]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * vtk/vtkGdcmWriter.[h|cxx] : add a first version of vtkGdcmWriter
3    * src/gdcmValEntry.cxx : bug fix when setting the value. Problems of odd
4      length
5    * src/gdcmHeader.cxx : Remove a useless call to Util::DicomString
6    * Add vtkGdcmWriter example and test
7
8 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
9    * Test/TestUtil.cxx : reformat the source code
10    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove and change prints
11    * src/gdcmValEntry.[cxx|h] : now set the length of the value when calling
12      SetValue
13    * src/gdcmBinEntry.[cxx|h] : SetValue method don't set the length
14    * src/*.cxx : remove all useless call to SetLength of a ValEntry object
15
16 2004-12-07 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
17    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : ficnished this class
18    * src/gdcmFile.cxx : finished the correctly use of PixelWriteConvert
19
20 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
21    * src/gdcmDocument.cxx : bug fix when opening the file. All read is followed
22      by an eof to prevent all bad read of the file... and in this case, the
23      file isn't readable. 
24
25 2004-12-06 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
26    * Example/Volume2Dicom.cxx : comment unused variables
27    * Test/PrintDicomDir.cxx : comment unused variables
28    * Test/BuildUpDicomDir.cxx : remove dbg.Verbose. Remove the FIXME.
29    * src/SQItem.[h|cxx] : remove the PtagHT variable. Remove the AddDocEntry
30      method that is redondant with AddEntry.
31    * src/gdcmDocEntrySet.h : add pure virtual methods common to ElementSet and
32      SQItem
33
34 2004-12-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
35    * Bug fix due my last commit (compilation under Windows).
36    * Example/Volume2Dicom : bug fix in the file and reformatting source code
37    * src/gdcmFile.h : bug fix. Variable type and variable name had same name
38
39 2004-12-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
40    * Huge cleanup:
41      - Remove printf / sprintf
42      - include iostream AFTER gdcm so we don't get warnings
43      - GDCM_NO_ANSI_STRING_STREAM shouldn't be used explitely ouside of gdcm 
44        source
45      - Also remove tons of include from header files, hopefully this should 
46        speeup the compilation time, since it was becoming a dog slow.
47      - Remove gdcm.h as it include way too many files and slow down compilation 
48        (plus it is not up to date)
49      - remove 'using namespace std' this is BAD !
50
51 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
52    * Remove memory leaks on the DicomDir
53    * Remove some useless datas in DicomDirObject
54    * Add usefull methods in SQItem, to be complient withe the ElementSet
55
56 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
57    * src/gdcmFile.[h|cxx] : now use FileType instead of TWriteType.
58
59 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
60    * src/gdcmPixelWriteConvert.[h|cxx] : new class to write datas (and in the
61      future, with convertion)
62    * src/gdcmFile.[h|cxx] : the PixelWriteConverter instance replace Pixel_Data
63      and ImageDataSize values. Remove the method to get the PixelReadConverter
64      from the output of the class
65
66 2004-12-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
67    * Rename src/gdcmPixelConvert.[h|cxx] to src/gdcmPixelReadConvert.[h|cxx]
68
69 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : correct error in vtkDebugMacro, vtkWarningMacro
71      and vtkErrorMacro use.
72    * gdcmPython/gdcm.i : corrections to avoid warnings at compilation
73
74 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
75    * Test/TestCopyDicom.cxx : the new dicom created is created empty, without
76      file name in input
77    * src/gdcmSeqEntry.cxx : bug fix in destruction of an element
78    * src/gdcmHeader.cxx : bug fix. Keep the string, otherwise it is destroyed.
79      The string leaves only in the fonction. So when we make a .c_str(), we
80      get the pointeur on the first element, element that will be destroyed 
81      immediately after thee instruction.
82    * src/gdcmDocument.cxx : remove memory leaks. Bug fix when testing if the
83      file has been opened : the test must be made on the content of the 
84      pointer and not directly on the pointer !
85      Code formatting
86
87 2004-12-02 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
88    * gdcmPython/gdcm.i : change gdcmHeaderHelper to gdcmSerieHeader. Now,
89      the python part recompiles
90
91 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
92    * Test/ShowDicom.cxx : Change the test to only open one vtkImageViewer.
93      Otherwise, under linux (Graphic card : NVidia / SE : FedoraCore 1) the
94      X session is killed (for my computer... it seems to not be identic on
95      all linux)
96
97 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
98    * Test/ShowDicom.cxx : now can be used with an off-screen rendering to
99      avoid problems (otherwise, the difference test between the visible image
100      and the reference is incorrect. If the reference is greater than the
101      screen resolution, it's produce errors).
102      Can be used for only one image. Can be used with a visible flag.
103    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : remove commented codes.
104    * vtk/vtkGdcmReader.h : add the gdcmCommon.h include file to avoid warnings
105      under windows at compilation
106    * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : reformat the file. Apply a default window/level
107      for grayscale images
108    * vtk/GdcmToBaseline.cxx : new program to easy create the reference image
109
110 2004-11-30 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
111    * src/gdcmFile.[h|cxx] : bug fix for ACR-LIBIDO files when writting the file
112    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : add
113      tests on the image size X, Y, Z
114
115 2004-11-26 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
116    * Remove some useless methods in gdcm::Document, gdcm::Header and gdcm::File
117    * Rename gdcmHeaderHelper.[h|cxx] to gdcmSerieHeader.[h|cxx] to be coherent
118      between the class name and the file name
119
120 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
121    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different
122      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
123      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
124      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
125      this variable content.
126
127 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
128    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
129      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
130      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the
131      DocEntryArchive
132    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
133      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
134      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
135    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
136      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
137
138 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
139    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
140
141 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
142    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
143    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
144      the header.
145    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
146      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
147      write
148    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
149      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
150      is now on RGB datas (as before my last commit
151    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
152
153 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
154    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
155      Add a print information of the type of the entry
156    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
157      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
158    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
159      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
160    * Test/ : test on files are now made using Raw datas and not color datas if
161      any.
