]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
aaeef5af61aa2d4c54deeafa3b7315fd9ef703c6
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
3      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
4      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
5      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
6      - removal of typedef duplication.
7      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
8      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
9    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
10       - printf polluting ctest removed.
11       - TAB removal for comminting
12    * Test:
13      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
14        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
15        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
16        this test creates them.
17        Note: we need to validate each reference image, but before that
18              I'd like to rename them with a more explicit name...
19      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
20    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
21      including each header needed).
22
23 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
24    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
25      test suite to the Example directory. Are concerned:
26      - PrintHeader.cxx
27      - TestDcm2Acr.cxx
28      - TestFindTags.cxx
29      - TestWrite.cxx was
30      - TestWriteSimple.cxx
31    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
32      image gdcmData/oldACR00001.ima
33
34 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
35    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
36      with removal from gdcmData):
37       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
38       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
39       - US.3405.1.dcm
40      Added the following because after last cvs update, they cause
41        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
42      to segfault:
43       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
44       - oldACR00001.ima
45    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
46      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
47      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
48      form of test...
49    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
50      we don't need to black list the following images anymore:
51       - 8BitsUncompressedColor.dcm
52       - OT-PAL-8-face.dcm
53       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
54    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
55      fixes and the beautified code ;-)
56      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
57      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
58      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
59            improve the test suite). The bug could be detected by using
60            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
61            or by using
62            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
63            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
64
65 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
66    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
67          - replace by uggly but working old code :-(
68                 A lot of things should be OK again.
69         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
70         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
71         (twice, withing a fortnigh ...)         
72
73 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
74    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
75      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
76    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
77      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
78      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
79                    - OT-PAL-8-face.dcm
80                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
81    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
82      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
83      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
84      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
85      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
86      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
87      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
88      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
89      image.
90    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
91      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
92      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
93      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
94    
95 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
96   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
97   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
98                           (instead of infinite loop)
99   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
100
101 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
102    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
103
104 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
105    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
106                     when SamplesPerPixel =3
107          - now Write is no longer confused by 
108                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
109          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
110                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
111    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
112                     (in order to split the job that has not to be done 
113                                         for gdcmDicomDir)
114
115 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
116    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
117      loop on the same image until memory went out. 
118      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
119    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
120      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
121
122 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
123    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
124             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
125                                 is added a the end, when necessary.
126             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
127                       now written correctly
128                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
129                                 (even for odd groups) 
130         Note : only Explicit Value Representation was checked.
131                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
132
133 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
134    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
135    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
136      coding style).
137
138 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
139    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
140      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
141    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
142
143 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
144    FIX : gdcmDocument.cxx
145       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
146         code 'beautyfication' :-(
147       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
148
149 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
150    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
151                  : to allow user to create his own Sequences
152         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
153
154 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
155         
156         - gdcmBinEntry
157           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
158           
159    - gdcmDocEntry
160           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
161           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
162           
163         - gdcmDocEntrySet
164           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
165           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
166      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
167      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
168      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
169      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
170                                             guint16 element,
171                                             std::string vr     = "unkn",
172                                             std::string fourth = "unkn",
173                                             std::string name   = "unkn"); 
174           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
175      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
176      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
177      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
178      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
179      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
180           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
181      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
182           
183         - gdcmDocument
184      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
185      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
186      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
187      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
188      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
189                                         FILE *_fp, FileType type);
190      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
191      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
192      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
193      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
194      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
195      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
196      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
197      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
198                                             guint16 element,
199                                             std::string vr     = "unkn",
200                                             std::string fourth = "unkn",
201                                             std::string name   = "unkn");
202      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
203      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
204      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
205      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
206                                                                                                                  
207         - gdcmElementSet
208           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
209           
210    - gdcmSeqEntry
211           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
212  
213    - gdcmSQItem
214      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
215      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
216      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
217      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
218
219    - gdcmValEntry
220          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
221                                   
222 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
223     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
224       The default constructor invoked by the line
225          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
226       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
227       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
228       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
229     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
230       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
231       Could anyone explain why ?
232     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
233       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
234       code related to gdcmBinEntry).
