]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
:ENH: Adding the 16bits ijg jpeg lib. This is only the lossless part since there...
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
3     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
4     reproduce at home.
5
6 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
7   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
8   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
9     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
10   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
11   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
12   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
13   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
14     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
15     from File:: to PixelConvert::.
16
17 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
18   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
19     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
20      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
21      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
22
23 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
24   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
25   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
26   like this:
27     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
28   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
29   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
30   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
31
32 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
33   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
34     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
35     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
36     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
37     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
38       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
39       (for the time being this is better than having them attach to
40        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
41     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
42       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
43     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
44       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
45       gdcmPixelConvert::
46
47 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
48   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
49   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
50     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
51       clean up of RLE related code. 
52   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
53     - src/gdcmRLE.cxx removed
54     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
55     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
56     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
57   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
58     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
59       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
60       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
61
62 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
63   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
64     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
65       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
66       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
67       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
68       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
69       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
70       offsets.
71   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
72     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
73         with the retired Parse7Fe0().
74     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
75     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
76
77 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
78   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
79     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
80     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
81     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
82   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
83     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
84       to return an unused length.
85
86 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
87   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
88     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
89     to use to do simple stuff.
90
91 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
92   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
93     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
94     copying of the file within different directory, configure header file to
95     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
96     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
97
98 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
99   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
100      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
101        with it's binary name).
102      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
103        the Website to be more complete.
104      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
105        doxygenated documentation.
106      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
107        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
108                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
109   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
110   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
111    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
112
113 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
114   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
115    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
116
117 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
118   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
119     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
120     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
121     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
122     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
123   * GDCMHOME clean up:
124     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
125       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
126       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
127   * Autotools clean up:
128     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
129     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
130
131 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
132   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
133   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
134   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
135
136 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
137   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
138     describing TODO entries and used it for new entries.
139   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
140     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
141     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
142   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
143     documentation itself, but the website) moved to html and
144     placed in directory Doc/Website:
145     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
146     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
147     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
148   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
149   * CMakeLists.txt changed accordingly.
150   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
151     DeveloppersPython.html
152   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
153
154 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
155   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
156     of gdcm Web site.
157
158 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
159   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
160     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
161          we can now delete[] it safely  
162   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
163     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
164   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
165
166 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
167   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
168     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
169     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
170     pointed content.
171
172 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
173   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
174   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
175
176 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
177   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
178     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
179     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
180     an example of usage.
181     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
182       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
183     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
184       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
185     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
186     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
187     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
188
189 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
190   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
191     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
192     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
193     in class 
194     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
195       and associated accessors. Doxygenation of the class.
196     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
197       accessors added.
198     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
199       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
200     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
201     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
202
203 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
204   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
205     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
206       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
207            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
208            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
209            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
210            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
211            the same group and element all share the same (group, element)
212            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
213            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
214            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
215            consider the following definition of a TagKey:
216            - let Group, Element be the string representation of the
217              group and element dicom tag members,
218            - let ItemNumber be the string representation of the integer
219              index of the considered item number of a sequence,
220            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
221            the form:
222               /ItemNumber#Group|Element
223            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
224            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
225               Group|Element<SeqTag>
226            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
227            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
228            string e.g.
229                0028|1201
230            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
231            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
232            string e.g.
233                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
234     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
235       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
236       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
237     - src/gdcmDocEntry.cxx:
238       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
239          Key member.
240       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
241     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
242     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
243       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
244       -- now has a new BaseTagKey member.
245       -- STYLE.
246   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
247     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
248     truly belongs.
249     This poses the problem with the semantics of the following lines
250        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
251        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
252        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
253     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
254     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
255     order to get things working the dicom dictionary was altered !
256     Please fix things urgently...
257   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
258     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
259     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
260     set to OW:
261       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
262       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
263       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
264   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
265     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
266   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
267
268 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
269   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
270
271 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
272   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
273     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
274   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
275   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
276
277 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
278   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
279     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
280   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
281     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
282   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
283     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
284   * TODO updated
285   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
286     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
287   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
288   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
289     exception_on_error parameter.
290     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
291     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
292     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
293
294 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
295   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
296   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
297     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
298   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
299   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
300   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
301     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
302   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
303
304 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
305   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
306     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
307
308 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
309   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
310        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
311                  
312 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
313   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
314         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
315
316 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
317    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
318    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
319      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
320      is now in static in the gdcmDebug class
321    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
322    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
323
324 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
325    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
326      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
327    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
328      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
329      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
330      that displays position and size).
331    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
332      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
333      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
334      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
335      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
336      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
337      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
338         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
339      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
340      commiting changes).
341    * Test/CMakeLists.txt:
342       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
343       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
344         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
345         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
346    * TODO updated.