162    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
163
164 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
165    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
166      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
167      opened or not.
168
169 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
170    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
171      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
172    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
173      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
174      DocEntryArchive
175    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
176      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
177    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
178      - test the pixels written
179      - add test points to quickly find where is the error
180      - can set a file name input and output in arguments
181    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
182      amelioration of the test output
183
184 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
185    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
186      all replaced DocEntry's
187    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting datas.
188      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
189      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
190      header initial state.
191
192 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
193    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
194
195 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
196    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
197      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
198      then, it musn't change in the time.
199    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
200      header correctly. At this time, the change is only made for the first
201      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
202      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
203      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
204      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
205    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
206    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
207      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
208      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
209
210 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
211    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
212    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
213
214 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
215    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
216      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
217      is copied).
218    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
219      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
220    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
221
222 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
223    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
224      Two problems appear when doing it :
225       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
226         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
227         datas (pixels). And each structure destruct the datas when it's
228         destructed. So we have two destructions for the same datas. To solve it,
229         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
230         datas or not. If it doesn't own datas, then they will not destroyed by
231         the gdcmBinEntry.
232       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
233         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
234         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
235         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
236         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
237    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
238
239 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
240    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
241    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
242      squeeze method
243
244 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
245    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
246    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
247      after it have been deleted
248
249 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
250    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
251    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
252    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
253      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
254      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
255
256 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
257     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
258     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
259     3. Use const ref when possible
260     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
261     5. A few more comments
262     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
263
264 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
265   * ENH: Slightly bigger patch:
266     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
267     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
268     3. File was not close properly in gdcmDict
269     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
270     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
271     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
272     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
273     8. Do not repeat virtual in subclasses
274     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
275
276 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
277   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
278     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
279     of a null character as defined by standard
280   
281 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
282   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
283     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
284
285 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
286   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
287   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
288     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
289
290 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
291   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
292     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
293     a verbose message is generated.
294     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
295     correctly close is a call to CloseFile.
296     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
297   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
298     file. For an uncompressed image, the copied datas correspond in the least 
299     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
300     header. A verbose is generated if these two size mismatch
301
302 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
303   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
304     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
305     break under windows (with msvc6 compilation).
306
307 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
308   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
309     compiling with MSVC6)
310
311 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
312   * Bugs fix for the Windows build with VC6
313   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
314     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
315     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
316     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
317   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
318     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
319     gdcm.i file)
320   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
321     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
322     std::cerr of vtk.
323
324 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
325   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
326   * gdcmPython/gdcm.i:
327     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
328     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
329       NOT need to be wrapped anymore.
330   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
331     DicomDir::Method) new example added.
332
333 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
334   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
335     A DicomString can contain as many \0 as they want
336     and it is *always* of even length.
337     We only support odd length for very rare case. 
338     And in the near future this should be removed.
339
340 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
341   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
342     little endian. This should -heopfully- fix some tests
343
344 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
345   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
346     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
347     the one comiled into lib
348
349 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
350   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
351     This should definitely solve any leak problem, and we should be
352     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
353
354 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
355   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
356   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
357   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
358   
359 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
360   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
361   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
362     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
363   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
364   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
365     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
366     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
367       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
368       no longer exists.
369
370 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
371   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
372    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
373    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
374    the class.
375   
376 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
377   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
378     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
379     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
380
381 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
382   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
383   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
384     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
385     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
386     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
387       CloseFile() anymore.
388     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
389       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
390       into File::Pixel_Data.
391
392 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
393   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
394     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
395   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
396     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
397     method:
398     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
399     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
400       method to those classes.
401     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
402       -- Added a ::Print() method.
403       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
404       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
405          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
406
407 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
408   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
409     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
410     doxygen.
411   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
412   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
413     pointlessly wrapped (see
414     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
415   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
416     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
417     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
418     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
419     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
420       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
421            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
422       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
423          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
424
425 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
426   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
427     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
428
429 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
430   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
431     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
432     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
433   * TODO added new entry.
434   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
435     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
436     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
437     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
438       variable names for semantical coherence.
439
440 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
441   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
442   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
443   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
444   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
445   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
446   compilation time jpeg option.
447
448 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
449   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
450     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
451     reproduce at home.
452   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
453   Thanks dcmtk crew !
454
455 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
456   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
457   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
458     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
459   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
460   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
461   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
462   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
463     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
464     from File:: to PixelConvert::.
465
466 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
467   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
468     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
469      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
470      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
471
472 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
473   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
474   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
475   like this:
476     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
477   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
478   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
479   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
480
481 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
482   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
483     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
484     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
485     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
486     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
487       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
488       (for the time being this is better than having them attach to
489        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
490     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
491       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
492     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
493       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
494       gdcmPixelConvert::
495
496 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
497   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
498   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
499     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
500       clean up of RLE related code. 
501   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
502     - src/gdcmRLE.cxx removed
503     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
504     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
505     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
506   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
507     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
508       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
509       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
510
511 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
512   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
513     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
514       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
515       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
516       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
517       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
518       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
519       offsets.
520   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
521     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
522         with the retired Parse7Fe0().
523     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
524     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
525
526 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
527   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
528     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
529     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
530     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
531   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
532     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
533       to return an unused length.
534
535 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
536   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
537     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
538     to use to do simple stuff.
539
540 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
541   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
542     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
543     copying of the file within different directory, configure header file to
544     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
545     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
546
547 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
548   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
549      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
550        with it's binary name).
551      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
552        the Website to be more complete.
553      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
554        doxygenated documentation.
555      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
556        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
557                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
558   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
559   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
560    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
561
562 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
563   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
564    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
565
566 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
567   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
568     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
569     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
570     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
571     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
572   * GDCMHOME clean up:
573     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
574       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
575       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
576   * Autotools clean up:
577     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
578     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
579
580 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
582   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
583   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
584
585 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
586   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
587     describing TODO entries and used it for new entries.