235
236 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
237     * In order to fix memory leaks:
238      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
239        some delete calls.
240      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
241      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
242        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
243        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
244        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
245      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
246      - src/gdcmDocument.cxx:
247        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
248           from dynamic stores.
249        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
250           was causing memory leaks.
251      - src/gdcmSQItem.cxx:
252        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
253           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
254        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
255           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
256           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
257           This avoids SegFaulting.
258      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
259     * Conclusion:
260      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
261        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
262        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
263      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
264        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
265      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
266        segfaults).
267     * Erroneous leading white fix:
268      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
269        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
270      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
271      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
272     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
273     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
274
275
276 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
277     * In order to fix writing of dicom files:
278      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
279      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
280      - src/gdcmDocument.cxx:
281        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
282        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
283        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
284           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
285           manner.
286        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
287           to only declared) and build on top of
288           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
289        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
290      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
291        for usage in destructor and treatement of promotion in
292        ::ReplaceOrCreateByNumber().
293      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
294       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
295     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
296       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
297       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
298       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
299
300 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
301     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
302       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
303       learned that:
304           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
305           soon as possible by globally disabling memory caching.
306           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
307           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
308       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
309       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
310       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
311     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
312       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
313       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
314       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
315         with 1.
316       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
317       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
318       understand why the list is empty...).
319     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
320     * Doc/License.txt added.
321
322 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
323     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
324       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
325         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
326         the padding problem.
327       - general clean up, simplification, and coding style.
328       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
329     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
330
331 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
332    *  gdcmSeqEntry.cxx
333            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
334                 - fix the display of SQItem ordinal number
335       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
336                 - remove some useless never written private methods     
337                 
338 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
339    * gdcmBinEntry.cxx 
340       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
341            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
342               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
343                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
344    * dcmDocument.cxx
345       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
346               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
347            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
348       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
349    * gdcmFile.cxx
350       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
351    * gdcmSQItem.h
352       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
353             a (relative) Item identier inside a given Sequence
354             \warning : some pb remaining around this number
355                                 will be solved asap
356       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
357    * gdcmValEntry.cxx 
358       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
359
360 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
361     * Memory leak hunt with the following command:
362       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
363                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
364       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
365       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
366       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
367           grep "MEMORY LEAK" src/*
368       Here are two typical examples which I can't help fixing:
369       -----
370           #include <string>
371           int main() {
372              std::string name;
373              char * test = "babo";
374              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
375                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
376              name.clear();   //// Doesn't help !
377              return 0;
378           }
379       -----
380           #include <string>
381           #include <iostream>
382           int main() {
383              std::string line;
384              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
385              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
386                                         //// of 1320 bytes in call to
387                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
388             return 0;
389           }
390       -----
391
392
393 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
394     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
395       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
396         and related, moved away to gdcmDocument.
397       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
398         the corresponding protected accessors of inherited class
399         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
400         declared friend of class gdcmDocument (see below).
401       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
402       - Clean up of undefined or unused methods.
403     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
404       account the changes to gdcmHeader.h).
405     * src/gdcmDocument.h:
406       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
407         changes to gdcmHeader.h).
408       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
409         (see changes to gdcmHeader.h).
410       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
411       - Clean up of undefined or unused methods.
412     * src/gdcmDocument.cxx:
413       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
414       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
415       - some std::string properly set to VRKey
416     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
417       references to gdcmDocument. 
418     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
419     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
420       cvs repository gdcmData.
421
422 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
423     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
424     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
425       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
426     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
427     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
428       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
429     * src/gdcmDocument.cxx: 
430       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
431         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
432       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
433         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
434         removed. Reverting to previous code segment with the proper
435         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
436         Note: this was (partially) breaking the python test suite
437               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
438               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
439     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
440     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
441       now taken into account.
442     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
443       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
444     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
445       on posix.
446     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
447       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
448     * .... alas, the python testSuite is still broken.
449
450 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
451     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal 
452       gdcmGlob
453     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
454     * src/gdcmUtil.h : export methods
455
456 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
457     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
458       to right behavior
459     * Initial addition of automatic python testing
460     * Initial addition of automatic image comparison
461
462 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
463     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
464       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
465
466 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
467      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
468      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
469      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
470
471 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
472      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
473        new concepts (and new classes) :
474        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
475         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
476         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
477        a Sequence is composed of Items.
