]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * src/ : fix compilation warnings for the Write method (2 different 
3      proto). So Rename 'Write(ifstream* fp' into 'WriteContent(ifstream* fp'
4      fix compilation warnings for the gdcm::Document::TransferSyntaxStrings
5      variable... create a static method in gdcm::Document to access to
6      this variable content.
7
8 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
9    * src/gdcmDocument.[h|cxx] : set the Transfert Syntax values to the header
10      file, to be accessed by other files (like gdcmFile). Remove commented
11      code. Move the change of the header to the gdcmFile, using the 
12      DocEntryArchive
13    * src/gdcmHeader.[h|cxx] : the write is completely made in the Header.
14      To be sure of that (and simplify calls), the Write of the header now
15      gets a file name and not a file pointer (std::ifstream).
16    * src/gdcmFile.[h|cxx] : apply the write file type to the header, using the
17      DocEntryArchive. Remove all open of the written file
18
19 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
20    * vtk/vtkGdcmReader.cxx : compilation bug fix for the vtk part
21
22 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
23    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
24    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
25      the header.
26    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
27      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
28      write
29    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
30      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
31      is now on RGB datas (as before my last commit
32    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
33
34 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
35    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
36      Add a print information of the type of the entry
37    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
38      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
39    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
40      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
41    * Test/ : test on files are now made using Raw datas and not color datas if
42      any.
43    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
44
45 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
46    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
47      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
48      opened or not.
49
50 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
51    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
52      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
53    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
54      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
55      DocEntryArchive
56    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
57      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
58    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
59      - test the pixels written
60      - add test points to quickly find where is the error
61      - can set a file name input and output in arguments
62    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
63      amelioration of the test output
64
65 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
66    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
67      all replaced DocEntry's
68    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting datas.
69      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
70      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
71      header initial state.
72
73 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
74    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
75
76 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
77    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
78      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
79      then, it musn't change in the time.
80    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
81      header correctly. At this time, the change is only made for the first
82      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
83      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
84      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
85      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
86    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
87    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
88      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
89      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
90
91 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
92    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
93    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
94
95 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
96    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
97      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
98      is copied).
99    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
100      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
101    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
102
103 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
104    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
105      Two problems appear when doing it :
106       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
107         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
108         datas (pixels). And each structure destruct the datas when it's
109         destructed. So we have two destructions for the same datas. To solve it,
110         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
111         datas or not. If it doesn't own datas, then they will not destroyed by
112         the gdcmBinEntry.
113       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
114         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
115         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
116         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
117         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
118    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
119
120 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
121    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
122    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
123      squeeze method
124
125 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
126    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
127    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
128      after it have been deleted
129
130 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
131    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
132    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
133    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
134      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
135      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
136
137 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
138     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
139     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
140     3. Use const ref when possible
141     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
142     5. A few more comments
143     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
144
145 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
146   * ENH: Slightly bigger patch:
147     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
148     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
149     3. File was not close properly in gdcmDict
150     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
151     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
152     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
153     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
154     8. Do not repeat virtual in subclasses
155     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
156
157 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
158   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
159     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
160     of a null character as defined by standard
161   
162 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
163   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
164     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
165
166 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
167   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
168   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
169     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
170
171 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
172   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
173     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
174     a verbose message is generated.
175     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
176     correctly close is a call to CloseFile.
177     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
178   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
179     file. For an uncompressed image, the copied datas correspond in the least 
180     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
181     header. A verbose is generated if these two size mismatch
182
183 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
184   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
185     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
186     break under windows (with msvc6 compilation).
187
188 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
189   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
190     compiling with MSVC6)
191
192 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
193   * Bugs fix for the Windows build with VC6
194   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
195     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
196     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
197     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
198   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
199     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
200     gdcm.i file)
201   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
202     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
203     std::cerr of vtk.
204
205 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
206   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
207   * gdcmPython/gdcm.i:
208     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
209     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
210       NOT need to be wrapped anymore.
211   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
212     DicomDir::Method) new example added.
213
214 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
215   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
216     A DicomString can contain as many \0 as they want
217     and it is *always* of even length.
218     We only support odd length for very rare case. 
219     And in the near future this should be removed.
220
221 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
222   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
223     little endian. This should -heopfully- fix some tests
224
225 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
226   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
227     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
228     the one comiled into lib
229
230 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
231   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
232     This should definitely solve any leak problem, and we should be
233     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
234
235 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
236   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
237   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
238   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
239   
240 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
241   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
242   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
243     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
244   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
245   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
246     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
247     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
248       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
249       no longer exists.
250
251 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
252   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
253    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
254    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
255    the class.
256   
257 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
258   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
259     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
260     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
261
262 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
263   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
264   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
265     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
266     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
267     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
268       CloseFile() anymore.
269     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
270       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
271       into File::Pixel_Data.
272
273 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
274   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
275     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
276   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
277     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
278     method:
279     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
280     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
281       method to those classes.
282     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
283       -- Added a ::Print() method.
284       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
285       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
286          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
287
288 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
289   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
290     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
291     doxygen.
292   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
293   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
294     pointlessly wrapped (see
295     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
296   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
297     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
298     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
299     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
300     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
301       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
302            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
303       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
304          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
305
306 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
307   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
308     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
309
310 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
311   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
312     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
313     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
314   * TODO added new entry.
315   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
316     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
317     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
318     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
319       variable names for semantical coherence.
