]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
3      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
4      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the 
5      DocEntryArchive
6    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
7      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
8      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
9    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
10      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
11
12 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
13    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
14
15 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
16    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
17    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
18      the header.
19    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
20      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
21      write
22    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
23      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
24      is now on RGB datas (as before my last commit
25    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
26
27 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
28    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
29      Add a print information of the type of the entry
30    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
31      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
32    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
33      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
34    * Test/ : test on files are now made using Raw datas and not color datas if
35      any.
36    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
37
38 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
39    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
40      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
41      opened or not.
42
43 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
44    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
45      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
46    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
47      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
48      DocEntryArchive
49    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
50      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
51    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
52      - test the pixels written
53      - add test points to quickly find where is the error
54      - can set a file name input and output in arguments
55    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
56      amelioration of the test output
57
58 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
59    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
60      all replaced DocEntry's
61    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting datas.
62      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
63      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
64      header initial state.
65
66 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
67    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
68
69 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
71      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
72      then, it musn't change in the time.
73    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
74      header correctly. At this time, the change is only made for the first
75      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
76      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
77      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
78      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
79    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
80    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
81      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
82      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
83
84 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
85    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
86    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
87
88 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
89    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
90      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
91      is copied).
92    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
93      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
94    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
95
96 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
97    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
98      Two problems appear when doing it :
99       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
100         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
101         datas (pixels). And each structure destruct the datas when it's
102         destructed. So we have two destructions for the same datas. To solve it,
103         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
104         datas or not. If it doesn't own datas, then they will not destroyed by
105         the gdcmBinEntry.
106       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
107         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
108         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
109         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
110         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
111    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
112
113 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
114    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
115    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
116      squeeze method
117
118 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
119    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
120    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
121      after it have been deleted
122
123 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
124    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
125    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
126    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
127      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
128      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
129
130 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
131     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
132     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
133     3. Use const ref when possible
134     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
135     5. A few more comments
136     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
137
138 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
139   * ENH: Slightly bigger patch:
140     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
141     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
142     3. File was not close properly in gdcmDict
143     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
144     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
145     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
146     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
147     8. Do not repeat virtual in subclasses
148     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
149
150 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
151   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
152     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
153     of a null character as defined by standard
154   
155 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
156   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
157     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
158
159 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
160   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
161   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
162     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
163
164 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
165   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
166     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
167     a verbose message is generated.
168     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
169     correctly close is a call to CloseFile.
170     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
171   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
172     file. For an uncompressed image, the copied datas correspond in the least 
173     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
174     header. A verbose is generated if these two size mismatch
175
176 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
177   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
178     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
179     break under windows (with msvc6 compilation).
180
181 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
182   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
183     compiling with MSVC6)
184
185 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
186   * Bugs fix for the Windows build with VC6
187   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
188     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
189     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
190     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
191   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
192     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
193     gdcm.i file)
194   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
195     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
196     std::cerr of vtk.
197
198 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
199   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
200   * gdcmPython/gdcm.i:
201     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
202     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
203       NOT need to be wrapped anymore.
204   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
205     DicomDir::Method) new example added.
206
207 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
208   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
209     A DicomString can contain as many \0 as they want
210     and it is *always* of even length.
211     We only support odd length for very rare case. 
212     And in the near future this should be removed.
213
214 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
215   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
216     little endian. This should -heopfully- fix some tests
217
218 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
219   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
220     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
221     the one comiled into lib
222
223 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
224   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
225     This should definitely solve any leak problem, and we should be
226     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
227
228 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
229   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
230   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
231   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
232   
233 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
234   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
235   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
236     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
237   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
238   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
239     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
240     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
241       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
242       no longer exists.
243
244 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
245   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
246    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
247    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
248    the class.
249   
250 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
251   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
252     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
253     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
254
255 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
256   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
257   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
258     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
259     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
260     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
261       CloseFile() anymore.
262     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
263       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
264       into File::Pixel_Data.
265
266 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
267   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
268     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
269   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
270     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
271     method:
272     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
273     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
274       method to those classes.
275     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
276       -- Added a ::Print() method.
277       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
278       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
279          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
280
281 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
282   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
283     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
284     doxygen.
285   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
286   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
287     pointlessly wrapped (see
288     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
289   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
290     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
291     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
292     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
293     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
294       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
295            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
296       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
297          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
298
299 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
300   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
301     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
302
303 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
304   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
305     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
306     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
307   * TODO added new entry.
308   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
309     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
310     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
311     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
312       variable names for semantical coherence.
313
314 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
315   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
316   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
317   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
318   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
319   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
320   compilation time jpeg option.
321
322 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
323   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
324     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
325     reproduce at home.
326   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
327   Thanks dcmtk crew !
328
329 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
330   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
331   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
332     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
333   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
334   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
335   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
336   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
337     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
338     from File:: to PixelConvert::.
339
340 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
341   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
342     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
343      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
344      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
345
346 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
347   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
348   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
349   like this:
350     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
351   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
352   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
353   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
354
355 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
356   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
357     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
358     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
359     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
360     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
361       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
362       (for the time being this is better than having them attach to
363        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
364     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
365       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
366     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
367       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
368       gdcmPixelConvert::
369
370 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
371   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
372   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
373     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
374       clean up of RLE related code. 