478        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
479        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
480        (never taken into account)
481        Our unability to add a new 'entry' in the header
482        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
483        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
484        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
485        nothing is finished.
486        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
487
488 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
489      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
490      
491 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
492      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
493        file prefix (SetFilePrefix)
494
495 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
496      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
497        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
498        baseline.
499      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
500        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
501
502 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
503      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
504        dicom image
505
506 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
507      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
508      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
509        between the developper and user version.
510      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
511      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
512
513 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
514      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
515        when using cmake.
516
517 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
518      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
519                src directory, now generated in the build dir.
520             2. Tests as mentionned smarter
521             3. Some clean up
522             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
523           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
524           where we could set the institution name / patient name...
525
526        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
527               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
528                  (this was not true before)
529
530 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
531      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
532            SeQuence indented printing of Dicom Header.
533      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
534            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
535            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
536      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
537            tree-like structure of a Dicom Header.
538      * FIX Test code cleaning     
539            
540 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
541      * ENH: Adding automatic testing
542        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
543        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
544        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
545        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
546           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
547           too many projects
548      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
549      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
550        one file instead of seven + some small cleanup
551
552 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
553      * ENH Minor changes to the Print() methods.
554      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
555            Header printing. Example given with :
556            > PrintHeader fileName  2 new
557           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
558            
559 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
560      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
561          1. I have added some unsigned where needed
562          2. Some function parameter not used -> (void)
563          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
564          4. g++ don't like character '\' in comment
565          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
566                     this really need to be fixed
567          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
568          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
569                     this also really need to be fixed
570          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
571                     remove compression file 
572                     (as we only do decompression, right ?)     
573      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
574
575 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
576      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
577            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
578            defaulted to yspacing
579            
580 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
581      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
582      * ENH add parameters :
583                bool  exception_on_error = false, 
584                bool  enable_sequences   = false,
585                bool  ignore_shadow      = false
586            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
587      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
588            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
589               
590 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
591      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
592      
593 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
594      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
595      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
596              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
597              
598 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
599      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
600          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
601
602 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
603      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
604        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
605        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
606        in gdcmHeader.
607      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
608        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
609        already does the job.
610      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
611        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
612
613 2004-03-30 Benoit Regrain
614      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
615        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
616        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
617
618 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
619      * ENH : Check on file type to be written moved
620              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
621      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
622              when end-of-list is reached
623            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
624
625 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
626      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
627      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
628      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
629        equivalent to ExplicitVR in existing code).
630
631 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
632      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
633        now contains all the gdcmGlobal related code.
634      * minor coding style and doxygenation changes.
635
636 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
637      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
638        now contains all the Debug related code.
639      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
640      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
641        CreateCleanString) removed.
642      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
643      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
644      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
645      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
646        src/gdcmDirList.cxx)
647
648 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
649      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
650
651 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
652      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
653            big endian made volumes
654      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
655            end user to instanciate class gdcmParser
656           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
657
658 2004-03-22 Benoit Regrain
659      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
660      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
661              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
662
663 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
664      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
665            an already existing DICOMDIR file is consistent with
666            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
667            or build from the files held (recursively) in a Directory
668            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
669            gdcmObject::SetBoundaries() added
670
671 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
672      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
673                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
674      * FIX now file names and directory name are written properly in the
675            DICOMDIR
676      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
677            about the name
678
679 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
681                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
682
683 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
684      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
685            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
686            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
687            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
688            to allow making gdcDicomDir object.
