]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
3 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
4       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
5 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
6       * Fix a few delete/delete[] mismatch
7 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
8       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
9       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
10       heuristics to get informations (look at different places).
11       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
12       sorting DICOM images based on different strategies.
13       * modified Makefiles accordingly.
14 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
15       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
16         when building in debug mode
17       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match 
18         src/win32/gdcmdll.dsp
19       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
20 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
21       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
22 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
23       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
24       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
25       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
26 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
27       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
28         the file
29       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
30       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
31         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
32       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
33         symbols... futur problem ?
34 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
35       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
36       * modified gdcm.dsw accordingly
37 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
38       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
39 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
40       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
41         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
42       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
43         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
44         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
45 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
46       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
47 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
48       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
49       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
50       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
51       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
52       * PACKAGER : adding all concerning windows
53 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
54       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
55         garbage debug code.
56       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
57       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
58         test suite reported error.
59       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
60         packaging a new release).
61       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
62       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
63       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
64         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
65         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
66 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
67       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
68       * src/gdcmHeader.h : formatting code
69 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
71         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
72         is made in an internal list to prevent this problem.
73         Bug fix when output is empty.
74         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
75         correction.
76       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
77 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
78       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
79       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
80         files. Added method to remove all files on the input
81         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
82         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
83 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
84       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
85         when using make instal.
86       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
87         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
88 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
89       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
90       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
91 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
92       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
93         linux and WINDOWS !
94       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
95       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
96 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
97       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
98         addon of the jpeg library)
99       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
100       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
101       * INSTALL now points to web documentation
102 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
103       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
104         gdcmUtil.h anymore.
105       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
106         clean target.
107       * src/gdcm*.[cxx|h] :
108         - to allow compilation with gcc 3.x
109           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
110           -- small fixes on exceptions.
111           Note: linking not tested !
112         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
113           building stage.
114       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
115         dependent convertion).
116 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
117       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
118         Changelog):
119         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
120         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
121           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
122         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
123 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
124       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to 
125         compile
126       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
127         (FileName -> Filename)
128 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
129       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
130         - UpdateProgress method should now be effective
131         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
132           to volumes),
133         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
134           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
135           accelerating things).
136         - when building a stack of images/volumes, files which are not
137           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
138           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
139           in the stack (for the caller to notice the problem).
140 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
141       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
142 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
143       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts 
144         between standard library (std) and vtk library (problems are found
145         under Windows... thanks Windows !)
146 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
147       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
148         debug stage).
149       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
150 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
151       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
152 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
153       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
154         called with different flags than the default ones (with automake).
155         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
156            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
157         and went for warning fixes:
158         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
159           up from unused variables.
160         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
161       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
162 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
163       * gdcmPython/gdcm.i:
164         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
165           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
166           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
167         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
168           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
169           exported to Python a as cvar.
170       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
171         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
172         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
173         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
174         C++ static methods).
175       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
176         with the above changes.
177 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
178       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
179 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
180       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
181         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
182         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
183          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
184          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
185            a wrapper
186          - Wrapper interface which wrap sources
187         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
188         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
189       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
190         files for compilation
191 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
192       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
193         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
194         - vtk/Makefile.am now builds a library
195         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
196           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
197           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
198           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
199           import library.
200         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
201           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
202           + vtk/vtkGdcmReader.so and
203           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
204           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
205         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
206           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
207         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
208           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
209       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
210       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
211         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
212         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
213         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
214         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
215         collision of various stl members (principally cout...).
216       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
217         file.
218       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
219          comply with above changes)
220 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
221       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
222       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
223         vtk data structure (an image Flip was required).
224       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
225       * cosmetic changes in documentation.
226 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
227       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
228         unexisting file is given as argument.
229       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
230         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
231         containing those images is now available at 
232           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
233         with the name gdcmData.
234         All the python scripts (including the package initialisation file
235         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
236         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
237 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
238       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
239         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
240         demo of the usage of this class.
241         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
242         at configure (or autogen.sh) stage.
