]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
3      test suite to the Example directory. Are concerned:
4      - PrintHeader.cxx
5      - TestDcm2Acr.cxx
6      - TestFindTags.cxx
7      - TestWrite.cxx was
8      - TestWriteSimple.cxx
9    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
10      image gdcmData/oldACR00001.ima
11
12 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
13    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
14      with removal from gdcmData):
15       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
16       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
17       - US.3405.1.dcm
18      Added the following because after last cvs update, they cause
19        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
20      to segfault:
21       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
22       - oldACR00001.ima
23    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
24      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
25      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
26      form of test...
27    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
28      we don't need to black list the following images anymore:
29       - 8BitsUncompressedColor.dcm
30       - OT-PAL-8-face.dcm
31       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
32    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
33      fixes and the beautified code ;-)
34      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
35      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
36      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
37            improve the test suite). The bug could be detected by using
38            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
39            or by using
40            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
41            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
42
43 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
44    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
45          - replace by uggly but working old code :-(
46                 A lot of things should be OK again.
47         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
48         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
49         (twice, withing a fortnigh ...)         
50
51 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
52    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
53      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
54    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
55      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
56      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
57                    - OT-PAL-8-face.dcm
58                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
59    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
60      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
61      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
62      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
63      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
64      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
65      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
66      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
67      image.
68    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
69      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
70      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
71      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
72    
73 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
74   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
75   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
76                           (instead of infinite loop)
77   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
78
79 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
80    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
81
82 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
83    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
84                     when SamplesPerPixel =3
85          - now Write is no longer confused by 
86                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
87          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
88                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
89    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
90                     (in order to split the job that has not to be done 
91                                         for gdcmDicomDir)
92
93 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
94    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
95      loop on the same image until memory went out. 
96      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
97    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
98      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
99
100 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
101    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
102             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
103                                 is added a the end, when necessary.
104             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
105                       now written correctly
106                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
107                                 (even for odd groups) 
108         Note : only Explicit Value Representation was checked.
109                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
110
111 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
112    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
113    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
114      coding style).
115
116 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
117    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
118      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
119    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
120
121 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
122    FIX : gdcmDocument.cxx
123       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
124         code 'beautyfication' :-(
125       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
126
127 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
128    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
129                  : to allow user to create his own Sequences
130         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
131
132 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
133         
134         - gdcmBinEntry
135           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
136           
137    - gdcmDocEntry
138           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
139           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
140           
141         - gdcmDocEntrySet
142           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
143           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
144      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
145      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
146      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
147      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
148                                             guint16 element,
149                                             std::string vr     = "unkn",
150                                             std::string fourth = "unkn",
151                                             std::string name   = "unkn"); 
152           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
153      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
154      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
155      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
156      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
157      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
158           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
159      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
160           
161         - gdcmDocument
162      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
163      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
164      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
165      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
166      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
167                                         FILE *_fp, FileType type);
168      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
169      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
170      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
171      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
172      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
173      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
174      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
175      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
176                                             guint16 element,
177                                             std::string vr     = "unkn",
178                                             std::string fourth = "unkn",
179                                             std::string name   = "unkn");
180      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
181      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
182      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
183      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
184                                                                                                                  
185         - gdcmElementSet
186           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
187           
188    - gdcmSeqEntry
189           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
190  
191    - gdcmSQItem
192      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
193      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
194      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
195      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
196
197    - gdcmValEntry
198          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
199                                   
200 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
201     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
202       The default constructor invoked by the line
203          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
204       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
205       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
206       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
207     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
208       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
209       Could anyone explain why ?
210     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
211       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
212       code related to gdcmBinEntry).
213
214 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
215     * In order to fix memory leaks:
216      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
217        some delete calls.
218      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
219      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
220        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
221        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
222        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
223      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
224      - src/gdcmDocument.cxx:
225        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
226           from dynamic stores.
227        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
228           was causing memory leaks.
229      - src/gdcmSQItem.cxx:
230        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
231           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
232        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
233           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
234           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
235           This avoids SegFaulting.
236      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
237     * Conclusion:
238      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
239        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
240        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
241      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
242        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
243      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
244        segfaults).
