]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
3   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
4     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
5   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
6   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
7   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
8   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
9     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
10     from File:: to PixelConvert::.
11
12 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
13   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
14     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
15      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
16      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
17
18 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
19   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
20   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
21   like this:
22     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
23   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
24   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
25   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
26
27 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
28   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
29     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
30     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
31     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
32     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
33       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
34       (for the time being this is better than having them attach to
35        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
36     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
37       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
38     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
39       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
40       gdcmPixelConvert::
41
42 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
43   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
44   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
45     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
46       clean up of RLE related code. 
47   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
48     - src/gdcmRLE.cxx removed
49     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
50     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
51     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
52   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
53     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
54       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
55       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
56
57 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
58   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
59     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
60       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
61       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
62       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
63       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
64       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
65       offsets.
66   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
67     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
68         with the retired Parse7Fe0().
69     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
70     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
71
72 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
73   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
74     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
75     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
76     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
77   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
78     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
79       to return an unused length.
80
81 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
82   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
83     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
84     to use to do simple stuff.
85
86 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
87   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
88     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
89     copying of the file within different directory, configure header file to
90     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
91     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
92
93 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
94   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
95      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
96        with it's binary name).
97      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
98        the Website to be more complete.
99      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
100        doxygenated documentation.
101      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
102        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
103                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
104   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
105   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
106    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
107
108 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
109   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
110    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
111
112 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
113   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
114     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
115     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
116     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
117     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
118   * GDCMHOME clean up:
119     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
120       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
121       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
122   * Autotools clean up:
123     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
124     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
125
126 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
127   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
128   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
129   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
130
131 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
132   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
133     describing TODO entries and used it for new entries.
134   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
135     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
136     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
137   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
138     documentation itself, but the website) moved to html and
139     placed in directory Doc/Website:
140     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
141     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
142     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
143   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
144   * CMakeLists.txt changed accordingly.
145   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
146     DeveloppersPython.html
147   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
148
149 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
150   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
151     of gdcm Web site.
152
153 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
154   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
155     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
156          we can now delete[] it safely  
157   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
158     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
159   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
160
161 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
162   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
163     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
164     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
165     pointed content.
166
167 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
168   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
169   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
170
171 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
172   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
173     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
174     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
175     an example of usage.
176     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
177       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
178     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
179       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
180     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
181     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
182     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
183
184 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
185   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
186     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
187     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
188     in class 
189     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
190       and associated accessors. Doxygenation of the class.
191     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
192       accessors added.
193     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
194       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
195     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
196     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
197
198 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
199   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
200     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
201       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
202            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
203            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
204            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
205            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
206            the same group and element all share the same (group, element)
207            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
208            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
209            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
210            consider the following definition of a TagKey:
211            - let Group, Element be the string representation of the
212              group and element dicom tag members,
213            - let ItemNumber be the string representation of the integer
214              index of the considered item number of a sequence,
215            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
216            the form:
217               /ItemNumber#Group|Element
218            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
219            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
220               Group|Element<SeqTag>
221            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
222            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
223            string e.g.
224                0028|1201
225            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
226            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
227            string e.g.
228                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
229     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
230       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
231       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
232     - src/gdcmDocEntry.cxx:
233       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
234          Key member.
235       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
236     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
237     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
238       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
239       -- now has a new BaseTagKey member.
240       -- STYLE.
241   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
242     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
243     truly belongs.
244     This poses the problem with the semantics of the following lines
245        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
246        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
247        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
248     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
249     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
250     order to get things working the dicom dictionary was altered !
251     Please fix things urgently...
252   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
253     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
254     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
255     set to OW:
256       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
257       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
258       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
259   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
260     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
261   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
262
263 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
264   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
265
266 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
267   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
268     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
269   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
270   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
271
272 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
273   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
274     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
275   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
276     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
277   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
278     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
279   * TODO updated
280   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
281     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
282   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
283   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
284     exception_on_error parameter.
285     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
286     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
287     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
288
289 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
290   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
291   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
292     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
293   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
294   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
295   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
296     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
297   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
298
299 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
300   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
301     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
302
303 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
304   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
305        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
306                  
307 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
308   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
309         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
310
311 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
312    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
313    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
314      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
315      is now in static in the gdcmDebug class
316    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
317    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
318
319 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
320    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
321      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
322    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
323      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
324      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
325      that displays position and size).
326    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
327      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
328      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
329      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
330      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
331      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
332      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
333         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
334      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
335      commiting changes).
336    * Test/CMakeLists.txt:
337       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
338       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
339         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
340         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
341    * TODO updated.
342
343 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
344    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
345      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
346      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
347      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
348      - removal of typedef duplication.
