]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
3   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
4     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
5       clean up of RLE related code. 
6
7 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
8   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
9     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
10       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
11       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
12       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
13       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
14       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
15       offsets.
16   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
17     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
18         with the retired Parse7Fe0().
19     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
20     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
21
22 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
23   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
24     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
25     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
26     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
27   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
28     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
29       to return an unused length.
30
31 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
32   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
33      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
34        with it's binary name).
35      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
36        the Website to be more complete.
37      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
38        doxygenated documentation.
39      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
40        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
41                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
42   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
43   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
44    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
45
46 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
47   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
48    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
49
50 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
51   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
52     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
53     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
54     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
55     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
56   * GDCMHOME clean up:
57     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
58       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
59       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
60   * Autotools clean up:
61     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
62     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
63
64 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
65   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
66   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
67   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
68
69 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
70   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
71     describing TODO entries and used it for new entries.
72   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
73     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
74     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
75   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
76     documentation itself, but the website) moved to html and
77     placed in directory Doc/Website:
78     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
79     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
80     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
81   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
82   * CMakeLists.txt changed accordingly.
83   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
84     DeveloppersPython.html
85   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
86
87 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
88   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
89     of gdcm Web site.
90
91 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
92   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
93     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
94          we can now delete[] it safely  
95   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
96     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
97   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
98
99 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
100   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
101     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
102     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
103     pointed content.
104
105 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
106   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
107   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
108
109 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
110   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
111     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
112     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
113     an example of usage.
114     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
115       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
116     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
117       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
118     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
119     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
120     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
121
122 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
123   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
124     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
125     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
126     in class 
127     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
128       and associated accessors. Doxygenation of the class.
129     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
130       accessors added.
131     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
132       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
133     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
134     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
135
136 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
137   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
138     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
139       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
140            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
141            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
142            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
143            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
144            the same group and element all share the same (group, element)
145            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
146            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
147            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
148            consider the following definition of a TagKey:
149            - let Group, Element be the string representation of the
150              group and element dicom tag members,
151            - let ItemNumber be the string representation of the integer
152              index of the considered item number of a sequence,
153            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
154            the form:
155               /ItemNumber#Group|Element
156            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
157            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
158               Group|Element<SeqTag>
159            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
160            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
161            string e.g.
162                0028|1201
163            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
164            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
165            string e.g.
166                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
167     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
168       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
169       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
170     - src/gdcmDocEntry.cxx:
171       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
172          Key member.
173       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
174     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
175     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
176       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
177       -- now has a new BaseTagKey member.
178       -- STYLE.
179   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
180     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
181     truly belongs.
182     This poses the problem with the semantics of the following lines
183        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
184        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
185        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
186     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
187     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
188     order to get things working the dicom dictionary was altered !
189     Please fix things urgently...
190   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
191     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
192     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
193     set to OW:
194       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
195       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
196       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
197   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
198     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
199   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
200
201 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
202   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
203
204 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
205   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
206     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
207   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
208   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
209
210 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
211   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
212     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
213   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
214     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
215   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
216     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
217   * TODO updated
218   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
219     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
220   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
221   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
222     exception_on_error parameter.
223     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
224     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
225     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
226
227 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
228   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
229   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
230     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
231   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
232   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
233   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
234     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
235   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
236
237 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
238   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
239     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
240
241 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
242   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
243        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
244                  
245 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
246   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
247         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
248
249 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
250    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
251    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
252      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
253      is now in static in the gdcmDebug class
254    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
255    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
256
257 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
258    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
259      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
260    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
261      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
262      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
263      that displays position and size).
264    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
265      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
266      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
267      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
268      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
269      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
270      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
271         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
272      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
273      commiting changes).
274    * Test/CMakeLists.txt:
275       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
276       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
277         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
278         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
279    * TODO updated.
280
281 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
282    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
283      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
284      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
285      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
286      - removal of typedef duplication.
287      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
288      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
289    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
290       - printf polluting ctest removed.
291       - TAB removal for comminting
292    * Test:
293      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
294        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
295        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
296        this test creates them.
297        Note: we need to validate each reference image, but before that
298              I'd like to rename them with a more explicit name...
299      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
300    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
301      including each header needed).
302
303 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
304    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
305      test suite to the Example directory. Are concerned:
306      - PrintHeader.cxx
307      - TestDcm2Acr.cxx
308      - TestFindTags.cxx
309      - TestWrite.cxx was
310      - TestWriteSimple.cxx
311    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
312      image gdcmData/oldACR00001.ima
313
314 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
315    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
316      with removal from gdcmData):
317       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
318       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
319       - US.3405.1.dcm
320      Added the following because after last cvs update, they cause
321        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
322      to segfault:
323       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
324       - oldACR00001.ima
325    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
326      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
327      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
328      form of test...
