]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
*** empty log message ***
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-01-19 Benoit Regrain
2     * removal of file gdcmHeader2.cxx
3     * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
4       inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
5       of dicom dir parsing
6
7 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
8     * removal of class gdcmHeaderEntrySet
9     * removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
10     * add file gdcmHeader2.cxx 
11     * add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
12
13 2004-01-15 Benoit Regrain
14      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
15        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
16        when the gdcmDictSet will be destroyed
17      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
18        gdcmDictSet
19
20 2004-01-15 Benoit Regrain
21      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
22        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
23        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
24        some memory and vtk seems to have some problems with that.
25      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
26
27 2004-01-14 Benoit Regrain
28      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
29      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
30      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
31      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
32
33 2004-01-13 Benoit Regrain
34      * src/*.[h|cxx] : coding style
35      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
36
37 2004-01-13 Benoit Regrain
38      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
39      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
40        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
41      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
42
43 2004-01-12 Benoit Regrain
44      * src/*.h : add comments
45      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
46      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
47        directly setted in the source code
48      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
49        gdcmTS and gdcmVR
50
51 2004-01-09 Benoit Regrain
52      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
53      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
54
55 2004-01-07 Benoit Regrain
56      * Modification to compile with the distutils.
57      * Bug fix in code
58
59 2003-12-10 Benoit Regrain
60      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
61        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
62      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
63        made in the source code
64
65 2003-12-10 Benoit Regrain
66      * Update Windows projects and .cvsignore files
67
68 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
69      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
70            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
71            if he wants to.
72            gdcmElValSet:Print takes it into account
73
74 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
75      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
76      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
77      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
78
79 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
80       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
81              on the ListTag listElem member,
82              not longer on the TagElValueHT tagHt member
83       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
84              with the tagHt member and the listElem member.
85              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
86
87       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
88              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
89                             if bug fixing is necessary), for internal
90                             use only
91              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
92                             or to allow Parser going on.
93              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
94              with a length (not 0000) is found
95       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
96                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
97                 (to be written)
98
99 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
100      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
101      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
102           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
103           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
104
105 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
106      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
107
108 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
109      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
110           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
111
112 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
113      * in testSuite.py : new files names for checking the package
114      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
115              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
116              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
117
118 2003-11-05 Benoit Regrain
119      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
120                        : Explicit error messages
121      * in __init__.py  : Related modif
122
123 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
124      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
125            to be used by aware (vtk) users that want to manage
126            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
127      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
128                     (vtkGdcmReader compliant)              
129            
130 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
131      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
132        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
133        
134 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
135      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
136            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
137            
138 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
139      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
140                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
141              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
142              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
143              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
144              such an image : 
145              After gdcmHeader :
146                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
147                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
148                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
149      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
150              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
151
152 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
153      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
154              
155 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
156      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
157            being coherents dicom files.
158      
159 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
160      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
161            from medcon lib !
162      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
163      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
164      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
165      *ENH: Add include dir to medcon lib
166      *FIX: only one function is being exported for now ! 
167            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
168             
169 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
170       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
171                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
172                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
173       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
174       
175 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
176       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
177  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
178                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
179        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
180        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
181            
182 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
183       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
184                                                
185 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
186       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
187       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
188       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
189       
190 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
191       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
192       * ENH: Try adding a search script for python site-package
193       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
194       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
195       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
196       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
197              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
198              But it fasten debug compilation time.
199             
200 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
201       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
202         (they are compressed as 2 planes images, 
203          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
204
205 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
206      * Now CheckRead takes into account :
207             the bugged 'Leonardo' Siemens images
208             the XA images, sent thru the burning VPRO station
209      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
210      (breaks DicomWorks)
211
212 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
213       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
214              one should remove the '\'
215              
216 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
217       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
218         (wrong lengths in header)
219         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
220       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
221         (breaks DicomWorks)
222
223 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
224       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
225         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
226
227 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
228       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
229       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
230
231 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
232       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
233      
234 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
235       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
236         (the patch is easy to remove)
237       * cosmetic changes to avoid warnings
238       
239 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
240       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
241         no need to press 'r' now.
242         
243 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
244       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
245         to new Jpeg Lossless decompressor
246        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
247        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
248        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
249                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
250 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
251       * general anonymisation in gdcmData
252       * adding the 'color files' from
253          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
254       * adding some well knowed bugged-header images
255       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
256          waiting for their inclusion in Python testsuite
257
258 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
259     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
260       no longer seg faults when file is not found
261
262 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
263      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
264
265 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
266      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
267
268 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
269      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
270         OpenFile takes it into account
271      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
272      * Missing elements added in dicomV3.dic
273       (just to be affraid : have a look at
274        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
275        and do it again next year ;->
276
277 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
278      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
279        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
280        But there are NOT. It's fixed !
281        
282 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
283      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
284      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
285          
286 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
287      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
288              an ACR-NEMA / DICOM one.
