]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
STYLE: ivars should start with a capital letter. Accessors should be const to avoid...
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
3   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
4   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
5   
6 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
7   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
8   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
9     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
10   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
11   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
12     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
13     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
14       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
15       no longer exists.
16
17 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
18   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
19    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
20    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
21    the class.
22   
23 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
24   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
25     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
26     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
27
28 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
29   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
30   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
31     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
32     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
33     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
34       CloseFile() anymore.
35     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
36       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
37       into File::Pixel_Data.
38
39 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
40   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
41     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
42   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
43     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
44     method:
45     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
46     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
47       method to those classes.
48     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
49       -- Added a ::Print() method.
50       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
51       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
52          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
53
54 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
55   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
56     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
57     doxygen.
58   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
59   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
60     pointlessly wrapped (see
61     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
62   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
63     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
64     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
65     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
66     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
67       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
68            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
69       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
70          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
71
72 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
73   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
74     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
75
76 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
77   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
78     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
79     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
80   * TODO added new entry.
81   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
82     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
83     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
84     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
85       variable names for semantical coherence.
86
87 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
88   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
89   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
90   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
91   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
92   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
93   compilation time jpeg option.
94
95 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
96   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
97     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
98     reproduce at home.
99   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
100   Thanks dcmtk crew !
101
102 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
103   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
104   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
105     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
106   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
107   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
108   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
109   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
110     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
111     from File:: to PixelConvert::.
112
113 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
114   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
115     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
116      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
117      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
118
119 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
120   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
121   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
122   like this:
123     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
124   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
125   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
126   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
127
128 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
129   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
130     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
131     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
132     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
133     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
134       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
135       (for the time being this is better than having them attach to
136        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
137     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
138       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
139     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
140       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
141       gdcmPixelConvert::
142
143 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
144   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
145   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
146     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
147       clean up of RLE related code. 
148   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
149     - src/gdcmRLE.cxx removed
150     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
151     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
152     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
153   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
154     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
155       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
156       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
157
158 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
159   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
160     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
161       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
162       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
163       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
164       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
165       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
166       offsets.
167   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
168     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
169         with the retired Parse7Fe0().
170     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
171     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
172
173 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
174   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
175     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
176     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
177     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
178   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
179     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
180       to return an unused length.
181
182 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
183   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
184     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
185     to use to do simple stuff.
186
187 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
188   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
189     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
190     copying of the file within different directory, configure header file to
191     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
192     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
193
194 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
195   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
196      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
197        with it's binary name).
198      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
199        the Website to be more complete.
200      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
201        doxygenated documentation.
202      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
203        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
204                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
205   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
206   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
207    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
208
209 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
210   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
211    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
212
213 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
214   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
215     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
216     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
217     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
218     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
219   * GDCMHOME clean up:
220     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
221       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
222       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
223   * Autotools clean up:
224     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
225     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
226
227 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
228   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
229   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
230   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
231
232 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
233   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
234     describing TODO entries and used it for new entries.
235   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
236     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
237     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
238   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
239     documentation itself, but the website) moved to html and
240     placed in directory Doc/Website:
241     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
242     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
243     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
244   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
245   * CMakeLists.txt changed accordingly.
246   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
247     DeveloppersPython.html
248   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
249
250 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
251   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
252     of gdcm Web site.
253
254 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
255   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
256     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
257          we can now delete[] it safely  
258   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
259     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
260   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
261
262 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
263   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
264     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
265     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
266     pointed content.
267
268 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
269   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
270   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
271
272 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
273   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
274     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
275     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
276     an example of usage.
277     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
278       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
279     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
280       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
281     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
282     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
283     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
284
285 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
286   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
287     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
288     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
289     in class 
290     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
291       and associated accessors. Doxygenation of the class.
292     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
293       accessors added.
294     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
295       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
296     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
297     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
298
299 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
301     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
302       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
303            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
304            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
305            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
306            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
307            the same group and element all share the same (group, element)
308            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
309            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
310            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
311            consider the following definition of a TagKey:
312            - let Group, Element be the string representation of the
313              group and element dicom tag members,
314            - let ItemNumber be the string representation of the integer
315              index of the considered item number of a sequence,
316            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
317            the form:
318               /ItemNumber#Group|Element
319            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
320            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
321               Group|Element<SeqTag>
322            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
323            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
324            string e.g.
325                0028|1201
326            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
327            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
328            string e.g.
329                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
330     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
331       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
332       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
333     - src/gdcmDocEntry.cxx:
334       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
335          Key member.
336       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
337     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
338     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
339       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
340       -- now has a new BaseTagKey member.
341       -- STYLE.
342   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
343     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
344     truly belongs.
345     This poses the problem with the semantics of the following lines
346        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
347        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
348        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
349     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
350     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
351     order to get things working the dicom dictionary was altered !
