]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
3     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
4   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
5     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
6     method:
7     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
8     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
9       method to those classes.
10     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
11       -- Added a ::Print() method.
12       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
13       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
14          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
15
16 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
17   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
18     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
19     doxygen.
20   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
21   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
22     pointlessly wrapped (see
23     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
24   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
25     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
26     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
27     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
28     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
29       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
30            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
31       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
32          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
33
34 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
35   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
36     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
37
38 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
39   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
40     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
41     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
42   * TODO added new entry.
43   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
44     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
45     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
46     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
47       variable names for semantical coherence.
48
49 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
50   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
51   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
52   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
53   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
54   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
55   compilation time jpeg option.
56
57 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
58   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
59     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
60     reproduce at home.
61   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
62   Thanks dcmtk crew !
63
64 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
65   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
66   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
67     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
68   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
69   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
70   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
71   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
72     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
73     from File:: to PixelConvert::.
74
75 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
76   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
77     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
78      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
79      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
80
81 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
82   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
83   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
84   like this:
85     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
86   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
87   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
88   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
89
90 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
91   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
92     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
93     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
94     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
95     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
96       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
97       (for the time being this is better than having them attach to
98        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
99     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
100       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
101     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
102       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
103       gdcmPixelConvert::
104
105 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
106   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
107   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
108     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
109       clean up of RLE related code. 
110   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
111     - src/gdcmRLE.cxx removed
112     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
113     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
114     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
115   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
116     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
117       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
118       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
119
120 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
121   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
122     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
123       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
124       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
125       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
126       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
127       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
128       offsets.
129   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
130     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
131         with the retired Parse7Fe0().
132     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
133     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
134
135 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
136   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
137     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
138     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
139     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
140   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
141     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
142       to return an unused length.
143
144 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
145   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
146     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
147     to use to do simple stuff.
148
149 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
150   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
151     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
152     copying of the file within different directory, configure header file to
153     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
154     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
155
156 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
157   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
158      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
159        with it's binary name).
160      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
161        the Website to be more complete.
162      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
163        doxygenated documentation.
164      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
165        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
166                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
167   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
168   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
169    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
170
171 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
172   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
173    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
174
175 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
176   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
177     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
178     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
179     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
180     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
181   * GDCMHOME clean up:
182     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
183       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
184       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
185   * Autotools clean up:
186     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
187     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
188
189 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
190   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
191   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
192   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
193
194 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
195   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
196     describing TODO entries and used it for new entries.
197   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
198     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
199     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
200   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
201     documentation itself, but the website) moved to html and
202     placed in directory Doc/Website:
203     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
204     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
205     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
206   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
207   * CMakeLists.txt changed accordingly.
208   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
209     DeveloppersPython.html
210   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
211
212 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
213   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
214     of gdcm Web site.
215
216 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
217   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
218     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
219          we can now delete[] it safely  
220   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
221     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
222   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
223
224 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
225   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
226     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
227     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
228     pointed content.
229
230 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
231   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
232   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
233
234 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
235   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
236     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
237     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
238     an example of usage.
239     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
240       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
241     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
242       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
243     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
244     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
245     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
246
247 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
248   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
249     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
250     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
251     in class 
252     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
253       and associated accessors. Doxygenation of the class.
254     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
255       accessors added.
256     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
257       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
258     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
259     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
260
261 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
262   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
263     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
264       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
265            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
266            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
267            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
268            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
269            the same group and element all share the same (group, element)
270            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
271            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
272            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
273            consider the following definition of a TagKey:
274            - let Group, Element be the string representation of the
275              group and element dicom tag members,
276            - let ItemNumber be the string representation of the integer
277              index of the considered item number of a sequence,
278            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
279            the form:
280               /ItemNumber#Group|Element
281            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
282            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
283               Group|Element<SeqTag>
284            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
285            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
286            string e.g.
287                0028|1201
288            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
289            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
290            string e.g.
291                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
292     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
293       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
294       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
295     - src/gdcmDocEntry.cxx:
296       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
297          Key member.
298       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
299     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
300     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
301       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
302       -- now has a new BaseTagKey member.
303       -- STYLE.
304   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
305     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
306     truly belongs.
307     This poses the problem with the semantics of the following lines
308        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
309        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
310        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
311     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
312     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
313     order to get things working the dicom dictionary was altered !
314     Please fix things urgently...
315   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
316     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
317     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
318     set to OW:
319       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
320       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
321       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
322   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
323     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
324   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
325
326 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
327   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
328
329 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
330   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
331     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
332   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
333   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
334
335 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
336   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
337     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
338   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
339     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
340   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
341     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
342   * TODO updated
343   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
344     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
345   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
346   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
347     exception_on_error parameter.