320
321 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
322   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
323   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
324   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
325   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
326   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
327   compilation time jpeg option.
328
329 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
330   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
331     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
332     reproduce at home.
333   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
334   Thanks dcmtk crew !
335
336 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
337   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
338   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
339     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
340   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
341   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
342   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
343   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
344     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
345     from File:: to PixelConvert::.
346
347 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
348   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
349     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
350      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
351      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
352
353 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
354   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
355   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
356   like this:
357     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
358   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
359   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
360   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
361
362 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
363   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
364     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
365     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
366     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
367     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
368       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
369       (for the time being this is better than having them attach to
370        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
371     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
372       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
373     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
374       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
375       gdcmPixelConvert::
376
377 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
378   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
379   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
380     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
381       clean up of RLE related code. 
382   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
383     - src/gdcmRLE.cxx removed
384     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
385     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
386     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
387   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
388     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
389       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
390       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
391
392 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
393   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
394     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
395       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
396       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
397       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
398       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
399       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
400       offsets.
401   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
402     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
403         with the retired Parse7Fe0().
404     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
405     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
406
407 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
408   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
409     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
410     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
411     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
412   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
413     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
414       to return an unused length.
415
416 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
417   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
418     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
419     to use to do simple stuff.
420
421 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
422   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
423     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
424     copying of the file within different directory, configure header file to
425     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
426     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
427
428 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
429   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
430      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
431        with it's binary name).
432      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
433        the Website to be more complete.
434      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
435        doxygenated documentation.
436      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
437        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
438                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
439   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
440   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
441    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
442
443 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
444   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
445    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
446
447 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
448   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
449     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
450     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
451     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
452     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
453   * GDCMHOME clean up:
454     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
455       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
456       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
457   * Autotools clean up:
458     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
459     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
460
461 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
462   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
463   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
464   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
465
466 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
467   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
468     describing TODO entries and used it for new entries.
469   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
470     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
471     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
472   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
473     documentation itself, but the website) moved to html and
474     placed in directory Doc/Website:
475     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
476     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
477     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
478   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
479   * CMakeLists.txt changed accordingly.
480   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
481     DeveloppersPython.html
482   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
483
484 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
485   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
486     of gdcm Web site.
487
488 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
489   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
490     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
491     we can now delete[] it safely 
492   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
493     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
494   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
495
496 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
497   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
498     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
499     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
500     pointed content.
501
502 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
503   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
504   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
505
506 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
507   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
508     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
509     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
510     an example of usage.
511     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
512       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
513     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
514       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
515     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
516     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
517     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
518
519 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
520   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
521     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
522     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
523     in class 
524     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
525       and associated accessors. Doxygenation of the class.
526     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
527       accessors added.
528     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
529       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
530     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
531     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
532
533 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
534   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
535     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
536       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
537            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
538            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
539            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
540            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
541            the same group and element all share the same (group, element)
542            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
543            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
544            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
545            consider the following definition of a TagKey:
546            - let Group, Element be the string representation of the
547              group and element dicom tag members,
548            - let ItemNumber be the string representation of the integer
549              index of the considered item number of a sequence,
550            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
551            the form:
552               /ItemNumber#Group|Element
553            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
554            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
555               Group|Element<SeqTag>
556            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
557            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
558            string e.g.
559                0028|1201
560            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
561            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
562            string e.g.
563                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
564     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
565       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
566       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
567     - src/gdcmDocEntry.cxx:
568       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
569          Key member.
570       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
571     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
572     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
573       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
574       -- now has a new BaseTagKey member.
575       -- STYLE.
576   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
577     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
578     truly belongs.
579     This poses the problem with the semantics of the following lines
580        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
581        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
582        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
583     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
584     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
585     order to get things working the dicom dictionary was altered !
586     Please fix things urgently...
587   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
588     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
589     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
590     set to OW:
591       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
592       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
593       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
594   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
595     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
596   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
597
598 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
599   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
600
601 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
602   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
603     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
604   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
605   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
606
607 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
608   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
609     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
610   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
611     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
612   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
613     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
614   * TODO updated
615   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
616     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
617   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
618   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
619     exception_on_error parameter.
620     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
621     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
622     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
623
624 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
625   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
626   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
627     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
628   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
629   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
630   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
631     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
632   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
633
634 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
635   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
636     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
637
638 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
639   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
640        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
641  
642 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
643   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
644         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
645
646 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
647    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
648    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
649      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
650      is now in static in the gdcmDebug class
651    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
652    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
653
654 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
655    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
656      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
657    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
658      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
659      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
660      that displays position and size).
661    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
662      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
663      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
664      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
665      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
666      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
667      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
668         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
669      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
670      commiting changes).
671    * Test/CMakeLists.txt:
672       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
673       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
674         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
675         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
676    * TODO updated.
677
678 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
679    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
680      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
681      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
682      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
683      - removal of typedef duplication.
684      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
685      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
686    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
687       - printf polluting ctest removed.
688       - TAB removal for comminting
689    * Test:
690      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
691        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
692        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
693        this test creates them.
694        Note: we need to validate each reference image, but before that
695              I'd like to rename them with a more explicit name...
696      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
697    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
698      including each header needed).
