]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
3
4 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
5    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
6    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
7      the header.
8    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
9      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
10      write
11    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
12      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
13      is now on RGB datas (as before my last commit
14    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
15
16 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
17    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
18      Add a print information of the type of the entry
19    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
20      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
21    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
22      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
23    * Test/ : test on files are now made using Raw datas and not color datas if
24      any.
25    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
26
27 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
28    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
29      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
30      opened or not.
31
32 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
33    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
34      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
35    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
36      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
37      DocEntryArchive
38    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
39      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
40    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
41      - test the pixels written
42      - add test points to quickly find where is the error
43      - can set a file name input and output in arguments
44    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
45      amelioration of the test output
46
47 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
48    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
49      all replaced DocEntry's
50    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting datas.
51      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
52      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
53      header initial state.
54
55 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
56    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
57
58 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
59    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
60      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
61      then, it musn't change in the time.
62    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
63      header correctly. At this time, the change is only made for the first
64      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
65      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
66      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
67      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
68    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
69    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
70      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
71      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
72
73 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
74    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
75    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
76
77 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
78    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
79      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
80      is copied).
81    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
82      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
83    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
84
85 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
86    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
87      Two problems appear when doing it :
88       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
89         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
90         datas (pixels). And each structure destruct the datas when it's
91         destructed. So we have two destructions for the same datas. To solve it,
92         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
93         datas or not. If it doesn't own datas, then they will not destroyed by
94         the gdcmBinEntry.
95       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
96         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
97         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
98         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
99         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
100    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
101
102 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
103    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
104    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
105      squeeze method
106
107 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
108    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
109    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
110      after it have been deleted
111
112 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
113    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
114    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
115    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
116      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
117      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
118
119 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
120     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
121     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
122     3. Use const ref when possible
123     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
124     5. A few more comments
125     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
126
127 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
128   * ENH: Slightly bigger patch:
129     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
130     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
131     3. File was not close properly in gdcmDict
132     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
133     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
134     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
135     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
136     8. Do not repeat virtual in subclasses
137     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
138
139 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
140   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
141     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
142     of a null character as defined by standard
143   
144 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
145   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
146     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
147
148 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
149   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
150   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
151     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
152
153 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
154   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
155     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
156     a verbose message is generated.
157     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
158     correctly close is a call to CloseFile.
159     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
160   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
161     file. For an uncompressed image, the copied datas correspond in the least 
162     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
163     header. A verbose is generated if these two size mismatch
164
165 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
166   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
167     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
168     break under windows (with msvc6 compilation).
169
170 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
171   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
172     compiling with MSVC6)
173
174 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
175   * Bugs fix for the Windows build with VC6
176   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
177     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
178     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
179     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
180   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
181     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
182     gdcm.i file)
183   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
184     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
185     std::cerr of vtk.
186
187 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
188   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
189   * gdcmPython/gdcm.i:
190     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
191     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
192       NOT need to be wrapped anymore.
193   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
194     DicomDir::Method) new example added.
195
196 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
197   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
198     A DicomString can contain as many \0 as they want
199     and it is *always* of even length.
200     We only support odd length for very rare case. 
201     And in the near future this should be removed.
202
203 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
204   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
205     little endian. This should -heopfully- fix some tests
206
207 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
208   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
209     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
210     the one comiled into lib
211
212 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
213   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
214     This should definitely solve any leak problem, and we should be
215     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
216
217 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
218   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
219   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
220   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
221   
222 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
223   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
224   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
225     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
226   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
227   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
228     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
229     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
230       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
231       no longer exists.
232
233 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
234   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
235    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
236    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
237    the class.
238   
239 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
240   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
241     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
242     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
243
244 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
245   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
246   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
247     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
248     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
249     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
250       CloseFile() anymore.
251     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
252       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
253       into File::Pixel_Data.
254
255 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
256   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
257     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
258   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
259     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
260     method:
261     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
262     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
263       method to those classes.
264     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
265       -- Added a ::Print() method.
266       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
267       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
268          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
269
270 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
271   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
272     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
273     doxygen.
274   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
275   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
276     pointlessly wrapped (see
277     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
278   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
279     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
280     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
281     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
282     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
283       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
284            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
285       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
286          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
287
288 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
289   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
290     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
291
292 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
293   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
294     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
295     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
296   * TODO added new entry.
297   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
298     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
299     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
300     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
301       variable names for semantical coherence.
302
303 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
304   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
305   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
306   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
307   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
308   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
309   compilation time jpeg option.
310
311 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
312   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
313     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
314     reproduce at home.
315   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
316   Thanks dcmtk crew !
317
318 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
319   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
320   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
321     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
322   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
323   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
324   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
325   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
326     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
327     from File:: to PixelConvert::.
328
329 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
330   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
331     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
332      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
333      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
334
335 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
336   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
337   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
338   like this:
339     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
340   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
341   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
342   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
343
344 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
345   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
346     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
347     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
348     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
349     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
350       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
351       (for the time being this is better than having them attach to
352        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
353     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
354       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
355     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
356       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
357       gdcmPixelConvert::
358
359 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
360   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
361   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
362     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
363       clean up of RLE related code. 