329    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
330      we don't need to black list the following images anymore:
331       - 8BitsUncompressedColor.dcm
332       - OT-PAL-8-face.dcm
333       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
334    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
335      fixes and the beautified code ;-)
336      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
337      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
338      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
339            improve the test suite). The bug could be detected by using
340            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
341            or by using
342            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
343            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
344
345 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
346    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
347          - replace by uggly but working old code :-(
348                 A lot of things should be OK again.
349         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
350         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
351         (twice, withing a fortnigh ...)         
352
353 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
354    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
355      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
356    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
357      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
358      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
359                    - OT-PAL-8-face.dcm
360                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
361    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
362      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
363      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
364      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
365      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
366      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
367      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
368      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
369      image.
370    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
371      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
372      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
373      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
374    
375 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
376   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
377   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
378                           (instead of infinite loop)
379   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
380
381 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
382    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
383
384 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
385    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
386                     when SamplesPerPixel =3
387          - now Write is no longer confused by 
388                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
389          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
390                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
391    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
392                     (in order to split the job that has not to be done 
393                                         for gdcmDicomDir)
394
395 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
396    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
397      loop on the same image until memory went out. 
398      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
399    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
400      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
401
402 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
403    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
404             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
405                                 is added a the end, when necessary.
406             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
407                       now written correctly
408                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
409                                 (even for odd groups) 
410         Note : only Explicit Value Representation was checked.
411                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
412
413 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
414    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
415    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
416      coding style).
417
418 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
419    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
420      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
421    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
422
423 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
424    FIX : gdcmDocument.cxx
425       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
426         code 'beautyfication' :-(
427       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
428
429 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
430    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
431                  : to allow user to create his own Sequences
432         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
433
434 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
435         
436         - gdcmBinEntry
437           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
438           
439    - gdcmDocEntry
440           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
441           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
442           
443         - gdcmDocEntrySet
444           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
445           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
446      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
447      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
448      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
449      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
450                                             guint16 element,
451                                             std::string vr     = "unkn",
452                                             std::string fourth = "unkn",
453                                             std::string name   = "unkn"); 
454           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
455      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
456      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
457      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
458      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
459      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
460           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
461      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
462           
463         - gdcmDocument
464      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
465      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
466      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
467      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
468      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
469                                         FILE *_fp, FileType type);
470      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
471      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
472      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
473      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
474      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
475      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
476      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
477      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
478                                             guint16 element,
479                                             std::string vr     = "unkn",
480                                             std::string fourth = "unkn",
481                                             std::string name   = "unkn");
482      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
483      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
484      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
485      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
486                                                                                                                  
487         - gdcmElementSet
488           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
489           
490    - gdcmSeqEntry
491           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
492  
493    - gdcmSQItem
494      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
495      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
496      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
497      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
498
499    - gdcmValEntry
500          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
501                                   
502 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
503     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
504       The default constructor invoked by the line
505          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
506       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
507       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
508       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
509     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
510       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
511       Could anyone explain why ?
512     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
513       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
514       code related to gdcmBinEntry).
515
516 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
517     * In order to fix memory leaks:
518      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
519        some delete calls.
520      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
521      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
522        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
523        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
524        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
525      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
526      - src/gdcmDocument.cxx:
527        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
528           from dynamic stores.
529        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
530           was causing memory leaks.
531      - src/gdcmSQItem.cxx:
532        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
533           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
534        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
535           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
536           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
537           This avoids SegFaulting.
538      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
539     * Conclusion:
540      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
541        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
542        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
543      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
544        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
545      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
546        segfaults).
547     * Erroneous leading white fix:
548      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
549        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
550      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
551      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
552     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
553     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
554
555
556 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
557     * In order to fix writing of dicom files:
558      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
559      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
560      - src/gdcmDocument.cxx:
561        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
562        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
563        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
564           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
565           manner.
566        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
567           to only declared) and build on top of
568           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
569        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
570      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
571        for usage in destructor and treatement of promotion in
572        ::ReplaceOrCreateByNumber().
573      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
574       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
575     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
576       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
577       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
578       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
579
580 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
582       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
583       learned that:
584           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
585           soon as possible by globally disabling memory caching.
586           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
587           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
588       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
589       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
590       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
591     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
592       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
593       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
594       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
595         with 1.
596       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
597       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
598       understand why the list is empty...).
599     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
600     * Doc/License.txt added.
