ChangeLog

   1 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
   2       * Cosmetic changes:
   3         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
   4           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
   5           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
   6           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
   7         - PACKAGER corrected
   8         - DEVELOPPER added.
   9         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
  10 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  11       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
  12 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  13       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
  14 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  15       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
  16 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  17       * Fix a few delete/delete[] mismatch
  18 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  19       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
  20       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
  21       heuristics to get informations (look at different places).
  22       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
  23       sorting DICOM images based on different strategies.
  24       * modified Makefiles accordingly.
  25 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  26       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
  27         when building in debug mode
  28       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
  29         src/win32/gdcmdll.dsp
  30       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
  31 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  32       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
  33 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  34       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
  35       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
  36       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
  37 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  38       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
  39         the file
  40       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
  41       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
  42         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
  43       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
  44         symbols... futur problem ?
  45 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  46       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
  47       * modified gdcm.dsw accordingly
  48 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
  49       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
  50 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  51       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
  52         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
  53       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
  54         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
  55         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
  56 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  57       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
  58 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  59       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
  60       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
  61       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
  62       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
  63       * PACKAGER : adding all concerning windows
  64 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  65       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
  66         garbage debug code.
  67       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
  68       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
  69         test suite reported error.
  70       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
  71         packaging a new release).
  72       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
  73       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
  74       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
  75         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
  76         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
  77 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  78       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
  79       * src/gdcmHeader.h : formatting code
  80 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  81       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
  82         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
  83         is made in an internal list to prevent this problem.
  84         Bug fix when output is empty.
  85         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
  86         correction.
  87       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
  88 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  89       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
  90       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
  91         files. Added method to remove all files on the input
  92         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
  93         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
  94 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  95       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
  96         when using make instal.
  97       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
  98         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
  99 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 100       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
 101       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
 102 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 103       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
 104         linux and WINDOWS !
 105       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
 106       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
 107 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 108       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
 109         addon of the jpeg library)
 110       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
 111       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
 112       * INSTALL now points to web documentation
 113 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 114       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
 115         gdcmUtil.h anymore.
 116       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
 117         clean target.
 118       * src/gdcm*.[cxx|h] :
 119         - to allow compilation with gcc 3.x
 120           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
 121           -- small fixes on exceptions.
 122           Note: linking not tested !
 123         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
 124           building stage.
 125       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
 126         dependent convertion).
 127 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 128       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
 129         Changelog):
 130         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
 131         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
 132           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
 133         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
 134 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 135       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
 136         compile
 137       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
 138         (FileName -> Filename)
 139 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 140       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
 141         - UpdateProgress method should now be effective
 142         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
 143           to volumes),
 144         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
 145           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
 146           accelerating things).
 147         - when building a stack of images/volumes, files which are not
 148           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
 149           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
 150           in the stack (for the caller to notice the problem).
 151 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 152       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
 153 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 154       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
 155         between standard library (std) and vtk library (problems are found
 156         under Windows... thanks Windows !)
 157 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 158       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
 159         debug stage).
 160       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
 161 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 162       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
 163 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 164       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
 165         called with different flags than the default ones (with automake).
 166         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
 167            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
 168         and went for warning fixes:
 169         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
 170           up from unused variables.
 171         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
 172       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
 173 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 174       * gdcmPython/gdcm.i:
 175         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
 176           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
 177           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
 178         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
 179           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
 180           exported to Python a as cvar.
 181       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
 182         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
 183         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
 184         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
 185         C++ static methods).
 186       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
 187         with the above changes.
 188 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 189       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
 190 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 191       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
 192         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
 193         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
 194          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
 195          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
 196            a wrapper
 197          - Wrapper interface which wrap sources
 198         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
 199         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
 200       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
 201         files for compilation
 202 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
 203       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
 204         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
 205         - vtk/Makefile.am now builds a library
 206         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
 207           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
 208           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
 209           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
 210           import library.
 211         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
 212           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
 213           + vtk/vtkGdcmReader.so and
 214           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
 215           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
 216         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
 217           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
 218         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
 219           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
 220       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
 221       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
 222         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
 223         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
 224         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
 225         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
 226         collision of various stl members (principally cout...).
 227       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
 228         file.
 229       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
 230          comply with above changes)
 231 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 232       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
 233       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
 234         vtk data structure (an image Flip was required).