352     Please fix things urgently...
353   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
354     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
355     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
356     set to OW:
357       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
358       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
359       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
360   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
361     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
362   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
363
364 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
365   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
366
367 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
368   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
369     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
370   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
371   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
372
373 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
374   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
375     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
376   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
377     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
378   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
379     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
380   * TODO updated
381   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
382     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
383   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
384   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
385     exception_on_error parameter.
386     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
387     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
388     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
389
390 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
391   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
392   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
393     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
394   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
395   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
396   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
397     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
398   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
399
400 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
401   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
402     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
403
404 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
405   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
406        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
407                  
408 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
409   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
410         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
411
412 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
413    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
414    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
415      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
416      is now in static in the gdcmDebug class
417    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
418    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
419
420 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
421    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
422      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
423    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
424      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
425      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
426      that displays position and size).
427    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
428      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
429      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
430      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
431      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
432      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
433      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
434         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
435      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
436      commiting changes).
437    * Test/CMakeLists.txt:
438       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
439       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
440         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
441         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
442    * TODO updated.
443
444 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
445    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
446      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
447      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
448      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
449      - removal of typedef duplication.
450      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
451      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
452    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
453       - printf polluting ctest removed.
454       - TAB removal for comminting
455    * Test:
456      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
457        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
458        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
459        this test creates them.
460        Note: we need to validate each reference image, but before that
461              I'd like to rename them with a more explicit name...
462      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
463    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
464      including each header needed).
465
466 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
467    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
468      test suite to the Example directory. Are concerned:
469      - PrintHeader.cxx
470      - TestDcm2Acr.cxx
471      - TestFindTags.cxx
472      - TestWrite.cxx was
473      - TestWriteSimple.cxx
474    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
475      image gdcmData/oldACR00001.ima
476
477 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
478    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
479      with removal from gdcmData):
480       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
481       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
482       - US.3405.1.dcm
483      Added the following because after last cvs update, they cause
484        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
485      to segfault:
486       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
487       - oldACR00001.ima
488    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
489      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
490      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
491      form of test...
492    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
493      we don't need to black list the following images anymore:
494       - 8BitsUncompressedColor.dcm
495       - OT-PAL-8-face.dcm
496       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
497    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
498      fixes and the beautified code ;-)
499      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
500      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
501      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
502            improve the test suite). The bug could be detected by using
503            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
504            or by using
505            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
506            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
507
508 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
509    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
510          - replace by uggly but working old code :-(
511                 A lot of things should be OK again.
512         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
513         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
514         (twice, withing a fortnigh ...)         
515
516 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
517    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
518      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
519    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
520      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
521      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
522                    - OT-PAL-8-face.dcm
523                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
524    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
525      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
526      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
527      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
528      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
529      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
530      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
531      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
532      image.
533    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
534      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
535      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
536      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
537    
538 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
539   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
540   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
541                           (instead of infinite loop)
542   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
543
544 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
545    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
546
547 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
548    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
549                     when SamplesPerPixel =3
550          - now Write is no longer confused by 
551                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
552          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
553                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
554    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
555                     (in order to split the job that has not to be done 
556                                         for gdcmDicomDir)
557
558 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
559    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
560      loop on the same image until memory went out. 
561      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
562    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
563      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
564
565 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
566    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
567             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
568                                 is added a the end, when necessary.
569             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
570                       now written correctly
571                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
572                                 (even for odd groups) 
573         Note : only Explicit Value Representation was checked.
574                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
575
576 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
577    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
578    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
579      coding style).
580
581 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
582    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
583      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
584    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
585
586 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
587    FIX : gdcmDocument.cxx
588       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
589         code 'beautyfication' :-(
590       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
591
592 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
593    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
594                  : to allow user to create his own Sequences
595         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
596
597 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
598         
599         - gdcmBinEntry
600           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
601           
602    - gdcmDocEntry
603           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
604           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
605           
606         - gdcmDocEntrySet
607           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
608           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
609      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
610      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
611      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
612      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
613                                             guint16 element,
614                                             std::string vr     = "unkn",
615                                             std::string fourth = "unkn",
616                                             std::string name   = "unkn"); 
617           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
618      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
619      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
620      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
621      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
622      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
623           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
624      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
625           
626         - gdcmDocument
627      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
628      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
629      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
630      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
631      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
632                                         FILE *_fp, FileType type);
633      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
634      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
635      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
636      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
637      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
638      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
639      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
640      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
641                                             guint16 element,
642                                             std::string vr     = "unkn",
643                                             std::string fourth = "unkn",
644                                             std::string name   = "unkn");
645      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
646      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
647      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
648      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
649                                                                                                                  
650         - gdcmElementSet
651           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
652           
653    - gdcmSeqEntry
654           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
655  
656    - gdcmSQItem
657      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
658      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
659      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
660      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
661
662    - gdcmValEntry
663          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
664                                   
665 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
666     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
667       The default constructor invoked by the line
668          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
669       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
670       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
671       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
672     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
673       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
674       Could anyone explain why ?
675     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
676       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
677       code related to gdcmBinEntry).