348     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
349     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
350     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
351
352 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
353   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
354   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
355     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
356   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
357   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
358   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
359     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
360   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
361
362 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
363   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
364     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
365
366 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
367   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
368        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
369                  
370 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
371   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
372         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
373
374 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
375    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
376    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
377      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
378      is now in static in the gdcmDebug class
379    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
380    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
381
382 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
383    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
384      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
385    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
386      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
387      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
388      that displays position and size).
389    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
390      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
391      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
392      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
393      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
394      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
395      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
396         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
397      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
398      commiting changes).
399    * Test/CMakeLists.txt:
400       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
401       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
402         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
403         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
404    * TODO updated.
405
406 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
407    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
408      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
409      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
410      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
411      - removal of typedef duplication.
412      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
413      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
414    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
415       - printf polluting ctest removed.
416       - TAB removal for comminting
417    * Test:
418      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
419        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
420        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
421        this test creates them.
422        Note: we need to validate each reference image, but before that
423              I'd like to rename them with a more explicit name...
424      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
425    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
426      including each header needed).
427
428 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
429    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
430      test suite to the Example directory. Are concerned:
431      - PrintHeader.cxx
432      - TestDcm2Acr.cxx
433      - TestFindTags.cxx
434      - TestWrite.cxx was
435      - TestWriteSimple.cxx
436    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
437      image gdcmData/oldACR00001.ima
438
439 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
440    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
441      with removal from gdcmData):
442       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
443       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
444       - US.3405.1.dcm
445      Added the following because after last cvs update, they cause
446        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
447      to segfault:
448       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
449       - oldACR00001.ima
450    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
451      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
452      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
453      form of test...
454    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
455      we don't need to black list the following images anymore:
456       - 8BitsUncompressedColor.dcm
457       - OT-PAL-8-face.dcm
458       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
459    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
460      fixes and the beautified code ;-)
461      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
462      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
463      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
464            improve the test suite). The bug could be detected by using
465            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
466            or by using
467            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
468            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
469
470 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
471    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
472          - replace by uggly but working old code :-(
473                 A lot of things should be OK again.
474         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
475         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
476         (twice, withing a fortnigh ...)         
477
478 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
479    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
480      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
481    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
482      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
483      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
484                    - OT-PAL-8-face.dcm
485                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
486    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
487      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
488      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
489      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
490      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
491      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
492      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
493      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
494      image.
495    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
496      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
497      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
498      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
499    
500 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
501   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
502   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
503                           (instead of infinite loop)
504   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
505
506 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
507    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
508
509 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
510    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
511                     when SamplesPerPixel =3
512          - now Write is no longer confused by 
513                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
514          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
515                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
516    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
517                     (in order to split the job that has not to be done 
518                                         for gdcmDicomDir)
519
520 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
521    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
522      loop on the same image until memory went out. 
523      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
524    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
525      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
526
527 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
528    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
529             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
530                                 is added a the end, when necessary.
531             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
532                       now written correctly
533                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
534                                 (even for odd groups) 
535         Note : only Explicit Value Representation was checked.
536                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
537
538 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
539    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
540    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
541      coding style).
542
543 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
544    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
545      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
546    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
547
548 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
549    FIX : gdcmDocument.cxx
550       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
551         code 'beautyfication' :-(
552       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
553
554 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
555    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
556                  : to allow user to create his own Sequences
557         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
558
559 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
560         
561         - gdcmBinEntry
562           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
563           
564    - gdcmDocEntry
565           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
566           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
567           
568         - gdcmDocEntrySet
569           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
570           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
571      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
572      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
573      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
574      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
575                                             guint16 element,
576                                             std::string vr     = "unkn",
577                                             std::string fourth = "unkn",
578                                             std::string name   = "unkn"); 
579           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
580      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
581      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
582      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
583      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
584      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
585           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
586      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
587           
588         - gdcmDocument
589      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
590      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
591      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
592      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
593      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
594                                         FILE *_fp, FileType type);
595      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
596      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
597      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
598      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
599      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
600      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
601      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
602      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
603                                             guint16 element,
604                                             std::string vr     = "unkn",
605                                             std::string fourth = "unkn",
606                                             std::string name   = "unkn");
607      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
608      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
609      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
610      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
611                                                                                                                  
612         - gdcmElementSet
613           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
614           
615    - gdcmSeqEntry
616           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
617  
618    - gdcmSQItem
619      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
620      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
621      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
622      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
623
624    - gdcmValEntry
625          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
626                                   
627 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
628     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
629       The default constructor invoked by the line
630          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
631       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
632       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
633       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
634     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
635       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
636       Could anyone explain why ?
637     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
638       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
639       code related to gdcmBinEntry).
640
641 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
642     * In order to fix memory leaks:
643      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
644        some delete calls.
645      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
646      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
647        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
648        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
649        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
650      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
651      - src/gdcmDocument.cxx:
652        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
653           from dynamic stores.