364   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
365     - src/gdcmRLE.cxx removed
366     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
367     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
368     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
369   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
370     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
371       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
372       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
373
374 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
375   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
376     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
377       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
378       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
379       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
380       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
381       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
382       offsets.
383   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
384     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
385         with the retired Parse7Fe0().
386     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
387     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
388
389 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
390   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
391     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
392     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
393     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
394   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
395     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
396       to return an unused length.
397
398 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
399   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
400     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
401     to use to do simple stuff.
402
403 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
404   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
405     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
406     copying of the file within different directory, configure header file to
407     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
408     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
409
410 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
411   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
412      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
413        with it's binary name).
414      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
415        the Website to be more complete.
416      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
417        doxygenated documentation.
418      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
419        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
420                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
421   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
422   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
423    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
424
425 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
426   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
427    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
428
429 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
430   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
431     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
432     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
433     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
434     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
435   * GDCMHOME clean up:
436     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
437       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
438       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
439   * Autotools clean up:
440     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
441     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
442
443 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
444   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
445   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
446   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
447
448 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
449   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
450     describing TODO entries and used it for new entries.
451   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
452     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
453     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
454   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
455     documentation itself, but the website) moved to html and
456     placed in directory Doc/Website:
457     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
458     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
459     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
460   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
461   * CMakeLists.txt changed accordingly.
462   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
463     DeveloppersPython.html
464   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
465
466 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
467   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
468     of gdcm Web site.
469
470 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
471   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
472     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
473     we can now delete[] it safely 
474   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
475     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
476   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
477
478 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
479   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
480     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
481     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
482     pointed content.
483
484 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
485   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
486   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
487
488 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
489   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
490     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
491     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
492     an example of usage.
493     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
494       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
495     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
496       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
497     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
498     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
499     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
500
501 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
502   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
503     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
504     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
505     in class 
506     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
507       and associated accessors. Doxygenation of the class.
508     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
509       accessors added.
510     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
511       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
512     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
513     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
514
515 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
516   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
517     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
518       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
519            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
520            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
521            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
522            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
523            the same group and element all share the same (group, element)
524            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
525            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
526            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
527            consider the following definition of a TagKey:
528            - let Group, Element be the string representation of the
529              group and element dicom tag members,
530            - let ItemNumber be the string representation of the integer
531              index of the considered item number of a sequence,
532            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
533            the form:
534               /ItemNumber#Group|Element
535            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
536            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
537               Group|Element<SeqTag>
538            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
539            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
540            string e.g.
541                0028|1201
542            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
543            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
544            string e.g.
545                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
546     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
547       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
548       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
549     - src/gdcmDocEntry.cxx:
550       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
551          Key member.
552       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
553     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
554     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
555       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
556       -- now has a new BaseTagKey member.
557       -- STYLE.
558   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
559     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
560     truly belongs.
561     This poses the problem with the semantics of the following lines
562        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
563        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
564        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
565     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
566     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
567     order to get things working the dicom dictionary was altered !
568     Please fix things urgently...
569   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
570     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
571     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
572     set to OW:
573       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
574       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
575       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
576   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
577     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
578   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
579
580 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
582
583 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
584   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
585     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
586   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
587   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
588
589 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
590   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
591     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
592   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
593     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
594   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
595     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
596   * TODO updated
597   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
598     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
599   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
600   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
601     exception_on_error parameter.
602     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
603     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
604     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
605
606 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
607   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
608   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
609     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
610   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
611   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
612   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
613     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
614   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
615
616 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
617   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
618     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
619
620 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
621   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
622        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
623  
624 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
625   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
626         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
627
628 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
629    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
630    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
631      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
632      is now in static in the gdcmDebug class
633    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
634    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
635
636 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
637    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
638      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
639    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
640      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
641      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
642      that displays position and size).
643    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
644      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
645      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
646      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
647      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
648      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
649      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
650         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
651      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
652      commiting changes).
653    * Test/CMakeLists.txt:
654       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
655       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
656         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
657         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
658    * TODO updated.
659
660 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
661    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
662      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
663      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
664      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
665      - removal of typedef duplication.
666      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
667      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
668    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
669       - printf polluting ctest removed.
670       - TAB removal for comminting
671    * Test:
672      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
673        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
674        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
675        this test creates them.
676        Note: we need to validate each reference image, but before that
677              I'd like to rename them with a more explicit name...
678      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
679    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
680      including each header needed).
681
682 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
683    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
684      test suite to the Example directory. Are concerned:
685      - PrintHeader.cxx
686      - TestDcm2Acr.cxx
687      - TestFindTags.cxx
688      - TestWrite.cxx was
689      - TestWriteSimple.cxx
690    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
691      image gdcmData/oldACR00001.ima
692
693 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
694    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
695      with removal from gdcmData):
696       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
697       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
698       - US.3405.1.dcm
699      Added the following because after last cvs update, they cause
700        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
701      to segfault:
702       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
703       - oldACR00001.ima
704    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
705      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
706      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
707      form of test...
708    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
709      we don't need to black list the following images anymore:
710       - 8BitsUncompressedColor.dcm
711       - OT-PAL-8-face.dcm
712       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
713    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
714      fixes and the beautified code ;-)
715      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
716      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
717      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
718            improve the test suite). The bug could be detected by using
719            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
720            or by using
721            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
722            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
723
724 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
725    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
726          - replace by uggly but working old code :-(
727    A lot of things should be OK again.
728    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
729    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
730    (twice, withing a fortnigh ...)      