349      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
350      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
351    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
352       - printf polluting ctest removed.
353       - TAB removal for comminting
354    * Test:
355      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
356        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
357        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
358        this test creates them.
359        Note: we need to validate each reference image, but before that
360              I'd like to rename them with a more explicit name...
361      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
362    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
363      including each header needed).
364
365 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
366    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
367      test suite to the Example directory. Are concerned:
368      - PrintHeader.cxx
369      - TestDcm2Acr.cxx
370      - TestFindTags.cxx
371      - TestWrite.cxx was
372      - TestWriteSimple.cxx
373    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
374      image gdcmData/oldACR00001.ima
375
376 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
377    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
378      with removal from gdcmData):
379       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
380       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
381       - US.3405.1.dcm
382      Added the following because after last cvs update, they cause
383        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
384      to segfault:
385       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
386       - oldACR00001.ima
387    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
388      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
389      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
390      form of test...
391    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
392      we don't need to black list the following images anymore:
393       - 8BitsUncompressedColor.dcm
394       - OT-PAL-8-face.dcm
395       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
396    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
397      fixes and the beautified code ;-)
398      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
399      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
400      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
401            improve the test suite). The bug could be detected by using
402            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
403            or by using
404            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
405            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
406
407 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
408    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
409          - replace by uggly but working old code :-(
410                 A lot of things should be OK again.
411         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
412         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
413         (twice, withing a fortnigh ...)         
414
415 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
416    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
417      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
418    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
419      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
420      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
421                    - OT-PAL-8-face.dcm
422                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
423    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
424      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
425      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
426      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
427      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
428      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
429      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
430      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
431      image.
432    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
433      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
434      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
435      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
436    
437 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
438   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
439   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
440                           (instead of infinite loop)
441   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
442
443 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
444    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
445
446 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
447    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
448                     when SamplesPerPixel =3
449          - now Write is no longer confused by 
450                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
451          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
452                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
453    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
454                     (in order to split the job that has not to be done 
455                                         for gdcmDicomDir)
456
457 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
458    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
459      loop on the same image until memory went out. 
460      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
461    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
462      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
463
464 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
465    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
466             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
467                                 is added a the end, when necessary.
468             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
469                       now written correctly
470                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
471                                 (even for odd groups) 
472         Note : only Explicit Value Representation was checked.
473                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
474
475 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
476    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
477    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
478      coding style).
479
480 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
481    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
482      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
483    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
484
485 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
486    FIX : gdcmDocument.cxx
487       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
488         code 'beautyfication' :-(
489       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
490
491 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
492    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
493                  : to allow user to create his own Sequences
494         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
495
496 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
497         
498         - gdcmBinEntry
499           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
500           
501    - gdcmDocEntry
502           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
503           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
504           
505         - gdcmDocEntrySet
506           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
507           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
508      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
509      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
510      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
511      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
512                                             guint16 element,
513                                             std::string vr     = "unkn",
514                                             std::string fourth = "unkn",
515                                             std::string name   = "unkn"); 
516           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
517      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
518      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
519      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
520      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
521      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
522           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
523      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
524           
525         - gdcmDocument
526      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
527      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
528      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
529      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
530      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
531                                         FILE *_fp, FileType type);
532      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
533      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
534      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
535      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
536      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
537      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
538      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
539      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
540                                             guint16 element,
541                                             std::string vr     = "unkn",
542                                             std::string fourth = "unkn",
543                                             std::string name   = "unkn");
544      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
545      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
546      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
547      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
548                                                                                                                  
549         - gdcmElementSet
550           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
551           
552    - gdcmSeqEntry
553           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
554  
555    - gdcmSQItem
556      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
557      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
558      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
559      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
560
561    - gdcmValEntry
562          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
563                                   
564 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
565     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
566       The default constructor invoked by the line
567          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
568       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
569       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
570       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
571     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
572       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
573       Could anyone explain why ?
574     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
575       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
576       code related to gdcmBinEntry).
577
578 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
579     * In order to fix memory leaks:
580      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
581        some delete calls.
582      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
583      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
584        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
585        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
586        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
587      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
588      - src/gdcmDocument.cxx:
589        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
590           from dynamic stores.
591        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
592           was causing memory leaks.
593      - src/gdcmSQItem.cxx:
594        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
595           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
596        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
597           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
598           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
599           This avoids SegFaulting.
600      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
601     * Conclusion:
602      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
603        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
604        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
605      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
606        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
607      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
608        segfaults).
609     * Erroneous leading white fix:
610      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
611        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
612      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
613      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
614     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
615     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
616
617
618 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
619     * In order to fix writing of dicom files:
620      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
621      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
622      - src/gdcmDocument.cxx:
623        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
624        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
625        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
626           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
627           manner.