678
679 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680     * In order to fix memory leaks:
681      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
682        some delete calls.
683      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
684      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
685        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
686        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
687        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
688      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
689      - src/gdcmDocument.cxx:
690        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
691           from dynamic stores.
692        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
693           was causing memory leaks.
694      - src/gdcmSQItem.cxx:
695        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
696           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
697        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
698           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
699           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
700           This avoids SegFaulting.
701      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
702     * Conclusion:
703      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
704        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
705        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
706      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
707        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
708      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
709        segfaults).
710     * Erroneous leading white fix:
711      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
712        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
713      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
714      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
715     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
716     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
717
718
719 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
720     * In order to fix writing of dicom files:
721      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
722      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
723      - src/gdcmDocument.cxx:
724        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
725        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
726        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
727           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
728           manner.
729        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
730           to only declared) and build on top of
731           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
732        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
733      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
734        for usage in destructor and treatement of promotion in
735        ::ReplaceOrCreateByNumber().
736      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
737       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
738     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
739       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
740       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
741       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
742
743 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
744     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
745       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
746       learned that:
747           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
748           soon as possible by globally disabling memory caching.
749           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
750           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
751       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
752       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
753       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
754     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
755       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
756       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
757       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
758         with 1.
759       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
760       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
761       understand why the list is empty...).
762     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
763     * Doc/License.txt added.
764
765 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
766     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
767       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
768         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
769         the padding problem.
770       - general clean up, simplification, and coding style.
771       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
772     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
773
774 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
775    *  gdcmSeqEntry.cxx
776            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
777                 - fix the display of SQItem ordinal number
778       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
779                 - remove some useless never written private methods     
780                 
781 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
782    * gdcmBinEntry.cxx 
783       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
784            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
785               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
786                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
787    * dcmDocument.cxx
788       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
789               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
790            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
791       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
792    * gdcmFile.cxx
793       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
794    * gdcmSQItem.h
795       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
796             a (relative) Item identier inside a given Sequence
797             \warning : some pb remaining around this number
798                                 will be solved asap
799       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
800    * gdcmValEntry.cxx 
801       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
802
803 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
804     * Memory leak hunt with the following command:
805       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
806                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
807       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
808       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
809       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
810           grep "MEMORY LEAK" src/*
811       Here are two typical examples which I can't help fixing:
812       -----
813           #include <string>
814           int main() {
815              std::string name;
816              char * test = "babo";
817              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
818                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
819              name.clear();   //// Doesn't help !
820              return 0;
821           }
822       -----
823           #include <string>
824           #include <iostream>
825           int main() {
826              std::string line;
827              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
828              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
829                                         //// of 1320 bytes in call to
830                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
831             return 0;
832           }
833       -----
834
835
836 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
837     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
838       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
839         and related, moved away to gdcmDocument.
840       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
841         the corresponding protected accessors of inherited class
842         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
843         declared friend of class gdcmDocument (see below).
844       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
845       - Clean up of undefined or unused methods.
846     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
847       account the changes to gdcmHeader.h).
848     * src/gdcmDocument.h:
849       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
850         changes to gdcmHeader.h).
851       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
852         (see changes to gdcmHeader.h).
853       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
854       - Clean up of undefined or unused methods.
855     * src/gdcmDocument.cxx:
856       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
857       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
858       - some std::string properly set to VRKey
859     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
860       references to gdcmDocument. 
861     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
862     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
863       cvs repository gdcmData.
864
865 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
866     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
867     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
868       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
869     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
870     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
871       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
872     * src/gdcmDocument.cxx: 
873       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
874         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
875       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
876         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
877         removed. Reverting to previous code segment with the proper
878         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
879         Note: this was (partially) breaking the python test suite
880               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
881               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
882     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
883     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
884       now taken into account.
885     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
886       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
887     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
888       on posix.
889     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
890       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
891     * .... alas, the python testSuite is still broken.
892
893 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
894     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
895       gdcmGlob
896     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
897     * src/gdcmUtil.h : export methods
898
899 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
900     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
901       to right behavior
902     * Initial addition of automatic python testing
903     * Initial addition of automatic image comparison
904
905 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
906     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
907       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
908
909 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
910      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
911      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
912      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
913
914 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
915      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
916        new concepts (and new classes) :
917        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
918         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
919         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
920        a Sequence is composed of Items.
921        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
922        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
923        (never taken into account)
924        Our unability to add a new 'entry' in the header
925        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
926        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
927        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
928        nothing is finished.
929        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
930
931 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
932      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
933      
934 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
935      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
936        file prefix (SetFilePrefix)
937
938 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
939      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
940        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
941        baseline.
