ChangeLog

   1 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
   3         garbage debug code.
   4       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
   5       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
   6         test suite reported error.
   7       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
   8         packaging a new release).
   9       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
  10       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
  11       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
  12         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
  13         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
  14
  15 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  16       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
  17       * src/gdcmHeader.h : formatting code
  18
  19 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  20       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
  21         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
  22         is made in an internal list to prevent this problem.
  23         Bug fix when output is empty.
  24         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
  25         correction.
  26       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
  27
  28 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  29       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
  30       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
  31         files. Added method to remove all files on the input
  32         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
  33         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
  34
  35 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  36       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
  37         when using make instal.
  38       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
  39         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
  40
  41 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  42       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
  43       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
  44
  45 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  46       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
  47         linux and WINDOWS !
  48       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
  49       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
  50
  51 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  52       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
  53         addon of the jpeg library)
  54       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
  55       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
  56       * INSTALL now points to web documentation
  57
  58 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  59       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
  60         gdcmUtil.h anymore.
  61       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
  62         clean target.
  63       * src/gdcm*.[cxx|h] :
  64         - to allow compilation with gcc 3.x
  65           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
  66           -- small fixes on exceptions.
  67           Note: linking not tested !
  68         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
  69           building stage.
  70       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
  71         dependent convertion).
  72
  73 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  74       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
  75         Changelog):
  76         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
  77         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
  78           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
  79         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
  80
  81 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  82       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
  83         compile
  84       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
  85         (FileName -> Filename)
  86
  87 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  88       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
  89         - UpdateProgress method should now be effective
  90         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
  91           to volumes),
  92         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
  93           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
  94           accelerating things).
  95         - when building a stack of images/volumes, files which are not
  96           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
  97           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
  98           in the stack (for the caller to notice the problem).
  99
 100 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 101       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
 102
 103 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 104       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
 105         between standard library (std) and vtk library (problems are found
 106         under Windows... thanks Windows !)
 107
 108 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 109       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
 110         debug stage).
 111       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
 112
 113 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 114       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
 115
 116 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 117       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
 118         called with different flags than the default ones (with automake).
 119         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
 120            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
 121         and went for warning fixes:
 122         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
 123           up from unused variables.
 124         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
 125       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
 126
 127 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 128       * gdcmPython/gdcm.i:
 129         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
 130           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
 131           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
 132         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
 133           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
 134           exported to Python a as cvar.
 135       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
 136         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
 137         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
 138         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
 139         C++ static methods).
 140       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
 141         with the above changes.
 142
 143 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 144       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
 145
 146 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 147       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
 148         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
 149         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
 150          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
 151          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
 152            a wrapper
 153          - Wrapper interface which wrap sources
 154         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
 155         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
 156       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
 157         files for compilation
 158
 159 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
 160       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
 161         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
 162         - vtk/Makefile.am now builds a library
 163         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
 164           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
 165           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
 166           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
 167           import library.
 168         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
 169           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
 170           + vtk/vtkGdcmReader.so and
 171           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
 172           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
 173         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
 174           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
 175         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
 176           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
 177       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
 178       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
 179         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
 180         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
 181         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
 182         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
 183         collision of various stl members (principally cout...).
 184       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
 185         file.
 186       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
 187          comply with above changes)
 188
 189 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 190       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
 191       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
 192         vtk data structure (an image Flip was required).
 193       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
 194       * cosmetic changes in documentation.
 195
 196 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 197       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
 198         unexisting file is given as argument.
 199       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
 200         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
 201         containing those images is now available at
 202           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
 203         with the name gdcmData.
 204         All the python scripts (including the package initialisation file
 205         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
 206         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
 207
 208 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 209       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
 210         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
 211         demo of the usage of this class.
 212         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
 213         at configure (or autogen.sh) stage.
 214
 215 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 216       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
 217         Notes on valgrind:
 218           - maximum info is obtained with a command of the form:
 219             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
 220                    --show-reachable=yes PrintHeader
 221           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
 222             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
 223             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
 224             (in fact further invocation to the STL would recollect the
 225              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
 226       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
 227         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
 228         Note: some images don't seem to work e.g.
 229             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
 230       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
 231         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
 232         make gdcm more thread friendly.