654        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
655           was causing memory leaks.
656      - src/gdcmSQItem.cxx:
657        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
658           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
659        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
660           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
661           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
662           This avoids SegFaulting.
663      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
664     * Conclusion:
665      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
666        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
667        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
668      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
669        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
670      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
671        segfaults).
672     * Erroneous leading white fix:
673      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
674        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
675      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
676      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
677     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
678     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
679
680
681 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
682     * In order to fix writing of dicom files:
683      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
684      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
685      - src/gdcmDocument.cxx:
686        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
687        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
688        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
689           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
690           manner.
691        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
692           to only declared) and build on top of
693           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
694        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
695      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
696        for usage in destructor and treatement of promotion in
697        ::ReplaceOrCreateByNumber().
698      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
699       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
700     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
701       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
702       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
703       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
704
705 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
706     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
707       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
708       learned that:
709           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
710           soon as possible by globally disabling memory caching.
711           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
712           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
713       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
714       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
715       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
716     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
717       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
718       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
719       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
720         with 1.
721       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
722       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
723       understand why the list is empty...).
724     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
725     * Doc/License.txt added.
726
727 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
728     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
729       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
730         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
731         the padding problem.
732       - general clean up, simplification, and coding style.
733       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
734     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
735
736 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
737    *  gdcmSeqEntry.cxx
738            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
739                 - fix the display of SQItem ordinal number
740       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
741                 - remove some useless never written private methods     
742                 
743 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
744    * gdcmBinEntry.cxx 
745       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
746            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
747               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
748                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
749    * dcmDocument.cxx
750       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
751               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
752            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
753       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
754    * gdcmFile.cxx
755       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
756    * gdcmSQItem.h
757       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
758             a (relative) Item identier inside a given Sequence
759             \warning : some pb remaining around this number
760                                 will be solved asap
761       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
762    * gdcmValEntry.cxx 
763       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
764
765 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
766     * Memory leak hunt with the following command:
767       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
768                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
769       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
770       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
771       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
772           grep "MEMORY LEAK" src/*
773       Here are two typical examples which I can't help fixing:
774       -----
775           #include <string>
776           int main() {
777              std::string name;
778              char * test = "babo";
779              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
780                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
781              name.clear();   //// Doesn't help !
782              return 0;
783           }
784       -----
785           #include <string>
786           #include <iostream>
787           int main() {
788              std::string line;
789              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
790              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
791                                         //// of 1320 bytes in call to
792                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
793             return 0;
794           }
795       -----
796
797
798 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
799     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
800       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
801         and related, moved away to gdcmDocument.
802       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
803         the corresponding protected accessors of inherited class
804         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
805         declared friend of class gdcmDocument (see below).
806       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
807       - Clean up of undefined or unused methods.
808     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
809       account the changes to gdcmHeader.h).
810     * src/gdcmDocument.h:
811       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
812         changes to gdcmHeader.h).
813       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
814         (see changes to gdcmHeader.h).
815       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
816       - Clean up of undefined or unused methods.
817     * src/gdcmDocument.cxx:
818       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
819       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
820       - some std::string properly set to VRKey
821     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
822       references to gdcmDocument. 
823     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
824     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
825       cvs repository gdcmData.
826
827 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
828     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
829     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
830       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
831     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
832     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
833       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
834     * src/gdcmDocument.cxx: 
835       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
836         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
837       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
838         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
839         removed. Reverting to previous code segment with the proper
840         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
841         Note: this was (partially) breaking the python test suite
842               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
843               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
844     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
845     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
846       now taken into account.
847     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
848       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
849     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
850       on posix.
851     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
852       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
853     * .... alas, the python testSuite is still broken.
854
855 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
856     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
857       gdcmGlob
858     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
859     * src/gdcmUtil.h : export methods
860
861 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
862     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
863       to right behavior
864     * Initial addition of automatic python testing
865     * Initial addition of automatic image comparison
866
867 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
868     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
869       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
870
871 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
872      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
873      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
874      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
875
876 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
877      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
878        new concepts (and new classes) :
879        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
880         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
881         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
882        a Sequence is composed of Items.
883        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
884        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
885        (never taken into account)
886        Our unability to add a new 'entry' in the header
887        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
888        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
889        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
890        nothing is finished.
891        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
892
893 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
894      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
895      
896 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
897      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
898        file prefix (SetFilePrefix)
899
900 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
901      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
902        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
903        baseline.
904      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
905        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
906
907 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
908      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
909        dicom image
910
911 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
912      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
913      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
914        between the developper and user version.
915      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
916      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
917
918 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
919      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
920        when using cmake.
921
922 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
923      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
924                src directory, now generated in the build dir.