699
700 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
701    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
702      test suite to the Example directory. Are concerned:
703      - PrintHeader.cxx
704      - TestDcm2Acr.cxx
705      - TestFindTags.cxx
706      - TestWrite.cxx was
707      - TestWriteSimple.cxx
708    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
709      image gdcmData/oldACR00001.ima
710
711 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
712    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
713      with removal from gdcmData):
714       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
715       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
716       - US.3405.1.dcm
717      Added the following because after last cvs update, they cause
718        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
719      to segfault:
720       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
721       - oldACR00001.ima
722    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
723      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
724      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
725      form of test...
726    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
727      we don't need to black list the following images anymore:
728       - 8BitsUncompressedColor.dcm
729       - OT-PAL-8-face.dcm
730       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
731    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
732      fixes and the beautified code ;-)
733      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
734      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
735      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
736            improve the test suite). The bug could be detected by using
737            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
738            or by using
739            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
740            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
741
742 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
743    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
744          - replace by uggly but working old code :-(
745    A lot of things should be OK again.
746    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
747    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
748    (twice, withing a fortnigh ...)      
749
750 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
751    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
752      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
753    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
754      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
755      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
756                    - OT-PAL-8-face.dcm
757                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
758    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
759      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
760      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
761      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
762      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
763      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
764      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
765      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
766      image.
767    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
768      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
769      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
770      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
771    
772 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
773   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
774   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
775                           (instead of infinite loop)
776   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
777
778 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
779    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
780
781 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
782    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
783            when SamplesPerPixel =3
784          - now Write is no longer confused by 
785           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
786          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
787                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
788    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
789            (in order to split the job that has not to be done 
790            for gdcmDicomDir)
791
792 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
793    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
794      loop on the same image until memory went out. 
795      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
796    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
797      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
798
799 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
800    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
801             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
802             is added a the end, when necessary.
803             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
804               now written correctly
805             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
806               (even for odd groups) 
807         Note : only Explicit Value Representation was checked.
808                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
809
810 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
811    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
812    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
813      coding style).
814
815 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
816    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
817      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
818    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
819
820 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
821    FIX : gdcmDocument.cxx
822       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
823         code 'beautyfication' :-(
824       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
825
826 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
827    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
828             : to allow user to create his own Sequences
829    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
830
831    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
832
833    - gdcmBinEntry
834      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
835   
836    - gdcmDocEntry
837      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
838      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
839   
840    - gdcmDocEntrySet
841      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
842      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
843      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
844      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
845      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
846      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
847                                             guint16 element,
848                                             std::string vr     = "unkn",
849                                             std::string fourth = "unkn",
850                                             std::string name   = "unkn"); 
851      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
852      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
853      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
854      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
855      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
856      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
857      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
858      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
859   
860    - gdcmDocument
861      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
862      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
863      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
864      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
865      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
866                                         FILE *_fp, FileType type);
867      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
868      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
869      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
870      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
871      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
872      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
873      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
874      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
875                                             guint16 element,
876                                             std::string vr     = "unkn",
877                                             std::string fourth = "unkn",
878                                             std::string name   = "unkn");
879      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
880      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
881      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
882      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
883                                                                                                                  
884         - gdcmElementSet
885           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
886           
887    - gdcmSeqEntry
888           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
889  
890    - gdcmSQItem
891      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
892      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
893      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
894      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
895
896    - gdcmValEntry
897          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
898                                   
899 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
900     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
901       The default constructor invoked by the line
902          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
903       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
904       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
905       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
906     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
907       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
908       Could anyone explain why ?
909     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
910       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
911       code related to gdcmBinEntry).
912
913 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
914     * In order to fix memory leaks:
915      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
916        some delete calls.
917      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
918      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
919        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
920        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
921        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
922      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
923      - src/gdcmDocument.cxx:
924        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
925           from dynamic stores.
926        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
927           was causing memory leaks.
928      - src/gdcmSQItem.cxx:
929        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
930           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
931        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
932           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
933           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
934           This avoids SegFaulting.
935      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
936     * Conclusion:
937      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
938        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
939        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
940      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
941        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
942      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
943        segfaults).
944     * Erroneous leading white fix:
945      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
946        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
947      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
948      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
949     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
950     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
951
952
953 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
954     * In order to fix writing of dicom files:
955      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
956      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
957      - src/gdcmDocument.cxx:
958        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
959        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
960        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
961           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
962           manner.
963        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
964           to only declared) and build on top of
965           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
966        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
967      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
968        for usage in destructor and treatement of promotion in
969        ::ReplaceOrCreateByNumber().
970      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
971       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
972     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
973       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
974       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
975       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
976
977 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
978     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
979       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
980       learned that:
981           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
982           soon as possible by globally disabling memory caching.
983           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
984           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
985       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
986       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
987       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
988     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
989       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
990       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
991       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
992         with 1.
993       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
994       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
995       understand why the list is empty...).
996     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
997     * Doc/License.txt added.
998
999 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1000     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
1001       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
1002         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
1003         the padding problem.
1004       - general clean up, simplification, and coding style.
1005       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
1006     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
1007
1008 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
1009    *  gdcmSeqEntry.cxx
1010            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
1011                 - fix the display of SQItem ordinal number
1012       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
1013                 - remove some useless never written private methods     
1014                 
1015 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
1016    * gdcmBinEntry.cxx 
1017       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
1018            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
1019               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
1020                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1021    * dcmDocument.cxx
1022       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1023               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1024            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1025       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1026    * gdcmFile.cxx
1027       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1028    * gdcmSQItem.h
1029       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1030             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1031             \warning : some pb remaining around this number
1032                                 will be solved asap
1033       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1034    * gdcmValEntry.cxx 
1035       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1036
1037 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1038     * Memory leak hunt with the following command:
1039       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1040                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1041       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1042       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1043       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1044           grep "MEMORY LEAK" src/*
1045       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1046       -----
1047           #include <string>
1048           int main() {
1049              std::string name;
1050              char * test = "babo";
1051              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1052                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1053              name.clear();   //// Doesn't help !