347
348 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
349    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
350      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
351      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
352      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
353      - removal of typedef duplication.
354      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
355      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
356    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
357       - printf polluting ctest removed.
358       - TAB removal for comminting
359    * Test:
360      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
361        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
362        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
363        this test creates them.
364        Note: we need to validate each reference image, but before that
365              I'd like to rename them with a more explicit name...
366      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
367    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
368      including each header needed).
369
370 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
371    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
372      test suite to the Example directory. Are concerned:
373      - PrintHeader.cxx
374      - TestDcm2Acr.cxx
375      - TestFindTags.cxx
376      - TestWrite.cxx was
377      - TestWriteSimple.cxx
378    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
379      image gdcmData/oldACR00001.ima
380
381 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
382    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
383      with removal from gdcmData):
384       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
385       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
386       - US.3405.1.dcm
387      Added the following because after last cvs update, they cause
388        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
389      to segfault:
390       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
391       - oldACR00001.ima
392    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
393      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
394      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
395      form of test...
396    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
397      we don't need to black list the following images anymore:
398       - 8BitsUncompressedColor.dcm
399       - OT-PAL-8-face.dcm
400       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
401    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
402      fixes and the beautified code ;-)
403      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
404      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
405      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
406            improve the test suite). The bug could be detected by using
407            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
408            or by using
409            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
410            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
411
412 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
413    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
414          - replace by uggly but working old code :-(
415                 A lot of things should be OK again.
416         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
417         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
418         (twice, withing a fortnigh ...)         
419
420 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
421    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
422      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
423    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
424      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
425      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
426                    - OT-PAL-8-face.dcm
427                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
428    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
429      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
430      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
431      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
432      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
433      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
434      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
435      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
436      image.
437    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
438      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
439      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
440      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
441    
442 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
443   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
444   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
445                           (instead of infinite loop)
446   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
447
448 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
449    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
450
451 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
452    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
453                     when SamplesPerPixel =3
454          - now Write is no longer confused by 
455                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
456          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
457                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
458    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
459                     (in order to split the job that has not to be done 
460                                         for gdcmDicomDir)
461
462 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
463    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
464      loop on the same image until memory went out. 
465      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
466    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
467      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
468
469 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
470    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
471             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
472                                 is added a the end, when necessary.
473             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
474                       now written correctly
475                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
476                                 (even for odd groups) 
477         Note : only Explicit Value Representation was checked.
478                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
479
480 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
481    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
482    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
483      coding style).
484
485 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
486    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
487      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
488    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
489
490 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
491    FIX : gdcmDocument.cxx
492       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
493         code 'beautyfication' :-(
494       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
495
496 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
497    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
498                  : to allow user to create his own Sequences
499         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
500
501 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
502         
503         - gdcmBinEntry
504           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
505           
506    - gdcmDocEntry
507           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
508           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
509           
510         - gdcmDocEntrySet
511           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
512           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
513      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
514      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
515      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
516      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
517                                             guint16 element,
518                                             std::string vr     = "unkn",
519                                             std::string fourth = "unkn",
520                                             std::string name   = "unkn"); 
521           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
522      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
523      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
524      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
525      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
526      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
527           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
528      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
529           
530         - gdcmDocument
531      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
532      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
533      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
534      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
535      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
536                                         FILE *_fp, FileType type);
537      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
538      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
539      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
540      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
541      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
542      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
543      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
544      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
545                                             guint16 element,
546                                             std::string vr     = "unkn",
547                                             std::string fourth = "unkn",
548                                             std::string name   = "unkn");
549      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
550      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
551      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
552      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
553                                                                                                                  
554         - gdcmElementSet
555           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
556           
557    - gdcmSeqEntry
558           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
559  
560    - gdcmSQItem
561      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
562      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
563      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
564      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
565
566    - gdcmValEntry
567          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
568                                   
569 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
570     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
571       The default constructor invoked by the line
572          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
573       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
574       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
575       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
576     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
577       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
578       Could anyone explain why ?
579     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
580       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
581       code related to gdcmBinEntry).
582
583 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
584     * In order to fix memory leaks:
585      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
586        some delete calls.
587      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
588      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
589        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
590        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
591        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
592      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
593      - src/gdcmDocument.cxx:
594        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
595           from dynamic stores.
596        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
597           was causing memory leaks.
598      - src/gdcmSQItem.cxx:
599        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
600           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
601        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
602           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
603           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
604           This avoids SegFaulting.
605      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
606     * Conclusion:
607      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
608        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
609        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
610      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
611        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
612      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
613        segfaults).