601
602 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
603     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
604       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
605         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
606         the padding problem.
607       - general clean up, simplification, and coding style.
608       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
609     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
610
611 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
612    *  gdcmSeqEntry.cxx
613            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
614                 - fix the display of SQItem ordinal number
615       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
616                 - remove some useless never written private methods     
617                 
618 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
619    * gdcmBinEntry.cxx 
620       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
621            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
622               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
623                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
624    * dcmDocument.cxx
625       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
626               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
627            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
628       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
629    * gdcmFile.cxx
630       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
631    * gdcmSQItem.h
632       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
633             a (relative) Item identier inside a given Sequence
634             \warning : some pb remaining around this number
635                                 will be solved asap
636       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
637    * gdcmValEntry.cxx 
638       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
639
640 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
641     * Memory leak hunt with the following command:
642       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
643                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
644       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
645       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
646       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
647           grep "MEMORY LEAK" src/*
648       Here are two typical examples which I can't help fixing:
649       -----
650           #include <string>
651           int main() {
652              std::string name;
653              char * test = "babo";
654              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
655                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
656              name.clear();   //// Doesn't help !
657              return 0;
658           }
659       -----
660           #include <string>
661           #include <iostream>
662           int main() {
663              std::string line;
664              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
665              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
666                                         //// of 1320 bytes in call to
667                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
668             return 0;
669           }
670       -----
671
672
673 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
674     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
675       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
676         and related, moved away to gdcmDocument.
677       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
678         the corresponding protected accessors of inherited class
679         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
680         declared friend of class gdcmDocument (see below).
681       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
682       - Clean up of undefined or unused methods.
683     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
684       account the changes to gdcmHeader.h).
685     * src/gdcmDocument.h:
686       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
687         changes to gdcmHeader.h).
688       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
689         (see changes to gdcmHeader.h).
690       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
691       - Clean up of undefined or unused methods.
692     * src/gdcmDocument.cxx:
693       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
694       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
695       - some std::string properly set to VRKey
696     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
697       references to gdcmDocument. 
698     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
699     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
700       cvs repository gdcmData.
701
702 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
703     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
704     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
705       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
706     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
707     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
708       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
709     * src/gdcmDocument.cxx: 
710       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
711         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
712       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
713         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
714         removed. Reverting to previous code segment with the proper
715         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
716         Note: this was (partially) breaking the python test suite
717               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
718               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
719     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
720     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
721       now taken into account.
722     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
723       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
724     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
725       on posix.
726     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
727       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
728     * .... alas, the python testSuite is still broken.
729
730 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
731     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
732       gdcmGlob
733     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
734     * src/gdcmUtil.h : export methods
735
736 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
737     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
738       to right behavior
739     * Initial addition of automatic python testing
740     * Initial addition of automatic image comparison
741
742 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
743     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
744       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
745
746 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
747      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
748      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
749      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
750
751 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
752      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
753        new concepts (and new classes) :
754        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
755         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
756         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
757        a Sequence is composed of Items.
758        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
759        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
760        (never taken into account)
761        Our unability to add a new 'entry' in the header
762        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
763        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
764        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
765        nothing is finished.
766        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
767
768 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
769      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
770      
771 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
772      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
773        file prefix (SetFilePrefix)
774
775 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
776      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
777        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
778        baseline.
779      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
780        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
781
782 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
783      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
784        dicom image
785
786 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
787      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
788      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
789        between the developper and user version.
790      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
791      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
792
793 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
794      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
795        when using cmake.
796
797 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
798      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
799                src directory, now generated in the build dir.
800             2. Tests as mentionned smarter
801             3. Some clean up
802             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
803           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
804           where we could set the institution name / patient name...
805
806        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
807               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
808                  (this was not true before)
809
810 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
811      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
812            SeQuence indented printing of Dicom Header.
813      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
814            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
815            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
816      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
817            tree-like structure of a Dicom Header.
818      * FIX Test code cleaning     
819            
820 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
821      * ENH: Adding automatic testing
822        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
823        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
824        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
825        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
826           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
827           too many projects
828      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
829      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
830        one file instead of seven + some small cleanup
831
832 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
833      * ENH Minor changes to the Print() methods.
834      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
835            Header printing. Example given with :
836            > PrintHeader fileName  2 new
837           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
838            
839 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
840      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
841          1. I have added some unsigned where needed
842          2. Some function parameter not used -> (void)
843          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
844          4. g++ don't like character '\' in comment
845          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
846                     this really need to be fixed
847          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
848          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
849                     this also really need to be fixed
850          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
851                     remove compression file 
852                     (as we only do decompression, right ?)     