375   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
376     - src/gdcmRLE.cxx removed
377     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
378     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
379     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
380   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
381     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
382       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
383       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
384
385 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
386   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
387     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
388       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
389       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
390       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
391       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
392       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
393       offsets.
394   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
395     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
396         with the retired Parse7Fe0().
397     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
398     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
399
400 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
401   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
402     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
403     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
404     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
405   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
406     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
407       to return an unused length.
408
409 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
410   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
411     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
412     to use to do simple stuff.
413
414 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
415   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
416     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
417     copying of the file within different directory, configure header file to
418     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
419     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
420
421 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
422   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
423      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
424        with it's binary name).
425      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
426        the Website to be more complete.
427      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
428        doxygenated documentation.
429      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
430        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
431                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
432   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
433   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
434    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
435
436 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
437   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
438    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
439
440 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
441   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
442     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
443     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
444     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
445     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
446   * GDCMHOME clean up:
447     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
448       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
449       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
450   * Autotools clean up:
451     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
452     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
453
454 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
455   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
456   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
457   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
458
459 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
460   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
461     describing TODO entries and used it for new entries.
462   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
463     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
464     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
465   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
466     documentation itself, but the website) moved to html and
467     placed in directory Doc/Website:
468     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
469     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
470     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
471   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
472   * CMakeLists.txt changed accordingly.
473   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
474     DeveloppersPython.html
475   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
476
477 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
478   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
479     of gdcm Web site.
480
481 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
482   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
483     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
484     we can now delete[] it safely 
485   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
486     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
487   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
488
489 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
490   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
491     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
492     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
493     pointed content.
494
495 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
496   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
497   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
498
499 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
500   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
501     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
502     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
503     an example of usage.
504     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
505       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
506     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
507       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
508     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
509     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
510     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
511
512 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
513   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
514     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
515     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
516     in class 
517     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
518       and associated accessors. Doxygenation of the class.
519     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
520       accessors added.
521     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
522       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
523     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
524     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
525
526 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
527   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
528     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
529       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
530            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
531            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
532            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
533            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
534            the same group and element all share the same (group, element)
535            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
536            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
537            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
538            consider the following definition of a TagKey:
539            - let Group, Element be the string representation of the
540              group and element dicom tag members,
541            - let ItemNumber be the string representation of the integer
542              index of the considered item number of a sequence,
543            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
544            the form:
545               /ItemNumber#Group|Element
546            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
547            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
548               Group|Element<SeqTag>
549            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
550            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
551            string e.g.
552                0028|1201
553            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
554            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
555            string e.g.
556                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
557     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
558       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
559       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
560     - src/gdcmDocEntry.cxx:
561       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
562          Key member.
563       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
564     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
565     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
566       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
567       -- now has a new BaseTagKey member.
568       -- STYLE.
569   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
570     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
571     truly belongs.
572     This poses the problem with the semantics of the following lines
573        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
574        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
575        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
576     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
577     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
578     order to get things working the dicom dictionary was altered !
579     Please fix things urgently...
580   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
581     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
582     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
583     set to OW:
584       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
585       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
586       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
587   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
588     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
589   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
590
591 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
592   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
593
594 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
595   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
596     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
597   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
598   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
599
600 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
601   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
602     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
603   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
604     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
605   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
606     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
607   * TODO updated
608   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
609     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
610   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
611   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
612     exception_on_error parameter.
613     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
614     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
615     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
616
617 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
618   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
619   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
620     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
621   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
622   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
623   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
624     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
625   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
626
627 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
628   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
629     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
630
631 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
632   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
633        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
634  
635 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
636   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
637         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
638
639 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
640    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
641    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
642      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
643      is now in static in the gdcmDebug class
644    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
645    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
646
647 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
648    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
649      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
650    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
651      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
652      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
653      that displays position and size).
654    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
655      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
656      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
657      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
658      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
659      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
660      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
661         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
662      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
663      commiting changes).
664    * Test/CMakeLists.txt:
665       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
666       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
667         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
668         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
669    * TODO updated.
670
671 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
672    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
673      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
674      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
675      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
676      - removal of typedef duplication.
677      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
678      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
679    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
680       - printf polluting ctest removed.
681       - TAB removal for comminting
682    * Test:
683      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
684        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
685        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
686        this test creates them.
687        Note: we need to validate each reference image, but before that
688              I'd like to rename them with a more explicit name...
689      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
690    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
691      including each header needed).
692
693 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
694    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
695      test suite to the Example directory. Are concerned:
696      - PrintHeader.cxx
697      - TestDcm2Acr.cxx
698      - TestFindTags.cxx
699      - TestWrite.cxx was
700      - TestWriteSimple.cxx
701    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
702      image gdcmData/oldACR00001.ima
703
704 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
705    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
706      with removal from gdcmData):
707       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
708       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
709       - US.3405.1.dcm
710      Added the following because after last cvs update, they cause
711        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
712      to segfault:
713       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
714       - oldACR00001.ima
715    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
716      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
717      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
718      form of test...
