]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
3   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
4     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
5   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
6   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
7
8 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
9   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
10     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
11
12 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
13   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
14        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
15                  
16 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
17   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
18         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
19
20 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
21    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
22    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
23      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
24      is now in static in the gdcmDebug class
25    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
26    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
27
28 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
29    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
30      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
31    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
32      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
33      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
34      that displays position and size).
35    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
36      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
37      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
38      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
39      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
40      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
41      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
42         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
43      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
44      commiting changes).
45    * Test/CMakeLists.txt:
46       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
47       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
48         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
49         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
50    * TODO updated.
51
52 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
53    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
54      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
55      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
56      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
57      - removal of typedef duplication.
58      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
59      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
60    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
61       - printf polluting ctest removed.
62       - TAB removal for comminting
63    * Test:
64      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
65        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
66        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
67        this test creates them.
68        Note: we need to validate each reference image, but before that
69              I'd like to rename them with a more explicit name...
70      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
71    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
72      including each header needed).
73
74 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
75    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
76      test suite to the Example directory. Are concerned:
77      - PrintHeader.cxx
78      - TestDcm2Acr.cxx
79      - TestFindTags.cxx
80      - TestWrite.cxx was
81      - TestWriteSimple.cxx
82    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
83      image gdcmData/oldACR00001.ima
84
85 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
86    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
87      with removal from gdcmData):
88       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
89       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
90       - US.3405.1.dcm
91      Added the following because after last cvs update, they cause
92        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
93      to segfault:
94       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
95       - oldACR00001.ima
96    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
97      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
98      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
99      form of test...
100    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
101      we don't need to black list the following images anymore:
102       - 8BitsUncompressedColor.dcm
103       - OT-PAL-8-face.dcm
104       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
105    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
106      fixes and the beautified code ;-)
107      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
108      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
109      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
110            improve the test suite). The bug could be detected by using
111            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
112            or by using
113            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
114            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
115
116 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
117    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
118          - replace by uggly but working old code :-(
119                 A lot of things should be OK again.
120         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
121         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
122         (twice, withing a fortnigh ...)         
123
124 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
125    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
126      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
127    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
128      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
129      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
130                    - OT-PAL-8-face.dcm
131                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
132    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
133      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
134      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
135      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
136      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
137      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
138      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
139      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
140      image.
141    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
142      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
143      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
144      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
145    
146 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
147   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
148   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
149                           (instead of infinite loop)
150   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
151
152 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
153    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
154
155 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
156    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
157                     when SamplesPerPixel =3
158          - now Write is no longer confused by 
159                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
160          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
161                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
162    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
163                     (in order to split the job that has not to be done 
164                                         for gdcmDicomDir)
165
166 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
167    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
168      loop on the same image until memory went out. 
169      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
170    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
171      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
172
173 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
174    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
175             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
176                                 is added a the end, when necessary.
177             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
178                       now written correctly
179                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
180                                 (even for odd groups) 
181         Note : only Explicit Value Representation was checked.
182                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
183
184 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
185    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
186    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
187      coding style).
188
189 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
190    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
191      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
192    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
193
194 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
195    FIX : gdcmDocument.cxx
196       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
197         code 'beautyfication' :-(
198       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
199
200 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
201    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
202                  : to allow user to create his own Sequences
203         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
204
205 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
206         
207         - gdcmBinEntry
208           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
209           
210    - gdcmDocEntry
211           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
212           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
213           
214         - gdcmDocEntrySet
215           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
216           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
217      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
218      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
219      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
220      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
221                                             guint16 element,
222                                             std::string vr     = "unkn",
223                                             std::string fourth = "unkn",
224                                             std::string name   = "unkn"); 
225           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
226      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
227      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
228      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
229      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
230      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
231           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
232      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
233           
234         - gdcmDocument
235      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
236      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
237      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
238      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
239      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
240                                         FILE *_fp, FileType type);
241      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
242      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
243      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
244      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
245      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
246      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
247      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
248      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
249                                             guint16 element,
250                                             std::string vr     = "unkn",
251                                             std::string fourth = "unkn",
252                                             std::string name   = "unkn");
253      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
254      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
255      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
256      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
257                                                                                                                  
258         - gdcmElementSet
259           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
260           
261    - gdcmSeqEntry
262           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
263  
264    - gdcmSQItem
265      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
266      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
267      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
268      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
269
270    - gdcmValEntry
271          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
272                                   
273 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
274     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
275       The default constructor invoked by the line
276          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
277       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
278       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
279       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
280     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
281       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
282       Could anyone explain why ?
283     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
284       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
285       code related to gdcmBinEntry).
