ChangeLog

   1 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
   3
   4 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   5       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
   6         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
   7         for usage).
   8       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
   9         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
  10         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
  11       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
  12         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
  13
  14 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  15       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
  16         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
  17         value of GDCM_DICT_PATH.
  18       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
  19
  20 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  21       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
  22       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
  23       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
  24         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
  25         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
  26
  27 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  28       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
  29         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
  30         gdcmHeader.h
  31       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
  32         (as opposed to gdcm.h)
  33       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
  34       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
  35         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
  36       * autogen.sh removed history related references to crea package.
  37
  38 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  39       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
  40         bug.
  41
  42 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  43       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
  44         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
  45         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
  46         of hidding away the python related distutils specific files
  47         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
  48         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
  49         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
  50         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
  51
  52 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  53       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
  54       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
  55         among the list of sources.
  56
  57 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  58       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
  59       * modifications in MSVC projects
  60
  61 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  62       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
  63         looks like we can move back to original usage of exception within
  64         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
  65         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
  66       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
  67         README file for usage added.
  68       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
  69         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  70         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  71         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  72       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  73       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  74         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  75           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  76           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  77           instance of class gdcmHeader.
  78         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  79           require no instances at all to be invocated.
  80         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  81           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  82           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  83       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  84         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  85       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  86         the above to be effective.
  87       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  88         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  89       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  90         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  91         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  92         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  93         (for python dectection).
  94       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  95         now avoids publishing the empty entries.
  96
  97 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  98       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  99         ExtraPath reused :-P
 100       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 101
 102 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 103       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 104       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 105       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 106         and links
 107
 108 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 109       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 110         method. Doxygenation.
 111       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 112
 113 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 114       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 115         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 116         when using "python setup.py install".
 117       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 118         reexports the working classes.
 119       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 120         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 121         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 122         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 123         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 124         subdir (see the README file). This problem probably due to
 125         an combination of g++ and dynamic loading.
 126       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 127
 128 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 129       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 130         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 131         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 132         again in a python subdir, but the package itself is now in
 133         python/gdcmPython.
 134       * setup.py was cleaned up:
 135         - pythonIncludePath removed
 136         - python setup.py bdist target is now functional.
 137       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 138         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 139         accordingly.
 140 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 141       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 142       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 143         distutils installer is operational.
 144       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 145           shadow classes (from gdcm.py).
 146         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 147           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 148         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 149
 150
 151 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 152       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 153         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 154         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 155         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 156         dictionary.
 157         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 158           are now in the "???" group.
 159         - python/gdcm.i changed accordingly,
 160         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 161           of the above new functionalities in Python.
 162
 163 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 164       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 165         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 166           were definitively removed.
 167         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 168       * src/gdcmElValSet.cxx:
 169         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 170         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 171         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 172         - Added GetElementByName(string).
 173       * src/gdcmHeader.cxx: added
 174         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 175         - GetPubElValRepByName(string)
 176         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 177         - GetShaElValRepByName(string)
 178         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 179         - GetShaElValRepByName(string)
 180         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 181         - GetElValRepByName(string)
 182         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 183         - GetElValRepByName(string)
 184       * Doc/requirements.txt added.
 185
 186 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 187       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 188       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 189         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 190         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 191         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 192       * python/testSuite.py changed accordingly.
 193
 194 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 195       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 196         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 197              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 198               cannot be exported. [...]
 199               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 200               be exported. [...]
 201               This is caused by a designed limitation that once a template
 202               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 203               exported."
 204         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 205         limitation" of VC++ is a pitfall.
 206         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 207         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 208         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 209         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 210         library.
 211         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 212       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 213          dll under windows !!!!)
 214       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 215       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 216         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 217       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 218         (one) of image(s).
 219       * removed glib references
 220       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 221
 222 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 223       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 224         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 225         the files of the testsuite without using unittest.
 226       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 227       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 228       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 229         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 230
 231 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 232       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 233         values, but limits itself to values which are below a user specified
 234         size (by default 1024 bytes).
 235       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 236         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 237         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 238         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 239       * python/testSuite.py
 240         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 241         - two new examples added.
 242       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 243
 244 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 245       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 246         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 247       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 248       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 249       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 250
 251 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 252       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 253         the vr was also RET.
 254       * python/testSuite.py more tests added.
 255
 256 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 257       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 258       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 259       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 260         7.18 Integer types (see stdint.h)
 261         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 262       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 263         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 264         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 265         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 266         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 267         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 268         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 269         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 270
 271 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 272       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 273         VR files.
 274       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 275
 276 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 277       * Adaptation for porting to VC++:
 278         - src/gdcm.h
 279           o forced to use std namespace (for string to be known)
 280           o all class use __declspec export style on WIN32
 281         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 282           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 283       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 284         variable GDCM_DICT_PATH.
 285       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 286
 287 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 288       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 289         to native Python dictionary.
 290       * python/demo/test.py:
 291         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 292         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 293       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 294         PubElVals hashing table.
 295       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 296
 297 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 298       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 299         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 300       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 301       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 302       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 303         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 304       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 305
 306 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 307       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 308         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 309         that we can import de shadow classes without errors].
 310
 311 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 312       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 313       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 314       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 315       * src/Makefile prepared for python wrapping
 316
 317 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 318       * src/gdcmHeader.cxx :
 319         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 320           (see gdcmHeader::LoadElements).
 321         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 322           ReadInt16 and ReadInt32)
 323
 324 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 325       * src/gdcmHeader.cxx :
 326         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 327           method.
 328         - SetLgrElem renamed to SetLength
 329         - GetLgrElem renamed to GetLength
 330         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 331       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 332       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 333         due to IdoDude was cleaned out.
 334
 335 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 336       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 337         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 338         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 339         returning the unecessary skL (skipped length).
 340         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 341         it was redundant with the File position internals (by using
 342         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 343         jajun.
 344       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 345         on the libido specificities which are handled through class
 346         inheritance.
 347       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 348         added.
 349
 350 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 351       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 352         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 353
 354 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 355       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 356
 357 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 358       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 359         and _IdDcmSWAP_LONG.
 360
 361 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 362       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 363         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 364