614     * Erroneous leading white fix:
615      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
616        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
617      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
618      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
619     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
620     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
621
622
623 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
624     * In order to fix writing of dicom files:
625      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
626      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
627      - src/gdcmDocument.cxx:
628        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
629        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
630        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
631           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
632           manner.
633        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
634           to only declared) and build on top of
635           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
636        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
637      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
638        for usage in destructor and treatement of promotion in
639        ::ReplaceOrCreateByNumber().
640      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
641       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
642     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
643       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
644       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
645       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
646
647 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
648     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
649       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
650       learned that:
651           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
652           soon as possible by globally disabling memory caching.
653           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
654           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
655       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
656       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
657       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
658     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
659       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
660       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
661       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
662         with 1.
663       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
664       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
665       understand why the list is empty...).
666     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
667     * Doc/License.txt added.
668
669 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
670     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
671       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
672         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
673         the padding problem.
674       - general clean up, simplification, and coding style.
675       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
676     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
677
678 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
679    *  gdcmSeqEntry.cxx
680            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
681                 - fix the display of SQItem ordinal number
682       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
683                 - remove some useless never written private methods     
684                 
685 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
686    * gdcmBinEntry.cxx 
687       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
688            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
689               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
690                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
691    * dcmDocument.cxx
692       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
693               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
694            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
695       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
696    * gdcmFile.cxx
697       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
698    * gdcmSQItem.h
699       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
700             a (relative) Item identier inside a given Sequence
701             \warning : some pb remaining around this number
702                                 will be solved asap
703       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
704    * gdcmValEntry.cxx 
705       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
706
707 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
708     * Memory leak hunt with the following command:
709       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
710                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
711       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
712       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
713       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
714           grep "MEMORY LEAK" src/*
715       Here are two typical examples which I can't help fixing:
716       -----
717           #include <string>
718           int main() {
719              std::string name;
720              char * test = "babo";
721              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
722                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
723              name.clear();   //// Doesn't help !
724              return 0;
725           }
726       -----
727           #include <string>
728           #include <iostream>
729           int main() {
730              std::string line;
731              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
732              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
733                                         //// of 1320 bytes in call to
734                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
735             return 0;
736           }
737       -----
738
739
740 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
741     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
742       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
743         and related, moved away to gdcmDocument.
744       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
745         the corresponding protected accessors of inherited class
746         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
747         declared friend of class gdcmDocument (see below).
748       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
749       - Clean up of undefined or unused methods.
750     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
751       account the changes to gdcmHeader.h).
752     * src/gdcmDocument.h:
753       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
754         changes to gdcmHeader.h).
755       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
756         (see changes to gdcmHeader.h).
757       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
758       - Clean up of undefined or unused methods.
759     * src/gdcmDocument.cxx:
760       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
761       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
762       - some std::string properly set to VRKey
763     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
764       references to gdcmDocument. 
765     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
766     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
767       cvs repository gdcmData.
768
769 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
770     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
771     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
772       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
773     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
774     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
775       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
776     * src/gdcmDocument.cxx: 
777       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
778         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
779       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
780         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
781         removed. Reverting to previous code segment with the proper
782         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
783         Note: this was (partially) breaking the python test suite
784               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
785               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
786     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
787     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
788       now taken into account.
789     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
790       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
791     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
792       on posix.
793     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
794       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
795     * .... alas, the python testSuite is still broken.
796
797 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
798     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
799       gdcmGlob
800     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
801     * src/gdcmUtil.h : export methods
802
803 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
804     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
805       to right behavior
806     * Initial addition of automatic python testing
807     * Initial addition of automatic image comparison
808
809 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
810     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
811       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
812
813 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
814      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
815      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
816      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
817
818 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
819      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
820        new concepts (and new classes) :
821        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
822         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
823         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
824        a Sequence is composed of Items.
825        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
826        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
827        (never taken into account)
828        Our unability to add a new 'entry' in the header
829        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
830        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
831        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
832        nothing is finished.
833        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
834
835 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
836      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
837      
838 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
839      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
840        file prefix (SetFilePrefix)
841
842 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
843      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
844        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
845        baseline.
846      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
847        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
848
849 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
850      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
851        dicom image
852
853 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
854      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
855      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
856        between the developper and user version.
857      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
858      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
859
860 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
861      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
862        when using cmake.
863
864 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
865      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
866                src directory, now generated in the build dir.
867             2. Tests as mentionned smarter
868             3. Some clean up
869             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
870           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
871           where we could set the institution name / patient name...
872
873        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
874               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
875                  (this was not true before)
876
877 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
878      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
879            SeQuence indented printing of Dicom Header.
880      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
881            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
882            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
883      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
884            tree-like structure of a Dicom Header.