286
287 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
288     * In order to fix memory leaks:
289      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
290        some delete calls.
291      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
292      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
293        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
294        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
295        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
296      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
297      - src/gdcmDocument.cxx:
298        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
299           from dynamic stores.
300        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
301           was causing memory leaks.
302      - src/gdcmSQItem.cxx:
303        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
304           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
305        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
306           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
307           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
308           This avoids SegFaulting.
309      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
310     * Conclusion:
311      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
312        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
313        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
314      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
315        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
316      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
317        segfaults).
318     * Erroneous leading white fix:
319      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
320        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
321      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
322      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
323     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
324     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
325
326
327 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
328     * In order to fix writing of dicom files:
329      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
330      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
331      - src/gdcmDocument.cxx:
332        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
333        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
334        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
335           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
336           manner.
337        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
338           to only declared) and build on top of
339           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
340        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
341      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
342        for usage in destructor and treatement of promotion in
343        ::ReplaceOrCreateByNumber().
344      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
345       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
346     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
347       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
348       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
349       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
350
351 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
352     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
353       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
354       learned that:
355           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
356           soon as possible by globally disabling memory caching.
357           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
358           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
359       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
360       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
361       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
362     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
363       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
364       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
365       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
366         with 1.
367       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
368       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
369       understand why the list is empty...).
370     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
371     * Doc/License.txt added.
372
373 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
374     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
375       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
376         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
377         the padding problem.
378       - general clean up, simplification, and coding style.
379       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
380     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
381
382 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
383    *  gdcmSeqEntry.cxx
384            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
385                 - fix the display of SQItem ordinal number
386       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
387                 - remove some useless never written private methods     
388                 
389 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
390    * gdcmBinEntry.cxx 
391       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
392            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
393               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
394                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
395    * dcmDocument.cxx
396       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
397               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
398            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
399       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
400    * gdcmFile.cxx
401       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
402    * gdcmSQItem.h
403       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
404             a (relative) Item identier inside a given Sequence
405             \warning : some pb remaining around this number
406                                 will be solved asap
407       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
408    * gdcmValEntry.cxx 
409       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
410
411 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
412     * Memory leak hunt with the following command:
413       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
414                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
415       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
416       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
417       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
418           grep "MEMORY LEAK" src/*
419       Here are two typical examples which I can't help fixing:
420       -----
421           #include <string>
422           int main() {
423              std::string name;
424              char * test = "babo";
425              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
426                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
427              name.clear();   //// Doesn't help !
428              return 0;
429           }
430       -----
431           #include <string>
432           #include <iostream>
433           int main() {
434              std::string line;
435              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
436              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
437                                         //// of 1320 bytes in call to
438                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
439             return 0;
440           }
441       -----
442
443
444 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
445     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
446       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
447         and related, moved away to gdcmDocument.
448       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
449         the corresponding protected accessors of inherited class
450         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
451         declared friend of class gdcmDocument (see below).
452       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
453       - Clean up of undefined or unused methods.
454     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
455       account the changes to gdcmHeader.h).
456     * src/gdcmDocument.h:
457       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
458         changes to gdcmHeader.h).
459       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
460         (see changes to gdcmHeader.h).
461       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
462       - Clean up of undefined or unused methods.
463     * src/gdcmDocument.cxx:
464       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
465       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
466       - some std::string properly set to VRKey
467     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
468       references to gdcmDocument. 
469     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
470     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
471       cvs repository gdcmData.
472
473 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
474     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
475     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
476       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
477     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
478     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
479       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
480     * src/gdcmDocument.cxx: 
481       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
482         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
483       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
484         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
485         removed. Reverting to previous code segment with the proper
486         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
487         Note: this was (partially) breaking the python test suite
488               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
489               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
490     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
491     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
492       now taken into account.
