]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
d1ced5d25ff7cc7b61603ec049e41a37a328992e
[gdcm.git] / ChangeLog
1 Thu Aug 25 16:59:49 2005 by jpr
2    gdcmBinEntry.cxx
3    Now Print displays the BinEntry Content (if it's printable, and loaded)
4    Usefull for a lot od Implicit VR 'Bin'Entry (if we knew there VR, they wouldn't
5    be Bin ...)
6    Appreciate the difference having a look at PrintFile result for
7    gdcmData/SIEMENS_MAGNETOM-12-MONO2-FileSeq0.dcm.
8
9 Thu Aug 25 16:55:47 2005 by jpr
10    gdcmUtil.cxx
11    Add methods to check the 'printability' of a bin area
12
13 Thu Aug 25 15:45:40 2005  by jpr
14   gdcmBinEntry.cxx 
15   According to Mathieu's suggestion, Print now display FL BinEntries in a human
16   readable form
17
18 Thu Aug 25 15:12:43 2005 by jpr
19    gdcmDocEntry.cxx
20    According to Mathieu's suggestion, *all* the elements 0x000
21    are now named 'Group Length' (even if they belong to a Shadow Group')
22
23 Wed Aug 24 14:09:13 2005 by jpr
24   gdcmDocEntry.cxx,h, gdcmDocEntrySet.cxx,h
25   Removal of QD patch for Private Sequence + Immplicit VR.
26    Add a clean solution (Backtracking if an Item Starter is found
27     out of any SQItem)
28
29 Tue Aug 23 14:57:49 2005 by jpr
30    gdcmDocument.cxx
31    Brutal patch, waiting till we find a clever way to guess
32    if a doc entry is a Sequence,
33         - when it's odd number
34                   - and the file is Implicit VR Transfert Syntax
35 It solves temporarily some Philips Medical Systems image problems
36
37 Mon Aug 22 18:17:54 200 by jpr
38    gdcmUtil.cxx
39    Save a *few* microseconds at run time : inline method Util::GetVersion()
40    ;-)
41
42 Tue Aug 23 14:58:49 2005 by jpr
43    gdcmSeqEntry.cxx, gdcmDocEntry.cxx
44    Improve 'Print' methods
45
46 Sat Aug 20 11:10:24 2005by jpr
47    TestWriteSimple.cxx
48    Use new style FileHelper contructor
49
50 Sat Aug 20 11:04:50 2005 by jpr
51    gdcmFileHelper.cxx
52    FileHelper::Initialize() doesn't call GrabInformationFromFile(),
53    in order not to do the job twice when using new style FileHelper Constructor.
54
55 Fri Aug 19 18:31:07 2005 by malaterre
56   gdcmCommon.h
57   ENH: Provide a GetVersion function, apparently need for python
58
59 Fri Aug 19 15:12:15 2005 by jpr
60    gdcmFileHelper.cxx
61    Initialize UserFunction pointer to 0, even for 'deprecated' form 
62         of constructor.
63
64 Sat Jul 30 20:27:00 2005 by jpr
65    gdcmFileHelper.cxx, gdcmPixelReadConvertor.cxx
66       User is now allowed to pass a Pointer to a function of his own
67       to allow modification of pixel order (i.e. : Mirror, TopDown, )
68       to gdcm::FileHeleper, using SetUserFunction(userSuppliedFunction)
69       described as : void userSuppliedFunction(uint8_t *im, gdcm::File *f);
70       NB : the "uint8_t *" type of first param is just for prototyping.
71         User will Cast it according what he founds with f->GetPixelType()
72         See ctkgdcmSerieViewer for an example
73
74 Sat Jul 30 20:13:24 2005 by jpr
75    gdcmSerieHelper.cxx
76    Add SerieHelper::IsCoherent() method to allow checking that the files with same
77    Serie UID have the same sizes and pixel type.
78         
79 Fri Jul 29 17:07:16 2005 by jpr
80    gdcmSerieHelper.cxx
81    User may now use
82       SetSortOrderToDirect() or SetSortOrderToReverse()
83    to choose the ways the File* will be sorted.
84
85 Thu Jul 21 06:55:50 2005 by jpr
86    AnonymizeDicomDir.cxx, AnomymizeNoLoad.cxx, PrintFile.cxx, PrintDicomDir.cxx
87    Unify user interface
88
89 Thu Jul 21 06:55:30 2005 by jpr
90    exSerieHelper.cxx
91    Add an example of use for SerieHelper
92
93 Thu Jul 21 07:00:15 2005 by jpr
94    gdcmSerieHelper.cxx
95    Extend 'Restriction' syntax :
96    void SerieHelper::AddRestriction(uint16_t group, uint16_t elem,
97                                     std::string const &value, int op)
98    op belongs to :
99    /// \brief comparaison operators
100    enum CompOperators {
101       GDCM_EQUAL = 0,
102       GDCM_DIFFERENT,
103       GDCM_GREATER,
104       GDCM_GREATEROREQUAL,
105       GDCM_LESS,
106       GDCM_LESSOREQUAL
107    };
108
109 Wed Jul 20 15:39:00 2005  by jpr
110    AnonymizeNoLoad.cxx
111    AnonymizeNoLoad user can now ask for anonymization of 'BinEntries'
112    (e.g. Private entries when the TS is Implict VR)
113    AnonymizeNoLoad filein=... rubout=0x0009-0x0001,0x0013-0x1100
114    Thx to Luca Picello for reporting pb and supplying data to fix the bug.
115
116 Wed Jul 20 16:49:41 2005 by jpr
117    gdcmFile.cxx
118    Use GDCM_LEGACY for DicomDir, as well
119
120 Wed Jul 20 15:31:01 2005 by jpr
121    gdcmFile.cxx
122    We can now anonymize 'BinEntries' as well
123
124 Wed Jul 20 15:29:42 2005 by jpr
125    gdcmArgMgr.cxx
126    Add ArgMgrGetXInt16Enum to decode from the command line pairs of unsigned int
127    16, written in hexadecimal.
128    (usefull to allow terminal user to pass the (private) elements he wants to
129    anonymize)
130
131 Tue Jul 19 17:25:53 2005  by jpr
132    gdcmFile.cxx
133    Add some comments on the 'Patient Position'
134
135 Tue Jul 19 11:04:58 2005 by jpr
136    gdcmSerieHelper.cxx
137    Add SerieHelper::AddGdcmFile(File *header) method.
138     * \brief add a gdcm::File to the first (and supposed to be unique) list
139     *        of the gdcm::SerieHelper.
140     * \warning : this method should be used by aware users only!
141     *            User is supposed to know the files he want to deal with
142     *           and consider them they belong to the same Serie
143     *           (even if their Serie UID is different)
144     *           user will probabely OrderFileList() this list (actually, ordering
145     *           user choosen gdm::File is the sole interest of this method)
146     *           Moreover, using vtkGdcmReader::SetCoherentFileList() will avoid
147     *           vtkGdcmReader parsing twice the same files.
148     *           *no* coherence check is performed, but those specified
149     *           by SerieHelper::AddRestriction()
150
151 Mon Jul 18 12:20:20 2005 by jpr
152    gdcmCommon.cxx
153    In order to prepare the future extension of SerieHelper::AddRestriction (key,
154    string, operator)
155    operator = { EQUAL, DIFFERENT, LESS, LESSOREQUAL, GREATER, GREATEROOREQUAL}
156    add method
157    bool Util::CompareDicomString(const std::string &s1, const char *s2, int op)
158
159 Sun Jul 17 06:27:49 2005 by jpr
160    gdcmSerieHelper.cxx
161    Use new style for Loading files
162
163 Tue Jul 12 19:08:12 2005 by jpr
164    gdcmCommon.cxx, gdcmSQItem.cxx
165    To speed up DicomDir, instead of copying -and removing the source afterwards-
166    each entry of the SQItem (found after gdcm::Document parsing) towards
167    the gdcm::Object  belonging to the gdcm::DicomDir, we just copy
168    the chained list itself.
169
170 Tue Jul 12 16:55:43 2005 by jpr
171    AnonymizeNoLoad.cxx
172    AnonymizeNoLoad has now one more option :
173    dirin=
174    to give the (single Patient) directory name whose content we want to anonymize.
175
176 Mon Jul 11 10:20:25 2005 by jpr
177    gdcmDicomDirStudy.cxx
178    Reorder methods
179
180 Fri Jul 8 21:07:12 2005 by jpr
181    gdcmDicomDir...
182    Add the VISIT object within DicomDir
183
184 Fri Jul 8 12:15:08 2005 by jpr
185    gdcmDicomDir...
186    Use new style for DicomDir loading
187
188 Fri Jul 8 16:36:48 2005 by jpr
189    gdcmFileHelper.cxx
190    To remain unimpared, gdcm::FileHelper class needs also its
191    void FileHelper::SetLoadMode(int loadMode)
192    void FileHelper::SetFileName(std::string const &fileName)
193    bool FileHelper::Load()
194
195 Thu Jul 7 19:31:53 2005 by jpr
196    Example/*.cxx
197    Begin of kosherization of Example
198    New 'gdcm2' style.
199
200 Thu Jul 7 18:37:40 2005 by jpr
201    gdcmDocument.cxx
202    On the way to gdcm2 ...
203    Now, the stand way to use a file is :
204    gdcm::File *f = new gdcm::File();
205    f->SetLoadMode ( user say here what he wants *not* to load );
206    f->SetFileName("myFile.gdcm");
207    f->Load();
208    Old styles are kept, not to break the C++ API.
209       - gdcm::File *f = new gdcm::File("myFile.gdcm");
210       - f->Load("myFile.gdcm");
211    Due to the syntaxic abilities of Python maybe some troubles will occur
212    (not sure ...)
213
214 Thu Jul 7 15:55:39 2005 by jpr
215   gdcmDocument.cxx
216   Comment out the time consuming, never used/useless
217   'Extended tag' stuff for Sequence embedded Entries
218
219 Thu Jul 7 15:11:38 2005 by jpr
220   gdcmDocument.cxx
221   Move code lines LTTG so save some CPU time.
222   (hope so)
223
224 Tue Jun 7 13:12:10 2005 CEST by jpr
225    Example/*.cxx
226    Use Argument Manager in 'utilities'
227
228 Thu Jul 7 12:12:32 2005 by jpr
229    gdcmFile.cxx
230    Due to something stupid in the gdcm::File constructor, the file was parsed 
231    twice when we used old style, e.g :
232    gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);
233    instead of new style, e.g. :
234    gdcm::File *f = new gdcm::File( );
235    f->SetLoadMode ( choose what you want *not* to load here );
236    f->Load( filename );
237
238 Wed Jul 6 11:53:43 2005 by jpr
239    TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx
240    Now TestAllReadCompareDicom.cxx TestReadWriteReadCompare.cxx accept a third
241    param, in order not to have to recompile to gdcm::Debug::DebugOn().
242
243 Wed Jul 6 17:18:42 2005 by jpr
244    gdcmDocument.cxx
245    According to Mathieu's requirement, Load twice the same file keeps the rseult of
246    the first Load (instead of doing it twice)
247
248 Wed Jul 6 11:25:12 2005 by jpr
249    gdcmDocument.cxx
250    - Clean out the Entries if a Document is parsed more than once
251    - Uncomment (usefull) warning messages
252
253 Wed Jul 6 10:42:33 2005 by jpr
254    gdcmDocument.cxx
255    - Comment out a for the moment too much verbose warning message.
256    - Delay some statement as late as possible, to save some CPU time when they're
257      useless
258   
259 Wed Jul 6 13:01:08 2005 by jpr
260    gdcmFile.cxx
261    Now gdcmFile::Load() returns false if file is not gdcm parsable
262    Only gdcmDocument::Load() did it, before.
263    Thx to Benoit for reporting bug
264
265 Sun Jul 3 14:42:04 2005 by jpr
266    gdcmDocument.cxx
267    Should avoid some troubles with 'no length' SQItems within 'true length'
268    Sequences.
269    Thx to Loic Boussel for providing data to fix the bug.
270
271 Sun Jul 3 14:42:04 2005 by jpr
272    gdcmDocument.cxx
273    Should avoid some troubles with 'no length' SQItems within 'true length'
274    Sequences.
275    Thx to Loic Boussel for providing data to fix the bug.
276
277 Sun Jul 3 14:47:23 2005 by jpr 
278    gdcmSQItem.cxx
279    Enh warning message
280
281 Fri Jul 1 13:25:51 2005 by jpr
282    gdcmPixelReadConvert.cxx
283    Initialize RLEInfo and JPEGInfo to 0 a avoid further problems
284    (e.g. PrintFile on a DICOMDIR document)
285
286 Thu Jun 30 16:49:02 2005 by jpr
287    gdcmFile.cxx
288    Enhance gdcm::File::IsReable() heuristics to be able to process some Loic
289    Boussel's Hall of Shame Dicom images
290
291 Wed Jun 29 17:58:33 2005 by jpr
292    gdcmDocument.cxx
293    Add the NO_SHADOWSEQ load mode
294
295 2005-06-26 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
296     * Quite a few new dictionaries were added in gdcm. The file:
297       gdcm/Dict/README should always explain were the info was found
298       (in case of double check). Also some dict are still only
299       express as 'template' (they contain 'xx'), therefore
300       a python script should be run first to generate a full dict.
301       In the longer term this python script should be replaced by
302       a cmake script.