 235       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
 236       * cosmetic changes in documentation.
 237 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 238       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
 239         unexisting file is given as argument.
 240       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
 241         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
 242         containing those images is now available at
 243           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
 244         with the name gdcmData.
 245         All the python scripts (including the package initialisation file
 246         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
 247         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
 248 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 249       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
 250         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
 251         demo of the usage of this class.
 252         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
 253         at configure (or autogen.sh) stage.
 254 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 255       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
 256         Notes on valgrind:
 257           - maximum info is obtained with a command of the form:
 258             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
 259                    --show-reachable=yes PrintHeader
 260           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
 261             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
 262             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
 263             (in fact further invocation to the STL would recollect the
 264              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
 265       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
 266         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
 267         Note: some images don't seem to work e.g.
 268             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
 269       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
 270         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
 271         make gdcm more thread friendly.
 272 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 273       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
 274           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
 275         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
 276           gdcmHeader::_dicom_vr.
 277         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
 278         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
 279           VRHT*.
 280         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
 281 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 282       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
 283         make install stage.
 284 2003-04-9 JPR
 285       * UpdateGroupLength replaced by new one
 286 2003-04-7 JPR
 287       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
 288         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
 289
 290 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 291       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 292       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
 293       * src:
 294         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
 295         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
 296           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
 297         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
 298           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
 299           carried the same semantics.
 300           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
 301         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
 302           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
 303         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
 304       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
 305       * gdcmGetXSize added
 306       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
 307       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
 308 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 309       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
 310         (to avoid double call by end user).
 311       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
 312         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
 313 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 314       * gdcm/Doc many doxygen changes:
 315         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
 316           the html.users end users oriented documentation and
 317           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
 318           oriented documentation.
 319         - README changed accordingly
 320         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
 321         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
 322           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
 323         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
 324           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
 325           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
 326       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
 327         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
 328       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
 329         ill-formed documentation sections.
 330       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
 331 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 332       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
 333       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
 334         un*ces with sh-utils test utility.
 335       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
 336       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
 337       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
 338       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
 339       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
 340 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 341       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
 342       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
 343 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 344       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
 345       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
 346       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
 347       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
 348         compilation work.
 349       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
 350       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
 351 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 352       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
 353         hence the user doesn't need this explicit call.
 354         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
 355           i.e. LoadElements() call removed.
 356       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
 357         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
 358       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
 359         for adding user defined new tags.
 360         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
 361         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
 362           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
 363 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
 364       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
 365    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
 366    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
 367    with the autotools, included the python wrappers part.
 368       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
 369 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 370       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
 371 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 372       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
 373         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
 374         for usage).
 375       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
 376         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
 377         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
 378       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
 379         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
 380 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 381       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
 382         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
 383         value of GDCM_DICT_PATH.
 384       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
 385 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 386       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
 387       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
 388       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
 389         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
 390         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
 391 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 392       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
 393         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
 394         gdcmHeader.h
 395       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
 396         (as opposed to gdcm.h)
 397       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
 398       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
 399         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
 400       * autogen.sh removed history related references to crea package.
 401 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 402       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
 403         bug.
 404 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 405       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
 406         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
 407         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
 408         of hidding away the python related distutils specific files
 409         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
 410         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
 411         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
 412         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
 413 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 414       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
 415       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
 416         among the list of sources.
 417
 418 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 419       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
 420       * modifications in MSVC projects
 421 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 422       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
 423         looks like we can move back to original usage of exception within
 424         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
 425         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
 426       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
 427         README file for usage added.
 428       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
 429         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
 430         testing the proper parsing of a Dicom related file.
 431         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
 432       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
 433       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
 434         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
 435           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
 436           Dicom public dictionnary were not accessible without an
 437           instance of class gdcmHeader.
 438         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
 439           require no instances at all to be invocated.
 440         - within gdcmDictSet this change required to change some method
 441           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
 442           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
 443       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
 444         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
 445       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
 446         the above to be effective.
 447       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
 448         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
 449       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
 450         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
 451         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
 452         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
 453         (for python dectection).
 454       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
 455         now avoids publishing the empty entries.
 456 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 457       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
 458         ExtraPath reused :-P
 459       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 460 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 461       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 462       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 463       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 464         and links
 465 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 466       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 467         method. Doxygenation.