853      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
854
855 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
856      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
857            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
858            defaulted to yspacing
859            
860 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
861      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
862      * ENH add parameters :
863                bool  exception_on_error = false, 
864                bool  enable_sequences   = false,
865                bool  ignore_shadow      = false
866            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
867      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
868            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
869               
870 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
871      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
872      
873 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
874      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
875      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
876              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
877              
878 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
879      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
880          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
881
882 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
883      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
884        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
885        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
886        in gdcmHeader.
887      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
888        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
889        already does the job.
890      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
891        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
892
893 2004-03-30 Benoit Regrain
894      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
895        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
896        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
897
898 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
899      * ENH : Check on file type to be written moved
900              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
901      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
902              when end-of-list is reached
903            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
904
905 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
906      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
907      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
908      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
909        equivalent to ExplicitVR in existing code).
910
911 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
912      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
913        now contains all the gdcmGlobal related code.
914      * minor coding style and doxygenation changes.
915
916 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
917      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
918        now contains all the Debug related code.
919      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
920      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
921        CreateCleanString) removed.
922      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
923      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
924      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
925      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
926        src/gdcmDirList.cxx)
927
928 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
929      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
930
931 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
932      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
933            big endian made volumes
934      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
935            end user to instanciate class gdcmParser
936           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
937
938 2004-03-22 Benoit Regrain
939      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
940      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
941              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
942
943 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
944      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
945            an already existing DICOMDIR file is consistent with
946            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
947            or build from the files held (recursively) in a Directory
948            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
949            gdcmObject::SetBoundaries() added
950
951 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
952      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
953                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
954      * FIX now file names and directory name are written properly in the
955            DICOMDIR
956      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
957            about the name
958
959 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
960      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
961                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
962
963 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
964      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
965            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
966            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
967            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
968            to allow making gdcDicomDir object.
969      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
970           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
971
972 2004-02-11 Benoit Regrain
973      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
974              when using from python
975
976 2004-02-10 Benoit Regrain
977      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
978      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
979      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
980              directory parsing
981
982 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
983      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
984              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
985              - class gdcmMeta created
986      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
987              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
988      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
989
990 2004-02-05 Benoit Regrain
991      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
992              header entries
993      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
994      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
995
996 2004-02-04 Benoit Regrain
997      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
998      * FIX : sort the images in the dicom dir
999      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1000      * ADD : a python demo
1001
1002 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1003      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1004      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1005              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1006              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1007              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1008      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1009            to make full checking easier
1010         
1011 2004-02-04 Benoit Regrain
1012      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1013      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1014
1015 2004-02-03 Benoit Regrain
1016      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1017      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1018      * Bug fix and print add-on
1019
1020 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1021      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1022      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1023      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1024      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1025            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1026         
1027 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1028      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1029              iterator on last
1030              of the last synonym :-(
1031      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1032              for DICOMDIR ;-)
1033      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1034      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1035      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1036            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1037       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1038
1039 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1040      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1041            no longer writes 'Un' on disk
1042      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1043      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1044            the length (for Palette expanded images)
1045            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1046      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1047            (that broke Write). Replaced by UL.
1048            Aware user will reload the field if he 
1049            thinks it's necesssary
1050              
1051 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1052      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1053        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1054        IsReadable() methods.
1055        
1056      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1057       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1058       but so usefull for people that miss them ;-)
1059       
1060      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1061        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1062
1063 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1064      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1065
1066 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1067      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1068              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1069         The TRUE value for this param has to be used 
1070         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1071         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1072      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1073              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1074         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1075         
1076      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1077              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1078              Fixed
1079
1080      * gdcmHeader add the method
1081              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1082         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1083         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1084         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1085
1086 2004-01-26 Benoit Regrain
1087      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1088        in the print and add a third level of print to print them
1089
1090 2004-01-23 Benoit Regrain
1091      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1092      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1093      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1094        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1095
1096 2004-01-22 Benoit Regrain
1097      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1098      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1099
1100 2004-01-19 Benoit Regrain
1101      * Add the use of shadow dictionaries
1102      * bug fix and coding style
1103
1104 2004-01-19 Benoit Regrain
1105      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1106      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1107      * Add the update of header entries using the shadow library
1108
1109 2004-01-19 Benoit Regrain
1110      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1111      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1112        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1113        of dicom dir parsing
1114      * bug fix under python
1115
1116 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1117     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1118     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1119     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1120     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1121
1122 2004-01-15 Benoit Regrain
1123      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1124        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1125        when the gdcmDictSet will be destroyed
1126      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1127        gdcmDictSet
1128
1129 2004-01-15 Benoit Regrain
1130      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1131        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1132        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1133        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1134      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1135
1136 2004-01-14 Benoit Regrain
1137      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1138      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1139      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1140      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1141
1142 2004-01-13 Benoit Regrain
1143      * src/*.[h|cxx] : coding style
1144      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1145
1146 2004-01-13 Benoit Regrain
1147      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1148      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1149        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1150      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1151
1152 2004-01-12 Benoit Regrain
1153      * src/*.h : add comments
1154      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1155      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1156        directly setted in the source code
1157      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1158        gdcmTS and gdcmVR
1159
1160 2004-01-09 Benoit Regrain
1161      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1162      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1163
1164 2004-01-07 Benoit Regrain
1165      * Modification to compile with the distutils.