303
304 2005-06-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
305    * dicomV3.dic is deprecated in favor of gdcm.dic
306      There is now a dictionary per family:
307      - dicomV3.dic -> DICOM V3
308      - Papyrus.dic -> Papyrus
309      - NIH.dic     -> tags that were never allowed in the main standard
310
311 Fri Jun 24 12:50:20 2005 CEST by jpr
312    gdcmFile.cxx
313    Pixel Spacing related problems : update comments.
314    Thx to D. Clunie for providing data to check the code
315
316 Fri Jun 24 12:55:58 2005 by jpr
317    Summer nights are really too hot to sleep.
318    Coding style : kosherization of all the 'if's (300 amongst 900 were haram)
319
320 Thu Jun 23 11:20:23 2005 by jpr
321    gdcmDocument.cxx
322    Extend warning message, for debugging purpose
323
324 Wed Jun 22 10:11:23 2005 by jpr
325    gdcmFile.cxx
326    Coding Style
327
328 Wed Jun 22 10:00:29 2005  by jpr
329    gdcmPixelReadConvert.cxx
330    Fix misstyping, while removing spurious \t characters
331
332 Wed Jun 22 09:52:32 2005 by jpr
333    gdcmPixelReadConvert.cxx
334    Some constructors (at least one ...) use BitsAllocated =! BitsStored for
335    negative Pixels.
336    That break at lot of viewers ...
337    We now *propagate the sign bit* upon the unused ones, better than masking them
338    out.
339    Thx to Luca Picello for profiding data to fix the bug
340
341 Wed Jun 22 09:53:52 2005 by jpr
342    gdcmFileHelper.cxx
343    gdcm images are now "GDCM 1.1" built.
344
345 Mon Jun 20 19:10:17 2005 by jpr
346    gdcmFileHelper.cxx
347    Avoid re writing Palette Color Lookup Table UID when Palette Color is removed
348
349 Mon Jun 20 17:58:53 2005 by jpr
350    gdcmDocument.cxx
351    Preventive bug fix for LUT Data.
352    I said : LUT Date, *not* Palette Color
353
354 Sun Jun 19 17:57:29 2005 by jpr
355    gdcmDocumentcxx
356    To avoid warnings at compile time
357
358 Fri Jun 17 14:27:52 2005 by jpr
359    gdcmRLEFrames.cxx
360    Try to solve RLE pb
361
362 Fri Jun 17 14:36:07 2005 by jpr
363    gdcmDocument.cxx
364    Add comments
365
366 Fri Jun 17 14:35:00 2005 by jpr
367    gdcmFileHelper.cxx
368    Add some accessors for debugging purpose
369
370 Tue Jun 14 15:56:41 2005 by jpr
371    gdcmPixelReadConvert.cxx
372    Now gdcm deals with 16 bits per pixel images with 16 bits Palette colors
373    (3 * 65536 short int ...)
374    Nice fat header.
375    "Segmented Palettes" pb still pending, but I never saw any viewer dealing with it.
376
377 Mon Jun 13 17:43:48 2005 by jpr
378    gdcmPixelReadConvert.cxx
379    Some more oddities dealt with.
380    Doesn't work yet with 65536 entries 16 Bits LUT (?!?), with 16 bits pixels.
381    Still looking for accurate info on the web about it
382
383 Fri Jun 10 16:05:38 2005 by jpr
384    gdcmDocument.cxx
385    Bug fix in Load method.
386    Thx to Benoit for providing fix.
387 2005-06-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
388    * src/gdcmUtil.cxx : change call to Util::Format to sprintf because of 
389      lantency with the Util::Format function
390
391 Tue Jun 7 15:48:35 2005 by jpr
392    gdcmUtil.cxx
393    The highy time consuming method GetMacAdress is now called just once
394
395 Tue Jun 7 11:58:29 2005 by jpr
396    gdcmDicomDirElement.cxx
397    Use TranslateToKey better than Format
398
399 Tue Jun 7 12:07:20 by jpr
400    gdcmDictEntry.cxx
401    Remove some spurious calls to Format
402    // according to 'Purify', TranslateToKey is one of the most
403    // time consuming methods.
404    // Let's try to shorten it !
405
406 Mon Jun 6 14:37:58 2005
407    class ArgMgr (for Arguments Manager) is designed for
408        command line arguments management
409        (to make programmer's live easier)
410        (could be used for any kind of 'command line program')
411
412 2005-06-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
413    * Adding users file in CVSROOT for mail blaming 
414
415 2005-06-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
416    * Adding potential support for JPEG-LS DICOM files.
417
418 Fri Jun 3 18:05:23 2005 by jpr
419    gdcmDocument.cxx
420    Fix VR processing, to be CP-288 conform.
421    Now we can parse any kind of DICOM SR.
422
423 Fri Jun 3 11:05:15 2005 by jpr
424    gdcmDocument.h
425    Doxygenation
426
427 Thu Jun 2 15:42:18 2005 by jpr
428   gdcmDocument.cxx
429    Add warning about Load Mode
430
431 Thu Jun 2 16:20:14 2005 by jpr
432    gdcmFile.cxx
433    Harden gdcm::File::IsReadable(), in order not to be confused any longer
434    by lost of Pixel Element
435
436 Fri May 27 12:51:00 2005 by jpr
437    gdcmFileHelper.cxx
438    To avoid pushing out twice the meta elements, wile trying to write 'ACR-NEMA-
439    style.
440    And avoid some memry leaks -hope so-
441
442 Wed May 25 14:54:17 2005 by jpr
443    gdcmDocument.cxx
444    Should avoid some memory leaks
445
446 2005-05-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
447    * Adding potential support for mpeg and jpeg2000 through two new lin
448     - JasPer for JPEG2000
449     - libmpeg2 from the MPEG consortium
450     Also adding intial work to use this lib.
451
452 Fri May 20 10:27:55 2005 by jpr
453    gdcmFileHelper.cxx
454    To avoid warning.
455    (this time, it's wasn't dangerous at run time)
456
457 Thu May 19 17:31:21 2005 by jpr
458    gdcmFileHelper.cxx
459    FIX possible troubles when checking
460      'Hight Bit Position' vs 'Bits Allocated' and 'Bits Stored'
461    Thx to Mathieu for reporting bug
462
463 Wed May 18 12:12:07 2005 by jpr
464    gdcmDocument.cxx
465    Fix : now dcm deals with 'No preamble', Big Endian Explicit VR group 0002.
466    Thx to Dennis Hu for providing a sample image to fix the bug.
467
468 Tue May 17 14:44:09 2005 by jpr
469    gdcmFile.cxx
470    ENH : According to David Clunie's advice, we check now 'Imager Pixel Spacing'
471       before 'Pixel Spacing', when we want to get X or Y Spacing.
472
473 Tue May 17 19:10:49 2005 by jpr
474    gdcmFileHelper.cxx
475    ENH : Now, FileHelper::CheckMandatoryElements() makes some consistency checking,
476          at LTTG (Least Time To Go)
477          around Bits Allocated, Bits Stored, High Bit Position,
478          to avoid unaware user to mess up the stuff.
479
480 Tue May 3 11:43:04 2005 by jpr
481    gdcmDicomDir.h, .cxx
482    Load returns now a bool (allow user not to call IsReadable() )
483
484 Tue May 3 11:51:06 2005by jpr
485    gdcmFileHelper.cxx
486    Now the gdcm::File remains unimpaired after writting, in any case
487
488 Fri Apr 29 17:10:55 2005by jpr
489    gdcmDocument.cxx
490    Don't abort the prog when File not open
491
492 Wed Apr 27 12:00:35 2005 by jpr
493    gdcmFile.cxx
494    Removal of now useless lut-related stuff
495
496 Wed Apr 27 11:52:27 2005 by jpr
497    gdcmFile.cxx
498    Pb of 'Bits Allocated = 12' is now dealt with in
499    FileHelper::CheckMandatoryElements, no longer in File::Write.
500    Thx to Mathieu for reporting bug.
501
502 2005-04-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
503    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : update the test printed results and
504      description.
505
506 Tue Apr 26 18:18:23 2005 by jpr
507    gdcmDocument.cxx
508    Should leave gdcm::Document constructor in a much quicker
509    and much cleaner way when anything wrong occurs.
510
511 Tue Apr 26 18:25:49 2005 by jpr
512    gdcmPixelReadConvert.cxx
513    Prepare MPEG Dicom encapsulated processing (within a loooong future)
514
515 Fri Apr 22 14:59:58 2005 by jpr
516    gdcmDocument.cxx
517    Modify Print() output
518
519 Fri Apr 22 15:37:57 2005  by jpr
520    gdcmTS.cxx
521    Prepare (future) MPEG integration
522
523 Thu Apr 21 09:40:00 2005 by jpr
524    gdcmTS.cxx
525    Taking into account Dicom MPEG
526
527 2005-04-20 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
528    * FIX : Numerical exception on borland (cannot divide by 0, doh !)
529          But this is a case where we should really signify the user there is
530          few chance the serie is really a serie...
531
532 2005-04-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
533    * FIX : on X, the python part is correctly installed. All files are
534      installed in gdcm sub-directory
535
536 Tue Apr 19 11:58:19 2005 by jpr
537    gdcmDocEntry
538    Should suppress some warnings from Borland compiler
539
540 2005-04-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
541    * Builder/ : add something to facilitate the RPM creation of gdcm
542
543 2005-04-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
544    * Fix gdcmDirList::IsDirectory. Apparently borland did not like the ending
545      '/'
546    * Also fix compilation on gcc 3.3.5 does not have ios::failure either ...
547
548 Thu Apr 14 16:26:19 2005 by jpr
549    gdcmDicomDir.h, .cxx
550    Now, user can ask gdcm::DicomDir to skip SeqEntries or shadow groups, when
551    possible :
552      // Old style (still available) :
553      dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);
554
555     // new style (user is allowed no to load Sequences an/or Shadow Groups)
556     dcmdir = new gdcm::DicomDir( );
557     dcmdir->SetParseDir(true);
558     dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);
559     dcmdir->Load(dirName);
560
561 2005-04-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
562    * vtk/vtkGdcmWriter fix bug when writing spacing. The Y spacing comes first
563      then the X spacing.
564     * Fix compilation on gcc 2.96 (which does not have ios::failure)
565
566 Mon Apr 4 17:15:24 2005 by jpr
567    gdcmFileHelper.cxx
568    Fix stupid bug when writting ACR-NEMA image from 'ACR-LibIDO' one.
569
570 2005-04-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
571    * src/gdcmDictGroupName.[h|cxx] : add a correlation between a group (number)
572      and it's representation name (for the NIH)
573
574 2005-03-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
575    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : problems of around of double to uint8, when
576      conversion of YBR to RGB pixels. So, now, the conversion is made using 
577      integers only
578
579 2005-03-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
580    * Testing/TestAllReadCompareDicom.cxx : now use test files (invented file
581      format) to replace 'at-run' dicom files generated by the 
582      TestAllReadCompareDicom test
583
584 Tue Mar 22 12:29:37 2005 by jpr
585    gdcmDocument.cxx
586    * FIX : element 0x0000 of shadow groups is now force to a ValEntry, 
587      and it's VR is forced to UL
588    * ENH : user id now allowed to tell he doesn't want to deal with Sequences
589       and/or with Shadow groups
590       use SetLoadMode (NO_SEQ | NO-SHADOW);
591
592 Tue Mar 22 12:40:13 2005 by jpr
593    gdcmFileHelper.cxx
594    *FIX Restore pushed out elements
595
596 Fri Mar 11 12:08:31 2005 by jpr
597    gdcmDocEntry.cxx
598    Remove spurious #define MAX_SIZE_PRINT_ELEMENT_VALUE
599
600 Fri Mar 11 12:12:13 2005 by jpr
601    gdcmFile.cxx
602    Final removal of gdcmFileHelper::InitializeDefaultFile();
603
604 Wed Mar 9 20:29:38 2005 by jpr
605    gdcmDicomDir.h, .cxx
606    Add Anonymize method (not yet fully checked)
607
608 2005-03-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
609    * src/gdcmFileHelper.cxx : remove memory leaks and bugs when writing files
610
611 Wed Mar 2 18:18:32 2005by jpr
612    gdcmFile.cxx
613    Fix gdcm::FileHelper::CheckMandatoryElements() to take into account David
614    Clunie's remarks.
615
616 2005-02-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
617    * src/gdcmFileHelper.cxx : JPR bad personal choices fix
618
619 Mon Feb 21 18:45:41 2005 by jpr
620    gdcmFileHelper.cxx
621    * Replace method CheckMetaElements by CheckManadatoryElements
622      To deal with the pb of UID's, and with Type 1 an Type 2 Entries
623      (probabely some stuff still missing)
624    * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Serie UID
625       between a given call and the next one (to add images to a Serie he just
626       created)
627   * We shall have to decide the way we proceed to allow user 'freeze' Study UID
628       between a given call and the next one, or to reuse an already existing
629       Study UID (i he wants to add his own Series to an already existing Study)
630
631 Thu Feb 17 17:18:33 2005 by jpr
632    gdcmFile.cxx
633    To avoid further pb, Initialize defaults now Photochromatic Interpretation to
634    MONOCHROME2 (low values = dark), better than MONOCHRONE1.
635    Thx to Benoit for reporting bug
636
637 Thu Feb 17 11:56:20 2005 by jpr
638    gdcmUtil.cxx
639    Prepare FileMetaInformationVersion (group 0002) management
640
641 Thu Feb 17 12:02:47 2005 by jpr
642    gdcmFile.cxx
643    Group 0002 management
644
645 Thu Feb 17 12:03:32 2005 by jpr
646    gdcmDocEntryArchive.cxx
647    Fix comments
648
649 Wed Feb 16 11:19:19 2005 CET by jpr
650    gdcmPixelReadConvert.cxx
651    Taking into account MONOCHROME1 + Signed Pixels (?!)
652
653 Tue Feb 15 19:12:34 2005  by jpr
654    gdcmFile.cxx
655    Taking into account the difference between MONOCHROME1 (low values = bright)
656    and MONOCHROME2 (low values = dark)
657
658 Mon Feb 14 11:45:04 2005by jpr
659    gdcmDocument.cxx
660    Remove some useless mask operations, to save CPU time
661
662 Mon Feb 14 15:51:10 2005 by jpr
663    gdcmUtil.cxx
664    *never* forget to re-compile just *before* committing!
