]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
fcadcbf2d0af0c2c840e2f4b2ba3a02d61083b5c
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-07-27 Jean-Pierre Roux
2   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
3     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
4
5 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
6   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
7        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
8                  
9 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
10   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
11         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
12
13 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
14    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
15    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
16      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
17      is now in static in the gdcmDebug class
18    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
19    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
20
21 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
22    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
23      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
24    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
25      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
26      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
27      that displays position and size).
28    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
29      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
30      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
31      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
32      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
33      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
34      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
35         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
36      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
37      commiting changes).
38    * Test/CMakeLists.txt:
39       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
40       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
41         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
42         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
43    * TODO updated.
44
45 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
46    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
47      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
48      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
49      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
50      - removal of typedef duplication.
51      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
52      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
53    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
54       - printf polluting ctest removed.
55       - TAB removal for comminting
56    * Test:
57      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
58        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
59        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
60        this test creates them.
61        Note: we need to validate each reference image, but before that
62              I'd like to rename them with a more explicit name...
63      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
64    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
65      including each header needed).
66
67 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
68    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
69      test suite to the Example directory. Are concerned:
70      - PrintHeader.cxx
71      - TestDcm2Acr.cxx
72      - TestFindTags.cxx
73      - TestWrite.cxx was
74      - TestWriteSimple.cxx
75    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
76      image gdcmData/oldACR00001.ima
77
78 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
79    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
80      with removal from gdcmData):
81       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
82       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
83       - US.3405.1.dcm
84      Added the following because after last cvs update, they cause
85        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
86      to segfault:
87       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
88       - oldACR00001.ima
89    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
90      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
91      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
92      form of test...
93    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
94      we don't need to black list the following images anymore:
95       - 8BitsUncompressedColor.dcm
96       - OT-PAL-8-face.dcm
97       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
98    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
99      fixes and the beautified code ;-)
100      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
101      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
102      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
103            improve the test suite). The bug could be detected by using
104            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
105            or by using
106            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
107            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
108
109 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
110    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
111          - replace by uggly but working old code :-(
112                 A lot of things should be OK again.
113         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
114         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
115         (twice, withing a fortnigh ...)         
116
117 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
118    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
119      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
120    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
121      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
122      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
123                    - OT-PAL-8-face.dcm
124                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
125    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
126      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
127      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
128      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
129      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
130      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
131      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
132      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
133      image.
134    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
135      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
136      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
137      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
138    
139 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
140   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
141   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
142                           (instead of infinite loop)
143   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
144
145 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
146    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
147
148 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
149    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
150                     when SamplesPerPixel =3
151          - now Write is no longer confused by 
152                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
153          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
154                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
155    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
156                     (in order to split the job that has not to be done 
157                                         for gdcmDicomDir)
158
159 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
160    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
161      loop on the same image until memory went out. 
162      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
163    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
164      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
165
166 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
167    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
168             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
169                                 is added a the end, when necessary.
170             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
171                       now written correctly
172                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
173                                 (even for odd groups) 
174         Note : only Explicit Value Representation was checked.
175                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
176
177 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
178    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
179    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
180      coding style).
181
182 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
183    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
184      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
185    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
186
187 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
188    FIX : gdcmDocument.cxx
189       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
190         code 'beautyfication' :-(
191       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
192
193 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
194    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
195                  : to allow user to create his own Sequences
196         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
197
198 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
199         
200         - gdcmBinEntry
201           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
202           
203    - gdcmDocEntry
204           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
205           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
206           
207         - gdcmDocEntrySet
208           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
209           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
210      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
211      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
212      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
213      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
214                                             guint16 element,
215                                             std::string vr     = "unkn",
216                                             std::string fourth = "unkn",
217                                             std::string name   = "unkn"); 
218           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
219      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
220      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
221      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
222      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
223      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
224           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
225      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
226           
227         - gdcmDocument
228      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
229      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
230      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
231      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
232      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
233                                         FILE *_fp, FileType type);
234      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
235      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
236      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
237      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
238      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
239      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
240      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
241      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
242                                             guint16 element,
243                                             std::string vr     = "unkn",
244                                             std::string fourth = "unkn",
245                                             std::string name   = "unkn");
246      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
247      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
248      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
249      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
250                                                                                                                  
251         - gdcmElementSet
252           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
253           
254    - gdcmSeqEntry
255           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
256  
257    - gdcmSQItem
258      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
259      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
260      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
261      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
262
263    - gdcmValEntry
264          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
265                                   
266 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
267     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
268       The default constructor invoked by the line
269          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
270       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
271       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
272       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
273     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
274       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
275       Could anyone explain why ?
276     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
277       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
278       code related to gdcmBinEntry).
