]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
update ChangeLog
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
2      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
3
4 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
5      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' iterator on last
6              of the last synonym :-(
7      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except for
8              DICOMDIR ;-)            
9      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting      
10      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
11      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
12            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
13            ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull 
14
15 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
16      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
17                        no longer writes 'Un' on disk
18      * FIX  SQ elements with actual length are now dealt with corectly
19      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
20                      the length (for Palette expanded omages) 
21                      and Raw Length (non expanded image + Palette)
22       * FIX  Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
23                      (that broke Write). Replaced by UL.
24                      Aware user will reload the field if he 
25                      thinks it's necesssary
26                        
27 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
28      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
29        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
30        IsReadable() methods.
31        
32      * gdcmHederlHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
33       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
34       but so usefull for people that miss them ;-)
35       
36      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
37        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
38
39 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
40      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
41
42 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
43      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
44              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
45              The TRUE value for this param has to be used 
46              with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
47              ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
48      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
49              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
50              element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
51              
52      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
53              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
54              Fixed
55                      
56      * gdcmHeader add the method
57              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
58              to get *all* the Header Entries with the same tag.
59              GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
60              (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
61
62 2004-01-26 Benoit Regrain
63      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
64        in the print and add a third level of print to print them
65
66 2004-01-23 Benoit Regrain
67      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
68      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
69      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
70        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
71
72 2004-01-22 Benoit Regrain
73      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
74      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
75
76 2004-01-19 Benoit Regrain
77      * Add the use of shadow dictionaries
78      * bug fix and coding style
79
80 2004-01-19 Benoit Regrain
81      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
82      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
83      * Add the update of header entries using the shadow library
84
85 2004-01-19 Benoit Regrain
86     * removal of file gdcmHeader2.cxx
87     * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
88       inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
89       of dicom dir parsing
90     * bug fix under python
91
92 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
93     * removal of class gdcmHeaderEntrySet
94     * removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
95     * add file gdcmHeader2.cxx 
96     * add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
97
98 2004-01-15 Benoit Regrain
99      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
100        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
101        when the gdcmDictSet will be destroyed
102      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
103        gdcmDictSet
104
105 2004-01-15 Benoit Regrain
106      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
107        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
108        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
109        some memory and vtk seems to have some problems with that.
110      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
111
112 2004-01-14 Benoit Regrain
113      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
114      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
115      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
116      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
117
118 2004-01-13 Benoit Regrain
119      * src/*.[h|cxx] : coding style
120      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
121
122 2004-01-13 Benoit Regrain
123      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
124      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
125        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
126      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
127
128 2004-01-12 Benoit Regrain
129      * src/*.h : add comments
130      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
131      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
132        directly setted in the source code
133      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
134        gdcmTS and gdcmVR
135
136 2004-01-09 Benoit Regrain
137      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
138      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
139
140 2004-01-07 Benoit Regrain
141      * Modification to compile with the distutils.
142      * Bug fix in code
143
144 2003-12-10 Benoit Regrain
145      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
146        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
147      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
148        made in the source code
149
150 2003-12-10 Benoit Regrain
151      * Update Windows projects and .cvsignore files
152
153 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
154      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
155            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
156            if he wants to.
157            gdcmElValSet:Print takes it into account
158
159 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
160      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
161      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
162      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
163
164 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
165       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
166              on the ListTag listElem member,
167              not longer on the TagElValueHT tagHt member
168       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
169              with the tagHt member and the listElem member.
170              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
171
172       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
173              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
174                             if bug fixing is necessary), for internal
175                             use only
176              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
177                             or to allow Parser going on.
178              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
179              with a length (not 0000) is found
180       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
181                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
182                 (to be written)
183
184 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
185      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
186      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
187           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
188           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
189
190 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
191      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
192
193 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
194      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
195           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
196
197 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
198      * in testSuite.py : new files names for checking the package
199      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
200              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
201              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
202
203 2003-11-05 Benoit Regrain
204      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
205                        : Explicit error messages
206      * in __init__.py  : Related modif
207
208 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
209      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
210            to be used by aware (vtk) users that want to manage
211            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
212      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
213                     (vtkGdcmReader compliant)              
214            
215 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
216      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
217        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
218        
219 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
220      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
221            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
222            
223 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
224      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
225                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
226              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
227              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
228              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
229              such an image : 
230              After gdcmHeader :
231                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
232                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
233                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
234      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
235              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
236
237 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
238      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
239              
240 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
241      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
242            being coherents dicom files.