243 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
244       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
245         Notes on valgrind:
246           - maximum info is obtained with a command of the form:
247             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
248                    --show-reachable=yes PrintHeader
249           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
250             allocation scheme through the usage of map and list. It looks 
251             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
252             (in fact further invocation to the STL would recollect the
253              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
254       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
255         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
256         Note: some images don't seem to work e.g.
257             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
258       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
259         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
260         make gdcm more thread friendly.
261 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
262       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
263           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
264         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
265           gdcmHeader::_dicom_vr.
266         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
267         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
268           VRHT*.
269         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
270 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
271       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
272         make install stage.
273 2003-04-9 JPR
274       * UpdateGroupLength replaced by new one
275 2003-04-7 JPR
276       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
277         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
278       
279 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
280       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
281       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
282       * src:
283         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
284         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
285           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
286         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
287           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
288           carried the same semantics.
289           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
290         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
291           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
292         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
293       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
294       * gdcmGetXSize added
295       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
296       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
297 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
298       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
299         (to avoid double call by end user).
300       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
301         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
302 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
303       * gdcm/Doc many doxygen changes:
304         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
305           the html.users end users oriented documentation and
306           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
307           oriented documentation.
308         - README changed accordingly
309         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
310         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
311           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
312         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
313           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying 
314           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
315       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
316         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
317       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
318         ill-formed documentation sections.
319       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
320 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
321       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
322       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
323         un*ces with sh-utils test utility.
324       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
325       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
326       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
327       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
328       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
329 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
330       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
331       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
332 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
333       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
334       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
335       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
336       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
337         compilation work.
338       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
339       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
340 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
341       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
342         hence the user doesn't need this explicit call.
343         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
344           i.e. LoadElements() call removed.
345       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
346         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
347       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
348         for adding user defined new tags.
349         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
350         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
351           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
352 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
353       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
354    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am, 
355    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
356    with the autotools, included the python wrappers part. 
357       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
358 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
359       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
360 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
361       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
362         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
363         for usage).
364       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
365         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
366         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
367       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
368         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
369 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
370       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
371         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
372         value of GDCM_DICT_PATH.
373       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
374 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
375       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
376       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
377       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
378         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
379         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
380 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
381       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
382         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
383         gdcmHeader.h
384       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
385         (as opposed to gdcm.h)
386       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
387       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
388         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
389       * autogen.sh removed history related references to crea package.
390 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
391       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
392         bug.
393 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
394       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
395         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
396         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
397         of hidding away the python related distutils specific files
398         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
399         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
400         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
401         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
402 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
403       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
404       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
405         among the list of sources.
406       
407 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
408       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
409       * modifications in MSVC projects
410 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
411       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
412         looks like we can move back to original usage of exception within
413         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
414         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
415       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
416         README file for usage added.
417       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
418         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
419         testing the proper parsing of a Dicom related file.
420         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
421       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
422       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
423         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
424           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
425           Dicom public dictionnary were not accessible without an
426           instance of class gdcmHeader.
427         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
428           require no instances at all to be invocated.
429         - within gdcmDictSet this change required to change some method
430           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
431           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
432       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
433         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
434       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
435         the above to be effective.
436       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
437         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
438       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
439         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
440         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
441         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
442         (for python dectection).
443       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
444         now avoids publishing the empty entries.
445 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
446       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
447         ExtraPath reused :-P
448       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
449 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
450       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
451       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
452       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
453         and links
454 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
455       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
456         method. Doxygenation.
457       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
458 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
459       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
460         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
461         when using "python setup.py install".
462       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
463         reexports the working classes.
464       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
465         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
466         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
467         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
468         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
469         subdir (see the README file). This problem probably due to
470         an combination of g++ and dynamic loading.
471       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
472 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
473       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
474         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
475         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
476         again in a python subdir, but the package itself is now in
477         python/gdcmPython.
478       * setup.py was cleaned up:
479         - pythonIncludePath removed
480         - python setup.py bdist target is now functional.
481       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
482         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
483         accordingly.