279
280 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
281     * In order to fix memory leaks:
282      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
283        some delete calls.
284      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
285      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
286        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
287        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
288        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
289      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
290      - src/gdcmDocument.cxx:
291        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
292           from dynamic stores.
293        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
294           was causing memory leaks.
295      - src/gdcmSQItem.cxx:
296        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
297           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
298        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
299           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
300           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
301           This avoids SegFaulting.
302      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
303     * Conclusion:
304      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
305        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
306        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
307      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
308        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
309      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
310        segfaults).
311     * Erroneous leading white fix:
312      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
313        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
314      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
315      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
316     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
317     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
318
319
320 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
321     * In order to fix writing of dicom files:
322      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
323      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
324      - src/gdcmDocument.cxx:
325        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
326        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
327        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
328           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
329           manner.
330        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
331           to only declared) and build on top of
332           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
333        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
334      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
335        for usage in destructor and treatement of promotion in
336        ::ReplaceOrCreateByNumber().
337      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
338       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
339     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
340       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
341       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
342       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
343
344 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
345     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
346       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
347       learned that:
348           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
349           soon as possible by globally disabling memory caching.
350           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
351           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
352       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
353       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
354       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
355     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
356       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
357       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
358       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
359         with 1.
360       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
361       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
362       understand why the list is empty...).
363     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
364     * Doc/License.txt added.
365
366 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
367     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
368       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
369         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
370         the padding problem.
371       - general clean up, simplification, and coding style.
372       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
373     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
374
375 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
376    *  gdcmSeqEntry.cxx
377            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
378                 - fix the display of SQItem ordinal number
379       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
380                 - remove some useless never written private methods     
381                 
382 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
383    * gdcmBinEntry.cxx 
384       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
385            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
386               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
387                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
388    * dcmDocument.cxx
389       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
390               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
391            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
392       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
393    * gdcmFile.cxx
394       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
395    * gdcmSQItem.h
396       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
397             a (relative) Item identier inside a given Sequence
398             \warning : some pb remaining around this number
399                                 will be solved asap
400       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
401    * gdcmValEntry.cxx 
402       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
403
404 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
405     * Memory leak hunt with the following command:
406       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
407                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
408       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
409       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
410       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
411           grep "MEMORY LEAK" src/*
412       Here are two typical examples which I can't help fixing:
413       -----
414           #include <string>
415           int main() {
416              std::string name;
417              char * test = "babo";
418              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
419                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
420              name.clear();   //// Doesn't help !
421              return 0;
422           }
423       -----
424           #include <string>
425           #include <iostream>
426           int main() {
427              std::string line;
428              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
429              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
430                                         //// of 1320 bytes in call to
431                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
432             return 0;
433           }
434       -----
435
436
437 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
438     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
439       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
440         and related, moved away to gdcmDocument.
441       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
442         the corresponding protected accessors of inherited class
443         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
444         declared friend of class gdcmDocument (see below).
445       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
446       - Clean up of undefined or unused methods.
447     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
448       account the changes to gdcmHeader.h).
449     * src/gdcmDocument.h:
450       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
451         changes to gdcmHeader.h).
452       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
453         (see changes to gdcmHeader.h).
454       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
455       - Clean up of undefined or unused methods.
456     * src/gdcmDocument.cxx:
457       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
458       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
459       - some std::string properly set to VRKey
460     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
461       references to gdcmDocument. 
462     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
463     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
464       cvs repository gdcmData.
465
466 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
467     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
468     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
469       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
470     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
471     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
472       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
473     * src/gdcmDocument.cxx: 
474       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
475         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
476       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
477         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
478         removed. Reverting to previous code segment with the proper
479         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
480         Note: this was (partially) breaking the python test suite
481               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
482               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
483     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
484     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
485       now taken into account.