588   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
589     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
590     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
591   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
592     documentation itself, but the website) moved to html and
593     placed in directory Doc/Website:
594     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
595     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
596     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
597   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
598   * CMakeLists.txt changed accordingly.
599   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
600     DeveloppersPython.html
601   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
602
603 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
604   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
605     of gdcm Web site.
606
607 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
608   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
609     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
610     we can now delete[] it safely 
611   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
612     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
613   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
614
615 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
616   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
617     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
618     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
619     pointed content.
620
621 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
622   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
623   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
624
625 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
626   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
627     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
628     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
629     an example of usage.
630     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
631       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
632     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
633       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
634     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
635     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
636     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
637
638 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
639   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
640     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
641     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
642     in class 
643     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
644       and associated accessors. Doxygenation of the class.
645     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
646       accessors added.
647     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
648       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
649     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
650     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
651
652 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
653   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
654     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
655       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
656            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
657            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
658            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
659            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
660            the same group and element all share the same (group, element)
661            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
662            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
663            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
664            consider the following definition of a TagKey:
665            - let Group, Element be the string representation of the
666              group and element dicom tag members,
667            - let ItemNumber be the string representation of the integer
668              index of the considered item number of a sequence,
669            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
670            the form:
671               /ItemNumber#Group|Element
672            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
673            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
674               Group|Element<SeqTag>
675            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
676            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
677            string e.g.
678                0028|1201
679            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
680            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
681            string e.g.
682                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
683     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
684       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
685       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
686     - src/gdcmDocEntry.cxx:
687       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
688          Key member.
689       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
690     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
691     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
692       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
693       -- now has a new BaseTagKey member.
694       -- STYLE.
695   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
696     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
697     truly belongs.
698     This poses the problem with the semantics of the following lines
699        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
700        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
701        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
702     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
703     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
704     order to get things working the dicom dictionary was altered !
705     Please fix things urgently...
706   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
707     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
708     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
709     set to OW:
710       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
711       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
712       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
713   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
714     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
715   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
716
717 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
718   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
719
720 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
721   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
722     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
723   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
724   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
725
726 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
727   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
728     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
729   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
730     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
731   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
732     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
733   * TODO updated
734   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
735     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
736   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
737   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
738     exception_on_error parameter.
739     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
740     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
741     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
742
743 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
744   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
745   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
746     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
747   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
748   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
749   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
750     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
751   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
752
753 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
754   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
755     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
756
757 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
758   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
759        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
760  
761 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
762   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
763         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
764
765 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
766    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
767    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
768      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
769      is now in static in the gdcmDebug class
770    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
771    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
772
773 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
774    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
775      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
776    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
777      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
778      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
779      that displays position and size).
780    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
781      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
782      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
783      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
784      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
785      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
786      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
787         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
788      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
789      commiting changes).
790    * Test/CMakeLists.txt:
791       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
792       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
793         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
794         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
795    * TODO updated.
796
797 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
798    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
799      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
800      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
801      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
802      - removal of typedef duplication.
803      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
804      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
805    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
806       - printf polluting ctest removed.
807       - TAB removal for comminting
808    * Test:
809      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
810        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
811        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
812        this test creates them.
813        Note: we need to validate each reference image, but before that
814              I'd like to rename them with a more explicit name...
815      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
816    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
817      including each header needed).
818
819 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
820    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
821      test suite to the Example directory. Are concerned:
822      - PrintHeader.cxx
823      - TestDcm2Acr.cxx
824      - TestFindTags.cxx
825      - TestWrite.cxx was
826      - TestWriteSimple.cxx
827    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
828      image gdcmData/oldACR00001.ima
829
830 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
831    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
832      with removal from gdcmData):
833       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
834       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
835       - US.3405.1.dcm
836      Added the following because after last cvs update, they cause
837        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
838      to segfault:
839       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
840       - oldACR00001.ima
841    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
842      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
843      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
844      form of test...
845    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
846      we don't need to black list the following images anymore:
847       - 8BitsUncompressedColor.dcm
848       - OT-PAL-8-face.dcm
849       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
850    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
851      fixes and the beautified code ;-)
852      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
853      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
854      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
855            improve the test suite). The bug could be detected by using
856            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
857            or by using
858            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
859            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
860
861 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
862    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
863          - replace by uggly but working old code :-(
864    A lot of things should be OK again.
865    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
866    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
867    (twice, withing a fortnigh ...)      
868
869 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
870    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
871      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
872    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
873      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
874      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
875                    - OT-PAL-8-face.dcm
876                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
877    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
878      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
879      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
880      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
881      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
882      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
883      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
884      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
885      image.
886    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
887      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
888      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
889      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
890    
891 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
892   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
893   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
894                           (instead of infinite loop)
895   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
896
897 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
898    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
899
900 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
901    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
902            when SamplesPerPixel =3
903          - now Write is no longer confused by 
904           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
905          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
906                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
907    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
908            (in order to split the job that has not to be done 
909            for gdcmDicomDir)
910
911 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
912    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
913      loop on the same image until memory went out. 
914      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
915    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
916      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
917
918 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
919    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
920             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
921             is added a the end, when necessary.
922             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
923               now written correctly
924             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
925               (even for odd groups) 
926         Note : only Explicit Value Representation was checked.
927                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
928
929 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
930    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
931    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
932      coding style).