731
732 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
733    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
734      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
735    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
736      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
737      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
738                    - OT-PAL-8-face.dcm
739                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
740    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
741      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
742      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
743      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
744      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
745      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
746      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
747      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
748      image.
749    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
750      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
751      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
752      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
753    
754 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
755   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
756   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
757                           (instead of infinite loop)
758   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
759
760 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
761    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
762
763 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
764    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
765            when SamplesPerPixel =3
766          - now Write is no longer confused by 
767           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
768          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
769                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
770    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
771            (in order to split the job that has not to be done 
772            for gdcmDicomDir)
773
774 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
775    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
776      loop on the same image until memory went out. 
777      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
778    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
779      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
780
781 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
782    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
783             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
784             is added a the end, when necessary.
785             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
786               now written correctly
787             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
788               (even for odd groups) 
789         Note : only Explicit Value Representation was checked.
790                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
791
792 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
793    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
794    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
795      coding style).
796
797 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
798    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
799      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
800    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
801
802 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
803    FIX : gdcmDocument.cxx
804       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
805         code 'beautyfication' :-(
806       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
807
808 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
809    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
810             : to allow user to create his own Sequences
811    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
812
813    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
814
815    - gdcmBinEntry
816      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
817   
818    - gdcmDocEntry
819      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
820      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
821   
822    - gdcmDocEntrySet
823      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
824      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
825      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
826      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
827      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
828      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
829                                             guint16 element,
830                                             std::string vr     = "unkn",
831                                             std::string fourth = "unkn",
832                                             std::string name   = "unkn"); 
833      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
834      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
835      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
836      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
837      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
838      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
839      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
840      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
841   
842    - gdcmDocument
843      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
844      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
845      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
846      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
847      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
848                                         FILE *_fp, FileType type);
849      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
850      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
851      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
852      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
853      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
854      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
855      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
856      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
857                                             guint16 element,
858                                             std::string vr     = "unkn",
859                                             std::string fourth = "unkn",
860                                             std::string name   = "unkn");
861      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
862      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
863      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
864      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
865                                                                                                                  
866         - gdcmElementSet
867           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
868           
869    - gdcmSeqEntry
870           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
871  
872    - gdcmSQItem
873      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
874      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
875      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
876      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
877
878    - gdcmValEntry
879          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
880                                   
881 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
882     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
883       The default constructor invoked by the line
884          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
885       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
886       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
887       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
888     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
889       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
890       Could anyone explain why ?
891     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
892       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
893       code related to gdcmBinEntry).
894
895 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
896     * In order to fix memory leaks:
897      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
898        some delete calls.
899      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
900      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
901        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
902        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
903        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
904      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
905      - src/gdcmDocument.cxx:
906        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
907           from dynamic stores.
908        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
909           was causing memory leaks.
910      - src/gdcmSQItem.cxx:
911        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
912           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
913        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
914           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
915           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
916           This avoids SegFaulting.
917      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
918     * Conclusion:
919      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
920        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
921        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
922      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
923        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
924      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
925        segfaults).
926     * Erroneous leading white fix:
927      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
928        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
929      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
930      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
931     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
932     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
933
934
935 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
936     * In order to fix writing of dicom files:
937      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
938      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
939      - src/gdcmDocument.cxx:
940        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
941        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
942        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
943           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
944           manner.
945        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
946           to only declared) and build on top of
947           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
948        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
949      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
950        for usage in destructor and treatement of promotion in
951        ::ReplaceOrCreateByNumber().
952      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
953       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
954     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
955       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
956       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
957       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
958
959 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
960     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
961       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
962       learned that:
963           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
964           soon as possible by globally disabling memory caching.
965           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
966           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
967       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
968       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
969       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
970     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
971       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
972       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
973       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
974         with 1.
975       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
976       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
977       understand why the list is empty...).
978     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
979     * Doc/License.txt added.
980
981 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
982     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
983       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
984         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
985         the padding problem.
986       - general clean up, simplification, and coding style.
987       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
988     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
989
990 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
991    *  gdcmSeqEntry.cxx
992            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
993                 - fix the display of SQItem ordinal number
994       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
995                 - remove some useless never written private methods     
996                 
997 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
998    * gdcmBinEntry.cxx 
999       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1000            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1001               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1002                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1003    * dcmDocument.cxx
1004       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1005               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1006            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1007       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1008    * gdcmFile.cxx
1009       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1010    * gdcmSQItem.h
1011       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1012             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1013             \warning : some pb remaining around this number
1014                                 will be solved asap
1015       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1016    * gdcmValEntry.cxx 
1017       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1018
1019 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1020     * Memory leak hunt with the following command:
1021       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1022                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1023       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1024       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1025       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1026           grep "MEMORY LEAK" src/*
1027       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1028       -----
1029           #include <string>
1030           int main() {
1031              std::string name;
1032              char * test = "babo";
1033              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1034                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1035              name.clear();   //// Doesn't help !
