]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
3     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
4     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
5     in class 
6     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
7       and associated accessors. Doxygenation of the class.
8     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
9       accessors added.
10     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
11       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
12     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
13     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
14
15 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
16   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
17     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
18       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
19            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
20            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
21            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
22            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
23            the same group and element all share the same (group, element)
24            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
25            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
26            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
27            consider the following definition of a TagKey:
28            - let Group, Element be the string representation of the
29              group and element dicom tag members,
30            - let ItemNumber be the string representation of the integer
31              index of the considered item number of a sequence,
32            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
33            the form:
34               /ItemNumber#Group|Element
35            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
36            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
37               Group|Element<SeqTag>
38            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
39            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
40            string e.g.
41                0028|1201
42            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
43            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
44            string e.g.
45                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
46     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
47       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
48       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
49     - src/gdcmDocEntry.cxx:
50       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
51          Key member.
52       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
53     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
54     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
55       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
56       -- now has a new BaseTagKey member.
57       -- STYLE.
58   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
59     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
60     truly belongs.
61     This poses the problem with the semantics of the following lines
62        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
63        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
64        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
65     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
66     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
67     order to get things working the dicom dictionary was altered !
68     Please fix things urgently...
69   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
70     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
71     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
72     set to OW:
73       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
74       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
75       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
76   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
77     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
78   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
79
80 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
81   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
82
83 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
84   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
85     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
86   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
87   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
88
89 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
90   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
91     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
92   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
93     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
94   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
95     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
96   * TODO updated
97   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
98     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
99   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
100   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
101     exception_on_error parameter.
102     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
103     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
104     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
105
106 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
107   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
108   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
109     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
110   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
111   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
112   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
113     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
114   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
115
116 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
117   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
118     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
119
120 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
121   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
122        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
123                  
124 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
125   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
126         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
127
128 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
129    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
130    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
131      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
132      is now in static in the gdcmDebug class
133    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
134    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
135
136 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
137    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
138      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
139    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
140      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
141      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
142      that displays position and size).
143    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
144      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
145      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
146      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
147      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
148      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
149      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
150         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
151      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
152      commiting changes).
153    * Test/CMakeLists.txt:
154       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
155       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
156         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
157         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
158    * TODO updated.
159
160 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
161    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
162      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
163      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
164      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
165      - removal of typedef duplication.
166      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
167      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
168    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
169       - printf polluting ctest removed.
170       - TAB removal for comminting
171    * Test:
172      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
173        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
174        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
175        this test creates them.
176        Note: we need to validate each reference image, but before that
177              I'd like to rename them with a more explicit name...
178      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
179    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
180      including each header needed).
181
182 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
183    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
184      test suite to the Example directory. Are concerned:
185      - PrintHeader.cxx
186      - TestDcm2Acr.cxx
187      - TestFindTags.cxx
188      - TestWrite.cxx was
189      - TestWriteSimple.cxx
190    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
191      image gdcmData/oldACR00001.ima
192
193 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
194    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
195      with removal from gdcmData):
196       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
197       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
198       - US.3405.1.dcm
199      Added the following because after last cvs update, they cause
200        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
201      to segfault:
202       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
203       - oldACR00001.ima
204    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
205      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
206      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
207      form of test...
208    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
209      we don't need to black list the following images anymore:
210       - 8BitsUncompressedColor.dcm
211       - OT-PAL-8-face.dcm
212       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
213    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
214      fixes and the beautified code ;-)
215      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
216      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
217      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
218            improve the test suite). The bug could be detected by using
219            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
220            or by using
221            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
222            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
223
224 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
225    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
226          - replace by uggly but working old code :-(
227                 A lot of things should be OK again.
228         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
229         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
230         (twice, withing a fortnigh ...)         
231
232 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
233    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
234      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
235    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
236      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
237      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
238                    - OT-PAL-8-face.dcm
239                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
240    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
241      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
242      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
243      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
244      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
245      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
246      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
247      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
248      image.
249    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
250      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
251      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
252      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
253    
254 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
255   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
256   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
257                           (instead of infinite loop)
258   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
259
260 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
261    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
262
263 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
264    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
265                     when SamplesPerPixel =3
266          - now Write is no longer confused by 
267                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
268          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
269                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
270    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
271                     (in order to split the job that has not to be done 
272                                         for gdcmDicomDir)
273
274 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
275    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
276      loop on the same image until memory went out. 