289      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
290              is not gdcm Readable
291      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
292              is now decoded.
293              
294 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
295      * FIX: CMake generate now documentation
296      * ENH: out of source doc build !
297      * ENH: Generate both user and dev documentation
298      * ENH: Should work on windows too
299      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
300      * FIX: make install should be ok now on ùnix plateform
301      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
302      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
303                      
304 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
305      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
306      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
307      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
308         window level & window width
309
310 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
311      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
312      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
313      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
314      
315 2003-10-06  Emanuel Ollart
316      * FIX : compilation process wad broken.
317              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
318              
319 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
320      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
321      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
322      
323 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
324      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
325            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
326                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
327       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
328
329 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
330       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
331         to remain compliant with already defined strings, 
332         like Transfert Syntax UID and others)
333
334 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
335       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
336              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
337              
338 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
339       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
340       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
341
342 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
343       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
344         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
345               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
346       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
347
348 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
349       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
350
351 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
352       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
353         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
354
355 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
356       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
357          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
358          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
359          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
360           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
361           (no sample found :-(
362
363 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
364       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
365         Two reasons: - clear things
366                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
367                      suffer anymore VC++ complains
368 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
369       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
370       * removed leaks
371                      
372 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
373       * The lines are now eigthy characters long.for 
374         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
375
376 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
377       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
378         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
379         previous commis of Malaterre)
380       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
381         before the last Malaterre's commit.
382
383 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
384       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
385         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
386       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
387         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
388
389 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
390       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
391         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
392         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
393
394 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
395       * Cosmetic changes:
396         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
397           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
398           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
399           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
400         - PACKAGER corrected
401         - DEVELOPPER added.
402         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
403       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
404
405 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
406       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
407
408 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
409       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
410
411 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
412       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
413
414 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
415       * Fix a few delete/delete[] mismatch
416
417 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
418       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
419       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
420       heuristics to get informations (look at different places).
421       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
422       sorting DICOM images based on different strategies.
423       * modified Makefiles accordingly.
424
425 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
426       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
427         when building in debug mode
428       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
429         src/win32/gdcmdll.dsp
430       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
431
432 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
433       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
434
435 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
436       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
437       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
438       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
439
440 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
441       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
442         the file
443       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
444       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
445         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
446       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
447         symbols... future problem ?
448
449 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
450       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
451       * modified gdcm.dsw accordingly
452
453 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
454       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
455
456 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
457       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
458         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
459       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
460         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
461         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
462
463 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
464       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
465
466 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
467       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
468       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
469       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
470       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
471       * PACKAGER : adding all concerning windows
472
473 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
474       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
475         garbage debug code.
476       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
477       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
478         test suite reported error.
479       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
480         packaging a new release).
481       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
482       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
483       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
484         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
485         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
486
487 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
488       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
489       * src/gdcmHeader.h : formatting code
490
491 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
492       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
493         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
494         is made in an internal list to prevent this problem.
495         Bug fix when output is empty.
496         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
497         correction.
498       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
499
500 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
501       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
502       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
503         files. Added method to remove all files on the input
504         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
505         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
506
507 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
508       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
509         when using make instal.
510       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
511         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
512
513 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
514       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
515       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
516
517 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
518       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
519         linux and WINDOWS !
520       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
521       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
522
523 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
524       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
525         addon of the jpeg library)
526       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
527       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
528       * INSTALL now points to web documentation
529
530 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
531       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
532         gdcmUtil.h anymore.
533       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
534         clean target.
535       * src/gdcm*.[cxx|h] :
536         - to allow compilation with gcc 3.x
537           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
538           -- small fixes on exceptions.
539           Note: linking not tested !
540         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
541           building stage.
542       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
543         dependent convertion).
544
545 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
546       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
547         Changelog):
548         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
549         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
550           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
551         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
552
553 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
554       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
555         compile
556       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
557         (FileName -> Filename)
558
559 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
560       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
561         - UpdateProgress method should now be effective
562         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
563           to volumes),
564         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
565           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
566           accelerating things).
567         - when building a stack of images/volumes, files which are not
568           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
569           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
570           in the stack (for the caller to notice the problem).
571
572 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
573       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
574
575 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
576       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
577         between standard library (std) and vtk library (problems are found
578         under Windows... thanks Windows !)
579
580 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
582         debug stage).
583       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
584
585 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
586       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
587
588 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
589       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
590         called with different flags than the default ones (with automake).
591         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
592            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
593         and went for warning fixes:
594         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
595           up from unused variables.