885      * FIX Test code cleaning     
886            
887 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
888      * ENH: Adding automatic testing
889        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
890        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
891        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
892        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
893           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
894           too many projects
895      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
896      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
897        one file instead of seven + some small cleanup
898
899 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
900      * ENH Minor changes to the Print() methods.
901      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
902            Header printing. Example given with :
903            > PrintHeader fileName  2 new
904           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
905            
906 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
907      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
908          1. I have added some unsigned where needed
909          2. Some function parameter not used -> (void)
910          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
911          4. g++ don't like character '\' in comment
912          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
913                     this really need to be fixed
914          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
915          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
916                     this also really need to be fixed
917          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
918                     remove compression file 
919                     (as we only do decompression, right ?)     
920      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
921
922 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
923      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
924            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
925            defaulted to yspacing
926            
927 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
928      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
929      * ENH add parameters :
930                bool  exception_on_error = false, 
931                bool  enable_sequences   = false,
932                bool  ignore_shadow      = false
933            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
934      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
935            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
936               
937 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
938      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
939      
940 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
941      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
942      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
943              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
944              
945 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
946      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
947          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
948
949 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
950      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
951        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
952        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
953        in gdcmHeader.
954      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
955        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
956        already does the job.
957      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
958        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
959
960 2004-03-30 Benoit Regrain
961      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
962        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
963        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
964
965 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
966      * ENH : Check on file type to be written moved
967              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
968      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
969              when end-of-list is reached
970            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
971
972 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
973      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
974      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
975      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
976        equivalent to ExplicitVR in existing code).
977
978 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
979      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
980        now contains all the gdcmGlobal related code.
981      * minor coding style and doxygenation changes.
982
983 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
984      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
985        now contains all the Debug related code.
986      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
987      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
988        CreateCleanString) removed.
989      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
990      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
991      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
992      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
993        src/gdcmDirList.cxx)
994
995 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
996      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
997
998 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
999      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1000            big endian made volumes
1001      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1002            end user to instanciate class gdcmParser
1003           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1004
1005 2004-03-22 Benoit Regrain
1006      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1007      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1008              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1009
1010 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1011      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1012            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1013            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1014            or build from the files held (recursively) in a Directory
1015            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1016            gdcmObject::SetBoundaries() added
1017
1018 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1019      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1020                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1021      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1022            DICOMDIR
1023      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1024            about the name
1025
1026 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1027      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1028                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1029
1030 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1031      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1032            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1033            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1034            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1035            to allow making gdcDicomDir object.
1036      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1037           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1038
1039 2004-02-11 Benoit Regrain
1040      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1041              when using from python
1042
1043 2004-02-10 Benoit Regrain
1044      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1045      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1046      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1047              directory parsing
1048
1049 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1050      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1051              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1052              - class gdcmMeta created
1053      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1054              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1055      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1056
1057 2004-02-05 Benoit Regrain
1058      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1059              header entries
1060      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1061      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1062
1063 2004-02-04 Benoit Regrain
1064      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1065      * FIX : sort the images in the dicom dir
1066      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1067      * ADD : a python demo
1068
1069 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1070      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1071      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1072              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1073              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1074              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1075      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1076            to make full checking easier
1077         
1078 2004-02-04 Benoit Regrain
1079      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1080      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1081
1082 2004-02-03 Benoit Regrain
1083      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1084      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1085      * Bug fix and print add-on
1086
1087 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1088      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1089      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1090      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1091      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1092            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1093         
1094 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1095      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1096              iterator on last
1097              of the last synonym :-(
1098      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1099              for DICOMDIR ;-)
1100      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1101      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1102      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1103            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1104       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1105
1106 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1107      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1108            no longer writes 'Un' on disk
1109      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1110      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1111            the length (for Palette expanded images)
1112            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1113      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1114            (that broke Write). Replaced by UL.
1115            Aware user will reload the field if he 
1116            thinks it's necesssary
1117              
1118 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1119      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1120        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1121        IsReadable() methods.