277      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
278    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
279      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
280
281 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
282    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
283             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
284                                 is added a the end, when necessary.
285             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
286                       now written correctly
287                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
288                                 (even for odd groups) 
289         Note : only Explicit Value Representation was checked.
290                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
291
292 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
293    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
294    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
295      coding style).
296
297 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
298    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
299      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
300    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
301
302 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
303    FIX : gdcmDocument.cxx
304       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
305         code 'beautyfication' :-(
306       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
307
308 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
309    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
310                  : to allow user to create his own Sequences
311         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
312
313 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
314         
315         - gdcmBinEntry
316           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
317           
318    - gdcmDocEntry
319           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
320           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
321           
322         - gdcmDocEntrySet
323           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
324           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
325      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
326      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
327      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
328      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
329                                             guint16 element,
330                                             std::string vr     = "unkn",
331                                             std::string fourth = "unkn",
332                                             std::string name   = "unkn"); 
333           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
334      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
335      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
336      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
337      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
338      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
339           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
340      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
341           
342         - gdcmDocument
343      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
344      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
345      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
346      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
347      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
348                                         FILE *_fp, FileType type);
349      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
350      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
351      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
352      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
353      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
354      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
355      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
356      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
357                                             guint16 element,
358                                             std::string vr     = "unkn",
359                                             std::string fourth = "unkn",
360                                             std::string name   = "unkn");
361      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
362      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
363      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
364      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
365                                                                                                                  
366         - gdcmElementSet
367           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
368           
369    - gdcmSeqEntry
370           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
371  
372    - gdcmSQItem
373      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
374      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
375      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
376      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
377
378    - gdcmValEntry
379          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
380                                   
381 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
382     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
383       The default constructor invoked by the line
384          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
385       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
386       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
387       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
388     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
389       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
390       Could anyone explain why ?
391     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
392       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
393       code related to gdcmBinEntry).
394
395 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
396     * In order to fix memory leaks:
397      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
398        some delete calls.
399      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
400      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
401        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
402        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
403        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
404      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
405      - src/gdcmDocument.cxx:
406        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
407           from dynamic stores.
408        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
409           was causing memory leaks.
410      - src/gdcmSQItem.cxx:
411        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
412           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
413        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
414           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
415           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
416           This avoids SegFaulting.
417      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
418     * Conclusion:
419      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
420        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
421        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
422      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
423        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
424      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
425        segfaults).
426     * Erroneous leading white fix:
427      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
428        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
429      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
430      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
431     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
432     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
433
434
435 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
436     * In order to fix writing of dicom files:
437      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
438      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
439      - src/gdcmDocument.cxx:
440        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
441        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
442        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
443           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
444           manner.
445        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
446           to only declared) and build on top of
447           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
448        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
449      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
450        for usage in destructor and treatement of promotion in
451        ::ReplaceOrCreateByNumber().
452      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
453       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
454     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
455       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
456       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
457       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
458
459 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
460     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
461       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
462       learned that:
463           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
464           soon as possible by globally disabling memory caching.
465           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
466           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
467       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
468       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
469       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
470     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
471       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
472       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
473       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
474         with 1.
475       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
476       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
477       understand why the list is empty...).
478     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
479     * Doc/License.txt added.
480
481 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
482     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
483       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
484         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
485         the padding problem.
486       - general clean up, simplification, and coding style.
487       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
488     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
489
490 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
491    *  gdcmSeqEntry.cxx
492            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
493                 - fix the display of SQItem ordinal number
494       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
495                 - remove some useless never written private methods     
496                 
497 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
498    * gdcmBinEntry.cxx 
499       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
500            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
501               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
502                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
503    * dcmDocument.cxx
504       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
505               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
506            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
507       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
508    * gdcmFile.cxx
509       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
510    * gdcmSQItem.h
511       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
512             a (relative) Item identier inside a given Sequence
513             \warning : some pb remaining around this number
514                                 will be solved asap
515       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
516    * gdcmValEntry.cxx 
517       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
518
519 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
520     * Memory leak hunt with the following command:
521       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
522                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
523       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
524       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
525       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
526           grep "MEMORY LEAK" src/*
527       Here are two typical examples which I can't help fixing:
528       -----
529           #include <string>
530           int main() {
531              std::string name;
532              char * test = "babo";
533              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
534                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
535              name.clear();   //// Doesn't help !