1036              return 0;
1037           }
1038       -----
1039           #include <string>
1040           #include <iostream>
1041           int main() {
1042              std::string line;
1043              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1044              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1045                                         //// of 1320 bytes in call to
1046                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1047             return 0;
1048           }
1049       -----
1050
1051
1052 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1053     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1054       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1055         and related, moved away to gdcmDocument.
1056       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1057         the corresponding protected accessors of inherited class
1058         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1059         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1060       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1061       - Clean up of undefined or unused methods.
1062     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1063       account the changes to gdcmHeader.h).
1064     * src/gdcmDocument.h:
1065       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1066         changes to gdcmHeader.h).
1067       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1068         (see changes to gdcmHeader.h).
1069       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1070       - Clean up of undefined or unused methods.
1071     * src/gdcmDocument.cxx:
1072       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1073       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1074       - some std::string properly set to VRKey
1075     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1076       references to gdcmDocument. 
1077     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1078     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1079       cvs repository gdcmData.
1080
1081 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1082     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1083     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1084       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1085     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1086     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1087       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1088     * src/gdcmDocument.cxx: 
1089       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1090         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1091       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1092         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1093         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1094         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1095         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1096               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1097               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1098     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1099     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1100       now taken into account.
1101     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1102       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1103     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1104       on posix.
1105     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1106       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1107     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1108
1109 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1110     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1111       gdcmGlob
1112     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1113     * src/gdcmUtil.h : export methods
1114
1115 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1116     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1117       to right behavior
1118     * Initial addition of automatic python testing
1119     * Initial addition of automatic image comparison
1120
1121 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1122     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1123       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1124
1125 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1126      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1127      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1128      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1129
1130 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1131      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1132        new concepts (and new classes) :
1133        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1134         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1135         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1136        a Sequence is composed of Items.
1137        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1138        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1139        (never taken into account)
1140        Our unability to add a new 'entry' in the header
1141        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1142        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1143        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1144        nothing is finished.
1145        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1146
1147 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1148      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1149      
1150 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1151      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1152        file prefix (SetFilePrefix)
1153
1154 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1155      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1156        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1157        baseline.
1158      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1159        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1160
1161 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1162      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1163        dicom image
1164
1165 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1166      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1167      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1168        between the developper and user version.
1169      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1170      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1171
1172 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1173      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1174        when using cmake.
1175
1176 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1177      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1178                src directory, now generated in the build dir.
1179             2. Tests as mentionned smarter
1180             3. Some clean up
1181             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1182           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1183           where we could set the institution name / patient name...
1184
1185        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1186               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1187                  (this was not true before)
1188
1189 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1190      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1191            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1192      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1193            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1194            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1195      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1196            tree-like structure of a Dicom Header.
1197      * FIX Test code cleaning     
1198            
1199 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1200      * ENH: Adding automatic testing
1201        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1202        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1203        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1204        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1205           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1206           too many projects
1207      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1208      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1209        one file instead of seven + some small cleanup
1210
1211 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1212      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1213      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1214            Header printing. Example given with :
1215            > PrintHeader fileName  2 new
1216           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1217            
1218 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1219      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1220          1. I have added some unsigned where needed
1221          2. Some function parameter not used -> (void)
1222          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1223          4. g++ don't like character '\' in comment
1224          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1225                     this really need to be fixed
1226          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1227          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1228                     this also really need to be fixed
1229          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1230                     remove compression file 
1231                     (as we only do decompression, right ?)     
1232      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1233
1234 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1235      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1236            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1237            defaulted to yspacing
1238            
1239 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1240      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1241      * ENH add parameters :
1242                bool  exception_on_error = false, 
1243                bool  enable_sequences   = false,
1244                bool  ignore_shadow      = false
1245            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1246      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1247            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1248               
1249 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1250      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1251      
1252 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1253      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1254      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1255              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1256              
1257 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1258      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1259          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1260
1261 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1262      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1263        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1264        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1265        in gdcmHeader.
1266      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1267        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1268        already does the job.
1269      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1270        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1271
1272 2004-03-30 Benoit Regrain
1273      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1274        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1275        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1276
1277 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1278      * ENH : Check on file type to be written moved
1279              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1280      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1281              when end-of-list is reached
1282            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1283
1284 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1285      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1286      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1287      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1288        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1289
1290 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1291      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1292        now contains all the gdcmGlobal related code.
1293      * minor coding style and doxygenation changes.
1294
1295 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1296      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1297        now contains all the Debug related code.
1298      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1299      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1300        CreateCleanString) removed.
1301      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1302      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1303      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1304      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1305        src/gdcmDirList.cxx)
1306
1307 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1308      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1309
1310 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1311      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1312            big endian made volumes
1313      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1314            end user to instanciate class gdcmParser
1315           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1316
1317 2004-03-22 Benoit Regrain
1318      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1319      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1320              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1321
1322 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1323      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1324            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1325            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1326            or build from the files held (recursively) in a Directory
1327            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1328            gdcmObject::SetBoundaries() added
1329
1330 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1331      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1332                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1333      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1334            DICOMDIR
1335      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1336            about the name
1337
1338 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1339      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1340                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1341
1342 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1343      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1344            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1345            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1346            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1347            to allow making gdcDicomDir object.