1122        
1123      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1124       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1125       but so usefull for people that miss them ;-)
1126       
1127      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1128        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1129
1130 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1131      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1132
1133 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1134      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1135              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1136         The TRUE value for this param has to be used 
1137         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1138         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1139      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1140              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1141         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1142         
1143      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1144              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1145              Fixed
1146
1147      * gdcmHeader add the method
1148              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1149         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1150         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1151         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1152
1153 2004-01-26 Benoit Regrain
1154      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1155        in the print and add a third level of print to print them
1156
1157 2004-01-23 Benoit Regrain
1158      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1159      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1160      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1161        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1162
1163 2004-01-22 Benoit Regrain
1164      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1165      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1166
1167 2004-01-19 Benoit Regrain
1168      * Add the use of shadow dictionaries
1169      * bug fix and coding style
1170
1171 2004-01-19 Benoit Regrain
1172      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1173      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1174      * Add the update of header entries using the shadow library
1175
1176 2004-01-19 Benoit Regrain
1177      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1178      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1179        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1180        of dicom dir parsing
1181      * bug fix under python
1182
1183 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1184     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1185     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1186     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1187     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1188
1189 2004-01-15 Benoit Regrain
1190      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1191        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1192        when the gdcmDictSet will be destroyed
1193      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1194        gdcmDictSet
1195
1196 2004-01-15 Benoit Regrain
1197      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1198        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1199        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1200        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1201      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1202
1203 2004-01-14 Benoit Regrain
1204      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1205      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1206      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1207      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1208
1209 2004-01-13 Benoit Regrain
1210      * src/*.[h|cxx] : coding style
1211      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1212
1213 2004-01-13 Benoit Regrain
1214      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1215      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1216        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1217      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1218
1219 2004-01-12 Benoit Regrain
1220      * src/*.h : add comments
1221      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1222      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1223        directly setted in the source code
1224      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1225        gdcmTS and gdcmVR
1226
1227 2004-01-09 Benoit Regrain
1228      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1229      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1230
1231 2004-01-07 Benoit Regrain
1232      * Modification to compile with the distutils.
1233      * Bug fix in code
1234
1235 2003-12-10 Benoit Regrain
1236      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1237        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1238      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1239        made in the source code
1240
1241 2003-12-10 Benoit Regrain
1242      * Update Windows projects and .cvsignore files
1243
1244 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1245      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1246            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1247            if he wants to.
1248            gdcmElValSet:Print takes it into account
1249
1250 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1251      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1252      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1253      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1254
1255 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1256       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1257              on the ListTag listElem member,
1258              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1259       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1260              with the tagHt member and the listElem member.
1261              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1262
1263       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1264              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1265                             if bug fixing is necessary), for internal
1266                             use only
1267              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1268                             or to allow Parser going on.
1269              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1270              with a length (not 0000) is found
1271       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1272                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1273                 (to be written)
1274
1275 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1276      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1277      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1278           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1279      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1280
1281 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1282      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1283
1284 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1285      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1286           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1287
1288 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1289      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1290      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1291              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1292              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1293
1294 2003-11-05 Benoit Regrain
1295      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1296                        : Explicit error messages
1297      * in __init__.py  : Related modif
1298
1299 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1300      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1301            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1302            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1303      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1304                     (vtkGdcmReader compliant)           
1305       
1306 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1307      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1308        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1309        
1310 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1311      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1312            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1313
1314 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1315      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1316                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1317              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1318              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1319              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1320              such an image :
1321              After gdcmHeader :
1322               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1323               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1324               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1325      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1326              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1327
1328 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1329      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1330              
1331 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1332      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1333            being coherents dicom files.
1334      
1335 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1336      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1337            from medcon lib !
1338      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1339      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1340      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1341      * ENH: Add include dir to medcon lib
1342      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1343            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1344             
1345 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1346       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1347         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1348           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1349       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1350
1351 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1352       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1353         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1354         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1355       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1356       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1357
1358 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1359       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1360                                                
1361 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1362       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1363       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1364       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1365       
1366 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1367       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1368       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1369       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1370       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1371       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1372       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1373              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1374         But it fasten debug compilation time.
1375             
1376 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1377       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1378         (they are compressed as 2 planes images, 
1379          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1380
1381 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1382       * Now CheckRead takes into account :
1383          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1384          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1385       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1386        (breaks DicomWorks)
1387
1388 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1389       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1390              one should remove the '\'
1391         
1392 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1393       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1394         (wrong lengths in header)
1395         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1396       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1397         (breaks DicomWorks)
1398
1399 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1400       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1401         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1402
1403 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1404       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1405       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1406
1407 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1408       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1409      
1410 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1411       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1412         (the patch is easy to remove)
1413       * cosmetic changes to avoid warnings
1414       
1415 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1416       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1417         no need to press 'r' now.
1418    
1419 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1420       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1421         to new Jpeg Lossless decompressor
1422       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1423       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1424       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1425                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1426 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1427       * general anonymisation in gdcmData
1428       * adding the 'color files' from
1429         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1430       * adding some well knowed bugged-header images
1431       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1432         waiting for their inclusion in Python testsuite
1433
1434 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1435     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1436       no longer seg faults when file is not found
1437
1438 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1439      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1440        MultiFrame images
1441
1442 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1443      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1444
1445 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1446      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1447         OpenFile takes it into account
1448      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1449      * Missing elements added in dicomV3.dic
1450       (just to be affraid : have a look at
1451        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1452        and do it again next year ;->
1453
1454 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1455      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1456        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1457        But there are NOT. It's fixed !
