]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
ENH: update my recent changes, sorry for troubles
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
3     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
4      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
5      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
6
7 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
8   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
9   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
10   like this:
11     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
12   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
13   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
14   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
15
16 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
17   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
18     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
19     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
20     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
21     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
22       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
23       (for the time being this is better than having them attach to
24        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
25     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
26       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
27     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
28       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
29       gdcmPixelConvert::
30
31 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
32   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
33   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
34     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
35       clean up of RLE related code. 
36   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
37     - src/gdcmRLE.cxx removed
38     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
39     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
40     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
41   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
42     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
43       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
44       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
45
46 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
47   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
48     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
49       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
50       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
51       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
52       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
53       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
54       offsets.
55   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
56     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
57         with the retired Parse7Fe0().
58     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
59     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
60
61 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
62   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
63     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
64     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
65     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
66   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
67     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
68       to return an unused length.
69
70 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
71   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
72     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
73     to use to do simple stuff.
74
75 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
76   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
77     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
78     copying of the file within different directory, configure header file to
79     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
80     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
81
82 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
83   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
84      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
85        with it's binary name).
86      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
87        the Website to be more complete.
88      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
89        doxygenated documentation.
90      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
91        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
92                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
93   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
94   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
95    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
96
97 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
98   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
99    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
100
101 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
102   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
103     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
104     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
105     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
106     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
107   * GDCMHOME clean up:
108     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
109       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
110       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
111   * Autotools clean up:
112     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
113     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
114
115 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
116   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
117   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
118   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
119
120 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
121   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
122     describing TODO entries and used it for new entries.
123   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
124     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
125     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
126   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
127     documentation itself, but the website) moved to html and
128     placed in directory Doc/Website:
129     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
130     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
131     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
132   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
133   * CMakeLists.txt changed accordingly.
134   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
135     DeveloppersPython.html
136   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
137
138 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
139   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
140     of gdcm Web site.
141
142 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
143   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
144     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
145          we can now delete[] it safely  
146   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
147     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
148   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
149
150 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
151   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
152     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
153     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
154     pointed content.
155
156 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
157   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
158   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
159
160 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
161   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
162     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
163     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
164     an example of usage.
165     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
166       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
167     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
168       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
169     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
170     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
171     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
172
173 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
174   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
175     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
176     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
177     in class 
178     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
179       and associated accessors. Doxygenation of the class.
180     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
181       accessors added.
182     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
183       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
184     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
185     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
186
187 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
188   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
189     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
190       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
191            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
192            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
193            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
194            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
195            the same group and element all share the same (group, element)
196            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
197            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
198            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
199            consider the following definition of a TagKey:
200            - let Group, Element be the string representation of the
201              group and element dicom tag members,
202            - let ItemNumber be the string representation of the integer
203              index of the considered item number of a sequence,
204            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
205            the form:
206               /ItemNumber#Group|Element
207            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
208            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
209               Group|Element<SeqTag>
210            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
211            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
212            string e.g.
213                0028|1201
214            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
215            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
216            string e.g.
217                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
218     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
219       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
220       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
221     - src/gdcmDocEntry.cxx:
222       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
223          Key member.
224       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
225     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
226     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
227       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
228       -- now has a new BaseTagKey member.
229       -- STYLE.
230   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
231     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
232     truly belongs.
233     This poses the problem with the semantics of the following lines
234        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
235        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
236        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
237     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
238     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
239     order to get things working the dicom dictionary was altered !
240     Please fix things urgently...
241   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
242     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
243     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
244     set to OW:
245       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
246       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
247       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
248   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
249     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
250   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
251
252 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
253   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
254
255 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
256   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
257     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
258   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
259   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
260
261 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
262   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
263     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
264   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
265     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
266   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
267     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
268   * TODO updated
269   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
270     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
271   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
272   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
273     exception_on_error parameter.
274     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
275     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
276     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
277
278 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
279   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
280   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
281     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
282   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
283   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
284   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
285     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
286   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
287
288 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
289   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
290     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
291
292 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
293   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
294        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
295                  
296 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
297   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
298         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
299
300 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
301    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
302    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
303      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
304      is now in static in the gdcmDebug class
305    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
306    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
307
308 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
309    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
310      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
311    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
312      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
313      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
314      that displays position and size).
315    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
316      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
317      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
318      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
319      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
320      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
321      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
322         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
323      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
324      commiting changes).
325    * Test/CMakeLists.txt:
326       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
327       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
328         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
329         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
330    * TODO updated.
331
332 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
333    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
334      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
335      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
336      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
337      - removal of typedef duplication.
338      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
339      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
340    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
341       - printf polluting ctest removed.