536              return 0;
537           }
538       -----
539           #include <string>
540           #include <iostream>
541           int main() {
542              std::string line;
543              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
544              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
545                                         //// of 1320 bytes in call to
546                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
547             return 0;
548           }
549       -----
550
551
552 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
553     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
554       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
555         and related, moved away to gdcmDocument.
556       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
557         the corresponding protected accessors of inherited class
558         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
559         declared friend of class gdcmDocument (see below).
560       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
561       - Clean up of undefined or unused methods.
562     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
563       account the changes to gdcmHeader.h).
564     * src/gdcmDocument.h:
565       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
566         changes to gdcmHeader.h).
567       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
568         (see changes to gdcmHeader.h).
569       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
570       - Clean up of undefined or unused methods.
571     * src/gdcmDocument.cxx:
572       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
573       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
574       - some std::string properly set to VRKey
575     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
576       references to gdcmDocument. 
577     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
578     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
579       cvs repository gdcmData.
580
581 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
582     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
583     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
584       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
585     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
586     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
587       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
588     * src/gdcmDocument.cxx: 
589       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
590         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
591       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
592         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
593         removed. Reverting to previous code segment with the proper
594         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
595         Note: this was (partially) breaking the python test suite
596               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
597               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
598     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
599     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
600       now taken into account.
601     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
602       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
603     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
604       on posix.
605     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
606       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
607     * .... alas, the python testSuite is still broken.
608
609 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
610     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
611       gdcmGlob
612     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
613     * src/gdcmUtil.h : export methods
614
615 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
616     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
617       to right behavior
618     * Initial addition of automatic python testing
619     * Initial addition of automatic image comparison
620
621 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
622     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
623       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
624
625 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
626      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
627      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
628      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
629
630 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
631      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
632        new concepts (and new classes) :
633        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
634         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
635         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
636        a Sequence is composed of Items.
637        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
638        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
639        (never taken into account)
640        Our unability to add a new 'entry' in the header
641        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
642        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
643        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
644        nothing is finished.
645        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
646
647 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
648      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
649      
650 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
651      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
652        file prefix (SetFilePrefix)
653
654 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
655      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
656        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
657        baseline.
658      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
659        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
660
661 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
662      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
663        dicom image
664
665 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
667      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
668        between the developper and user version.
669      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
670      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
671
672 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
673      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
674        when using cmake.
675
676 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
677      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
678                src directory, now generated in the build dir.
679             2. Tests as mentionned smarter
680             3. Some clean up
681             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
682           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
683           where we could set the institution name / patient name...
684
685        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
686               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
687                  (this was not true before)
688
689 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
690      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
691            SeQuence indented printing of Dicom Header.
692      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
693            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
694            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
695      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
696            tree-like structure of a Dicom Header.
697      * FIX Test code cleaning     
698            
699 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
700      * ENH: Adding automatic testing
701        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
702        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
703        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
704        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
705           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
706           too many projects
707      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
708      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
709        one file instead of seven + some small cleanup
710
711 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
712      * ENH Minor changes to the Print() methods.
713      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
714            Header printing. Example given with :
715            > PrintHeader fileName  2 new
716           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
717            
718 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
719      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
720          1. I have added some unsigned where needed
721          2. Some function parameter not used -> (void)
722          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
723          4. g++ don't like character '\' in comment
724          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
725                     this really need to be fixed
726          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
727          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
728                     this also really need to be fixed
729          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
730                     remove compression file 
731                     (as we only do decompression, right ?)     
732      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
733
734 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
735      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
736            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
737            defaulted to yspacing
738            
739 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
740      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
741      * ENH add parameters :
742                bool  exception_on_error = false, 
743                bool  enable_sequences   = false,
744                bool  ignore_shadow      = false
745            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
746      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
747            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
748               
749 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
750      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
751      
752 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
753      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
754      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
755              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
756              
757 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
758      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
759          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
760
761 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
762      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
763        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
764        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
765        in gdcmHeader.
766      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
767        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
768        already does the job.
769      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
770        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
771
772 2004-03-30 Benoit Regrain
773      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
774        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
775        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
776
777 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
778      * ENH : Check on file type to be written moved
779              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
780      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
781              when end-of-list is reached
782            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
783
784 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
785      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
786      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
787      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
788        equivalent to ExplicitVR in existing code).
789
790 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
791      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
792        now contains all the gdcmGlobal related code.
793      * minor coding style and doxygenation changes.