719    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
720      we don't need to black list the following images anymore:
721       - 8BitsUncompressedColor.dcm
722       - OT-PAL-8-face.dcm
723       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
724    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
725      fixes and the beautified code ;-)
726      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
727      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
728      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
729            improve the test suite). The bug could be detected by using
730            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
731            or by using
732            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
733            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
734
735 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
736    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
737          - replace by uggly but working old code :-(
738    A lot of things should be OK again.
739    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
740    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
741    (twice, withing a fortnigh ...)      
742
743 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
744    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
745      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
746    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
747      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
748      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
749                    - OT-PAL-8-face.dcm
750                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
751    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
752      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
753      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
754      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
755      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
756      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
757      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
758      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
759      image.
760    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
761      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
762      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
763      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
764    
765 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
766   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
767   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
768                           (instead of infinite loop)
769   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
770
771 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
772    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
773
774 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
775    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
776            when SamplesPerPixel =3
777          - now Write is no longer confused by 
778           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
779          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
780                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
781    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
782            (in order to split the job that has not to be done 
783            for gdcmDicomDir)
784
785 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
786    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
787      loop on the same image until memory went out. 
788      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
789    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
790      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
791
792 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
793    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
794             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
795             is added a the end, when necessary.
796             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
797               now written correctly
798             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
799               (even for odd groups) 
800         Note : only Explicit Value Representation was checked.
801                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
802
803 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
804    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
805    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
806      coding style).
807
808 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
809    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
810      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
811    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
812
813 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
814    FIX : gdcmDocument.cxx
815       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
816         code 'beautyfication' :-(
817       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
818
819 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
820    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
821             : to allow user to create his own Sequences
822    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
823
824    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
825
826    - gdcmBinEntry
827      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
828   
829    - gdcmDocEntry
830      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
831      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
832   
833    - gdcmDocEntrySet
834      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
835      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
836      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
837      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
838      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
839      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
840                                             guint16 element,
841                                             std::string vr     = "unkn",
842                                             std::string fourth = "unkn",
843                                             std::string name   = "unkn"); 
844      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
845      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
846      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
847      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
848      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
849      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
850      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
851      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
852   
853    - gdcmDocument
854      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
855      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
856      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
857      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
858      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
859                                         FILE *_fp, FileType type);
860      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
861      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
862      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
863      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
864      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
865      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
866      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
867      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
868                                             guint16 element,
869                                             std::string vr     = "unkn",
870                                             std::string fourth = "unkn",
871                                             std::string name   = "unkn");
872      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
873      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
874      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
875      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
876                                                                                                                  
877         - gdcmElementSet
878           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
879           
880    - gdcmSeqEntry
881           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
882  
883    - gdcmSQItem
884      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
885      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
886      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
887      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
888
889    - gdcmValEntry
890          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
891                                   
892 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
893     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
894       The default constructor invoked by the line
895          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
896       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
897       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
898       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
899     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
900       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
901       Could anyone explain why ?
902     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
903       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
904       code related to gdcmBinEntry).
905
906 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
907     * In order to fix memory leaks:
908      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
909        some delete calls.
910      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
911      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
912        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
913        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
914        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
915      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
916      - src/gdcmDocument.cxx:
917        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
918           from dynamic stores.
919        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
920           was causing memory leaks.
921      - src/gdcmSQItem.cxx:
922        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
923           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
924        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
925           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
926           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
927           This avoids SegFaulting.
928      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
929     * Conclusion:
930      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
931        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
932        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
933      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
934        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
935      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
936        segfaults).
937     * Erroneous leading white fix:
938      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
939        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
940      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
941      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
942     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
943     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
944
945
946 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
947     * In order to fix writing of dicom files:
948      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
949      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
950      - src/gdcmDocument.cxx:
951        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
952        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
953        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
954           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
955           manner.
956        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
957           to only declared) and build on top of
958           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
959        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
960      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
961        for usage in destructor and treatement of promotion in
962        ::ReplaceOrCreateByNumber().
963      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
964       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
965     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
966       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
967       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
968       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
969
970 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
971     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
972       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
973       learned that:
974           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
975           soon as possible by globally disabling memory caching.
976           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
977           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
978       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
979       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
980       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
981     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
982       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
983       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
984       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
985         with 1.
986       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
987       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
988       understand why the list is empty...).
989     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
990     * Doc/License.txt added.
991
992 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
993     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
994       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
995         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
996         the padding problem.
997       - general clean up, simplification, and coding style.
998       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
999     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1000
1001 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1002    *  gdcmSeqEntry.cxx
1003            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1004                 - fix the display of SQItem ordinal number
1005       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1006                 - remove some useless never written private methods     
1007                 
1008 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1009    * gdcmBinEntry.cxx 
1010       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1011            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1012               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1013                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1014    * dcmDocument.cxx
1015       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1016               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1017            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1018       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1019    * gdcmFile.cxx
1020       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1021    * gdcmSQItem.h
1022       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1023             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1024             \warning : some pb remaining around this number
1025                                 will be solved asap
1026       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1027    * gdcmValEntry.cxx 
1028       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1029
1030 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1031     * Memory leak hunt with the following command:
1032       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1033                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1034       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1035       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1036       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1037           grep "MEMORY LEAK" src/*
1038       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1039       -----
1040           #include <string>
1041           int main() {
1042              std::string name;
1043              char * test = "babo";
1044              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1045                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1046              name.clear();   //// Doesn't help !