628        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
629           to only declared) and build on top of
630           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
631        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
632      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
633        for usage in destructor and treatement of promotion in
634        ::ReplaceOrCreateByNumber().
635      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
636       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
637     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
638       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
639       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
640       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
641
642 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
643     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
644       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
645       learned that:
646           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
647           soon as possible by globally disabling memory caching.
648           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
649           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
650       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
651       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
652       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
653     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
654       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
655       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
656       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
657         with 1.
658       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
659       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
660       understand why the list is empty...).
661     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
662     * Doc/License.txt added.
663
664 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
665     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
666       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
667         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
668         the padding problem.
669       - general clean up, simplification, and coding style.
670       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
671     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
672
673 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
674    *  gdcmSeqEntry.cxx
675            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
676                 - fix the display of SQItem ordinal number
677       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
678                 - remove some useless never written private methods     
679                 
680 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
681    * gdcmBinEntry.cxx 
682       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
683            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
684               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
685                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
686    * dcmDocument.cxx
687       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
688               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
689            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
690       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
691    * gdcmFile.cxx
692       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
693    * gdcmSQItem.h
694       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
695             a (relative) Item identier inside a given Sequence
696             \warning : some pb remaining around this number
697                                 will be solved asap
698       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
699    * gdcmValEntry.cxx 
700       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
701
702 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
703     * Memory leak hunt with the following command:
704       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
705                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
706       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
707       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
708       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
709           grep "MEMORY LEAK" src/*
710       Here are two typical examples which I can't help fixing:
711       -----
712           #include <string>
713           int main() {
714              std::string name;
715              char * test = "babo";
716              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
717                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
718              name.clear();   //// Doesn't help !
719              return 0;
720           }
721       -----
722           #include <string>
723           #include <iostream>
724           int main() {
725              std::string line;
726              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
727              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
728                                         //// of 1320 bytes in call to
729                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
730             return 0;
731           }
732       -----
733
734
735 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
736     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
737       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
738         and related, moved away to gdcmDocument.
739       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
740         the corresponding protected accessors of inherited class
741         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
742         declared friend of class gdcmDocument (see below).
743       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
744       - Clean up of undefined or unused methods.
745     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
746       account the changes to gdcmHeader.h).
747     * src/gdcmDocument.h:
748       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
749         changes to gdcmHeader.h).
750       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
751         (see changes to gdcmHeader.h).
752       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
753       - Clean up of undefined or unused methods.
754     * src/gdcmDocument.cxx:
755       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
756       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
757       - some std::string properly set to VRKey
758     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
759       references to gdcmDocument. 
760     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
761     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
762       cvs repository gdcmData.
763
764 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
765     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
766     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
767       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
768     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
769     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
770       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
771     * src/gdcmDocument.cxx: 
772       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
773         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
774       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
775         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
776         removed. Reverting to previous code segment with the proper
777         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
778         Note: this was (partially) breaking the python test suite
779               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
780               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
781     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
782     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
783       now taken into account.
784     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
785       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
786     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
787       on posix.
788     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
789       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
790     * .... alas, the python testSuite is still broken.
791
792 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
793     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
794       gdcmGlob
795     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
796     * src/gdcmUtil.h : export methods
797
798 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
799     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
800       to right behavior
801     * Initial addition of automatic python testing
802     * Initial addition of automatic image comparison
803
804 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
805     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
806       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
807
808 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
809      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
810      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
811      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
812
813 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
814      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
815        new concepts (and new classes) :
816        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
817         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
818         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
819        a Sequence is composed of Items.
820        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
821        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
822        (never taken into account)
823        Our unability to add a new 'entry' in the header
824        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
825        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
826        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
827        nothing is finished.
828        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
829
830 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
831      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
832      
833 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
834      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
835        file prefix (SetFilePrefix)
836
837 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
838      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
839        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
840        baseline.
841      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
842        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
843
844 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
845      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
846        dicom image
847
848 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
849      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
850      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
851        between the developper and user version.
852      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
853      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
854
855 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
856      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
857        when using cmake.
858
859 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
860      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
861                src directory, now generated in the build dir.
862             2. Tests as mentionned smarter
863             3. Some clean up
864             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
865           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
866           where we could set the institution name / patient name...
867
868        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
869               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
870                  (this was not true before)
871
872 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
873      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
874            SeQuence indented printing of Dicom Header.
875      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
876            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
877            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
878      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
879            tree-like structure of a Dicom Header.
880      * FIX Test code cleaning     
881            
882 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
883      * ENH: Adding automatic testing
884        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
885        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
886        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
887        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
888           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
889           too many projects
890      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
891      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
892        one file instead of seven + some small cleanup
893
894 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
895      * ENH Minor changes to the Print() methods.