794
795 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
796      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
797        now contains all the Debug related code.
798      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
799      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
800        CreateCleanString) removed.
801      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
802      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
803      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
804      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
805        src/gdcmDirList.cxx)
806
807 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
808      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
809
810 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
811      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
812            big endian made volumes
813      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
814            end user to instanciate class gdcmParser
815           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
816
817 2004-03-22 Benoit Regrain
818      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
819      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
820              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
821
822 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
823      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
824            an already existing DICOMDIR file is consistent with
825            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
826            or build from the files held (recursively) in a Directory
827            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
828            gdcmObject::SetBoundaries() added
829
830 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
831      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
832                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
833      * FIX now file names and directory name are written properly in the
834            DICOMDIR
835      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
836            about the name
837
838 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
839      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
840                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
841
842 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
843      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
844            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
845            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
846            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
847            to allow making gdcDicomDir object.
848      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
849           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
850
851 2004-02-11 Benoit Regrain
852      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
853              when using from python
854
855 2004-02-10 Benoit Regrain
856      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
857      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
858      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
859              directory parsing
860
861 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
862      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
863              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
864              - class gdcmMeta created
865      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
866              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
867      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
868
869 2004-02-05 Benoit Regrain
870      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
871              header entries
872      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
873      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
874
875 2004-02-04 Benoit Regrain
876      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
877      * FIX : sort the images in the dicom dir
878      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
879      * ADD : a python demo
880
881 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
882      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
883      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
884              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
885              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
886              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
887      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
888            to make full checking easier
889         
890 2004-02-04 Benoit Regrain
891      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
892      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
893
894 2004-02-03 Benoit Regrain
895      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
896      * gdcmDicomDir : add the load of directory
897      * Bug fix and print add-on
898
899 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
900      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
901      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
902      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
903      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
904            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
905         
906 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
907      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
908              iterator on last
909              of the last synonym :-(
910      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
911              for DICOMDIR ;-)
912      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
913      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
914      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
915            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
916       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
917
918 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
919      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
920            no longer writes 'Un' on disk
921      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
922      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
923            the length (for Palette expanded images)
924            and Raw Length (non expanded image + Palette)
925      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
926            (that broke Write). Replaced by UL.
927            Aware user will reload the field if he 
928            thinks it's necesssary
929              
930 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
931      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
932        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
933        IsReadable() methods.
934        
935      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
936       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
937       but so usefull for people that miss them ;-)
938       
939      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
940        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
941
942 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
943      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
944
945 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
946      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
947              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
948         The TRUE value for this param has to be used 
949         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
950         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
951      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
952              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
953         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
954         
955      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
956              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
957              Fixed
958
959      * gdcmHeader add the method
960              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
961         to get *all* the Header Entries with the same tag.
962         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
963         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
964
965 2004-01-26 Benoit Regrain
966      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
967        in the print and add a third level of print to print them
968
969 2004-01-23 Benoit Regrain
970      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
971      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
972      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
973        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
974
975 2004-01-22 Benoit Regrain
976      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
977      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
978
979 2004-01-19 Benoit Regrain
980      * Add the use of shadow dictionaries
981      * bug fix and coding style
982
983 2004-01-19 Benoit Regrain
984      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
985      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
986      * Add the update of header entries using the shadow library
987
988 2004-01-19 Benoit Regrain
989      * removal of file gdcmHeader2.cxx
990      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
991        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
992        of dicom dir parsing
993      * bug fix under python
994
995 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
996     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
997     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
998     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
999     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1000
1001 2004-01-15 Benoit Regrain
1002      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1003        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1004        when the gdcmDictSet will be destroyed
1005      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1006        gdcmDictSet
1007
1008 2004-01-15 Benoit Regrain
1009      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1010        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1011        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1012        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1013      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1014
1015 2004-01-14 Benoit Regrain
1016      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1017      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1018      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1019      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1020
1021 2004-01-13 Benoit Regrain
1022      * src/*.[h|cxx] : coding style
1023      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1024
1025 2004-01-13 Benoit Regrain
1026      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1027      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1028        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1029      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1030
1031 2004-01-12 Benoit Regrain
1032      * src/*.h : add comments
1033      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1034      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1035        directly setted in the source code
1036      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1037        gdcmTS and gdcmVR
1038
1039 2004-01-09 Benoit Regrain
1040      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1041      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1042
1043 2004-01-07 Benoit Regrain
1044      * Modification to compile with the distutils.