1458        
1459 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1460      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1461      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1462          
1463 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1464      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1465              an ACR-NEMA / DICOM one.
1466      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1467              is not gdcm Readable
1468      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1469              is now decoded.
1470         
1471 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1472      * FIX: CMake generate now documentation
1473      * ENH: out of source doc build !
1474      * ENH: Generate both user and dev documentation
1475      * ENH: Should work on windows too
1476      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1477      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1478      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1479      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1480                      
1481 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1482      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1483      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1484      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1485         window level & window width
1486
1487 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1488      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1489      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1490      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1491      
1492 2003-10-06  Emanuel Ollart
1493      * FIX : compilation process wad broken.
1494              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1495         
1496 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1497      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1498      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1499      
1500 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1501      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1502            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1503                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1504       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1505
1506 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1507       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1508         to remain compliant with already defined strings, 
1509         like Transfert Syntax UID and others)
1510
1511 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1512       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1513              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1514         
1515 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1516       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1517       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1518
1519 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1520       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1521         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1522               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1523       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1524
1525 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1526       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1527
1528 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1529       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1530         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1531
1532 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1533       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1534          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1535          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1536          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1537           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1538                                             YBR_RCT files.
1539           (no sample found :-(
1540
1541 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1542       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1543         Two reasons: - clear things
1544                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1545                        suffer anymore VC++ complains
1546
1547 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1548       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1549       * removed leaks
1550
1551 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1552       * The lines are now eigthy characters long.for 
1553         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1554
1555 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1556       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1557         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1558         previous commis of Malaterre)
1559       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1560         before the last Malaterre's commit.
1561
1562 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1563       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1564         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1565       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1566         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1567
1568 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1569       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1570         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1571         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1572
1573 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1574       * Cosmetic changes:
1575         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1576           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1577           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1578           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1579         - PACKAGER corrected
1580         - DEVELOPPER added.
1581         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1582       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1583
1584 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1585       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1586
1587 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1588       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1589
1590 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1591       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1592
1593 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1594       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1595
1596 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1597       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1598         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1599         heuristics to get informations (look at different places).
1600       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1601         sorting DICOM images based on different strategies.
1602       * modified Makefiles accordingly.
1603
1604 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1605       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1606         when building in debug mode
1607       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1608         src/win32/gdcmdll.dsp
1609       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1610
1611 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1613             to valgrind.
1614
1615 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1616       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1617       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1618                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1619       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1620
1621 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1622       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1623         the file
1624       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1625       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1626         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1627       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1628         symbols... future problem ?
1629
1630 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1631       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1632       * modified gdcm.dsw accordingly
1633
1634 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1635       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1636
1637 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1638       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1639         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1640       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1641         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1642         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1643
1644 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1645       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1646
1647 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1648       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1649       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1650       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1651       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1652       * PACKAGER : adding all concerning windows
1653
1654 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1655       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1656         garbage debug code.
1657       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1658       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1659         test suite reported error.
1660       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1661         packaging a new release).
1662       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1663       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1664       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1665         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1666         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1667
1668 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1669       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1670       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1671
1672 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1673       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1674         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1675         is made in an internal list to prevent this problem.
1676         Bug fix when output is empty.
1677         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1678         correction.
1679       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1680
1681 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1682       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1683       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1684         files. Added method to remove all files on the input
1685         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1686         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1687
1688 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1689       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1690         when using make instal.
1691       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1692         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1693
1694 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1695       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1696       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1697
1698 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1699       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1700         linux and WINDOWS !
1701       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1702       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1703
1704 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1705       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1706         addon of the jpeg library)
1707       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1708       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1709       * INSTALL now points to web documentation
1710
1711 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1713         gdcmUtil.h anymore.
1714       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1715         clean target.
1716       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1717         - to allow compilation with gcc 3.x
1718           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1719           -- small fixes on exceptions.
1720           Note: linking not tested !
1721         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1722           building stage.
1723       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1724         dependent convertion).
1725
1726 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1727       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1728         Changelog):
1729         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1730         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1731           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1732         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1733
1734 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1735       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1736         compile
1737       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1738         (FileName -> Filename)
1739
1740 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1741       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1742         - UpdateProgress method should now be effective
1743         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1744           to volumes),
1745         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1746           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1747           accelerating things).
1748         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1749           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1750           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1751           in the stack (for the caller to notice the problem).
1752
1753 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1754       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1755
1756 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1757       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1758         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1759         under Windows... thanks Windows !)
1760
1761 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1762       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1763         debug stage).
1764       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1765
1766 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1767       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1768
1769 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1770       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1771         called with different flags than the default ones (with automake).
1772         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1773            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1774         and went for warning fixes:
1775         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1776           up from unused variables.