243      
244 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
245      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
246            from medcon lib !
247      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
248      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
249      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
250      *ENH: Add include dir to medcon lib
251      *FIX: only one function is being exported for now ! 
252            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
253             
254 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
255       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
256                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
257                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
258       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
259       
260 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
261       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
262  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
263                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
264        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
265        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
266            
267 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
268       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
269                                                
270 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
271       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
272       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
273       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
274       
275 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
276       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
277       * ENH: Try adding a search script for python site-package
278       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
279       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
280       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
281       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
282              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
283              But it fasten debug compilation time.
284             
285 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
286       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
287         (they are compressed as 2 planes images, 
288          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
289
290 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
291      * Now CheckRead takes into account :
292             the bugged 'Leonardo' Siemens images
293             the XA images, sent thru the burning VPRO station
294      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
295      (breaks DicomWorks)
296
297 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
298       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
299              one should remove the '\'
300              
301 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
302       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
303         (wrong lengths in header)
304         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
305       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
306         (breaks DicomWorks)
307
308 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
309       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
310         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
311
312 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
313       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
314       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
315
316 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
317       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
318      
319 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
320       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
321         (the patch is easy to remove)
322       * cosmetic changes to avoid warnings
323       
324 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
325       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
326         no need to press 'r' now.
327         
328 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
329       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
330         to new Jpeg Lossless decompressor
331        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
332        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
333        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
334                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
335 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
336       * general anonymisation in gdcmData
337       * adding the 'color files' from
338          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
339       * adding some well knowed bugged-header images
340       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
341          waiting for their inclusion in Python testsuite
342
343 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
344     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
345       no longer seg faults when file is not found
346
347 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
348      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
349
350 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
351      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
352
353 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
354      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
355         OpenFile takes it into account
356      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
357      * Missing elements added in dicomV3.dic
358       (just to be affraid : have a look at
359        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
360        and do it again next year ;->
361
362 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
363      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
364        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
365        But there are NOT. It's fixed !
366        
367 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
368      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
369      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
370          
371 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
372      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
373              an ACR-NEMA / DICOM one.
374      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
375              is not gdcm Readable
376      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
377              is now decoded.
378              
379 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
380      * FIX: CMake generate now documentation
381      * ENH: out of source doc build !
382      * ENH: Generate both user and dev documentation
383      * ENH: Should work on windows too
384      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
385      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
386      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
387      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
388                      
389 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
390      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
391      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
392      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
393         window level & window width
394
395 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
396      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
397      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
398      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
399      
400 2003-10-06  Emanuel Ollart
401      * FIX : compilation process wad broken.
402              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
403              
404 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
405      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
406      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
407      
408 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
409      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
410            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
411                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
412       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
413
414 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
415       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
416         to remain compliant with already defined strings, 
417         like Transfert Syntax UID and others)
418
419 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
420       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
421              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
422              
423 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
424       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
425       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
426
427 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
428       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
429         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
430               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
431       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
432
433 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
434       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
435
436 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
437       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
438         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
439
440 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
441       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
442          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
443          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
444          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
445           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
446           (no sample found :-(
447
448 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
449       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
450         Two reasons: - clear things
451                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
452                      suffer anymore VC++ complains
453 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
454       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
455       * removed leaks
456                      
457 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
458       * The lines are now eigthy characters long.for 
459         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
460
461 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
462       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
463         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
464         previous commis of Malaterre)
465       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
466         before the last Malaterre's commit.
467
468 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
469       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
470         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
471       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
472         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
473
474 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
475       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
476         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
477         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
478
479 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
480       * Cosmetic changes:
481         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
482           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
483           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
484           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
485         - PACKAGER corrected
486         - DEVELOPPER added.