689      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
690           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
691
692 2004-02-11 Benoit Regrain
693      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
694              when using from python
695
696 2004-02-10 Benoit Regrain
697      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
698      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
699      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
700              directory parsing
701
702 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
703      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
704              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
705              - class gdcmMeta created
706      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
707              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
708      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
709
710 2004-02-05 Benoit Regrain
711      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
712              header entries
713      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
714      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
715
716 2004-02-04 Benoit Regrain
717      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
718      * FIX : sort the images in the dicom dir
719      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
720      * ADD : a python demo
721
722 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
723      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
724      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
725              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
726              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
727              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
728      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
729            to make full checking easier
730         
731 2004-02-04 Benoit Regrain
732      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
733      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
734
735 2004-02-03 Benoit Regrain
736      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
737      * gdcmDicomDir : add the load of directory
738      * Bug fix and print add-on
739
740 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
741      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
742      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
743      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
744      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
745            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
746         
747 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
748      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
749              iterator on last
750              of the last synonym :-(
751      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
752              for DICOMDIR ;-)
753      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
754      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
755      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
756            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
757       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
758
759 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
760      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
761            no longer writes 'Un' on disk
762      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
763      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
764            the length (for Palette expanded images)
765            and Raw Length (non expanded image + Palette)
766      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
767            (that broke Write). Replaced by UL.
768            Aware user will reload the field if he 
769            thinks it's necesssary
770              
771 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
772      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
773        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
774        IsReadable() methods.
775        
776      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
777       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
778       but so usefull for people that miss them ;-)
779       
780      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
781        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
782
783 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
784      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
785
786 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
787      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
788              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
789         The TRUE value for this param has to be used 
790         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
791         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
792      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
793              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
794         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
795         
796      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
797              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
798              Fixed
799
800      * gdcmHeader add the method
801              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
802         to get *all* the Header Entries with the same tag.
803         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
804         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
805
806 2004-01-26 Benoit Regrain
807      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
808        in the print and add a third level of print to print them
809
810 2004-01-23 Benoit Regrain
811      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
812      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
813      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
814        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
815
816 2004-01-22 Benoit Regrain
817      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
818      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
819
820 2004-01-19 Benoit Regrain
821      * Add the use of shadow dictionaries
822      * bug fix and coding style
823
824 2004-01-19 Benoit Regrain
825      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
826      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
827      * Add the update of header entries using the shadow library
828
829 2004-01-19 Benoit Regrain
830      * removal of file gdcmHeader2.cxx
831      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
832        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
833        of dicom dir parsing
834      * bug fix under python
835
836 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
837     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
838     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
839     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
840     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
841
842 2004-01-15 Benoit Regrain
843      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
844        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
845        when the gdcmDictSet will be destroyed
846      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
847        gdcmDictSet
848
849 2004-01-15 Benoit Regrain
850      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
851        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
852        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
853        some memory and vtk seems to have some problems with that.
854      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
855
856 2004-01-14 Benoit Regrain
857      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
858      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
859      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
860      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
861
862 2004-01-13 Benoit Regrain
863      * src/*.[h|cxx] : coding style
864      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
865
866 2004-01-13 Benoit Regrain
867      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
868      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
869        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
870      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
871
872 2004-01-12 Benoit Regrain
873      * src/*.h : add comments
874      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
875      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
876        directly setted in the source code
877      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
878        gdcmTS and gdcmVR
879
880 2004-01-09 Benoit Regrain
881      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
882      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
883
884 2004-01-07 Benoit Regrain
885      * Modification to compile with the distutils.
886      * Bug fix in code
887
888 2003-12-10 Benoit Regrain
889      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
890        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
891      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
892        made in the source code
893
894 2003-12-10 Benoit Regrain
895      * Update Windows projects and .cvsignore files
896
897 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
898      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
899            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
900            if he wants to.
901            gdcmElValSet:Print takes it into account
902
903 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
904      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
905      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
906      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
907
908 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
909       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
910              on the ListTag listElem member,
911              not longer on the TagElValueHT tagHt member
912       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
913              with the tagHt member and the listElem member.
914              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
915
916       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
917              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
918                             if bug fixing is necessary), for internal
919                             use only
920              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
921                             or to allow Parser going on.