1054              return 0;
1055           }
1056       -----
1057           #include <string>
1058           #include <iostream>
1059           int main() {
1060              std::string line;
1061              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1062              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1063                                         //// of 1320 bytes in call to
1064                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1065             return 0;
1066           }
1067       -----
1068
1069
1070 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1071     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1072       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1073         and related, moved away to gdcmDocument.
1074       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1075         the corresponding protected accessors of inherited class
1076         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1077         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1078       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1079       - Clean up of undefined or unused methods.
1080     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1081       account the changes to gdcmHeader.h).
1082     * src/gdcmDocument.h:
1083       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1084         changes to gdcmHeader.h).
1085       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1086         (see changes to gdcmHeader.h).
1087       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1088       - Clean up of undefined or unused methods.
1089     * src/gdcmDocument.cxx:
1090       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1091       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1092       - some std::string properly set to VRKey
1093     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1094       references to gdcmDocument. 
1095     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1096     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1097       cvs repository gdcmData.
1098
1099 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1100     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1101     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1102       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1103     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1104     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1105       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1106     * src/gdcmDocument.cxx: 
1107       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1108         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1109       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1110         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1111         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1112         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1113         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1114               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1115               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1116     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1117     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1118       now taken into account.
1119     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1120       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1121     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1122       on posix.
1123     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1124       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1125     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1126
1127 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1128     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1129       gdcmGlob
1130     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1131     * src/gdcmUtil.h : export methods
1132
1133 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1134     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1135       to right behavior
1136     * Initial addition of automatic python testing
1137     * Initial addition of automatic image comparison
1138
1139 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1140     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1141       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1142
1143 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1144      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1145      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1146      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1147
1148 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1149      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1150        new concepts (and new classes) :
1151        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1152         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1153         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1154        a Sequence is composed of Items.
1155        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1156        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1157        (never taken into account)
1158        Our unability to add a new 'entry' in the header
1159        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1160        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1161        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1162        nothing is finished.
1163        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1164
1165 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1166      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1167      
1168 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1169      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1170        file prefix (SetFilePrefix)
1171
1172 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1173      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1174        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1175        baseline.
1176      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1177        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1178
1179 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1180      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1181        dicom image
1182
1183 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1184      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1185      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1186        between the developper and user version.
1187      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1188      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1189
1190 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1191      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1192        when using cmake.
1193
1194 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1195      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1196                src directory, now generated in the build dir.
1197             2. Tests as mentionned smarter
1198             3. Some clean up
1199             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1200           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1201           where we could set the institution name / patient name...
1202
1203        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1204               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1205                  (this was not true before)
1206
1207 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1208      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1209            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1210      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1211            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1212            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1213      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1214            tree-like structure of a Dicom Header.
1215      * FIX Test code cleaning     
1216            
1217 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1218      * ENH: Adding automatic testing
1219        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1220        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1221        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1222        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1223           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1224           too many projects
1225      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1226      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1227        one file instead of seven + some small cleanup
1228
1229 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1230      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1231      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1232            Header printing. Example given with :
1233            > PrintHeader fileName  2 new
1234           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1235            
1236 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1237      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1238          1. I have added some unsigned where needed
1239          2. Some function parameter not used -> (void)
1240          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1241          4. g++ don't like character '\' in comment
1242          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1243                     this really need to be fixed
1244          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1245          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1246                     this also really need to be fixed
1247          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1248                     remove compression file 
1249                     (as we only do decompression, right ?)     
1250      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1251
1252 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1253      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1254            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1255            defaulted to yspacing
1256            
1257 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1258      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1259      * ENH add parameters :
1260                bool  exception_on_error = false, 
1261                bool  enable_sequences   = false,
1262                bool  ignore_shadow      = false
1263            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1264      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1265            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1266               
1267 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1268      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1269      
1270 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1271      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1272      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1273              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1274              
1275 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1276      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1277          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1278
1279 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1280      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1281        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1282        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1283        in gdcmHeader.
1284      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1285        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1286        already does the job.
1287      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1288        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1289
1290 2004-03-30 Benoit Regrain
1291      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1292        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1293        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1294
1295 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1296      * ENH : Check on file type to be written moved
1297              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1298      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1299              when end-of-list is reached
1300            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1301
1302 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1303      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1304      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1305      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1306        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1307
1308 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1309      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1310        now contains all the gdcmGlobal related code.
1311      * minor coding style and doxygenation changes.
1312
1313 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1314      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1315        now contains all the Debug related code.
1316      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1317      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1318        CreateCleanString) removed.