 468       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 469 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 470       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 471         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 472         when using "python setup.py install".
 473       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 474         reexports the working classes.
 475       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 476         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 477         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 478         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 479         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 480         subdir (see the README file). This problem probably due to
 481         an combination of g++ and dynamic loading.
 482       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 483 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 484       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 485         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 486         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 487         again in a python subdir, but the package itself is now in
 488         python/gdcmPython.
 489       * setup.py was cleaned up:
 490         - pythonIncludePath removed
 491         - python setup.py bdist target is now functional.
 492       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 493         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 494         accordingly.
 495 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 496       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 497       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 498         distutils installer is operational.
 499       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 500           shadow classes (from gdcm.py).
 501         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 502           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 503         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 504
 505 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 506       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 507         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 508         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 509         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 510         dictionary.
 511         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 512           are now in the "???" group.
 513         - python/gdcm.i changed accordingly,
 514         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 515           of the above new functionalities in Python.
 516 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 517       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 518         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 519           were definitively removed.
 520         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 521       * src/gdcmElValSet.cxx:
 522         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 523         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 524         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 525         - Added GetElementByName(string).
 526       * src/gdcmHeader.cxx: added
 527         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 528         - GetPubElValRepByName(string)
 529         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 530         - GetShaElValRepByName(string)
 531         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 532         - GetShaElValRepByName(string)
 533         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 534         - GetElValRepByName(string)
 535         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 536         - GetElValRepByName(string)
 537       * Doc/requirements.txt added.
 538 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 539       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 540       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 541         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 542         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 543         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 544       * python/testSuite.py changed accordingly.
 545 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 546       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 547         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 548              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 549               cannot be exported. [...]
 550               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 551               be exported. [...]
 552               This is caused by a designed limitation that once a template
 553               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 554               exported."
 555         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 556         limitation" of VC++ is a pitfall.
 557         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 558         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 559         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 560         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 561         library.
 562         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 563       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 564          dll under windows !!!!)
 565       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 566       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 567         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 568       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 569         (one) of image(s).
 570       * removed glib references
 571       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 572 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 573       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 574         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 575         the files of the testsuite without using unittest.
 576       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 577       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 578       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 579         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 580 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 581       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 582         values, but limits itself to values which are below a user specified
 583         size (by default 1024 bytes).
 584       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 585         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 586         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 587         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 588       * python/testSuite.py
 589         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 590         - two new examples added.
 591       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 592 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 593       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 594         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 595       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 596       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 597       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 598 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 599       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 600         the vr was also RET.
 601       * python/testSuite.py more tests added.
 602 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 603       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 604       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 605       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 606         7.18 Integer types (see stdint.h)
 607         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 608       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 609         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 610         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 611         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 612         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 613         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 614         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 615         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 616 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 617       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 618         VR files.
 619       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 620 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 621       * Adaptation for porting to VC++:
 622         - src/gdcm.h
 623           o forced to use std namespace (for string to be known)
 624           o all class use __declspec export style on WIN32
 625         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 626           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 627       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 628         variable GDCM_DICT_PATH.
 629       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 630 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 631       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 632         to native Python dictionary.
 633       * python/demo/test.py:
 634         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 635         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 636       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 637         PubElVals hashing table.
 638       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 639 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 640       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 641         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 642       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 643       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 644       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 645         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 646       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 647 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 648       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 649         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 650         that we can import de shadow classes without errors].
 651 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 652       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 653       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 654       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 655       * src/Makefile prepared for python wrapping
 656 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 657       * src/gdcmHeader.cxx :
 658         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 659           (see gdcmHeader::LoadElements).
 660         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 661           ReadInt16 and ReadInt32)
 662 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 663       * src/gdcmHeader.cxx :
 664         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 665           method.
 666         - SetLgrElem renamed to SetLength
 667         - GetLgrElem renamed to GetLength
 668         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 669       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 670       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 671         due to IdoDude was cleaned out.
 672 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 673       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 674         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 675         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 676         returning the unecessary skL (skipped length).
 677         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 678         it was redundant with the File position internals (by using
 679         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 680         jajun.
 681       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 682         on the libido specificities which are handled through class
 683         inheritance.
 684       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 685         added.
 686 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 687       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 688         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 689 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 690       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 691 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 692       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 693         and _IdDcmSWAP_LONG.
 694 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 695       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 696         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 697