922              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
923              with a length (not 0000) is found
924       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
925                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
926                 (to be written)
927
928 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
929      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
930      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
931           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
932      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
933
934 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
935      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
936
937 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
938      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
939           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
940
941 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
942      * in testSuite.py : new files names for checking the package
943      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
944              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
945              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
946
947 2003-11-05 Benoit Regrain
948      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
949                        : Explicit error messages
950      * in __init__.py  : Related modif
951
952 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
953      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
954            to be used by aware (vtk) users that want to manage
955            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
956      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
957                     (vtkGdcmReader compliant)           
958       
959 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
960      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
961        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
962        
963 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
964      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
965            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
966
967 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
968      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
969                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
970              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
971              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
972              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
973              such an image :
974              After gdcmHeader :
975               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
976               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
977               GetImageDataRaw returns the gray Plane
978      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
979              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
980
981 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
982      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
983              
984 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
985      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
986            being coherents dicom files.
987      
988 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
989      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
990            from medcon lib !
991      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
992      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
993      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
994      * ENH: Add include dir to medcon lib
995      * FIX: only one function is being exported for now ! 
996            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
997             
998 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
999       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1000         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1001           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1002       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1003
1004 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1005       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1006         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1007         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1008       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1009       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1010
1011 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1012       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1013                                                
1014 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1015       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1016       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1017       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1018       
1019 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1020       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1021       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1022       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1023       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1024       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1025       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1026              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1027         But it fasten debug compilation time.
1028             
1029 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1030       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1031         (they are compressed as 2 planes images, 
1032          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1033
1034 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1035       * Now CheckRead takes into account :
1036          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1037          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1038       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1039        (breaks DicomWorks)
1040
1041 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1042       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1043              one should remove the '\'
1044         
1045 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1046       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1047         (wrong lengths in header)
1048         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1049       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1050         (breaks DicomWorks)
1051
1052 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1053       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1054         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1055
1056 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1057       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1058       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1059
1060 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1061       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1062      
1063 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1064       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1065         (the patch is easy to remove)
1066       * cosmetic changes to avoid warnings
1067       
1068 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1069       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1070         no need to press 'r' now.
1071    
1072 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1073       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1074         to new Jpeg Lossless decompressor
1075       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1076       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1077       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1078                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1079 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1080       * general anonymisation in gdcmData
1081       * adding the 'color files' from
1082         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1083       * adding some well knowed bugged-header images
1084       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1085         waiting for their inclusion in Python testsuite
1086
1087 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1088     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1089       no longer seg faults when file is not found
1090
1091 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1092      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1093        MultiFrame images
1094
1095 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1096      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1097
1098 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1099      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1100         OpenFile takes it into account
1101      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1102      * Missing elements added in dicomV3.dic
1103       (just to be affraid : have a look at
1104        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1105        and do it again next year ;->
1106
1107 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1108      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1109        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1110        But there are NOT. It's fixed !
1111        
1112 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1113      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1114      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1115          
1116 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1117      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1118              an ACR-NEMA / DICOM one.
1119      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1120              is not gdcm Readable
1121      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1122              is now decoded.
1123         
1124 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1125      * FIX: CMake generate now documentation
1126      * ENH: out of source doc build !
1127      * ENH: Generate both user and dev documentation
1128      * ENH: Should work on windows too
1129      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1130      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1131      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1132      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1133                      
1134 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1135      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1136      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1137      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1138         window level & window width
1139
1140 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1141      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1142      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1143      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1144      
1145 2003-10-06  Emanuel Ollart
1146      * FIX : compilation process wad broken.
1147              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1148         
1149 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1150      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1151      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1152      
1153 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1154      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1155            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1156                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1157       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1158
1159 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1160       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1161         to remain compliant with already defined strings, 
1162         like Transfert Syntax UID and others)
1163
1164 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1165       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1166              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1167         
1168 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1169       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1170       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1171
1172 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1173       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1174         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1175               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1176       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1177
1178 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1179       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1180
1181 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1182       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1183         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1184
1185 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1186       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1187          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1188          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1189          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1190           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1191                                             YBR_RCT files.
1192           (no sample found :-(
1193
1194 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1195       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1196         Two reasons: - clear things
1197                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1198                        suffer anymore VC++ complains
1199
1200 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1201       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1202       * removed leaks
1203
1204 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1205       * The lines are now eigthy characters long.for 
1206         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1207
1208 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1209       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1210         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1211         previous commis of Malaterre)
1212       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1213         before the last Malaterre's commit.