486     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
487       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
488     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
489       on posix.
490     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
491       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
492     * .... alas, the python testSuite is still broken.
493
494 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
495     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
496       gdcmGlob
497     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
498     * src/gdcmUtil.h : export methods
499
500 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
501     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
502       to right behavior
503     * Initial addition of automatic python testing
504     * Initial addition of automatic image comparison
505
506 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
507     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
508       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
509
510 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
511      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
512      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
513      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
514
515 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
516      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
517        new concepts (and new classes) :
518        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
519         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
520         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
521        a Sequence is composed of Items.
522        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
523        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
524        (never taken into account)
525        Our unability to add a new 'entry' in the header
526        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
527        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
528        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
529        nothing is finished.
530        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
531
532 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
533      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
534      
535 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
536      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
537        file prefix (SetFilePrefix)
538
539 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
540      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
541        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
542        baseline.
543      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
544        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
545
546 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
547      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
548        dicom image
549
550 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
551      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
552      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
553        between the developper and user version.
554      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
555      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
556
557 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
558      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
559        when using cmake.
560
561 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
562      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
563                src directory, now generated in the build dir.
564             2. Tests as mentionned smarter
565             3. Some clean up
566             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
567           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
568           where we could set the institution name / patient name...
569
570        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
571               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
572                  (this was not true before)
573
574 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
575      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
576            SeQuence indented printing of Dicom Header.
577      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
578            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
579            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
580      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
581            tree-like structure of a Dicom Header.
582      * FIX Test code cleaning     
583            
584 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
585      * ENH: Adding automatic testing
586        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
587        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
588        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
589        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
590           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
591           too many projects
592      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
593      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
594        one file instead of seven + some small cleanup
595
596 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
597      * ENH Minor changes to the Print() methods.
598      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
599            Header printing. Example given with :
600            > PrintHeader fileName  2 new
601           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
602            
603 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
604      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
605          1. I have added some unsigned where needed
606          2. Some function parameter not used -> (void)
607          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
608          4. g++ don't like character '\' in comment
609          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
610                     this really need to be fixed
611          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
612          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
613                     this also really need to be fixed
614          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
615                     remove compression file 
616                     (as we only do decompression, right ?)     
617      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
618
619 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
620      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
621            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
622            defaulted to yspacing
623            
624 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
625      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
626      * ENH add parameters :
627                bool  exception_on_error = false, 
628                bool  enable_sequences   = false,
629                bool  ignore_shadow      = false
630            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
631      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
632            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
633               
634 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
635      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
636      
637 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
638      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
639      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
640              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
641              
642 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
643      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
644          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
645
646 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
647      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
648        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
649        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
650        in gdcmHeader.
651      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
652        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
653        already does the job.
654      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
655        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
656
657 2004-03-30 Benoit Regrain
658      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
659        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
660        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
661
662 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
663      * ENH : Check on file type to be written moved
664              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
665      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
666              when end-of-list is reached
667            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
668
669 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
670      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
671      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
672      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
673        equivalent to ExplicitVR in existing code).
674
675 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
676      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
677        now contains all the gdcmGlobal related code.
678      * minor coding style and doxygenation changes.
679
680 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
681      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
682        now contains all the Debug related code.
683      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
684      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
685        CreateCleanString) removed.
686      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
687      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
688      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
689      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
690        src/gdcmDirList.cxx)
691
692 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
693      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
694
695 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
696      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
697            big endian made volumes
698      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
699            end user to instanciate class gdcmParser
700           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
701
702 2004-03-22 Benoit Regrain
703      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
704      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
705              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
706
707 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
708      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
709            an already existing DICOMDIR file is consistent with
710            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
711            or build from the files held (recursively) in a Directory
712            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
713            gdcmObject::SetBoundaries() added
714
715 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
716      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
717                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
718      * FIX now file names and directory name are written properly in the
719            DICOMDIR
720      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
721            about the name
722
723 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
724      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
725                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
726
727 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
728      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
729            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
730            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
731            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
732            to allow making gdcDicomDir object.