342       - TAB removal for comminting
343    * Test:
344      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
345        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
346        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
347        this test creates them.
348        Note: we need to validate each reference image, but before that
349              I'd like to rename them with a more explicit name...
350      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
351    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
352      including each header needed).
353
354 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
355    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
356      test suite to the Example directory. Are concerned:
357      - PrintHeader.cxx
358      - TestDcm2Acr.cxx
359      - TestFindTags.cxx
360      - TestWrite.cxx was
361      - TestWriteSimple.cxx
362    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
363      image gdcmData/oldACR00001.ima
364
365 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
366    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
367      with removal from gdcmData):
368       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
369       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
370       - US.3405.1.dcm
371      Added the following because after last cvs update, they cause
372        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
373      to segfault:
374       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
375       - oldACR00001.ima
376    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
377      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
378      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
379      form of test...
380    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
381      we don't need to black list the following images anymore:
382       - 8BitsUncompressedColor.dcm
383       - OT-PAL-8-face.dcm
384       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
385    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
386      fixes and the beautified code ;-)
387      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
388      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
389      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
390            improve the test suite). The bug could be detected by using
391            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
392            or by using
393            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
394            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
395
396 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
397    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
398          - replace by uggly but working old code :-(
399                 A lot of things should be OK again.
400         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
401         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
402         (twice, withing a fortnigh ...)         
403
404 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
405    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
406      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
407    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
408      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
409      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
410                    - OT-PAL-8-face.dcm
411                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
412    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
413      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
414      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
415      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
416      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
417      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
418      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
419      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
420      image.
421    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
422      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
423      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
424      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
425    
426 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
427   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
428   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
429                           (instead of infinite loop)
430   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
431
432 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
433    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
434
435 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
436    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
437                     when SamplesPerPixel =3
438          - now Write is no longer confused by 
439                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
440          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
441                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
442    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
443                     (in order to split the job that has not to be done 
444                                         for gdcmDicomDir)
445
446 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
447    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
448      loop on the same image until memory went out. 
449      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
450    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
451      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
452
453 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
454    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
455             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
456                                 is added a the end, when necessary.
457             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
458                       now written correctly
459                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
460                                 (even for odd groups) 
461         Note : only Explicit Value Representation was checked.
462                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
463
464 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
465    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
466    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
467      coding style).
468
469 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
470    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
471      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
472    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
473
474 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
475    FIX : gdcmDocument.cxx
476       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
477         code 'beautyfication' :-(
478       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
479
480 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
481    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
482                  : to allow user to create his own Sequences
483         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
484
485 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
486         
487         - gdcmBinEntry
488           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
489           
490    - gdcmDocEntry
491           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
492           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
493           
494         - gdcmDocEntrySet
495           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
496           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
497      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
498      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
499      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
500      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
501                                             guint16 element,
502                                             std::string vr     = "unkn",
503                                             std::string fourth = "unkn",
504                                             std::string name   = "unkn"); 
505           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
506      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
507      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
508      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
509      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
510      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
511           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
512      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
513           
514         - gdcmDocument
515      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
516      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
517      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
518      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
519      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
520                                         FILE *_fp, FileType type);
521      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
522      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
523      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
524      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
525      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
526      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
527      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
528      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
529                                             guint16 element,
530                                             std::string vr     = "unkn",
531                                             std::string fourth = "unkn",
532                                             std::string name   = "unkn");
533      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
534      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
535      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
536      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
537                                                                                                                  
538         - gdcmElementSet
539           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
540           
541    - gdcmSeqEntry
542           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
543  
544    - gdcmSQItem
545      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
546      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
547      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
548      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
549
550    - gdcmValEntry
551          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
552                                   
553 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
554     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
555       The default constructor invoked by the line
556          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
557       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
558       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
559       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
560     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
561       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
562       Could anyone explain why ?
563     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
564       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
565       code related to gdcmBinEntry).
566
567 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
568     * In order to fix memory leaks:
569      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
570        some delete calls.
571      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
572      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
573        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
574        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
575        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
576      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
577      - src/gdcmDocument.cxx:
578        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
579           from dynamic stores.
580        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
581           was causing memory leaks.
582      - src/gdcmSQItem.cxx:
583        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
584           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
585        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
586           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
587           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
588           This avoids SegFaulting.
589      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
590     * Conclusion:
591      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
592        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
593        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
594      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
595        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
596      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
597        segfaults).
598     * Erroneous leading white fix:
599      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
600        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
601      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
602      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
603     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
604     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
605
606
607 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
608     * In order to fix writing of dicom files:
609      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
610      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
611      - src/gdcmDocument.cxx:
612        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
613        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
614        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
615           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
616           manner.