1045      * Bug fix in code
1046
1047 2003-12-10 Benoit Regrain
1048      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1049        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1050      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1051        made in the source code
1052
1053 2003-12-10 Benoit Regrain
1054      * Update Windows projects and .cvsignore files
1055
1056 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1057      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1058            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1059            if he wants to.
1060            gdcmElValSet:Print takes it into account
1061
1062 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1063      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1064      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1065      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1066
1067 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1068       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1069              on the ListTag listElem member,
1070              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1071       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1072              with the tagHt member and the listElem member.
1073              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1074
1075       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1076              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1077                             if bug fixing is necessary), for internal
1078                             use only
1079              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1080                             or to allow Parser going on.
1081              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1082              with a length (not 0000) is found
1083       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1084                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1085                 (to be written)
1086
1087 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1088      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1089      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1090           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1091      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1092
1093 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1094      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1095
1096 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1097      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1098           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1099
1100 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1101      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1102      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1103              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1104              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1105
1106 2003-11-05 Benoit Regrain
1107      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1108                        : Explicit error messages
1109      * in __init__.py  : Related modif
1110
1111 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1112      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1113            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1114            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1115      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1116                     (vtkGdcmReader compliant)           
1117       
1118 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1119      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1120        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1121        
1122 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1123      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1124            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1125
1126 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1127      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1128                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1129              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1130              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1131              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1132              such an image :
1133              After gdcmHeader :
1134               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1135               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1136               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1137      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1138              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1139
1140 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1141      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1142              
1143 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1144      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1145            being coherents dicom files.
1146      
1147 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1148      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1149            from medcon lib !
1150      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1151      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1152      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1153      * ENH: Add include dir to medcon lib
1154      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1155            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1156             
1157 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1158       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1159         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1160           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1161       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1162
1163 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1164       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1165         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1166         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1167       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1168       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1169
1170 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1171       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1172                                                
1173 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1174       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1175       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1176       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1177       
1178 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1179       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1180       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1181       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1182       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1183       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1184       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1185              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1186         But it fasten debug compilation time.
1187             
1188 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1189       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1190         (they are compressed as 2 planes images, 
1191          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1192
1193 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1194       * Now CheckRead takes into account :
1195          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1196          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1197       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1198        (breaks DicomWorks)
1199
1200 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1201       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1202              one should remove the '\'
1203         
1204 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1205       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1206         (wrong lengths in header)
1207         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1208       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1209         (breaks DicomWorks)
1210
1211 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1212       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1213         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1214
1215 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1216       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1217       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1218
1219 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1220       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1221      
1222 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1223       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1224         (the patch is easy to remove)
1225       * cosmetic changes to avoid warnings
1226       
1227 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1228       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1229         no need to press 'r' now.
1230    
1231 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1232       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1233         to new Jpeg Lossless decompressor
1234       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1235       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1236       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1237                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1238 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1239       * general anonymisation in gdcmData
1240       * adding the 'color files' from
1241         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1242       * adding some well knowed bugged-header images
1243       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1244         waiting for their inclusion in Python testsuite
1245
1246 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1247     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1248       no longer seg faults when file is not found
1249
1250 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1251      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1252        MultiFrame images
1253
1254 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1255      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1256
1257 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1258      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1259         OpenFile takes it into account
1260      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1261      * Missing elements added in dicomV3.dic
1262       (just to be affraid : have a look at
1263        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1264        and do it again next year ;->
1265
1266 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1267      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1268        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1269        But there are NOT. It's fixed !
1270        
1271 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1272      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1273      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1274          
1275 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1276      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1277              an ACR-NEMA / DICOM one.
1278      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1279              is not gdcm Readable
1280      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1281              is now decoded.
1282         
1283 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1284      * FIX: CMake generate now documentation
1285      * ENH: out of source doc build !
1286      * ENH: Generate both user and dev documentation
1287      * ENH: Should work on windows too
1288      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1289      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1290      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1291      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1292                      
1293 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1294      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1295      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1296      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1297         window level & window width
1298
1299 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1300      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1301      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1302      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1303      
1304 2003-10-06  Emanuel Ollart
1305      * FIX : compilation process wad broken.