1214
1215 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1216       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1217         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1218       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1219         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1220
1221 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1222       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1223         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1224         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1225
1226 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1227       * Cosmetic changes:
1228         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1229           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1230           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1231           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1232         - PACKAGER corrected
1233         - DEVELOPPER added.
1234         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1235       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1236
1237 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1238       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1239
1240 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1241       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1242
1243 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1244       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1245
1246 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1247       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1248
1249 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1250       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1251         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1252         heuristics to get informations (look at different places).
1253       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1254         sorting DICOM images based on different strategies.
1255       * modified Makefiles accordingly.
1256
1257 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1258       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1259         when building in debug mode
1260       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1261         src/win32/gdcmdll.dsp
1262       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1263
1264 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1265       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1266             to valgrind.
1267
1268 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1269       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1270       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1271                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1272       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1273
1274 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1275       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1276         the file
1277       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1278       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1279         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1280       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1281         symbols... future problem ?
1282
1283 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1284       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1285       * modified gdcm.dsw accordingly
1286
1287 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1288       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1289
1290 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1291       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1292         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1293       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1294         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1295         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1296
1297 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1298       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1299
1300 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1301       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1302       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1303       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1304       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1305       * PACKAGER : adding all concerning windows
1306
1307 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1308       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1309         garbage debug code.
1310       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1311       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1312         test suite reported error.
1313       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1314         packaging a new release).
1315       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1316       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1317       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1318         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1319         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1320
1321 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1322       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1323       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1324
1325 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1326       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1327         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1328         is made in an internal list to prevent this problem.
1329         Bug fix when output is empty.
1330         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1331         correction.
1332       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1333
1334 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1335       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1336       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1337         files. Added method to remove all files on the input
1338         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1339         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1340
1341 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1342       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1343         when using make instal.
1344       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1345         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1346
1347 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1348       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1349       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1350
1351 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1352       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1353         linux and WINDOWS !
1354       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1355       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1356
1357 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1358       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1359         addon of the jpeg library)
1360       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1361       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1362       * INSTALL now points to web documentation
1363
1364 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1365       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1366         gdcmUtil.h anymore.
1367       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1368         clean target.
1369       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1370         - to allow compilation with gcc 3.x
1371           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1372           -- small fixes on exceptions.
1373           Note: linking not tested !
1374         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1375           building stage.
1376       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1377         dependent convertion).
1378
1379 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1380       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1381         Changelog):
1382         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1383         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1384           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1385         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1386
1387 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1388       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1389         compile
1390       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1391         (FileName -> Filename)
1392
1393 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1394       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1395         - UpdateProgress method should now be effective
1396         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1397           to volumes),
1398         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1399           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1400           accelerating things).
1401         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1402           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1403           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1404           in the stack (for the caller to notice the problem).
1405
1406 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1407       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1408
1409 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1410       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1411         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1412         under Windows... thanks Windows !)
1413
1414 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1415       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1416         debug stage).
1417       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1418
1419 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1420       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1421
1422 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1423       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1424         called with different flags than the default ones (with automake).
1425         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1426            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1427         and went for warning fixes:
1428         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1429           up from unused variables.
1430         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1431       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1432
1433 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1434       * gdcmPython/gdcm.i:
1435         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1436           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1437           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1438         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1439           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1440           exported to Python a as cvar.
1441       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1442         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1443         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1444         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1445         C++ static methods).
1446       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1447         with the above changes.
1448
1449 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1450       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1451
1452 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1453       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1454         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1455         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1456          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1457          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1458            a wrapper
1459          - Wrapper interface which wrap sources
1460         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1461         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1462       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1463         files for compilation
1464
1465 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1466       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1467         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1468         - vtk/Makefile.am now builds a library
1469         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1470           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1471           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1472           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1473           import library.
1474         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1475           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1476           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1477           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1478           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1479         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1480           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1481         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1482           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1483       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1484       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1485         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1486         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1487         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1488         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1489         collision of various stl members (principally cout...).
1490       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1491         file.
1492       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1493         comply with above changes)
1494
1495 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1496       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1497       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1498         vtk data structure (an image Flip was required).
1499       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1500       * cosmetic changes in documentation.