487         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
488       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
489
490 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
491       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
492
493 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
494       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
495
496 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
497       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
498
499 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
500       * Fix a few delete/delete[] mismatch
501
502 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
503       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
504       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
505       heuristics to get informations (look at different places).
506       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
507       sorting DICOM images based on different strategies.
508       * modified Makefiles accordingly.
509
510 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
511       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
512         when building in debug mode
513       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
514         src/win32/gdcmdll.dsp
515       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
516
517 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
518       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
519
520 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
521       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
522       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
523       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
524
525 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
526       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
527         the file
528       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
529       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
530         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
531       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
532         symbols... future problem ?
533
534 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
535       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
536       * modified gdcm.dsw accordingly
537
538 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
539       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
540
541 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
542       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
543         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
544       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
545         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
546         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
547
548 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
549       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
550
551 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
552       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
553       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
554       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
555       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
556       * PACKAGER : adding all concerning windows
557
558 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
559       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
560         garbage debug code.
561       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
562       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
563         test suite reported error.
564       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
565         packaging a new release).
566       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
567       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
568       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
569         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
570         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
571
572 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
573       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
574       * src/gdcmHeader.h : formatting code
575
576 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
577       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
578         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
579         is made in an internal list to prevent this problem.
580         Bug fix when output is empty.
581         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
582         correction.
583       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
584
585 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
586       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
587       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
588         files. Added method to remove all files on the input
589         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
590         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
591
592 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
593       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
594         when using make instal.
595       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
596         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
597
598 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
599       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
600       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
601
602 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
603       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
604         linux and WINDOWS !
605       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
606       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
607
608 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
609       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
610         addon of the jpeg library)
611       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
612       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
613       * INSTALL now points to web documentation
614
615 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
616       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
617         gdcmUtil.h anymore.
618       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
619         clean target.
620       * src/gdcm*.[cxx|h] :
621         - to allow compilation with gcc 3.x
622           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
623           -- small fixes on exceptions.
624           Note: linking not tested !
625         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
626           building stage.
627       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
628         dependent convertion).
629
630 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
631       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
632         Changelog):
633         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
634         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
635           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
636         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
637
638 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
639       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
640         compile
641       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
642         (FileName -> Filename)
643
644 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
645       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
646         - UpdateProgress method should now be effective
647         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
648           to volumes),
649         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
650           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
651           accelerating things).
652         - when building a stack of images/volumes, files which are not
653           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
654           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
655           in the stack (for the caller to notice the problem).
656
657 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
659
660 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
661       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
662         between standard library (std) and vtk library (problems are found
663         under Windows... thanks Windows !)
664
665 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
667         debug stage).
668       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
669
670 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
671       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
672
673 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
674       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
675         called with different flags than the default ones (with automake).
676         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
677            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
678         and went for warning fixes:
679         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
680           up from unused variables.
681         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
682       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
683
684 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
685       * gdcmPython/gdcm.i:
686         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
687           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
688           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
689         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
690           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
691           exported to Python a as cvar.
692       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
693         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
694         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
695         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
696         C++ static methods).
697       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
698         with the above changes.
699
700 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
701       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
702
703 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
704       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
705         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
706         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
707          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
708          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
709            a wrapper
710          - Wrapper interface which wrap sources
711         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
712         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
713       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
714         files for compilation
715
716 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
717       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
718         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
719         - vtk/Makefile.am now builds a library
720         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
721           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
722           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
723           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
724           import library.
725         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
726           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
727           + vtk/vtkGdcmReader.so and
728           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
729           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
730         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
731           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
732         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
733           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
734       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
735       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
736         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
737         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
738         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
739         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
740         collision of various stl members (principally cout...).
741       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
742         file.
743       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
744         comply with above changes)
745
746 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
747       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
748       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
749         vtk data structure (an image Flip was required).
750       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
751       * cosmetic changes in documentation.
752
753 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
754       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
755         unexisting file is given as argument.
756       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
757         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
758         containing those images is now available at
759           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
760         with the name gdcmData.
761         All the python scripts (including the package initialisation file
762         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
763         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
764
765 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
766       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
767         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
768         demo of the usage of this class.