617        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
618           to only declared) and build on top of
619           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
620        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
621      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
622        for usage in destructor and treatement of promotion in
623        ::ReplaceOrCreateByNumber().
624      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
625       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
626     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
627       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
628       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
629       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
630
631 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
632     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
633       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
634       learned that:
635           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
636           soon as possible by globally disabling memory caching.
637           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
638           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
639       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
640       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
641       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
642     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
643       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
644       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
645       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
646         with 1.
647       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
648       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
649       understand why the list is empty...).
650     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
651     * Doc/License.txt added.
652
653 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
654     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
655       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
656         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
657         the padding problem.
658       - general clean up, simplification, and coding style.
659       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
660     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
661
662 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
663    *  gdcmSeqEntry.cxx
664            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
665                 - fix the display of SQItem ordinal number
666       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
667                 - remove some useless never written private methods     
668                 
669 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
670    * gdcmBinEntry.cxx 
671       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
672            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
673               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
674                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
675    * dcmDocument.cxx
676       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
677               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
678            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
679       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
680    * gdcmFile.cxx
681       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
682    * gdcmSQItem.h
683       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
684             a (relative) Item identier inside a given Sequence
685             \warning : some pb remaining around this number
686                                 will be solved asap
687       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
688    * gdcmValEntry.cxx 
689       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
690
691 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
692     * Memory leak hunt with the following command:
693       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
694                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
695       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
696       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
697       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
698           grep "MEMORY LEAK" src/*
699       Here are two typical examples which I can't help fixing:
700       -----
701           #include <string>
702           int main() {
703              std::string name;
704              char * test = "babo";
705              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
706                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
707              name.clear();   //// Doesn't help !
708              return 0;
709           }
710       -----
711           #include <string>
712           #include <iostream>
713           int main() {
714              std::string line;
715              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
716              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
717                                         //// of 1320 bytes in call to
718                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
719             return 0;
720           }
721       -----
722
723
724 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
725     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
726       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
727         and related, moved away to gdcmDocument.
728       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
729         the corresponding protected accessors of inherited class
730         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
731         declared friend of class gdcmDocument (see below).
732       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
733       - Clean up of undefined or unused methods.
734     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
735       account the changes to gdcmHeader.h).
736     * src/gdcmDocument.h:
737       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
738         changes to gdcmHeader.h).
739       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
740         (see changes to gdcmHeader.h).
741       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
742       - Clean up of undefined or unused methods.
743     * src/gdcmDocument.cxx:
744       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
745       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
746       - some std::string properly set to VRKey
747     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
748       references to gdcmDocument. 
749     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
750     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
751       cvs repository gdcmData.
752
753 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
754     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
755     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
756       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
757     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
758     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
759       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
760     * src/gdcmDocument.cxx: 
761       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
762         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
763       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
764         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
765         removed. Reverting to previous code segment with the proper
766         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
767         Note: this was (partially) breaking the python test suite
768               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
769               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
770     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
771     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
772       now taken into account.
773     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
774       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
775     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
776       on posix.
777     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
778       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
779     * .... alas, the python testSuite is still broken.
780
781 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
782     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
783       gdcmGlob
784     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
785     * src/gdcmUtil.h : export methods
786
787 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
788     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
789       to right behavior
790     * Initial addition of automatic python testing
791     * Initial addition of automatic image comparison
792
793 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
794     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
795       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
796
797 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
798      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
799      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
800      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
801
802 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
803      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
804        new concepts (and new classes) :
805        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
806         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
807         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
808        a Sequence is composed of Items.
809        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
810        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
811        (never taken into account)
812        Our unability to add a new 'entry' in the header
813        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
814        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
815        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
816        nothing is finished.
817        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
818
819 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
820      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
821      
822 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
823      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
824        file prefix (SetFilePrefix)
825
826 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
827      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
828        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
829        baseline.
830      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
831        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
832
833 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
834      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
835        dicom image
836
837 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
838      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
839      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
840        between the developper and user version.
841      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
842      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
843
844 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
845      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
846        when using cmake.
847
848 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
849      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
850                src directory, now generated in the build dir.
851             2. Tests as mentionned smarter
852             3. Some clean up
853             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
854           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
855           where we could set the institution name / patient name...
856
857        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
858               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
859                  (this was not true before)
860
861 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
862      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
863            SeQuence indented printing of Dicom Header.
864      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
865            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
866            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
867      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
868            tree-like structure of a Dicom Header.
869      * FIX Test code cleaning     
870            
871 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
872      * ENH: Adding automatic testing
873        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
874        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
875        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
876        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
877           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
878           too many projects
879      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
880      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
881        one file instead of seven + some small cleanup
882
883 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
884      * ENH Minor changes to the Print() methods.