1501
1502 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1503       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1504         unexisting file is given as argument.
1505       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1506         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1507         containing those images is now available at
1508           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1509         with the name gdcmData.
1510         All the python scripts (including the package initialisation file
1511         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1512         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1513
1514 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1515       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1516         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1517         demo of the usage of this class.
1518         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1519         at configure (or autogen.sh) stage.
1520
1521 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1522       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1523         Notes on valgrind:
1524           - maximum info is obtained with a command of the form:
1525             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1526                      --show-reachable=yes PrintHeader
1527           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1528             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1529             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1530             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1531              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1532       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1533         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1534         Note: some images don't seem to work e.g.
1535             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1536       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1537         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1538         make gdcm more thread friendly.
1539
1540 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1541       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1542           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1543         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1544           gdcmHeader::_dicom_vr.
1545         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1546         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1547           VRHT*.
1548         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1549
1550 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1551       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1552         make install stage.
1553
1554 2003-04-9 JPR
1555       * UpdateGroupLength replaced by new one
1556
1557 2003-04-7 JPR
1558       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1559         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1560
1561 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1562       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1563       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1564       * src:
1565         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1566         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1567           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1568         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1569           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1570           carried the same semantics.
1571           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1572         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1573           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1574         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1575       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1576       * gdcmGetXSize added
1577       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1578       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1579
1580 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1581       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1582         (to avoid double call by end user).
1583       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1584         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1585
1586 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1587       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1588         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1589           the html.users end users oriented documentation and
1590           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1591           oriented documentation.
1592         - README changed accordingly
1593         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1594         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1595           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1596         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1597           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1598           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1599       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1600         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1601       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1602         ill-formed documentation sections.
1603       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1604
1605 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1607       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1608         un*ces with sh-utils test utility.
1609       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1610       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1611       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1612       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1613       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1614
1615 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1616       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1617       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1618
1619 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1620       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1621       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1622       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1623       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1624         compilation work.
1625       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1626       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1627
1628 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1629       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1630         hence the user doesn't need this explicit call.
1631         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1632           i.e. LoadElements() call removed.
1633       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1634         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1635       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1636         for adding user defined new tags.
1637         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1638         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1639           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1640
1641 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1642       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1643         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1644         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1645         with the autotools, included the python wrappers part.
1646       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1647
1648 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1649       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1650
1651 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1652       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1653         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1654         for usage).
1655       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1656         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1657         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1658       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1659         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1660
1661 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1662       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1663         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1664         value of GDCM_DICT_PATH.
1665       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1666
1667 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1669       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1670       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1671         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1672         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1673
1674 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1675       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1676         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1677         gdcmHeader.h
1678       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1679         (as opposed to gdcm.h)
1680       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1681       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1682         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1683       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1684
1685 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1686       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1687         bug.
1688
1689 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1691         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1692         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1693         of hidding away the python related distutils specific files
1694         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1695         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1696         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1697         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1698
1699 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1700       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1701       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1702         among the list of sources.
1703
1704 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1705       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1706       * modifications in MSVC projects
1707
1708 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1709       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1710         looks like we can move back to original usage of exception within
1711         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1712         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1713       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1714         README file for usage added.
1715       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1716         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1717         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1718         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1719       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1720       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1721         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1722           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1723           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1724           instance of class gdcmHeader.
1725         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1726           require no instances at all to be invocated.
1727         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1728           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1729           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1730       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1731         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1732       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1733         the above to be effective.
1734       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1735         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1736       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1737         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1738         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1739         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1740         (for python dectection).
1741       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1742         now avoids publishing the empty entries.
1743
1744 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1745       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1746         ExtraPath reused :-P
1747       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1748
1749 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1750       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1751       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1752       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1753         and links
1754
1755 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1756       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1757         method. Doxygenation.
1758       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1759
1760 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1761       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1762         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1763         when using "python setup.py install".
1764       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1765         reexports the working classes.
1766       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1767         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1768         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1769         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1770         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1771         subdir (see the README file). This problem probably due to
1772         an combination of g++ and dynamic loading.
1773       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1774
1775 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1776       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1777         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1778         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1779         again in a python subdir, but the package itself is now in
1780         python/gdcmPython.