896      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
897            Header printing. Example given with :
898            > PrintHeader fileName  2 new
899           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
900            
901 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
902      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
903          1. I have added some unsigned where needed
904          2. Some function parameter not used -> (void)
905          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
906          4. g++ don't like character '\' in comment
907          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
908                     this really need to be fixed
909          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
910          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
911                     this also really need to be fixed
912          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
913                     remove compression file 
914                     (as we only do decompression, right ?)     
915      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
916
917 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
918      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
919            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
920            defaulted to yspacing
921            
922 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
923      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
924      * ENH add parameters :
925                bool  exception_on_error = false, 
926                bool  enable_sequences   = false,
927                bool  ignore_shadow      = false
928            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
929      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
930            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
931               
932 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
933      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
934      
935 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
936      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
937      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
938              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
939              
940 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
941      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
942          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
943
944 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
945      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
946        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
947        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
948        in gdcmHeader.
949      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
950        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
951        already does the job.
952      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
953        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
954
955 2004-03-30 Benoit Regrain
956      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
957        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
958        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
959
960 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
961      * ENH : Check on file type to be written moved
962              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
963      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
964              when end-of-list is reached
965            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
966
967 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
968      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
969      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
970      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
971        equivalent to ExplicitVR in existing code).
972
973 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
974      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
975        now contains all the gdcmGlobal related code.
976      * minor coding style and doxygenation changes.
977
978 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
979      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
980        now contains all the Debug related code.
981      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
982      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
983        CreateCleanString) removed.
984      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
985      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
986      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
987      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
988        src/gdcmDirList.cxx)
989
990 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
991      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
992
993 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
994      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
995            big endian made volumes
996      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
997            end user to instanciate class gdcmParser
998           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
999
1000 2004-03-22 Benoit Regrain
1001      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1002      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1003              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1004
1005 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1006      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1007            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1008            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1009            or build from the files held (recursively) in a Directory
1010            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1011            gdcmObject::SetBoundaries() added
1012
1013 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1014      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1015                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1016      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1017            DICOMDIR
1018      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1019            about the name
1020
1021 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1022      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1023                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1024
1025 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1026      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1027            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1028            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1029            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1030            to allow making gdcDicomDir object.
1031      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1032           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1033
1034 2004-02-11 Benoit Regrain
1035      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1036              when using from python
1037
1038 2004-02-10 Benoit Regrain
1039      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1040      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1041      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1042              directory parsing
1043
1044 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1045      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1046              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1047              - class gdcmMeta created
1048      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1049              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1050      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1051
1052 2004-02-05 Benoit Regrain
1053      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1054              header entries
1055      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1056      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1057
1058 2004-02-04 Benoit Regrain
1059      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1060      * FIX : sort the images in the dicom dir
1061      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1062      * ADD : a python demo
1063
1064 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1065      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1066      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1067              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1068              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1069              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1070      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1071            to make full checking easier
1072         
1073 2004-02-04 Benoit Regrain
1074      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1075      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1076
1077 2004-02-03 Benoit Regrain
1078      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1079      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1080      * Bug fix and print add-on
1081
1082 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1083      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1084      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1085      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1086      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1087            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1088         
1089 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1090      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1091              iterator on last
1092              of the last synonym :-(
1093      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1094              for DICOMDIR ;-)
1095      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1096      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1097      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1098            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1099       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1100
1101 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1102      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1103            no longer writes 'Un' on disk
1104      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1105      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1106            the length (for Palette expanded images)
1107            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1108      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1109            (that broke Write). Replaced by UL.
1110            Aware user will reload the field if he 
1111            thinks it's necesssary
1112              
1113 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1114      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1115        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1116        IsReadable() methods.