245     * Erroneous leading white fix:
246      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
247        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
248      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
249      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
250     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
251     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
252
253
254 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
255     * In order to fix writing of dicom files:
256      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
257      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
258      - src/gdcmDocument.cxx:
259        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
260        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
261        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
262           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
263           manner.
264        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
265           to only declared) and build on top of
266           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
267        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
268      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
269        for usage in destructor and treatement of promotion in
270        ::ReplaceOrCreateByNumber().
271      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
272       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
273     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
274       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
275       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
276       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
277
278 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
279     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
280       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
281       learned that:
282           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
283           soon as possible by globally disabling memory caching.
284           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
285           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
286       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
287       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
288       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
289     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
290       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
291       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
292       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
293         with 1.
294       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
295       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
296       understand why the list is empty...).
297     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
298     * Doc/License.txt added.
299
300 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
301     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
302       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
303         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
304         the padding problem.
305       - general clean up, simplification, and coding style.
306       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
307     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
308
309 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
310    *  gdcmSeqEntry.cxx
311            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
312                 - fix the display of SQItem ordinal number
313       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
314                 - remove some useless never written private methods     
315                 
316 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
317    * gdcmBinEntry.cxx 
318       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
319            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
320               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
321                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
322    * dcmDocument.cxx
323       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
324               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
325            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
326       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
327    * gdcmFile.cxx
328       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
329    * gdcmSQItem.h
330       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
331             a (relative) Item identier inside a given Sequence
332             \warning : some pb remaining around this number
333                                 will be solved asap
334       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
335    * gdcmValEntry.cxx 
336       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
337
338 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
339     * Memory leak hunt with the following command:
340       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
341                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
342       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
343       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
344       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
345           grep "MEMORY LEAK" src/*
346       Here are two typical examples which I can't help fixing:
347       -----
348           #include <string>
349           int main() {
350              std::string name;
351              char * test = "babo";
352              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
353                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
354              name.clear();   //// Doesn't help !
355              return 0;
356           }
357       -----
358           #include <string>
359           #include <iostream>
360           int main() {
361              std::string line;
362              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
363              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
364                                         //// of 1320 bytes in call to
365                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
366             return 0;
367           }
368       -----
369
370
371 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
372     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
373       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
374         and related, moved away to gdcmDocument.
375       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
376         the corresponding protected accessors of inherited class
377         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
378         declared friend of class gdcmDocument (see below).
379       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
380       - Clean up of undefined or unused methods.
381     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
382       account the changes to gdcmHeader.h).
383     * src/gdcmDocument.h:
384       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
385         changes to gdcmHeader.h).
386       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
387         (see changes to gdcmHeader.h).
388       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
389       - Clean up of undefined or unused methods.
390     * src/gdcmDocument.cxx:
391       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
392       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
393       - some std::string properly set to VRKey
394     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
395       references to gdcmDocument. 
396     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
397     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
398       cvs repository gdcmData.
399
400 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
401     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
402     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
403       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
404     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
405     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
406       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
407     * src/gdcmDocument.cxx: 
408       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
409         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
410       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
411         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
412         removed. Reverting to previous code segment with the proper
413         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
414         Note: this was (partially) breaking the python test suite
415               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
416               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
417     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
418     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
419       now taken into account.
420     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
421       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
422     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
423       on posix.
424     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
425       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
426     * .... alas, the python testSuite is still broken.
427
428 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
429     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal 
430       gdcmGlob
431     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
432     * src/gdcmUtil.h : export methods
433
434 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
435     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
436       to right behavior
437     * Initial addition of automatic python testing
438     * Initial addition of automatic image comparison
439
440 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
441     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
442       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
443
444 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
445      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
446      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
447      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
448
449 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
450      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
451        new concepts (and new classes) :
452        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
453         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
454         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
455        a Sequence is composed of Items.
456        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
457        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
458        (never taken into account)
459        Our unability to add a new 'entry' in the header
460        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
461        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
462        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
463        nothing is finished.