 233
 234 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 235       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
 236           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
 237         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
 238           gdcmHeader::_dicom_vr.
 239         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
 240         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
 241           VRHT*.
 242         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
 243
 244 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 245       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
 246         make install stage.
 247
 248 2003-04-9 JPR
 249       * UpdateGroupLength replaced by new one
 250
 251 2003-04-7 JPR
 252       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
 253         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
 254
 255 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 256       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 257       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
 258       * src:
 259         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
 260         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
 261           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
 262         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
 263           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
 264           carried the same semantics.
 265           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
 266         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
 267           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
 268         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
 269       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
 270       * gdcmGetXSize added
 271       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
 272       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
 273
 274 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 275       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
 276         (to avoid double call by end user).
 277       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
 278         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
 279
 280 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 281       * gdcm/Doc many doxygen changes:
 282         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
 283           the html.users end users oriented documentation and
 284           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
 285           oriented documentation.
 286         - README changed accordingly
 287         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
 288         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
 289           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
 290         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
 291           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
 292           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
 293       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
 294         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
 295       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
 296         ill-formed documentation sections.
 297       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
 298
 299 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 300       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
 301       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
 302         un*ces with sh-utils test utility.
 303       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
 304       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
 305       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
 306       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
 307       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
 308
 309 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 310       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
 311       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
 312
 313 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 314       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
 315       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
 316       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
 317       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
 318         compilation work.
 319       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
 320       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
 321
 322 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 323       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
 324         hence the user doesn't need this explicit call.
 325         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
 326           i.e. LoadElements() call removed.
 327       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
 328         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
 329       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
 330         for adding user defined new tags.
 331         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
 332         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
 333           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
 334
 335 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
 336       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
 337    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
 338    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
 339    with the autotools, included the python wrappers part.
 340       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
 341
 342 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 343       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
 344
 345 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 346       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
 347         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
 348         for usage).
 349       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
 350         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
 351         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
 352       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
 353         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
 354
 355 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 356       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
 357         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
 358         value of GDCM_DICT_PATH.
 359       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
 360
 361 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 362       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
 363       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
 364       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
 365         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
 366         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
 367
 368 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 369       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
 370         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
 371         gdcmHeader.h
 372       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
 373         (as opposed to gdcm.h)
 374       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
 375       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
 376         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
 377       * autogen.sh removed history related references to crea package.
 378
 379 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 380       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
 381         bug.
 382
 383 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 384       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
 385         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
 386         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
 387         of hidding away the python related distutils specific files
 388         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
 389         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
 390         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
 391         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
 392
 393 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 394       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
 395       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
 396         among the list of sources.
 397
 398 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 399       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
 400       * modifications in MSVC projects
 401
 402 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 403       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
 404         looks like we can move back to original usage of exception within
 405         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
 406         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
 407       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
 408         README file for usage added.
 409       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
 410         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
 411         testing the proper parsing of a Dicom related file.
 412         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
 413       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
 414       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
 415         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
 416           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
 417           Dicom public dictionnary were not accessible without an
 418           instance of class gdcmHeader.
 419         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
 420           require no instances at all to be invocated.
 421         - within gdcmDictSet this change required to change some method
 422           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
 423           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
 424       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
 425         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
 426       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
 427         the above to be effective.
 428       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
 429         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
 430       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
 431         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
 432         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
 433         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
 434         (for python dectection).
 435       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
 436         now avoids publishing the empty entries.
 437
 438 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 439       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
 440         ExtraPath reused :-P
 441       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 442
 443 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 444       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 445       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 446       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 447         and links
 448
 449 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 450       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 451         method. Doxygenation.
 452       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 453
 454 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 455       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 456         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 457         when using "python setup.py install".
 458       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 459         reexports the working classes.
 460       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 461         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 462         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 463         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 464         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 465         subdir (see the README file). This problem probably due to
 466         an combination of g++ and dynamic loading.
 467       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 468
 469 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 470       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 471         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 472         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 473         again in a python subdir, but the package itself is now in
 474         python/gdcmPython.