942      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
943        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
944
945 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
946      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
947        dicom image
948
949 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
950      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
951      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
952        between the developper and user version.
953      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
954      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
955
956 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
957      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
958        when using cmake.
959
960 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
961      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
962                src directory, now generated in the build dir.
963             2. Tests as mentionned smarter
964             3. Some clean up
965             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
966           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
967           where we could set the institution name / patient name...
968
969        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
970               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
971                  (this was not true before)
972
973 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
974      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
975            SeQuence indented printing of Dicom Header.
976      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
977            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
978            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
979      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
980            tree-like structure of a Dicom Header.
981      * FIX Test code cleaning     
982            
983 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
984      * ENH: Adding automatic testing
985        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
986        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
987        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
988        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
989           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
990           too many projects
991      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
992      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
993        one file instead of seven + some small cleanup
994
995 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
996      * ENH Minor changes to the Print() methods.
997      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
998            Header printing. Example given with :
999            > PrintHeader fileName  2 new
1000           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1001            
1002 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1003      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1004          1. I have added some unsigned where needed
1005          2. Some function parameter not used -> (void)
1006          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1007          4. g++ don't like character '\' in comment
1008          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1009                     this really need to be fixed
1010          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1011          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1012                     this also really need to be fixed
1013          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1014                     remove compression file 
1015                     (as we only do decompression, right ?)     
1016      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1017
1018 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1019      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1020            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1021            defaulted to yspacing
1022            
1023 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1024      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1025      * ENH add parameters :
1026                bool  exception_on_error = false, 
1027                bool  enable_sequences   = false,
1028                bool  ignore_shadow      = false
1029            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1030      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1031            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1032               
1033 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1034      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1035      
1036 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1037      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1038      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1039              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1040              
1041 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1042      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1043          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1044
1045 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1046      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1047        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1048        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1049        in gdcmHeader.
1050      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1051        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1052        already does the job.
1053      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1054        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1055
1056 2004-03-30 Benoit Regrain
1057      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1058        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1059        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1060
1061 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1062      * ENH : Check on file type to be written moved
1063              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1064      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1065              when end-of-list is reached
1066            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1067
1068 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1069      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1070      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1071      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1072        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1073
1074 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1075      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1076        now contains all the gdcmGlobal related code.
1077      * minor coding style and doxygenation changes.
1078
1079 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1080      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1081        now contains all the Debug related code.
1082      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1083      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1084        CreateCleanString) removed.
1085      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1086      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1087      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1088      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1089        src/gdcmDirList.cxx)
1090
1091 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1092      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1093
1094 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1095      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1096            big endian made volumes
1097      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1098            end user to instanciate class gdcmParser
1099           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1100
1101 2004-03-22 Benoit Regrain
1102      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1103      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1104              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1105
1106 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1107      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1108            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1109            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1110            or build from the files held (recursively) in a Directory
1111            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1112            gdcmObject::SetBoundaries() added
1113
1114 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1115      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1116                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1117      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1118            DICOMDIR
1119      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1120            about the name
1121
1122 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1123      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1124                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1125
1126 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1127      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1128            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1129            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1130            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1131            to allow making gdcDicomDir object.
1132      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1133           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1134
1135 2004-02-11 Benoit Regrain
1136      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1137              when using from python
1138
1139 2004-02-10 Benoit Regrain
1140      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1141      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1142      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1143              directory parsing
1144
1145 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1146      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1147              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1148              - class gdcmMeta created
1149      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1150              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1151      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1152
1153 2004-02-05 Benoit Regrain
1154      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1155              header entries
1156      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1157      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1158
1159 2004-02-04 Benoit Regrain
1160      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1161      * FIX : sort the images in the dicom dir
1162      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1163      * ADD : a python demo
1164
1165 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1166      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1167      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1168              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1169              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1170              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1171      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1172            to make full checking easier
1173         
1174 2004-02-04 Benoit Regrain
1175      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1176      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1177
1178 2004-02-03 Benoit Regrain
1179      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1180      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1181      * Bug fix and print add-on
1182
1183 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1184      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1185      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1186      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1187      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1188            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1189         
1190 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1191      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1192              iterator on last
1193              of the last synonym :-(
1194      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1195              for DICOMDIR ;-)
1196      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1197      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1198      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1199            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1200       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1201
1202 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1203      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1204            no longer writes 'Un' on disk
1205      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1206      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1207            the length (for Palette expanded images)
1208            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1209      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1210            (that broke Write). Replaced by UL.
1211            Aware user will reload the field if he 
1212            thinks it's necesssary
1213              
1214 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1215      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1216        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1217        IsReadable() methods.