925             2. Tests as mentionned smarter
926             3. Some clean up
927             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
928           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
929           where we could set the institution name / patient name...
930
931        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
932               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
933                  (this was not true before)
934
935 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
936      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
937            SeQuence indented printing of Dicom Header.
938      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
939            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
940            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
941      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
942            tree-like structure of a Dicom Header.
943      * FIX Test code cleaning     
944            
945 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
946      * ENH: Adding automatic testing
947        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
948        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
949        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
950        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
951           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
952           too many projects
953      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
954      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
955        one file instead of seven + some small cleanup
956
957 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
958      * ENH Minor changes to the Print() methods.
959      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
960            Header printing. Example given with :
961            > PrintHeader fileName  2 new
962           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
963            
964 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
965      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
966          1. I have added some unsigned where needed
967          2. Some function parameter not used -> (void)
968          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
969          4. g++ don't like character '\' in comment
970          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
971                     this really need to be fixed
972          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
973          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
974                     this also really need to be fixed
975          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
976                     remove compression file 
977                     (as we only do decompression, right ?)     
978      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
979
980 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
981      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
982            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
983            defaulted to yspacing
984            
985 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
986      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
987      * ENH add parameters :
988                bool  exception_on_error = false, 
989                bool  enable_sequences   = false,
990                bool  ignore_shadow      = false
991            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
992      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
993            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
994               
995 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
996      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
997      
998 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
999      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1000      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1001              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1002              
1003 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1004      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1005          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1006
1007 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1008      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1009        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1010        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1011        in gdcmHeader.
1012      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1013        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1014        already does the job.
1015      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1016        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1017
1018 2004-03-30 Benoit Regrain
1019      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1020        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1021        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1022
1023 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1024      * ENH : Check on file type to be written moved
1025              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1026      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1027              when end-of-list is reached
1028            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1029
1030 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1031      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1032      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1033      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1034        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1035
1036 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1037      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1038        now contains all the gdcmGlobal related code.
1039      * minor coding style and doxygenation changes.
1040
1041 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1042      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1043        now contains all the Debug related code.
1044      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1045      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1046        CreateCleanString) removed.
1047      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1048      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1049      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1050      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1051        src/gdcmDirList.cxx)
1052
1053 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1054      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1055
1056 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1057      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1058            big endian made volumes
1059      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1060            end user to instanciate class gdcmParser
1061           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1062
1063 2004-03-22 Benoit Regrain
1064      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1065      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1066              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1067
1068 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1069      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1070            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1071            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1072            or build from the files held (recursively) in a Directory
1073            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1074            gdcmObject::SetBoundaries() added
1075
1076 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1077      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1078                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1079      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1080            DICOMDIR
1081      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1082            about the name
1083
1084 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1085      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1086                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1087
1088 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1089      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1090            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1091            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1092            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1093            to allow making gdcDicomDir object.
1094      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1095           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1096
1097 2004-02-11 Benoit Regrain
1098      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1099              when using from python
1100
1101 2004-02-10 Benoit Regrain
1102      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1103      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1104      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1105              directory parsing
1106
1107 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1108      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1109              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1110              - class gdcmMeta created
1111      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1112              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1113      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1114
1115 2004-02-05 Benoit Regrain
1116      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1117              header entries
1118      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1119      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1120
1121 2004-02-04 Benoit Regrain
1122      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1123      * FIX : sort the images in the dicom dir
1124      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1125      * ADD : a python demo
1126
1127 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1128      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1129      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1130              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1131              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1132              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1133      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1134            to make full checking easier
1135         
1136 2004-02-04 Benoit Regrain
1137      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1138      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1139
1140 2004-02-03 Benoit Regrain
1141      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1142      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1143      * Bug fix and print add-on
1144
1145 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1146      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1147      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1148      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1149      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1150            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1151         
1152 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1153      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1154              iterator on last
1155              of the last synonym :-(
1156      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1157              for DICOMDIR ;-)
1158      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1159      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1160      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1161            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1162       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1163
1164 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1165      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1166            no longer writes 'Un' on disk
1167      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1168      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1169            the length (for Palette expanded images)
1170            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1171      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1172            (that broke Write). Replaced by UL.
1173            Aware user will reload the field if he 
1174            thinks it's necesssary
1175              
1176 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1177      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1178        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1179        IsReadable() methods.