769         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
770         at configure (or autogen.sh) stage.
771
772 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
773       * More memory link related corrections and documentation fixes.
774         Notes on valgrind:
775           - maximum info is obtained with a command of the form:
776             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
777                    --show-reachable=yes PrintHeader
778           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
779             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
780             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
781             (in fact further invocation to the STL would recollect the
782              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
783       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
784         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
785         Note: some images don't seem to work e.g.
786             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
787       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
788         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
789         make gdcm more thread friendly.
790
791 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
792       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
793           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
794         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
795           gdcmHeader::_dicom_vr.
796         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
797         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
798           VRHT*.
799         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
800
801 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
802       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
803         make install stage.
804
805 2003-04-9 JPR
806       * UpdateGroupLength replaced by new one
807
808 2003-04-7 JPR
809       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
810         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
811
812 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
813       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
814       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
815       * src:
816         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
817         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
818           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
819         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
820           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
821           carried the same semantics.
822           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
823         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
824           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
825         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
826       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
827       * gdcmGetXSize added
828       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
829       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
830
831 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
832       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
833         (to avoid double call by end user).
834       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
835         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
836
837 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
838       * gdcm/Doc many doxygen changes:
839         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
840           the html.users end users oriented documentation and
841           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
842           oriented documentation.
843         - README changed accordingly
844         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
845         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
846           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
847         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
848           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
849           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
850       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
851         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
852       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
853         ill-formed documentation sections.
854       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
855
856 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
857       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
858       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
859         un*ces with sh-utils test utility.
860       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
861       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
862       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
863       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
864       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
865
866 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
867       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
868       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
869
870 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
871       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
872       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
873       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
874       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
875         compilation work.
876       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
877       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
878
879 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
880       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
881         hence the user doesn't need this explicit call.
882         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
883           i.e. LoadElements() call removed.
884       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
885         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
886       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
887         for adding user defined new tags.
888         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
889         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
890           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
891
892 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
893       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
894         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
895         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
896         with the autotools, included the python wrappers part.
897       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
898
899 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
900       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
901
902 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
903       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
904         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
905         for usage).
906       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
907         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
908         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
909       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
910         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
911
912 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
913       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
914         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
915         value of GDCM_DICT_PATH.
916       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
917
918 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
919       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
920       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
921       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
922         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
923         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
924
925 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
926       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
927         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
928         gdcmHeader.h
929       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
930         (as opposed to gdcm.h)
931       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
932       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
933         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
934       * autogen.sh removed history related references to crea package.
935
936 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
937       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
938         bug.
939
940 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
941       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
942         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
943         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
944         of hidding away the python related distutils specific files
945         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
946         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
947         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
948         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
949
950 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
951       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
952       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
953         among the list of sources.
954
955 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
956       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
957       * modifications in MSVC projects
958
959 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
960       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
961         looks like we can move back to original usage of exception within
962         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
963         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
964       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
965         README file for usage added.
966       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
967         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
968         testing the proper parsing of a Dicom related file.
969         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
970       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
971       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
972         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
973           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
974           Dicom public dictionnary were not accessible without an
975           instance of class gdcmHeader.
976         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
977           require no instances at all to be invocated.
978         - within gdcmDictSet this change required to change some method
979           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
980           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
981       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
982         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
983       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
984         the above to be effective.
985       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
986         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
987       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
988         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
989         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
990         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
991         (for python dectection).
992       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
993         now avoids publishing the empty entries.
994
995 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
996       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
997         ExtraPath reused :-P
998       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
999
1000 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1001       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1002       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1003       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1004         and links
1005
1006 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1007       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1008         method. Doxygenation.
1009       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1010
1011 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1012       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1013         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1014         when using "python setup.py install".
1015       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1016         reexports the working classes.
1017       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1018         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1019         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1020         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1021         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1022         subdir (see the README file). This problem probably due to
1023         an combination of g++ and dynamic loading.
1024       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1025
1026 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1027       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1028         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1029         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1030         again in a python subdir, but the package itself is now in
1031         python/gdcmPython.