1218        
1219      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1220       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1221       but so usefull for people that miss them ;-)
1222       
1223      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1224        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1225
1226 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1227      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1228
1229 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1230      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1231              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1232         The TRUE value for this param has to be used 
1233         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1234         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1235      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1236              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1237         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1238         
1239      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1240              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1241              Fixed
1242
1243      * gdcmHeader add the method
1244              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1245         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1246         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1247         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1248
1249 2004-01-26 Benoit Regrain
1250      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1251        in the print and add a third level of print to print them
1252
1253 2004-01-23 Benoit Regrain
1254      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1255      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1256      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1257        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1258
1259 2004-01-22 Benoit Regrain
1260      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1261      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1262
1263 2004-01-19 Benoit Regrain
1264      * Add the use of shadow dictionaries
1265      * bug fix and coding style
1266
1267 2004-01-19 Benoit Regrain
1268      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1269      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1270      * Add the update of header entries using the shadow library
1271
1272 2004-01-19 Benoit Regrain
1273      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1274      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1275        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1276        of dicom dir parsing
1277      * bug fix under python
1278
1279 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1280     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1281     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1282     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1283     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1284
1285 2004-01-15 Benoit Regrain
1286      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1287        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1288        when the gdcmDictSet will be destroyed
1289      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1290        gdcmDictSet
1291
1292 2004-01-15 Benoit Regrain
1293      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1294        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1295        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1296        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1297      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1298
1299 2004-01-14 Benoit Regrain
1300      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1301      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1302      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1303      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1304
1305 2004-01-13 Benoit Regrain
1306      * src/*.[h|cxx] : coding style
1307      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1308
1309 2004-01-13 Benoit Regrain
1310      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1311      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1312        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1313      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1314
1315 2004-01-12 Benoit Regrain
1316      * src/*.h : add comments
1317      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1318      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1319        directly setted in the source code
1320      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1321        gdcmTS and gdcmVR
1322
1323 2004-01-09 Benoit Regrain
1324      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1325      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1326
1327 2004-01-07 Benoit Regrain
1328      * Modification to compile with the distutils.
1329      * Bug fix in code
1330
1331 2003-12-10 Benoit Regrain
1332      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1333        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1334      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1335        made in the source code
1336
1337 2003-12-10 Benoit Regrain
1338      * Update Windows projects and .cvsignore files
1339
1340 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1341      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1342            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1343            if he wants to.
1344            gdcmElValSet:Print takes it into account
1345
1346 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1347      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1348      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1349      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1350
1351 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1352       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1353              on the ListTag listElem member,
1354              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1355       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1356              with the tagHt member and the listElem member.
1357              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1358
1359       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1360              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1361                             if bug fixing is necessary), for internal
1362                             use only
1363              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1364                             or to allow Parser going on.
1365              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1366              with a length (not 0000) is found
1367       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1368                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1369                 (to be written)
1370
1371 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1372      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1373      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1374           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1375      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1376
1377 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1378      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1379
1380 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1381      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1382           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1383
1384 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1385      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1386      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1387              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1388              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1389
1390 2003-11-05 Benoit Regrain
1391      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1392                        : Explicit error messages
1393      * in __init__.py  : Related modif
1394
1395 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1396      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1397            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1398            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1399      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1400                     (vtkGdcmReader compliant)           
1401       
1402 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1403      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1404        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1405        
1406 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1407      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1408            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1409
1410 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1411      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1412                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1413              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1414              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1415              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1416              such an image :
1417              After gdcmHeader :
1418               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1419               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1420               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1421      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1422              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1423
1424 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1425      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1426              
1427 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1428      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1429            being coherents dicom files.
1430      
1431 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1432      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1433            from medcon lib !
1434      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1435      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1436      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1437      * ENH: Add include dir to medcon lib
1438      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1439            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1440             
1441 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1442       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1443         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1444           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1445       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1446
1447 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1448       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1449         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1450         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1451       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1452       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1453
1454 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1455       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1456                                                
1457 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1458       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1459       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1460       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1461       
1462 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1463       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1464       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1465       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1466       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1467       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1468       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1469              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1470         But it fasten debug compilation time.
1471             
1472 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1473       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1474         (they are compressed as 2 planes images, 
1475          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1476
1477 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1478       * Now CheckRead takes into account :
1479          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1480          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1481       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1482        (breaks DicomWorks)
1483
1484 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1485       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1486              one should remove the '\'
1487         
1488 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1489       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1490         (wrong lengths in header)
1491         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1492       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1493         (breaks DicomWorks)
1494
1495 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1496       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1497         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1498
1499 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1500       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1501       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1502
1503 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1504       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1505      
1506 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1507       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1508         (the patch is easy to remove)
1509       * cosmetic changes to avoid warnings
1510       
1511 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1512       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1513         no need to press 'r' now.