733      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
734           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
735
736 2004-02-11 Benoit Regrain
737      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
738              when using from python
739
740 2004-02-10 Benoit Regrain
741      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
742      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
743      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
744              directory parsing
745
746 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
747      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
748              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
749              - class gdcmMeta created
750      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
751              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
752      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
753
754 2004-02-05 Benoit Regrain
755      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
756              header entries
757      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
758      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
759
760 2004-02-04 Benoit Regrain
761      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
762      * FIX : sort the images in the dicom dir
763      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
764      * ADD : a python demo
765
766 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
767      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
768      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
769              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
770              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
771              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
772      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
773            to make full checking easier
774         
775 2004-02-04 Benoit Regrain
776      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
777      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
778
779 2004-02-03 Benoit Regrain
780      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
781      * gdcmDicomDir : add the load of directory
782      * Bug fix and print add-on
783
784 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
785      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
786      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
787      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
788      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
789            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
790         
791 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
792      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
793              iterator on last
794              of the last synonym :-(
795      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
796              for DICOMDIR ;-)
797      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
798      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
799      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
800            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
801       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
802
803 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
804      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
805            no longer writes 'Un' on disk
806      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
807      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
808            the length (for Palette expanded images)
809            and Raw Length (non expanded image + Palette)
810      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
811            (that broke Write). Replaced by UL.
812            Aware user will reload the field if he 
813            thinks it's necesssary
814              
815 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
816      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
817        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
818        IsReadable() methods.
819        
820      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
821       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
822       but so usefull for people that miss them ;-)
823       
824      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
825        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
826
827 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
828      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
829
830 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
831      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
832              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
833         The TRUE value for this param has to be used 
834         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
835         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
836      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
837              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
838         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
839         
840      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
841              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
842              Fixed
843
844      * gdcmHeader add the method
845              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
846         to get *all* the Header Entries with the same tag.
847         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
848         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
849
850 2004-01-26 Benoit Regrain
851      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
852        in the print and add a third level of print to print them
853
854 2004-01-23 Benoit Regrain
855      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
856      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
857      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
858        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
859
860 2004-01-22 Benoit Regrain
861      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
862      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
863
864 2004-01-19 Benoit Regrain
865      * Add the use of shadow dictionaries
866      * bug fix and coding style
867
868 2004-01-19 Benoit Regrain
869      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
870      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
871      * Add the update of header entries using the shadow library
872
873 2004-01-19 Benoit Regrain
874      * removal of file gdcmHeader2.cxx
875      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
876        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
877        of dicom dir parsing
878      * bug fix under python
879
880 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
881     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
882     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
883     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
884     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
885
886 2004-01-15 Benoit Regrain
887      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
888        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
889        when the gdcmDictSet will be destroyed
890      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
891        gdcmDictSet
892
893 2004-01-15 Benoit Regrain
894      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
895        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
896        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
897        some memory and vtk seems to have some problems with that.
898      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
899
900 2004-01-14 Benoit Regrain
901      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
902      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
903      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
904      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
905
906 2004-01-13 Benoit Regrain
907      * src/*.[h|cxx] : coding style
908      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
909
910 2004-01-13 Benoit Regrain
911      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
912      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
913        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
914      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
915
916 2004-01-12 Benoit Regrain
917      * src/*.h : add comments
918      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
919      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
920        directly setted in the source code
921      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
922        gdcmTS and gdcmVR
923
924 2004-01-09 Benoit Regrain
925      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
926      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
927
928 2004-01-07 Benoit Regrain
929      * Modification to compile with the distutils.
930      * Bug fix in code
931
932 2003-12-10 Benoit Regrain
933      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
934        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
935      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
936        made in the source code
937
938 2003-12-10 Benoit Regrain
939      * Update Windows projects and .cvsignore files
940
941 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
942      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
943            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
944            if he wants to.
945            gdcmElValSet:Print takes it into account
946
947 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
948      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
949      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
950      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
951
952 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
953       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
954              on the ListTag listElem member,
955              not longer on the TagElValueHT tagHt member
956       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
957              with the tagHt member and the listElem member.
958              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
959
960       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
961              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
962                             if bug fixing is necessary), for internal
963                             use only
964              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
965                             or to allow Parser going on.