1180        
1181      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1182       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1183       but so usefull for people that miss them ;-)
1184       
1185      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1186        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1187
1188 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1189      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1190
1191 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1192      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1193              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1194         The TRUE value for this param has to be used 
1195         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1196         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1197      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1198              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1199         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1200         
1201      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1202              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1203              Fixed
1204
1205      * gdcmHeader add the method
1206              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1207         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1208         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1209         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1210
1211 2004-01-26 Benoit Regrain
1212      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1213        in the print and add a third level of print to print them
1214
1215 2004-01-23 Benoit Regrain
1216      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1217      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1218      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1219        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1220
1221 2004-01-22 Benoit Regrain
1222      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1223      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1224
1225 2004-01-19 Benoit Regrain
1226      * Add the use of shadow dictionaries
1227      * bug fix and coding style
1228
1229 2004-01-19 Benoit Regrain
1230      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1231      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1232      * Add the update of header entries using the shadow library
1233
1234 2004-01-19 Benoit Regrain
1235      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1236      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1237        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1238        of dicom dir parsing
1239      * bug fix under python
1240
1241 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1242     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1243     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1244     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1245     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1246
1247 2004-01-15 Benoit Regrain
1248      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1249        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1250        when the gdcmDictSet will be destroyed
1251      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1252        gdcmDictSet
1253
1254 2004-01-15 Benoit Regrain
1255      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1256        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1257        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1258        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1259      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1260
1261 2004-01-14 Benoit Regrain
1262      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1263      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1264      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1265      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1266
1267 2004-01-13 Benoit Regrain
1268      * src/*.[h|cxx] : coding style
1269      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1270
1271 2004-01-13 Benoit Regrain
1272      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1273      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1274        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1275      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1276
1277 2004-01-12 Benoit Regrain
1278      * src/*.h : add comments
1279      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1280      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1281        directly setted in the source code
1282      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1283        gdcmTS and gdcmVR
1284
1285 2004-01-09 Benoit Regrain
1286      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1287      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1288
1289 2004-01-07 Benoit Regrain
1290      * Modification to compile with the distutils.
1291      * Bug fix in code
1292
1293 2003-12-10 Benoit Regrain
1294      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1295        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1296      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1297        made in the source code
1298
1299 2003-12-10 Benoit Regrain
1300      * Update Windows projects and .cvsignore files
1301
1302 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1303      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1304            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1305            if he wants to.
1306            gdcmElValSet:Print takes it into account
1307
1308 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1309      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1310      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1311      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1312
1313 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1314       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1315              on the ListTag listElem member,
1316              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1317       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1318              with the tagHt member and the listElem member.
1319              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1320
1321       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1322              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1323                             if bug fixing is necessary), for internal
1324                             use only
1325              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1326                             or to allow Parser going on.
1327              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1328              with a length (not 0000) is found
1329       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1330                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1331                 (to be written)
1332
1333 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1334      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1335      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1336           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1337      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1338
1339 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1340      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1341
1342 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1343      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1344           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1345
1346 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1347      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1348      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1349              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1350              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1351
1352 2003-11-05 Benoit Regrain
1353      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1354                        : Explicit error messages
1355      * in __init__.py  : Related modif
1356
1357 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1358      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1359            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1360            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1361      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1362                     (vtkGdcmReader compliant)           
1363       
1364 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1365      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1366        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1367        
1368 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1369      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1370            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1371
1372 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1373      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1374                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1375              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1376              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1377              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1378              such an image :
1379              After gdcmHeader :
1380               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1381               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1382               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1383      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1384              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1385
1386 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1387      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1388              
1389 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1390      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1391            being coherents dicom files.
1392      
1393 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1394      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1395            from medcon lib !
1396      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1397      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1398      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1399      * ENH: Add include dir to medcon lib
1400      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1401            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1402             
1403 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1404       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1405         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1406           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1407       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1408
1409 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1410       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1411         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1412         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1413       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1414       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1415
1416 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1417       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1418                                                
1419 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1420       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1421       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1422       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1423       
1424 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1425       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1426       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1427       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1428       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1429       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1430       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1431              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1432         But it fasten debug compilation time.
1433             
1434 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1435       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1436         (they are compressed as 2 planes images, 
1437          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1438
1439 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1440       * Now CheckRead takes into account :
1441          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1442          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1443       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1444        (breaks DicomWorks)
1445
1446 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1447       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1448              one should remove the '\'
1449         
1450 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1451       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1452         (wrong lengths in header)
1453         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1454       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1455         (breaks DicomWorks)
1456
1457 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1458       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1459         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1460
1461 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1462       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1463       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1464
1465 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1466       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1467      
1468 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1469       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1470         (the patch is easy to remove)
1471       * cosmetic changes to avoid warnings
1472       
1473 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1474       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1475         no need to press 'r' now.
1476    
1477 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1478       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1479         to new Jpeg Lossless decompressor
1480       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1481       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1482       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1483                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1484 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1485       * general anonymisation in gdcmData
1486       * adding the 'color files' from
1487         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1488       * adding some well knowed bugged-header images
1489       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1490         waiting for their inclusion in Python testsuite
1491
1492 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1493     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1494       no longer seg faults when file is not found
1495
1496 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1497      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1498        MultiFrame images
1499
1500 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1501      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1502
1503 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1504      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1505         OpenFile takes it into account
1506      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1507      * Missing elements added in dicomV3.dic
1508       (just to be affraid : have a look at
1509        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1510        and do it again next year ;->
1511
1512 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1513      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1514        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1515        But there are NOT. It's fixed !