1117        
1118      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1119       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1120       but so usefull for people that miss them ;-)
1121       
1122      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1123        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1124
1125 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1126      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1127
1128 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1129      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1130              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1131         The TRUE value for this param has to be used 
1132         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1133         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1134      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1135              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1136         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1137         
1138      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1139              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1140              Fixed
1141
1142      * gdcmHeader add the method
1143              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1144         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1145         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1146         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1147
1148 2004-01-26 Benoit Regrain
1149      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1150        in the print and add a third level of print to print them
1151
1152 2004-01-23 Benoit Regrain
1153      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1154      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1155      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1156        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1157
1158 2004-01-22 Benoit Regrain
1159      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1160      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1161
1162 2004-01-19 Benoit Regrain
1163      * Add the use of shadow dictionaries
1164      * bug fix and coding style
1165
1166 2004-01-19 Benoit Regrain
1167      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1168      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1169      * Add the update of header entries using the shadow library
1170
1171 2004-01-19 Benoit Regrain
1172      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1173      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1174        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1175        of dicom dir parsing
1176      * bug fix under python
1177
1178 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1179     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1180     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1181     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1182     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1183
1184 2004-01-15 Benoit Regrain
1185      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1186        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1187        when the gdcmDictSet will be destroyed
1188      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1189        gdcmDictSet
1190
1191 2004-01-15 Benoit Regrain
1192      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1193        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1194        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1195        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1196      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1197
1198 2004-01-14 Benoit Regrain
1199      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1200      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1201      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1202      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1203
1204 2004-01-13 Benoit Regrain
1205      * src/*.[h|cxx] : coding style
1206      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1207
1208 2004-01-13 Benoit Regrain
1209      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1210      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1211        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1212      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1213
1214 2004-01-12 Benoit Regrain
1215      * src/*.h : add comments
1216      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1217      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1218        directly setted in the source code
1219      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1220        gdcmTS and gdcmVR
1221
1222 2004-01-09 Benoit Regrain
1223      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1224      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1225
1226 2004-01-07 Benoit Regrain
1227      * Modification to compile with the distutils.
1228      * Bug fix in code
1229
1230 2003-12-10 Benoit Regrain
1231      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1232        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1233      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1234        made in the source code
1235
1236 2003-12-10 Benoit Regrain
1237      * Update Windows projects and .cvsignore files
1238
1239 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1240      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1241            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1242            if he wants to.
1243            gdcmElValSet:Print takes it into account
1244
1245 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1246      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1247      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1248      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1249
1250 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1251       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1252              on the ListTag listElem member,
1253              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1254       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1255              with the tagHt member and the listElem member.
1256              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1257
1258       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1259              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1260                             if bug fixing is necessary), for internal
1261                             use only
1262              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1263                             or to allow Parser going on.
1264              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1265              with a length (not 0000) is found
1266       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1267                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1268                 (to be written)
1269
1270 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1271      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1272      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1273           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1274      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1275
1276 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1277      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1278
1279 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1280      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1281           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1282
1283 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1284      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1285      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1286              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1287              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1288
1289 2003-11-05 Benoit Regrain
1290      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1291                        : Explicit error messages
1292      * in __init__.py  : Related modif
1293
1294 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1295      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1296            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1297            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1298      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1299                     (vtkGdcmReader compliant)           
1300       
1301 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1302      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1303        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1304        
1305 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1306      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1307            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1308
1309 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1310      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1311                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1312              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1313              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1314              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1315              such an image :
1316              After gdcmHeader :
1317               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1318               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1319               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1320      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1321              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1322
1323 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1324      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1325              
1326 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1327      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1328            being coherents dicom files.
1329      
1330 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1331      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1332            from medcon lib !
1333      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1334      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1335      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1336      * ENH: Add include dir to medcon lib
1337      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1338            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1339             
1340 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1341       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1342         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1343           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1344       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1345
1346 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1347       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1348         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1349         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1350       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1351       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1352
1353 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1354       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1355                                                
1356 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1357       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1358       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1359       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1360       
1361 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1362       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1363       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1364       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1365       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1366       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1367       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1368              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1369         But it fasten debug compilation time.
1370             
1371 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1372       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1373         (they are compressed as 2 planes images, 
1374          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1375
1376 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1377       * Now CheckRead takes into account :
1378          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1379          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1380       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1381        (breaks DicomWorks)
1382
1383 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1384       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1385              one should remove the '\'
1386         
1387 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1388       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1389         (wrong lengths in header)
1390         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1391       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1392         (breaks DicomWorks)
1393
1394 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1395       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1396         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1397
1398 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1399       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1400       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1401
1402 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1403       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1404      
1405 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1406       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1407         (the patch is easy to remove)
1408       * cosmetic changes to avoid warnings
1409       
1410 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1411       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1412         no need to press 'r' now.
1413    
1414 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1415       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1416         to new Jpeg Lossless decompressor
1417       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1418       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1419       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1420                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1421 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1422       * general anonymisation in gdcmData
1423       * adding the 'color files' from
1424         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1425       * adding some well knowed bugged-header images
1426       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1427         waiting for their inclusion in Python testsuite
1428
1429 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1430     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1431       no longer seg faults when file is not found
1432
1433 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1434      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1435        MultiFrame images
1436
1437 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1438      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1439
1440 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1441      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1442         OpenFile takes it into account
1443      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1444      * Missing elements added in dicomV3.dic
1445       (just to be affraid : have a look at
1446        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1447        and do it again next year ;->
1448
1449 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1450      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1451        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1452        But there are NOT. It's fixed !