933
934 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
935    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
936      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
937    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
938
939 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
940    FIX : gdcmDocument.cxx
941       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
942         code 'beautyfication' :-(
943       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
944
945 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
946    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
947             : to allow user to create his own Sequences
948    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
949
950    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
951
952    - gdcmBinEntry
953      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
954   
955    - gdcmDocEntry
956      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
957      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
958   
959    - gdcmDocEntrySet
960      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
961      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
962      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
963      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
964      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
965      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
966                                             guint16 element,
967                                             std::string vr     = "unkn",
968                                             std::string fourth = "unkn",
969                                             std::string name   = "unkn"); 
970      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
971      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
972      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
973      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
974      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
975      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
976      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
977      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
978   
979    - gdcmDocument
980      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
981      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
982      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
983      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
984      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
985                                         FILE *_fp, FileType type);
986      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
987      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
988      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
989      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
990      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
991      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
992      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
993      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
994                                             guint16 element,
995                                             std::string vr     = "unkn",
996                                             std::string fourth = "unkn",
997                                             std::string name   = "unkn");
998      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
999      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
1000      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1001      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
1002                                                                                                                  
1003         - gdcmElementSet
1004           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1005           
1006    - gdcmSeqEntry
1007           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
1008  
1009    - gdcmSQItem
1010      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
1011      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
1012      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
1013      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
1014
1015    - gdcmValEntry
1016          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
1017                                   
1018 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1019     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
1020       The default constructor invoked by the line
1021          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
1022       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
1023       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
1024       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
1025     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
1026       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
1027       Could anyone explain why ?
1028     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
1029       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
1030       code related to gdcmBinEntry).
1031
1032 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1033     * In order to fix memory leaks:
1034      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
1035        some delete calls.
1036      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
1037      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
1038        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
1039        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
1040        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
1041      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
1042      - src/gdcmDocument.cxx:
1043        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
1044           from dynamic stores.
1045        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
1046           was causing memory leaks.
1047      - src/gdcmSQItem.cxx:
1048        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
1049           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
1050        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
1051           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
1052           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
1053           This avoids SegFaulting.
1054      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
1055     * Conclusion:
1056      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
1057        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
1058        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
1059      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
1060        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
1061      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
1062        segfaults).
1063     * Erroneous leading white fix:
1064      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
1065        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
1066      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
1067      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
1068     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
1069     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
1070
1071
1072 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1073     * In order to fix writing of dicom files:
1074      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
1075      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
1076      - src/gdcmDocument.cxx:
1077        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
1078        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
1079        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
1080           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
1081           manner.
1082        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
1083           to only declared) and build on top of
1084           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
1085        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
1086      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
1087        for usage in destructor and treatement of promotion in
1088        ::ReplaceOrCreateByNumber().
1089      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
1090       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
1091     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
1092       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
1093       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
1094       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
1095
1096 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1097     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
1098       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
1099       learned that:
1100           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
1101           soon as possible by globally disabling memory caching.
1102           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
1103           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
1104       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
1105       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
1106       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
1107     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
1108       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
1109       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
1110       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
1111         with 1.
1112       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
1113       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
1114       understand why the list is empty...).
1115     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
1116     * Doc/License.txt added.
1117
1118 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1119     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1120       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1121         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1122         the padding problem.
1123       - general clean up, simplification, and coding style.
1124       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1125     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1126
1127 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1128    *  gdcmSeqEntry.cxx
1129            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1130                 - fix the display of SQItem ordinal number
1131       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1132                 - remove some useless never written private methods     
1133                 
1134 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1135    * gdcmBinEntry.cxx 
1136       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1137            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1138               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1139                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1140    * dcmDocument.cxx
1141       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1142               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1143            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1144       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1145    * gdcmFile.cxx
1146       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1147    * gdcmSQItem.h
1148       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1149             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1150             \warning : some pb remaining around this number
1151                                 will be solved asap
1152       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1153    * gdcmValEntry.cxx 
1154       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1155
1156 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1157     * Memory leak hunt with the following command:
1158       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1159                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1160       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1161       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1162       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1163           grep "MEMORY LEAK" src/*
1164       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1165       -----
1166           #include <string>
1167           int main() {
1168              std::string name;
1169              char * test = "babo";
1170              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1171                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1172              name.clear();   //// Doesn't help !
1173              return 0;
1174           }
1175       -----
1176           #include <string>
1177           #include <iostream>
1178           int main() {
1179              std::string line;
1180              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1181              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1182                                         //// of 1320 bytes in call to
1183                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1184             return 0;
1185           }
1186       -----
1187
1188
1189 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1190     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1191       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1192         and related, moved away to gdcmDocument.
1193       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1194         the corresponding protected accessors of inherited class
1195         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1196         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1197       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1198       - Clean up of undefined or unused methods.
1199     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1200       account the changes to gdcmHeader.h).
1201     * src/gdcmDocument.h:
1202       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1203         changes to gdcmHeader.h).
1204       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1205         (see changes to gdcmHeader.h).
1206       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1207       - Clean up of undefined or unused methods.
1208     * src/gdcmDocument.cxx:
1209       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1210       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1211       - some std::string properly set to VRKey
1212     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1213       references to gdcmDocument. 
1214     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1215     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1216       cvs repository gdcmData.
1217
1218 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1219     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1220     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1221       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1222     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1223     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1224       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1225     * src/gdcmDocument.cxx: 
1226       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1227         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1228       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1229         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1230         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1231         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1232         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1233               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1234               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1235     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1236     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1237       now taken into account.
1238     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1239       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1240     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1241       on posix.
1242     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1243       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1244     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1245
1246 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1247     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1248       gdcmGlob
1249     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1250     * src/gdcmUtil.h : export methods
1251
1252 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1253     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1254       to right behavior
1255     * Initial addition of automatic python testing
1256     * Initial addition of automatic image comparison
1257
1258 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1259     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1260       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1261
1262 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1263      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1264      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1265      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1266
1267 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1268      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1269        new concepts (and new classes) :
1270        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1271         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1272         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1273        a Sequence is composed of Items.
1274        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1275        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1276        (never taken into account)
1277        Our unability to add a new 'entry' in the header
1278        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1279        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1280        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1281        nothing is finished.
1282        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1283
1284 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1285      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1286      
1287 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1288      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1289        file prefix (SetFilePrefix)
1290
1291 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1292      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1293        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1294        baseline.
1295      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1296        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1297
1298 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1299      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1300        dicom image
1301
1302 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1303      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1304      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1305        between the developper and user version.
1306      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1307      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1308
1309 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1310      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1311        when using cmake.
1312
1313 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1314      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1315                src directory, now generated in the build dir.