1516        
1517 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1518      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1519      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1520          
1521 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1522      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1523              an ACR-NEMA / DICOM one.
1524      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1525              is not gdcm Readable
1526      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1527              is now decoded.
1528         
1529 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1530      * FIX: CMake generate now documentation
1531      * ENH: out of source doc build !
1532      * ENH: Generate both user and dev documentation
1533      * ENH: Should work on windows too
1534      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1535      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1536      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1537      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1538                      
1539 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1540      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1541      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1542      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1543         window level & window width
1544
1545 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1546      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1547      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1548      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1549      
1550 2003-10-06  Emanuel Ollart
1551      * FIX : compilation process wad broken.
1552              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1553         
1554 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1555      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1556      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1557      
1558 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1559      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1560            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1561                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1562       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1563
1564 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1565       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1566         to remain compliant with already defined strings, 
1567         like Transfert Syntax UID and others)
1568
1569 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1570       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1571              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1572         
1573 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1574       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1575       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1576
1577 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1578       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1579         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1580               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1581       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1582
1583 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1584       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1585
1586 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1587       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1588         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1589
1590 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1591       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1592          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1593          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1594          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1595           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1596                                             YBR_RCT files.
1597           (no sample found :-(
1598
1599 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1600       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1601         Two reasons: - clear things
1602                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1603                        suffer anymore VC++ complains
1604
1605 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1607       * removed leaks
1608
1609 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1610       * The lines are now eigthy characters long.for 
1611         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1612
1613 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1614       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1615         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1616         previous commis of Malaterre)
1617       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1618         before the last Malaterre's commit.
1619
1620 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1621       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1622         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1623       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1624         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1625
1626 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1627       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1628         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1629         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1630
1631 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1632       * Cosmetic changes:
1633         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1634           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1635           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1636           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1637         - PACKAGER corrected
1638         - DEVELOPPER added.
1639         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1640       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1641
1642 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1643       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1644
1645 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1646       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1647
1648 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1649       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1650
1651 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1652       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1653
1654 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1655       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1656         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1657         heuristics to get informations (look at different places).
1658       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1659         sorting DICOM images based on different strategies.
1660       * modified Makefiles accordingly.
1661
1662 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1663       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1664         when building in debug mode
1665       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1666         src/win32/gdcmdll.dsp
1667       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1668
1669 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1670       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1671             to valgrind.
1672
1673 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1675       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1676                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1677       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1678
1679 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1680       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1681         the file
1682       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1683       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1684         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1685       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1686         symbols... future problem ?
1687
1688 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1689       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1690       * modified gdcm.dsw accordingly
1691
1692 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1693       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1694
1695 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1696       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1697         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1698       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1699         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1700         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1701
1702 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1703       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1704
1705 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1706       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1707       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1708       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1709       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1710       * PACKAGER : adding all concerning windows
1711
1712 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1713       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1714         garbage debug code.
1715       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1716       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1717         test suite reported error.
1718       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1719         packaging a new release).
1720       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1721       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1722       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1723         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1724         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1725
1726 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1727       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1728       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1729
1730 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1731       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1732         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1733         is made in an internal list to prevent this problem.
1734         Bug fix when output is empty.
1735         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1736         correction.
1737       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1738
1739 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1740       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1741       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1742         files. Added method to remove all files on the input
1743         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1744         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1745
1746 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1747       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1748         when using make instal.
1749       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1750         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1751
1752 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1753       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1754       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1755
1756 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1757       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1758         linux and WINDOWS !
1759       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1760       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1761
1762 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1763       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1764         addon of the jpeg library)
1765       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1766       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1767       * INSTALL now points to web documentation
1768
1769 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1770       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1771         gdcmUtil.h anymore.
1772       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1773         clean target.
1774       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1775         - to allow compilation with gcc 3.x
1776           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1777           -- small fixes on exceptions.
1778           Note: linking not tested !
1779         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1780           building stage.
1781       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1782         dependent convertion).
1783
1784 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1785       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1786         Changelog):
1787         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1788         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1789           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1790         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1791
1792 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1793       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1794         compile
1795       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1796         (FileName -> Filename)
1797
1798 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1800         - UpdateProgress method should now be effective
1801         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1802           to volumes),
1803         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1804           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1805           accelerating things).
1806         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1807           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1808           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1809           in the stack (for the caller to notice the problem).
1810
1811 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1812       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1813
1814 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1815       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1816         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1817         under Windows... thanks Windows !)
1818
1819 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1820       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1821         debug stage).