1453        
1454 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1455      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1456      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1457          
1458 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1459      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1460              an ACR-NEMA / DICOM one.
1461      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1462              is not gdcm Readable
1463      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1464              is now decoded.
1465         
1466 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1467      * FIX: CMake generate now documentation
1468      * ENH: out of source doc build !
1469      * ENH: Generate both user and dev documentation
1470      * ENH: Should work on windows too
1471      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1472      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1473      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1474      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1475                      
1476 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1477      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1478      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1479      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1480         window level & window width
1481
1482 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1483      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1484      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1485      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1486      
1487 2003-10-06  Emanuel Ollart
1488      * FIX : compilation process wad broken.
1489              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1490         
1491 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1492      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1493      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1494      
1495 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1496      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1497            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1498                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1499       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1500
1501 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1502       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1503         to remain compliant with already defined strings, 
1504         like Transfert Syntax UID and others)
1505
1506 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1507       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1508              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1509         
1510 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1511       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1512       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1513
1514 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1515       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1516         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1517               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1518       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1519
1520 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1521       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1522
1523 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1524       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1525         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1526
1527 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1528       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1529          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1530          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1531          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1532           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1533                                             YBR_RCT files.
1534           (no sample found :-(
1535
1536 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1537       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1538         Two reasons: - clear things
1539                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1540                        suffer anymore VC++ complains
1541
1542 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1543       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1544       * removed leaks
1545
1546 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1547       * The lines are now eigthy characters long.for 
1548         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1549
1550 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1551       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1552         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1553         previous commis of Malaterre)
1554       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1555         before the last Malaterre's commit.
1556
1557 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1558       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1559         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1560       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1561         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1562
1563 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1564       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1565         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1566         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1567
1568 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1569       * Cosmetic changes:
1570         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1571           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1572           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1573           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1574         - PACKAGER corrected
1575         - DEVELOPPER added.
1576         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1577       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1578
1579 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1580       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1581
1582 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1583       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1584
1585 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1586       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1587
1588 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1589       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1590
1591 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1592       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1593         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1594         heuristics to get informations (look at different places).
1595       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1596         sorting DICOM images based on different strategies.
1597       * modified Makefiles accordingly.
1598
1599 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1600       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1601         when building in debug mode
1602       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1603         src/win32/gdcmdll.dsp
1604       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1605
1606 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1607       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1608             to valgrind.
1609
1610 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1611       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1612       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1613                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1614       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1615
1616 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1617       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1618         the file
1619       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1620       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1621         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1622       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1623         symbols... future problem ?
1624
1625 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1626       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1627       * modified gdcm.dsw accordingly
1628
1629 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1630       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1631
1632 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1633       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1634         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1635       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1636         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1637         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1638
1639 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1640       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1641
1642 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1643       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1644       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1645       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1646       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1647       * PACKAGER : adding all concerning windows
1648
1649 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1650       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1651         garbage debug code.
1652       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1653       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1654         test suite reported error.
1655       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1656         packaging a new release).
1657       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1658       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1659       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1660         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1661         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1662
1663 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1664       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1665       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1666
1667 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1669         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1670         is made in an internal list to prevent this problem.
1671         Bug fix when output is empty.
1672         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1673         correction.
1674       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1675
1676 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1677       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1678       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1679         files. Added method to remove all files on the input
1680         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1681         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1682
1683 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1684       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1685         when using make instal.
1686       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1687         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1688
1689 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1691       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1692
1693 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1694       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1695         linux and WINDOWS !
1696       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1697       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1698
1699 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1700       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1701         addon of the jpeg library)
1702       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1703       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1704       * INSTALL now points to web documentation
1705
1706 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1707       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1708         gdcmUtil.h anymore.
1709       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1710         clean target.
1711       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1712         - to allow compilation with gcc 3.x
1713           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1714           -- small fixes on exceptions.
1715           Note: linking not tested !
1716         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1717           building stage.
1718       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1719         dependent convertion).
1720
1721 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1722       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1723         Changelog):
1724         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1725         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1726           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1727         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1728
1729 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1730       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1731         compile
1732       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1733         (FileName -> Filename)
1734
1735 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1736       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1737         - UpdateProgress method should now be effective
1738         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1739           to volumes),
1740         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1741           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1742           accelerating things).
1743         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1744           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1745           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1746           in the stack (for the caller to notice the problem).
1747
1748 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1749       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1750
1751 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1752       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1753         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1754         under Windows... thanks Windows !)
1755
1756 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1757       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1758         debug stage).
1759       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1760
1761 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1762       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1763
1764 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1766         called with different flags than the default ones (with automake).
1767         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1768            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1769         and went for warning fixes:
1770         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1771           up from unused variables.