1316             2. Tests as mentionned smarter
1317             3. Some clean up
1318             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1319           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1320           where we could set the institution name / patient name...
1321
1322        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1323               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1324                  (this was not true before)
1325
1326 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1327      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1328            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1329      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1330            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1331            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1332      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1333            tree-like structure of a Dicom Header.
1334      * FIX Test code cleaning     
1335            
1336 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1337      * ENH: Adding automatic testing
1338        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1339        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1340        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1341        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1342           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1343           too many projects
1344      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1345      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1346        one file instead of seven + some small cleanup
1347
1348 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1349      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1350      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1351            Header printing. Example given with :
1352            > PrintHeader fileName  2 new
1353           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1354            
1355 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1356      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1357          1. I have added some unsigned where needed
1358          2. Some function parameter not used -> (void)
1359          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1360          4. g++ don't like character '\' in comment
1361          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1362                     this really need to be fixed
1363          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1364          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1365                     this also really need to be fixed
1366          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1367                     remove compression file 
1368                     (as we only do decompression, right ?)     
1369      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1370
1371 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1372      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1373            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1374            defaulted to yspacing
1375            
1376 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1377      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1378      * ENH add parameters :
1379                bool  exception_on_error = false, 
1380                bool  enable_sequences   = false,
1381                bool  ignore_shadow      = false
1382            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1383      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1384            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1385               
1386 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1387      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1388      
1389 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1390      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1391      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1392              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1393              
1394 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1395      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1396          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1397
1398 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1399      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1400        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1401        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1402        in gdcmHeader.
1403      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1404        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1405        already does the job.
1406      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1407        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1408
1409 2004-03-30 Benoit Regrain
1410      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1411        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1412        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1413
1414 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1415      * ENH : Check on file type to be written moved
1416              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1417      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1418              when end-of-list is reached
1419            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1420
1421 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1422      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1423      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1424      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1425        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1426
1427 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1428      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1429        now contains all the gdcmGlobal related code.
1430      * minor coding style and doxygenation changes.
1431
1432 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1433      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1434        now contains all the Debug related code.
1435      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1436      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1437        CreateCleanString) removed.
1438      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1439      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1440      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1441      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1442        src/gdcmDirList.cxx)
1443
1444 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1445      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1446
1447 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1448      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1449            big endian made volumes
1450      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1451            end user to instanciate class gdcmParser
1452           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1453
1454 2004-03-22 Benoit Regrain
1455      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1456      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1457              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1458
1459 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1460      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1461            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1462            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1463            or build from the files held (recursively) in a Directory
1464            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1465            gdcmObject::SetBoundaries() added
1466
1467 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1468      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1469                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1470      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1471            DICOMDIR
1472      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1473            about the name
1474
1475 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1476      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1477                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1478
1479 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1480      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1481            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1482            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1483            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1484            to allow making gdcDicomDir object.
1485      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1486           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1487
1488 2004-02-11 Benoit Regrain
1489      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1490              when using from python
1491
1492 2004-02-10 Benoit Regrain
1493      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1494      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1495      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1496              directory parsing
1497
1498 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1499      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1500              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1501              - class gdcmMeta created
1502      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1503              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1504      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1505
1506 2004-02-05 Benoit Regrain
1507      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1508              header entries
1509      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1510      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1511
1512 2004-02-04 Benoit Regrain
1513      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1514      * FIX : sort the images in the dicom dir
1515      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1516      * ADD : a python demo
1517
1518 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1519      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1520      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1521              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1522              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1523              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1524      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1525            to make full checking easier
1526         
1527 2004-02-04 Benoit Regrain
1528      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1529      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1530
1531 2004-02-03 Benoit Regrain
1532      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1533      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1534      * Bug fix and print add-on
1535
1536 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1537      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1538      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1539      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1540      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1541            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1542         
1543 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1544      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1545              iterator on last
1546              of the last synonym :-(
1547      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1548              for DICOMDIR ;-)
1549      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1550      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1551      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1552            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1553       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1554
1555 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1556      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1557            no longer writes 'Un' on disk
1558      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1559      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1560            the length (for Palette expanded images)
1561            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1562      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1563            (that broke Write). Replaced by UL.
1564            Aware user will reload the field if he 
1565            thinks it's necesssary
1566              
1567 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1568      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1569        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1570        IsReadable() methods.
1571        
1572      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1573       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1574       but so usefull for people that miss them ;-)
1575       
1576      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1577        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1578
1579 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1580      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1581
1582 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1583      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1584              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1585         The TRUE value for this param has to be used 
1586         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1587         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1588      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1589              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1590         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1591         
1592      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1593              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1594              Fixed
1595
1596      * gdcmHeader add the method
1597              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1598         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1599         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1600         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1601
1602 2004-01-26 Benoit Regrain
1603      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1604        in the print and add a third level of print to print them
1605
1606 2004-01-23 Benoit Regrain
1607      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1608      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1609      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1610        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1611
1612 2004-01-22 Benoit Regrain
1613      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1614      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1615
1616 2004-01-19 Benoit Regrain
1617      * Add the use of shadow dictionaries
1618      * bug fix and coding style
1619
1620 2004-01-19 Benoit Regrain
1621      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1622      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1623      * Add the update of header entries using the shadow library
1624
1625 2004-01-19 Benoit Regrain
1626      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1627      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1628        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1629        of dicom dir parsing
1630      * bug fix under python
1631
1632 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1633     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1634     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1635     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1636     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1637
1638 2004-01-15 Benoit Regrain
1639      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1640        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1641        when the gdcmDictSet will be destroyed
1642      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1643        gdcmDictSet
1644
1645 2004-01-15 Benoit Regrain
1646      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1647        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1648        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1649        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1650      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1651
1652 2004-01-14 Benoit Regrain
1653      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1654      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1655      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1656      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1657
1658 2004-01-13 Benoit Regrain
1659      * src/*.[h|cxx] : coding style
1660      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1661
1662 2004-01-13 Benoit Regrain
1663      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1664      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1665        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1666      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1667
1668 2004-01-12 Benoit Regrain
1669      * src/*.h : add comments
1670      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1671      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1672        directly setted in the source code
1673      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1674        gdcmTS and gdcmVR
1675
1676 2004-01-09 Benoit Regrain
1677      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1678      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1679
1680 2004-01-07 Benoit Regrain
1681      * Modification to compile with the distutils.