1348      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1349           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1350
1351 2004-02-11 Benoit Regrain
1352      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1353              when using from python
1354
1355 2004-02-10 Benoit Regrain
1356      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1357      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1358      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1359              directory parsing
1360
1361 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1362      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1363              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1364              - class gdcmMeta created
1365      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1366              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1367      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1368
1369 2004-02-05 Benoit Regrain
1370      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1371              header entries
1372      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1373      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1374
1375 2004-02-04 Benoit Regrain
1376      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1377      * FIX : sort the images in the dicom dir
1378      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1379      * ADD : a python demo
1380
1381 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1382      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1383      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1384              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1385              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1386              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1387      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1388            to make full checking easier
1389         
1390 2004-02-04 Benoit Regrain
1391      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1392      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1393
1394 2004-02-03 Benoit Regrain
1395      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1396      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1397      * Bug fix and print add-on
1398
1399 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1400      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1401      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1402      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1403      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1404            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1405         
1406 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1407      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1408              iterator on last
1409              of the last synonym :-(
1410      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1411              for DICOMDIR ;-)
1412      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1413      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1414      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1415            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1416       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1417
1418 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1419      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1420            no longer writes 'Un' on disk
1421      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1422      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1423            the length (for Palette expanded images)
1424            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1425      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1426            (that broke Write). Replaced by UL.
1427            Aware user will reload the field if he 
1428            thinks it's necesssary
1429              
1430 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1431      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1432        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1433        IsReadable() methods.
1434        
1435      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1436       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1437       but so usefull for people that miss them ;-)
1438       
1439      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1440        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1441
1442 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1443      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1444
1445 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1446      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1447              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1448         The TRUE value for this param has to be used 
1449         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1450         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1451      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1452              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1453         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1454         
1455      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1456              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1457              Fixed
1458
1459      * gdcmHeader add the method
1460              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1461         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1462         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1463         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1464
1465 2004-01-26 Benoit Regrain
1466      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1467        in the print and add a third level of print to print them
1468
1469 2004-01-23 Benoit Regrain
1470      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1471      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1472      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1473        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1474
1475 2004-01-22 Benoit Regrain
1476      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1477      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1478
1479 2004-01-19 Benoit Regrain
1480      * Add the use of shadow dictionaries
1481      * bug fix and coding style
1482
1483 2004-01-19 Benoit Regrain
1484      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1485      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1486      * Add the update of header entries using the shadow library
1487
1488 2004-01-19 Benoit Regrain
1489      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1490      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1491        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1492        of dicom dir parsing
1493      * bug fix under python
1494
1495 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1496     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1497     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1498     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1499     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1500
1501 2004-01-15 Benoit Regrain
1502      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1503        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1504        when the gdcmDictSet will be destroyed
1505      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1506        gdcmDictSet
1507
1508 2004-01-15 Benoit Regrain
1509      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1510        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1511        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1512        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1513      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1514
1515 2004-01-14 Benoit Regrain
1516      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1517      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1518      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1519      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1520
1521 2004-01-13 Benoit Regrain
1522      * src/*.[h|cxx] : coding style
1523      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1524
1525 2004-01-13 Benoit Regrain
1526      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1527      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1528        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1529      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1530
1531 2004-01-12 Benoit Regrain
1532      * src/*.h : add comments
1533      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1534      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1535        directly setted in the source code
1536      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1537        gdcmTS and gdcmVR
1538
1539 2004-01-09 Benoit Regrain
1540      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1541      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1542
1543 2004-01-07 Benoit Regrain
1544      * Modification to compile with the distutils.
1545      * Bug fix in code
1546
1547 2003-12-10 Benoit Regrain
1548      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1549        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1550      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1551        made in the source code
1552
1553 2003-12-10 Benoit Regrain
1554      * Update Windows projects and .cvsignore files
1555
1556 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1557      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1558            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1559            if he wants to.
1560            gdcmElValSet:Print takes it into account
1561
1562 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1563      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1564      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1565      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1566
1567 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1568       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1569              on the ListTag listElem member,
1570              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1571       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1572              with the tagHt member and the listElem member.
1573              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1574
1575       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1576              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1577                             if bug fixing is necessary), for internal
1578                             use only
1579              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1580                             or to allow Parser going on.
1581              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1582              with a length (not 0000) is found
1583       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1584                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1585                 (to be written)
1586
1587 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1588      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1589      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1590           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1591      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1592
1593 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1594      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1595
1596 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1597      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1598           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1599
1600 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1601      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1602      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1603              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1604              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1605
1606 2003-11-05 Benoit Regrain
1607      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1608                        : Explicit error messages
1609      * in __init__.py  : Related modif
1610
1611 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1612      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1613            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1614            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1615      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1616                     (vtkGdcmReader compliant)           
1617       
1618 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1619      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1620        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1621        
1622 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1623      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1624            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1625
1626 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1627      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1628                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1629              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1630              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1631              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1632              such an image :
1633              After gdcmHeader :
1634               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1635               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1636               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1637      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1638              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1639
1640 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1641      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1642              
1643 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1644      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1645            being coherents dicom files.
1646      
1647 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1648      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1649            from medcon lib !
1650      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1651      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1652      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1653      * ENH: Add include dir to medcon lib
1654      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1655            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1656             
1657 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1658       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1659         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1660           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1661       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1662
1663 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1664       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1665         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1666         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1667       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1668       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1669
1670 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1671       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1672                                                
1673 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1675       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1676       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1677       
1678 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1679       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1680       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1681       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1682       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1683       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1684       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1685              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1686         But it fasten debug compilation time.