1319      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1320      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1321      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1322      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1323        src/gdcmDirList.cxx)
1324
1325 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1326      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1327
1328 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1329      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1330            big endian made volumes
1331      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1332            end user to instanciate class gdcmParser
1333           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1334
1335 2004-03-22 Benoit Regrain
1336      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1337      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1338              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1339
1340 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1341      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1342            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1343            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1344            or build from the files held (recursively) in a Directory
1345            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1346            gdcmObject::SetBoundaries() added
1347
1348 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1349      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1350                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1351      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1352            DICOMDIR
1353      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1354            about the name
1355
1356 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1357      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1358                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1359
1360 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1361      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1362            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1363            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1364            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1365            to allow making gdcDicomDir object.
1366      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1367           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1368
1369 2004-02-11 Benoit Regrain
1370      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1371              when using from python
1372
1373 2004-02-10 Benoit Regrain
1374      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1375      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1376      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1377              directory parsing
1378
1379 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1380      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1381              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1382              - class gdcmMeta created
1383      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1384              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1385      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1386
1387 2004-02-05 Benoit Regrain
1388      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1389              header entries
1390      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1391      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1392
1393 2004-02-04 Benoit Regrain
1394      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1395      * FIX : sort the images in the dicom dir
1396      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1397      * ADD : a python demo
1398
1399 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1400      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1401      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1402              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1403              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1404              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1405      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1406            to make full checking easier
1407         
1408 2004-02-04 Benoit Regrain
1409      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1410      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1411
1412 2004-02-03 Benoit Regrain
1413      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1414      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1415      * Bug fix and print add-on
1416
1417 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1418      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1419      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1420      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1421      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1422            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1423         
1424 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1425      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1426              iterator on last
1427              of the last synonym :-(
1428      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1429              for DICOMDIR ;-)
1430      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1431      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1432      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1433            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1434       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1435
1436 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1437      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1438            no longer writes 'Un' on disk
1439      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1440      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1441            the length (for Palette expanded images)
1442            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1443      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1444            (that broke Write). Replaced by UL.
1445            Aware user will reload the field if he 
1446            thinks it's necesssary
1447              
1448 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1449      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1450        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1451        IsReadable() methods.
1452        
1453      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1454       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1455       but so usefull for people that miss them ;-)
1456       
1457      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1458        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1459
1460 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1461      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1462
1463 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1464      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1465              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1466         The TRUE value for this param has to be used 
1467         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1468         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1469      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1470              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1471         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1472         
1473      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1474              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1475              Fixed
1476
1477      * gdcmHeader add the method
1478              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1479         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1480         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1481         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1482
1483 2004-01-26 Benoit Regrain
1484      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1485        in the print and add a third level of print to print them
1486
1487 2004-01-23 Benoit Regrain
1488      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1489      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1490      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1491        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1492
1493 2004-01-22 Benoit Regrain
1494      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1495      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1496
1497 2004-01-19 Benoit Regrain
1498      * Add the use of shadow dictionaries
1499      * bug fix and coding style
1500
1501 2004-01-19 Benoit Regrain
1502      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1503      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1504      * Add the update of header entries using the shadow library
1505
1506 2004-01-19 Benoit Regrain
1507      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1508      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1509        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1510        of dicom dir parsing
1511      * bug fix under python
1512
1513 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1514     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1515     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1516     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1517     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1518
1519 2004-01-15 Benoit Regrain
1520      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1521        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1522        when the gdcmDictSet will be destroyed
1523      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1524        gdcmDictSet
1525
1526 2004-01-15 Benoit Regrain
1527      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1528        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1529        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1530        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1531      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1532
1533 2004-01-14 Benoit Regrain
1534      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1535      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1536      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1537      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1538
1539 2004-01-13 Benoit Regrain
1540      * src/*.[h|cxx] : coding style
1541      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1542
1543 2004-01-13 Benoit Regrain
1544      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1545      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1546        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1547      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1548
1549 2004-01-12 Benoit Regrain
1550      * src/*.h : add comments
1551      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1552      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1553        directly setted in the source code
1554      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1555        gdcmTS and gdcmVR
1556
1557 2004-01-09 Benoit Regrain
1558      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1559      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1560
1561 2004-01-07 Benoit Regrain
1562      * Modification to compile with the distutils.
1563      * Bug fix in code
1564
1565 2003-12-10 Benoit Regrain
1566      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1567        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1568      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1569        made in the source code
1570
1571 2003-12-10 Benoit Regrain
1572      * Update Windows projects and .cvsignore files
1573
1574 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1575      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1576            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1577            if he wants to.
1578            gdcmElValSet:Print takes it into account
1579
1580 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1581      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1582      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1583      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1584
1585 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1586       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1587              on the ListTag listElem member,
1588              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1589       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1590              with the tagHt member and the listElem member.
1591              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1592
1593       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1594              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1595                             if bug fixing is necessary), for internal
1596                             use only
1597              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1598                             or to allow Parser going on.
1599              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1600              with a length (not 0000) is found
1601       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1602                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1603                 (to be written)
1604
1605 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1606      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1607      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1608           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1609      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1610
1611 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1612      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1613
1614 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1615      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1616           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1617
1618 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1619      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1620      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1621              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1622              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1623
1624 2003-11-05 Benoit Regrain
1625      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1626                        : Explicit error messages
1627      * in __init__.py  : Related modif
1628
1629 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1630      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1631            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1632            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1633      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1634                     (vtkGdcmReader compliant)           
1635       
1636 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1637      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1638        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1639        
1640 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1641      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1642            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1643
1644 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1645      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1646                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1647              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1648              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1649              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1650              such an image :
1651              After gdcmHeader :
1652               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1653               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1654               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1655      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1656              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1657
1658 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1659      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1660              
1661 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1662      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1663            being coherents dicom files.