1682      * Bug fix in code
1683
1684 2003-12-10 Benoit Regrain
1685      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1686        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1687      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1688        made in the source code
1689
1690 2003-12-10 Benoit Regrain
1691      * Update Windows projects and .cvsignore files
1692
1693 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1694      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1695            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1696            if he wants to.
1697            gdcmElValSet:Print takes it into account
1698
1699 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1700      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1701      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1702      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1703
1704 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1705       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1706              on the ListTag listElem member,
1707              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1708       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1709              with the tagHt member and the listElem member.
1710              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1711
1712       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1713              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1714                             if bug fixing is necessary), for internal
1715                             use only
1716              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1717                             or to allow Parser going on.
1718              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1719              with a length (not 0000) is found
1720       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1721                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1722                 (to be written)
1723
1724 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1725      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1726      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1727           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1728      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1729
1730 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1731      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1732
1733 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1734      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1735           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1736
1737 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1738      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1739      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1740              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1741              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1742
1743 2003-11-05 Benoit Regrain
1744      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1745                        : Explicit error messages
1746      * in __init__.py  : Related modif
1747
1748 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1749      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1750            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1751            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1752      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1753                     (vtkGdcmReader compliant)           
1754       
1755 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1756      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1757        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1758        
1759 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1760      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1761            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1762
1763 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1764      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1765                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1766              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1767              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1768              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1769              such an image :
1770              After gdcmHeader :
1771               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1772               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1773               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1774      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1775              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1776
1777 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1778      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1779              
1780 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1781      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1782            being coherents dicom files.
1783      
1784 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1785      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1786            from medcon lib !
1787      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1788      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1789      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1790      * ENH: Add include dir to medcon lib
1791      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1792            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1793             
1794 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1795       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1796         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1797           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1798       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1799
1800 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1801       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1802         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1803         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1804       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1805       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1806
1807 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1808       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1809                                                
1810 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1811       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1812       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1813       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1814       
1815 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1816       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1817       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1818       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1819       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1820       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1821       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1822              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1823         But it fasten debug compilation time.
1824             
1825 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1826       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1827         (they are compressed as 2 planes images, 
1828          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1829
1830 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1831       * Now CheckRead takes into account :
1832          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1833          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1834       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1835        (breaks DicomWorks)
1836
1837 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1838       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1839              one should remove the '\'
1840         
1841 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1842       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1843         (wrong lengths in header)
1844         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1845       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1846         (breaks DicomWorks)
1847
1848 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1849       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1850         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1851
1852 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1853       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1854       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1855
1856 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1857       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1858      
1859 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1860       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1861         (the patch is easy to remove)
1862       * cosmetic changes to avoid warnings
1863       
1864 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1865       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1866         no need to press 'r' now.
1867    
1868 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1869       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1870         to new Jpeg Lossless decompressor
1871       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1872       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1873       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1874                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1875 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1876       * general anonymisation in gdcmData
1877       * adding the 'color files' from
1878         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1879       * adding some well knowed bugged-header images
1880       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1881         waiting for their inclusion in Python testsuite
1882
1883 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1884     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1885       no longer seg faults when file is not found
1886
1887 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1888      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1889        MultiFrame images
1890
1891 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1892      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1893
1894 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1895      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1896         OpenFile takes it into account
1897      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1898      * Missing elements added in dicomV3.dic
1899       (just to be affraid : have a look at
1900        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1901        and do it again next year ;->
1902
1903 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1904      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1905        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1906        But there are NOT. It's fixed !
1907        
1908 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1909      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1910      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1911          
1912 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1913      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1914              an ACR-NEMA / DICOM one.
1915      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1916              is not gdcm Readable
1917      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1918              is now decoded.
1919         
1920 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1921      * FIX: CMake generate now documentation
1922      * ENH: out of source doc build !
1923      * ENH: Generate both user and dev documentation
1924      * ENH: Should work on windows too
1925      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1926      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1927      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1928      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1929                      
1930 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1931      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1932      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1933      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1934         window level & window width
1935
1936 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1937      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1938      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1939      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1940      
1941 2003-10-06  Emanuel Ollart
1942      * FIX : compilation process wad broken.
1943              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1944         
1945 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1946      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1947      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1948      
1949 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1950      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1951            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1952                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1953       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1954
1955 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1956       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1957         to remain compliant with already defined strings, 
1958         like Transfert Syntax UID and others)
1959
1960 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1961       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1962              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1963         
1964 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1965       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1966       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1967
1968 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1969       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1970         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1971               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1972       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1973
1974 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1975       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1976
1977 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1978       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1979         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1980
1981 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1982       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1983          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1984          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1985          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1986           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1987                                             YBR_RCT files.
1988           (no sample found :-(
1989
1990 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1991       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1992         Two reasons: - clear things
1993                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1994                        suffer anymore VC++ complains
1995
1996 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1997       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1998       * removed leaks
1999
2000 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
2001       * The lines are now eigthy characters long.for 
2002         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
2003
2004 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2005       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
2006         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
2007         previous commis of Malaterre)
2008       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
2009         before the last Malaterre's commit.
2010
2011 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2012       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
2013         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
2014       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
2015         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
2016
2017 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2018       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
2019         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
2020         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
2021
2022 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2023       * Cosmetic changes:
2024         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
2025           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
2026           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
2027           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
2028         - PACKAGER corrected
2029         - DEVELOPPER added.
2030         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
2031       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
2032
2033 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2034       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
2035
2036 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2037       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
2038
2039 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2040       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
2041
2042 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2043       * Fix a few delete/delete[] mismatch
2044
2045 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2046       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
2047         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
2048         heuristics to get informations (look at different places).