665
666 Mon Feb 14 15:34:27 2005 by jpr
667    gdcmUtil.cxx
668    First commit on the post 1.0 (Version? / Tag? / Branch?) :
669    Fix Doxygen warnings
670
671 Mon Feb 14 11:45:47 2005 by jpr
672    gdcmValEntry.cxx
673    remove useless comments
674
675 2005-02-11 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
676    * Testing/TestMAkeIcon.cxx : complete the test
677
678 2005-02-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
679    * Testing/TestWriteSimple.cxx, TestSequence.cxx : fix memory leaks
680
681 Fri Feb 11 16:22:18 2005 by jpr
682    gdcmDocEntrySet.cxx
683    Typo, comments, doxygenation
684
685 Thu Feb 10 11:55:26 2005 by jpr
686    gdcmFile.cxx
687    AnonymizeNoLoad improvement
688
689 Thu Feb 10 10:07:19 2005 by jpr
690    gdcmFile.cxx
691    Duplicate Matthieu's hack to prevent bombing in Anonymize
692
693 Thu Feb 10 12:20:34 2005by jpr
694    gdcmDocEntrySrt.cxx
695    The following gdcm::DocEntrySet methods, no re-definable is child classes are no
696    longer virtual
697     virtual ValEntry *GetValEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
698     virtual BinEntry *GetBinEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
699     virtual SeqEntry *GetSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
700     virtual bool SetValEntry(std::string const &content,
701     virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth,
702     virtual bool SetValEntry(std::string const &content, ValEntry *entry);
703     virtual bool SetBinEntry(uint8_t *content, int lgth, BinEntry *entry);
704     virtual ValEntry *InsertValEntry(std::string const &value,
705     virtual BinEntry *InsertBinEntry(uint8_t *binArea, int lgth,
706     virtual SeqEntry *InsertSeqEntry(uint16_t group, uint16_t elem);
707
708 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
709    * src/gdcmFileHelper.[h|cxx] : now correctly set the VR of the datas when 
710      writting the file
711
712 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
713    * Test/VTKTestWriteSeq.cxx : add a VTK test to write sequences
714
715 2005-02-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
716    * Test/ : accelerate tests (it's not very significant accelerations).
717      Remove TestCopyDicom that is redundant with TestCopyRescaleDicom
718
719 Mon Feb 7 15:48:34 2005 by jpr
720    gdcmDicomDir.h, .cxx
721    Add some commented out lines to prepare future version of 'Full DICOMDIR' stuff
722
723
724 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
725    * Testing/TestSequence.cxx : add test for sequences of images... test that
726      we have the same serie or the same study UID
727
728 2005-02-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
729    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Now string are correctly converted in python
730      string type
731    * src/gdcmDict.h : remove commented code
732    * src/gdcmDocument.cxx : initialize values
733    * src/gdcmFile.cxx : bug fix when reading values
734    * gdcmPython/demo/ : change file names. Remove useless files
735
736 Sun Feb 6 15:31:09 2005 by jpr
737    gdcmDicomDirStudy.h
738    Update comments for DicomDir stuff
739
740 Sun Feb 6 15:39:35 2005 by jpr
741    gdcmDocument.cxx
742    * Add method File::AnonymizeNoLoad, to allow anomymizing files
743            even when the pixels are not gdcm Readable
744     * Add methods File::AddAnonymizeElement and File::ClearAnonymizeList
745             to allow user to choose the elements whose value
746             he wants to white out / replace
747
748 2005-02-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
749    * src/gdcmFile.cxx : remove the default array of initialization.
750      The static array contained pointers to non-static values (comming from
751      strings). To have coherences, when creating files, these values can't be
752      static. So, the array can't be static, too ! To simplify, the array have
753      been replaced by repeted lines to insert values in the File
754
755 Fri Feb 4 15:49:01 2005 by jpr
756    gdcmDocEntry.cxx
757    * Add GetFirstValEntry + GetNextValEntry, for Python users
758    * Some more Doxygenation + typo fixing
759
760 2005-02-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
761    * src/gdcmBinEntry.cxx : bug fix for BIG_ENDIAN part when writing the content
762    * gdcmPython/gdcm.i : rename gdcmHeader to gdcmHelper
763
764 Thu Feb 3 18:12:46 2005 by jpr
765    gdcmPixelReadConvert.cxx
766    Fix Doxygen warning
767
768 2005-02-02 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
769    * FIX SQItem::AddEntry inserts now *in the right place* any Entry
770               (Dicom Element) into the Sequence Item
771
772 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
773    * src/*.cxx : first parss to normalize file organisation
774
775 2005-01-31 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
776    * src/gdcmDirList.[h|cxx] : add method to find a directory
777    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : bug fix under Windows
778
779 2005-01-31 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
780    * Finish cleaning up my JPEG mess. Should be ok now.
781    * Getting toward a RLE very similar to JPEG. Every RLE stuff is now self
782       contained within the RLE* class(doh!)
783
784 2005-01-30 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
785    * SerieHeader::SetDirectory() allow recursive exploration of the Directory
786    * SerieHeader::AddFileName() creates as many Coherent Files lists 
787              (same Serie UID) as it founds different Serie UID 
788               amongst the files instead of discarting any file 
789              that doesn't match with the first one he found.
790     * SerieHeader::OrderGdcmFileList has now one parameter : 
791                the Coherent Files list the user wants to sort
792    * SerieHeader::GetFirstCoherentFileList()  |
793    * SerieHeader::GetLastCoherentFileList()   | allow to parse 
794                the set of Coherent Files lists 
795    * const SerieHeader::GdcmFileList &GetGdcmFileList() is kept, for backwards
796                compatibility (it returns the *first* Coherent Files list, 
797                since there was only one before)
798    * Test/TestSerieHeader gets gdcmData as a default root directory
799   
800 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
801    * Remove friend between DocEntry and File classes
802    * Remove friend between PixelReadConverter and RLEFramesInfo, 
803      JPEGFragmentsInfo
804
805 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
806    * src/gdcmFile.cxx, gdcmDocument.cxx : fix the bug on the group|element
807      0002|0000. The value was incorrect.
808
809 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
810    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the gestion of UID
811
812 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
813    * src/gdcmUtil.cxx : compilation fix on Win32
814    * src/gdcmUtil.[h|cxx] : Set the default GDCM UID in a static constant
815      variable, to be easy found. Add methods to change the default UID.
816      Amelioration of the CreateUniqueUID to use the correct default UID.
817    * src/gdcmFile.cxx : correct use of the CreateUniqueUID method to create
818      a new file
819
820 2005-01-28 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
821    * Test/TestVR.cxx : fix memory leaks
822
823 2005-01-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
824    * Rewrite the base 256 to base 10 conversion, using string operation only.
825      This allows us to get rid of the problematic 64bits integer type (does not
826      always exist on target platform).
827
828 2005-01-27 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
829    * Add construct and destructor to class gdcm::Debug to close the debug file
830           automatically
831    * Don't let uset to open twice the same file
832    * gdcm has now an official UID prefix,
833           supplied by http://www.medicalconnections.co.uk
834           1.2.826.0.1.3680043.2.1143
835           (Thx to Mathieu for providing URL)
836    * Add a forty-entries private Dicom Dictionary (Philips MR Intera)
837          to be able to perform some more tests
838    * gdcm::ContentEntry : Contructors and Destructor are now protected,
839          in order to be sure no user will try to use them.
840          (at user level, only the children classes are meaningfull)
841
842 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
843    * move RLEInfo & JPEGInfo from Document to File
844
845 2005-01-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
846    * FIX : remove so many friend between classes
847
848 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
849    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : Bug fix when getting the value
850    * src/gdcmContentEntry.[h|cxx], gdcmValEntry.cxx : amelioration of code
851
852 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
853    In order to avoid missbehaviour :
854    . gdcm::DocEntry is now specialized in
855      - gdcm::SeqEntry (Dicom Sequence) as opposed to :
856      - gdcm::ContentEntry (Dicom entry with a 'content')
857    . gdcm::ContentEntry is specialized in
858      - gdcm::ValEntry (Dicom entry with a std::string representable value, i.e.
859        characters value, or integers)
860      - gdcm::BinEntry (Dicom entry with a non strig representable value
861    (user hasn't any longer to thing about the precedence of his dynamic_casts)
862
863 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
864    * Test/VTKTest*.cxx : bug fix under linux
865
866 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
867    * src/ : rename some methods on Entry (SetXxx, InsertXxx) to have a better
868      use with python. Some methods are moved from Document to ElementSet or
869      DocEntrySet. The equivalent methods to ElementSet have been added to 
870      SQItem and are virtual in DocEntrySet. Methods that may have the same code
871      in SQItem and ElementSet is directly placed in DocEntrySet
872
873 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
874    * Test/VTKTest*.cxx : remove the show variable in each test method because
875      it's useless (the viewer variable replace this variable)
876
877 2005-01-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
878    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix on potential memory leak
879    * src/gdcmSQItem.cxx : initialize the SQItemNumber value in the constructor
880    * src/gdcmSQItem.[h|cxx], gdcmElementSet.[h|cxx], gdcmDicomDir*.[h|cxx] : 
881      Add ClearXxx methods to remove all the content of the list or map
882    * gdcmDocEntrySet.h : add GetFirst/NextEntry in pure virtual
883
884 2005-01-25 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
885    * methods ReplaceOrCreate renamed as Insert
886      (nobody will be any longer confused by 'CreateOrReplace')
887   
888 2005-01-24 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
889    * Grealty simplify the JPEg decompression, no need to differenciate based on 
890      the JPEG possible type (with/without fragment, with/without multiple frame). 
891      Everything is done throught the JPEG IO Suspension mechanism in IJG
892
893 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
894    * Stage 3 of normalization :
895      in order to avoid any missunderstanding while reading method names :
896      - All the methods xxxEntry now deal with dicom Entries
897      - Methods GetEntry splitted into
898         GetEntryValue
899         GetEntryBinArea
900      - Method SetEntry renamed as SetEntryValue
901      - Method SetEntryBinArea let as it was
902
903 2005-01-24 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
904     - Add empty nutshell for JPEG-LS (JPG-LS in NOT jpeg 'lossless')
905     - Position correctly the entry points for JPEG2000 and JPEG-LS
906       (Now Fragments info is get from the file, even for JPEG2000 and JPEG-LS)
907
908 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
909    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDict.h : rename AddNewXxx methods to AddXxx.
910    * src/gdcmDict.h : rename GetDictEntry moethod to GetEntry, to be coherent 
911      with other method names
912    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix. Add the typemaps for the TagName type
913    * Test/TestDicomDirElement.cxx : add new test
914
915 2005-01-22 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
916    * Finish the CreateUniqueUID stuff. Seems to compiled/runs on every
917      plateforms ITK support. Had some troubles with uint64_t on Win32, go to
918      http://msdn.microsoft.com/library/default.asp?url=/library/en-us/vclang/html/_langref_data_type_ranges.asp
919      for more info. Basically you can not used 'unsigned' __int8 in an ostream.
920      So can't you use __int64 in ostream at all.
921
922 2005-01-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
923    * bug fix for compilation on MSVC6
924    * gdcmPython/gdcm.i : rename of classes missed
925
926 2005-01-21 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
927    * Stage 2 of names normalization :
928      - A gdcm::Document is now either a gdcm::DicomDir or a gdcm::File
929        (easy to understand ...)
930      - gdcm::FileHelper replaces old class gdcm::File
931
932 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
933    * gdcmDicomDirElement.[h|cxx] : change the AddEntry method. Now, it gets a
934      type and not a string. So, there remove problems on the format of the
935      string.
936
937 2005-01-20 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
938    * Add Example/TestPapyrus.cxx
939      - reads a Papyrus file (gdcm::Header compliant),
940      - gets the pixels of all the images, using low level iterators
941      - writes an multiframes Dicom image.
942    (Just to show it's *possible* to do that)
943     Uses SQItems accessors (we could use it as a 'Test' program, to improve test
944     coverage ...)
945
946 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
947    * src/gdcmDicomDirObject.h : set the FillObject method in protected.