966              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
967              with a length (not 0000) is found
968       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
969                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
970                 (to be written)
971
972 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
973      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
974      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
975           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
976      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
977
978 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
979      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
980
981 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
982      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
983           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
984
985 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
986      * in testSuite.py : new files names for checking the package
987      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
988              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
989              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
990
991 2003-11-05 Benoit Regrain
992      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
993                        : Explicit error messages
994      * in __init__.py  : Related modif
995
996 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
997      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
998            to be used by aware (vtk) users that want to manage
999            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1000      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1001                     (vtkGdcmReader compliant)           
1002       
1003 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1004      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1005        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1006        
1007 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1008      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1009            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1010
1011 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1012      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1013                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1014              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1015              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1016              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1017              such an image :
1018              After gdcmHeader :
1019               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1020               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1021               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1022      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1023              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1024
1025 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1026      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1027              
1028 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1029      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1030            being coherents dicom files.
1031      
1032 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1033      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1034            from medcon lib !
1035      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1036      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1037      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1038      * ENH: Add include dir to medcon lib
1039      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1040            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1041             
1042 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1043       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1044         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1045           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1046       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1047
1048 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1049       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1050         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1051         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1052       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1053       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1054
1055 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1056       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1057                                                
1058 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1059       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1060       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1061       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1062       
1063 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1064       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1065       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1066       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1067       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1068       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1069       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1070              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1071         But it fasten debug compilation time.
1072             
1073 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1074       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1075         (they are compressed as 2 planes images, 
1076          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1077
1078 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1079       * Now CheckRead takes into account :
1080          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1081          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1082       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1083        (breaks DicomWorks)
1084
1085 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1086       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1087              one should remove the '\'
1088         
1089 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1090       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1091         (wrong lengths in header)
1092         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1093       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1094         (breaks DicomWorks)
1095
1096 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1097       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1098         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1099
1100 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1101       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1102       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1103
1104 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1105       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1106      
1107 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1108       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1109         (the patch is easy to remove)
1110       * cosmetic changes to avoid warnings
1111       
1112 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1113       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1114         no need to press 'r' now.
1115    
1116 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1117       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1118         to new Jpeg Lossless decompressor
1119       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1120       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1121       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1122                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1123 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1124       * general anonymisation in gdcmData
1125       * adding the 'color files' from
1126         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1127       * adding some well knowed bugged-header images
1128       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1129         waiting for their inclusion in Python testsuite
1130
1131 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1132     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1133       no longer seg faults when file is not found
1134
1135 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1136      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1137        MultiFrame images
1138
1139 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1140      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1141
1142 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1143      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1144         OpenFile takes it into account
1145      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1146      * Missing elements added in dicomV3.dic
1147       (just to be affraid : have a look at
1148        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1149        and do it again next year ;->
1150
1151 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1152      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1153        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1154        But there are NOT. It's fixed !
1155        
1156 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1157      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1158      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1159          
1160 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1161      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1162              an ACR-NEMA / DICOM one.
1163      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1164              is not gdcm Readable
1165      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1166              is now decoded.
1167         
1168 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1169      * FIX: CMake generate now documentation
1170      * ENH: out of source doc build !
1171      * ENH: Generate both user and dev documentation
1172      * ENH: Should work on windows too
1173      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1174      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1175      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1176      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1177                      
1178 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1179      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1180      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1181      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1182         window level & window width
1183
1184 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1185      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1186      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1187      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1188      
1189 2003-10-06  Emanuel Ollart
1190      * FIX : compilation process wad broken.
1191              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1192         
1193 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1194      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1195      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1196      
1197 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1198      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1199            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1200                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1201       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1202
1203 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1204       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1205         to remain compliant with already defined strings, 
1206         like Transfert Syntax UID and others)
1207
1208 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1209       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1210              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1211         
1212 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1213       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1214       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1215
1216 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1217       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1218         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1219               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1220       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1221
1222 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1223       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1224
1225 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1226       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1227         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1228
1229 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1230       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1231          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1232          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1233          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1234           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1235                                             YBR_RCT files.
1236           (no sample found :-(
1237
1238 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1239       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1240         Two reasons: - clear things
1241                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1242                        suffer anymore VC++ complains
1243
1244 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1245       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1246       * removed leaks
1247
1248 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1249       * The lines are now eigthy characters long.for 
1250         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1251
1252 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1253       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1254         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1255         previous commis of Malaterre)
1256       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1257         before the last Malaterre's commit.