596         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
597       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
598
599 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
600       * gdcmPython/gdcm.i:
601         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
602           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
603           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
604         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
605           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
606           exported to Python a as cvar.
607       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
608         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
609         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
610         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
611         C++ static methods).
612       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
613         with the above changes.
614
615 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
616       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
617
618 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
619       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
620         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
621         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
622          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
623          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
624            a wrapper
625          - Wrapper interface which wrap sources
626         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
627         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
628       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
629         files for compilation
630
631 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
632       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
633         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
634         - vtk/Makefile.am now builds a library
635         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
636           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
637           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
638           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
639           import library.
640         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
641           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
642           + vtk/vtkGdcmReader.so and
643           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
644           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
645         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
646           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
647         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
648           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
649       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
650       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
651         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
652         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
653         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
654         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
655         collision of various stl members (principally cout...).
656       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
657         file.
658       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
659         comply with above changes)
660
661 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
662       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
663       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
664         vtk data structure (an image Flip was required).
665       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
666       * cosmetic changes in documentation.
667
668 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
669       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
670         unexisting file is given as argument.
671       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
672         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
673         containing those images is now available at
674           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
675         with the name gdcmData.
676         All the python scripts (including the package initialisation file
677         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
678         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
679
680 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
681       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
682         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
683         demo of the usage of this class.
684         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
685         at configure (or autogen.sh) stage.
686
687 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
688       * More memory link related corrections and documentation fixes.
689         Notes on valgrind:
690           - maximum info is obtained with a command of the form:
691             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
692                    --show-reachable=yes PrintHeader
693           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
694             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
695             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
696             (in fact further invocation to the STL would recollect the
697              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
698       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
699         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
700         Note: some images don't seem to work e.g.
701             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
702       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
703         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
704         make gdcm more thread friendly.
705
706 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
707       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
708           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
709         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
710           gdcmHeader::_dicom_vr.
711         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
712         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
713           VRHT*.
714         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
715
716 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
717       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
718         make install stage.
719
720 2003-04-9 JPR
721       * UpdateGroupLength replaced by new one
722
723 2003-04-7 JPR
724       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
725         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
726
727 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
728       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
729       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
730       * src:
731         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
732         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
733           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
734         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
735           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
736           carried the same semantics.
737           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
738         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
739           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
740         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
741       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
742       * gdcmGetXSize added
743       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
744       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
745
746 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
747       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
748         (to avoid double call by end user).
749       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
750         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
751
752 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
753       * gdcm/Doc many doxygen changes:
754         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
755           the html.users end users oriented documentation and
756           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
757           oriented documentation.
758         - README changed accordingly
759         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
760         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
761           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
762         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
763           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
764           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
765       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
766         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
767       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
768         ill-formed documentation sections.
769       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
770
771 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
772       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
773       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
774         un*ces with sh-utils test utility.
775       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
776       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
777       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
778       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
779       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
780
781 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
782       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
783       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
784
785 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
786       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
787       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
788       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
789       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
790         compilation work.
791       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
792       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
793
794 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
795       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
796         hence the user doesn't need this explicit call.
797         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
798           i.e. LoadElements() call removed.
799       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
800         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
801       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
802         for adding user defined new tags.
803         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
804         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
805           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
806
807 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
808       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
809         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
810         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
811         with the autotools, included the python wrappers part.
812       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
813
814 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
815       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
816
817 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
818       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
819         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
820         for usage).
821       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
822         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
823         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
824       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
825         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
826
827 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
828       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
829         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
830         value of GDCM_DICT_PATH.
831       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
832
833 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
834       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
835       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
836       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
837         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
838         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
839
840 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
841       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
842         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
843         gdcmHeader.h
844       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
845         (as opposed to gdcm.h)
846       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
847       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
848         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
849       * autogen.sh removed history related references to crea package.
850
851 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
852       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
853         bug.
854
855 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
856       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
857         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
858         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
859         of hidding away the python related distutils specific files
860         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
861         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
862         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
863         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
864
865 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
866       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
867       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
868         among the list of sources.
869
870 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
871       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
872       * modifications in MSVC projects
873
874 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
875       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
876         looks like we can move back to original usage of exception within
877         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
878         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
879       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
880         README file for usage added.
881       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
882         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
883         testing the proper parsing of a Dicom related file.
884         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
885       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
886       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
887         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
888           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
889           Dicom public dictionnary were not accessible without an
890           instance of class gdcmHeader.
891         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
892           require no instances at all to be invocated.
893         - within gdcmDictSet this change required to change some method
894           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
895           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
896       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
897         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
898       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
899         the above to be effective.
900       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
901         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
902       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
903         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
904         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
905         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
906         (for python dectection).