1514    
1515 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1516       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1517         to new Jpeg Lossless decompressor
1518       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1519       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1520       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1521                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1522 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1523       * general anonymisation in gdcmData
1524       * adding the 'color files' from
1525         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1526       * adding some well knowed bugged-header images
1527       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1528         waiting for their inclusion in Python testsuite
1529
1530 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1531     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1532       no longer seg faults when file is not found
1533
1534 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1535      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1536        MultiFrame images
1537
1538 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1539      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1540
1541 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1542      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1543         OpenFile takes it into account
1544      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1545      * Missing elements added in dicomV3.dic
1546       (just to be affraid : have a look at
1547        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1548        and do it again next year ;->
1549
1550 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1551      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1552        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1553        But there are NOT. It's fixed !
1554        
1555 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1556      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1557      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1558          
1559 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1560      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1561              an ACR-NEMA / DICOM one.
1562      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1563              is not gdcm Readable
1564      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1565              is now decoded.
1566         
1567 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1568      * FIX: CMake generate now documentation
1569      * ENH: out of source doc build !
1570      * ENH: Generate both user and dev documentation
1571      * ENH: Should work on windows too
1572      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1573      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1574      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1575      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1576                      
1577 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1578      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1579      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1580      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1581         window level & window width
1582
1583 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1584      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1585      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1586      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1587      
1588 2003-10-06  Emanuel Ollart
1589      * FIX : compilation process wad broken.
1590              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1591         
1592 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1593      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1594      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1595      
1596 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1597      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1598            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1599                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1600       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1601
1602 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1603       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1604         to remain compliant with already defined strings, 
1605         like Transfert Syntax UID and others)
1606
1607 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1608       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1609              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1610         
1611 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1613       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1614
1615 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1616       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1617         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1618               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1619       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1620
1621 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1622       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1623
1624 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1625       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1626         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1627
1628 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1629       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1630          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1631          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1632          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1633           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1634                                             YBR_RCT files.
1635           (no sample found :-(
1636
1637 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1638       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1639         Two reasons: - clear things
1640                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1641                        suffer anymore VC++ complains
1642
1643 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1644       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1645       * removed leaks
1646
1647 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1648       * The lines are now eigthy characters long.for 
1649         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1650
1651 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1652       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1653         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1654         previous commis of Malaterre)
1655       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1656         before the last Malaterre's commit.
1657
1658 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1660         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1661       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1662         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1663
1664 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1665       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1666         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1667         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1668
1669 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1670       * Cosmetic changes:
1671         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1672           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1673           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1674           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1675         - PACKAGER corrected
1676         - DEVELOPPER added.
1677         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1678       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1679
1680 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1681       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1682
1683 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1684       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1685
1686 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1687       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1688
1689 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1691
1692 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1693       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1694         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1695         heuristics to get informations (look at different places).
1696       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1697         sorting DICOM images based on different strategies.
1698       * modified Makefiles accordingly.
1699
1700 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1701       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1702         when building in debug mode
1703       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1704         src/win32/gdcmdll.dsp
1705       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1706
1707 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1708       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1709             to valgrind.
1710
1711 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1713       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1714                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1715       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1716
1717 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1718       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1719         the file
1720       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1721       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1722         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1723       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1724         symbols... future problem ?
1725
1726 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1727       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1728       * modified gdcm.dsw accordingly
1729
1730 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1731       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1732
1733 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1734       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1735         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1736       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1737         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1738         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1739
1740 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1741       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1742
1743 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1744       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1745       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1746       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1747       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1748       * PACKAGER : adding all concerning windows
1749
1750 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1751       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1752         garbage debug code.
1753       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1754       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1755         test suite reported error.
1756       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1757         packaging a new release).
1758       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1759       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1760       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1761         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1762         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1763
1764 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1766       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1767
1768 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1769       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1770         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1771         is made in an internal list to prevent this problem.
1772         Bug fix when output is empty.
1773         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1774         correction.
1775       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1776
1777 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1778       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1779       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1780         files. Added method to remove all files on the input
1781         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1782         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1783
1784 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1785       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1786         when using make instal.
1787       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1788         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1789
1790 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1791       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1792       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1793
1794 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1795       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1796         linux and WINDOWS !
1797       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1798       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1799
1800 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1801       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1802         addon of the jpeg library)
1803       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1804       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1805       * INSTALL now points to web documentation
1806
1807 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1808       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1809         gdcmUtil.h anymore.
1810       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1811         clean target.
1812       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1813         - to allow compilation with gcc 3.x
1814           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1815           -- small fixes on exceptions.
1816           Note: linking not tested !
1817         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1818           building stage.
1819       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1820         dependent convertion).
1821
1822 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1823       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1824         Changelog):
1825         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1826         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1827           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1828         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1829
1830 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1831       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1832         compile
1833       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1834         (FileName -> Filename)
1835
1836 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1837       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1838         - UpdateProgress method should now be effective
1839         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1840           to volumes),
1841         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1842           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1843           accelerating things).
1844         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1845           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1846           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1847           in the stack (for the caller to notice the problem).
