ChangeLog

   1 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
   3         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
   4         for usage).
   5       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
   6         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
   7         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
   8
   9 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  10       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
  11         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
  12         value of GDCM_DICT_PATH.
  13       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
  14
  15 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  16       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
  17       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
  18       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
  19         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
  20         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
  21
  22 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  23       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
  24         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
  25         gdcmHeader.h
  26       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
  27         (as opposed to gdcm.h)
  28       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
  29       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
  30         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
  31       * autogen.sh removed history related references to crea package.
  32
  33 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  34       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
  35         bug.
  36
  37 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  38       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
  39         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
  40         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
  41         of hidding away the python related distutils specific files
  42         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
  43         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
  44         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
  45         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
  46
  47 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  48       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
  49       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
  50         among the list of sources.
  51
  52 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  53       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
  54       * modifications in MSVC projects
  55
  56 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  57       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
  58         looks like we can move back to original usage of exception within
  59         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
  60         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
  61       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
  62         README file for usage added.
  63       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
  64         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  65         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  66         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  67       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  68       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  69         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  70           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  71           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  72           instance of class gdcmHeader.
  73         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  74           require no instances at all to be invocated.
  75         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  76           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  77           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  78       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  79         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  80       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  81         the above to be effective.
  82       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  83         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  84       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  85         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  86         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  87         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  88         (for python dectection).
  89       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  90         now avoids publishing the empty entries.
  91
  92 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  93       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  94         ExtraPath reused :-P
  95       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
  96
  97 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  98       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
  99       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 100       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 101         and links
 102
 103 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 104       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 105         method. Doxygenation.
 106       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 107
 108 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 109       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 110         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 111         when using "python setup.py install".
 112       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 113         reexports the working classes.
 114       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 115         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 116         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 117         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 118         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 119         subdir (see the README file). This problem probably due to
 120         an combination of g++ and dynamic loading.
 121       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 122
 123 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 124       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 125         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 126         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 127         again in a python subdir, but the package itself is now in
 128         python/gdcmPython.
 129       * setup.py was cleaned up:
 130         - pythonIncludePath removed
 131         - python setup.py bdist target is now functional.
 132       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 133         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 134         accordingly.
 135 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 136       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 137       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 138         distutils installer is operational.
 139       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 140           shadow classes (from gdcm.py).
 141         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 142           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 143         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 144
 145
 146 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 147       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 148         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 149         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 150         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 151         dictionary.
 152         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 153           are now in the "???" group.
 154         - python/gdcm.i changed accordingly,
 155         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 156           of the above new functionalities in Python.
 157
 158 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 159       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 160         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 161           were definitively removed.
 162         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 163       * src/gdcmElValSet.cxx:
 164         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 165         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 166         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 167         - Added GetElementByName(string).
 168       * src/gdcmHeader.cxx: added
 169         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 170         - GetPubElValRepByName(string)
 171         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 172         - GetShaElValRepByName(string)
 173         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 174         - GetShaElValRepByName(string)
 175         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 176         - GetElValRepByName(string)
 177         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 178         - GetElValRepByName(string)
 179       * Doc/requirements.txt added.
 180
 181 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 182       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 183       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 184         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 185         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 186         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 187       * python/testSuite.py changed accordingly.
 188
 189 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 190       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 191         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 192              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 193               cannot be exported. [...]
 194               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 195               be exported. [...]
 196               This is caused by a designed limitation that once a template
 197               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 198               exported."
 199         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 200         limitation" of VC++ is a pitfall.
 201         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 202         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 203         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 204         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 205         library.
 206         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 207       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 208          dll under windows !!!!)
 209       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 210       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 211         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 212       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 213         (one) of image(s).
 214       * removed glib references
 215       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 216
 217 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 218       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 219         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 220         the files of the testsuite without using unittest.
 221       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 222       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 223       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 224         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 225
 226 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 227       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 228         values, but limits itself to values which are below a user specified
 229         size (by default 1024 bytes).
 230       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 231         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 232         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 233         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 234       * python/testSuite.py
 235         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 236         - two new examples added.
 237       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 238
 239 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 240       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 241         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 242       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 243       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 244       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 245
 246 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 247       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 248         the vr was also RET.
 249       * python/testSuite.py more tests added.
 250
 251 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 252       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 253       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 254       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 255         7.18 Integer types (see stdint.h)
 256         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 257       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 258         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 259         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 260         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 261         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 262         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 263         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 264         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 265
 266 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 267       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 268         VR files.
 269       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 270
 271 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 272       * Adaptation for porting to VC++:
 273         - src/gdcm.h
 274           o forced to use std namespace (for string to be known)
 275           o all class use __declspec export style on WIN32
 276         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 277           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 278       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 279         variable GDCM_DICT_PATH.
 280       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 281
 282 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 283       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 284         to native Python dictionary.
 285       * python/demo/test.py:
 286         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 287         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 288       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 289         PubElVals hashing table.
 290       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 291
 292 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 293       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 294         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 295       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 296       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 297       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 298         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 299       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 300
 301 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 302       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 303         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 304         that we can import de shadow classes without errors].
 305
 306 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 307       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 308       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 309       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 310       * src/Makefile prepared for python wrapping
 311
 312 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 313       * src/gdcmHeader.cxx :
 314         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 315           (see gdcmHeader::LoadElements).
 316         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 317           ReadInt16 and ReadInt32)
 318
 319 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 320       * src/gdcmHeader.cxx :
 321         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 322           method.
 323         - SetLgrElem renamed to SetLength
 324         - GetLgrElem renamed to GetLength
 325         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 326       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 327       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 328         due to IdoDude was cleaned out.
 329
 330 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 331       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 332         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 333         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 334         returning the unecessary skL (skipped length).
 335         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 336         it was redundant with the File position internals (by using
 337         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 338         jajun.
 339       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 340         on the libido specificities which are handled through class
 341         inheritance.
 342       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 343         added.
 344
 345 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 346       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 347         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 348
 349 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 350       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 351
 352 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 353       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 354         and _IdDcmSWAP_LONG.
 355
 356 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 357       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 358         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 359