1047              return 0;
1048           }
1049       -----
1050           #include <string>
1051           #include <iostream>
1052           int main() {
1053              std::string line;
1054              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1055              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1056                                         //// of 1320 bytes in call to
1057                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1058             return 0;
1059           }
1060       -----
1061
1062
1063 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1064     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1065       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1066         and related, moved away to gdcmDocument.
1067       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1068         the corresponding protected accessors of inherited class
1069         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1070         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1071       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1072       - Clean up of undefined or unused methods.
1073     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1074       account the changes to gdcmHeader.h).
1075     * src/gdcmDocument.h:
1076       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1077         changes to gdcmHeader.h).
1078       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1079         (see changes to gdcmHeader.h).
1080       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1081       - Clean up of undefined or unused methods.
1082     * src/gdcmDocument.cxx:
1083       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1084       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1085       - some std::string properly set to VRKey
1086     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1087       references to gdcmDocument. 
1088     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1089     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1090       cvs repository gdcmData.
1091
1092 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1093     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1094     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1095       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1096     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1097     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1098       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1099     * src/gdcmDocument.cxx: 
1100       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1101         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1102       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1103         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1104         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1105         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1106         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1107               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1108               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1109     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1110     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1111       now taken into account.
1112     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1113       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1114     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1115       on posix.
1116     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1117       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1118     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1119
1120 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1121     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1122       gdcmGlob
1123     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1124     * src/gdcmUtil.h : export methods
1125
1126 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1127     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1128       to right behavior
1129     * Initial addition of automatic python testing
1130     * Initial addition of automatic image comparison
1131
1132 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1133     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1134       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1135
1136 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1137      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1138      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1139      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1140
1141 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1142      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1143        new concepts (and new classes) :
1144        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1145         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1146         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1147        a Sequence is composed of Items.
1148        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1149        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1150        (never taken into account)
1151        Our unability to add a new 'entry' in the header
1152        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1153        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1154        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1155        nothing is finished.
1156        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1157
1158 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1159      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1160      
1161 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1162      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1163        file prefix (SetFilePrefix)
1164
1165 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1166      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1167        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1168        baseline.
1169      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1170        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1171
1172 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1173      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1174        dicom image
1175
1176 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1177      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1178      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1179        between the developper and user version.
1180      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1181      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1182
1183 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1184      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1185        when using cmake.
1186
1187 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1188      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1189                src directory, now generated in the build dir.
1190             2. Tests as mentionned smarter
1191             3. Some clean up
1192             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1193           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1194           where we could set the institution name / patient name...
1195
1196        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1197               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1198                  (this was not true before)
1199
1200 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1201      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1202            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1203      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1204            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1205            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1206      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1207            tree-like structure of a Dicom Header.
1208      * FIX Test code cleaning     
1209            
1210 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1211      * ENH: Adding automatic testing
1212        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1213        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1214        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1215        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1216           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1217           too many projects
1218      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1219      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1220        one file instead of seven + some small cleanup
1221
1222 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1223      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1224      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1225            Header printing. Example given with :
1226            > PrintHeader fileName  2 new
1227           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1228            
1229 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1230      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1231          1. I have added some unsigned where needed
1232          2. Some function parameter not used -> (void)
1233          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1234          4. g++ don't like character '\' in comment
1235          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1236                     this really need to be fixed
1237          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1238          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1239                     this also really need to be fixed
1240          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1241                     remove compression file 
1242                     (as we only do decompression, right ?)     
1243      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1244
1245 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1246      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1247            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1248            defaulted to yspacing
1249            
1250 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1251      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1252      * ENH add parameters :
1253                bool  exception_on_error = false, 
1254                bool  enable_sequences   = false,
1255                bool  ignore_shadow      = false
1256            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1257      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1258            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1259               
1260 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1261      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1262      
1263 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1264      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1265      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1266              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1267              
1268 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1269      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1270          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1271
1272 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1273      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1274        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1275        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1276        in gdcmHeader.
1277      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1278        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1279        already does the job.
1280      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1281        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1282
1283 2004-03-30 Benoit Regrain
1284      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1285        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1286        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1287
1288 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1289      * ENH : Check on file type to be written moved
1290              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1291      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1292              when end-of-list is reached
1293            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1294
1295 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1296      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1297      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1298      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1299        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1300
1301 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1302      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1303        now contains all the gdcmGlobal related code.
1304      * minor coding style and doxygenation changes.
1305
1306 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1307      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1308        now contains all the Debug related code.
1309      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1310      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1311        CreateCleanString) removed.
1312      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1313      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1314      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1315      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1316        src/gdcmDirList.cxx)
1317
1318 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1319      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1320
1321 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1322      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1323            big endian made volumes
1324      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1325            end user to instanciate class gdcmParser
1326           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1327
1328 2004-03-22 Benoit Regrain
1329      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1330      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1331              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1332
1333 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1334      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1335            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1336            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1337            or build from the files held (recursively) in a Directory
1338            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1339            gdcmObject::SetBoundaries() added
1340
1341 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1342      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1343                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1344      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1345            DICOMDIR
1346      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1347            about the name
1348
1349 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1350      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1351                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1352
1353 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1354      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1355            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1356            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1357            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1358            to allow making gdcDicomDir object.