1781       * setup.py was cleaned up:
1782         - pythonIncludePath removed
1783         - python setup.py bdist target is now functional.
1784       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1785         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1786         accordingly.
1787
1788 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1789       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1790       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1791         distutils installer is operational.
1792       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1793           shadow classes (from gdcm.py).
1794         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1795           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1796         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1797
1798 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1800         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1801         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1802         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1803         dictionary.
1804         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1805           are now in the "???" group.
1806         - python/gdcm.i changed accordingly,
1807         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1808           of the above new functionalities in Python.
1809
1810 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1811       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1812         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1813           were definitively removed.
1814         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1815       * src/gdcmElValSet.cxx:
1816         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1817         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1818         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1819         - Added GetElementByName(string).
1820       * src/gdcmHeader.cxx: added
1821         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1822         - GetPubElValRepByName(string)
1823         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1824         - GetShaElValRepByName(string)
1825         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1826         - GetShaElValRepByName(string)
1827         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1828         - GetElValRepByName(string)
1829         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1830         - GetElValRepByName(string)
1831       * Doc/requirements.txt added.
1832
1833 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1834       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1835       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1836         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1837         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1838         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1839       * python/testSuite.py changed accordingly.
1840
1841 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1842       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1843         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1844              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1845               cannot be exported. [...]
1846               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1847               be exported. [...]
1848               This is caused by a designed limitation that once a template
1849               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1850               exported."
1851         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1852         limitation" of VC++ is a pitfall.
1853         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1854         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1855         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1856         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1857         library.
1858         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1859       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1860          dll under windows !!!!)
1861       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1862       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1863         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1864       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1865         (one) of image(s).
1866       * removed glib references
1867       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1868
1869 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1870       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1871         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1872         the files of the testsuite without using unittest.
1873       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1874       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1875       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1876         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1877
1878 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1879       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1880         values, but limits itself to values which are below a user specified
1881         size (by default 1024 bytes).
1882       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1883         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1884         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1885         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1886       * python/testSuite.py
1887         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1888         - two new examples added.
1889       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1890
1891 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1892       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1893         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1894       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1895       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1896       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1897
1898 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1899       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1900         the vr was also RET.
1901       * python/testSuite.py more tests added.
1902
1903 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1904       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1905       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1906       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1907         7.18 Integer types (see stdint.h)
1908         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1909       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1910         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1911         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1912         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1913         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1914         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1915         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1916         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1917
1918 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1919       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1920         VR files.
1921       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1922
1923 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1924       * Adaptation for porting to VC++:
1925         - src/gdcm.h
1926           o forced to use std namespace (for string to be known)
1927           o all class use __declspec export style on WIN32
1928         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1929           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1930       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1931         variable GDCM_DICT_PATH.
1932       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1933
1934 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1935       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1936         to native Python dictionary.
1937       * python/demo/test.py:
1938         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1939         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1940       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1941         PubElVals hashing table.
1942       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1943
1944 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1945       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1946         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1947       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1948       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1949       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1950         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1951       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1952
1953 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1954       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1955         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1956         that we can import de shadow classes without errors].
1957
1958 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1959       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1960       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1961       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1962       * src/Makefile prepared for python wrapping
1963
1964 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1965       * src/gdcmHeader.cxx :
1966         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1967           (see gdcmHeader::LoadElements).
1968         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1969           ReadInt16 and ReadInt32)
1970
1971 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1972       * src/gdcmHeader.cxx :
1973         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1974           method.
1975         - SetLgrElem renamed to SetLength
1976         - GetLgrElem renamed to GetLength
1977         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1978       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1979       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1980         due to IdoDude was cleaned out.
1981
1982 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1983       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1984         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1985         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1986         returning the unecessary skL (skipped length).
1987         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1988         it was redundant with the File position internals (by using
1989         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1990         jajun.
1991       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1992         on the libido specificities which are handled through class
1993         inheritance.
1994       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1995         added.
1996
1997 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1998       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1999         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2000
2001 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2002       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2003
2004 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2005       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2006         and _IdDcmSWAP_LONG.
2007
2008 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2009       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2010         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2011