493     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
494       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
495     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
496       on posix.
497     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
498       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
499     * .... alas, the python testSuite is still broken.
500
501 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
502     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
503       gdcmGlob
504     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
505     * src/gdcmUtil.h : export methods
506
507 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
508     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
509       to right behavior
510     * Initial addition of automatic python testing
511     * Initial addition of automatic image comparison
512
513 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
514     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
515       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
516
517 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
518      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
519      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
520      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
521
522 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
523      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
524        new concepts (and new classes) :
525        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
526         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
527         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
528        a Sequence is composed of Items.
529        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
530        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
531        (never taken into account)
532        Our unability to add a new 'entry' in the header
533        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
534        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
535        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
536        nothing is finished.
537        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
538
539 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
540      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
541      
542 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
543      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
544        file prefix (SetFilePrefix)
545
546 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
547      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
548        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
549        baseline.
550      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
551        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
552
553 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
554      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
555        dicom image
556
557 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
558      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
559      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
560        between the developper and user version.
561      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
562      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
563
564 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
565      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
566        when using cmake.
567
568 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
569      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
570                src directory, now generated in the build dir.
571             2. Tests as mentionned smarter
572             3. Some clean up
573             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
574           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
575           where we could set the institution name / patient name...
576
577        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
578               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
579                  (this was not true before)
580
581 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
582      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
583            SeQuence indented printing of Dicom Header.
584      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
585            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
586            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
587      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
588            tree-like structure of a Dicom Header.
589      * FIX Test code cleaning     
590            
591 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
592      * ENH: Adding automatic testing
593        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
594        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
595        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
596        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
597           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
598           too many projects
599      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
600      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
601        one file instead of seven + some small cleanup
602
603 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
604      * ENH Minor changes to the Print() methods.
605      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
606            Header printing. Example given with :
607            > PrintHeader fileName  2 new
608           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
609            
610 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
611      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
612          1. I have added some unsigned where needed
613          2. Some function parameter not used -> (void)
614          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
615          4. g++ don't like character '\' in comment
616          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
617                     this really need to be fixed
618          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
619          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
620                     this also really need to be fixed
621          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
622                     remove compression file 
623                     (as we only do decompression, right ?)     
624      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
625
626 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
627      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
628            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
629            defaulted to yspacing
630            
631 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
632      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
633      * ENH add parameters :
634                bool  exception_on_error = false, 
635                bool  enable_sequences   = false,
636                bool  ignore_shadow      = false
637            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
638      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
639            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
640               
641 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
642      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
643      
644 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
645      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
646      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
647              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
648              
649 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
650      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
651          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
652
653 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
654      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
655        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
656        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
657        in gdcmHeader.
658      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
659        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
660        already does the job.
661      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
662        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
663
664 2004-03-30 Benoit Regrain
665      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
666        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
667        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
668
669 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
670      * ENH : Check on file type to be written moved
671              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
672      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
673              when end-of-list is reached
674            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
675
676 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
677      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
678      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
679      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
680        equivalent to ExplicitVR in existing code).
681
682 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
683      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
684        now contains all the gdcmGlobal related code.
685      * minor coding style and doxygenation changes.
686
687 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
688      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
689        now contains all the Debug related code.
690      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
691      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
692        CreateCleanString) removed.
693      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
694      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
695      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
696      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
697        src/gdcmDirList.cxx)
698
699 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
700      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
701
702 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
703      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
704            big endian made volumes
705      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
706            end user to instanciate class gdcmParser
707           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
708
709 2004-03-22 Benoit Regrain
710      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
711      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
712              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
713
714 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
715      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
716            an already existing DICOMDIR file is consistent with
717            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
718            or build from the files held (recursively) in a Directory
719            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
720            gdcmObject::SetBoundaries() added
721
722 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
723      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
724                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
725      * FIX now file names and directory name are written properly in the
726            DICOMDIR
727      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
728            about the name
729
730 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
731      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
732                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
733
734 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
735      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
736            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
737            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
738            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
739            to allow making gdcDicomDir object.