1359      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1360           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1361
1362 2004-02-11 Benoit Regrain
1363      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1364              when using from python
1365
1366 2004-02-10 Benoit Regrain
1367      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1368      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1369      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1370              directory parsing
1371
1372 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1373      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1374              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1375              - class gdcmMeta created
1376      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1377              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1378      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1379
1380 2004-02-05 Benoit Regrain
1381      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1382              header entries
1383      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1384      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1385
1386 2004-02-04 Benoit Regrain
1387      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1388      * FIX : sort the images in the dicom dir
1389      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1390      * ADD : a python demo
1391
1392 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1393      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1394      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1395              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1396              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1397              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1398      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1399            to make full checking easier
1400         
1401 2004-02-04 Benoit Regrain
1402      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1403      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1404
1405 2004-02-03 Benoit Regrain
1406      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1407      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1408      * Bug fix and print add-on
1409
1410 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1411      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1412      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1413      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1414      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1415            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1416         
1417 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1418      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1419              iterator on last
1420              of the last synonym :-(
1421      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1422              for DICOMDIR ;-)
1423      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1424      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1425      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1426            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1427       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1428
1429 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1430      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1431            no longer writes 'Un' on disk
1432      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1433      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1434            the length (for Palette expanded images)
1435            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1436      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1437            (that broke Write). Replaced by UL.
1438            Aware user will reload the field if he 
1439            thinks it's necesssary
1440              
1441 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1442      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1443        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1444        IsReadable() methods.
1445        
1446      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1447       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1448       but so usefull for people that miss them ;-)
1449       
1450      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1451        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1452
1453 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1454      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1455
1456 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1457      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1458              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1459         The TRUE value for this param has to be used 
1460         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1461         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1462      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1463              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1464         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1465         
1466      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1467              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1468              Fixed
1469
1470      * gdcmHeader add the method
1471              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1472         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1473         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1474         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1475
1476 2004-01-26 Benoit Regrain
1477      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1478        in the print and add a third level of print to print them
1479
1480 2004-01-23 Benoit Regrain
1481      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1482      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1483      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1484        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1485
1486 2004-01-22 Benoit Regrain
1487      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1488      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1489
1490 2004-01-19 Benoit Regrain
1491      * Add the use of shadow dictionaries
1492      * bug fix and coding style
1493
1494 2004-01-19 Benoit Regrain
1495      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1496      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1497      * Add the update of header entries using the shadow library
1498
1499 2004-01-19 Benoit Regrain
1500      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1501      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1502        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1503        of dicom dir parsing
1504      * bug fix under python
1505
1506 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1507     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1508     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1509     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1510     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1511
1512 2004-01-15 Benoit Regrain
1513      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1514        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1515        when the gdcmDictSet will be destroyed
1516      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1517        gdcmDictSet
1518
1519 2004-01-15 Benoit Regrain
1520      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1521        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1522        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1523        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1524      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1525
1526 2004-01-14 Benoit Regrain
1527      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1528      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1529      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1530      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1531
1532 2004-01-13 Benoit Regrain
1533      * src/*.[h|cxx] : coding style
1534      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1535
1536 2004-01-13 Benoit Regrain
1537      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1538      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1539        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1540      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1541
1542 2004-01-12 Benoit Regrain
1543      * src/*.h : add comments
1544      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1545      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1546        directly setted in the source code
1547      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1548        gdcmTS and gdcmVR
1549
1550 2004-01-09 Benoit Regrain
1551      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1552      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1553
1554 2004-01-07 Benoit Regrain
1555      * Modification to compile with the distutils.
1556      * Bug fix in code
1557
1558 2003-12-10 Benoit Regrain
1559      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1560        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1561      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1562        made in the source code
1563
1564 2003-12-10 Benoit Regrain
1565      * Update Windows projects and .cvsignore files
1566
1567 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1568      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1569            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1570            if he wants to.
1571            gdcmElValSet:Print takes it into account
1572
1573 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1574      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1575      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1576      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1577
1578 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1579       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1580              on the ListTag listElem member,
1581              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1582       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1583              with the tagHt member and the listElem member.
1584              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1585
1586       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1587              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1588                             if bug fixing is necessary), for internal
1589                             use only
1590              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1591                             or to allow Parser going on.
1592              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1593              with a length (not 0000) is found
1594       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1595                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1596                 (to be written)
1597
1598 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1599      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1600      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1601           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1602      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1603
1604 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1605      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1606
1607 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1608      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1609           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1610
1611 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1612      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1613      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1614              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1615              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1616
1617 2003-11-05 Benoit Regrain
1618      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1619                        : Explicit error messages
1620      * in __init__.py  : Related modif
1621
1622 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1623      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1624            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1625            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1626      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1627                     (vtkGdcmReader compliant)           
1628       
1629 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1630      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1631        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1632        
1633 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1634      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1635            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1636
1637 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1638      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1639                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1640              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1641              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1642              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1643              such an image :
1644              After gdcmHeader :
1645               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1646               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1647               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1648      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1649              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1650
1651 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1652      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1653              
1654 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1655      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1656            being coherents dicom files.
1657      
1658 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1660            from medcon lib !
