832
1833 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1834       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1835         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1836         - vtk/Makefile.am now builds a library
1837         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1838           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1839           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1840           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1841           import library.
1842         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1843           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1844           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1845           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1846           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1847         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1848           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1849         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1850           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1851       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1852       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1853         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1854         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1855         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1856         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1857         collision of various stl members (principally cout...).
1858       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1859         file.
1860       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1861         comply with above changes)
1862
1863 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1864       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1865       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1866         vtk data structure (an image Flip was required).
1867       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1868       * cosmetic changes in documentation.
1869
1870 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1871       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1872         unexisting file is given as argument.
1873       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1874         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1875         containing those images is now available at
1876           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1877         with the name gdcmData.
1878         All the python scripts (including the package initialisation file
1879         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1880         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1881
1882 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1883       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1884         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1885         demo of the usage of this class.
1886         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1887         at configure (or autogen.sh) stage.
1888
1889 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1890       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1891         Notes on valgrind:
1892           - maximum info is obtained with a command of the form:
1893             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1894                      --show-reachable=yes PrintHeader
1895           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1896             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1897             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1898             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1899              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1900       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1901         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1902         Note: some images don't seem to work e.g.
1903             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1904       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1905         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1906         make gdcm more thread friendly.
1907
1908 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1909       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1910           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1911         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1912           gdcmHeader::_dicom_vr.
1913         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1914         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1915           VRHT*.
1916         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1917
1918 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1919       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1920         make install stage.
1921
1922 2003-04-9 JPR
1923       * UpdateGroupLength replaced by new one
1924
1925 2003-04-7 JPR
1926       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1927         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1928
1929 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1930       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1931       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1932       * src:
1933         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1934         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1935           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1936         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1937           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1938           carried the same semantics.
1939           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1940         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1941           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1942         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1943       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1944       * gdcmGetXSize added
1945       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1946       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1947
1948 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1949       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1950         (to avoid double call by end user).
1951       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1952         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1953
1954 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1955       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1956         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1957           the html.users end users oriented documentation and
1958           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1959           oriented documentation.
1960         - README changed accordingly
1961         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1962         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1963           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1964         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1965           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1966           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1967       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1968         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1969       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1970         ill-formed documentation sections.
1971       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1972
1973 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1974       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1975       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1976         un*ces with sh-utils test utility.
1977       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1978       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1979       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1980       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1981       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1982
1983 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1984       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1985       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1986
1987 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1988       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1989       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1990       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1991       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1992         compilation work.
1993       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1994       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1995
1996 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1997       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1998         hence the user doesn't need this explicit call.
1999         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2000           i.e. LoadElements() call removed.
2001       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2002         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2003       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2004         for adding user defined new tags.
2005         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2006         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2007           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2008
2009 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2010       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2011         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2012         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2013         with the autotools, included the python wrappers part.
2014       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2015
2016 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2017       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2018
2019 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2020       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2021         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2022         for usage).
2023       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2024         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2025         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2026       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2027         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2028
2029 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2030       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2031         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2032         value of GDCM_DICT_PATH.
2033       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2034
2035 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2036       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2037       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2038       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2039         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2040         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2041
2042 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2043       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2044         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2045         gdcmHeader.h
2046       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2047         (as opposed to gdcm.h)
2048       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2049       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2050         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2051       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2052
2053 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2054       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2055         bug.
2056
2057 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2058       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2059         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2060         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2061         of hidding away the python related distutils specific files
2062         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2063         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2064         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2065         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2066
2067 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2068       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2069       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2070         among the list of sources.
2071
2072 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2073       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2074       * modifications in MSVC projects
2075
2076 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2077       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2078         looks like we can move back to original usage of exception within
2079         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2080         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2081       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2082         README file for usage added.
2083       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2084         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2085         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2086         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2087       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2088       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2089         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2090           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2091           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2092           instance of class gdcmHeader.
2093         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2094           require no instances at all to be invocated.
2095         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2096           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2097           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2098       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2099         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2100       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2101         the above to be effective.
2102       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2103         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2104       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2105         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2106         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2107         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2108         (for python dectection).
2109       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2110         now avoids publishing the empty entries.
2111
2112 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2113       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2114         ExtraPath reused :-P
2115       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2116
2117 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2119       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2120       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2121         and links
2122
2123 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2124       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2125         method. Doxygenation.
2126       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2127
2128 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2129       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2130         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2131         when using "python setup.py install".