1822       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1823
1824 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1825       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1826
1827 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1828       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1829         called with different flags than the default ones (with automake).
1830         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1831            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1832         and went for warning fixes:
1833         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1834           up from unused variables.
1835         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1836       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1837
1838 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1839       * gdcmPython/gdcm.i:
1840         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1841           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1842           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1843         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1844           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1845           exported to Python a as cvar.
1846       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1847         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1848         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1849         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1850         C++ static methods).
1851       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1852         with the above changes.
1853
1854 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1855       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1856
1857 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1858       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1859         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1860         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1861          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1862          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1863            a wrapper
1864          - Wrapper interface which wrap sources
1865         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1866         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1867       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1868         files for compilation
1869
1870 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1871       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1872         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1873         - vtk/Makefile.am now builds a library
1874         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1875           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1876           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1877           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1878           import library.
1879         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1880           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1881           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1882           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1883           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1884         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1885           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1886         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1887           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1888       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1889       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1890         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1891         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1892         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1893         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1894         collision of various stl members (principally cout...).
1895       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1896         file.
1897       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1898         comply with above changes)
1899
1900 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1901       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1902       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1903         vtk data structure (an image Flip was required).
1904       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1905       * cosmetic changes in documentation.
1906
1907 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1908       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1909         unexisting file is given as argument.
1910       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1911         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1912         containing those images is now available at
1913           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1914         with the name gdcmData.
1915         All the python scripts (including the package initialisation file
1916         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1917         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1918
1919 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1920       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1921         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1922         demo of the usage of this class.
1923         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1924         at configure (or autogen.sh) stage.
1925
1926 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1927       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1928         Notes on valgrind:
1929           - maximum info is obtained with a command of the form:
1930             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1931                      --show-reachable=yes PrintHeader
1932           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1933             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1934             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1935             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1936              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1937       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1938         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1939         Note: some images don't seem to work e.g.
1940             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1941       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1942         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1943         make gdcm more thread friendly.
1944
1945 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1946       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1947           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1948         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1949           gdcmHeader::_dicom_vr.
1950         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1951         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1952           VRHT*.
1953         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1954
1955 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1956       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1957         make install stage.
1958
1959 2003-04-9 JPR
1960       * UpdateGroupLength replaced by new one
1961
1962 2003-04-7 JPR
1963       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1964         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1965
1966 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1967       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1968       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1969       * src:
1970         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1971         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1972           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1973         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1974           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1975           carried the same semantics.
1976           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1977         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1978           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1979         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1980       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1981       * gdcmGetXSize added
1982       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1983       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1984
1985 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1986       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1987         (to avoid double call by end user).
1988       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1989         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1990
1991 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1992       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1993         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1994           the html.users end users oriented documentation and
1995           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1996           oriented documentation.
1997         - README changed accordingly
1998         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1999         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2000           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2001         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2002           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2003           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2004       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2005         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2006       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2007         ill-formed documentation sections.
2008       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2009
2010 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2011       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2012       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2013         un*ces with sh-utils test utility.
2014       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2015       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2016       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2017       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2018       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2019
2020 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2021       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2022       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2023
2024 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2025       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2026       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2027       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2028       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2029         compilation work.
2030       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2031       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2032
2033 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2034       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2035         hence the user doesn't need this explicit call.
2036         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2037           i.e. LoadElements() call removed.
2038       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2039         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2040       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2041         for adding user defined new tags.
2042         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2043         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2044           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2045
2046 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2047       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2048         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2049         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2050         with the autotools, included the python wrappers part.
2051       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2052
2053 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2054       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2055
2056 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2057       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2058         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2059         for usage).
2060       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2061         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2062         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2063       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2064         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2065
2066 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2067       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2068         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2069         value of GDCM_DICT_PATH.
2070       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2071
2072 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2073       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2074       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2075       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2076         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2077         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2078
2079 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2080       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2081         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2082         gdcmHeader.h
2083       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2084         (as opposed to gdcm.h)
2085       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2086       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2087         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2088       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2089
2090 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2091       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2092         bug.
2093
2094 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2095       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2096         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2097         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2098         of hidding away the python related distutils specific files
2099         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2100         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2101         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2102         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2103
2104 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2105       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2106       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2107         among the list of sources.
2108
2109 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2110       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2111       * modifications in MSVC projects
2112
2113 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2114       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2115         looks like we can move back to original usage of exception within
2116         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2117         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2118       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2119         README file for usage added.
2120       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2121         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2122         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2123         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2124       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2125       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2126         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2127           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2128           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2129           instance of class gdcmHeader.
2130         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2131           require no instances at all to be invocated.
2132         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2133           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2134           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2135       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2136         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2137       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2138         the above to be effective.
2139       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2140         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2141       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2142         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2143         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2144         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2145         (for python dectection).