1848
1849 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1850       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1851
1852 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1853       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1854         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1855         under Windows... thanks Windows !)
1856
1857 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1858       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1859         debug stage).
1860       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1861
1862 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1863       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1864
1865 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1866       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1867         called with different flags than the default ones (with automake).
1868         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1869            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1870         and went for warning fixes:
1871         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1872           up from unused variables.
1873         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1874       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1875
1876 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1877       * gdcmPython/gdcm.i:
1878         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1879           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1880           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1881         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1882           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1883           exported to Python a as cvar.
1884       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1885         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1886         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1887         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1888         C++ static methods).
1889       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1890         with the above changes.
1891
1892 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1893       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1894
1895 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1896       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1897         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1898         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1899          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1900          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1901            a wrapper
1902          - Wrapper interface which wrap sources
1903         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1904         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1905       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1906         files for compilation
1907
1908 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1909       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1910         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1911         - vtk/Makefile.am now builds a library
1912         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1913           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1914           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1915           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1916           import library.
1917         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1918           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1919           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1920           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1921           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1922         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1923           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1924         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1925           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1926       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1927       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1928         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1929         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1930         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1931         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1932         collision of various stl members (principally cout...).
1933       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1934         file.
1935       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1936         comply with above changes)
1937
1938 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1939       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1940       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1941         vtk data structure (an image Flip was required).
1942       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1943       * cosmetic changes in documentation.
1944
1945 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1946       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1947         unexisting file is given as argument.
1948       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1949         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1950         containing those images is now available at
1951           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1952         with the name gdcmData.
1953         All the python scripts (including the package initialisation file
1954         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1955         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1956
1957 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1958       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1959         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1960         demo of the usage of this class.
1961         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1962         at configure (or autogen.sh) stage.
1963
1964 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1965       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1966         Notes on valgrind:
1967           - maximum info is obtained with a command of the form:
1968             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1969                      --show-reachable=yes PrintHeader
1970           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1971             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1972             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1973             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1974              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1975       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1976         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1977         Note: some images don't seem to work e.g.
1978             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1979       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1980         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1981         make gdcm more thread friendly.
1982
1983 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1984       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1985           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1986         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1987           gdcmHeader::_dicom_vr.
1988         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1989         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1990           VRHT*.
1991         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1992
1993 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1994       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1995         make install stage.
1996
1997 2003-04-9 JPR
1998       * UpdateGroupLength replaced by new one
1999
2000 2003-04-7 JPR
2001       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2002         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2003
2004 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2005       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2006       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2007       * src:
2008         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2009         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2010           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2011         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2012           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2013           carried the same semantics.
2014           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2015         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2016           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2017         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2018       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2019       * gdcmGetXSize added
2020       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2021       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2022
2023 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2024       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2025         (to avoid double call by end user).
2026       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2027         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2028
2029 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2030       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2031         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2032           the html.users end users oriented documentation and
2033           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2034           oriented documentation.
2035         - README changed accordingly
2036         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2037         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2038           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2039         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2040           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2041           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2042       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2043         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2044       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2045         ill-formed documentation sections.
2046       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2047
2048 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2049       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2050       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2051         un*ces with sh-utils test utility.
2052       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2053       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2054       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2055       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2056       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2057
2058 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2059       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2060       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2061
2062 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2063       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2064       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2065       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2066       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2067         compilation work.
2068       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2069       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2070
2071 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2072       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2073         hence the user doesn't need this explicit call.
2074         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2075           i.e. LoadElements() call removed.
2076       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2077         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2078       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2079         for adding user defined new tags.
2080         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2081         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2082           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2083
2084 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2085       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2086         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2087         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2088         with the autotools, included the python wrappers part.
2089       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2090
2091 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2092       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2093
2094 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2095       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2096         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2097         for usage).
2098       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2099         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2100         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2101       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2102         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2103
2104 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2105       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2106         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2107         value of GDCM_DICT_PATH.
2108       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2109
2110 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2111       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2112       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2113       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2114         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2115         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2116
2117 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2119         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2120         gdcmHeader.h
2121       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2122         (as opposed to gdcm.h)
2123       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2124       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2125         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2126       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2127
2128 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2129       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2130         bug.
2131
2132 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2133       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2134         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2135         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2136         of hidding away the python related distutils specific files
2137         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2138         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2139         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2140         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2141
2142 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2143       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2144       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2145         among the list of sources.
2146
2147 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2148       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2149       * modifications in MSVC projects
2150
2151 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2152       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2153         looks like we can move back to original usage of exception within
2154         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2155         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2156       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2157         README file for usage added.
2158       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2159         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2160         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2161         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2162       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2163       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2164         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2165           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2166           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2167           instance of class gdcmHeader.
2168         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2169           require no instances at all to be invocated.
2170         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2171           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2172           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2173       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2174         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2175       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2176         the above to be effective.