948      Thus, DicomDirXXX are created with a flad that indicates if the created
949      object is empty or not (when not empty, the DicomDirElement is used to
950      fill the object)
951
952 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
953    * src/gdcmDicomDir.cxx : simplify the NewPatient method, like made in
954      gdcm::DicomDirPatient, gdcm::DicomDirStudy, gdcm::DicomDirSerie
955
956 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
957    * src/gdcmSQItem[h|cxx] : rename some methods to have coherent names
958
959 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
960    * src/gdcmDicomDir*.[h|cxx] : rename methods to be logik in their name.
961      Remove all access to the hash-tables or lists in the objects.
962
963 2005-01-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
964    * src/gdcmDebug.h : remove the Debug test in the gdcmErrorMacro
965    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : rename the Initialise method to Initialize, to
966      be complient with all the gdcm source code
967
968 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
969    * src/gdcmDocEntry.h : DocEntry is now secure. User can't change the
970      DictEntry or the VR.
971
972 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
973    * gdcmPython/ : change GDCM_DATA_PATH to GDCM_DATA_ROOT to be complient with
974      all in gdcm
975
976 2005-01-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
977    * Test/ : rename VTK tests to have a best name for the tests
978    * gdcmPython/demo/*.py.in : Change the InitTraversal/GetNextEntry use to
979      GetFirstEntry/GetNextEntry use
980
981 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
982    * In SerieHeader::ImagePositionPatientOrdering()
983      // a Dicom 'Serie' may contain scout views
984      // and images may have differents directions.
985      // -> More than one may have the same 'pos'
986      // Sorting has then NO meaning !
987      Thx to Eduardo Davila for reporting bug.
988
989 2005-01-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
990    * Test/ShowDicom.cxx, ShowDicomSeq.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : change the
991      test. Now it's on image content and not on the resulting visualisation...
992      might solve the problem on linux when using the OpenGL drivers
993
994 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
995    * ENH for DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, 
996              DicomDirSerie, DicomDirImage
997              Dict, DictSet classes :
998          -add method GetFirstEntry to replace call to InitTraversal+GetNextEntry
999          -remove InitTraversal method.
1000    * UPD Test programs + Example programs
1001
1002 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1003    * remove useless and never updated keyword \ingroup         
1004    * Solve pb when structure (list, map, ...) is empty.
1005      Thx to Benoit for reporting bug
1006
1007 2005-01-18 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1008    * Taking into account of 'Transfer Syntax' value
1009        (for 'true' Dicom V3 files, the 'ACR-NEMA' heuristics sometimes gives
1010          unaccurate result)
1011
1012 2005-01-17 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1013    * src/gdcmUtil.cxx : bug fix to find the Windows MAC address. Now, there
1014      is no memory access violation
1015    * gdcmPython/demo : add python demos using VTK
1016
1017 2005-01-16 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1018     * FIX 'Dictionnary' is now spelt 'Dictionary'
1019           'wether' is now spelt 'whether'
1020           'archieve' is now spelt 'archive'   ;-)
1021
1022 2005-01-15 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1023     * ADD DicomDir, DicomDirPatient, DicomDirStudy, DicomDirSerie, DicomDirImage
1024           related methods, in order not to expose internal mechanisms
1025         InitTraversal();
1026         GetNextEntry();
1027     * REM methods that exposed internal mechanisms :
1028         DicomDir::GetDicomDirPatients()
1029         DicomDirPatient::GetDicomDirStudies()
1030         DicomDirStudy::GetDicomDirSeries()
1031         DicomDirSerie::GetDicomDirImages()
1032     * UPD Test programs :
1033         makeDicomDir.cxx
1034         BuildUpDicomDir.cxx
1035         TestDicomDir.cxx
1036      * UPD Example program
1037         PrintDicomDir.cxx
1038     * ADD DictSet methods
1039         InitTraversal()
1040         GetNextEntry()
1041
1042 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1043    * Removed the Print/indent/default parameter mess. There is absolutely no
1044     reason to have to methods, moreover with the second taking the ostream as
1045     *SECOND* parameter. This was clearly a bad hack to get things compile.
1046
1047 2005-01-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1048    * Complete rewrite of the GetMacAddress code. Now the code is *much*
1049     smaller (no more MacOSX specific crap). A lot more POSIX oriented.
1050     Unfortunately the main code does not work on SunOS, thus provide a specific
1051     code for this platform only (and Win32 of course). Since this seems to be
1052     working, change CreateUniqueUID to use GetMACAddress instead of the
1053     problematic GctestetIPAddress
1054
1055 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1056    * Unfortunately to be able to test gdcmDirList I had to break the API
1057      a little. Now the class is not a std::list anymore but has a member
1058      std::vector (more ITK compatible). Allow unit testing on Win32 and
1059      shared libs.
1060
1061 2005-01-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1062    * Update SerieHeader to take into account a Serie Instance UID to properly
1063      sort DICOM files
1064
1065 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1066    * ENH - Comment out Mathieu's (dangerous) Super Hack
1067          for dealing with BIGENDIAN processors
1068          - Move equivalent stuff to BinEntry::WriteContent
1069          When necessary, 16 Bits Pixels are swapped in a small buffer
1070          and then written. This avoid allocating a huge buffer, in
1071          PixelWriteConvertor, and avoid modifying the Pixel Area.
1072          Note :
1073          Probabely, the same operation will have to be done when we want 
1074          to write image with Big Endian Transfert Syntax, 
1075          and we are working on Little Endian Processor
1076                   
1077 2005-01-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1078    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : comment all methods concerning a flat hash
1079      table.
1080    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : rename Initialize into InitTraversal
1081    * src/gdcmDict.[h|cxx] : add InitTraversal/getNextEntry methods to parse
1082      all the dict content.
1083    * src/gdcmDictEntry.cxx : add a carriage return at the end of the DictEntry
1084      print
1085    * Test/TestDict.cxx : add a new test for the dict classes
1086
1087 2005-01-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1088    * src/gdcmDebug.h : Adding an option to redirect debug stream to a 
1089                        file. Debug is yanked if compiled with NDEBUG
1090
1091 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1092    * src/gdcmDictSet.h : set the default output to the os variable
1093    * src/gdcmDictEntry.[h|cxx] : add the Print method
1094    * gdcmPython/demo/ : add a new test
1095
1096 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1097    * merging of Test/PrintDicomDir and Test/TestDicomDir
1098    * removal of now redundant Test/PrintDicomDir
1099    * enhancement of Example/PrintDicomDir
1100
1101 2005-01-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1102    * Now, python test might work on systems
1103    * Add the PrintDicomDir test
1104
1105 2005-01-13 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1106    * FIX : First entry following group 0002 was lost for
1107            Explicit Big Endian Transfer Syntax files
1108           (group and elem not swaped)
1109    
1110 2005-01-12 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1111    * FIX : Old quick and dirty 'optimistic' heuristic to deal with
1112            Big Endian Transfer Syntax supposed the group following 0002
1113            begins always by element 0000 (element 0000 is *optional*)
1114            To avoid further troubles, let's be pessimistic, and use
1115            Document::HandleOutOfGroup0002() method 
1116     * FIX : comparison between GDCM_NOTLOADED and Transfer Syntax
1117               (related pb not yet solved)
1118
1119 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1120    * Bug fix for the python part use
1121    * Now, PrintHeader.py pass... but outside the ctest use. shit !
1122
1123 2005-01-12 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1124    * gdcmPython/gdcm.i : bug fix when compiling with MSCV
1125
1126 2005-01-11 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1127    * Untangle TransferSynatx from gdcm::Document. Now Document only manipulate
1128      a string and should ask the global TS dict what are the propreties of 
1129      the transfer syntax
1130
1131 2005-01-11 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1132    * Replace confusing name SwitchSwapToBigEndian name by SwitchByteSwapCode
1133    * Add the Document::HandleOutOfGroup0002(uint16_t group) method
1134        to swap the Swap Code, at parsing time, when we come out of group 0002
1135        and Transfer Syntax is Big Endian
1136        We should be able to read now 'true DICOM" Big Endian coded images
1137     * Add optional run time SetDebugOn (last param) for PrintHeader, PrintFile
1138     * Replace the french 'Transfert Syntax' by the english 'Transfer Syntax'
1139
1140 2005-01-10 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1141    * Hopefully fix the bug on MacOSX and static global initialization.
1142    This is the only -minor- patch I found that both please MacOSX and VS6.
1143    Other patch would be to declare a const std::string & GDCM_UNFOUND() instead,
1144    but this would require a lot of change. Another approach would be that Global
1145    create those string and GDCM_UNFOUND becomes a pointer to a string (which
1146    gdcm::Global would destroy at exit).
1147
1148 2005-01-08 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1149    * Fix bug on MacOSX with static initialization in a multy threaded
1150     environment. static const string in a header file used to be ill
1151     initialized provoquing the freeze of any tests. patch should solve this
1152     issue.
1153
1154 2005-01-08 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1155    * According to Benoit's suggestion, and without any objection from anybody
1156       - methods SetxxxByNumber and GetxxxByNumber renamed as Setxxx and Getxxx
1157       - methods Dict::Print() and Dict::PrintByKey() merged into Dict::Print()
1158       - method gdcmDicomDirObject::GetEntry() renamed as 
1159          gdcmDicomDirObject::GetEntryHT() to avoid confusion (and compile error)
1160
1161 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1162    * Now gdcm::Debug is clearly a copy/paste of VTK approach. You can manipulate
1163      you debug/warning message just as c++ streams which make them very convinient
1164      to use. Once this is stabilize I will change the ostringstrem to be
1165      redirected to a file (ofstream).
1166    * Properly support C99 extension: __FUNCTION__ which allow us to display
1167      the name of the function call (GNUC also allow __PRETTY_FUNCTION__ for c++)
1168
1169 2005-01-07 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1170    * Removal of useless and dangerous methods :
1171          GetEntryByName, GetEntryVRByName, GetDocEntryByName, SetEntryByName
1172          GetDocEntryByName, GetEntryByName, GetDictEntryByName
1173    * Removal of usless methods :
1174          Dict::PrintByName, Dict::GetDictEntryByName
1175    * Commenting out of probabely useless methods :
1176          Dict::GetDictEntryNames()
1177          Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
1178          DictSet::GetPubDictEntryNames()
1179          DictSet::GetPubDictEntryNamesByCategory()         
1180    * ENH : New Dicom Dictionary (with Value Multiplicity) is now used    
1181    * ENH : Use dicomTS.dic as described in 2004 version   
1182    * ENH : Removal out of the Dicom Dictionary of non dicom 'fourth' field
1183            Add         to the Dicom Dictionary of Dicom 'Value Multiplicity' field
1184            Add Accessors on VM (Value Multiplicity), and VM related methods           
1185    * ADD : Add a list of 'Dicom Attribute types', as found in
1186            http://medical.nema.org/dicom/2004/04_15PU.PDF
1187                       Unused till now...           
1188    * ADD : Add dicomGroupNameAbbreviations.dic
1189            should be used to write a method to replace the former
1190            Dict::GetDictEntryNamesByCategory()
1191
1192 2005-01-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1193    * src/gdcmDocEntry.[h|cxx] : now the ReadLength is the length of the data
1194      to read in the file... and only it ! Length is the efective length of the
1195      data in the DocEntry structure
1196
1197 2005-01-07 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1198    * Change the gdcmDebug approach. Remov the global static debug 'dbg'.
1199      And now use a static function call instead, with a global variable. i
1200      This is much closer to the VTK approach. Hopefully should be bulletproof
1201      and easier to use...hopefully
1202
1203 2005-01-06 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1204    * Adding GetMACAddres very alpha for now. This is tricky to be cross plateform.
1205
1206 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1207    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : remove all copy of DocEntry when parsing a file
1208
1209 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1210    * src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.[h|cxx] : amelioration of
1211      ValEntry, BinEntry, SeqEntry creation or replace
1212
1213 2005-01-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1214    * src/gdcmDictEntry.h : now, the IsVRUnknown is correct
1215    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : simplify the search of VR value when parsing
1216      a file
1217    * src/gdcmDocEntrySet.cxx : now the created DocEntry without values is good
1218      when specifying the VR
1219    * src/gdcmVR.[h|cxx] : add usefull method to test the validity of a VR
1220    * src/gdcmDocEntry.cxx : amelioration of print
1221
1222 2005-01-05 Jean-Pierre Roux <jpr@creatis.univ-lyon1.fr>
1223    * ADD : Add the method Util::IsCurrentProcessorBigEndian
1224           (we'll need it for 'Explicit VR Big Endian' Transfert Syntax)
1225    * ADD  Method Document::ComputeGroupLength
1226    * ENH : now  parsing creates a Vitual DictEntry for Pixels Element,
1227            in order to allow further VR modification by user
1228    * REM : removal of once-called method File::WriteBase   
1229            integration of its code in formerly one-line method File::Write
1230
1231 2005-01-05 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1232    * src/gdcmCommon.h : add the GDCM_UNKNOWN constant. This constant is to
1233      replace the different values "??", "Unkn", "Unknown".
1234    * src/gdcmDicomDirElement.h, gdcmDictEntry.h, gdcmDictSet.h,
1235      gdcmDocEntry.cxx, gdcmDocEntrySet.[h|cxx], gdcmDocument.h, gdcmSQItem.cxx,
1236      gdcmVR.cxx : use the GDCM_UNKNOWN constant.