1664      
1665 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1666      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1667            from medcon lib !
1668      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1669      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1670      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1671      * ENH: Add include dir to medcon lib
1672      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1673            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1674             
1675 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1676       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1677         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1678           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1679       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1680
1681 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1682       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1683         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1684         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1685       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1686       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1687
1688 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1689       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1690                                                
1691 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1692       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1693       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1694       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1695       
1696 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1697       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1698       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1699       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1700       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1701       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1702       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1703              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1704         But it fasten debug compilation time.
1705             
1706 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1707       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1708         (they are compressed as 2 planes images, 
1709          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1710
1711 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1712       * Now CheckRead takes into account :
1713          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1714          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1715       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1716        (breaks DicomWorks)
1717
1718 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1719       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1720              one should remove the '\'
1721         
1722 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1723       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1724         (wrong lengths in header)
1725         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1726       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1727         (breaks DicomWorks)
1728
1729 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1730       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1731         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1732
1733 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1734       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1735       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1736
1737 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1738       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1739      
1740 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1741       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1742         (the patch is easy to remove)
1743       * cosmetic changes to avoid warnings
1744       
1745 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1746       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1747         no need to press 'r' now.
1748    
1749 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1750       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1751         to new Jpeg Lossless decompressor
1752       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1753       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1754       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1755                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1756 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1757       * general anonymisation in gdcmData
1758       * adding the 'color files' from
1759         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1760       * adding some well knowed bugged-header images
1761       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1762         waiting for their inclusion in Python testsuite
1763
1764 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1765     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1766       no longer seg faults when file is not found
1767
1768 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1769      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1770        MultiFrame images
1771
1772 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1773      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1774
1775 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1776      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1777         OpenFile takes it into account
1778      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1779      * Missing elements added in dicomV3.dic
1780       (just to be affraid : have a look at
1781        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1782        and do it again next year ;->
1783
1784 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1785      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1786        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1787        But there are NOT. It's fixed !
1788        
1789 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1790      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1791      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1792          
1793 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1794      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1795              an ACR-NEMA / DICOM one.
1796      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1797              is not gdcm Readable
1798      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1799              is now decoded.
1800         
1801 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1802      * FIX: CMake generate now documentation
1803      * ENH: out of source doc build !
1804      * ENH: Generate both user and dev documentation
1805      * ENH: Should work on windows too
1806      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1807      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1808      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1809      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1810                      
1811 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1812      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1813      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1814      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1815         window level & window width
1816
1817 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1818      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1819      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1820      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1821      
1822 2003-10-06  Emanuel Ollart
1823      * FIX : compilation process wad broken.
1824              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1825         
1826 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1827      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1828      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1829      
1830 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1831      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1832            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1833                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1834       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1835
1836 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1837       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1838         to remain compliant with already defined strings, 
1839         like Transfert Syntax UID and others)
1840
1841 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1842       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1843              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1844         
1845 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1846       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1847       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1848
1849 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1850       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1851         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1852               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1853       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1854
1855 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1856       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1857
1858 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1859       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1860         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1861
1862 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1863       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1864          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1865          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1866          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1867           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1868                                             YBR_RCT files.
1869           (no sample found :-(
1870
1871 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1872       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1873         Two reasons: - clear things
1874                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1875                        suffer anymore VC++ complains
1876
1877 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1878       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1879       * removed leaks
1880
1881 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1882       * The lines are now eigthy characters long.for 
1883         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1884
1885 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1886       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1887         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1888         previous commis of Malaterre)
1889       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1890         before the last Malaterre's commit.
1891
1892 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1893       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1894         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1895       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1896         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1897
1898 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1899       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1900         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1901         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1902
1903 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1904       * Cosmetic changes:
1905         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1906           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1907           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1908           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1909         - PACKAGER corrected
1910         - DEVELOPPER added.
1911         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1912       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1913
1914 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1915       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1916
1917 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1918       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1919
1920 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1921       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1922
1923 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1924       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1925
1926 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1927       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1928         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1929         heuristics to get informations (look at different places).
1930       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1931         sorting DICOM images based on different strategies.
1932       * modified Makefiles accordingly.
1933
1934 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1935       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1936         when building in debug mode
1937       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1938         src/win32/gdcmdll.dsp
1939       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1940
1941 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1942       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1943             to valgrind.
1944
1945 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1946       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1947       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1948                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1949       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1950
1951 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1952       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1953         the file
1954       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1955       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1956         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1957       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1958         symbols... future problem ?
1959
1960 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1961       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1962       * modified gdcm.dsw accordingly
1963
1964 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1965       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1966
1967 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1968       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1969         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1970       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1971         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1972         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1973
1974 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1975       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1976
1977 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1978       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1979       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1980       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1981       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1982       * PACKAGER : adding all concerning windows
1983
1984 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1985       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1986         garbage debug code.
1987       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1988       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1989         test suite reported error.
1990       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1991         packaging a new release).
1992       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1993       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1994       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1995         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1996         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1997
1998 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1999       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
2000       * src/gdcmHeader.h : formatting code
2001
2002 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2003       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
2004         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
2005         is made in an internal list to prevent this problem.
2006         Bug fix when output is empty.
2007         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
2008         correction.
2009       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
2010
2011 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2012       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
2013       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
2014         files. Added method to remove all files on the input
2015         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
2016         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
2017
2018 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2019       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
2020         when using make instal.