885      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
886            Header printing. Example given with :
887            > PrintHeader fileName  2 new
888           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
889            
890 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
891      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
892          1. I have added some unsigned where needed
893          2. Some function parameter not used -> (void)
894          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
895          4. g++ don't like character '\' in comment
896          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
897                     this really need to be fixed
898          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
899          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
900                     this also really need to be fixed
901          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
902                     remove compression file 
903                     (as we only do decompression, right ?)     
904      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
905
906 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
907      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
908            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
909            defaulted to yspacing
910            
911 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
912      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
913      * ENH add parameters :
914                bool  exception_on_error = false, 
915                bool  enable_sequences   = false,
916                bool  ignore_shadow      = false
917            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
918      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
919            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
920               
921 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
922      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
923      
924 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
925      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
926      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
927              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
928              
929 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
930      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
931          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
932
933 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
934      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
935        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
936        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
937        in gdcmHeader.
938      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
939        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
940        already does the job.
941      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
942        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
943
944 2004-03-30 Benoit Regrain
945      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
946        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
947        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
948
949 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
950      * ENH : Check on file type to be written moved
951              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
952      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
953              when end-of-list is reached
954            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
955
956 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
957      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
958      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
959      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
960        equivalent to ExplicitVR in existing code).
961
962 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
963      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
964        now contains all the gdcmGlobal related code.
965      * minor coding style and doxygenation changes.
966
967 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
968      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
969        now contains all the Debug related code.
970      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
971      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
972        CreateCleanString) removed.
973      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
974      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
975      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
976      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
977        src/gdcmDirList.cxx)
978
979 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
980      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
981
982 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
983      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
984            big endian made volumes
985      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
986            end user to instanciate class gdcmParser
987           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
988
989 2004-03-22 Benoit Regrain
990      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
991      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
992              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
993
994 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
995      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
996            an already existing DICOMDIR file is consistent with
997            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
998            or build from the files held (recursively) in a Directory
999            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1000            gdcmObject::SetBoundaries() added
1001
1002 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1003      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1004                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1005      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1006            DICOMDIR
1007      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1008            about the name
1009
1010 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1011      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1012                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1013
1014 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1015      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1016            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1017            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1018            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1019            to allow making gdcDicomDir object.
1020      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1021           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1022
1023 2004-02-11 Benoit Regrain
1024      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1025              when using from python
1026
1027 2004-02-10 Benoit Regrain
1028      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1029      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1030      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1031              directory parsing
1032
1033 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1034      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1035              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1036              - class gdcmMeta created
1037      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1038              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1039      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1040
1041 2004-02-05 Benoit Regrain
1042      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1043              header entries
1044      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1045      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1046
1047 2004-02-04 Benoit Regrain
1048      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1049      * FIX : sort the images in the dicom dir
1050      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1051      * ADD : a python demo
1052
1053 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1054      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1055      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1056              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1057              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1058              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1059      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1060            to make full checking easier
1061         
1062 2004-02-04 Benoit Regrain
1063      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1064      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1065
1066 2004-02-03 Benoit Regrain
1067      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1068      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1069      * Bug fix and print add-on
1070
1071 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1072      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1073      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1074      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1075      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1076            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1077         
1078 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1079      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1080              iterator on last
1081              of the last synonym :-(
1082      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1083              for DICOMDIR ;-)
1084      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1085      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1086      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1087            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1088       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1089
1090 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1091      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1092            no longer writes 'Un' on disk
1093      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1094      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1095            the length (for Palette expanded images)
1096            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1097      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1098            (that broke Write). Replaced by UL.
1099            Aware user will reload the field if he 
1100            thinks it's necesssary
1101              
1102 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1103      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1104        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1105        IsReadable() methods.