740      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
741           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
742
743 2004-02-11 Benoit Regrain
744      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
745              when using from python
746
747 2004-02-10 Benoit Regrain
748      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
749      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
750      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
751              directory parsing
752
753 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
754      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
755              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
756              - class gdcmMeta created
757      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
758              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
759      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
760
761 2004-02-05 Benoit Regrain
762      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
763              header entries
764      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
765      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
766
767 2004-02-04 Benoit Regrain
768      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
769      * FIX : sort the images in the dicom dir
770      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
771      * ADD : a python demo
772
773 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
774      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
775      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
776              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
777              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
778              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
779      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
780            to make full checking easier
781         
782 2004-02-04 Benoit Regrain
783      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
784      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
785
786 2004-02-03 Benoit Regrain
787      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
788      * gdcmDicomDir : add the load of directory
789      * Bug fix and print add-on
790
791 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
792      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
793      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
794      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
795      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
796            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
797         
798 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
799      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
800              iterator on last
801              of the last synonym :-(
802      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
803              for DICOMDIR ;-)
804      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
805      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
806      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
807            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
808       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
809
810 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
811      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
812            no longer writes 'Un' on disk
813      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
814      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
815            the length (for Palette expanded images)
816            and Raw Length (non expanded image + Palette)
817      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
818            (that broke Write). Replaced by UL.
819            Aware user will reload the field if he 
820            thinks it's necesssary
821              
822 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
823      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
824        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
825        IsReadable() methods.
826        
827      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
828       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
829       but so usefull for people that miss them ;-)
830       
831      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
832        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
833
834 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
835      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
836
837 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
838      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
839              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
840         The TRUE value for this param has to be used 
841         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
842         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
843      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
844              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
845         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
846         
847      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
848              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
849              Fixed
850
851      * gdcmHeader add the method
852              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
853         to get *all* the Header Entries with the same tag.
854         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
855         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
856
857 2004-01-26 Benoit Regrain
858      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
859        in the print and add a third level of print to print them
860
861 2004-01-23 Benoit Regrain
862      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
863      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
864      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
865        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
866
867 2004-01-22 Benoit Regrain
868      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
869      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
870
871 2004-01-19 Benoit Regrain
872      * Add the use of shadow dictionaries
873      * bug fix and coding style
874
875 2004-01-19 Benoit Regrain
876      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
877      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
878      * Add the update of header entries using the shadow library
879
880 2004-01-19 Benoit Regrain
881      * removal of file gdcmHeader2.cxx
882      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
883        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
884        of dicom dir parsing
885      * bug fix under python
886
887 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
888     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
889     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
890     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
891     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
892
893 2004-01-15 Benoit Regrain
894      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
895        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
896        when the gdcmDictSet will be destroyed
897      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
898        gdcmDictSet
899
900 2004-01-15 Benoit Regrain
901      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
902        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
903        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
904        some memory and vtk seems to have some problems with that.
905      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
906
907 2004-01-14 Benoit Regrain
908      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
909      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
910      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
911      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
912
913 2004-01-13 Benoit Regrain
914      * src/*.[h|cxx] : coding style
915      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
916
917 2004-01-13 Benoit Regrain
918      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
919      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
920        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
921      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
922
923 2004-01-12 Benoit Regrain
924      * src/*.h : add comments
925      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
926      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
927        directly setted in the source code
928      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
929        gdcmTS and gdcmVR
930
931 2004-01-09 Benoit Regrain
932      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
933      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
934
935 2004-01-07 Benoit Regrain
936      * Modification to compile with the distutils.
937      * Bug fix in code
938
939 2003-12-10 Benoit Regrain
940      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
941        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
942      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
943        made in the source code
944
945 2003-12-10 Benoit Regrain
946      * Update Windows projects and .cvsignore files
947
948 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
949      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
950            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
951            if he wants to.
952            gdcmElValSet:Print takes it into account
953
954 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
955      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
956      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
957      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
958
959 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
960       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
961              on the ListTag listElem member,
962              not longer on the TagElValueHT tagHt member
963       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
964              with the tagHt member and the listElem member.
965              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
966
967       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
968              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
969                             if bug fixing is necessary), for internal
970                             use only
971              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
972                             or to allow Parser going on.
