]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-02-05 Benoit Regrain
2      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
3        header entries
4
5 2004-02-04 Benoit Regrain
6      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
7      * FIX : sort the images in the dicom dir
8      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
9      * Add a python demo
10
11 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
12      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
13      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
14              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
15              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
16              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
17      * ENH  add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
18             to make full checking easier
19              
20 2004-02-04 Benoit Regrain
21      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
22      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
23
24 2004-02-03 Benoit Regrain
25      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
26      * gdcmDicomDir : add the load of directory
27      * Bug fix and print add-on
28
29 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
30      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
31      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
32      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
33      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
34            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
35         
36 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
37      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
38                   iterator on last
39              of the last synonym :-(
40      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
41                   for DICOMDIR ;-)
42      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
43      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
44      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
45            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
46            ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
47
48 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
49      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
50                        no longer writes 'Un' on disk
51      * FIX  SQ elements with actual length are now dealt with corectly
52      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
53                      the length (for Palette expanded omages) 
54                      and Raw Length (non expanded image + Palette)
55       * FIX  Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
56                      (that broke Write). Replaced by UL.
57                      Aware user will reload the field if he 
58                      thinks it's necesssary
59                        
60 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
61      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
62        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
63        IsReadable() methods.
64        
65      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
66       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
67       but so usefull for people that miss them ;-)
68       
69      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
70        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
71
72 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
73      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
74
75 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
76      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
77              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
78              The TRUE value for this param has to be used 
79              with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
80              ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
81      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
82              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
83              element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
84              
85      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
86              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
87              Fixed
88                      
89      * gdcmHeader add the method
90              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
91              to get *all* the Header Entries with the same tag.
92              GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
93              (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
94
95 2004-01-26 Benoit Regrain
96      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
97        in the print and add a third level of print to print them
98
99 2004-01-23 Benoit Regrain
100      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
101      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
102      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
103        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
104
105 2004-01-22 Benoit Regrain
106      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
107      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
108
109 2004-01-19 Benoit Regrain
110      * Add the use of shadow dictionaries
111      * bug fix and coding style
112
113 2004-01-19 Benoit Regrain
114      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
115      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
116      * Add the update of header entries using the shadow library
117
118 2004-01-19 Benoit Regrain
119     * removal of file gdcmHeader2.cxx
120     * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
121       inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
122       of dicom dir parsing
123     * bug fix under python
124
125 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
126     * removal of class gdcmHeaderEntrySet
127     * removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
128     * add file gdcmHeader2.cxx 
129     * add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
130
131 2004-01-15 Benoit Regrain
132      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
133        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
134        when the gdcmDictSet will be destroyed
135      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
136        gdcmDictSet
137
138 2004-01-15 Benoit Regrain
139      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
140        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
141        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
142        some memory and vtk seems to have some problems with that.
143      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
144
145 2004-01-14 Benoit Regrain
146      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
147      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
148      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
149      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
150
151 2004-01-13 Benoit Regrain
152      * src/*.[h|cxx] : coding style
153      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
154
155 2004-01-13 Benoit Regrain
156      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
157      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
158        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
159      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
160
161 2004-01-12 Benoit Regrain
162      * src/*.h : add comments
163      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
164      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
165        directly setted in the source code
166      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
167        gdcmTS and gdcmVR
168
169 2004-01-09 Benoit Regrain
170      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
171      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
172
173 2004-01-07 Benoit Regrain
174      * Modification to compile with the distutils.
175      * Bug fix in code
176
177 2003-12-10 Benoit Regrain
178      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
179        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
180      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
181        made in the source code
182
183 2003-12-10 Benoit Regrain
184      * Update Windows projects and .cvsignore files
185
186 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
187      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
188            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
189            if he wants to.
190            gdcmElValSet:Print takes it into account
191
192 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
193      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
194      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
195      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
196
197 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
198       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
199              on the ListTag listElem member,
200              not longer on the TagElValueHT tagHt member
201       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
202              with the tagHt member and the listElem member.
203              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
204
205       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
206              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
207                             if bug fixing is necessary), for internal
208                             use only
209              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
210                             or to allow Parser going on.
211              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
212              with a length (not 0000) is found
213       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
214                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
215                 (to be written)
216
217 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
218      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
219      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
220           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
221           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
222
223 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
224      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
225
226 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
227      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
228           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
229
230 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
231      * in testSuite.py : new files names for checking the package
232      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
233              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
234              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
235
236 2003-11-05 Benoit Regrain
237      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
238                        : Explicit error messages
239      * in __init__.py  : Related modif
240
241 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
242      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
243            to be used by aware (vtk) users that want to manage
244            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
245      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
246                     (vtkGdcmReader compliant)              
247            
248 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
249      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
250        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
251        
252 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
253      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
254            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
255            
256 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
257      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
258                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
259              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
260              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
261              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
262              such an image : 
263              After gdcmHeader :
264                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
265                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
266                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
267      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
268              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
269
270 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
271      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
272              
273 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
274      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
275            being coherents dicom files.