464        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
465
466 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
467      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
468      
469 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
470      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
471        file prefix (SetFilePrefix)
472
473 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
474      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
475        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
476        baseline.
477      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
478        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
479
480 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
481      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
482        dicom image
483
484 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
485      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
486      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
487        between the developper and user version.
488      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
489      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
490
491 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
492      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
493        when using cmake.
494
495 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
496      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
497                src directory, now generated in the build dir.
498             2. Tests as mentionned smarter
499             3. Some clean up
500             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
501           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
502           where we could set the institution name / patient name...
503
504        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
505               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
506                  (this was not true before)
507
508 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
509      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
510            SeQuence indented printing of Dicom Header.
511      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
512            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
513            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
514      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
515            tree-like structure of a Dicom Header.
516      * FIX Test code cleaning     
517            
518 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
519      * ENH: Adding automatic testing
520        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
521        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
522        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
523        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
524           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
525           too many projects
526      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
527      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
528        one file instead of seven + some small cleanup
529
530 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
531      * ENH Minor changes to the Print() methods.
532      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
533            Header printing. Example given with :
534            > PrintHeader fileName  2 new
535           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
536            
537 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
538      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
539          1. I have added some unsigned where needed
540          2. Some function parameter not used -> (void)
541          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
542          4. g++ don't like character '\' in comment
543          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
544                     this really need to be fixed
545          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
546          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
547                     this also really need to be fixed
548          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
549                     remove compression file 
550                     (as we only do decompression, right ?)     
551      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
552
553 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
554      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
555            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
556            defaulted to yspacing
557            
558 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
559      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
560      * ENH add parameters :
561                bool  exception_on_error = false, 
562                bool  enable_sequences   = false,
563                bool  ignore_shadow      = false
564            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
565      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
566            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
567               
568 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
569      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
570      
571 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
572      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
573      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
574              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
575              
576 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
577      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
578          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
579
580 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
582        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
583        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
584        in gdcmHeader.
585      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
586        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
587        already does the job.
588      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
589        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
590
591 2004-03-30 Benoit Regrain
592      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
593        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
594        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
595
596 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
597      * ENH : Check on file type to be written moved
598              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
599      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
600              when end-of-list is reached
601            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
602
603 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
604      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
605      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
606      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
607        equivalent to ExplicitVR in existing code).
608
609 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
610      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
611        now contains all the gdcmGlobal related code.
612      * minor coding style and doxygenation changes.
613
614 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
615      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
616        now contains all the Debug related code.
617      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
618      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
619        CreateCleanString) removed.
620      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
621      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
622      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
623      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
624        src/gdcmDirList.cxx)
625
626 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
627      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
628
629 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
630      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
631            big endian made volumes
632      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
633            end user to instanciate class gdcmParser
634           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
635
636 2004-03-22 Benoit Regrain
637      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
638      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
639              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
640
641 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
642      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
643            an already existing DICOMDIR file is consistent with
644            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
645            or build from the files held (recursively) in a Directory
646            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
647            gdcmObject::SetBoundaries() added
648
649 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
650      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
651                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
652      * FIX now file names and directory name are written properly in the
653            DICOMDIR
654      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
655            about the name
656
657 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
659                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
660
661 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
662      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
663            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
664            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
665            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
666            to allow making gdcDicomDir object.
667      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
668           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
669
670 2004-02-11 Benoit Regrain
671      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
672              when using from python
673
674 2004-02-10 Benoit Regrain
675      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
676      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
677      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
678              directory parsing
679
680 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
681      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
682              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
683              - class gdcmMeta created
684      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
685              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
686      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
687
688 2004-02-05 Benoit Regrain
689      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
690              header entries
691      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
692      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
693
694 2004-02-04 Benoit Regrain
695      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
696      * FIX : sort the images in the dicom dir
697      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
698      * ADD : a python demo
699
700 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
701      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
702      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
703              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
704              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
705              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
706      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
707            to make full checking easier
708         
709 2004-02-04 Benoit Regrain
710      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
711      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
712
713 2004-02-03 Benoit Regrain
714      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
715      * gdcmDicomDir : add the load of directory
716      * Bug fix and print add-on
717
718 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
719      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
720      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
721      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
722      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
723            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
724         
725 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
726      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
727              iterator on last
728              of the last synonym :-(
729      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
730              for DICOMDIR ;-)
731      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
732      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
733      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
734            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
735       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
736
737 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
738      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
739            no longer writes 'Un' on disk
740      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
741      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
742            the length (for Palette expanded images)
743            and Raw Length (non expanded image + Palette)
744      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
745            (that broke Write). Replaced by UL.