1777         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1778       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1779
1780 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1781       * gdcmPython/gdcm.i:
1782         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1783           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1784           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1785         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1786           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1787           exported to Python a as cvar.
1788       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1789         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1790         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1791         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1792         C++ static methods).
1793       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1794         with the above changes.
1795
1796 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1797       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1798
1799 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1800       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1801         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1802         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1803          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1804          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1805            a wrapper
1806          - Wrapper interface which wrap sources
1807         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1808         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1809       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1810         files for compilation
1811
1812 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1813       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1814         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1815         - vtk/Makefile.am now builds a library
1816         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1817           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1818           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1819           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1820           import library.
1821         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1822           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1823           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1824           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1825           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1826         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1827           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1828         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1829           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1830       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1831       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1832         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1833         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1834         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1835         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1836         collision of various stl members (principally cout...).
1837       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1838         file.
1839       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1840         comply with above changes)
1841
1842 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1843       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1844       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1845         vtk data structure (an image Flip was required).
1846       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1847       * cosmetic changes in documentation.
1848
1849 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1850       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1851         unexisting file is given as argument.
1852       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1853         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1854         containing those images is now available at
1855           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1856         with the name gdcmData.
1857         All the python scripts (including the package initialisation file
1858         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1859         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1860
1861 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1862       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1863         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1864         demo of the usage of this class.
1865         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1866         at configure (or autogen.sh) stage.
1867
1868 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1869       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1870         Notes on valgrind:
1871           - maximum info is obtained with a command of the form:
1872             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1873                      --show-reachable=yes PrintHeader
1874           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1875             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1876             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1877             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1878              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1879       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1880         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1881         Note: some images don't seem to work e.g.
1882             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1883       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1884         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1885         make gdcm more thread friendly.
1886
1887 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1888       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1889           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1890         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1891           gdcmHeader::_dicom_vr.
1892         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1893         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1894           VRHT*.
1895         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1896
1897 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1898       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1899         make install stage.
1900
1901 2003-04-9 JPR
1902       * UpdateGroupLength replaced by new one
1903
1904 2003-04-7 JPR
1905       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1906         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1907
1908 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1909       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1910       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1911       * src:
1912         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1913         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1914           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1915         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1916           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1917           carried the same semantics.
1918           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1919         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1920           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1921         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1922       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1923       * gdcmGetXSize added
1924       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1925       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1926
1927 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1928       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1929         (to avoid double call by end user).
1930       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1931         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1932
1933 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1934       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1935         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1936           the html.users end users oriented documentation and
1937           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1938           oriented documentation.
1939         - README changed accordingly
1940         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1941         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1942           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1943         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1944           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1945           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1946       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1947         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1948       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1949         ill-formed documentation sections.
1950       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1951
1952 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1953       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1954       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1955         un*ces with sh-utils test utility.
1956       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1957       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1958       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1959       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1960       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1961
1962 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1963       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1964       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1965
1966 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1967       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1968       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1969       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1970       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1971         compilation work.
1972       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1973       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1974
1975 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1976       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1977         hence the user doesn't need this explicit call.
1978         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1979           i.e. LoadElements() call removed.
1980       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1981         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1982       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1983         for adding user defined new tags.
1984         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1985         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1986           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1987
1988 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1989       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1990         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1991         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1992         with the autotools, included the python wrappers part.
1993       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1994
1995 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1996       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1997
1998 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1999       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2000         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2001         for usage).
2002       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2003         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2004         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2005       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2006         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2007
2008 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2009       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2010         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2011         value of GDCM_DICT_PATH.
2012       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2013
2014 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2015       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2016       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2017       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2018         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2019         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2020
2021 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2022       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2023         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2024         gdcmHeader.h
2025       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2026         (as opposed to gdcm.h)
2027       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2028       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2029         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2030       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2031
2032 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2033       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2034         bug.
2035
2036 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2037       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2038         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2039         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2040         of hidding away the python related distutils specific files
2041         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2042         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2043         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2044         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2045
2046 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2047       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2048       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2049         among the list of sources.
2050
2051 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2052       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2053       * modifications in MSVC projects
2054
2055 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2056       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2057         looks like we can move back to original usage of exception within
2058         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2059         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2060       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2061         README file for usage added.
2062       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2063         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2064         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2065         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2066       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2067       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2068         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2069           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2070           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2071           instance of class gdcmHeader.
2072         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2073           require no instances at all to be invocated.
2074         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2075           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2076           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2077       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2078         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2079       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2080         the above to be effective.
2081       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2082         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2083       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2084         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2085         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2086         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2087         (for python dectection).
2088       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2089         now avoids publishing the empty entries.