1306              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1307         
1308 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1309      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1310      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1311      
1312 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1313      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1314            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1315                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1316       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1317
1318 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1319       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1320         to remain compliant with already defined strings, 
1321         like Transfert Syntax UID and others)
1322
1323 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1324       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1325              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1326         
1327 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1328       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1329       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1330
1331 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1332       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1333         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1334               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1335       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1336
1337 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1338       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1339
1340 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1341       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1342         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1343
1344 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1345       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1346          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1347          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1348          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1349           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1350                                             YBR_RCT files.
1351           (no sample found :-(
1352
1353 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1354       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1355         Two reasons: - clear things
1356                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1357                        suffer anymore VC++ complains
1358
1359 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1360       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1361       * removed leaks
1362
1363 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1364       * The lines are now eigthy characters long.for 
1365         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1366
1367 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1368       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1369         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1370         previous commis of Malaterre)
1371       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1372         before the last Malaterre's commit.
1373
1374 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1375       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1376         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1377       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1378         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1379
1380 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1381       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1382         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1383         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1384
1385 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1386       * Cosmetic changes:
1387         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1388           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1389           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1390           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1391         - PACKAGER corrected
1392         - DEVELOPPER added.
1393         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1394       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1395
1396 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1397       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1398
1399 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1400       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1401
1402 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1403       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1404
1405 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1406       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1407
1408 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1409       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1410         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1411         heuristics to get informations (look at different places).
1412       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1413         sorting DICOM images based on different strategies.
1414       * modified Makefiles accordingly.
1415
1416 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1417       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1418         when building in debug mode
1419       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1420         src/win32/gdcmdll.dsp
1421       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1422
1423 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1424       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1425             to valgrind.
1426
1427 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1428       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1429       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1430                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1431       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1432
1433 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1434       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1435         the file
1436       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1437       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1438         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1439       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1440         symbols... future problem ?
1441
1442 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1443       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1444       * modified gdcm.dsw accordingly
1445
1446 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1447       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1448
1449 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1450       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1451         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1452       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1453         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1454         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1455
1456 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1457       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1458
1459 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1460       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1461       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1462       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1463       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1464       * PACKAGER : adding all concerning windows
1465
1466 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1467       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1468         garbage debug code.
1469       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1470       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1471         test suite reported error.
1472       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1473         packaging a new release).
1474       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1475       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1476       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1477         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1478         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1479
1480 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1481       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1482       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1483
1484 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1485       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1486         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1487         is made in an internal list to prevent this problem.
1488         Bug fix when output is empty.
1489         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1490         correction.
1491       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1492
1493 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1494       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1495       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1496         files. Added method to remove all files on the input
1497         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1498         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1499
1500 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1501       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1502         when using make instal.
1503       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1504         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1505
1506 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1507       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1508       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1509
1510 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1511       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1512         linux and WINDOWS !
1513       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1514       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1515
1516 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1517       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1518         addon of the jpeg library)
1519       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1520       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1521       * INSTALL now points to web documentation
1522
1523 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1524       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1525         gdcmUtil.h anymore.
1526       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1527         clean target.
1528       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1529         - to allow compilation with gcc 3.x
1530           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1531           -- small fixes on exceptions.
1532           Note: linking not tested !
1533         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1534           building stage.
1535       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1536         dependent convertion).
1537
1538 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1539       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1540         Changelog):
1541         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1542         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1543           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1544         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1545
1546 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1547       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1548         compile
1549       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1550         (FileName -> Filename)
1551
1552 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1553       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1554         - UpdateProgress method should now be effective
1555         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1556           to volumes),
1557         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1558           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1559           accelerating things).
1560         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1561           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1562           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1563           in the stack (for the caller to notice the problem).
1564
1565 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1566       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1567
1568 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1569       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1570         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1571         under Windows... thanks Windows !)
1572
1573 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1574       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1575         debug stage).
1576       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1577
1578 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1579       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1580
1581 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1582       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1583         called with different flags than the default ones (with automake).
1584         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1585            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1586         and went for warning fixes:
1587         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1588           up from unused variables.
1589         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1590       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1591
1592 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1593       * gdcmPython/gdcm.i:
1594         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1595           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1596           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1597         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1598           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1599           exported to Python a as cvar.
1600       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1601         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1602         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1603         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1604         C++ static methods).
1605       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1606         with the above changes.
1607
1608 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1609       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1610
1611 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1612       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1613         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1614         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1615          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1616          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1617            a wrapper
1618          - Wrapper interface which wrap sources
1619         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1620         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1621       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1622         files for compilation
1623
1624 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1625       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1626         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1627         - vtk/Makefile.am now builds a library
1628         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1629           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1630           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1631           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1632           import library.