276      
277 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
278      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
279            from medcon lib !
280      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
281      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
282      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
283      *ENH: Add include dir to medcon lib
284      *FIX: only one function is being exported for now ! 
285            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
286             
287 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
288       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
289                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
290                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
291       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
292       
293 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
294       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
295  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
296                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
297        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
298        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
299            
300 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
301       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
302                                                
303 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
304       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
305       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
306       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
307       
308 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
309       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
310       * ENH: Try adding a search script for python site-package
311       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
312       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
313       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
314       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
315              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
316              But it fasten debug compilation time.
317             
318 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
319       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
320         (they are compressed as 2 planes images, 
321          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
322
323 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
324      * Now CheckRead takes into account :
325             the bugged 'Leonardo' Siemens images
326             the XA images, sent thru the burning VPRO station
327      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
328      (breaks DicomWorks)
329
330 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
331       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
332              one should remove the '\'
333              
334 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
335       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
336         (wrong lengths in header)
337         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
338       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
339         (breaks DicomWorks)
340
341 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
342       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
343         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
344
345 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
346       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
347       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
348
349 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
350       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
351      
352 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
353       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
354         (the patch is easy to remove)
355       * cosmetic changes to avoid warnings
356       
357 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
358       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
359         no need to press 'r' now.
360         
361 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
362       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
363         to new Jpeg Lossless decompressor
364        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
365        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
366        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
367                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
368 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
369       * general anonymisation in gdcmData
370       * adding the 'color files' from
371          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
372       * adding some well knowed bugged-header images
373       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
374          waiting for their inclusion in Python testsuite
375
376 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
377     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
378       no longer seg faults when file is not found
379
380 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
381      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
382
383 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
384      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
385
386 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
387      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
388         OpenFile takes it into account
389      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
390      * Missing elements added in dicomV3.dic
391       (just to be affraid : have a look at
392        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
393        and do it again next year ;->
394
395 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
396      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
397        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
398        But there are NOT. It's fixed !
399        
400 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
401      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
402      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
403          
404 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
405      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
406              an ACR-NEMA / DICOM one.
407      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
408              is not gdcm Readable
409      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
410              is now decoded.
411              
412 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
413      * FIX: CMake generate now documentation
414      * ENH: out of source doc build !
415      * ENH: Generate both user and dev documentation
416      * ENH: Should work on windows too
417      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
418      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
419      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
420      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
421                      
422 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
423      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
424      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
425      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
426         window level & window width
427
428 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
429      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
430      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
431      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
432      
433 2003-10-06  Emanuel Ollart
434      * FIX : compilation process wad broken.
435              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
436              
437 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
438      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
439      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
440      
441 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
442      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
443            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
444                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
445       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
446
447 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
448       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
449         to remain compliant with already defined strings, 
450         like Transfert Syntax UID and others)
451
452 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
453       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
454              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
455              
456 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
457       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
458       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
459
460 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
461       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
462         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
463               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
464       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
465
466 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
467       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
468
469 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
470       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
471         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
472
473 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
474       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
475          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
476          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
477          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
478           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
479           (no sample found :-(
480
481 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
482       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
483         Two reasons: - clear things
484                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
485                      suffer anymore VC++ complains
486 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
487       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
488       * removed leaks
489                      
490 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
491       * The lines are now eigthy characters long.for 
492         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
493
494 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
495       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
496         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
497         previous commis of Malaterre)
498       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
499         before the last Malaterre's commit.
500
501 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
502       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
503         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
504       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
505         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
506
507 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
508       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
509         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
510         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
511
512 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
513       * Cosmetic changes:
514         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
515           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
516           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
517           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
518         - PACKAGER corrected
519         - DEVELOPPER added.
520         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
521       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
522
523 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
524       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
525
526 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
527       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
528
529 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
530       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
531
532 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
533       * Fix a few delete/delete[] mismatch
534
535 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
536       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
537       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
538       heuristics to get informations (look at different places).
539       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
540       sorting DICOM images based on different strategies.
541       * modified Makefiles accordingly.
542
543 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
544       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
545         when building in debug mode
546       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
547         src/win32/gdcmdll.dsp
548       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
549
550 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
551       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
552
553 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
554       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
555       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
556       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
557
558 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
559       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
560         the file
561       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
562       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
563         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
564       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
565         symbols... future problem ?