2021       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2022         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2023
2024 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2025       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2026       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2027
2028 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2029       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2030         linux and WINDOWS !
2031       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2032       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2033
2034 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2035       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2036         addon of the jpeg library)
2037       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2038       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2039       * INSTALL now points to web documentation
2040
2041 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2042       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2043         gdcmUtil.h anymore.
2044       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2045         clean target.
2046       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2047         - to allow compilation with gcc 3.x
2048           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2049           -- small fixes on exceptions.
2050           Note: linking not tested !
2051         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2052           building stage.
2053       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2054         dependent convertion).
2055
2056 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2057       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2058         Changelog):
2059         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2060         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2061           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2062         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2063
2064 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2065       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2066         compile
2067       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2068         (FileName -> Filename)
2069
2070 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2071       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2072         - UpdateProgress method should now be effective
2073         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2074           to volumes),
2075         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2076           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2077           accelerating things).
2078         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2079           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2080           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2081           in the stack (for the caller to notice the problem).
2082
2083 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2085
2086 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2087       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2088         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2089         under Windows... thanks Windows !)
2090
2091 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2092       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2093         debug stage).
2094       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2095
2096 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2097       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2098
2099 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2100       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2101         called with different flags than the default ones (with automake).
2102         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2103            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2104         and went for warning fixes:
2105         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2106           up from unused variables.
2107         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2108       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2109
2110 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2111       * gdcmPython/gdcm.i:
2112         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2113           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2114           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2115         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2116           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2117           exported to Python a as cvar.
2118       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2119         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2120         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2121         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2122         C++ static methods).
2123       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2124         with the above changes.
2125
2126 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2127       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2128
2129 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2130       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2131         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2132         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2133          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2134          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2135            a wrapper
2136          - Wrapper interface which wrap sources
2137         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2138         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2139       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2140         files for compilation
2141
2142 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2143       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2144         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2145         - vtk/Makefile.am now builds a library
2146         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2147           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2148           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2149           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2150           import library.
2151         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2152           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2153           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2154           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2155           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2156         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2157           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2158         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2159           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2160       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2161       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2162         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2163         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2164         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2165         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2166         collision of various stl members (principally cout...).
2167       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2168         file.
2169       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2170         comply with above changes)
2171
2172 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2173       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2174       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2175         vtk data structure (an image Flip was required).
2176       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2177       * cosmetic changes in documentation.
2178
2179 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2180       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2181         unexisting file is given as argument.
2182       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2183         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2184         containing those images is now available at
2185           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2186         with the name gdcmData.
2187         All the python scripts (including the package initialisation file
2188         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2189         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2190
2191 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2192       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2193         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2194         demo of the usage of this class.
2195         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2196         at configure (or autogen.sh) stage.
2197
2198 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2199       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2200         Notes on valgrind:
2201           - maximum info is obtained with a command of the form:
2202             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2203                      --show-reachable=yes PrintHeader
2204           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2205             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2206             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2207             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2208              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2209       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2210         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2211         Note: some images don't seem to work e.g.
2212             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2213       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2214         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2215         make gdcm more thread friendly.
2216
2217 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2218       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2219           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2220         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2221           gdcmHeader::_dicom_vr.
2222         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2223         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2224           VRHT*.
2225         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2226
2227 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2228       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2229         make install stage.
2230
2231 2003-04-9 JPR
2232       * UpdateGroupLength replaced by new one
2233
2234 2003-04-7 JPR
2235       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2236         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2237
2238 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2239       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2240       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2241       * src:
2242         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2243         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2244           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2245         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2246           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2247           carried the same semantics.
2248           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2249         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2250           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2251         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2252       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2253       * gdcmGetXSize added
2254       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2255       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2256
2257 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2258       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2259         (to avoid double call by end user).
2260       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2261         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2262
2263 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2264       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2265         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2266           the html.users end users oriented documentation and
2267           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2268           oriented documentation.
2269         - README changed accordingly
2270         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2271         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2272           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2273         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2274           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2275           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2276       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2277         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2278       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2279         ill-formed documentation sections.
2280       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2281
2282 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2283       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2284       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2285         un*ces with sh-utils test utility.
2286       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2287       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2288       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2289       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2290       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2291
2292 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2293       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2294       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2295
2296 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2297       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2298       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2299       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2300       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2301         compilation work.
2302       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2303       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2304
2305 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2306       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2307         hence the user doesn't need this explicit call.
2308         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2309           i.e. LoadElements() call removed.
2310       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2311         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2312       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2313         for adding user defined new tags.
2314         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2315         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2316           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2317
2318 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2319       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2320         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2321         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2322         with the autotools, included the python wrappers part.
2323       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2324
2325 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2326       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2327
2328 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2329       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2330         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2331         for usage).
2332       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2333         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2334         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2335       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2336         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2337
2338 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2339       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2340         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2341         value of GDCM_DICT_PATH.
2342       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2343
2344 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2345       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2346       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2347       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2348         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2349         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2350
2351 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2352       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2353         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2354         gdcmHeader.h
2355       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2356         (as opposed to gdcm.h)
2357       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2358       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2359         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2360       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2361
2362 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2363       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2364         bug.
2365
2366 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2367       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2368         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2369         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2370         of hidding away the python related distutils specific files
2371         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2372         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2373         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2374         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2375
2376 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2377       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2378       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2379         among the list of sources.