1032       * setup.py was cleaned up:
1033         - pythonIncludePath removed
1034         - python setup.py bdist target is now functional.
1035       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1036         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1037         accordingly.
1038
1039 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1040       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1041       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1042         distutils installer is operational.
1043       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1044           shadow classes (from gdcm.py).
1045         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1046           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1047         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1048
1049 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1050       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1051         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1052         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1053         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1054         dictionary.
1055         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1056           are now in the "???" group.
1057         - python/gdcm.i changed accordingly,
1058         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1059           of the above new functionalities in Python.
1060
1061 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1062       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1063         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1064           were definitively removed.
1065         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1066       * src/gdcmElValSet.cxx:
1067         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1068         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1069         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1070         - Added GetElementByName(string).
1071       * src/gdcmHeader.cxx: added
1072         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1073         - GetPubElValRepByName(string)
1074         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1075         - GetShaElValRepByName(string)
1076         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1077         - GetShaElValRepByName(string)
1078         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1079         - GetElValRepByName(string)
1080         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1081         - GetElValRepByName(string)
1082       * Doc/requirements.txt added.
1083
1084 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1085       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1086       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1087         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1088         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1089         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1090       * python/testSuite.py changed accordingly.
1091
1092 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1093       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1094         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1095              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1096               cannot be exported. [...]
1097               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1098               be exported. [...]
1099               This is caused by a designed limitation that once a template
1100               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1101               exported."
1102         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1103         limitation" of VC++ is a pitfall.
1104         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1105         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1106         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1107         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1108         library.
1109         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1110       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1111          dll under windows !!!!)
1112       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1113       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1114         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1115       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1116         (one) of image(s).
1117       * removed glib references
1118       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1119
1120 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1121       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1122         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1123         the files of the testsuite without using unittest.
1124       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1125       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1126       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1127         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1128
1129 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1130       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1131         values, but limits itself to values which are below a user specified
1132         size (by default 1024 bytes).
1133       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1134         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1135         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1136         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1137       * python/testSuite.py
1138         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1139         - two new examples added.
1140       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1141
1142 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1143       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1144         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1145       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1146       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1147       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1148
1149 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1150       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1151         the vr was also RET.
1152       * python/testSuite.py more tests added.
1153
1154 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1155       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1156       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1157       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1158         7.18 Integer types (see stdint.h)
1159         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1160       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1161         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1162         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1163         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1164         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1165         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1166         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1167         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1168
1169 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1170       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1171         VR files.
1172       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1173
1174 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1175       * Adaptation for porting to VC++:
1176         - src/gdcm.h
1177           o forced to use std namespace (for string to be known)
1178           o all class use __declspec export style on WIN32
1179         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1180           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1181       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1182         variable GDCM_DICT_PATH.
1183       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1184
1185 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1186       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1187         to native Python dictionary.
1188       * python/demo/test.py:
1189         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1190         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1191       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1192         PubElVals hashing table.
1193       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1194
1195 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1196       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1197         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1198       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1199       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1200       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1201         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1202       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1203
1204 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1205       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1206         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1207         that we can import de shadow classes without errors].
1208
1209 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1210       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1211       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1212       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1213       * src/Makefile prepared for python wrapping
1214
1215 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1216       * src/gdcmHeader.cxx :
1217         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1218           (see gdcmHeader::LoadElements).
1219         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1220           ReadInt16 and ReadInt32)
1221
1222 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1223       * src/gdcmHeader.cxx :
1224         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1225           method.
1226         - SetLgrElem renamed to SetLength
1227         - GetLgrElem renamed to GetLength
1228         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1229       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1230       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1231         due to IdoDude was cleaned out.
1232
1233 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1234       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1235         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1236         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1237         returning the unecessary skL (skipped length).
1238         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1239         it was redundant with the File position internals (by using
1240         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1241         jajun.
1242       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1243         on the libido specificities which are handled through class
1244         inheritance.
1245       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1246         added.
1247
1248 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1249       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1250         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1251
1252 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1253       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1254
1255 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1256       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1257         and _IdDcmSWAP_LONG.
1258
1259 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1260       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1261         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1262