1772         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1773       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1774
1775 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1776       * gdcmPython/gdcm.i:
1777         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1778           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1779           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1780         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1781           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1782           exported to Python a as cvar.
1783       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1784         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1785         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1786         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1787         C++ static methods).
1788       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1789         with the above changes.
1790
1791 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1792       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1793
1794 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1795       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1796         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1797         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1798          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1799          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1800            a wrapper
1801          - Wrapper interface which wrap sources
1802         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1803         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1804       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1805         files for compilation
1806
1807 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1808       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1809         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1810         - vtk/Makefile.am now builds a library
1811         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1812           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1813           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1814           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1815           import library.
1816         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1817           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1818           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1819           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1820           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1821         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1822           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1823         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1824           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1825       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1826       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1827         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1828         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1829         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1830         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1831         collision of various stl members (principally cout...).
1832       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1833         file.
1834       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1835         comply with above changes)
1836
1837 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1838       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1839       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1840         vtk data structure (an image Flip was required).
1841       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1842       * cosmetic changes in documentation.
1843
1844 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1845       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1846         unexisting file is given as argument.
1847       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1848         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1849         containing those images is now available at
1850           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1851         with the name gdcmData.
1852         All the python scripts (including the package initialisation file
1853         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1854         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1855
1856 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1857       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1858         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1859         demo of the usage of this class.
1860         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1861         at configure (or autogen.sh) stage.
1862
1863 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1864       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1865         Notes on valgrind:
1866           - maximum info is obtained with a command of the form:
1867             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1868                      --show-reachable=yes PrintHeader
1869           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1870             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1871             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1872             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1873              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1874       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1875         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1876         Note: some images don't seem to work e.g.
1877             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1878       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1879         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1880         make gdcm more thread friendly.
1881
1882 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1883       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1884           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1885         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1886           gdcmHeader::_dicom_vr.
1887         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1888         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1889           VRHT*.
1890         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1891
1892 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1893       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1894         make install stage.
1895
1896 2003-04-9 JPR
1897       * UpdateGroupLength replaced by new one
1898
1899 2003-04-7 JPR
1900       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1901         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1902
1903 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1904       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1905       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1906       * src:
1907         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1908         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1909           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1910         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1911           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1912           carried the same semantics.
1913           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1914         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1915           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1916         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1917       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1918       * gdcmGetXSize added
1919       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1920       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1921
1922 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1923       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1924         (to avoid double call by end user).
1925       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1926         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1927
1928 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1929       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1930         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1931           the html.users end users oriented documentation and
1932           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1933           oriented documentation.
1934         - README changed accordingly
1935         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1936         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1937           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1938         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1939           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1940           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1941       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1942         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1943       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1944         ill-formed documentation sections.
1945       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1946
1947 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1948       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1949       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1950         un*ces with sh-utils test utility.
1951       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1952       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1953       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1954       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1955       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1956
1957 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1958       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1959       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1960
1961 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1962       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1963       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1964       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1965       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1966         compilation work.
1967       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1968       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1969
1970 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1971       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1972         hence the user doesn't need this explicit call.
1973         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1974           i.e. LoadElements() call removed.
1975       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1976         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1977       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1978         for adding user defined new tags.
1979         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1980         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1981           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1982
1983 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1984       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1985         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1986         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1987         with the autotools, included the python wrappers part.
1988       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1989
1990 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1991       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1992
1993 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1994       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1995         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1996         for usage).
1997       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1998         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1999         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2000       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2001         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2002
2003 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2004       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2005         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2006         value of GDCM_DICT_PATH.
2007       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2008
2009 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2010       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2011       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2012       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2013         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2014         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2015
2016 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2017       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2018         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2019         gdcmHeader.h
2020       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2021         (as opposed to gdcm.h)
2022       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2023       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2024         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2025       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2026
2027 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2028       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2029         bug.
2030
2031 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2032       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2033         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2034         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2035         of hidding away the python related distutils specific files
2036         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2037         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2038         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2039         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2040
2041 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2042       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2043       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2044         among the list of sources.
2045
2046 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2047       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2048       * modifications in MSVC projects
2049
2050 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2051       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2052         looks like we can move back to original usage of exception within
2053         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2054         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2055       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2056         README file for usage added.
2057       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2058         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2059         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2060         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2061       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2062       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2063         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2064           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2065           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2066           instance of class gdcmHeader.
2067         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2068           require no instances at all to be invocated.
2069         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2070           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2071           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2072       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2073         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2074       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2075         the above to be effective.
2076       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2077         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2078       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2079         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2080         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2081         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2082         (for python dectection).
2083       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2084         now avoids publishing the empty entries.