1166      * Bug fix in code
1167
1168 2003-12-10 Benoit Regrain
1169      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1170        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1171      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1172        made in the source code
1173
1174 2003-12-10 Benoit Regrain
1175      * Update Windows projects and .cvsignore files
1176
1177 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1178      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1179            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1180            if he wants to.
1181            gdcmElValSet:Print takes it into account
1182
1183 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1184      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1185      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1186      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1187
1188 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1189       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1190              on the ListTag listElem member,
1191              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1192       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1193              with the tagHt member and the listElem member.
1194              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1195
1196       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1197              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1198                             if bug fixing is necessary), for internal
1199                             use only
1200              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1201                             or to allow Parser going on.
1202              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1203              with a length (not 0000) is found
1204       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1205                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1206                 (to be written)
1207
1208 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1209      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1210      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1211           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1212      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1213
1214 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1215      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1216
1217 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1218      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1219           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1220
1221 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1222      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1223      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1224              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1225              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1226
1227 2003-11-05 Benoit Regrain
1228      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1229                        : Explicit error messages
1230      * in __init__.py  : Related modif
1231
1232 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1233      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1234            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1235            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1236      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1237                     (vtkGdcmReader compliant)           
1238       
1239 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1240      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1241        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1242        
1243 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1244      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1245            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1246
1247 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1248      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1249                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1250              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1251              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1252              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1253              such an image :
1254              After gdcmHeader :
1255               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1256               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1257               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1258      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1259              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1260
1261 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1262      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1263              
1264 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1265      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1266            being coherents dicom files.
1267      
1268 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1269      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1270            from medcon lib !
1271      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1272      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1273      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1274      * ENH: Add include dir to medcon lib
1275      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1276            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1277             
1278 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1279       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1280         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1281           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1282       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1283
1284 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1285       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1286         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1287         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1288       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1289       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1290
1291 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1292       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1293                                                
1294 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1295       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1296       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1297       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1298       
1299 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1300       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1301       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1302       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1303       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1304       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1305       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1306              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1307         But it fasten debug compilation time.
1308             
1309 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1310       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1311         (they are compressed as 2 planes images, 
1312          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1313
1314 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1315       * Now CheckRead takes into account :
1316          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1317          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1318       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1319        (breaks DicomWorks)
1320
1321 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1322       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1323              one should remove the '\'
1324         
1325 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1326       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1327         (wrong lengths in header)
1328         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1329       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1330         (breaks DicomWorks)
1331
1332 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1333       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1334         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1335
1336 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1337       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1338       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1339
1340 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1341       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1342      
1343 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1344       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1345         (the patch is easy to remove)
1346       * cosmetic changes to avoid warnings
1347       
1348 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1349       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1350         no need to press 'r' now.
1351    
1352 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1353       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1354         to new Jpeg Lossless decompressor
1355       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1356       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1357       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1358                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1359 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1360       * general anonymisation in gdcmData
1361       * adding the 'color files' from
1362         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1363       * adding some well knowed bugged-header images
1364       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1365         waiting for their inclusion in Python testsuite
1366
1367 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1368     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1369       no longer seg faults when file is not found
1370
1371 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1372      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1373        MultiFrame images
1374
1375 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1376      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1377
1378 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1379      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1380         OpenFile takes it into account
1381      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1382      * Missing elements added in dicomV3.dic
1383       (just to be affraid : have a look at
1384        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1385        and do it again next year ;->
1386
1387 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1388      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1389        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1390        But there are NOT. It's fixed !
1391        
1392 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1393      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1394      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1395          
1396 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1397      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1398              an ACR-NEMA / DICOM one.
1399      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1400              is not gdcm Readable
1401      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1402              is now decoded.
1403         
1404 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1405      * FIX: CMake generate now documentation
1406      * ENH: out of source doc build !