2177       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2178         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2179       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2180         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2181         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2182         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2183         (for python dectection).
2184       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2185         now avoids publishing the empty entries.
2186
2187 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2188       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2189         ExtraPath reused :-P
2190       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2191
2192 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2193       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2194       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2195       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2196         and links
2197
2198 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2199       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2200         method. Doxygenation.
2201       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2202
2203 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2204       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2205         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2206         when using "python setup.py install".
2207       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2208         reexports the working classes.
2209       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2210         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2211         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2212         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2213         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2214         subdir (see the README file). This problem probably due to
2215         an combination of g++ and dynamic loading.
2216       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2217
2218 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2219       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2220         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2221         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2222         again in a python subdir, but the package itself is now in
2223         python/gdcmPython.
2224       * setup.py was cleaned up:
2225         - pythonIncludePath removed
2226         - python setup.py bdist target is now functional.
2227       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2228         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2229         accordingly.
2230
2231 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2232       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2233       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2234         distutils installer is operational.
2235       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2236           shadow classes (from gdcm.py).
2237         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2238           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2239         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2240
2241 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2242       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2243         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2244         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2245         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2246         dictionary.
2247         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2248           are now in the "???" group.
2249         - python/gdcm.i changed accordingly,
2250         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2251           of the above new functionalities in Python.
2252
2253 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2254       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2255         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2256           were definitively removed.
2257         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2258       * src/gdcmElValSet.cxx:
2259         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2260         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2261         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2262         - Added GetElementByName(string).
2263       * src/gdcmHeader.cxx: added
2264         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2265         - GetPubElValRepByName(string)
2266         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2267         - GetShaElValRepByName(string)
2268         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2269         - GetShaElValRepByName(string)
2270         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2271         - GetElValRepByName(string)
2272         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2273         - GetElValRepByName(string)
2274       * Doc/requirements.txt added.
2275
2276 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2277       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2278       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2279         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2280         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2281         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2282       * python/testSuite.py changed accordingly.
2283
2284 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2285       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2286         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2287              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2288               cannot be exported. [...]
2289               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2290               be exported. [...]
2291               This is caused by a designed limitation that once a template
2292               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2293               exported."
2294         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2295         limitation" of VC++ is a pitfall.
2296         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2297         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2298         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2299         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2300         library.
2301         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2302       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2303          dll under windows !!!!)
2304       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2305       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2306         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2307       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2308         (one) of image(s).
2309       * removed glib references
2310       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2311
2312 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2313       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2314         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2315         the files of the testsuite without using unittest.
2316       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2317       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2318       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2319         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2320
2321 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2322       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2323         values, but limits itself to values which are below a user specified
2324         size (by default 1024 bytes).
2325       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2326         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2327         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2328         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2329       * python/testSuite.py
2330         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2331         - two new examples added.
2332       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2333
2334 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2335       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2336         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2337       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2338       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2339       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2340
2341 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2342       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2343         the vr was also RET.
2344       * python/testSuite.py more tests added.
2345
2346 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2347       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2348       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2349       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2350         7.18 Integer types (see stdint.h)
2351         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2352       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2353         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2354         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2355         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2356         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2357         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2358         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2359         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2360
2361 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2362       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2363         VR files.
2364       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2365
2366 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2367       * Adaptation for porting to VC++:
2368         - src/gdcm.h
2369           o forced to use std namespace (for string to be known)
2370           o all class use __declspec export style on WIN32
2371         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2372           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2373       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2374         variable GDCM_DICT_PATH.
2375       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2376
2377 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2378       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2379         to native Python dictionary.
2380       * python/demo/test.py:
2381         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2382         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2383       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2384         PubElVals hashing table.
2385       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2386
2387 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2388       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2389         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2390       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2391       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2392       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2393         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2394       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2395
2396 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2397       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2398         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2399         that we can import de shadow classes without errors].
2400
2401 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2402       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2403       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2404       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2405       * src/Makefile prepared for python wrapping
2406
2407 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2408       * src/gdcmHeader.cxx :
2409         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2410           (see gdcmHeader::LoadElements).
2411         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2412           ReadInt16 and ReadInt32)
2413
2414 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2415       * src/gdcmHeader.cxx :
2416         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2417           method.
2418         - SetLgrElem renamed to SetLength
2419         - GetLgrElem renamed to GetLength
2420         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2421       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2422       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2423         due to IdoDude was cleaned out.
2424
2425 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2426       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2427         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2428         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2429         returning the unecessary skL (skipped length).
2430         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2431         it was redundant with the File position internals (by using
2432         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2433         jajun.
2434       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2435         on the libido specificities which are handled through class
2436         inheritance.
2437       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2438         added.
2439
2440 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2441       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2442         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2443
2444 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2445       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2446
2447 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2448       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2449         and _IdDcmSWAP_LONG.
2450
2451 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2452       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2453         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2454