2146       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2147         now avoids publishing the empty entries.
2148
2149 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2150       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2151         ExtraPath reused :-P
2152       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2153
2154 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2155       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2156       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2157       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2158         and links
2159
2160 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2161       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2162         method. Doxygenation.
2163       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2164
2165 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2166       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2167         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2168         when using "python setup.py install".
2169       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2170         reexports the working classes.
2171       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2172         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2173         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2174         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2175         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2176         subdir (see the README file). This problem probably due to
2177         an combination of g++ and dynamic loading.
2178       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2179
2180 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2181       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2182         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2183         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2184         again in a python subdir, but the package itself is now in
2185         python/gdcmPython.
2186       * setup.py was cleaned up:
2187         - pythonIncludePath removed
2188         - python setup.py bdist target is now functional.
2189       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2190         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2191         accordingly.
2192
2193 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2194       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2195       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2196         distutils installer is operational.
2197       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2198           shadow classes (from gdcm.py).
2199         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2200           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2201         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2202
2203 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2204       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2205         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2206         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2207         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2208         dictionary.
2209         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2210           are now in the "???" group.
2211         - python/gdcm.i changed accordingly,
2212         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2213           of the above new functionalities in Python.
2214
2215 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2216       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2217         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2218           were definitively removed.
2219         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2220       * src/gdcmElValSet.cxx:
2221         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2222         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2223         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2224         - Added GetElementByName(string).
2225       * src/gdcmHeader.cxx: added
2226         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2227         - GetPubElValRepByName(string)
2228         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2229         - GetShaElValRepByName(string)
2230         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2231         - GetShaElValRepByName(string)
2232         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2233         - GetElValRepByName(string)
2234         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2235         - GetElValRepByName(string)
2236       * Doc/requirements.txt added.
2237
2238 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2239       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2240       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2241         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2242         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2243         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2244       * python/testSuite.py changed accordingly.
2245
2246 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2247       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2248         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2249              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2250               cannot be exported. [...]
2251               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2252               be exported. [...]
2253               This is caused by a designed limitation that once a template
2254               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2255               exported."
2256         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2257         limitation" of VC++ is a pitfall.
2258         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2259         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2260         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2261         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2262         library.
2263         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2264       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2265          dll under windows !!!!)
2266       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2267       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2268         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2269       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2270         (one) of image(s).
2271       * removed glib references
2272       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2273
2274 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2275       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2276         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2277         the files of the testsuite without using unittest.
2278       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2279       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2280       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2281         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2282
2283 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2284       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2285         values, but limits itself to values which are below a user specified
2286         size (by default 1024 bytes).
2287       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2288         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2289         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2290         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2291       * python/testSuite.py
2292         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2293         - two new examples added.
2294       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2295
2296 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2297       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2298         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2299       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2300       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2301       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2302
2303 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2304       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2305         the vr was also RET.
2306       * python/testSuite.py more tests added.
2307
2308 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2309       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2310       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2311       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2312         7.18 Integer types (see stdint.h)
2313         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2314       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2315         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2316         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2317         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2318         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2319         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2320         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2321         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2322
2323 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2324       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2325         VR files.
2326       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2327
2328 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2329       * Adaptation for porting to VC++:
2330         - src/gdcm.h
2331           o forced to use std namespace (for string to be known)
2332           o all class use __declspec export style on WIN32
2333         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2334           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2335       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2336         variable GDCM_DICT_PATH.
2337       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2338
2339 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2341         to native Python dictionary.
2342       * python/demo/test.py:
2343         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2344         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2345       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2346         PubElVals hashing table.
2347       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2348
2349 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2350       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2351         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2352       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2353       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2354       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2355         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2356       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2357
2358 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2359       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2360         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2361         that we can import de shadow classes without errors].
2362
2363 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2364       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2365       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2366       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2367       * src/Makefile prepared for python wrapping
2368
2369 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2370       * src/gdcmHeader.cxx :
2371         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2372           (see gdcmHeader::LoadElements).
2373         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2374           ReadInt16 and ReadInt32)
2375
2376 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * src/gdcmHeader.cxx :
2378         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2379           method.
2380         - SetLgrElem renamed to SetLength
2381         - GetLgrElem renamed to GetLength
2382         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2383       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2384       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2385         due to IdoDude was cleaned out.
2386
2387 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2388       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2389         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2390         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2391         returning the unecessary skL (skipped length).
2392         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2393         it was redundant with the File position internals (by using
2394         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2395         jajun.
2396       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2397         on the libido specificities which are handled through class
2398         inheritance.
2399       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2400         added.
2401
2402 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2403       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2404         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2405
2406 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2407       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2408
2409 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2410       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2411         and _IdDcmSWAP_LONG.
2412
2413 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2414       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2415         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2416