973              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
974              with a length (not 0000) is found
975       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
976                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
977                 (to be written)
978
979 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
980      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
981      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
982           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
983      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
984
985 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
986      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
987
988 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
989      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
990           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
991
992 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
993      * in testSuite.py : new files names for checking the package
994      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
995              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
996              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
997
998 2003-11-05 Benoit Regrain
999      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1000                        : Explicit error messages
1001      * in __init__.py  : Related modif
1002
1003 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1004      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1005            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1006            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1007      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1008                     (vtkGdcmReader compliant)           
1009       
1010 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1011      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1012        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1013        
1014 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1015      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1016            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1017
1018 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1019      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1020                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1021              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1022              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1023              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1024              such an image :
1025              After gdcmHeader :
1026               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1027               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1028               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1029      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1030              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1031
1032 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1033      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1034              
1035 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1036      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1037            being coherents dicom files.
1038      
1039 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1040      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1041            from medcon lib !
1042      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1043      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1044      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1045      * ENH: Add include dir to medcon lib
1046      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1047            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1048             
1049 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1050       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1051         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1052           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1053       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1054
1055 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1056       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1057         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1058         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1059       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1060       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1061
1062 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1063       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1064                                                
1065 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1066       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1067       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1068       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1069       
1070 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1071       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1072       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1073       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1074       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1075       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1076       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1077              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1078         But it fasten debug compilation time.
1079             
1080 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1081       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1082         (they are compressed as 2 planes images, 
1083          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1084
1085 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1086       * Now CheckRead takes into account :
1087          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1088          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1089       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1090        (breaks DicomWorks)
1091
1092 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1093       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1094              one should remove the '\'
1095         
1096 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1097       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1098         (wrong lengths in header)
1099         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1100       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1101         (breaks DicomWorks)
1102
1103 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1104       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1105         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1106
1107 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1108       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1109       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1110
1111 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1112       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1113      
1114 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1115       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1116         (the patch is easy to remove)
1117       * cosmetic changes to avoid warnings
1118       
1119 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1120       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1121         no need to press 'r' now.
1122    
1123 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1124       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1125         to new Jpeg Lossless decompressor
1126       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1127       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1128       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1129                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1130 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1131       * general anonymisation in gdcmData
1132       * adding the 'color files' from
1133         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1134       * adding some well knowed bugged-header images
1135       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1136         waiting for their inclusion in Python testsuite
1137
1138 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1139     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1140       no longer seg faults when file is not found
1141
1142 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1143      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1144        MultiFrame images
1145
1146 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1147      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1148
1149 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1150      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1151         OpenFile takes it into account
1152      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1153      * Missing elements added in dicomV3.dic
1154       (just to be affraid : have a look at
1155        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1156        and do it again next year ;->
1157
1158 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1159      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1160        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1161        But there are NOT. It's fixed !
1162        
1163 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1164      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1165      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1166          
1167 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1168      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1169              an ACR-NEMA / DICOM one.
1170      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1171              is not gdcm Readable
1172      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1173              is now decoded.
1174         
1175 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1176      * FIX: CMake generate now documentation
1177      * ENH: out of source doc build !
1178      * ENH: Generate both user and dev documentation
1179      * ENH: Should work on windows too
1180      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1181      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1182      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1183      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1184                      
1185 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1186      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1187      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1188      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1189         window level & window width
1190
1191 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1192      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1193      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1194      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1195      
1196 2003-10-06  Emanuel Ollart
1197      * FIX : compilation process wad broken.
1198              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1199         
1200 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1201      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1202      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1203      
1204 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1205      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1206            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1207                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1208       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1209
1210 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1211       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1212         to remain compliant with already defined strings, 
1213         like Transfert Syntax UID and others)
1214
1215 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1216       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1217              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1218         
1219 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1220       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1221       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1222
1223 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1224       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1225         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1226               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1227       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1228
1229 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1230       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1231
1232 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1233       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1234         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1235
1236 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1237       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1238          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1239          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1240          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1241           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1242                                             YBR_RCT files.
1243           (no sample found :-(
1244
1245 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1246       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1247         Two reasons: - clear things
1248                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1249                        suffer anymore VC++ complains
1250
1251 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1252       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1253       * removed leaks
1254
1255 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1256       * The lines are now eigthy characters long.for 
1257         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1258
1259 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1260       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1261         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1262         previous commis of Malaterre)
1263       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1264         before the last Malaterre's commit.