 475       * setup.py was cleaned up:
 476         - pythonIncludePath removed
 477         - python setup.py bdist target is now functional.
 478       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 479         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 480         accordingly.
 481 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 482       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 483       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 484         distutils installer is operational.
 485       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 486           shadow classes (from gdcm.py).
 487         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 488           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 489         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 490
 491
 492 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 493       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 494         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 495         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 496         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 497         dictionary.
 498         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 499           are now in the "???" group.
 500         - python/gdcm.i changed accordingly,
 501         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 502           of the above new functionalities in Python.
 503
 504 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 505       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 506         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 507           were definitively removed.
 508         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 509       * src/gdcmElValSet.cxx:
 510         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 511         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 512         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 513         - Added GetElementByName(string).
 514       * src/gdcmHeader.cxx: added
 515         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 516         - GetPubElValRepByName(string)
 517         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 518         - GetShaElValRepByName(string)
 519         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 520         - GetShaElValRepByName(string)
 521         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 522         - GetElValRepByName(string)
 523         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 524         - GetElValRepByName(string)
 525       * Doc/requirements.txt added.
 526
 527 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 528       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 529       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 530         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 531         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 532         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 533       * python/testSuite.py changed accordingly.
 534
 535 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 536       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 537         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 538              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 539               cannot be exported. [...]
 540               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 541               be exported. [...]
 542               This is caused by a designed limitation that once a template
 543               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 544               exported."
 545         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 546         limitation" of VC++ is a pitfall.
 547         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 548         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 549         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 550         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 551         library.
 552         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 553       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 554          dll under windows !!!!)
 555       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 556       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 557         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 558       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 559         (one) of image(s).
 560       * removed glib references
 561       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 562
 563 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 564       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 565         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 566         the files of the testsuite without using unittest.
 567       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 568       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 569       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 570         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 571
 572 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 573       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 574         values, but limits itself to values which are below a user specified
 575         size (by default 1024 bytes).
 576       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 577         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 578         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 579         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 580       * python/testSuite.py
 581         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 582         - two new examples added.
 583       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 584
 585 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 586       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 587         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 588       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 589       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 590       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 591
 592 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 593       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 594         the vr was also RET.
 595       * python/testSuite.py more tests added.
 596
 597 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 598       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 599       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 600       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 601         7.18 Integer types (see stdint.h)
 602         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 603       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 604         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 605         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 606         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 607         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 608         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 609         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 610         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 611
 612 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 613       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 614         VR files.
 615       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 616
 617 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 618       * Adaptation for porting to VC++:
 619         - src/gdcm.h
 620           o forced to use std namespace (for string to be known)
 621           o all class use __declspec export style on WIN32
 622         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 623           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 624       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 625         variable GDCM_DICT_PATH.
 626       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 627
 628 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 629       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 630         to native Python dictionary.
 631       * python/demo/test.py:
 632         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 633         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 634       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 635         PubElVals hashing table.
 636       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 637
 638 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 639       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 640         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 641       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 642       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 643       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 644         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 645       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 646
 647 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 648       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 649         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 650         that we can import de shadow classes without errors].
 651
 652 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 653       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 654       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 655       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 656       * src/Makefile prepared for python wrapping
 657
 658 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 659       * src/gdcmHeader.cxx :
 660         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 661           (see gdcmHeader::LoadElements).
 662         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 663           ReadInt16 and ReadInt32)
 664
 665 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 666       * src/gdcmHeader.cxx :
 667         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 668           method.
 669         - SetLgrElem renamed to SetLength
 670         - GetLgrElem renamed to GetLength
 671         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 672       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 673       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 674         due to IdoDude was cleaned out.
 675
 676 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 677       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 678         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 679         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 680         returning the unecessary skL (skipped length).
 681         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 682         it was redundant with the File position internals (by using
 683         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 684         jajun.
 685       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 686         on the libido specificities which are handled through class
 687         inheritance.
 688       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 689         added.
 690
 691 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 692       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 693         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 694
 695 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 696       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 697
 698 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 699       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 700         and _IdDcmSWAP_LONG.
 701
 702 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 703       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 704         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 705