746            Aware user will reload the field if he 
747            thinks it's necesssary
748              
749 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
750      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
751        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
752        IsReadable() methods.
753        
754      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
755       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
756       but so usefull for people that miss them ;-)
757       
758      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
759        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
760
761 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
762      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
763
764 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
765      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
766              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
767         The TRUE value for this param has to be used 
768         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
769         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
770      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
771              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
772         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
773         
774      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
775              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
776              Fixed
777
778      * gdcmHeader add the method
779              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
780         to get *all* the Header Entries with the same tag.
781         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
782         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
783
784 2004-01-26 Benoit Regrain
785      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
786        in the print and add a third level of print to print them
787
788 2004-01-23 Benoit Regrain
789      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
790      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
791      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
792        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
793
794 2004-01-22 Benoit Regrain
795      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
796      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
797
798 2004-01-19 Benoit Regrain
799      * Add the use of shadow dictionaries
800      * bug fix and coding style
801
802 2004-01-19 Benoit Regrain
803      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
804      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
805      * Add the update of header entries using the shadow library
806
807 2004-01-19 Benoit Regrain
808      * removal of file gdcmHeader2.cxx
809      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
810        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
811        of dicom dir parsing
812      * bug fix under python
813
814 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
815     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
816     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
817     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
818     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
819
820 2004-01-15 Benoit Regrain
821      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
822        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
823        when the gdcmDictSet will be destroyed
824      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
825        gdcmDictSet
826
827 2004-01-15 Benoit Regrain
828      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
829        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
830        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
831        some memory and vtk seems to have some problems with that.
832      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
833
834 2004-01-14 Benoit Regrain
835      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
836      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
837      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
838      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
839
840 2004-01-13 Benoit Regrain
841      * src/*.[h|cxx] : coding style
842      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
843
844 2004-01-13 Benoit Regrain
845      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
846      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
847        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
848      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
849
850 2004-01-12 Benoit Regrain
851      * src/*.h : add comments
852      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
853      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
854        directly setted in the source code
855      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
856        gdcmTS and gdcmVR
857
858 2004-01-09 Benoit Regrain
859      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
860      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
861
862 2004-01-07 Benoit Regrain
863      * Modification to compile with the distutils.
864      * Bug fix in code
865
866 2003-12-10 Benoit Regrain
867      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
868        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
869      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
870        made in the source code
871
872 2003-12-10 Benoit Regrain
873      * Update Windows projects and .cvsignore files
874
875 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
876      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
877            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
878            if he wants to.
879            gdcmElValSet:Print takes it into account
880
881 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
882      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
883      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
884      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
885
886 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
887       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
888              on the ListTag listElem member,
889              not longer on the TagElValueHT tagHt member
890       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
891              with the tagHt member and the listElem member.
892              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
893
894       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
895              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
896                             if bug fixing is necessary), for internal
897                             use only
898              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
899                             or to allow Parser going on.
900              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
901              with a length (not 0000) is found
902       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
903                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
904                 (to be written)
905
906 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
907      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
908      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
909           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
910      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
911
912 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
913      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
914
915 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
916      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
917           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
918
919 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
920      * in testSuite.py : new files names for checking the package
921      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
922              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
923              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
924
925 2003-11-05 Benoit Regrain
926      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
927                        : Explicit error messages
928      * in __init__.py  : Related modif
929
930 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
931      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
932            to be used by aware (vtk) users that want to manage
933            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
934      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
935                     (vtkGdcmReader compliant)           
936       
937 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
938      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
939        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
940        
941 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
942      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
943            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
944
945 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
946      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
947                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
948              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
949              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
950              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
951              such an image :
952              After gdcmHeader :
953               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
954               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
955               GetImageDataRaw returns the gray Plane
956      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
957              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
958
959 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
960      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
961              
962 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
963      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
964            being coherents dicom files.