1265
1266 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1267       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1268         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1269       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1270         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1271
1272 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1273       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1274         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1275         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1276
1277 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1278       * Cosmetic changes:
1279         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1280           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1281           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1282           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1283         - PACKAGER corrected
1284         - DEVELOPPER added.
1285         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1286       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1287
1288 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1289       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1290
1291 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1292       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1293
1294 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1295       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1296
1297 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1298       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1299
1300 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1301       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1302         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1303         heuristics to get informations (look at different places).
1304       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1305         sorting DICOM images based on different strategies.
1306       * modified Makefiles accordingly.
1307
1308 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1309       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1310         when building in debug mode
1311       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1312         src/win32/gdcmdll.dsp
1313       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1314
1315 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1316       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1317             to valgrind.
1318
1319 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1320       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1321       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1322                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1323       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1324
1325 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1326       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1327         the file
1328       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1329       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1330         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1331       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1332         symbols... future problem ?
1333
1334 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1335       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1336       * modified gdcm.dsw accordingly
1337
1338 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1339       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1340
1341 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1342       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1343         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1344       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1345         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1346         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1347
1348 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1349       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1350
1351 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1352       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1353       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1354       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1355       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1356       * PACKAGER : adding all concerning windows
1357
1358 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1359       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1360         garbage debug code.
1361       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1362       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1363         test suite reported error.
1364       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1365         packaging a new release).
1366       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1367       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1368       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1369         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1370         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1371
1372 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1373       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1374       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1375
1376 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1377       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1378         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1379         is made in an internal list to prevent this problem.
1380         Bug fix when output is empty.
1381         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1382         correction.
1383       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1384
1385 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1386       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1387       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1388         files. Added method to remove all files on the input
1389         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1390         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1391
1392 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1393       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1394         when using make instal.
1395       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1396         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1397
1398 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1399       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1400       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1401
1402 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1403       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1404         linux and WINDOWS !
1405       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1406       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1407
1408 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1409       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1410         addon of the jpeg library)
1411       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1412       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1413       * INSTALL now points to web documentation
1414
1415 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1416       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1417         gdcmUtil.h anymore.
1418       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1419         clean target.
1420       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1421         - to allow compilation with gcc 3.x
1422           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1423           -- small fixes on exceptions.
1424           Note: linking not tested !
1425         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1426           building stage.
1427       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1428         dependent convertion).
1429
1430 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1431       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1432         Changelog):
1433         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1434         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1435           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1436         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1437
1438 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1439       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1440         compile
1441       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1442         (FileName -> Filename)
1443
1444 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1445       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1446         - UpdateProgress method should now be effective
1447         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1448           to volumes),
1449         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1450           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1451           accelerating things).
1452         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1453           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1454           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1455           in the stack (for the caller to notice the problem).
1456
1457 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1458       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1459
1460 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1461       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1462         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1463         under Windows... thanks Windows !)
1464
1465 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1466       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1467         debug stage).
1468       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1469
1470 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1471       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1472
1473 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1474       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1475         called with different flags than the default ones (with automake).
1476         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1477            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1478         and went for warning fixes:
1479         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1480           up from unused variables.
1481         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1482       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1483
1484 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1485       * gdcmPython/gdcm.i:
1486         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1487           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1488           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1489         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1490           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1491           exported to Python a as cvar.
1492       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1493         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1494         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1495         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1496         C++ static methods).
1497       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1498         with the above changes.
1499
1500 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1501       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1502
1503 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1504       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1505         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1506         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1507          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1508          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1509            a wrapper
1510          - Wrapper interface which wrap sources
1511         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1512         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1513       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1514         files for compilation
1515
1516 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1517       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1518         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1519         - vtk/Makefile.am now builds a library
1520         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1521           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1522           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1523           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1524           import library.
1525         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1526           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1527           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1528           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1529           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1530         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1531           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1532         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1533           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1534       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1535       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1536         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1537         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1538         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1539         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1540         collision of various stl members (principally cout...).
1541       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1542         file.
1543       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1544         comply with above changes)
1545
1546 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1547       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1548       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1549         vtk data structure (an image Flip was required).