1687             
1688 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1689       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1690         (they are compressed as 2 planes images, 
1691          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1692
1693 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1694       * Now CheckRead takes into account :
1695          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1696          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1697       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1698        (breaks DicomWorks)
1699
1700 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1701       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1702              one should remove the '\'
1703         
1704 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1705       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1706         (wrong lengths in header)
1707         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1708       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1709         (breaks DicomWorks)
1710
1711 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1712       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1713         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1714
1715 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1716       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1717       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1718
1719 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1720       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1721      
1722 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1723       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1724         (the patch is easy to remove)
1725       * cosmetic changes to avoid warnings
1726       
1727 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1728       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1729         no need to press 'r' now.
1730    
1731 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1732       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1733         to new Jpeg Lossless decompressor
1734       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1735       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1736       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1737                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1738 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1739       * general anonymisation in gdcmData
1740       * adding the 'color files' from
1741         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1742       * adding some well knowed bugged-header images
1743       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1744         waiting for their inclusion in Python testsuite
1745
1746 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1747     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1748       no longer seg faults when file is not found
1749
1750 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1751      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1752        MultiFrame images
1753
1754 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1755      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1756
1757 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1758      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1759         OpenFile takes it into account
1760      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1761      * Missing elements added in dicomV3.dic
1762       (just to be affraid : have a look at
1763        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1764        and do it again next year ;->
1765
1766 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1767      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1768        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1769        But there are NOT. It's fixed !
1770        
1771 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1772      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1773      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1774          
1775 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1776      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1777              an ACR-NEMA / DICOM one.
1778      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1779              is not gdcm Readable
1780      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1781              is now decoded.
1782         
1783 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1784      * FIX: CMake generate now documentation
1785      * ENH: out of source doc build !
1786      * ENH: Generate both user and dev documentation
1787      * ENH: Should work on windows too
1788      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1789      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1790      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1791      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1792                      
1793 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1794      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1795      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1796      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1797         window level & window width
1798
1799 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1800      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1801      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1802      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1803      
1804 2003-10-06  Emanuel Ollart
1805      * FIX : compilation process wad broken.
1806              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1807         
1808 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1809      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1810      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1811      
1812 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1813      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1814            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1815                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1816       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1817
1818 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1819       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1820         to remain compliant with already defined strings, 
1821         like Transfert Syntax UID and others)
1822
1823 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1824       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1825              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1826         
1827 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1828       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1829       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1830
1831 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1832       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1833         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1834               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1835       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1836
1837 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1838       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1839
1840 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1841       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1842         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1843
1844 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1845       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1846          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1847          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1848          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1849           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1850                                             YBR_RCT files.
1851           (no sample found :-(
1852
1853 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1854       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1855         Two reasons: - clear things
1856                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1857                        suffer anymore VC++ complains
1858
1859 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1860       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1861       * removed leaks
1862
1863 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1864       * The lines are now eigthy characters long.for 
1865         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1866
1867 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1868       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1869         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1870         previous commis of Malaterre)
1871       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1872         before the last Malaterre's commit.
1873
1874 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1875       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1876         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1877       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1878         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1879
1880 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1881       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1882         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1883         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1884
1885 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1886       * Cosmetic changes:
1887         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1888           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1889           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1890           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1891         - PACKAGER corrected
1892         - DEVELOPPER added.
1893         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1894       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1895
1896 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1897       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1898
1899 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1900       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1901
1902 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1903       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1904
1905 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1906       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1907
1908 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1909       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1910         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1911         heuristics to get informations (look at different places).
1912       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1913         sorting DICOM images based on different strategies.
1914       * modified Makefiles accordingly.
1915
1916 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1917       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1918         when building in debug mode
1919       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1920         src/win32/gdcmdll.dsp
1921       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1922
1923 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1924       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1925             to valgrind.
1926
1927 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1928       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1929       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1930                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1931       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1932
1933 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1934       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1935         the file
1936       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1937       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1938         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1939       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1940         symbols... future problem ?
1941
1942 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1943       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1944       * modified gdcm.dsw accordingly
1945
1946 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1947       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1948
1949 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1950       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1951         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1952       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1953         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1954         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1955
1956 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1957       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1958
1959 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1960       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1961       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1962       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1963       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1964       * PACKAGER : adding all concerning windows
1965
1966 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1967       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1968         garbage debug code.
1969       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1970       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1971         test suite reported error.
1972       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1973         packaging a new release).
1974       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1975       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1976       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1977         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1978         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1979
1980 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1981       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1982       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1983
1984 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1985       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1986         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1987         is made in an internal list to prevent this problem.
1988         Bug fix when output is empty.
1989         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1990         correction.
1991       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1992
1993 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1994       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1995       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1996         files. Added method to remove all files on the input
1997         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1998         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1999
2000 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2001       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2002         when using make instal.
2003       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2004         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2005
2006 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2007       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2008       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2009
2010 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2011       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2012         linux and WINDOWS !