1407      * ENH: Generate both user and dev documentation
1408      * ENH: Should work on windows too
1409      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1410      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1411      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1412      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1413                      
1414 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1415      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1416      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1417      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1418         window level & window width
1419
1420 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1421      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1422      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1423      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1424      
1425 2003-10-06  Emanuel Ollart
1426      * FIX : compilation process wad broken.
1427              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1428         
1429 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1430      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1431      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1432      
1433 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1434      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1435            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1436                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1437       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1438
1439 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1440       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1441         to remain compliant with already defined strings, 
1442         like Transfert Syntax UID and others)
1443
1444 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1445       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1446              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1447         
1448 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1449       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1450       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1451
1452 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1453       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1454         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1455               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1456       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1457
1458 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1459       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1460
1461 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1462       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1463         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1464
1465 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1466       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1467          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1468          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1469          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1470           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1471                                             YBR_RCT files.
1472           (no sample found :-(
1473
1474 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1475       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1476         Two reasons: - clear things
1477                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1478                        suffer anymore VC++ complains
1479
1480 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1481       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1482       * removed leaks
1483
1484 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1485       * The lines are now eigthy characters long.for 
1486         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1487
1488 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1489       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1490         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1491         previous commis of Malaterre)
1492       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1493         before the last Malaterre's commit.
1494
1495 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1496       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1497         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1498       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1499         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1500
1501 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1502       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1503         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1504         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1505
1506 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1507       * Cosmetic changes:
1508         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1509           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1510           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1511           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1512         - PACKAGER corrected
1513         - DEVELOPPER added.
1514         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1515       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1516
1517 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1518       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1519
1520 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1521       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1522
1523 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1524       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1525
1526 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1527       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1528
1529 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1530       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1531         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1532         heuristics to get informations (look at different places).
1533       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1534         sorting DICOM images based on different strategies.
1535       * modified Makefiles accordingly.
1536
1537 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1538       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1539         when building in debug mode
1540       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1541         src/win32/gdcmdll.dsp
1542       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1543
1544 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1545       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1546             to valgrind.
1547
1548 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1549       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1550       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1551                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1552       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1553
1554 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1555       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1556         the file
1557       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1558       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1559         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1560       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1561         symbols... future problem ?
1562
1563 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1564       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1565       * modified gdcm.dsw accordingly
1566
1567 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1568       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1569
1570 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1571       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1572         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1573       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1574         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1575         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1576
1577 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1578       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1579
1580 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1581       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1582       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1583       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1584       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1585       * PACKAGER : adding all concerning windows
1586
1587 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1588       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1589         garbage debug code.
1590       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1591       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1592         test suite reported error.
1593       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1594         packaging a new release).
1595       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1596       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1597       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1598         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1599         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1600
1601 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1602       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1603       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1604
1605 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1607         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1608         is made in an internal list to prevent this problem.
1609         Bug fix when output is empty.
1610         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1611         correction.
1612       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1613
1614 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1615       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1616       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1617         files. Added method to remove all files on the input
1618         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1619         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1620
1621 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1622       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1623         when using make instal.
1624       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1625         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1626
1627 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1628       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1629       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1630
1631 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1632       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1633         linux and WINDOWS !
1634       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1635       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1636
1637 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1638       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1639         addon of the jpeg library)
1640       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1641       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1642       * INSTALL now points to web documentation
1643
1644 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1645       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1646         gdcmUtil.h anymore.
1647       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1648         clean target.
1649       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1650         - to allow compilation with gcc 3.x
1651           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1652           -- small fixes on exceptions.
1653           Note: linking not tested !
1654         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1655           building stage.
1656       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1657         dependent convertion).
1658
1659 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1660       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1661         Changelog):
1662         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1663         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1664           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1665         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1666
1667 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1669         compile
1670       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1671         (FileName -> Filename)
1672
1673 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1675         - UpdateProgress method should now be effective
1676         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1677           to volumes),
1678         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1679           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1680           accelerating things).
1681         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1682           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1683           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1684           in the stack (for the caller to notice the problem).
1685
1686 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1687       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1688
1689 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1691         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1692         under Windows... thanks Windows !)
1693
1694 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1695       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1696         debug stage).
1697       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1698
1699 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1700       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1701
1702 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1703       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1704         called with different flags than the default ones (with automake).
1705         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1706            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1707         and went for warning fixes:
1708         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1709           up from unused variables.
1710         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1711       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1712
1713 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1714       * gdcmPython/gdcm.i:
1715         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1716           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1717           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1718         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1719           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1720           exported to Python a as cvar.