1550       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1551       * cosmetic changes in documentation.
1552
1553 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1554       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1555         unexisting file is given as argument.
1556       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1557         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1558         containing those images is now available at
1559           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1560         with the name gdcmData.
1561         All the python scripts (including the package initialisation file
1562         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1563         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1564
1565 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1566       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1567         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1568         demo of the usage of this class.
1569         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1570         at configure (or autogen.sh) stage.
1571
1572 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1573       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1574         Notes on valgrind:
1575           - maximum info is obtained with a command of the form:
1576             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1577                      --show-reachable=yes PrintHeader
1578           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1579             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1580             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1581             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1582              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1583       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1584         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1585         Note: some images don't seem to work e.g.
1586             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1587       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1588         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1589         make gdcm more thread friendly.
1590
1591 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1592       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1593           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1594         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1595           gdcmHeader::_dicom_vr.
1596         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1597         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1598           VRHT*.
1599         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1600
1601 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1602       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1603         make install stage.
1604
1605 2003-04-9 JPR
1606       * UpdateGroupLength replaced by new one
1607
1608 2003-04-7 JPR
1609       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1610         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1611
1612 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1613       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1614       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1615       * src:
1616         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1617         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1618           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1619         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1620           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1621           carried the same semantics.
1622           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1623         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1624           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1625         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1626       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1627       * gdcmGetXSize added
1628       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1629       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1630
1631 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1632       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1633         (to avoid double call by end user).
1634       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1635         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1636
1637 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1638       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1639         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1640           the html.users end users oriented documentation and
1641           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1642           oriented documentation.
1643         - README changed accordingly
1644         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1645         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1646           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1647         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1648           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1649           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1650       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1651         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1652       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1653         ill-formed documentation sections.
1654       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1655
1656 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1657       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1658       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1659         un*ces with sh-utils test utility.
1660       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1661       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1662       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1663       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1664       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1665
1666 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1667       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1668       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1669
1670 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1671       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1672       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1673       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1674       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1675         compilation work.
1676       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1677       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1678
1679 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1680       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1681         hence the user doesn't need this explicit call.
1682         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1683           i.e. LoadElements() call removed.
1684       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1685         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1686       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1687         for adding user defined new tags.
1688         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1689         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1690           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1691
1692 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1693       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1694         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1695         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1696         with the autotools, included the python wrappers part.
1697       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1698
1699 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1700       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1701
1702 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1703       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1704         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1705         for usage).
1706       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1707         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1708         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1709       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1710         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1711
1712 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1713       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1714         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1715         value of GDCM_DICT_PATH.
1716       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1717
1718 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1719       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1720       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1721       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1722         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1723         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1724
1725 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1726       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1727         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1728         gdcmHeader.h
1729       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1730         (as opposed to gdcm.h)
1731       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1732       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1733         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1734       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1735
1736 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1737       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1738         bug.
1739
1740 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1741       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1742         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1743         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1744         of hidding away the python related distutils specific files
1745         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1746         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1747         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1748         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1749
1750 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1751       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1752       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1753         among the list of sources.
1754
1755 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1756       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1757       * modifications in MSVC projects
1758
1759 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1760       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1761         looks like we can move back to original usage of exception within
1762         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1763         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1764       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1765         README file for usage added.
1766       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1767         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1768         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1769         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1770       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1771       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1772         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1773           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1774           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1775           instance of class gdcmHeader.
1776         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1777           require no instances at all to be invocated.
1778         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1779           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1780           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1781       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1782         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1783       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1784         the above to be effective.
1785       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1786         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1787       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1788         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1789         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1790         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1791         (for python dectection).
1792       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1793         now avoids publishing the empty entries.
1794
1795 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1796       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1797         ExtraPath reused :-P
1798       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1799
1800 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1801       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1802       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1803       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1804         and links
1805
1806 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1807       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1808         method. Doxygenation.
1809       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1810
1811 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1812       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1813         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1814         when using "python setup.py install".
1815       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1816         reexports the working classes.
1817       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1818         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1819         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1820         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1821         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1822         subdir (see the README file). This problem probably due to
1823         an combination of g++ and dynamic loading.