1633         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1634           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1635           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1636           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1637           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1638         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1639           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1640         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1641           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1642       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1643       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1644         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1645         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1646         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1647         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1648         collision of various stl members (principally cout...).
1649       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1650         file.
1651       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1652         comply with above changes)
1653
1654 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1655       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1656       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1657         vtk data structure (an image Flip was required).
1658       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1659       * cosmetic changes in documentation.
1660
1661 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1662       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1663         unexisting file is given as argument.
1664       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1665         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1666         containing those images is now available at
1667           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1668         with the name gdcmData.
1669         All the python scripts (including the package initialisation file
1670         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1671         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1672
1673 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1674       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1675         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1676         demo of the usage of this class.
1677         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1678         at configure (or autogen.sh) stage.
1679
1680 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1681       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1682         Notes on valgrind:
1683           - maximum info is obtained with a command of the form:
1684             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1685                      --show-reachable=yes PrintHeader
1686           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1687             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1688             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1689             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1690              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1691       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1692         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1693         Note: some images don't seem to work e.g.
1694             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1695       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1696         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1697         make gdcm more thread friendly.
1698
1699 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1700       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1701           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1702         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1703           gdcmHeader::_dicom_vr.
1704         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1705         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1706           VRHT*.
1707         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1708
1709 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1710       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1711         make install stage.
1712
1713 2003-04-9 JPR
1714       * UpdateGroupLength replaced by new one
1715
1716 2003-04-7 JPR
1717       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1718         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1719
1720 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1721       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1722       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1723       * src:
1724         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1725         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1726           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1727         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1728           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1729           carried the same semantics.
1730           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1731         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1732           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1733         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1734       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1735       * gdcmGetXSize added
1736       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1737       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1738
1739 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1740       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1741         (to avoid double call by end user).
1742       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1743         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1744
1745 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1746       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1747         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1748           the html.users end users oriented documentation and
1749           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1750           oriented documentation.
1751         - README changed accordingly
1752         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1753         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1754           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1755         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1756           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1757           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1758       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1759         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1760       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1761         ill-formed documentation sections.
1762       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1763
1764 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1766       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1767         un*ces with sh-utils test utility.
1768       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1769       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1770       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1771       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1772       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1773
1774 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1775       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1776       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1777
1778 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1779       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1780       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1781       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1782       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1783         compilation work.
1784       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1785       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1786
1787 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1788       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1789         hence the user doesn't need this explicit call.
1790         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1791           i.e. LoadElements() call removed.
1792       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1793         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1794       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1795         for adding user defined new tags.
1796         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1797         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1798           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1799
1800 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1801       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1802         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1803         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1804         with the autotools, included the python wrappers part.
1805       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1806
1807 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1808       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1809
1810 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1811       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1812         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1813         for usage).
1814       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1815         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1816         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1817       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1818         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1819
1820 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1821       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1822         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1823         value of GDCM_DICT_PATH.
1824       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1825
1826 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1827       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1828       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1829       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1830         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1831         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1832
1833 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1834       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1835         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1836         gdcmHeader.h
1837       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1838         (as opposed to gdcm.h)
1839       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1840       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1841         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1842       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1843
1844 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1845       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1846         bug.
1847
1848 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1849       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1850         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1851         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1852         of hidding away the python related distutils specific files
1853         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1854         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1855         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1856         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1857
1858 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1859       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1860       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1861         among the list of sources.
1862
1863 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1864       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1865       * modifications in MSVC projects
1866
1867 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1868       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1869         looks like we can move back to original usage of exception within
1870         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1871         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1872       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1873         README file for usage added.
1874       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1875         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1876         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1877         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1878       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1879       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1880         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1881           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1882           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1883           instance of class gdcmHeader.
1884         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1885           require no instances at all to be invocated.
1886         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1887           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1888           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1889       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1890         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1891       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1892         the above to be effective.
1893       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1894         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1895       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1896         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1897         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1898         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1899         (for python dectection).
1900       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1901         now avoids publishing the empty entries.
1902
1903 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1904       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1905         ExtraPath reused :-P
1906       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1907
1908 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1909       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1910       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1911       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1912         and links
1913
1914 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1915       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1916         method. Doxygenation.
1917       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1918
1919 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1920       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1921         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1922         when using "python setup.py install".
1923       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1924         reexports the working classes.