1106        
1107      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1108       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1109       but so usefull for people that miss them ;-)
1110       
1111      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1112        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1113
1114 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1115      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1116
1117 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1118      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1119              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1120         The TRUE value for this param has to be used 
1121         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1122         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1123      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1124              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1125         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1126         
1127      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1128              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1129              Fixed
1130
1131      * gdcmHeader add the method
1132              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1133         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1134         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1135         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1136
1137 2004-01-26 Benoit Regrain
1138      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1139        in the print and add a third level of print to print them
1140
1141 2004-01-23 Benoit Regrain
1142      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1143      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1144      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1145        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1146
1147 2004-01-22 Benoit Regrain
1148      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1149      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1150
1151 2004-01-19 Benoit Regrain
1152      * Add the use of shadow dictionaries
1153      * bug fix and coding style
1154
1155 2004-01-19 Benoit Regrain
1156      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1157      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1158      * Add the update of header entries using the shadow library
1159
1160 2004-01-19 Benoit Regrain
1161      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1162      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1163        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1164        of dicom dir parsing
1165      * bug fix under python
1166
1167 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1168     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1169     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1170     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1171     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1172
1173 2004-01-15 Benoit Regrain
1174      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1175        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1176        when the gdcmDictSet will be destroyed
1177      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1178        gdcmDictSet
1179
1180 2004-01-15 Benoit Regrain
1181      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1182        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1183        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1184        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1185      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1186
1187 2004-01-14 Benoit Regrain
1188      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1189      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1190      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1191      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1192
1193 2004-01-13 Benoit Regrain
1194      * src/*.[h|cxx] : coding style
1195      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1196
1197 2004-01-13 Benoit Regrain
1198      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1199      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1200        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1201      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1202
1203 2004-01-12 Benoit Regrain
1204      * src/*.h : add comments
1205      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1206      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1207        directly setted in the source code
1208      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1209        gdcmTS and gdcmVR
1210
1211 2004-01-09 Benoit Regrain
1212      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1213      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1214
1215 2004-01-07 Benoit Regrain
1216      * Modification to compile with the distutils.
1217      * Bug fix in code
1218
1219 2003-12-10 Benoit Regrain
1220      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1221        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1222      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1223        made in the source code
1224
1225 2003-12-10 Benoit Regrain
1226      * Update Windows projects and .cvsignore files
1227
1228 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1229      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1230            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1231            if he wants to.
1232            gdcmElValSet:Print takes it into account
1233
1234 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1235      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1236      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1237      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1238
1239 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1240       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1241              on the ListTag listElem member,
1242              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1243       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1244              with the tagHt member and the listElem member.
1245              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1246
1247       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1248              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1249                             if bug fixing is necessary), for internal
1250                             use only
1251              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1252                             or to allow Parser going on.
1253              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1254              with a length (not 0000) is found
1255       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1256                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1257                 (to be written)
1258
1259 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1260      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1261      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1262           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1263      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1264
1265 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1266      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1267
1268 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1269      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1270           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1271
1272 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1273      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1274      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1275              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1276              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1277
1278 2003-11-05 Benoit Regrain
1279      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1280                        : Explicit error messages
1281      * in __init__.py  : Related modif
1282
1283 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1284      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1285            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1286            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1287      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1288                     (vtkGdcmReader compliant)           
1289       
1290 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1291      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1292        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1293        
1294 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1295      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1296            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1297
1298 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1299      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1300                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1301              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1302              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1303              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1304              such an image :
1305              After gdcmHeader :
1306               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1307               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1308               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1309      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1310              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1311
1312 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1313      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1314              
1315 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1316      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1317            being coherents dicom files.
1318      
1319 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1320      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1321            from medcon lib !
1322      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1323      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1324      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1325      * ENH: Add include dir to medcon lib
1326      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1327            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1328             
1329 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1330       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1331         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1332           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1333       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1334
1335 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1336       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1337         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1338         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1339       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1340       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1341
1342 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1343       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1344                                                
1345 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1346       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1347       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1348       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1349       
1350 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1351       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1352       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1353       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1354       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1355       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1356       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1357              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1358         But it fasten debug compilation time.
1359             
1360 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1361       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1362         (they are compressed as 2 planes images, 
1363          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1364
1365 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1366       * Now CheckRead takes into account :
1367          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1368          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1369       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1370        (breaks DicomWorks)
1371
1372 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1373       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1374              one should remove the '\'
1375         
1376 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1377       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1378         (wrong lengths in header)
1379         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1380       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1381         (breaks DicomWorks)
1382
1383 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1384       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1385         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1386
1387 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1388       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1389       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1390
1391 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1392       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1393      
1394 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1395       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1396         (the patch is easy to remove)
1397       * cosmetic changes to avoid warnings
1398       
1399 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1400       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1401         no need to press 'r' now.
1402    
1403 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1404       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1405         to new Jpeg Lossless decompressor
1406       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1407       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1408       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1409                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1410 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1411       * general anonymisation in gdcmData
1412       * adding the 'color files' from
1413         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1414       * adding some well knowed bugged-header images
1415       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1416         waiting for their inclusion in Python testsuite
1417
1418 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1419     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1420       no longer seg faults when file is not found
1421
1422 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1423      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1424        MultiFrame images
1425
1426 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1427      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1428
1429 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1430      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1431         OpenFile takes it into account
1432      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1433      * Missing elements added in dicomV3.dic
1434       (just to be affraid : have a look at
1435        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1436        and do it again next year ;->
1437
1438 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1439      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1440        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1441        But there are NOT. It's fixed !