2085
2086 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2087       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2088         ExtraPath reused :-P
2089       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2090
2091 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2092       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2093       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2094       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2095         and links
2096
2097 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2098       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2099         method. Doxygenation.
2100       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2101
2102 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2103       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2104         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2105         when using "python setup.py install".
2106       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2107         reexports the working classes.
2108       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2109         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2110         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2111         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2112         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2113         subdir (see the README file). This problem probably due to
2114         an combination of g++ and dynamic loading.
2115       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2116
2117 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2118       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2119         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2120         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2121         again in a python subdir, but the package itself is now in
2122         python/gdcmPython.
2123       * setup.py was cleaned up:
2124         - pythonIncludePath removed
2125         - python setup.py bdist target is now functional.
2126       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2127         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2128         accordingly.
2129
2130 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2131       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2132       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2133         distutils installer is operational.
2134       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2135           shadow classes (from gdcm.py).
2136         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2137           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2138         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2139
2140 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2141       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2142         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2143         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2144         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2145         dictionary.
2146         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2147           are now in the "???" group.
2148         - python/gdcm.i changed accordingly,
2149         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2150           of the above new functionalities in Python.
2151
2152 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2153       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2154         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2155           were definitively removed.
2156         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2157       * src/gdcmElValSet.cxx:
2158         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2159         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2160         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2161         - Added GetElementByName(string).
2162       * src/gdcmHeader.cxx: added
2163         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2164         - GetPubElValRepByName(string)
2165         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2166         - GetShaElValRepByName(string)
2167         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2168         - GetShaElValRepByName(string)
2169         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2170         - GetElValRepByName(string)
2171         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2172         - GetElValRepByName(string)
2173       * Doc/requirements.txt added.
2174
2175 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2176       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2177       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2178         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2179         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2180         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2181       * python/testSuite.py changed accordingly.
2182
2183 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2184       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2185         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2186              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2187               cannot be exported. [...]
2188               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2189               be exported. [...]
2190               This is caused by a designed limitation that once a template
2191               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2192               exported."
2193         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2194         limitation" of VC++ is a pitfall.
2195         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2196         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2197         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2198         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2199         library.
2200         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2201       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2202          dll under windows !!!!)
2203       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2204       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2205         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2206       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2207         (one) of image(s).
2208       * removed glib references
2209       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2210
2211 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2212       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2213         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2214         the files of the testsuite without using unittest.
2215       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2216       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2217       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2218         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2219
2220 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2221       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2222         values, but limits itself to values which are below a user specified
2223         size (by default 1024 bytes).
2224       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2225         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2226         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2227         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2228       * python/testSuite.py
2229         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2230         - two new examples added.
2231       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2232
2233 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2234       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2235         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2236       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2237       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2238       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2239
2240 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2241       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2242         the vr was also RET.
2243       * python/testSuite.py more tests added.
2244
2245 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2246       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2247       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2248       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2249         7.18 Integer types (see stdint.h)
2250         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2251       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2252         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2253         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2254         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2255         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2256         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2257         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2258         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2259
2260 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2261       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2262         VR files.
2263       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2264
2265 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2266       * Adaptation for porting to VC++:
2267         - src/gdcm.h
2268           o forced to use std namespace (for string to be known)
2269           o all class use __declspec export style on WIN32
2270         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2271           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2272       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2273         variable GDCM_DICT_PATH.
2274       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2275
2276 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2277       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2278         to native Python dictionary.
2279       * python/demo/test.py:
2280         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2281         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2282       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2283         PubElVals hashing table.
2284       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2285
2286 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2287       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2288         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2289       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2290       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2291       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2292         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2293       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2294
2295 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2296       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2297         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2298         that we can import de shadow classes without errors].
2299
2300 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2301       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2302       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2303       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2304       * src/Makefile prepared for python wrapping
2305
2306 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2307       * src/gdcmHeader.cxx :
2308         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2309           (see gdcmHeader::LoadElements).
2310         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2311           ReadInt16 and ReadInt32)
2312
2313 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2314       * src/gdcmHeader.cxx :
2315         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2316           method.
2317         - SetLgrElem renamed to SetLength
2318         - GetLgrElem renamed to GetLength
2319         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2320       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2321       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2322         due to IdoDude was cleaned out.
2323
2324 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2325       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2326         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2327         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2328         returning the unecessary skL (skipped length).
2329         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2330         it was redundant with the File position internals (by using
2331         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2332         jajun.
2333       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2334         on the libido specificities which are handled through class
2335         inheritance.
2336       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2337         added.
2338
2339 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2341         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2342
2343 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2344       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2345
2346 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2347       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2348         and _IdDcmSWAP_LONG.
2349
2350 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2351       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2352         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2353