2049       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
2050         sorting DICOM images based on different strategies.
2051       * modified Makefiles accordingly.
2052
2053 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2054       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
2055         when building in debug mode
2056       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
2057         src/win32/gdcmdll.dsp
2058       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
2059
2060 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2061       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
2062             to valgrind.
2063
2064 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2065       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
2066       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
2067                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
2068       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
2069
2070 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2071       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
2072         the file
2073       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
2074       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
2075         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
2076       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
2077         symbols... future problem ?
2078
2079 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2080       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
2081       * modified gdcm.dsw accordingly
2082
2083 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
2085
2086 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2087       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
2088         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
2089       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
2090         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
2091         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
2092
2093 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2094       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
2095
2096 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2097       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
2098       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
2099       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
2100       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
2101       * PACKAGER : adding all concerning windows
2102
2103 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2104       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
2105         garbage debug code.
2106       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
2107       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
2108         test suite reported error.
2109       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
2110         packaging a new release).
2111       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
2112       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
2113       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
2114         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
2115         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
2116
2117 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2119       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2120
2121 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2122       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2123         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2124         is made in an internal list to prevent this problem.
2125         Bug fix when output is empty.
2126         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2127         correction.
2128       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2129
2130 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2131       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2132       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2133         files. Added method to remove all files on the input
2134         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2135         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2136
2137 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2138       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2139         when using make instal.
2140       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2141         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2142
2143 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2144       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2145       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2146
2147 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2148       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2149         linux and WINDOWS !
2150       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2151       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2152
2153 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2154       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2155         addon of the jpeg library)
2156       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2157       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2158       * INSTALL now points to web documentation
2159
2160 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2161       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2162         gdcmUtil.h anymore.
2163       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2164         clean target.
2165       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2166         - to allow compilation with gcc 3.x
2167           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2168           -- small fixes on exceptions.
2169           Note: linking not tested !
2170         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2171           building stage.
2172       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2173         dependent convertion).
2174
2175 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2176       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2177         Changelog):
2178         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2179         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2180           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2181         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2182
2183 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2184       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2185         compile
2186       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2187         (FileName -> Filename)
2188
2189 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2190       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2191         - UpdateProgress method should now be effective
2192         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2193           to volumes),
2194         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2195           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2196           accelerating things).
2197         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2198           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2199           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2200           in the stack (for the caller to notice the problem).
2201
2202 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2203       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2204
2205 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2206       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2207         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2208         under Windows... thanks Windows !)
2209
2210 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2211       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2212         debug stage).
2213       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2214
2215 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2216       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2217
2218 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2219       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2220         called with different flags than the default ones (with automake).
2221         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2222            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2223         and went for warning fixes:
2224         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2225           up from unused variables.
2226         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2227       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2228
2229 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2230       * gdcmPython/gdcm.i:
2231         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2232           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2233           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2234         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2235           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2236           exported to Python a as cvar.
2237       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2238         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2239         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2240         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2241         C++ static methods).
2242       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2243         with the above changes.
2244
2245 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2246       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2247
2248 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2249       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2250         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2251         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2252          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2253          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2254            a wrapper
2255          - Wrapper interface which wrap sources
2256         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2257         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2258       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2259         files for compilation
2260
2261 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2262       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2263         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2264         - vtk/Makefile.am now builds a library
2265         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2266           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2267           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2268           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2269           import library.
2270         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2271           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2272           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2273           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2274           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2275         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2276           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2277         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2278           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2279       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2280       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2281         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2282         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2283         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2284         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2285         collision of various stl members (principally cout...).
2286       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2287         file.
2288       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2289         comply with above changes)
2290
2291 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2292       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2293       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2294         vtk data structure (an image Flip was required).
2295       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2296       * cosmetic changes in documentation.
2297
2298 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2299       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2300         unexisting file is given as argument.
2301       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2302         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2303         containing those images is now available at
2304           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2305         with the name gdcmData.
2306         All the python scripts (including the package initialisation file
2307         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2308         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2309
2310 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2311       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2312         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2313         demo of the usage of this class.
2314         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2315         at configure (or autogen.sh) stage.
2316
2317 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2318       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2319         Notes on valgrind:
2320           - maximum info is obtained with a command of the form:
2321             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2322                      --show-reachable=yes PrintHeader
2323           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2324             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2325             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2326             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2327              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2328       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2329         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2330         Note: some images don't seem to work e.g.
2331             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2332       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2333         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2334         make gdcm more thread friendly.
2335
2336 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2337       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2338           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2339         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2340           gdcmHeader::_dicom_vr.
2341         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2342         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2343           VRHT*.
2344         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2345
2346 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2347       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2348         make install stage.
2349
2350 2003-04-9 JPR
2351       * UpdateGroupLength replaced by new one
2352
2353 2003-04-7 JPR
2354       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2355         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2356
2357 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2358       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2359       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2360       * src:
2361         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2362         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2363           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2364         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2365           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2366           carried the same semantics.
2367           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2368         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2369           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2370         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2371       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2372       * gdcmGetXSize added
2373       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2374       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2375
2376 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2378         (to avoid double call by end user).
2379       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2380         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2381
2382 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2383       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2384         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2385           the html.users end users oriented documentation and
2386           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2387           oriented documentation.
2388         - README changed accordingly
2389         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2390         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2391           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2392         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2393           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2394           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2395       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2396         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2397       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2398         ill-formed documentation sections.
2399       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2400
2401 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2402       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2403       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2404         un*ces with sh-utils test utility.
2405       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2406       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2407       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2408       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2409       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2410
2411 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2412       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2413       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2414
2415 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2416       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2417       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2418       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2419       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2420         compilation work.
2421       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2422       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2423
2424 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2425       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2426         hence the user doesn't need this explicit call.
2427         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2428           i.e. LoadElements() call removed.
2429       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2430         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2431       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2432         for adding user defined new tags.
2433         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2434         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2435           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2436
2437 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2438       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2439         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2440         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2441         with the autotools, included the python wrappers part.