1442        
1443 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1444      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1445      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1446          
1447 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1448      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1449              an ACR-NEMA / DICOM one.
1450      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1451              is not gdcm Readable
1452      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1453              is now decoded.
1454         
1455 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1456      * FIX: CMake generate now documentation
1457      * ENH: out of source doc build !
1458      * ENH: Generate both user and dev documentation
1459      * ENH: Should work on windows too
1460      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1461      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1462      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1463      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1464                      
1465 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1466      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1467      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1468      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1469         window level & window width
1470
1471 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1472      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1473      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1474      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1475      
1476 2003-10-06  Emanuel Ollart
1477      * FIX : compilation process wad broken.
1478              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1479         
1480 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1481      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1482      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1483      
1484 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1485      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1486            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1487                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1488       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1489
1490 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1491       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1492         to remain compliant with already defined strings, 
1493         like Transfert Syntax UID and others)
1494
1495 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1496       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1497              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1498         
1499 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1500       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1501       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1502
1503 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1504       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1505         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1506               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1507       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1508
1509 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1510       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1511
1512 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1513       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1514         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1515
1516 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1517       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1518          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1519          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1520          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1521           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1522                                             YBR_RCT files.
1523           (no sample found :-(
1524
1525 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1526       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1527         Two reasons: - clear things
1528                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1529                        suffer anymore VC++ complains
1530
1531 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1532       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1533       * removed leaks
1534
1535 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1536       * The lines are now eigthy characters long.for 
1537         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1538
1539 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1540       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1541         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1542         previous commis of Malaterre)
1543       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1544         before the last Malaterre's commit.
1545
1546 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1547       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1548         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1549       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1550         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1551
1552 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1553       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1554         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1555         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1556
1557 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1558       * Cosmetic changes:
1559         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1560           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1561           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1562           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1563         - PACKAGER corrected
1564         - DEVELOPPER added.
1565         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1566       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1567
1568 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1569       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1570
1571 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1572       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1573
1574 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1575       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1576
1577 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1578       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1579
1580 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1581       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1582         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1583         heuristics to get informations (look at different places).
1584       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1585         sorting DICOM images based on different strategies.
1586       * modified Makefiles accordingly.
1587
1588 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1589       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1590         when building in debug mode
1591       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1592         src/win32/gdcmdll.dsp
1593       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1594
1595 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1596       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1597             to valgrind.
1598
1599 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1600       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1601       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1602                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1603       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1604
1605 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1607         the file
1608       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1609       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1610         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1611       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1612         symbols... future problem ?
1613
1614 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1615       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1616       * modified gdcm.dsw accordingly
1617
1618 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1619       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1620
1621 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1622       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1623         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1624       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1625         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1626         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1627
1628 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1629       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1630
1631 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1632       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1633       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1634       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1635       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1636       * PACKAGER : adding all concerning windows
1637
1638 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1639       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1640         garbage debug code.
1641       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1642       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1643         test suite reported error.
1644       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1645         packaging a new release).
1646       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1647       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1648       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1649         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1650         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1651
1652 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1653       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1654       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1655
1656 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1657       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1658         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1659         is made in an internal list to prevent this problem.
1660         Bug fix when output is empty.
1661         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1662         correction.
1663       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1664
1665 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1666       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1667       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1668         files. Added method to remove all files on the input
1669         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1670         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1671
1672 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1673       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1674         when using make instal.
1675       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1676         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1677
1678 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1679       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1680       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1681
1682 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1683       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1684         linux and WINDOWS !
1685       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1686       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1687
1688 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1689       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1690         addon of the jpeg library)
1691       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1692       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1693       * INSTALL now points to web documentation
1694
1695 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1696       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1697         gdcmUtil.h anymore.
1698       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1699         clean target.
1700       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1701         - to allow compilation with gcc 3.x
1702           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1703           -- small fixes on exceptions.
1704           Note: linking not tested !
1705         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1706           building stage.
1707       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1708         dependent convertion).
1709
1710 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1711       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1712         Changelog):
1713         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1714         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1715           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1716         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1717
1718 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1719       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1720         compile
1721       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1722         (FileName -> Filename)
1723
1724 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1725       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1726         - UpdateProgress method should now be effective
1727         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1728           to volumes),
1729         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1730           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1731           accelerating things).
1732         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1733           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1734           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1735           in the stack (for the caller to notice the problem).
1736
1737 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1738       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1739
1740 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1741       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1742         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1743         under Windows... thanks Windows !)
1744
1745 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1746       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1747         debug stage).
1748       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1749
1750 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1751       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1752
1753 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1754       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1755         called with different flags than the default ones (with automake).
1756         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1757            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1758         and went for warning fixes:
1759         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1760           up from unused variables.