965      
966 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
967      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
968            from medcon lib !
969      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
970      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
971      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
972      * ENH: Add include dir to medcon lib
973      * FIX: only one function is being exported for now ! 
974            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
975             
976 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
977       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
978         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
979           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
980       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
981
982 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
983       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
984         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
985         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
986       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
987       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
988
989 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
990       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
991                                                
992 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
993       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
994       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
995       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
996       
997 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
998       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
999       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1000       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1001       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1002       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1003       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1004              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1005         But it fasten debug compilation time.
1006             
1007 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1008       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1009         (they are compressed as 2 planes images, 
1010          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1011
1012 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1013       * Now CheckRead takes into account :
1014          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1015          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1016       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1017        (breaks DicomWorks)
1018
1019 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1020       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1021              one should remove the '\'
1022         
1023 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1024       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1025         (wrong lengths in header)
1026         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1027       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1028         (breaks DicomWorks)
1029
1030 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1031       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1032         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1033
1034 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1035       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1036       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1037
1038 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1039       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1040      
1041 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1042       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1043         (the patch is easy to remove)
1044       * cosmetic changes to avoid warnings
1045       
1046 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1047       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1048         no need to press 'r' now.
1049    
1050 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1051       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1052         to new Jpeg Lossless decompressor
1053       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1054       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1055       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1056                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1057 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1058       * general anonymisation in gdcmData
1059       * adding the 'color files' from
1060         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1061       * adding some well knowed bugged-header images
1062       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1063         waiting for their inclusion in Python testsuite
1064
1065 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1066     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1067       no longer seg faults when file is not found
1068
1069 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1070      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1071        MultiFrame images
1072
1073 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1074      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1075
1076 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1077      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1078         OpenFile takes it into account
1079      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1080      * Missing elements added in dicomV3.dic
1081       (just to be affraid : have a look at
1082        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1083        and do it again next year ;->
1084
1085 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1086      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1087        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1088        But there are NOT. It's fixed !
1089        
1090 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1091      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1092      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1093          
1094 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1095      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1096              an ACR-NEMA / DICOM one.
1097      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1098              is not gdcm Readable
1099      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1100              is now decoded.
1101         
1102 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1103      * FIX: CMake generate now documentation
1104      * ENH: out of source doc build !
1105      * ENH: Generate both user and dev documentation
1106      * ENH: Should work on windows too
1107      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1108      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1109      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1110      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1111                      
1112 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1113      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1114      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1115      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1116         window level & window width
1117
1118 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1119      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1120      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1121      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1122      
1123 2003-10-06  Emanuel Ollart
1124      * FIX : compilation process wad broken.
1125              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1126         
1127 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1128      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1129      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1130      
1131 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1132      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1133            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1134                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1135       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1136
1137 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1138       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1139         to remain compliant with already defined strings, 
1140         like Transfert Syntax UID and others)
1141
1142 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1143       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1144              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1145         
1146 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1147       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1148       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1149
1150 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1151       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1152         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1153               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1154       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1155
1156 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1157       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1158
1159 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1160       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1161         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1162
1163 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1164       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1165          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1166          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1167          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1168           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1169                                             YBR_RCT files.
1170           (no sample found :-(
1171
1172 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1173       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1174         Two reasons: - clear things
1175                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1176                        suffer anymore VC++ complains
1177
1178 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1179       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1180       * removed leaks
1181
1182 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1183       * The lines are now eigthy characters long.for 
1184         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1185
1186 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1187       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1188         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1189         previous commis of Malaterre)
1190       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1191         before the last Malaterre's commit.
1192
1193 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1194       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1195         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1196       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1197         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1198
1199 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1200       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1201         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1202         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1203
1204 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1205       * Cosmetic changes:
1206         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1207           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1208           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1209           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1210         - PACKAGER corrected
1211         - DEVELOPPER added.