1237    * Appears a bug in gdcmDictEntry : IsVRUnknown always returns false... bad
1238
1239 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1240    * src/gdcmBase.[h|cxx] : new base class. Contains the PrintLevel and an
1241      empty Print Method
1242    * Set the gdcm::Base class to some Printable classes
1243
1244 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1245    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add the Print method
1246    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : add the generalized Print method
1247    * src/gdcmDocEntrySet.h : generalize the Print with the PrintLevel
1248    * src/gdcmDocument.h : remove the PrintLevel informations
1249    * Example/PrintFile.cxx : use the new gdcm::File::Print
1250
1251 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1252    * src/gdcmFile.cxx : Add the code of ReplaceOrCreateByNumber to not have
1253      problems when compiling with the python wrapping
1254
1255 2004-12-16 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1256    * src/gdcmFile.cxx : bug fix. Omitted a Push in the DocEntryArchive when
1257      writting in ImplicitVR
1258
1259 2004-12-12 Jean-Michel Rouet <jm.rouet@noos.fr>
1260    * src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx], src/gdcmJpeg*.cxx : new handling of
1261      JPEG decompression, especially when dicom frames are split into several
1262      JPEG Fragments. This makes use of jpeg decompression from memory buffer.
1263      This solves reading for example gdcm-JPEG-Lossless_Thoravision.dcm.
1264
1265 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1266    * src/gdcmHeader.cxx : change the initialisation of default header.
1267      Now, this header is readable by gdm, e-film, DicomWorks
1268
1269 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1270    * src/gdcmFile.[h|cxx], gdcmPixelReadConvert.[h|cxx] : change the API.
1271      Rename Decompressed to Raw
1272    * Use the API changes in gdcm::File.
1273    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add the possibility to write in other modes
1274      Memory leaks fixed
1275
1276 2004-12-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1277    * vtk/vtkGdcmWriter.cxx, Example/WriteDicomSimple.cxx : add comments for
1278      each added entry in the header. Replace the 'Planes' field by the 'Number
1279      of Frames' field
1280
1281 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1282    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : now can write stack of images.
1283    * vtk/vtkWriteDicom.cxx : can write 2D stack or 3D image
1284
1285 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1286    * Example/WriteDicomSimple.cxx : example to write a dicom file from nothing.
1287      At this time, this image isn't readable by e-film... waiting JPR help to
1288      solve it.
1289
1290 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1291    * src/gdcmPixelReadConvert.cxx : bug fix when would forcing load of a
1292      DocEntry. Now use methods of the Document !
1293
1294 2004-12-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1295    * Test/ShowDicomSeq.cxx : bug fix
1296  
1297 2004-12-08 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1298    * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : bug fix. Plane order isn't inverted
1299    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : correctly write images (the Y axis is inverted)
1300    * Test/ShowDicomSeq.cxx : new test to verify the use of AddFileName method
1301    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : set the threshold of regression
1302      test to 0.0
1303    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : remove unused variable
1304    * Test/CMakeLists.txt : add the creation of the gdcmDataSeqImages.h file
1305      containing found sequences
1306
1307 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1308    * Test/ShowDicom.cxx, TestWriteWithVTK.cxx : bug fix, now this test pass
1309      not at all time
1310    * Test/TestCopyRescaleDicom.cxx : rearrange the test to correctly pass...
1311      Some fields in BinEntry must be copied to not seg fault when making the :
1312               gdcm::File *copy     = new gdcm::File( copyH );
1313      and tests are now made on good variables
1314
1315 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1316    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
1317    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
1318      length
1319    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
1320    * Add vtkGdcmWriter example and test
1321
1322 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1323    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
1324    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
1325    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
1326      SetValue
1327    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
1328    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
1329
1330 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1331    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
1332    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
1333
1334 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1335    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
1336      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
1337      file isn't readable. 
1338
1339 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1340    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
1341    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
1342    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
1343    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
1344      method that is redondant with AddEntry.
1345    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
1346      SQItem
1347
1348 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1349    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
1350    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
1351    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
1352
1353 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1354    * Huge cleanup:
1355      - Remove printf / sprintf
1356      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
1357      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
1358        source
1359      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
1360        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
1361      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
1362        (plus it is not up to date)
1363      - remove 'using namespace std' this is BAD !
1364
1365 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1366    * Remove memory leaks on the DicomDir
1367    * Remove some useless data in DicomDirObject
1368    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
1369
1370 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1371    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
1372
1373 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1374    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write data (and in the
1375      future, with convertion)
1376    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
1377      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
1378      from the output of the class
1379
1380 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1381    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
1382
1383 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1384    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
1385      and vtkErrorMacro use.
1386    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
1387
1388 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1389    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
1390      file name in input
1391    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
1392    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
1393      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
1394      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
1395      immediately after thee instruction.
1396    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
1397      file has been opened : the test must be made on the content of the 
1398      pointer and not directly on the pointer !
1399      Code formatting
1400
1401 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1402    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
1403      the python part recompiles
1404
1405 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1406    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
1407      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
1408      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
1409      all linux)
1410
1411 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1412    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
1413      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
1414      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
1415      screen resolution, it's produce errors).
1416      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
1417    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
1418    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
1419      under windows at compilation
1420    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
1421      for grayscale images
1422    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
1423
1424 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1425    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
1426    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
1427      tests on the image size X, Y, Z
1428
1429 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1430    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
1431    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
1432      between the class name and the file name
1433
1434 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1435    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
1436      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
1437      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
1438      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
1439      this variable content.
1440
1441 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1442    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
1443      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
1444      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
1445      DocEntryArchive
1446    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
1447      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
1448      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
1449    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
1450      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
1451
1452 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1453    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
1454
1455 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1456    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
1457    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
1458      the header.
1459    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
1460      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
1461      write
1462    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
1463      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
1464      is now on RGB data (as before my last commit
1465    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
1466
1467 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1468    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
1469      Add a print information of the type of the entry
1470    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
1471      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
1472    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
1473      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
1474    * Test/ : test on files are now made using Raw data and not color data if
1475      any.
1476    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
1477
1478 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1479    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
1480      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
1481      opened or not.
1482
1483 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1484    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
1485      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
1486    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
1487      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
1488      DocEntryArchive
1489    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
1490      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
1491    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
1492      - test the pixels written
1493      - add test points to quickly find where is the error
1494      - can set a file name input and output in arguments
1495    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
1496      amelioration of the test output
1497
1498 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1499    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
1500      all replaced DocEntry's
1501    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting data.
1502      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
1503      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
1504      header initial state.
1505
1506 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1507    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
1508
1509 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1510    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
1511      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
1512      then, it musn't change in the time.
1513    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
1514      header correctly. At this time, the change is only made for the first
1515      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
1516      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
1517      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
1518      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
1519    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
1520    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
1521      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
1522      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
1523
1524 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1525    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
1526    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
1527
1528 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1529    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
1530      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
1531      is copied).
1532    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
1533      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
1534    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
1535
1536 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1537    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
1538      Two problems appear when doing it :
1539       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
1540         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
1541         data (pixels). And each structure destruct the data when it's
1542         destructed. So we have two destructions for the same data. To solve it,
1543         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
1544         data or not. If it doesn't own data, then they will not destroyed by
1545         the gdcmBinEntry.
1546       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
1547         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
1548         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
1549         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
1550         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
1551    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
1552
1553 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1554    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
1555    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
1556      squeeze method
1557
1558 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1559    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
1560    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
1561      after it have been deleted
1562
1563 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1564    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
1565    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
1566    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
1567      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
1568      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
1569
1570 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1571     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
1572     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
1573     3. Use const ref when possible
1574     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
1575     5. A few more comments
1576     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
1577
1578 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1579   * ENH: Slightly bigger patch:
1580     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
1581     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
1582     3. File was not close properly in gdcmDict
1583     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
1584     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
1585     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
1586     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
1587     8. Do not repeat virtual in subclasses
1588     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
1589
1590 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1591   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
1592     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
1593     of a null character as defined by standard
1594   
1595 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1596   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
1597     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
1598
1599 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1600   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
1601   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
1602     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
1603
1604 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1605   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
1606     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
1607     a verbose message is generated.
1608     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
1609     correctly close is a call to CloseFile.
1610     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
1611   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
1612     file. For an uncompressed image, the copied data correspond in the least 
1613     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
1614     header. A verbose is generated if these two size mismatch
1615
1616 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1617   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
1618     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
1619     break under windows (with msvc6 compilation).
1620
1621 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1622   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
1623     compiling with MSVC6)
1624
1625 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1626   * Bugs fix for the Windows build with VC6
1627   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
1628     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
1629     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
1630     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
1631   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
1632     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
1633     gdcm.i file)
1634   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
1635     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
1636     std::cerr of vtk.
1637
1638 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1639   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
1640   * gdcmPython/gdcm.i:
1641     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
1642     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
1643       NOT need to be wrapped anymore.
1644   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
1645     DicomDir::Method) new example added.
1646
1647 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1648   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
1649     A DicomString can contain as many \0 as they want
1650     and it is *always* of even length.
1651     We only support odd length for very rare case. 
1652     And in the near future this should be removed.
1653
1654 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1655   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
1656     little endian. This should -heopfully- fix some tests
1657
1658 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
1660     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
1661     the one comiled into lib
1662
1663 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1664   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
1665     This should definitely solve any leak problem, and we should be
1666     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
1667
1668 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1669   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
1670   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
1671   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
1672   
1673 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1674   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
1675   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
1676     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
1677   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1678   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
1679     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
1680     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
1681       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
1682       no longer exists.
1683
1684 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1685   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
1686    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
1687    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
1688    the class.
1689   
1690 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1691   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
1692     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
1693     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
1694
1695 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1696   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
1697   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
1698     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
1699     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
1700     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
1701       CloseFile() anymore.
1702     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
1703       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
1704       into File::Pixel_Data.
1705
1706 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1707   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
1708     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
1709   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
1710     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
1711     method:
1712     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
1713     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
1714       method to those classes.
1715     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
1716       -- Added a ::Print() method.
1717       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
1718       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
1719          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
1720
1721 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1722   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
1723     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
1724     doxygen.
1725   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
1726   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
1727     pointlessly wrapped (see
1728     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
1729   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
1730     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
1731     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
1732     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
1733     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1734       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
1735            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
1736       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
1737          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
1738
1739 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1740   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
1741     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
1742
1743 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1744   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
1745     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
1746     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
1747   * TODO added new entry.
1748   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
1749     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1750     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
1751     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
1752       variable names for semantical coherence.
1753
1754 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1755   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
1756   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
1757   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
1758   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
1759   redefine symbols. This is not perfect but this the best solution I found for a
1760   compilation time jpeg option.
1761
1762 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1763   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
1764     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
1765     reproduce at home.
1766   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
1767   Thanks dcmtk crew !
1768
1769 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1770   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
1771   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
1772     matters, as stated in warning note at beginning of %include section).
1773   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
1774   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
1775   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
1776   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
1777     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
1778     from File:: to PixelConvert::.
1779
1780 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1781   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
1782     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
1783      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
1784      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
1785
1786 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1787   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
1788   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
1789   like this:
1790     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
1791   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
1792   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
1793   the standard namespace (like LP, Unknown ...)
1794
1795 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1796   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
1797     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
1798     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
1799     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
1800     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
1801       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
1802       (for the time being this is better than having them attach to
1803        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
1804     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
1805       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
1806     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
1807       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
1808       gdcmPixelConvert::
1809
1810 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1811   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
1812   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
1813     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
1814       clean up of RLE related code. 
1815   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
1816     - src/gdcmRLE.cxx removed
1817     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
1818     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
1819     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
1820   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
1821     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
1822       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
1823       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
1824
1825 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1826   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
1827     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
1828       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
1829       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
1830       time ago, EXCEPT I forgot the OW case...
1831       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
1832       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
1833       offsets.
1834   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
1835     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
1836         with the retired Parse7Fe0().
1837     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
1838     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
1839
1840 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1841   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
1842     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
1843     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
1844     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
1845   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
1846     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
1847       to return an unused length.
1848
1849 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1850   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
1851     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
1852     to use to do simple stuff.
1853
1854 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1855   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
1856     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
1857     copying of the file within different directory, configure header file to
1858     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
1859     that symbol are different whether we are within 8bits or 12bits.
1860
1861 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1862   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
1863      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
1864        with it's binary name).
1865      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
1866        the Website to be more complete.
1867      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
1868        doxygenated documentation.
1869      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
1870        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
1871                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
1872   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
1873   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
1874    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1875
1876 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1877   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
1878    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
1879
1880 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1881   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
1882     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
1883     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
1884     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
1885     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
1886   * GDCMHOME clean up:
1887     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
1888       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
1889       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
1890   * Autotools clean up:
1891     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
1892     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
1893
1894 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1895   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
1896   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
1897   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
1898
1899 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1900   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
1901     describing TODO entries and used it for new entries.
1902   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
1903     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
1904     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
1905   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
1906     documentation itself, but the website) moved to html and
1907     placed in directory Doc/Website:
1908     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
1909     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
1910     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
1911   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
1912   * CMakeLists.txt changed accordingly.
1913   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
1914     DeveloppersPython.html
1915   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
1916
1917 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1918   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
1919     of gdcm Web site.
1920
1921 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
1922   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
1923     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
1924     we can now delete[] it safely 
1925   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
1926     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
1927   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
1928
1929 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1930   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
1931     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
1932     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
1933     pointed content.