1661      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1662      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1663      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1664      * ENH: Add include dir to medcon lib
1665      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1666            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1667             
1668 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1669       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1670         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1671           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1672       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1673
1674 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1675       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1676         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1677         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1678       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1679       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1680
1681 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1682       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1683                                                
1684 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1685       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1686       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1687       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1688       
1689 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1690       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1691       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1692       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1693       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1694       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1695       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1696              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1697         But it fasten debug compilation time.
1698             
1699 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1700       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1701         (they are compressed as 2 planes images, 
1702          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1703
1704 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1705       * Now CheckRead takes into account :
1706          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1707          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1708       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1709        (breaks DicomWorks)
1710
1711 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1712       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1713              one should remove the '\'
1714         
1715 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1716       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1717         (wrong lengths in header)
1718         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1719       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1720         (breaks DicomWorks)
1721
1722 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1723       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1724         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1725
1726 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1727       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1728       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1729
1730 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1731       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1732      
1733 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1734       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1735         (the patch is easy to remove)
1736       * cosmetic changes to avoid warnings
1737       
1738 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1739       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1740         no need to press 'r' now.
1741    
1742 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1743       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1744         to new Jpeg Lossless decompressor
1745       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1746       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1747       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1748                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1749 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1750       * general anonymisation in gdcmData
1751       * adding the 'color files' from
1752         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1753       * adding some well knowed bugged-header images
1754       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1755         waiting for their inclusion in Python testsuite
1756
1757 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1758     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1759       no longer seg faults when file is not found
1760
1761 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1762      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1763        MultiFrame images
1764
1765 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1766      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1767
1768 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1769      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1770         OpenFile takes it into account
1771      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1772      * Missing elements added in dicomV3.dic
1773       (just to be affraid : have a look at
1774        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1775        and do it again next year ;->
1776
1777 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1778      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1779        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1780        But there are NOT. It's fixed !
1781        
1782 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1783      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1784      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1785          
1786 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1787      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1788              an ACR-NEMA / DICOM one.
1789      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1790              is not gdcm Readable
1791      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1792              is now decoded.
1793         
1794 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1795      * FIX: CMake generate now documentation
1796      * ENH: out of source doc build !
1797      * ENH: Generate both user and dev documentation
1798      * ENH: Should work on windows too
1799      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1800      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1801      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1802      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1803                      
1804 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1805      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1806      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1807      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1808         window level & window width
1809
1810 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1811      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1812      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1813      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1814      
1815 2003-10-06  Emanuel Ollart
1816      * FIX : compilation process wad broken.
1817              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1818         
1819 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1820      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1821      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1822      
1823 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1824      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1825            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1826                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1827       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1828
1829 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1830       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1831         to remain compliant with already defined strings, 
1832         like Transfert Syntax UID and others)
1833
1834 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1835       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1836              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1837         
1838 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1839       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1840       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1841
1842 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1843       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1844         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1845               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1846       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1847
1848 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1849       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1850
1851 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1852       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1853         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1854
1855 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1856       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1857          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1858          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1859          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1860           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1861                                             YBR_RCT files.
1862           (no sample found :-(
1863
1864 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1865       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1866         Two reasons: - clear things
1867                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1868                        suffer anymore VC++ complains
1869
1870 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1871       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1872       * removed leaks
1873
1874 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1875       * The lines are now eigthy characters long.for 
1876         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1877
1878 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1879       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1880         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1881         previous commis of Malaterre)
1882       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1883         before the last Malaterre's commit.
1884
1885 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1886       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1887         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1888       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1889         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1890
1891 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1892       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1893         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1894         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1895
1896 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1897       * Cosmetic changes:
1898         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1899           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1900           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1901           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1902         - PACKAGER corrected
1903         - DEVELOPPER added.
1904         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1905       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1906
1907 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1908       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1909
1910 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1911       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1912
1913 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1914       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1915
1916 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1917       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1918
1919 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1920       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1921         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1922         heuristics to get informations (look at different places).
1923       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1924         sorting DICOM images based on different strategies.
1925       * modified Makefiles accordingly.
1926
1927 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1928       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1929         when building in debug mode
1930       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1931         src/win32/gdcmdll.dsp
1932       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1933
1934 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1935       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1936             to valgrind.
1937
1938 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1939       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1940       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1941                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1942       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1943
1944 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1945       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1946         the file
1947       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1948       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1949         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1950       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1951         symbols... future problem ?
1952
1953 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1954       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1955       * modified gdcm.dsw accordingly
1956
1957 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1958       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1959
1960 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1961       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1962         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1963       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1964         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1965         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1966
1967 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1968       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1969
1970 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1971       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1972       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1973       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1974       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1975       * PACKAGER : adding all concerning windows
1976
1977 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1978       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1979         garbage debug code.
1980       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1981       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1982         test suite reported error.
1983       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1984         packaging a new release).
1985       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1986       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1987       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1988         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1989         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1990
1991 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1992       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1993       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1994
1995 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1996       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1997         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1998         is made in an internal list to prevent this problem.
1999         Bug fix when output is empty.
2000         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2001         correction.
2002       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2003
2004 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2005       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2006       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2007         files. Added method to remove all files on the input
2008         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2009         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2010
2011 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2012       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2013         when using make instal.
2014       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2015         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2016
2017 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2018       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2019       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2020
2021 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2022       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2023         linux and WINDOWS !