2013       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2014       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2015
2016 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2017       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2018         addon of the jpeg library)
2019       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2020       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2021       * INSTALL now points to web documentation
2022
2023 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2024       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2025         gdcmUtil.h anymore.
2026       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2027         clean target.
2028       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2029         - to allow compilation with gcc 3.x
2030           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2031           -- small fixes on exceptions.
2032           Note: linking not tested !
2033         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2034           building stage.
2035       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2036         dependent convertion).
2037
2038 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2039       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2040         Changelog):
2041         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2042         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2043           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2044         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2045
2046 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2047       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2048         compile
2049       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2050         (FileName -> Filename)
2051
2052 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2053       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2054         - UpdateProgress method should now be effective
2055         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2056           to volumes),
2057         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2058           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2059           accelerating things).
2060         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2061           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2062           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2063           in the stack (for the caller to notice the problem).
2064
2065 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2066       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2067
2068 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2069       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2070         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2071         under Windows... thanks Windows !)
2072
2073 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2074       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2075         debug stage).
2076       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2077
2078 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2079       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2080
2081 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2082       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2083         called with different flags than the default ones (with automake).
2084         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2085            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2086         and went for warning fixes:
2087         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2088           up from unused variables.
2089         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2090       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2091
2092 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2093       * gdcmPython/gdcm.i:
2094         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2095           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2096           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2097         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2098           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2099           exported to Python a as cvar.
2100       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2101         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2102         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2103         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2104         C++ static methods).
2105       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2106         with the above changes.
2107
2108 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2109       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2110
2111 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2112       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2113         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2114         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2115          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2116          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2117            a wrapper
2118          - Wrapper interface which wrap sources
2119         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2120         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2121       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2122         files for compilation
2123
2124 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2125       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2126         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2127         - vtk/Makefile.am now builds a library
2128         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2129           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2130           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2131           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2132           import library.
2133         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2134           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2135           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2136           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2137           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2138         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2139           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2140         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2141           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2142       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2143       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2144         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2145         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2146         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2147         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2148         collision of various stl members (principally cout...).
2149       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2150         file.
2151       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2152         comply with above changes)
2153
2154 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2155       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2156       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2157         vtk data structure (an image Flip was required).
2158       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2159       * cosmetic changes in documentation.
2160
2161 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2162       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2163         unexisting file is given as argument.
2164       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2165         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2166         containing those images is now available at
2167           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2168         with the name gdcmData.
2169         All the python scripts (including the package initialisation file
2170         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2171         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2172
2173 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2174       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2175         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2176         demo of the usage of this class.
2177         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2178         at configure (or autogen.sh) stage.
2179
2180 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2181       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2182         Notes on valgrind:
2183           - maximum info is obtained with a command of the form:
2184             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2185                      --show-reachable=yes PrintHeader
2186           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2187             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2188             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2189             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2190              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2191       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2192         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2193         Note: some images don't seem to work e.g.
2194             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2195       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2196         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2197         make gdcm more thread friendly.
2198
2199 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2200       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2201           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2202         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2203           gdcmHeader::_dicom_vr.
2204         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2205         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2206           VRHT*.
2207         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2208
2209 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2210       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2211         make install stage.
2212
2213 2003-04-9 JPR
2214       * UpdateGroupLength replaced by new one
2215
2216 2003-04-7 JPR
2217       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2218         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2219
2220 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2221       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2222       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2223       * src:
2224         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2225         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2226           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2227         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2228           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2229           carried the same semantics.
2230           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2231         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2232           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2233         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2234       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2235       * gdcmGetXSize added
2236       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2237       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2238
2239 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2240       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2241         (to avoid double call by end user).
2242       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2243         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2244
2245 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2246       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2247         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2248           the html.users end users oriented documentation and
2249           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2250           oriented documentation.
2251         - README changed accordingly
2252         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2253         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2254           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2255         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2256           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2257           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2258       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2259         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2260       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2261         ill-formed documentation sections.
2262       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2263
2264 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2265       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2266       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2267         un*ces with sh-utils test utility.
2268       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2269       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2270       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2271       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2272       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2273
2274 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2275       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2276       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2277
2278 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2279       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2280       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2281       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2282       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2283         compilation work.
2284       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2285       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2286
2287 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2288       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2289         hence the user doesn't need this explicit call.
2290         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2291           i.e. LoadElements() call removed.
2292       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2293         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2294       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2295         for adding user defined new tags.
2296         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2297         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2298           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2299
2300 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2301       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2302         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2303         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2304         with the autotools, included the python wrappers part.
2305       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2306
2307 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2308       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2309
2310 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2311       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2312         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2313         for usage).
2314       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2315         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2316         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2317       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2318         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2319
2320 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2321       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2322         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2323         value of GDCM_DICT_PATH.
2324       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2325
2326 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2327       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2328       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2329       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2330         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2331         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2332
2333 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2334       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2335         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2336         gdcmHeader.h
2337       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2338         (as opposed to gdcm.h)
2339       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2340       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2341         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2342       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2343
2344 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2345       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2346         bug.
2347
2348 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2349       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2350         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2351         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2352         of hidding away the python related distutils specific files
2353         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2354         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2355         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2356         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2357
2358 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2359       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2360       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2361         among the list of sources.