1934
1935 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1936   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
1937   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
1938
1939 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1940   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionary
1941     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
1942     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
1943     an example of usage.
1944     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
1945       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
1946     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
1947       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
1948     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
1949     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
1950     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
1951
1952 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1953   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
1954     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
1955     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
1956     in class 
1957     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
1958       and associated accessors. Doxygenation of the class.
1959     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
1960       accessors added.
1961     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
1962       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
1963     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
1964     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
1965
1966 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1967   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
1968     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
1969       of gdcmTagKey in src/gdcmCommon.h:
1970            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
1971            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
1972            A dicom tag always has a group and an element, but a set of tags
1973            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
1974            the same group and element all share the same (group, element)
1975            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
1976            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
1977            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
1978            consider the following definition of a TagKey:
1979            - let Group, Element be the string representation of the
1980              group and element dicom tag members,
1981            - let ItemNumber be the string representation of the integer
1982              index of the considered item number of a sequence,
1983            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
1984            the form:
1985               /ItemNumber#Group|Element
1986            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
1987            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
1988               Group|Element<SeqTag>
1989            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
1990            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
1991            string e.g.
1992                0028|1201
1993            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
1994            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
1995            string e.g.
1996                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
1997     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
1998       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
1999       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
2000     - src/gdcmDocEntry.cxx:
2001       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
2002          Key member.
2003       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
2004     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
2005     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
2006       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
2007       -- now has a new BaseTagKey member.
2008       -- STYLE.
2009   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
2010     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
2011     truly belongs.
2012     This poses the problem with the semantics of the following lines
2013        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
2014        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
2015        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
2016     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
2017     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
2018     order to get things working the dicom dictionary was altered !
2019     Please fix things urgently...
2020   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
2021     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
2022     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
2023     set to OW:
2024       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
2025       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
2026       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
2027   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
2028     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
2029   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
2030
2031 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2032   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
2033
2034 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2035   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
2036     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
2037   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
2038   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
2039
2040 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2041   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
2042     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
2043   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
2044     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
2045   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
2046     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
2047   * TODO updated
2048   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
2049     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
2050   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used always return true)
2051   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
2052     exception_on_error parameter.
2053     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
2054     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
2055     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
2056
2057 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2058   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
2059   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
2060     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
2061   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
2062   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
2063   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
2064     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
2065   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
2066
2067 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2068   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
2069     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
2070
2071 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
2072   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
2073        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
2074  
2075 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
2076   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
2077         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
2078
2079 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2080    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
2081    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
2082      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
2083      is now in static in the gdcmDebug class
2084    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
2085    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
2086
2087 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2088    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
2089      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
2090    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
2091      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
2092      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
2093      that displays position and size).
2094    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
2095      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
2096      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
2097      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
2098      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
2099      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
2100      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
2101         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
2102      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
2103      commiting changes).
2104    * Test/CMakeLists.txt:
2105       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
2106       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
2107         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
2108         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
2109    * TODO updated.
2110
2111 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2112    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
2113      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
2114      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
2115      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
2116      - removal of typedef duplication.
2117      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
2118      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
2119    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
2120       - printf polluting ctest removed.
2121       - TAB removal for comminting
2122    * Test:
2123      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
2124        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
2125        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
2126        this test creates them.
2127        Note: we need to validate each reference image, but before that
2128              I'd like to rename them with a more explicit name...
2129      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
2130    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
2131      including each header needed).
2132
2133 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2134    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
2135      test suite to the Example directory. Are concerned:
2136      - PrintHeader.cxx
2137      - TestDcm2Acr.cxx
2138      - TestFindTags.cxx
2139      - TestWrite.cxx was
2140      - TestWriteSimple.cxx
2141    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
2142      image gdcmData/oldACR00001.ima
2143
2144 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2145    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
2146      with removal from gdcmData):
2147       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
2148       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
2149       - US.3405.1.dcm
2150      Added the following because after last cvs update, they cause
2151        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
2152      to segfault:
2153       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
2154       - oldACR00001.ima
2155    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
2156      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
2157      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
2158      form of test...
2159    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
2160      we don't need to black list the following images anymore:
2161       - 8BitsUncompressedColor.dcm
2162       - OT-PAL-8-face.dcm
2163       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
2164    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
2165      fixes and the beautified code ;-)
2166      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
2167      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
2168      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
2169            improve the test suite). The bug could be detected by using
2170            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
2171            or by using
2172            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
2173            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
2174
2175 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
2176    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
2177          - replace by uggly but working old code :-(
2178    A lot of things should be OK again.
2179    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
2180    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
2181    (twice, withing a fortnigh ...)    
2182
2183 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2184    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
2185      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
2186    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
2187      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
2188      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
2189                    - OT-PAL-8-face.dcm
2190                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
2191    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
2192      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
2193      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
2194      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
2195      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
2196      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
2197      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
2198      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
2199      image.
2200    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
2201      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
2202      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was always
2203      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
2204    
2205 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2206   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
2207   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
2208                           (instead of infinite loop)
2209   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
2210
2211 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2212    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
2213
2214 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2215    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
2216            when SamplesPerPixel =3
2217          - now Write is no longer confused by 
2218           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
2219          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
2220                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
2221    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
2222            (in order to split the job that has not to be done 
2223            for gdcmDicomDir)
2224
2225 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2226    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
2227      loop on the same image until memory went out. 
2228      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
2229    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
2230      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
2231
2232 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
2233    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
2234             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
2235             is added a the end, when necessary.
2236             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
2237               now written correctly
2238             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
2239               (even for odd groups) 
2240         Note : only Explicit Value Representation was checked.
2241                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
2242
2243 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2244    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
2245    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
2246      coding style).
2247
2248 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2249    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
2250      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
2251    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
2252
2253 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
2254    FIX : gdcmDocument.cxx
2255       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
2256         code 'beautyfication' :-(
2257       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
2258
2259 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
2260    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
2261             : to allow user to create his own Sequences
2262    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
2263
2264    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
2265
2266    - gdcmBinEntry
2267      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2268   
2269    - gdcmDocEntry
2270      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2271      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
2272   
2273    - gdcmDocEntrySet
2274      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
2275      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
2276      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
2277      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
2278      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);            
2279      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
2280                                             guint16 element,
2281                                             std::string vr     = "unkn",
2282                                             std::string fourth = "unkn",
2283                                             std::string name   = "unkn"); 
2284      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
2285      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2286      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2287      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
2288      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
2289      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
2290      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
2291      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
2292   
2293    - gdcmDocument
2294      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
2295      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
2296      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
2297      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
2298      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
2299                                         FILE *_fp, FileType type);
2300      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
2301      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
2302      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
2303      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
2304      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
2305      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
2306      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
2307      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
2308                                             guint16 element,
2309                                             std::string vr     = "unkn",
2310                                             std::string fourth = "unkn",
2311                                             std::string name   = "unkn");
2312      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
2313      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
2314      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2315      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
2316                                              
2317    - gdcmElementSet
2318      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2319      
2320    - gdcmSeqEntry
2321      ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
2322  
2323    - gdcmSQItem
2324      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
2325      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);         
2326      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
2327      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
2328
2329    - gdcmValEntry
2330     ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
2331               
2332 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2333     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
2334       The default constructor invoked by the line
2335          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
2336       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
2337       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
2338       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
2339     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
2340       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
2341       Could anyone explain why ?
2342     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
2343       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
2344       code related to gdcmBinEntry).
2345
2346 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2347     * In order to fix memory leaks:
2348      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
2349        some delete calls.
2350      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
2351      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
2352        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
2353        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
2354        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
2355      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
2356      - src/gdcmDocument.cxx:
2357        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
2358           from dynamic stores.
2359        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
2360           was causing memory leaks.
2361      - src/gdcmSQItem.cxx:
2362        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
2363           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
2364        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
2365           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
2366           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
2367           This avoids SegFaulting.
2368      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
2369     * Conclusion:
2370      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
2371        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
2372        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
2373      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
2374        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
2375      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
2376        segfaults).
2377     * Erroneous leading white fix:
2378      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
2379        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
2380      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
2381      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
2382     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
2383     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
2384
2385
2386 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2387     * In order to fix writing of dicom files:
2388      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
2389      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
2390      - src/gdcmDocument.cxx:
2391        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
2392        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
2393        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
2394           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
2395           manner.
2396        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
2397           to only declared) and build on top of
2398           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
2399        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
2400      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
2401        for usage in destructor and treatement of promotion in
2402        ::ReplaceOrCreateByNumber().
2403      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
2404       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
2405     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
2406       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
2407       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
2408       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
2409
2410 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2411     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
2412       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
2413       learned that:
2414           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
2415           soon as possible by globally disabling memory caching.
2416           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
2417           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
2418       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
2419       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
2420       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
2421     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
2422       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
2423       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
2424       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
2425         with 1.
2426       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
2427       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
2428       understand why the list is empty...).
2429     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
2430     * Doc/License.txt added.
2431
2432 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2433     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
2434       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
2435         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
2436         the padding problem.
2437       - general clean up, simplification, and coding style.
2438       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
2439     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
2440
2441 2004-06-14 Jean-Pierre Roux      
2442    *  gdcmSeqEntry.cxx
2443       - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
2444       - fix the display of SQItem ordinal number
2445       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
2446       - remove some useless never written private methods   
2447       
2448 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
2449    * gdcmBinEntry.cxx 
2450       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
2451       - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
2452          a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
2453          a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
2454    * dcmDocument.cxx
2455       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
2456          according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
2457       - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
2458       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
2459    * gdcmFile.cxx
2460       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
2461    * gdcmSQItem.h
2462       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
2463             a (relative) Item identier inside a given Sequence
2464             \warning : some pb remaining around this number
2465             will be solved asap
2466       - AddEntry now takes the Item Number as a param    
2467    * gdcmValEntry.cxx 
2468       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param   
2469
2470 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2471     * Memory leak hunt with the following command:
2472       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2473                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
2474       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
2475       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
2476       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
2477           grep "MEMORY LEAK" src/*
2478       Here are two typical examples which I can't help fixing:
2479       -----
2480           #include <string>
2481           int main() {
2482              std::string name;
2483              char * test = "babo";
2484              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
2485                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
2486              name.clear();   //// Doesn't help !
2487              return 0;
2488           }
2489       -----
2490           #include <string>
2491           #include <iostream>
2492           int main() {
2493              std::string line;
2494              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
2495              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
2496                                         //// of 1320 bytes in call to
2497                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
2498             return 0;
2499           }
2500       -----
2501
2502
2503 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2504     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
2505       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
2506         and related, moved away to gdcmDocument.
2507       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
2508         the corresponding protected accessors of inherited class
2509         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
2510         declared friend of class gdcmDocument (see below).
2511       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
2512       - Clean up of undefined or unused methods.
2513     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
2514       account the changes to gdcmHeader.h).
2515     * src/gdcmDocument.h:
2516       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
2517         changes to gdcmHeader.h).
2518       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
2519         (see changes to gdcmHeader.h).
2520       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
2521       - Clean up of undefined or unused methods.
2522     * src/gdcmDocument.cxx:
2523       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
2524       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
2525       - some std::string properly set to VRKey
2526     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
2527       references to gdcmDocument. 
2528     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
2529     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
2530       cvs repository gdcmData.
2531
2532 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2533     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
2534     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
2535       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
2536     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
2537     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
2538       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
2539     * src/gdcmDocument.cxx: 
2540       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
2541         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
2542       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
2543         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
2544         removed. Reverting to previous code segment with the proper
2545         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
2546         Note: this was (partially) breaking the python test suite
2547               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
2548               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
2549     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
2550     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
2551       now taken into account.
2552     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
2553       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
2554     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
2555       on posix.
2556     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
2557       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
2558     * .... alas, the python testSuite is still broken.
2559
2560 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2561     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
2562       gdcmGlob
2563     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
2564     * src/gdcmUtil.h : export methods
2565
2566 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2567     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
2568       to right behavior
2569     * Initial addition of automatic python testing
2570     * Initial addition of automatic image comparison
2571
2572 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2573     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
2574       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
2575
2576 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2577      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
2578      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
2579      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
2580
2581 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
2582      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
2583        new concepts (and new classes) :
2584        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
2585         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
2586         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
2587        a Sequence is composed of Items.
2588        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
2589        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
2590        (never taken into account)
2591        Our unability to add a new 'entry' in the header
2592        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
2593        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
2594        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
2595        nothing is finished.
2596        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
2597
2598 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2599      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
2600      
2601 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2602      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
2603        file prefix (SetFilePrefix)
2604
2605 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2606      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
2607        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
2608        baseline.
2609      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
2610        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
2611
2612 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2613      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
2614        dicom image
2615
2616 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2617      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
2618      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
2619        between the developper and user version.
2620      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
2621      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
2622
2623 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2624      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
2625        when using cmake.
2626
2627 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2628      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
2629                src directory, now generated in the build dir.
2630             2. Tests as mentionned smarter
2631             3. Some clean up
2632             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
2633           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
2634           where we could set the institution name / patient name...
2635
2636        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
2637               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
2638                  (this was not true before)
2639
2640 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
2641      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
2642            SeQuence indented printing of Dicom Header.
2643      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
2644            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
2645       Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
2646      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
2647            tree-like structure of a Dicom Header.