2024       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2025       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2026
2027 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2028       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2029         addon of the jpeg library)
2030       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2031       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2032       * INSTALL now points to web documentation
2033
2034 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2035       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2036         gdcmUtil.h anymore.
2037       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2038         clean target.
2039       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2040         - to allow compilation with gcc 3.x
2041           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2042           -- small fixes on exceptions.
2043           Note: linking not tested !
2044         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2045           building stage.
2046       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2047         dependent convertion).
2048
2049 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2050       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2051         Changelog):
2052         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2053         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2054           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2055         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2056
2057 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2058       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2059         compile
2060       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2061         (FileName -> Filename)
2062
2063 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2064       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2065         - UpdateProgress method should now be effective
2066         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2067           to volumes),
2068         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2069           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2070           accelerating things).
2071         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2072           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2073           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2074           in the stack (for the caller to notice the problem).
2075
2076 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2077       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2078
2079 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2080       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2081         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2082         under Windows... thanks Windows !)
2083
2084 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2085       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2086         debug stage).
2087       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2088
2089 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2090       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2091
2092 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2093       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2094         called with different flags than the default ones (with automake).
2095         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2096            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2097         and went for warning fixes:
2098         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2099           up from unused variables.
2100         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2101       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2102
2103 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2104       * gdcmPython/gdcm.i:
2105         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2106           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2107           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2108         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2109           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2110           exported to Python a as cvar.
2111       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2112         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2113         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2114         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2115         C++ static methods).
2116       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2117         with the above changes.
2118
2119 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2120       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2121
2122 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2123       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2124         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2125         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2126          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2127          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2128            a wrapper
2129          - Wrapper interface which wrap sources
2130         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2131         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2132       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2133         files for compilation
2134
2135 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2136       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2137         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2138         - vtk/Makefile.am now builds a library
2139         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2140           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2141           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2142           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2143           import library.
2144         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2145           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2146           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2147           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2148           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2149         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2150           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2151         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2152           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2153       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2154       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2155         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2156         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2157         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2158         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2159         collision of various stl members (principally cout...).
2160       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2161         file.
2162       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2163         comply with above changes)
2164
2165 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2166       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2167       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2168         vtk data structure (an image Flip was required).
2169       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2170       * cosmetic changes in documentation.
2171
2172 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2173       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2174         unexisting file is given as argument.
2175       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2176         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2177         containing those images is now available at
2178           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2179         with the name gdcmData.
2180         All the python scripts (including the package initialisation file
2181         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2182         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2183
2184 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2185       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2186         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2187         demo of the usage of this class.
2188         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2189         at configure (or autogen.sh) stage.
2190
2191 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2192       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2193         Notes on valgrind:
2194           - maximum info is obtained with a command of the form:
2195             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2196                      --show-reachable=yes PrintHeader
2197           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2198             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2199             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2200             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2201              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2202       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2203         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2204         Note: some images don't seem to work e.g.
2205             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2206       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2207         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2208         make gdcm more thread friendly.
2209
2210 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2211       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2212           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2213         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2214           gdcmHeader::_dicom_vr.
2215         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2216         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2217           VRHT*.
2218         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2219
2220 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2221       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2222         make install stage.
2223
2224 2003-04-9 JPR
2225       * UpdateGroupLength replaced by new one
2226
2227 2003-04-7 JPR
2228       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2229         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2230
2231 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2232       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2233       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2234       * src:
2235         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2236         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2237           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2238         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2239           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2240           carried the same semantics.
2241           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2242         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2243           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2244         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2245       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2246       * gdcmGetXSize added
2247       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2248       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2249
2250 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2251       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2252         (to avoid double call by end user).
2253       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2254         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2255
2256 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2257       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2258         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2259           the html.users end users oriented documentation and
2260           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2261           oriented documentation.
2262         - README changed accordingly
2263         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2264         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2265           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2266         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2267           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2268           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2269       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2270         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2271       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2272         ill-formed documentation sections.
2273       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2274
2275 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2276       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2277       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2278         un*ces with sh-utils test utility.
2279       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2280       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2281       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2282       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2283       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2284
2285 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2286       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2287       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2288
2289 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2290       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2291       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2292       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2293       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2294         compilation work.
2295       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2296       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2297
2298 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2299       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2300         hence the user doesn't need this explicit call.
2301         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2302           i.e. LoadElements() call removed.
2303       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2304         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2305       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2306         for adding user defined new tags.
2307         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2308         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2309           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2310
2311 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2312       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2313         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2314         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2315         with the autotools, included the python wrappers part.
2316       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2317
2318 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2319       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2320
2321 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2322       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2323         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2324         for usage).
2325       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2326         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2327         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2328       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2329         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2330
2331 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2332       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2333         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2334         value of GDCM_DICT_PATH.
2335       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2336
2337 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2338       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2339       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2340       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2341         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2342         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2343
2344 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2345       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2346         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2347         gdcmHeader.h
2348       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2349         (as opposed to gdcm.h)
2350       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2351       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2352         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2353       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2354
2355 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2356       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2357         bug.
2358
2359 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2360       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2361         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2362         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2363         of hidding away the python related distutils specific files
2364         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2365         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2366         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2367         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2368
2369 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2370       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2371       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2372         among the list of sources.