2442       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2443
2444 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2445       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2446
2447 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2448       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2449         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2450         for usage).
2451       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2452         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2453         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2454       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2455         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2456
2457 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2458       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2459         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2460         value of GDCM_DICT_PATH.
2461       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2462
2463 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2464       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2465       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2466       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2467         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2468         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2469
2470 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2471       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2472         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2473         gdcmHeader.h
2474       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2475         (as opposed to gdcm.h)
2476       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2477       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2478         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2479       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2480
2481 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2482       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2483         bug.
2484
2485 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2486       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2487         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2488         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2489         of hidding away the python related distutils specific files
2490         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2491         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2492         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2493         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2494
2495 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2496       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2497       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2498         among the list of sources.
2499
2500 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2501       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2502       * modifications in MSVC projects
2503
2504 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2505       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2506         looks like we can move back to original usage of exception within
2507         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2508         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2509       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2510         README file for usage added.
2511       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2512         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2513         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2514         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2515       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2516       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2517         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2518           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2519           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2520           instance of class gdcmHeader.
2521         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2522           require no instances at all to be invocated.
2523         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2524           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2525           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2526       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2527         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2528       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2529         the above to be effective.
2530       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2531         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2532       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2533         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2534         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2535         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2536         (for python dectection).
2537       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2538         now avoids publishing the empty entries.
2539
2540 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2541       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2542         ExtraPath reused :-P
2543       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2544
2545 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2546       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2547       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2548       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2549         and links
2550
2551 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2552       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2553         method. Doxygenation.
2554       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2555
2556 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2557       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2558         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2559         when using "python setup.py install".
2560       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2561         reexports the working classes.
2562       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2563         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2564         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2565         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2566         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2567         subdir (see the README file). This problem probably due to
2568         an combination of g++ and dynamic loading.
2569       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2570
2571 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2572       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2573         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2574         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2575         again in a python subdir, but the package itself is now in
2576         python/gdcmPython.
2577       * setup.py was cleaned up:
2578         - pythonIncludePath removed
2579         - python setup.py bdist target is now functional.
2580       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2581         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2582         accordingly.
2583
2584 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2585       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2586       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2587         distutils installer is operational.
2588       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2589           shadow classes (from gdcm.py).
2590         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2591           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2592         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2593
2594 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2595       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2596         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2597         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2598         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2599         dictionary.
2600         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2601           are now in the "???" group.
2602         - python/gdcm.i changed accordingly,
2603         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2604           of the above new functionalities in Python.
2605
2606 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2607       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2608         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2609           were definitively removed.
2610         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2611       * src/gdcmElValSet.cxx:
2612         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2613         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2614         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2615         - Added GetElementByName(string).
2616       * src/gdcmHeader.cxx: added
2617         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2618         - GetPubElValRepByName(string)
2619         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2620         - GetShaElValRepByName(string)
2621         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2622         - GetShaElValRepByName(string)
2623         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2624         - GetElValRepByName(string)
2625         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2626         - GetElValRepByName(string)
2627       * Doc/requirements.txt added.
2628
2629 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2630       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2631       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2632         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2633         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2634         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2635       * python/testSuite.py changed accordingly.
2636
2637 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2638       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2639         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2640              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2641               cannot be exported. [...]
2642               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2643               be exported. [...]
2644               This is caused by a designed limitation that once a template
2645               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2646               exported."
2647         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2648         limitation" of VC++ is a pitfall.
2649         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2650         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2651         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2652         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2653         library.
2654         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2655       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2656          dll under windows !!!!)
2657       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2658       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2659         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2660       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2661         (one) of image(s).
2662       * removed glib references
2663       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2664
2665 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2666       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2667         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2668         the files of the testsuite without using unittest.
2669       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2670       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2671       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2672         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2673
2674 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2675       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2676         values, but limits itself to values which are below a user specified
2677         size (by default 1024 bytes).
2678       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2679         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2680         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2681         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2682       * python/testSuite.py
2683         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2684         - two new examples added.
2685       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2686
2687 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2688       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2689         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2690       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2691       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2692       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2693
2694 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2695       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2696         the vr was also RET.
2697       * python/testSuite.py more tests added.
2698
2699 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2700       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2701       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2702       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2703         7.18 Integer types (see stdint.h)
2704         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2705       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2706         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2707         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2708         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2709         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2710         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2711         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2712         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2713
2714 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2715       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2716         VR files.
2717       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2718
2719 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2720       * Adaptation for porting to VC++:
2721         - src/gdcm.h
2722           o forced to use std namespace (for string to be known)
2723           o all class use __declspec export style on WIN32
2724         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2725           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2726       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2727         variable GDCM_DICT_PATH.
2728       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2729
2730 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2731       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2732         to native Python dictionary.
2733       * python/demo/test.py:
2734         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2735         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2736       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2737         PubElVals hashing table.
2738       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2739
2740 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2741       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2742         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2743       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2744       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2745       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2746         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2747       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2748
2749 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2750       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2751         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2752         that we can import de shadow classes without errors].
2753
2754 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2755       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2756       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2757       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2758       * src/Makefile prepared for python wrapping
2759
2760 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2761       * src/gdcmHeader.cxx :
2762         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2763           (see gdcmHeader::LoadElements).
2764         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2765           ReadInt16 and ReadInt32)
2766
2767 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2768       * src/gdcmHeader.cxx :
2769         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2770           method.
2771         - SetLgrElem renamed to SetLength
2772         - GetLgrElem renamed to GetLength
2773         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2774       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2775       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2776         due to IdoDude was cleaned out.
2777
2778 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2779       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2780         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2781         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2782         returning the unecessary skL (skipped length).
2783         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2784         it was redundant with the File position internals (by using
2785         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2786         jajun.
2787       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2788         on the libido specificities which are handled through class
2789         inheritance.
2790       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2791         added.
2792
2793 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2794       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2795         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2796
2797 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2798       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2799
2800 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2801       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2802         and _IdDcmSWAP_LONG.
2803
2804 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2805       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2806         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2807