2648      * FIX Test code cleaning     
2649            
2650 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2651      * ENH: Adding automatic testing
2652        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
2653        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
2654        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
2655        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
2656           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
2657           too many projects
2658      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
2659      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
2660        one file instead of seven + some small cleanup
2661
2662 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
2663      * ENH Minor changes to the Print() methods.
2664      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
2665            Header printing. Example given with :
2666       > PrintHeader fileName  2 new
2667           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
2668       
2669 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2670      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
2671          1. I have added some unsigned where needed
2672          2. Some function parameter not used -> (void)
2673          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
2674          4. g++ don't like character '\' in comment
2675          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
2676                     this really need to be fixed
2677          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
2678          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
2679                     this also really need to be fixed
2680          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
2681                     remove compression file 
2682                     (as we only do decompression, right ?)     
2683      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
2684
2685 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
2686      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
2687            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
2688            defaulted to yspacing
2689       
2690 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
2691      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
2692      * ENH add parameters :
2693                bool  exception_on_error = false, 
2694                bool  enable_sequences   = false,
2695           bool  ignore_shadow      = false
2696            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
2697      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
2698            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
2699          
2700 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
2701      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
2702      
2703 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
2704      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
2705      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
2706              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
2707         
2708 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
2709      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
2710          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
2711
2712 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2713      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
2714        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
2715        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
2716        in gdcmHeader.
2717      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
2718        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
2719        already does the job.
2720      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
2721        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
2722
2723 2004-03-30 Benoit Regrain
2724      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
2725        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
2726        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
2727
2728 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
2729      * ENH : Check on file type to be written moved
2730              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
2731      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
2732              when end-of-list is reached
2733       : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
2734
2735 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2736      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
2737      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
2738      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
2739        equivalent to ExplicitVR in existing code).
2740
2741 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2742      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
2743        now contains all the gdcmGlobal related code.
2744      * minor coding style and doxygenation changes.
2745
2746 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2747      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
2748        now contains all the Debug related code.
2749      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
2750      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
2751        CreateCleanString) removed.
2752      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
2753      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
2754      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
2755      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
2756        src/gdcmDirList.cxx)
2757
2758 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
2759      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
2760
2761 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
2762      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
2763            big endian made volumes
2764      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
2765            end user to instanciate class gdcmParser
2766           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
2767
2768 2004-03-22 Benoit Regrain
2769      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
2770      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
2771              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
2772
2773 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
2774      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
2775            an already existing DICOMDIR file is consistent with
2776            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
2777            or build from the files held (recursively) in a Directory
2778            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
2779            gdcmObject::SetBoundaries() added
2780
2781 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
2782      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
2783                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
2784      * FIX now file names and directory name are written properly in the
2785            DICOMDIR
2786      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
2787            about the name
2788
2789 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2790      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
2791                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
2792
2793 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
2794      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
2795            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
2796            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
2797            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
2798       to allow making gdcDicomDir object.
2799      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
2800           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
2801
2802 2004-02-11 Benoit Regrain
2803      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
2804              when using from python
2805              
2806 2004-02-10 Benoit Regrain
2807      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
2808      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
2809      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
2810              directory parsing
2811
2812 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2813      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
2814              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
2815              - class gdcmMeta created
2816      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
2817              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
2818      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
2819
2820 2004-02-05 Benoit Regrain
2821      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
2822              header entries
2823      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
2824      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
2825
2826 2004-02-04 Benoit Regrain
2827      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
2828      * FIX : sort the images in the dicom dir
2829      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
2830      * ADD : a python demo
2831
2832 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
2833      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
2834      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
2835              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
2836              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
2837              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
2838      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
2839            to make full checking easier
2840         
2841 2004-02-04 Benoit Regrain
2842      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
2843      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
2844
2845 2004-02-03 Benoit Regrain
2846      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
2847      * gdcmDicomDir : add the load of directory
2848      * Bug fix and print add-on
2849
2850 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2851      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
2852      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
2853      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
2854      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
2855            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
2856         
2857 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
2858      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
2859              iterator on last
2860              of the last synonym :-(
2861      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
2862              for DICOMDIR ;-)
2863      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
2864      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
2865      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
2866            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
2867       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
2868
2869 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
2870      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
2871            no longer writes 'Un' on disk
2872      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
2873      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
2874            the length (for Palette expanded images)
2875            and Raw Length (non expanded image + Palette)
2876      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
2877            (that broke Write). Replaced by UL.
2878            Aware user will reload the field if he 
2879            thinks it's necesssary
2880              
2881 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
2882      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
2883        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
2884        IsReadable() methods.
2885        
2886      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
2887       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
2888       but so usefull for people that miss them ;-)
2889       
2890      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
2891        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
2892
2893 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
2894      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
2895
2896 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
2897      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
2898              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
2899         The TRUE value for this param has to be used 
2900         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
2901         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
2902      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
2903              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
2904         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
2905         
2906      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
2907              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
2908              Fixed
2909
2910      * gdcmHeader add the method
2911              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
2912         to get *all* the Header Entries with the same tag.
2913         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
2914         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionary)
2915
2916 2004-01-26 Benoit Regrain
2917      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
2918        in the print and add a third level of print to print them
2919
2920 2004-01-23 Benoit Regrain
2921      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
2922      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
2923      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
2924        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
2925
2926 2004-01-22 Benoit Regrain
2927      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
2928      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
2929
2930 2004-01-19 Benoit Regrain
2931      * Add the use of shadow dictionaries
2932      * bug fix and coding style
2933
2934 2004-01-19 Benoit Regrain
2935      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
2936      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
2937      * Add the update of header entries using the shadow library
2938
2939 2004-01-19 Benoit Regrain
2940      * removal of file gdcmHeader2.cxx
2941      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
2942        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
2943        of dicom dir parsing
2944      * bug fix under python
2945
2946 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
2947     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
2948     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
2949     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
2950     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
2951
2952 2004-01-15 Benoit Regrain
2953      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
2954        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
2955        when the gdcmDictSet will be destroyed
2956      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
2957        gdcmDictSet
2958
2959 2004-01-15 Benoit Regrain
2960      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
2961        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
2962        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
2963        some memory and vtk seems to have some problems with that.
2964      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
2965
2966 2004-01-14 Benoit Regrain
2967      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
2968      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
2969      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
2970      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
2971
2972 2004-01-13 Benoit Regrain
2973      * src/*.[h|cxx] : coding style
2974      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
2975
2976 2004-01-13 Benoit Regrain
2977      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
2978      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
2979        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
2980      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
2981
2982 2004-01-12 Benoit Regrain
2983      * src/*.h : add comments
2984      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
2985      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionary file other than to be
2986        directly setted in the source code
2987      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionary files loaded by
2988        gdcmTS and gdcmVR
2989
2990 2004-01-09 Benoit Regrain
2991      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
2992      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
2993
2994 2004-01-07 Benoit Regrain
2995      * Modification to compile with the distutils.
2996      * Bug fix in code
2997
2998 2003-12-10 Benoit Regrain
2999      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
3000        can use a gdcmHeaderHelper to load data
3001      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
3002        made in the source code
3003
3004 2003-12-10 Benoit Regrain
3005      * Update Windows projects and .cvsignore files
3006
3007 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
3008      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
3009            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
3010            if he wants to.
3011            gdcmElValSet:Print takes it into account
3012
3013 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3014      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
3015      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
3016      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
3017
3018 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
3019       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
3020              on the ListTag listElem member,
3021              not longer on the TagElValueHT tagHt member
3022       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
3023              with the tagHt member and the listElem member.
3024         (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
3025
3026       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
3027              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
3028                        if bug fixing is necessary), for internal
3029              use only
3030         UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
3031                        or to allow Parser going on.
3032         Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
3033         with a length (not 0000) is found
3034       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
3035            because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
3036       (to be written)
3037
3038 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
3039      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
3040      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
3041           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
3042      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
3043
3044 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3045      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
3046
3047 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3048      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
3049           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
3050
3051 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
3052      * in testSuite.py : new files names for checking the package
3053      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
3054              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
3055              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
3056
3057 2003-11-05 Benoit Regrain
3058      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
3059                        : Explicit error messages
3060      * in __init__.py  : Related modif
3061
3062 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
3063      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
3064            to be used by aware (vtk) users that want to manage
3065            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
3066      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
3067                     (vtkGdcmReader compliant)           
3068       
3069 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3070      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
3071        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
3072        
3073 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3074      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
3075            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
3076
3077 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
3078      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
3079                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
3080              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
3081              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
3082              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
3083              such an image :
3084              After gdcmHeader :
3085               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
3086               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
3087               GetImageDataRaw returns the gray Plane
3088      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
3089              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
3090
3091 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
3092      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
3093              
3094 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3095      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
3096       being coherents dicom files.
3097      
3098 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3099      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
3100            from medcon lib !
3101      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
3102      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
3103      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
3104      * ENH: Add include dir to medcon lib
3105      * FIX: only one function is being exported for now ! 
3106            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
3107             
3108 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
3109       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
3110         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
3111           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
3112       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
3113
3114 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
3115       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
3116         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
3117         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
3118       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
3119       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
3120
3121 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3122       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
3123                                                
3124 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3125       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
3126       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
3127       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
3128       
3129 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3130       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
3131       * ENH: Try adding a search script for python site-package
3132       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
3133       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
3134       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
3135       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
3136              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
3137         But it fasten debug compilation time.
3138             
3139 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
3140       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
3141         (they are compressed as 2 planes images, 
3142          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
3143
3144 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
3145       * Now CheckRead takes into account :
3146          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
3147          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
3148       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
3149        (breaks DicomWorks)
3150
3151 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3152       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
3153              one should remove the '\'
3154         
3155 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
3156       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
3157         (wrong lengths in header)
3158         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
3159       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
3160         (breaks DicomWorks)
3161
3162 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3163       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
3164         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
3165
3166 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3167       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
3168       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
3169
3170 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3171       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
3172      
3173 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
3174       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
3175         (the patch is easy to remove)
3176       * cosmetic changes to avoid warnings
3177       
3178 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3179       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
3180         no need to press 'r' now.
3181    
3182 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
3183       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
3184         to new Jpeg Lossless decompressor
3185       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
3186       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
3187       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
3188                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
3189 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
3190       * general anonymisation in gdcmData
3191       * adding the 'color files' from
3192         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
3193       * adding some well knowed bugged-header images
3194       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
3195         waiting for their inclusion in Python testsuite
3196
3197 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
3198     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
3199       no longer seg faults when file is not found
3200
3201 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
3202      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
3203        MultiFrame images
3204
3205 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3206      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
3207
3208 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
3209      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
3210         OpenFile takes it into account
3211      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
3212      * Missing elements added in dicomV3.dic
3213       (just to be affraid : have a look at
3214        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
3215        and do it again next year ;->
3216
3217 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
3218      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
3219        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
3220        But there are NOT. It's fixed !
3221        
3222 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3223      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
3224      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
3225          
3226 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
3227      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
3228              an ACR-NEMA / DICOM one.
3229      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
3230              is not gdcm Readable
3231      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
3232              is now decoded.
3233         
3234 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3235      * FIX: CMake generate now documentation
3236      * ENH: out of source doc build !
3237      * ENH: Generate both user and dev documentation
3238      * ENH: Should work on windows too
3239      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
3240      * FIX: make install should be ok now on Unix plateform
3241      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
3242      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
3243                      
3244 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3245      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
3246      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
3247      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
3248         window level & window width
3249
3250 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3251      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
3252      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
3253      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
3254      
3255 2003-10-06  Emanuel Ollart
3256      * FIX : compilation process wad broken.
3257              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
3258         
3259 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3260      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
3261      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
3262      
3263 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
3264      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
3265            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
3266                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
3267       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
3268
3269 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3270       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
3271         to remain compliant with already defined strings, 
3272         like Transfert Syntax UID and others)
3273
3274 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3275       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
3276              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
3277         
3278 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3279       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
3280       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
3281
3282 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3283       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
3284         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
3285               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
3286       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
3287
3288 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3289       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
3290
3291 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3292       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
3293         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
3294
3295 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
3296       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
3297          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
3298          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
3299          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
3300           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
3301                                        YBR_RCT files.
3302           (no sample found :-(
3303
3304 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3305       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
3306         Two reasons: - clear things
3307                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
3308                        suffer anymore VC++ complains
3309
3310 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3311       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
3312       * removed leaks
3313
3314 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
3315       * The lines are now eigthy characters long for 
3316         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
3317
3318 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3319       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
3320         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
3321         previous commis of Malaterre)
3322       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
3323         before the last Malaterre's commit.
3324
3325 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3326       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
3327         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
3328       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
3329         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
3330
3331 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3332       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
3333         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
3334         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
3335
3336 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3337       * Cosmetic changes:
3338         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
3339           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
3340           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
3341           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
3342         - PACKAGER corrected
3343         - DEVELOPPER added.
3344         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
3345       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
3346
3347 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3348       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
3349
3350 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3351       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
3352
3353 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3354       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
3355
3356 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3357       * Fix a few delete/delete[] mismatch
3358
3359 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3360       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
3361         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
3362         heuristics to get informations (look at different places).
3363       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
3364         sorting DICOM images based on different strategies.
3365       * modified Makefiles accordingly.
3366
3367 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3368       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
3369         when building in debug mode
3370       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
3371         src/win32/gdcmdll.dsp
3372       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
3373
3374 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3375       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
3376             to valgrind.