907       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
908         now avoids publishing the empty entries.
909
910 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
911       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
912         ExtraPath reused :-P
913       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
914
915 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
916       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
917       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
918       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
919         and links
920
921 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
922       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
923         method. Doxygenation.
924       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
925
926 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
927       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
928         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
929         when using "python setup.py install".
930       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
931         reexports the working classes.
932       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
933         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
934         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
935         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
936         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
937         subdir (see the README file). This problem probably due to
938         an combination of g++ and dynamic loading.
939       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
940
941 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
942       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
943         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
944         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
945         again in a python subdir, but the package itself is now in
946         python/gdcmPython.
947       * setup.py was cleaned up:
948         - pythonIncludePath removed
949         - python setup.py bdist target is now functional.
950       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
951         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
952         accordingly.
953
954 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
955       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
956       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
957         distutils installer is operational.
958       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
959           shadow classes (from gdcm.py).
960         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
961           instead of gdcmPython/demo/load.py.
962         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
963
964 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
965       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
966         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
967         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
968         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
969         dictionary.
970         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
971           are now in the "???" group.
972         - python/gdcm.i changed accordingly,
973         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
974           of the above new functionalities in Python.
975
976 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
977       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
978         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
979           were definitively removed.
980         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
981       * src/gdcmElValSet.cxx:
982         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
983         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
984         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
985         - Added GetElementByName(string).
986       * src/gdcmHeader.cxx: added
987         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
988         - GetPubElValRepByName(string)
989         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
990         - GetShaElValRepByName(string)
991         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
992         - GetShaElValRepByName(string)
993         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
994         - GetElValRepByName(string)
995         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
996         - GetElValRepByName(string)
997       * Doc/requirements.txt added.
998
999 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1000       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1001       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1002         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1003         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1004         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1005       * python/testSuite.py changed accordingly.
1006
1007 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1008       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1009         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1010              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1011               cannot be exported. [...]
1012               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1013               be exported. [...]
1014               This is caused by a designed limitation that once a template
1015               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1016               exported."
1017         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1018         limitation" of VC++ is a pitfall.
1019         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1020         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1021         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1022         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1023         library.
1024         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1025       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1026          dll under windows !!!!)
1027       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1028       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1029         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1030       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1031         (one) of image(s).
1032       * removed glib references
1033       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1034
1035 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1036       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1037         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1038         the files of the testsuite without using unittest.
1039       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1040       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1041       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1042         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1043
1044 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1045       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1046         values, but limits itself to values which are below a user specified
1047         size (by default 1024 bytes).
1048       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1049         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1050         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1051         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1052       * python/testSuite.py
1053         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1054         - two new examples added.
1055       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1056
1057 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1058       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1059         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1060       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1061       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1062       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1063
1064 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1065       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1066         the vr was also RET.
1067       * python/testSuite.py more tests added.
1068
1069 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1070       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1071       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1072       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1073         7.18 Integer types (see stdint.h)
1074         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1075       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1076         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1077         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1078         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1079         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1080         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1081         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1082         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1083
1084 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1085       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1086         VR files.
1087       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1088
1089 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1090       * Adaptation for porting to VC++:
1091         - src/gdcm.h
1092           o forced to use std namespace (for string to be known)
1093           o all class use __declspec export style on WIN32
1094         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1095           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1096       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1097         variable GDCM_DICT_PATH.
1098       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1099
1100 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1101       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1102         to native Python dictionary.
1103       * python/demo/test.py:
1104         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1105         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1106       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1107         PubElVals hashing table.
1108       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1109
1110 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1111       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1112         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1113       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1114       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1115       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1116         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1117       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1118
1119 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1120       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1121         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1122         that we can import de shadow classes without errors].
1123
1124 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1125       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1126       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1127       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1128       * src/Makefile prepared for python wrapping
1129
1130 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1131       * src/gdcmHeader.cxx :
1132         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1133           (see gdcmHeader::LoadElements).
1134         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1135           ReadInt16 and ReadInt32)
1136
1137 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1138       * src/gdcmHeader.cxx :
1139         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1140           method.
1141         - SetLgrElem renamed to SetLength
1142         - GetLgrElem renamed to GetLength
1143         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1144       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1145       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1146         due to IdoDude was cleaned out.
1147
1148 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1149       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1150         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1151         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1152         returning the unecessary skL (skipped length).
1153         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1154         it was redundant with the File position internals (by using
1155         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1156         jajun.
1157       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1158         on the libido specificities which are handled through class
1159         inheritance.
1160       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1161         added.
1162
1163 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1164       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1165         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1166
1167 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1168       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1169
1170 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1171       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1172         and _IdDcmSWAP_LONG.
1173
1174 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1175       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1176         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1177