1824       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1825
1826 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1827       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1828         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1829         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1830         again in a python subdir, but the package itself is now in
1831         python/gdcmPython.
1832       * setup.py was cleaned up:
1833         - pythonIncludePath removed
1834         - python setup.py bdist target is now functional.
1835       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1836         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1837         accordingly.
1838
1839 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1840       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1841       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1842         distutils installer is operational.
1843       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1844           shadow classes (from gdcm.py).
1845         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1846           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1847         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1848
1849 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1850       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1851         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1852         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1853         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1854         dictionary.
1855         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1856           are now in the "???" group.
1857         - python/gdcm.i changed accordingly,
1858         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1859           of the above new functionalities in Python.
1860
1861 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1862       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1863         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1864           were definitively removed.
1865         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1866       * src/gdcmElValSet.cxx:
1867         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1868         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1869         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1870         - Added GetElementByName(string).
1871       * src/gdcmHeader.cxx: added
1872         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1873         - GetPubElValRepByName(string)
1874         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1875         - GetShaElValRepByName(string)
1876         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1877         - GetShaElValRepByName(string)
1878         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1879         - GetElValRepByName(string)
1880         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1881         - GetElValRepByName(string)
1882       * Doc/requirements.txt added.
1883
1884 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1885       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1886       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1887         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1888         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1889         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1890       * python/testSuite.py changed accordingly.
1891
1892 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1893       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1894         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1895              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1896               cannot be exported. [...]
1897               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1898               be exported. [...]
1899               This is caused by a designed limitation that once a template
1900               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1901               exported."
1902         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1903         limitation" of VC++ is a pitfall.
1904         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1905         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1906         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1907         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1908         library.
1909         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1910       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1911          dll under windows !!!!)
1912       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1913       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1914         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1915       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1916         (one) of image(s).
1917       * removed glib references
1918       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1919
1920 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1921       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1922         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1923         the files of the testsuite without using unittest.
1924       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1925       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1926       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1927         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1928
1929 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1930       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1931         values, but limits itself to values which are below a user specified
1932         size (by default 1024 bytes).
1933       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1934         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1935         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1936         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1937       * python/testSuite.py
1938         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1939         - two new examples added.
1940       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1941
1942 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1943       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1944         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1945       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1946       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1947       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1948
1949 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1950       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1951         the vr was also RET.
1952       * python/testSuite.py more tests added.
1953
1954 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1955       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1956       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1957       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1958         7.18 Integer types (see stdint.h)
1959         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1960       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1961         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1962         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1963         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1964         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1965         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1966         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1967         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1968
1969 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1970       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1971         VR files.
1972       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1973
1974 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1975       * Adaptation for porting to VC++:
1976         - src/gdcm.h
1977           o forced to use std namespace (for string to be known)
1978           o all class use __declspec export style on WIN32
1979         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1980           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1981       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1982         variable GDCM_DICT_PATH.
1983       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1984
1985 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1986       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1987         to native Python dictionary.
1988       * python/demo/test.py:
1989         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1990         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1991       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1992         PubElVals hashing table.
1993       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1994
1995 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1996       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1997         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1998       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1999       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2000       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2001         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2002       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2003
2004 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2005       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2006         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2007         that we can import de shadow classes without errors].
2008
2009 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2010       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2011       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2012       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2013       * src/Makefile prepared for python wrapping
2014
2015 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2016       * src/gdcmHeader.cxx :
2017         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2018           (see gdcmHeader::LoadElements).
2019         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2020           ReadInt16 and ReadInt32)
2021
2022 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2023       * src/gdcmHeader.cxx :
2024         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2025           method.
2026         - SetLgrElem renamed to SetLength
2027         - GetLgrElem renamed to GetLength
2028         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2029       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2030       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2031         due to IdoDude was cleaned out.
2032
2033 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2034       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2035         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2036         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2037         returning the unecessary skL (skipped length).
2038         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2039         it was redundant with the File position internals (by using
2040         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2041         jajun.
2042       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2043         on the libido specificities which are handled through class
2044         inheritance.
2045       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2046         added.
2047
2048 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2049       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2050         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2051
2052 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2053       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2054
2055 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2056       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2057         and _IdDcmSWAP_LONG.
2058
2059 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2060       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2061         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2062