484 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
485       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
486       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
487         distutils installer is operational.
488       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
489           shadow classes (from gdcm.py).
490         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
491           instead of gdcmPython/demo/load.py.
492         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
493         
494 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
495       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
496         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
497         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
498         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
499         dictionary.
500         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
501           are now in the "???" group.
502         - python/gdcm.i changed accordingly,
503         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
504           of the above new functionalities in Python.
505 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
506       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
507         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
508           were definitively removed.
509         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
510       * src/gdcmElValSet.cxx:
511         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
512         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
513         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
514         - Added GetElementByName(string).
515       * src/gdcmHeader.cxx: added
516         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
517         - GetPubElValRepByName(string)
518         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
519         - GetShaElValRepByName(string)
520         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
521         - GetShaElValRepByName(string)
522         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
523         - GetElValRepByName(string)
524         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
525         - GetElValRepByName(string)
526       * Doc/requirements.txt added.
527 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
528       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
529       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
530         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of 
531         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
532         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
533       * python/testSuite.py changed accordingly.
534 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
535       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
536         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
537              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
538               cannot be exported. [...]
539               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
540               be exported. [...]
541               This is caused by a designed limitation that once a template
542               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
543               exported."
544         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
545         limitation" of VC++ is a pitfall.
546         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked 
547         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
548         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
549         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
550         library. 
551         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
552       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
553          dll under windows !!!!)
554       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
555       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
556         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
557       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set 
558         (one) of image(s).
559       * removed glib references
560       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
561 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
562       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
563         that only displays required tags and testAll.py that parses all
564         the files of the testsuite without using unittest.
565       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
566       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
567       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
568         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
569 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
570       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
571         values, but limits itself to values which are below a user specified
572         size (by default 1024 bytes).
573       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
574         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
575         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
576         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
577       * python/testSuite.py
578         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
579         - two new examples added.
580       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
581 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
582       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
583         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
584       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
585       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
586       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
587 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
588       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
589         the vr was also RET.
590       * python/testSuite.py more tests added.
591 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
592       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
593       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
594       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
595         7.18 Integer types (see stdint.h)
596         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
597       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
598         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
599         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
600         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
601         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
602         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
603         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
604         The rest of the changes we the necessary adaptations.
605 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
606       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
607         VR files.
608       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
609 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
610       * Adaptation for porting to VC++:
611         - src/gdcm.h
612           o forced to use std namespace (for string to be known)
613           o all class use __declspec export style on WIN32
614         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
615           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
616       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
617         variable GDCM_DICT_PATH.
618       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
619 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
620       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
621         to native Python dictionary.
622       * python/demo/test.py:
623         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
624         - takes an optional filename argument (the file to parse).
625       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
626         PubElVals hashing table. 
627       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
628 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
629       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
630         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
631       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
632       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
633       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
634         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
635       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
636 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
637       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
638         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
639         that we can import de shadow classes without errors].
640 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
641       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
642       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
643       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
644       * src/Makefile prepared for python wrapping
645 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
646       * src/gdcmHeader.cxx :
647         - Parsing of header is now separated from loading of element values
648           (see gdcmHeader::LoadElements).
649         - general clean up of hopefully all file access (creation of
650           ReadInt16 and ReadInt32)
651 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
652       * src/gdcmHeader.cxx :
653         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
654           method.
655         - SetLgrElem renamed to SetLength
656         - GetLgrElem renamed to GetLength
657         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
658       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
659       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
660         due to IdoDude was cleaned out.
661 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
662       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
663         concentrates on finding the value representation (when it exists).
664         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
665         returning the unecessary skL (skipped length).
666         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
667         it was redundant with the File position internals (by using
668         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
669         jajun.
670       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
671         on the libido specificities which are handled through class 
672         inheritance.
673       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
674         added. 
675 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
676       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
677         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
678 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
679       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
680 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
681       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
682         and _IdDcmSWAP_LONG.
683 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
684       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
685         May 23 2002. Needless to say we are running late...
686