1212         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1213       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1214
1215 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1216       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1217
1218 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1219       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1220
1221 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1222       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1223
1224 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1225       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1226
1227 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1228       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1229         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1230         heuristics to get informations (look at different places).
1231       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1232         sorting DICOM images based on different strategies.
1233       * modified Makefiles accordingly.
1234
1235 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1236       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1237         when building in debug mode
1238       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1239         src/win32/gdcmdll.dsp
1240       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1241
1242 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1243       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1244             to valgrind.
1245
1246 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1247       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1248       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1249                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1250       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1251
1252 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1253       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1254         the file
1255       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1256       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1257         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1258       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1259         symbols... future problem ?
1260
1261 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1262       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1263       * modified gdcm.dsw accordingly
1264
1265 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1266       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1267
1268 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1269       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1270         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1271       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1272         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1273         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1274
1275 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1276       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1277
1278 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1279       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1280       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1281       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1282       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1283       * PACKAGER : adding all concerning windows
1284
1285 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1286       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1287         garbage debug code.
1288       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1289       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1290         test suite reported error.
1291       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1292         packaging a new release).
1293       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1294       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1295       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1296         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1297         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1298
1299 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1300       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1301       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1302
1303 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1304       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1305         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1306         is made in an internal list to prevent this problem.
1307         Bug fix when output is empty.
1308         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1309         correction.
1310       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1311
1312 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1313       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1314       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1315         files. Added method to remove all files on the input
1316         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1317         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1318
1319 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1320       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1321         when using make instal.
1322       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1323         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1324
1325 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1326       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1327       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1328
1329 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1330       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1331         linux and WINDOWS !
1332       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1333       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1334
1335 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1336       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1337         addon of the jpeg library)
1338       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1339       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1340       * INSTALL now points to web documentation
1341
1342 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1343       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1344         gdcmUtil.h anymore.
1345       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1346         clean target.
1347       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1348         - to allow compilation with gcc 3.x
1349           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1350           -- small fixes on exceptions.
1351           Note: linking not tested !
1352         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1353           building stage.
1354       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1355         dependent convertion).
1356
1357 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1358       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1359         Changelog):
1360         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1361         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1362           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1363         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1364
1365 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1366       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1367         compile
1368       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1369         (FileName -> Filename)
1370
1371 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1372       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1373         - UpdateProgress method should now be effective
1374         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1375           to volumes),
1376         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1377           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1378           accelerating things).
1379         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1380           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1381           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1382           in the stack (for the caller to notice the problem).
1383
1384 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1385       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1386
1387 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1388       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1389         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1390         under Windows... thanks Windows !)
1391
1392 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1393       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1394         debug stage).
1395       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1396
1397 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1398       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1399
1400 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1401       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1402         called with different flags than the default ones (with automake).
1403         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1404            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1405         and went for warning fixes:
1406         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1407           up from unused variables.
1408         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1409       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1410
1411 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1412       * gdcmPython/gdcm.i:
1413         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1414           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1415           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1416         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1417           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1418           exported to Python a as cvar.
1419       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1420         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1421         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1422         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1423         C++ static methods).
1424       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1425         with the above changes.
1426
1427 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1428       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1429
1430 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1431       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1432         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1433         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1434          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1435          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1436            a wrapper
1437          - Wrapper interface which wrap sources
1438         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1439         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1440       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1441         files for compilation
1442
1443 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1444       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1445         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1446         - vtk/Makefile.am now builds a library
1447         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1448           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1449           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1450           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1451           import library.
1452         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1453           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1454           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1455           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1456           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1457         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1458           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1459         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1460           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1461       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1462       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1463         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1464         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1465         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1466         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1467         collision of various stl members (principally cout...).
1468       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1469         file.
1470       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1471         comply with above changes)
1472
1473 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1474       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1475       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1476         vtk data structure (an image Flip was required).
1477       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1478       * cosmetic changes in documentation.
1479
1480 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1481       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1482         unexisting file is given as argument.
1483       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1484         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1485         containing those images is now available at
1486           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1487         with the name gdcmData.