2380
2381 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2382       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2383       * modifications in MSVC projects
2384
2385 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2386       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2387         looks like we can move back to original usage of exception within
2388         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2389         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2390       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2391         README file for usage added.
2392       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2393         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2394         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2395         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2396       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2397       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2398         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2399           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2400           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2401           instance of class gdcmHeader.
2402         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2403           require no instances at all to be invocated.
2404         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2405           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2406           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2407       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2408         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2409       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2410         the above to be effective.
2411       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2412         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2413       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2414         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2415         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2416         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2417         (for python dectection).
2418       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2419         now avoids publishing the empty entries.
2420
2421 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2422       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2423         ExtraPath reused :-P
2424       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2425
2426 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2427       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2428       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2429       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2430         and links
2431
2432 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2433       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2434         method. Doxygenation.
2435       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2436
2437 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2438       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2439         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2440         when using "python setup.py install".
2441       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2442         reexports the working classes.
2443       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2444         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2445         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2446         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2447         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2448         subdir (see the README file). This problem probably due to
2449         an combination of g++ and dynamic loading.
2450       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2451
2452 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2453       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2454         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2455         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2456         again in a python subdir, but the package itself is now in
2457         python/gdcmPython.
2458       * setup.py was cleaned up:
2459         - pythonIncludePath removed
2460         - python setup.py bdist target is now functional.
2461       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2462         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2463         accordingly.
2464
2465 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2466       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2467       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2468         distutils installer is operational.
2469       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2470           shadow classes (from gdcm.py).
2471         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2472           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2473         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2474
2475 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2476       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2477         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2478         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2479         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2480         dictionary.
2481         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2482           are now in the "???" group.
2483         - python/gdcm.i changed accordingly,
2484         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2485           of the above new functionalities in Python.
2486
2487 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2488       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2489         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2490           were definitively removed.
2491         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2492       * src/gdcmElValSet.cxx:
2493         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2494         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2495         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2496         - Added GetElementByName(string).
2497       * src/gdcmHeader.cxx: added
2498         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2499         - GetPubElValRepByName(string)
2500         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2501         - GetShaElValRepByName(string)
2502         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2503         - GetShaElValRepByName(string)
2504         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2505         - GetElValRepByName(string)
2506         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2507         - GetElValRepByName(string)
2508       * Doc/requirements.txt added.
2509
2510 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2511       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2512       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2513         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2514         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2515         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2516       * python/testSuite.py changed accordingly.
2517
2518 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2519       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2520         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2521              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2522               cannot be exported. [...]
2523               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2524               be exported. [...]
2525               This is caused by a designed limitation that once a template
2526               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2527               exported."
2528         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2529         limitation" of VC++ is a pitfall.
2530         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2531         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2532         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2533         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2534         library.
2535         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2536       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2537          dll under windows !!!!)
2538       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2539       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2540         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2541       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2542         (one) of image(s).
2543       * removed glib references
2544       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2545
2546 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2547       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2548         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2549         the files of the testsuite without using unittest.
2550       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2551       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2552       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2553         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2554
2555 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2556       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2557         values, but limits itself to values which are below a user specified
2558         size (by default 1024 bytes).
2559       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2560         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2561         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2562         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2563       * python/testSuite.py
2564         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2565         - two new examples added.
2566       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2567
2568 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2569       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2570         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2571       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2572       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2573       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2574
2575 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2576       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2577         the vr was also RET.
2578       * python/testSuite.py more tests added.
2579
2580 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2581       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2582       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2583       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2584         7.18 Integer types (see stdint.h)
2585         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2586       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2587         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2588         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2589         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2590         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2591         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2592         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2593         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2594
2595 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2596       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2597         VR files.
2598       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2599
2600 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2601       * Adaptation for porting to VC++:
2602         - src/gdcm.h
2603           o forced to use std namespace (for string to be known)
2604           o all class use __declspec export style on WIN32
2605         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2606           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2607       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2608         variable GDCM_DICT_PATH.
2609       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2610
2611 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2612       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2613         to native Python dictionary.
2614       * python/demo/test.py:
2615         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2616         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2617       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2618         PubElVals hashing table.
2619       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2620
2621 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2622       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2623         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2624       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2625       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2626       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2627         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2628       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2629
2630 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2631       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2632         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2633         that we can import de shadow classes without errors].
2634
2635 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2636       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2637       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2638       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2639       * src/Makefile prepared for python wrapping
2640
2641 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2642       * src/gdcmHeader.cxx :
2643         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2644           (see gdcmHeader::LoadElements).
2645         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2646           ReadInt16 and ReadInt32)
2647
2648 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2649       * src/gdcmHeader.cxx :
2650         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2651           method.
2652         - SetLgrElem renamed to SetLength
2653         - GetLgrElem renamed to GetLength
2654         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2655       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2656       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2657         due to IdoDude was cleaned out.
2658
2659 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2660       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2661         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2662         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2663         returning the unecessary skL (skipped length).
2664         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2665         it was redundant with the File position internals (by using
2666         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2667         jajun.
2668       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2669         on the libido specificities which are handled through class
2670         inheritance.
2671       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2672         added.
2673
2674 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2675       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2676         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2677
2678 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2679       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2680
2681 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2682       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2683         and _IdDcmSWAP_LONG.
2684
2685 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2686       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2687         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2688