1258
1259 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1260       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1261         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1262       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1263         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1264
1265 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1266       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1267         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1268         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1269
1270 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1271       * Cosmetic changes:
1272         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1273           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1274           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1275           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1276         - PACKAGER corrected
1277         - DEVELOPPER added.
1278         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1279       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1280
1281 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1282       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1283
1284 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1285       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1286
1287 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1288       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1289
1290 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1291       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1292
1293 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1294       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1295         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1296         heuristics to get informations (look at different places).
1297       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1298         sorting DICOM images based on different strategies.
1299       * modified Makefiles accordingly.
1300
1301 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1302       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1303         when building in debug mode
1304       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1305         src/win32/gdcmdll.dsp
1306       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1307
1308 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1309       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1310             to valgrind.
1311
1312 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1313       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1314       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1315                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1316       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1317
1318 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1319       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1320         the file
1321       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1322       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1323         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1324       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1325         symbols... future problem ?
1326
1327 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1328       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1329       * modified gdcm.dsw accordingly
1330
1331 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1332       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1333
1334 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1335       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1336         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1337       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1338         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1339         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1340
1341 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1342       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1343
1344 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1345       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1346       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1347       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1348       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1349       * PACKAGER : adding all concerning windows
1350
1351 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1352       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1353         garbage debug code.
1354       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1355       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1356         test suite reported error.
1357       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1358         packaging a new release).
1359       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1360       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1361       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1362         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1363         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1364
1365 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1366       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1367       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1368
1369 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1370       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1371         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1372         is made in an internal list to prevent this problem.
1373         Bug fix when output is empty.
1374         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1375         correction.
1376       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1377
1378 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1379       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1380       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1381         files. Added method to remove all files on the input
1382         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1383         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1384
1385 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1386       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1387         when using make instal.
1388       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1389         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1390
1391 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1392       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1393       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1394
1395 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1396       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1397         linux and WINDOWS !
1398       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1399       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1400
1401 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1402       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1403         addon of the jpeg library)
1404       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1405       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1406       * INSTALL now points to web documentation
1407
1408 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1409       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1410         gdcmUtil.h anymore.
1411       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1412         clean target.
1413       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1414         - to allow compilation with gcc 3.x
1415           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1416           -- small fixes on exceptions.
1417           Note: linking not tested !
1418         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1419           building stage.
1420       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1421         dependent convertion).
1422
1423 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1424       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1425         Changelog):
1426         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1427         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1428           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1429         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1430
1431 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1432       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1433         compile
1434       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1435         (FileName -> Filename)
1436
1437 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1438       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1439         - UpdateProgress method should now be effective
1440         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1441           to volumes),
1442         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1443           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1444           accelerating things).
1445         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1446           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1447           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1448           in the stack (for the caller to notice the problem).
1449
1450 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1451       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1452
1453 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1454       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1455         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1456         under Windows... thanks Windows !)
1457
1458 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1459       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1460         debug stage).
1461       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1462
1463 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1464       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1465
1466 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1467       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1468         called with different flags than the default ones (with automake).
1469         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1470            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1471         and went for warning fixes:
1472         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1473           up from unused variables.
1474         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1475       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1476
1477 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1478       * gdcmPython/gdcm.i:
1479         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1480           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1481           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1482         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1483           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1484           exported to Python a as cvar.
1485       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1486         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1487         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1488         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1489         C++ static methods).
1490       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1491         with the above changes.
1492
1493 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1494       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1495
1496 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1497       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1498         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1499         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1500          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1501          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1502            a wrapper
1503          - Wrapper interface which wrap sources
1504         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1505         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1506       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1507         files for compilation
1508
1509 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1510       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1511         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1512         - vtk/Makefile.am now builds a library
1513         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1514           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1515           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1516           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1517           import library.
1518         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1519           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1520           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1521           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1522           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1523         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1524           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1525         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1526           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1527       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1528       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1529         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1530         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1531         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1532         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1533         collision of various stl members (principally cout...).
1534       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1535         file.
1536       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1537         comply with above changes)
1538
1539 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1540       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1541       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1542         vtk data structure (an image Flip was required).