1488         All the python scripts (including the package initialisation file
1489         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1490         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1491
1492 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1493       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1494         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1495         demo of the usage of this class.
1496         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1497         at configure (or autogen.sh) stage.
1498
1499 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1500       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1501         Notes on valgrind:
1502           - maximum info is obtained with a command of the form:
1503             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1504                      --show-reachable=yes PrintHeader
1505           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1506             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1507             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1508             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1509              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1510       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1511         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1512         Note: some images don't seem to work e.g.
1513             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1514       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1515         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1516         make gdcm more thread friendly.
1517
1518 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1519       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1520           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1521         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1522           gdcmHeader::_dicom_vr.
1523         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1524         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1525           VRHT*.
1526         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1527
1528 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1529       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1530         make install stage.
1531
1532 2003-04-9 JPR
1533       * UpdateGroupLength replaced by new one
1534
1535 2003-04-7 JPR
1536       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1537         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1538
1539 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1540       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1541       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1542       * src:
1543         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1544         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1545           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1546         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1547           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1548           carried the same semantics.
1549           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1550         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1551           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1552         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1553       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1554       * gdcmGetXSize added
1555       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1556       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1557
1558 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1559       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1560         (to avoid double call by end user).
1561       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1562         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1563
1564 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1565       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1566         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1567           the html.users end users oriented documentation and
1568           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1569           oriented documentation.
1570         - README changed accordingly
1571         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1572         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1573           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1574         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1575           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1576           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1577       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1578         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1579       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1580         ill-formed documentation sections.
1581       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1582
1583 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1584       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1585       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1586         un*ces with sh-utils test utility.
1587       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1588       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1589       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1590       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1591       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1592
1593 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1594       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1595       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1596
1597 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1598       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1599       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1600       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1601       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1602         compilation work.
1603       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1604       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1605
1606 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1607       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1608         hence the user doesn't need this explicit call.
1609         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1610           i.e. LoadElements() call removed.
1611       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1612         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1613       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1614         for adding user defined new tags.
1615         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1616         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1617           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1618
1619 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1620       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1621         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1622         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1623         with the autotools, included the python wrappers part.
1624       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1625
1626 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1627       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1628
1629 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1630       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1631         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1632         for usage).
1633       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1634         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1635         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1636       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1637         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1638
1639 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1640       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1641         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1642         value of GDCM_DICT_PATH.
1643       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1644
1645 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1646       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1647       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1648       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1649         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1650         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1651
1652 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1653       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1654         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1655         gdcmHeader.h
1656       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1657         (as opposed to gdcm.h)
1658       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1659       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1660         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1661       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1662
1663 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1664       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1665         bug.
1666
1667 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1669         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1670         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1671         of hidding away the python related distutils specific files
1672         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1673         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1674         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1675         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1676
1677 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1678       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1679       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1680         among the list of sources.
1681
1682 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1683       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1684       * modifications in MSVC projects
1685
1686 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1687       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1688         looks like we can move back to original usage of exception within
1689         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1690         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1691       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1692         README file for usage added.
1693       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1694         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1695         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1696         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1697       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1698       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1699         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1700           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1701           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1702           instance of class gdcmHeader.
1703         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1704           require no instances at all to be invocated.
1705         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1706           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1707           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1708       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1709         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1710       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1711         the above to be effective.
1712       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1713         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1714       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1715         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1716         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1717         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1718         (for python dectection).
1719       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1720         now avoids publishing the empty entries.
1721
1722 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1723       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1724         ExtraPath reused :-P
1725       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1726
1727 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1728       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1729       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1730       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1731         and links
1732
1733 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1734       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1735         method. Doxygenation.
1736       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1737
1738 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1739       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1740         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1741         when using "python setup.py install".
1742       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1743         reexports the working classes.
1744       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1745         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1746         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1747         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1748         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1749         subdir (see the README file). This problem probably due to
1750         an combination of g++ and dynamic loading.
1751       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1752
1753 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1754       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1755         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1756         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1757         again in a python subdir, but the package itself is now in
1758         python/gdcmPython.