2362
2363 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2364       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2365       * modifications in MSVC projects
2366
2367 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2368       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2369         looks like we can move back to original usage of exception within
2370         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2371         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2372       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2373         README file for usage added.
2374       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2375         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2376         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2377         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2378       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2379       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2380         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2381           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2382           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2383           instance of class gdcmHeader.
2384         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2385           require no instances at all to be invocated.
2386         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2387           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2388           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2389       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2390         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2391       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2392         the above to be effective.
2393       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2394         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2395       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2396         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2397         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2398         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2399         (for python dectection).
2400       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2401         now avoids publishing the empty entries.
2402
2403 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2404       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2405         ExtraPath reused :-P
2406       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2407
2408 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2409       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2410       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2411       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2412         and links
2413
2414 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2415       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2416         method. Doxygenation.
2417       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2418
2419 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2420       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2421         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2422         when using "python setup.py install".
2423       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2424         reexports the working classes.
2425       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2426         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2427         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2428         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2429         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2430         subdir (see the README file). This problem probably due to
2431         an combination of g++ and dynamic loading.
2432       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2433
2434 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2435       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2436         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2437         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2438         again in a python subdir, but the package itself is now in
2439         python/gdcmPython.
2440       * setup.py was cleaned up:
2441         - pythonIncludePath removed
2442         - python setup.py bdist target is now functional.
2443       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2444         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2445         accordingly.
2446
2447 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2448       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2449       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2450         distutils installer is operational.
2451       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2452           shadow classes (from gdcm.py).
2453         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2454           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2455         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2456
2457 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2458       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2459         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2460         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2461         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2462         dictionary.
2463         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2464           are now in the "???" group.
2465         - python/gdcm.i changed accordingly,
2466         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2467           of the above new functionalities in Python.
2468
2469 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2470       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2471         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2472           were definitively removed.
2473         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2474       * src/gdcmElValSet.cxx:
2475         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2476         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2477         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2478         - Added GetElementByName(string).
2479       * src/gdcmHeader.cxx: added
2480         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2481         - GetPubElValRepByName(string)
2482         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2483         - GetShaElValRepByName(string)
2484         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2485         - GetShaElValRepByName(string)
2486         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2487         - GetElValRepByName(string)
2488         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2489         - GetElValRepByName(string)
2490       * Doc/requirements.txt added.
2491
2492 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2493       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2494       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2495         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2496         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2497         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2498       * python/testSuite.py changed accordingly.
2499
2500 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2501       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2502         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2503              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2504               cannot be exported. [...]
2505               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2506               be exported. [...]
2507               This is caused by a designed limitation that once a template
2508               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2509               exported."
2510         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2511         limitation" of VC++ is a pitfall.
2512         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2513         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2514         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2515         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2516         library.
2517         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2518       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2519          dll under windows !!!!)
2520       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2521       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2522         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2523       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2524         (one) of image(s).
2525       * removed glib references
2526       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2527
2528 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2529       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2530         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2531         the files of the testsuite without using unittest.
2532       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2533       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2534       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2535         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2536
2537 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2538       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2539         values, but limits itself to values which are below a user specified
2540         size (by default 1024 bytes).
2541       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2542         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2543         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2544         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2545       * python/testSuite.py
2546         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2547         - two new examples added.
2548       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2549
2550 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2551       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2552         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2553       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2554       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2555       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2556
2557 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2558       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2559         the vr was also RET.
2560       * python/testSuite.py more tests added.
2561
2562 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2563       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2564       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2565       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2566         7.18 Integer types (see stdint.h)
2567         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2568       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2569         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2570         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2571         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2572         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2573         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2574         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2575         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2576
2577 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2578       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2579         VR files.
2580       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2581
2582 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2583       * Adaptation for porting to VC++:
2584         - src/gdcm.h
2585           o forced to use std namespace (for string to be known)
2586           o all class use __declspec export style on WIN32
2587         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2588           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2589       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2590         variable GDCM_DICT_PATH.
2591       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2592
2593 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2594       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2595         to native Python dictionary.
2596       * python/demo/test.py:
2597         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2598         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2599       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2600         PubElVals hashing table.
2601       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2602
2603 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2604       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2605         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2606       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2607       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2608       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2609         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2610       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2611
2612 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2613       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2614         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2615         that we can import de shadow classes without errors].
2616
2617 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2618       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2619       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2620       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2621       * src/Makefile prepared for python wrapping
2622
2623 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2624       * src/gdcmHeader.cxx :
2625         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2626           (see gdcmHeader::LoadElements).
2627         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2628           ReadInt16 and ReadInt32)
2629
2630 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2631       * src/gdcmHeader.cxx :
2632         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2633           method.
2634         - SetLgrElem renamed to SetLength
2635         - GetLgrElem renamed to GetLength
2636         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2637       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2638       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2639         due to IdoDude was cleaned out.
2640
2641 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2642       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2643         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2644         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2645         returning the unecessary skL (skipped length).
2646         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2647         it was redundant with the File position internals (by using
2648         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2649         jajun.
2650       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2651         on the libido specificities which are handled through class
2652         inheritance.
2653       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2654         added.
2655
2656 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2657       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2658         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2659
2660 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2661       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2662
2663 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2664       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2665         and _IdDcmSWAP_LONG.
2666
2667 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2668       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2669         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2670