1721       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1722         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1723         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1724         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1725         C++ static methods).
1726       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1727         with the above changes.
1728
1729 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1730       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1731
1732 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1733       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1734         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1735         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1736          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1737          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1738            a wrapper
1739          - Wrapper interface which wrap sources
1740         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1741         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1742       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1743         files for compilation
1744
1745 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1746       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1747         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1748         - vtk/Makefile.am now builds a library
1749         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1750           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1751           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1752           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1753           import library.
1754         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1755           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1756           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1757           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1758           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1759         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1760           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1761         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1762           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1763       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1764       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1765         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1766         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1767         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1768         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1769         collision of various stl members (principally cout...).
1770       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1771         file.
1772       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1773         comply with above changes)
1774
1775 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1776       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1777       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1778         vtk data structure (an image Flip was required).
1779       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1780       * cosmetic changes in documentation.
1781
1782 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1783       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1784         unexisting file is given as argument.
1785       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1786         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1787         containing those images is now available at
1788           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1789         with the name gdcmData.
1790         All the python scripts (including the package initialisation file
1791         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1792         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1793
1794 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1795       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1796         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1797         demo of the usage of this class.
1798         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1799         at configure (or autogen.sh) stage.
1800
1801 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1802       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1803         Notes on valgrind:
1804           - maximum info is obtained with a command of the form:
1805             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1806                      --show-reachable=yes PrintHeader
1807           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1808             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1809             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1810             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1811              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1812       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1813         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1814         Note: some images don't seem to work e.g.
1815             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1816       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1817         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1818         make gdcm more thread friendly.
1819
1820 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1821       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1822           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1823         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1824           gdcmHeader::_dicom_vr.
1825         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1826         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1827           VRHT*.
1828         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1829
1830 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1831       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1832         make install stage.
1833
1834 2003-04-9 JPR
1835       * UpdateGroupLength replaced by new one
1836
1837 2003-04-7 JPR
1838       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1839         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1840
1841 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1842       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1843       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1844       * src:
1845         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1846         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1847           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1848         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1849           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1850           carried the same semantics.
1851           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1852         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1853           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1854         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1855       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1856       * gdcmGetXSize added
1857       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1858       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1859
1860 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1861       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1862         (to avoid double call by end user).
1863       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1864         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1865
1866 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1867       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1868         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1869           the html.users end users oriented documentation and
1870           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1871           oriented documentation.
1872         - README changed accordingly
1873         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1874         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1875           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1876         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1877           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1878           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1879       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1880         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1881       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1882         ill-formed documentation sections.
1883       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1884
1885 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1886       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1887       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1888         un*ces with sh-utils test utility.
1889       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1890       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1891       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1892       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1893       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1894
1895 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1896       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1897       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1898
1899 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1900       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1901       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1902       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1903       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1904         compilation work.
1905       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1906       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1907
1908 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1909       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1910         hence the user doesn't need this explicit call.
1911         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1912           i.e. LoadElements() call removed.
1913       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1914         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1915       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1916         for adding user defined new tags.
1917         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1918         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1919           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1920
1921 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1922       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1923         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1924         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1925         with the autotools, included the python wrappers part.
1926       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1927
1928 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1929       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1930
1931 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1932       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1933         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1934         for usage).
1935       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1936         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1937         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1938       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1939         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1940
1941 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1942       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1943         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1944         value of GDCM_DICT_PATH.
1945       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1946
1947 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1948       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1949       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1950       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1951         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1952         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1953
1954 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1955       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1956         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1957         gdcmHeader.h
1958       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1959         (as opposed to gdcm.h)
1960       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1961       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1962         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1963       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1964
1965 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1966       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1967         bug.
1968
1969 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1970       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1971         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1972         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1973         of hidding away the python related distutils specific files
1974         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1975         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1976         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1977         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1978
1979 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1980       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1981       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1982         among the list of sources.
1983
1984 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1985       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1986       * modifications in MSVC projects
1987
1988 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1989       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1990         looks like we can move back to original usage of exception within
1991         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1992         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1993       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1994         README file for usage added.
1995       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1996         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1997         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1998         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1999       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2000       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2001         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2002           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2003           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2004           instance of class gdcmHeader.
2005         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2006           require no instances at all to be invocated.
2007         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2008           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2009           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2010       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2011         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2012       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2013         the above to be effective.
2014       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2015         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2016       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2017         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2018         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2019         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2020         (for python dectection).
2021       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2022         now avoids publishing the empty entries.
2023
2024 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2025       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2026         ExtraPath reused :-P
2027       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2028
2029 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2030       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2031       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2032       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2033         and links
2034
2035 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2036       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2037         method. Doxygenation.