1761         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1762       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1763
1764 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * gdcmPython/gdcm.i:
1766         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1767           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1768           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1769         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1770           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1771           exported to Python a as cvar.
1772       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1773         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1774         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1775         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1776         C++ static methods).
1777       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1778         with the above changes.
1779
1780 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1781       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1782
1783 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1784       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1785         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1786         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1787          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1788          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1789            a wrapper
1790          - Wrapper interface which wrap sources
1791         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1792         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1793       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1794         files for compilation
1795
1796 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1797       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1798         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1799         - vtk/Makefile.am now builds a library
1800         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1801           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1802           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1803           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1804           import library.
1805         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1806           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1807           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1808           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1809           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1810         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1811           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1812         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1813           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1814       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1815       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1816         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1817         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1818         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1819         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1820         collision of various stl members (principally cout...).
1821       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1822         file.
1823       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1824         comply with above changes)
1825
1826 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1827       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1828       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1829         vtk data structure (an image Flip was required).
1830       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1831       * cosmetic changes in documentation.
1832
1833 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1834       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1835         unexisting file is given as argument.
1836       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1837         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1838         containing those images is now available at
1839           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1840         with the name gdcmData.
1841         All the python scripts (including the package initialisation file
1842         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1843         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1844
1845 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1846       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1847         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1848         demo of the usage of this class.
1849         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1850         at configure (or autogen.sh) stage.
1851
1852 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1853       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1854         Notes on valgrind:
1855           - maximum info is obtained with a command of the form:
1856             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1857                      --show-reachable=yes PrintHeader
1858           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1859             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1860             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1861             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1862              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1863       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1864         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1865         Note: some images don't seem to work e.g.
1866             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1867       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1868         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1869         make gdcm more thread friendly.
1870
1871 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1872       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1873           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1874         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1875           gdcmHeader::_dicom_vr.
1876         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1877         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1878           VRHT*.
1879         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1880
1881 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1882       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1883         make install stage.
1884
1885 2003-04-9 JPR
1886       * UpdateGroupLength replaced by new one
1887
1888 2003-04-7 JPR
1889       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1890         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1891
1892 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1893       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1894       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1895       * src:
1896         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1897         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1898           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1899         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1900           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1901           carried the same semantics.
1902           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1903         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1904           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1905         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1906       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1907       * gdcmGetXSize added
1908       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1909       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1910
1911 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1912       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1913         (to avoid double call by end user).
1914       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1915         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1916
1917 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1918       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1919         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1920           the html.users end users oriented documentation and
1921           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1922           oriented documentation.
1923         - README changed accordingly
1924         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1925         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1926           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1927         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1928           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1929           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1930       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1931         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1932       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1933         ill-formed documentation sections.
1934       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1935
1936 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1937       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1938       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1939         un*ces with sh-utils test utility.
1940       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1941       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1942       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1943       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1944       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1945
1946 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1947       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1948       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1949
1950 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1951       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1952       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1953       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1954       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1955         compilation work.
1956       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1957       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1958
1959 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1960       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1961         hence the user doesn't need this explicit call.
1962         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1963           i.e. LoadElements() call removed.
1964       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1965         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1966       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1967         for adding user defined new tags.
1968         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1969         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1970           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1971
1972 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1973       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1974         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1975         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1976         with the autotools, included the python wrappers part.
1977       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1978
1979 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1980       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1981
1982 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1983       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1984         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1985         for usage).
1986       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1987         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1988         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1989       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1990         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1991
1992 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1993       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1994         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1995         value of GDCM_DICT_PATH.
1996       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1997
1998 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1999       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2000       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2001       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2002         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2003         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2004
2005 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2006       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2007         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2008         gdcmHeader.h
2009       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2010         (as opposed to gdcm.h)
2011       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2012       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2013         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2014       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2015
2016 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2017       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2018         bug.
2019
2020 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2021       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2022         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2023         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2024         of hidding away the python related distutils specific files
2025         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2026         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2027         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2028         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2029
2030 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2031       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2032       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2033         among the list of sources.
2034
2035 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2036       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2037       * modifications in MSVC projects
2038
2039 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2040       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2041         looks like we can move back to original usage of exception within
2042         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2043         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2044       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2045         README file for usage added.
2046       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2047         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2048         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2049         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2050       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2051       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2052         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2053           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2054           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2055           instance of class gdcmHeader.
2056         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2057           require no instances at all to be invocated.
2058         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2059           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2060           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2061       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2062         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2063       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2064         the above to be effective.
2065       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2066         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2067       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2068         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2069         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2070         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2071         (for python dectection).
2072       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2073         now avoids publishing the empty entries.