2090
2091 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2092       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2093         ExtraPath reused :-P
2094       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2095
2096 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2097       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2098       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2099       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2100         and links
2101
2102 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2103       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2104         method. Doxygenation.
2105       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2106
2107 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2108       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2109         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2110         when using "python setup.py install".
2111       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2112         reexports the working classes.
2113       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2114         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2115         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2116         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2117         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2118         subdir (see the README file). This problem probably due to
2119         an combination of g++ and dynamic loading.
2120       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2121
2122 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2123       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2124         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2125         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2126         again in a python subdir, but the package itself is now in
2127         python/gdcmPython.
2128       * setup.py was cleaned up:
2129         - pythonIncludePath removed
2130         - python setup.py bdist target is now functional.
2131       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2132         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2133         accordingly.
2134
2135 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2136       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2137       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2138         distutils installer is operational.
2139       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2140           shadow classes (from gdcm.py).
2141         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2142           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2143         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2144
2145 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2146       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2147         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2148         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2149         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2150         dictionary.
2151         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2152           are now in the "???" group.
2153         - python/gdcm.i changed accordingly,
2154         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2155           of the above new functionalities in Python.
2156
2157 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2158       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2159         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2160           were definitively removed.
2161         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2162       * src/gdcmElValSet.cxx:
2163         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2164         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2165         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2166         - Added GetElementByName(string).
2167       * src/gdcmHeader.cxx: added
2168         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2169         - GetPubElValRepByName(string)
2170         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2171         - GetShaElValRepByName(string)
2172         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2173         - GetShaElValRepByName(string)
2174         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2175         - GetElValRepByName(string)
2176         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2177         - GetElValRepByName(string)
2178       * Doc/requirements.txt added.
2179
2180 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2181       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2182       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2183         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2184         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2185         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2186       * python/testSuite.py changed accordingly.
2187
2188 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2189       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2190         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2191              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2192               cannot be exported. [...]
2193               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2194               be exported. [...]
2195               This is caused by a designed limitation that once a template
2196               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2197               exported."
2198         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2199         limitation" of VC++ is a pitfall.
2200         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2201         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2202         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2203         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2204         library.
2205         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2206       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2207          dll under windows !!!!)
2208       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2209       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2210         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2211       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2212         (one) of image(s).
2213       * removed glib references
2214       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2215
2216 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2217       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2218         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2219         the files of the testsuite without using unittest.
2220       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2221       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2222       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2223         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2224
2225 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2226       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2227         values, but limits itself to values which are below a user specified
2228         size (by default 1024 bytes).
2229       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2230         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2231         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2232         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2233       * python/testSuite.py
2234         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2235         - two new examples added.
2236       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2237
2238 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2239       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2240         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2241       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2242       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2243       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2244
2245 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2246       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2247         the vr was also RET.
2248       * python/testSuite.py more tests added.
2249
2250 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2251       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2252       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2253       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2254         7.18 Integer types (see stdint.h)
2255         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2256       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2257         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2258         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2259         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2260         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2261         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2262         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2263         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2264
2265 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2266       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2267         VR files.
2268       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2269
2270 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2271       * Adaptation for porting to VC++:
2272         - src/gdcm.h
2273           o forced to use std namespace (for string to be known)
2274           o all class use __declspec export style on WIN32
2275         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2276           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2277       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2278         variable GDCM_DICT_PATH.
2279       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2280
2281 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2282       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2283         to native Python dictionary.
2284       * python/demo/test.py:
2285         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2286         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2287       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2288         PubElVals hashing table.
2289       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2290
2291 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2292       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2293         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2294       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2295       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2296       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2297         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2298       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2299
2300 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2301       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2302         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2303         that we can import de shadow classes without errors].
2304
2305 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2306       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2307       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2308       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2309       * src/Makefile prepared for python wrapping
2310
2311 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2312       * src/gdcmHeader.cxx :
2313         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2314           (see gdcmHeader::LoadElements).
2315         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2316           ReadInt16 and ReadInt32)
2317
2318 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2319       * src/gdcmHeader.cxx :
2320         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2321           method.
2322         - SetLgrElem renamed to SetLength
2323         - GetLgrElem renamed to GetLength
2324         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2325       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2326       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2327         due to IdoDude was cleaned out.
2328
2329 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2330       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2331         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2332         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2333         returning the unecessary skL (skipped length).
2334         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2335         it was redundant with the File position internals (by using
2336         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2337         jajun.
2338       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2339         on the libido specificities which are handled through class
2340         inheritance.
2341       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2342         added.
2343
2344 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2345       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2346         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2347
2348 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2349       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2350
2351 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2352       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2353         and _IdDcmSWAP_LONG.
2354
2355 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2356       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2357         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2358