1543       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1544       * cosmetic changes in documentation.
1545
1546 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1547       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1548         unexisting file is given as argument.
1549       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1550         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1551         containing those images is now available at
1552           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1553         with the name gdcmData.
1554         All the python scripts (including the package initialisation file
1555         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1556         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1557
1558 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1559       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1560         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1561         demo of the usage of this class.
1562         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1563         at configure (or autogen.sh) stage.
1564
1565 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1566       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1567         Notes on valgrind:
1568           - maximum info is obtained with a command of the form:
1569             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1570                      --show-reachable=yes PrintHeader
1571           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1572             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1573             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1574             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1575              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1576       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1577         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1578         Note: some images don't seem to work e.g.
1579             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1580       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1581         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1582         make gdcm more thread friendly.
1583
1584 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1585       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1586           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1587         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1588           gdcmHeader::_dicom_vr.
1589         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1590         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1591           VRHT*.
1592         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1593
1594 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1595       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1596         make install stage.
1597
1598 2003-04-9 JPR
1599       * UpdateGroupLength replaced by new one
1600
1601 2003-04-7 JPR
1602       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1603         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1604
1605 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1606       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1607       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1608       * src:
1609         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1610         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1611           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1612         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1613           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1614           carried the same semantics.
1615           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1616         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1617           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1618         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1619       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1620       * gdcmGetXSize added
1621       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1622       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1623
1624 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1625       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1626         (to avoid double call by end user).
1627       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1628         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1629
1630 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1631       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1632         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1633           the html.users end users oriented documentation and
1634           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1635           oriented documentation.
1636         - README changed accordingly
1637         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1638         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1639           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1640         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1641           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1642           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1643       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1644         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1645       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1646         ill-formed documentation sections.
1647       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1648
1649 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1650       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1651       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1652         un*ces with sh-utils test utility.
1653       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1654       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1655       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1656       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1657       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1658
1659 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1660       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1661       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1662
1663 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1664       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1665       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1666       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1667       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1668         compilation work.
1669       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1670       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1671
1672 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1673       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1674         hence the user doesn't need this explicit call.
1675         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1676           i.e. LoadElements() call removed.
1677       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1678         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1679       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1680         for adding user defined new tags.
1681         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1682         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1683           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1684
1685 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1686       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1687         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1688         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1689         with the autotools, included the python wrappers part.
1690       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1691
1692 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1693       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1694
1695 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1696       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1697         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1698         for usage).
1699       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1700         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1701         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1702       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1703         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1704
1705 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1706       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1707         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1708         value of GDCM_DICT_PATH.
1709       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1710
1711 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1713       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1714       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1715         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1716         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1717
1718 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1719       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1720         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1721         gdcmHeader.h
1722       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1723         (as opposed to gdcm.h)
1724       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1725       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1726         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1727       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1728
1729 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1730       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1731         bug.
1732
1733 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1734       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1735         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1736         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1737         of hidding away the python related distutils specific files
1738         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1739         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1740         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1741         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1742
1743 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1744       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1745       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1746         among the list of sources.
1747
1748 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1749       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1750       * modifications in MSVC projects
1751
1752 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1753       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1754         looks like we can move back to original usage of exception within
1755         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1756         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1757       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1758         README file for usage added.
1759       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1760         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1761         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1762         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1763       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1764       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1765         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1766           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1767           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1768           instance of class gdcmHeader.
1769         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1770           require no instances at all to be invocated.
1771         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1772           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1773           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1774       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1775         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1776       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1777         the above to be effective.
1778       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1779         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1780       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1781         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1782         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1783         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1784         (for python dectection).
1785       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1786         now avoids publishing the empty entries.
1787
1788 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1789       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1790         ExtraPath reused :-P
1791       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1792
1793 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1794       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1795       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1796       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1797         and links
1798
1799 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1800       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1801         method. Doxygenation.
1802       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1803
1804 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1805       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1806         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1807         when using "python setup.py install".
1808       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1809         reexports the working classes.
1810       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1811         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1812         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1813         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1814         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1815         subdir (see the README file). This problem probably due to
1816         an combination of g++ and dynamic loading.