2132       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2133         reexports the working classes.
2134       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2135         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2136         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2137         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2138         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2139         subdir (see the README file). This problem probably due to
2140         an combination of g++ and dynamic loading.
2141       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2142
2143 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2144       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2145         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2146         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2147         again in a python subdir, but the package itself is now in
2148         python/gdcmPython.
2149       * setup.py was cleaned up:
2150         - pythonIncludePath removed
2151         - python setup.py bdist target is now functional.
2152       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2153         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2154         accordingly.
2155
2156 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2157       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2158       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2159         distutils installer is operational.
2160       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2161           shadow classes (from gdcm.py).
2162         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2163           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2164         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2165
2166 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2167       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2168         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2169         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2170         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2171         dictionary.
2172         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2173           are now in the "???" group.
2174         - python/gdcm.i changed accordingly,
2175         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2176           of the above new functionalities in Python.
2177
2178 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2179       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2180         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2181           were definitively removed.
2182         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2183       * src/gdcmElValSet.cxx:
2184         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2185         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2186         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2187         - Added GetElementByName(string).
2188       * src/gdcmHeader.cxx: added
2189         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2190         - GetPubElValRepByName(string)
2191         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2192         - GetShaElValRepByName(string)
2193         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2194         - GetShaElValRepByName(string)
2195         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2196         - GetElValRepByName(string)
2197         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2198         - GetElValRepByName(string)
2199       * Doc/requirements.txt added.
2200
2201 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2202       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2203       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2204         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2205         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2206         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2207       * python/testSuite.py changed accordingly.
2208
2209 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2210       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2211         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2212              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2213               cannot be exported. [...]
2214               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2215               be exported. [...]
2216               This is caused by a designed limitation that once a template
2217               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2218               exported."
2219         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2220         limitation" of VC++ is a pitfall.
2221         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2222         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2223         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2224         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2225         library.
2226         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2227       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2228          dll under windows !!!!)
2229       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2230       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2231         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2232       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2233         (one) of image(s).
2234       * removed glib references
2235       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2236
2237 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2238       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2239         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2240         the files of the testsuite without using unittest.
2241       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2242       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2243       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2244         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2245
2246 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2247       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2248         values, but limits itself to values which are below a user specified
2249         size (by default 1024 bytes).
2250       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2251         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2252         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2253         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2254       * python/testSuite.py
2255         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2256         - two new examples added.
2257       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2258
2259 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2260       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2261         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2262       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2263       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2264       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2265
2266 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2267       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2268         the vr was also RET.
2269       * python/testSuite.py more tests added.
2270
2271 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2272       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2273       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2274       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2275         7.18 Integer types (see stdint.h)
2276         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2277       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2278         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2279         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2280         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2281         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2282         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2283         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2284         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2285
2286 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2287       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2288         VR files.
2289       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2290
2291 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2292       * Adaptation for porting to VC++:
2293         - src/gdcm.h
2294           o forced to use std namespace (for string to be known)
2295           o all class use __declspec export style on WIN32
2296         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2297           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2298       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2299         variable GDCM_DICT_PATH.
2300       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2301
2302 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2303       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2304         to native Python dictionary.
2305       * python/demo/test.py:
2306         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2307         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2308       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2309         PubElVals hashing table.
2310       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2311
2312 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2313       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2314         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2315       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2316       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2317       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2318         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2319       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2320
2321 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2322       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2323         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2324         that we can import de shadow classes without errors].
2325
2326 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2327       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2328       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2329       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2330       * src/Makefile prepared for python wrapping
2331
2332 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2333       * src/gdcmHeader.cxx :
2334         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2335           (see gdcmHeader::LoadElements).
2336         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2337           ReadInt16 and ReadInt32)
2338
2339 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * src/gdcmHeader.cxx :
2341         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2342           method.
2343         - SetLgrElem renamed to SetLength
2344         - GetLgrElem renamed to GetLength
2345         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2346       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2347       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2348         due to IdoDude was cleaned out.
2349
2350 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2351       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2352         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2353         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2354         returning the unecessary skL (skipped length).
2355         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2356         it was redundant with the File position internals (by using
2357         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2358         jajun.
2359       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2360         on the libido specificities which are handled through class
2361         inheritance.
2362       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2363         added.
2364
2365 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2366       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2367         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2368
2369 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2370       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2371
2372 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2373       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2374         and _IdDcmSWAP_LONG.
2375
2376 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2378         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2379