1925       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1926         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1927         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1928         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1929         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1930         subdir (see the README file). This problem probably due to
1931         an combination of g++ and dynamic loading.
1932       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1933
1934 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1935       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1936         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1937         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1938         again in a python subdir, but the package itself is now in
1939         python/gdcmPython.
1940       * setup.py was cleaned up:
1941         - pythonIncludePath removed
1942         - python setup.py bdist target is now functional.
1943       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1944         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1945         accordingly.
1946
1947 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1948       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1949       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1950         distutils installer is operational.
1951       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1952           shadow classes (from gdcm.py).
1953         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1954           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1955         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1956
1957 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1958       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1959         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1960         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1961         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1962         dictionary.
1963         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1964           are now in the "???" group.
1965         - python/gdcm.i changed accordingly,
1966         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1967           of the above new functionalities in Python.
1968
1969 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1970       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1971         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1972           were definitively removed.
1973         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1974       * src/gdcmElValSet.cxx:
1975         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1976         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1977         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1978         - Added GetElementByName(string).
1979       * src/gdcmHeader.cxx: added
1980         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1981         - GetPubElValRepByName(string)
1982         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1983         - GetShaElValRepByName(string)
1984         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1985         - GetShaElValRepByName(string)
1986         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1987         - GetElValRepByName(string)
1988         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1989         - GetElValRepByName(string)
1990       * Doc/requirements.txt added.
1991
1992 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1993       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1994       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1995         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1996         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1997         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1998       * python/testSuite.py changed accordingly.
1999
2000 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2001       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2002         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2003              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2004               cannot be exported. [...]
2005               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2006               be exported. [...]
2007               This is caused by a designed limitation that once a template
2008               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2009               exported."
2010         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2011         limitation" of VC++ is a pitfall.
2012         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2013         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2014         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2015         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2016         library.
2017         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2018       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2019          dll under windows !!!!)
2020       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2021       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2022         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2023       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2024         (one) of image(s).
2025       * removed glib references
2026       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2027
2028 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2029       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2030         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2031         the files of the testsuite without using unittest.
2032       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2033       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2034       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2035         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2036
2037 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2038       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2039         values, but limits itself to values which are below a user specified
2040         size (by default 1024 bytes).
2041       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2042         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2043         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2044         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2045       * python/testSuite.py
2046         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2047         - two new examples added.
2048       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2049
2050 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2051       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2052         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2053       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2054       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2055       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2056
2057 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2058       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2059         the vr was also RET.
2060       * python/testSuite.py more tests added.
2061
2062 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2063       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2064       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2065       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2066         7.18 Integer types (see stdint.h)
2067         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2068       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2069         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2070         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2071         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2072         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2073         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2074         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2075         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2076
2077 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2078       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2079         VR files.
2080       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2081
2082 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2083       * Adaptation for porting to VC++:
2084         - src/gdcm.h
2085           o forced to use std namespace (for string to be known)
2086           o all class use __declspec export style on WIN32
2087         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2088           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2089       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2090         variable GDCM_DICT_PATH.
2091       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2092
2093 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2094       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2095         to native Python dictionary.
2096       * python/demo/test.py:
2097         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2098         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2099       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2100         PubElVals hashing table.
2101       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2102
2103 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2104       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2105         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2106       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2107       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2108       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2109         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2110       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2111
2112 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2113       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2114         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2115         that we can import de shadow classes without errors].
2116
2117 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2119       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2120       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2121       * src/Makefile prepared for python wrapping
2122
2123 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2124       * src/gdcmHeader.cxx :
2125         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2126           (see gdcmHeader::LoadElements).
2127         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2128           ReadInt16 and ReadInt32)
2129
2130 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2131       * src/gdcmHeader.cxx :
2132         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2133           method.
2134         - SetLgrElem renamed to SetLength
2135         - GetLgrElem renamed to GetLength
2136         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2137       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2138       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2139         due to IdoDude was cleaned out.
2140
2141 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2142       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2143         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2144         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2145         returning the unecessary skL (skipped length).
2146         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2147         it was redundant with the File position internals (by using
2148         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2149         jajun.
2150       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2151         on the libido specificities which are handled through class
2152         inheritance.
2153       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2154         added.
2155
2156 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2157       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2158         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2159
2160 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2161       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2162
2163 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2164       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2165         and _IdDcmSWAP_LONG.
2166
2167 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2168       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2169         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2170