2038       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2039
2040 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2041       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2042         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2043         when using "python setup.py install".
2044       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2045         reexports the working classes.
2046       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2047         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2048         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2049         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2050         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2051         subdir (see the README file). This problem probably due to
2052         an combination of g++ and dynamic loading.
2053       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2054
2055 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2056       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2057         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2058         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2059         again in a python subdir, but the package itself is now in
2060         python/gdcmPython.
2061       * setup.py was cleaned up:
2062         - pythonIncludePath removed
2063         - python setup.py bdist target is now functional.
2064       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2065         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2066         accordingly.
2067
2068 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2069       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2070       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2071         distutils installer is operational.
2072       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2073           shadow classes (from gdcm.py).
2074         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2075           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2076         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2077
2078 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2079       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2080         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2081         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2082         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2083         dictionary.
2084         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2085           are now in the "???" group.
2086         - python/gdcm.i changed accordingly,
2087         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2088           of the above new functionalities in Python.
2089
2090 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2091       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2092         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2093           were definitively removed.
2094         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2095       * src/gdcmElValSet.cxx:
2096         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2097         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2098         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2099         - Added GetElementByName(string).
2100       * src/gdcmHeader.cxx: added
2101         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2102         - GetPubElValRepByName(string)
2103         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2104         - GetShaElValRepByName(string)
2105         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2106         - GetShaElValRepByName(string)
2107         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2108         - GetElValRepByName(string)
2109         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2110         - GetElValRepByName(string)
2111       * Doc/requirements.txt added.
2112
2113 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2114       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2115       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2116         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2117         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2118         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2119       * python/testSuite.py changed accordingly.
2120
2121 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2122       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2123         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2124              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2125               cannot be exported. [...]
2126               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2127               be exported. [...]
2128               This is caused by a designed limitation that once a template
2129               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2130               exported."
2131         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2132         limitation" of VC++ is a pitfall.
2133         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2134         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2135         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2136         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2137         library.
2138         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2139       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2140          dll under windows !!!!)
2141       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2142       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2143         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2144       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2145         (one) of image(s).
2146       * removed glib references
2147       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2148
2149 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2150       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2151         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2152         the files of the testsuite without using unittest.
2153       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2154       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2155       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2156         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2157
2158 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2159       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2160         values, but limits itself to values which are below a user specified
2161         size (by default 1024 bytes).
2162       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2163         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2164         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2165         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2166       * python/testSuite.py
2167         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2168         - two new examples added.
2169       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2170
2171 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2172       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2173         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2174       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2175       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2176       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2177
2178 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2179       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2180         the vr was also RET.
2181       * python/testSuite.py more tests added.
2182
2183 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2184       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2185       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2186       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2187         7.18 Integer types (see stdint.h)
2188         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2189       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2190         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2191         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2192         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2193         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2194         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2195         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2196         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2197
2198 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2199       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2200         VR files.
2201       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2202
2203 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2204       * Adaptation for porting to VC++:
2205         - src/gdcm.h
2206           o forced to use std namespace (for string to be known)
2207           o all class use __declspec export style on WIN32
2208         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2209           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2210       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2211         variable GDCM_DICT_PATH.
2212       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2213
2214 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2215       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2216         to native Python dictionary.
2217       * python/demo/test.py:
2218         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2219         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2220       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2221         PubElVals hashing table.
2222       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2223
2224 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2225       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2226         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2227       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2228       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2229       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2230         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2231       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2232
2233 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2234       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2235         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2236         that we can import de shadow classes without errors].
2237
2238 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2239       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2240       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2241       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2242       * src/Makefile prepared for python wrapping
2243
2244 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2245       * src/gdcmHeader.cxx :
2246         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2247           (see gdcmHeader::LoadElements).
2248         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2249           ReadInt16 and ReadInt32)
2250
2251 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2252       * src/gdcmHeader.cxx :
2253         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2254           method.
2255         - SetLgrElem renamed to SetLength
2256         - GetLgrElem renamed to GetLength
2257         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2258       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2259       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2260         due to IdoDude was cleaned out.
2261
2262 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2263       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2264         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2265         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2266         returning the unecessary skL (skipped length).
2267         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2268         it was redundant with the File position internals (by using
2269         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2270         jajun.
2271       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2272         on the libido specificities which are handled through class
2273         inheritance.
2274       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2275         added.
2276
2277 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2278       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2279         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2280
2281 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2282       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2283
2284 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2285       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2286         and _IdDcmSWAP_LONG.
2287
2288 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2289       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2290         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2291