2074
2075 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2076       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2077         ExtraPath reused :-P
2078       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2079
2080 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2081       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2082       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2083       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2084         and links
2085
2086 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2087       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2088         method. Doxygenation.
2089       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2090
2091 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2092       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2093         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2094         when using "python setup.py install".
2095       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2096         reexports the working classes.
2097       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2098         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2099         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2100         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2101         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2102         subdir (see the README file). This problem probably due to
2103         an combination of g++ and dynamic loading.
2104       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2105
2106 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2107       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2108         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2109         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2110         again in a python subdir, but the package itself is now in
2111         python/gdcmPython.
2112       * setup.py was cleaned up:
2113         - pythonIncludePath removed
2114         - python setup.py bdist target is now functional.
2115       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2116         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2117         accordingly.
2118
2119 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2120       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2121       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2122         distutils installer is operational.
2123       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2124           shadow classes (from gdcm.py).
2125         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2126           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2127         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2128
2129 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2130       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2131         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2132         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2133         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2134         dictionary.
2135         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2136           are now in the "???" group.
2137         - python/gdcm.i changed accordingly,
2138         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2139           of the above new functionalities in Python.
2140
2141 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2142       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2143         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2144           were definitively removed.
2145         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2146       * src/gdcmElValSet.cxx:
2147         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2148         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2149         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2150         - Added GetElementByName(string).
2151       * src/gdcmHeader.cxx: added
2152         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2153         - GetPubElValRepByName(string)
2154         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2155         - GetShaElValRepByName(string)
2156         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2157         - GetShaElValRepByName(string)
2158         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2159         - GetElValRepByName(string)
2160         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2161         - GetElValRepByName(string)
2162       * Doc/requirements.txt added.
2163
2164 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2165       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2166       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2167         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2168         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2169         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2170       * python/testSuite.py changed accordingly.
2171
2172 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2173       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2174         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2175              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2176               cannot be exported. [...]
2177               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2178               be exported. [...]
2179               This is caused by a designed limitation that once a template
2180               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2181               exported."
2182         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2183         limitation" of VC++ is a pitfall.
2184         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2185         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2186         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2187         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2188         library.
2189         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2190       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2191          dll under windows !!!!)
2192       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2193       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2194         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2195       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2196         (one) of image(s).
2197       * removed glib references
2198       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2199
2200 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2201       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2202         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2203         the files of the testsuite without using unittest.
2204       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2205       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2206       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2207         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2208
2209 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2210       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2211         values, but limits itself to values which are below a user specified
2212         size (by default 1024 bytes).
2213       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2214         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2215         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2216         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2217       * python/testSuite.py
2218         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2219         - two new examples added.
2220       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2221
2222 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2223       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2224         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2225       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2226       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2227       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2228
2229 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2230       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2231         the vr was also RET.
2232       * python/testSuite.py more tests added.
2233
2234 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2235       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2236       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2237       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2238         7.18 Integer types (see stdint.h)
2239         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2240       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2241         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2242         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2243         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2244         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2245         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2246         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2247         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2248
2249 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2250       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2251         VR files.
2252       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2253
2254 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2255       * Adaptation for porting to VC++:
2256         - src/gdcm.h
2257           o forced to use std namespace (for string to be known)
2258           o all class use __declspec export style on WIN32
2259         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2260           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2261       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2262         variable GDCM_DICT_PATH.
2263       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2264
2265 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2266       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2267         to native Python dictionary.
2268       * python/demo/test.py:
2269         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2270         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2271       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2272         PubElVals hashing table.
2273       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2274
2275 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2276       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2277         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2278       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2279       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2280       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2281         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2282       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2283
2284 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2285       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2286         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2287         that we can import de shadow classes without errors].
2288
2289 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2290       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2291       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2292       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2293       * src/Makefile prepared for python wrapping
2294
2295 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2296       * src/gdcmHeader.cxx :
2297         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2298           (see gdcmHeader::LoadElements).
2299         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2300           ReadInt16 and ReadInt32)
2301
2302 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2303       * src/gdcmHeader.cxx :
2304         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2305           method.
2306         - SetLgrElem renamed to SetLength
2307         - GetLgrElem renamed to GetLength
2308         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2309       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2310       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2311         due to IdoDude was cleaned out.
2312
2313 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2314       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2315         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2316         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2317         returning the unecessary skL (skipped length).
2318         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2319         it was redundant with the File position internals (by using
2320         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2321         jajun.
2322       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2323         on the libido specificities which are handled through class
2324         inheritance.
2325       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2326         added.
2327
2328 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2329       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2330         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2331
2332 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2333       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2334
2335 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2336       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2337         and _IdDcmSWAP_LONG.
2338
2339 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2341         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2342