2373
2374 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2375       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2376       * modifications in MSVC projects
2377
2378 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2379       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2380         looks like we can move back to original usage of exception within
2381         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2382         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2383       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2384         README file for usage added.
2385       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2386         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2387         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2388         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2389       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2390       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2391         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2392           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2393           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2394           instance of class gdcmHeader.
2395         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2396           require no instances at all to be invocated.
2397         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2398           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2399           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2400       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2401         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2402       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2403         the above to be effective.
2404       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2405         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2406       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2407         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2408         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2409         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2410         (for python dectection).
2411       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2412         now avoids publishing the empty entries.
2413
2414 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2415       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2416         ExtraPath reused :-P
2417       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2418
2419 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2420       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2421       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2422       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2423         and links
2424
2425 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2426       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2427         method. Doxygenation.
2428       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2429
2430 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2431       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2432         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2433         when using "python setup.py install".
2434       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2435         reexports the working classes.
2436       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2437         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2438         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2439         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2440         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2441         subdir (see the README file). This problem probably due to
2442         an combination of g++ and dynamic loading.
2443       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2444
2445 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2446       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2447         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2448         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2449         again in a python subdir, but the package itself is now in
2450         python/gdcmPython.
2451       * setup.py was cleaned up:
2452         - pythonIncludePath removed
2453         - python setup.py bdist target is now functional.
2454       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2455         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2456         accordingly.
2457
2458 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2459       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2460       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2461         distutils installer is operational.
2462       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2463           shadow classes (from gdcm.py).
2464         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2465           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2466         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2467
2468 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2469       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2470         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2471         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2472         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2473         dictionary.
2474         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2475           are now in the "???" group.
2476         - python/gdcm.i changed accordingly,
2477         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2478           of the above new functionalities in Python.
2479
2480 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2481       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2482         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2483           were definitively removed.
2484         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2485       * src/gdcmElValSet.cxx:
2486         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2487         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2488         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2489         - Added GetElementByName(string).
2490       * src/gdcmHeader.cxx: added
2491         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2492         - GetPubElValRepByName(string)
2493         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2494         - GetShaElValRepByName(string)
2495         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2496         - GetShaElValRepByName(string)
2497         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2498         - GetElValRepByName(string)
2499         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2500         - GetElValRepByName(string)
2501       * Doc/requirements.txt added.
2502
2503 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2504       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2505       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2506         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2507         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2508         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2509       * python/testSuite.py changed accordingly.
2510
2511 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2512       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2513         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2514              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2515               cannot be exported. [...]
2516               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2517               be exported. [...]
2518               This is caused by a designed limitation that once a template
2519               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2520               exported."
2521         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2522         limitation" of VC++ is a pitfall.
2523         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2524         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2525         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2526         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2527         library.
2528         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2529       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2530          dll under windows !!!!)
2531       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2532       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2533         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2534       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2535         (one) of image(s).
2536       * removed glib references
2537       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2538
2539 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2540       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2541         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2542         the files of the testsuite without using unittest.
2543       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2544       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2545       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2546         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2547
2548 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2549       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2550         values, but limits itself to values which are below a user specified
2551         size (by default 1024 bytes).
2552       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2553         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2554         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2555         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2556       * python/testSuite.py
2557         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2558         - two new examples added.
2559       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2560
2561 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2562       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2563         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2564       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2565       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2566       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2567
2568 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2569       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2570         the vr was also RET.
2571       * python/testSuite.py more tests added.
2572
2573 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2574       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2575       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2576       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2577         7.18 Integer types (see stdint.h)
2578         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2579       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2580         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2581         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2582         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2583         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2584         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2585         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2586         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2587
2588 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2589       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2590         VR files.
2591       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2592
2593 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2594       * Adaptation for porting to VC++:
2595         - src/gdcm.h
2596           o forced to use std namespace (for string to be known)
2597           o all class use __declspec export style on WIN32
2598         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2599           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2600       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2601         variable GDCM_DICT_PATH.
2602       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2603
2604 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2605       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2606         to native Python dictionary.
2607       * python/demo/test.py:
2608         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2609         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2610       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2611         PubElVals hashing table.
2612       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2613
2614 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2615       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2616         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2617       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2618       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2619       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2620         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2621       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2622
2623 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2624       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2625         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2626         that we can import de shadow classes without errors].
2627
2628 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2629       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2630       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2631       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2632       * src/Makefile prepared for python wrapping
2633
2634 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2635       * src/gdcmHeader.cxx :
2636         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2637           (see gdcmHeader::LoadElements).
2638         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2639           ReadInt16 and ReadInt32)
2640
2641 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2642       * src/gdcmHeader.cxx :
2643         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2644           method.
2645         - SetLgrElem renamed to SetLength
2646         - GetLgrElem renamed to GetLength
2647         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2648       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2649       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2650         due to IdoDude was cleaned out.
2651
2652 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2653       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2654         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2655         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2656         returning the unecessary skL (skipped length).
2657         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2658         it was redundant with the File position internals (by using
2659         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2660         jajun.
2661       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2662         on the libido specificities which are handled through class
2663         inheritance.
2664       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2665         added.
2666
2667 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2668       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2669         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2670
2671 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2672       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2673
2674 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2675       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2676         and _IdDcmSWAP_LONG.
2677
2678 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2679       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2680         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2681