1759       * setup.py was cleaned up:
1760         - pythonIncludePath removed
1761         - python setup.py bdist target is now functional.
1762       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1763         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1764         accordingly.
1765
1766 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1767       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1768       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1769         distutils installer is operational.
1770       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1771           shadow classes (from gdcm.py).
1772         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1773           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1774         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1775
1776 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1777       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1778         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1779         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1780         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1781         dictionary.
1782         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1783           are now in the "???" group.
1784         - python/gdcm.i changed accordingly,
1785         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1786           of the above new functionalities in Python.
1787
1788 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1789       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1790         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1791           were definitively removed.
1792         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1793       * src/gdcmElValSet.cxx:
1794         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1795         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1796         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1797         - Added GetElementByName(string).
1798       * src/gdcmHeader.cxx: added
1799         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1800         - GetPubElValRepByName(string)
1801         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1802         - GetShaElValRepByName(string)
1803         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1804         - GetShaElValRepByName(string)
1805         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1806         - GetElValRepByName(string)
1807         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1808         - GetElValRepByName(string)
1809       * Doc/requirements.txt added.
1810
1811 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1812       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1813       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1814         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1815         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1816         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1817       * python/testSuite.py changed accordingly.
1818
1819 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1820       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1821         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1822              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1823               cannot be exported. [...]
1824               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1825               be exported. [...]
1826               This is caused by a designed limitation that once a template
1827               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1828               exported."
1829         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1830         limitation" of VC++ is a pitfall.
1831         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1832         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1833         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1834         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1835         library.
1836         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1837       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1838          dll under windows !!!!)
1839       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1840       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1841         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1842       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1843         (one) of image(s).
1844       * removed glib references
1845       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1846
1847 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1848       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1849         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1850         the files of the testsuite without using unittest.
1851       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1852       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1853       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1854         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1855
1856 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1857       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1858         values, but limits itself to values which are below a user specified
1859         size (by default 1024 bytes).
1860       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1861         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1862         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1863         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1864       * python/testSuite.py
1865         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1866         - two new examples added.
1867       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1868
1869 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1870       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1871         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1872       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1873       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1874       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1875
1876 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1877       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1878         the vr was also RET.
1879       * python/testSuite.py more tests added.
1880
1881 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1882       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1883       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1884       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1885         7.18 Integer types (see stdint.h)
1886         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1887       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1888         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1889         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1890         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1891         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1892         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1893         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1894         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1895
1896 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1897       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1898         VR files.
1899       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1900
1901 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1902       * Adaptation for porting to VC++:
1903         - src/gdcm.h
1904           o forced to use std namespace (for string to be known)
1905           o all class use __declspec export style on WIN32
1906         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1907           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1908       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1909         variable GDCM_DICT_PATH.
1910       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1911
1912 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1913       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1914         to native Python dictionary.
1915       * python/demo/test.py:
1916         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1917         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1918       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1919         PubElVals hashing table.
1920       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1921
1922 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1923       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1924         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1925       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1926       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1927       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1928         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1929       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1930
1931 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1932       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1933         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1934         that we can import de shadow classes without errors].
1935
1936 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1937       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1938       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1939       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1940       * src/Makefile prepared for python wrapping
1941
1942 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1943       * src/gdcmHeader.cxx :
1944         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1945           (see gdcmHeader::LoadElements).
1946         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1947           ReadInt16 and ReadInt32)
1948
1949 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1950       * src/gdcmHeader.cxx :
1951         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1952           method.
1953         - SetLgrElem renamed to SetLength
1954         - GetLgrElem renamed to GetLength
1955         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1956       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1957       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1958         due to IdoDude was cleaned out.
1959
1960 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1961       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1962         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1963         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1964         returning the unecessary skL (skipped length).
1965         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1966         it was redundant with the File position internals (by using
1967         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1968         jajun.
1969       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1970         on the libido specificities which are handled through class
1971         inheritance.
1972       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1973         added.
1974
1975 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1976       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1977         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1978
1979 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1980       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1981
1982 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1983       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1984         and _IdDcmSWAP_LONG.
1985
1986 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1987       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1988         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1989