1817       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1818
1819 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1820       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1821         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1822         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1823         again in a python subdir, but the package itself is now in
1824         python/gdcmPython.
1825       * setup.py was cleaned up:
1826         - pythonIncludePath removed
1827         - python setup.py bdist target is now functional.
1828       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1829         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1830         accordingly.
1831
1832 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1833       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1834       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1835         distutils installer is operational.
1836       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1837           shadow classes (from gdcm.py).
1838         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1839           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1840         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1841
1842 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1843       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1844         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1845         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1846         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1847         dictionary.
1848         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1849           are now in the "???" group.
1850         - python/gdcm.i changed accordingly,
1851         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1852           of the above new functionalities in Python.
1853
1854 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1855       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1856         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1857           were definitively removed.
1858         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1859       * src/gdcmElValSet.cxx:
1860         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1861         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1862         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1863         - Added GetElementByName(string).
1864       * src/gdcmHeader.cxx: added
1865         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1866         - GetPubElValRepByName(string)
1867         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1868         - GetShaElValRepByName(string)
1869         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1870         - GetShaElValRepByName(string)
1871         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1872         - GetElValRepByName(string)
1873         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1874         - GetElValRepByName(string)
1875       * Doc/requirements.txt added.
1876
1877 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1878       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1879       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1880         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1881         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1882         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1883       * python/testSuite.py changed accordingly.
1884
1885 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1886       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1887         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1888              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1889               cannot be exported. [...]
1890               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1891               be exported. [...]
1892               This is caused by a designed limitation that once a template
1893               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1894               exported."
1895         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1896         limitation" of VC++ is a pitfall.
1897         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1898         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1899         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1900         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1901         library.
1902         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1903       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1904          dll under windows !!!!)
1905       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1906       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1907         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1908       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1909         (one) of image(s).
1910       * removed glib references
1911       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1912
1913 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1914       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1915         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1916         the files of the testsuite without using unittest.
1917       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1918       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1919       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1920         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1921
1922 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1923       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1924         values, but limits itself to values which are below a user specified
1925         size (by default 1024 bytes).
1926       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1927         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1928         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1929         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1930       * python/testSuite.py
1931         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1932         - two new examples added.
1933       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1934
1935 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1936       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1937         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1938       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1939       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1940       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1941
1942 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1943       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1944         the vr was also RET.
1945       * python/testSuite.py more tests added.
1946
1947 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1948       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1949       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1950       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1951         7.18 Integer types (see stdint.h)
1952         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1953       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1954         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1955         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1956         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1957         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1958         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1959         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1960         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1961
1962 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1963       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1964         VR files.
1965       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1966
1967 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1968       * Adaptation for porting to VC++:
1969         - src/gdcm.h
1970           o forced to use std namespace (for string to be known)
1971           o all class use __declspec export style on WIN32
1972         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1973           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1974       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1975         variable GDCM_DICT_PATH.
1976       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1977
1978 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1979       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1980         to native Python dictionary.
1981       * python/demo/test.py:
1982         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1983         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1984       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1985         PubElVals hashing table.
1986       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1987
1988 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1989       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1990         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1991       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1992       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1993       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1994         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1995       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1996
1997 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1998       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1999         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2000         that we can import de shadow classes without errors].
2001
2002 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2003       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2004       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2005       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2006       * src/Makefile prepared for python wrapping
2007
2008 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2009       * src/gdcmHeader.cxx :
2010         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2011           (see gdcmHeader::LoadElements).
2012         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2013           ReadInt16 and ReadInt32)
2014
2015 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2016       * src/gdcmHeader.cxx :
2017         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2018           method.
2019         - SetLgrElem renamed to SetLength
2020         - GetLgrElem renamed to GetLength
2021         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2022       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2023       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2024         due to IdoDude was cleaned out.
2025
2026 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2027       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2028         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2029         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2030         returning the unecessary skL (skipped length).
2031         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2032         it was redundant with the File position internals (by using
2033         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2034         jajun.
2035       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2036         on the libido specificities which are handled through class
2037         inheritance.
2038       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2039         added.
2040
2041 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2042       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2043         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2044
2045 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2046       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2047
2048 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2049       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2050         and _IdDcmSWAP_LONG.
2051
2052 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2053       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2054         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2055