3377
3378 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3379       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
3380       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
3381                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
3382       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
3383
3384 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3385       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
3386         the file
3387       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
3388       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
3389         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
3390       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
3391         symbols... future problem ?
3392
3393 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3394       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
3395       * modified gdcm.dsw accordingly
3396
3397 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
3398       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
3399
3400 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3401       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
3402         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
3403       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
3404         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
3405         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
3406
3407 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3408       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
3409
3410 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3411       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
3412       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
3413       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
3414       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
3415       * PACKAGER : adding all concerning windows
3416
3417 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3418       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
3419         garbage debug code.
3420       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
3421       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
3422         test suite reported error.
3423       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
3424         packaging a new release).
3425       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
3426       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
3427       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
3428         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
3429         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
3430
3431 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3432       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
3433       * src/gdcmHeader.h : formatting code
3434
3435 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3436       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
3437         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
3438         is made in an internal list to prevent this problem.
3439         Bug fix when output is empty.
3440         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
3441         correction.
3442       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
3443
3444 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3445       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
3446       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
3447         files. Added method to remove all files on the input
3448         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
3449         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
3450
3451 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3452       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
3453         when using make instal.
3454       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
3455         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
3456
3457 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3458       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
3459       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
3460
3461 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3462       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
3463         linux and WINDOWS !
3464       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
3465       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
3466
3467 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3468       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
3469         addon of the jpeg library)
3470       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
3471       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
3472       * INSTALL now points to web documentation
3473
3474 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3475       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
3476         gdcmUtil.h anymore.
3477       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
3478         clean target.
3479       * src/gdcm*.[cxx|h] :
3480         - to allow compilation with gcc 3.x
3481           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
3482           -- small fixes on exceptions.
3483           Note: linking not tested !
3484         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
3485           building stage.
3486       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
3487         dependent convertion).
3488
3489 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3490       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
3491         Changelog):
3492         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
3493         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
3494           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
3495         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
3496
3497 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3498       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
3499         compile
3500       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
3501         (FileName -> Filename)
3502
3503 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3504       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
3505         - UpdateProgress method should now be effective
3506         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
3507           to volumes),
3508         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
3509           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
3510           accelerating things).
3511         - when building a stack of images/volumes, files which are not
3512           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
3513           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
3514           in the stack (for the caller to notice the problem).
3515
3516 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3517       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
3518
3519 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3520       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
3521         between standard library (std) and vtk library (problems are found
3522         under Windows... thanks Windows !)
3523
3524 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3525       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
3526         debug stage).
3527       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
3528
3529 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3530       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
3531
3532 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3533       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
3534         called with different flags than the default ones (with automake).
3535         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
3536            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
3537         and went for warning fixes:
3538         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
3539           up from unused variables.
3540         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
3541       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
3542
3543 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3544       * gdcmPython/gdcm.i:
3545         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
3546           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
3547           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
3548         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
3549           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
3550           exported to Python a as cvar.
3551       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
3552         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
3553         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
3554         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
3555         C++ static methods).
3556       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
3557         with the above changes.
3558
3559 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3560       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
3561
3562 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3563       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
3564         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
3565         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
3566          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
3567          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
3568            a wrapper
3569          - Wrapper interface which wrap sources
3570         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
3571         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
3572       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
3573         files for compilation
3574
3575 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
3576       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
3577         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
3578         - vtk/Makefile.am now builds a library
3579         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
3580           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
3581           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
3582           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
3583           import library.
3584         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
3585           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
3586           + vtk/vtkGdcmReader.so and
3587           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
3588           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
3589         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
3590           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
3591         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
3592           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
3593       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
3594       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
3595         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
3596         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
3597         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
3598         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
3599         collision of various stl members (principally cout...).
3600       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
3601         file.
3602       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
3603         comply with above changes)
3604
3605 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3606       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
3607       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
3608         vtk data structure (an image Flip was required).
3609       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
3610       * cosmetic changes in documentation.
3611
3612 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3613       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
3614         unexisting file is given as argument.
3615       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
3616         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
3617         containing those images is now available at
3618           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
3619         with the name gdcmData.
3620         All the python scripts (including the package initialisation file
3621         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
3622         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
3623
3624 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3625       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
3626         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
3627         demo of the usage of this class.
3628         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
3629         at configure (or autogen.sh) stage.
3630
3631 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3632       * More memory link related corrections and documentation fixes.
3633         Notes on valgrind:
3634           - maximum info is obtained with a command of the form:
3635             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
3636                      --show-reachable=yes PrintHeader
3637           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
3638             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
3639             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
3640             (in fact further invocation to the STL would recollect the
3641              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
3642       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
3643         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
3644         Note: some images don't seem to work e.g.
3645             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
3646       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
3647         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
3648         make gdcm more thread friendly.
3649
3650 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3651       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
3652           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
3653         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
3654           gdcmHeader::_dicom_vr.
3655         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
3656         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
3657           VRHT*.
3658         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
3659
3660 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3661       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
3662         make install stage.
3663
3664 2003-04-9 JPR
3665       * UpdateGroupLength replaced by new one
3666
3667 2003-04-7 JPR
3668       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
3669         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
3670
3671 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
3672       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
3673       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
3674       * src:
3675         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
3676         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
3677           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
3678         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
3679           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
3680           carried the same semantics.
3681           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
3682         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
3683           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
3684         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
3685       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
3686       * gdcmGetXSize added
3687       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
3688       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
3689
3690 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3691       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
3692         (to avoid double call by end user).
3693       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
3694         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
3695
3696 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3697       * gdcm/Doc many doxygen changes:
3698         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
3699           the html.users end users oriented documentation and
3700           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
3701           oriented documentation.
3702         - README changed accordingly
3703         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
3704         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
3705           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
3706         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
3707           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
3708           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
3709       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
3710         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
3711       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
3712         ill-formed documentation sections.
3713       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
3714
3715 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3716       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
3717       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
3718         un*ces with sh-utils test utility.
3719       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
3720       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
3721       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
3722       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
3723       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
3724
3725 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3726       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
3727       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
3728
3729 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3730       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
3731       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
3732       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
3733       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
3734         compilation work.
3735       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
3736       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
3737
3738 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3739       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
3740         hence the user doesn't need this explicit call.
3741         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
3742           i.e. LoadElements() call removed.
3743       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
3744         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
3745       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
3746         for adding user defined new tags.
3747         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
3748         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
3749           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
3750
3751 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
3752       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
3753         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
3754         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
3755         with the autotools, included the python wrappers part.
3756       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
3757
3758 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3759       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
3760
3761 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3762       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
3763         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
3764         for usage).
3765       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
3766         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
3767         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
3768       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
3769         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
3770
3771 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3772       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
3773         in InstallMode or PreInstallMode but with an environment given
3774         value of GDCM_DICT_PATH.
3775       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
3776
3777 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3778       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
3779       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
3780       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
3781         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
3782         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
3783
3784 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3785       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
3786         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
3787         gdcmHeader.h
3788       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
3789         (as opposed to gdcm.h)
3790       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
3791       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
3792         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
3793       * autogen.sh removed history related references to crea package.
3794
3795 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3796       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
3797         bug.
3798
3799 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3800       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
3801         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
3802         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
3803         of hidding away the python related distutils specific files
3804         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
3805         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
3806         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
3807         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
3808
3809 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3810       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
3811       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
3812         among the list of sources.
3813
3814 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3815       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
3816       * modifications in MSVC projects
3817
3818 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3819       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
3820         looks like we can move back to original usage of exception within
3821         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
3822         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
3823       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
3824         README file for usage added.
3825       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
3826         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
3827         testing the proper parsing of a Dicom related file.
3828         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
3829       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
3830       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
3831         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
3832           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
3833           Dicom public dictionary were not accessible without an
3834           instance of class gdcmHeader.
3835         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
3836           require no instances at all to be invocated.
3837         - within gdcmDictSet this change required to change some method
3838           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
3839           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
3840       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
3841         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
3842       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
3843         the above to be effective.
3844       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
3845         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
3846       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
3847         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
3848         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
3849         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
3850         (for python dectection).
3851       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
3852         now avoids publishing the empty entries.
3853
3854 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3855       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
3856         ExtraPath reused :-P
3857       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
3858
3859 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
3860       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
3861       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
3862       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
3863         and links
3864
3865 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3866       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
3867         method. Doxygenation.
3868       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
3869
3870 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3871       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
3872         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
3873         when using "python setup.py install".
3874       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
3875         reexports the working classes.
3876       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
3877         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
3878         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
3879         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
3880         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
3881         subdir (see the README file). This problem probably due to
3882         an combination of g++ and dynamic loading.
3883       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
3884
3885 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3886       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
3887         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
3888         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
3889         again in a python subdir, but the package itself is now in
3890         python/gdcmPython.
3891       * setup.py was cleaned up:
3892         - pythonIncludePath removed
3893         - python setup.py bdist target is now functional.
3894       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
3895         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
3896         accordingly.
3897
3898 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3899       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
3900       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
3901         distutils installer is operational.
3902       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
3903           shadow classes (from gdcm.py).
3904         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
3905           instead of gdcmPython/demo/load.py.
3906         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
3907
3908 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3909       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
3910         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
3911         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
3912         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
3913         dictionary.
3914         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had an unspecified fourth field
3915           are now in the "???" group.
3916         - python/gdcm.i changed accordingly,
3917         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
3918           of the above new functionalities in Python.
3919
3920 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3921       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
3922         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
3923           were definitively removed.
3924         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
3925       * src/gdcmElValSet.cxx:
3926         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
3927         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
3928         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
3929         - Added GetElementByName(string).
3930       * src/gdcmHeader.cxx: added
3931         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
3932         - GetPubElValRepByName(string)
3933         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
3934         - GetShaElValRepByName(string)
3935         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
3936         - GetShaElValRepByName(string)
3937         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
3938         - GetElValRepByName(string)
3939         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
3940         - GetElValRepByName(string)
3941       * Doc/requirements.txt added.
3942
3943 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3944       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
3945       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
3946         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
3947         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
3948         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
3949       * python/testSuite.py changed accordingly.
3950
3951 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
3952       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
3953         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
3954              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
3955               cannot be exported. [...]
3956               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
3957               be exported. [...]
3958               This is caused by a designed limitation that once a template
3959               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
3960               exported."
3961         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
3962         limitation" of VC++ is a pitfall.
3963         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
3964         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
3965         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
3966         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
3967         library.
3968         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
3969       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
3970          dll under windows !!!!)
3971       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
3972       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
3973         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
3974       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
3975         (one) of image(s).
3976       * removed glib references
3977       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
3978
3979 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3980       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
3981         that only displays required tags and testAll.py that parses all
3982         the files of the testsuite without using unittest.
3983       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
3984       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
3985       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
3986         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
3987
3988 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
3989       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
3990         values, but limits itself to values which are below a user specified
3991         size (by default 1024 bytes).
3992       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
3993         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
3994         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
3995         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
3996       * python/testSuite.py
3997         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
3998         - two new examples added.
3999       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
4000
4001 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4002       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
4003         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindLength().
4004       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
4005       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
4006       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
4007
4008 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4009       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
4010         the vr was also RET.
4011       * python/testSuite.py more tests added.
4012
4013 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4014       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
4015       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
4016       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
4017         7.18 Integer types (see stdint.h)
4018         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
4019       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
4020         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
4021         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
4022         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
4023         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
4024         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
4025         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
4026         The rest of the changes we the necessary adaptations.
4027
4028 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4029       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
4030         VR files.
4031       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
4032
4033 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4034       * Adaptation for porting to VC++:
4035         - src/gdcm.h
4036           o forced to use std namespace (for string to be known)
4037           o all class use __declspec export style on WIN32
4038         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
4039           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
4040       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
4041         variable GDCM_DICT_PATH.
4042       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
4043
4044 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4045       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
4046         to native Python dictionary.
4047       * python/demo/test.py:
4048         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
4049         - takes an optional filename argument (the file to parse).
4050       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
4051         PubElVals hashing table.
4052       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
4053
4054 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4055       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
4056         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
4057       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
4058       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
4059       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
4060         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
4061       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
4062
4063 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4064       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
4065         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
4066         that we can import the shadow classes without errors].
4067
4068 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4069       * hashtest.cxx removed (since already in Test)
4070       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
4071       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
4072       * src/Makefile prepared for python wrapping
4073
4074 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4075       * src/gdcmHeader.cxx :
4076         - Parsing of header is now separated from loading of element values
4077           (see gdcmHeader::LoadElements).
4078         - general clean up of hopefully all file access (creation of
4079           ReadInt16 and ReadInt32)
4080
4081 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4082       * src/gdcmHeader.cxx :
4083         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
4084           method.
4085         - SetLgrElem renamed to SetLength
4086         - GetLgrElem renamed to GetLength
4087         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
4088       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
4089       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
4090         due to IdoDude was cleaned out.
4091
4092 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4093       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
4094         concentrates on finding the value representation (when it exists).
4095         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
4096         returning the unecessary skL (skipped length).
4097         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
4098         it was redundant with the File position internals (by using
4099         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
4100         jajun.
4101       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
4102         on the libido specificities which are handled through class
4103         inheritance.
4104       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
4105         added.
4106
4107 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4108       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
4109         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
4110
4111 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4112       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
4113
4114 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4115       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
4116         and _IdDcmSWAP_LONG.
4117
4118 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
4119       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
4120         May 23 2002. Needless to say we are running late...
4121