566
567 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
568       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
569       * modified gdcm.dsw accordingly
570
571 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
572       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
573
574 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
575       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
576         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
577       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
578         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
579         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
580
581 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
582       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
583
584 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
585       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
586       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
587       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
588       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
589       * PACKAGER : adding all concerning windows
590
591 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
592       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
593         garbage debug code.
594       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
595       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
596         test suite reported error.
597       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
598         packaging a new release).
599       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
600       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
601       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
602         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
603         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
604
605 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
606       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
607       * src/gdcmHeader.h : formatting code
608
609 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
610       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
611         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
612         is made in an internal list to prevent this problem.
613         Bug fix when output is empty.
614         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
615         correction.
616       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
617
618 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
619       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
620       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
621         files. Added method to remove all files on the input
622         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
623         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
624
625 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
626       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
627         when using make instal.
628       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
629         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
630
631 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
632       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
633       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
634
635 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
636       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
637         linux and WINDOWS !
638       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
639       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
640
641 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
642       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
643         addon of the jpeg library)
644       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
645       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
646       * INSTALL now points to web documentation
647
648 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
649       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
650         gdcmUtil.h anymore.
651       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
652         clean target.
653       * src/gdcm*.[cxx|h] :
654         - to allow compilation with gcc 3.x
655           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
656           -- small fixes on exceptions.
657           Note: linking not tested !
658         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
659           building stage.
660       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
661         dependent convertion).
662
663 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
664       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
665         Changelog):
666         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
667         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
668           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
669         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
670
671 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
672       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
673         compile
674       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
675         (FileName -> Filename)
676
677 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
678       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
679         - UpdateProgress method should now be effective
680         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
681           to volumes),
682         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
683           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
684           accelerating things).
685         - when building a stack of images/volumes, files which are not
686           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
687           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
688           in the stack (for the caller to notice the problem).
689
690 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
692
693 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
694       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
695         between standard library (std) and vtk library (problems are found
696         under Windows... thanks Windows !)
697
698 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
699       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
700         debug stage).
701       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
702
703 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
704       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
705
706 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
707       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
708         called with different flags than the default ones (with automake).
709         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
710            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
711         and went for warning fixes:
712         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
713           up from unused variables.
714         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
715       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
716
717 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
718       * gdcmPython/gdcm.i:
719         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
720           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
721           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
722         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
723           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
724           exported to Python a as cvar.
725       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
726         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
727         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
728         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
729         C++ static methods).
730       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
731         with the above changes.
732
733 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
734       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
735
736 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
737       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
738         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
739         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
740          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
741          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
742            a wrapper
743          - Wrapper interface which wrap sources
744         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
745         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
746       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
747         files for compilation
748
749 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
750       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
751         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
752         - vtk/Makefile.am now builds a library
753         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
754           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
755           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
756           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
757           import library.
758         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
759           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
760           + vtk/vtkGdcmReader.so and
761           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
762           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
763         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
764           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
765         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
766           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
767       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
768       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
769         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
770         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
771         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
772         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
773         collision of various stl members (principally cout...).
774       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
775         file.
776       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
777         comply with above changes)
778
779 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
780       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
781       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
782         vtk data structure (an image Flip was required).
783       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
784       * cosmetic changes in documentation.
785
786 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
787       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
788         unexisting file is given as argument.
789       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
790         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
791         containing those images is now available at
792           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
793         with the name gdcmData.
794         All the python scripts (including the package initialisation file
795         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
796         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
797
798 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
799       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
800         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
801         demo of the usage of this class.
802         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
803         at configure (or autogen.sh) stage.
804
805 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
806       * More memory link related corrections and documentation fixes.
807         Notes on valgrind:
808           - maximum info is obtained with a command of the form:
809             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
810                    --show-reachable=yes PrintHeader
811           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
812             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
813             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
814             (in fact further invocation to the STL would recollect the
815              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
816       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
817         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
818         Note: some images don't seem to work e.g.
819             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
820       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
821         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
822         make gdcm more thread friendly.
823
824 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
825       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
826           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
827         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
828           gdcmHeader::_dicom_vr.
829         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
830         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
831           VRHT*.
832         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
833
834 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
835       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
836         make install stage.
837
838 2003-04-9 JPR
839       * UpdateGroupLength replaced by new one
840
841 2003-04-7 JPR
842       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
843         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
844
845 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
846       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
847       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
848       * src:
849         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
850         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
851           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
852         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
853           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
854           carried the same semantics.
855           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
856         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
857           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
858         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
859       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
860       * gdcmGetXSize added
861       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
862       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
863
864 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
865       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
866         (to avoid double call by end user).
867       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
868         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
869
870 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
871       * gdcm/Doc many doxygen changes:
872         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
873           the html.users end users oriented documentation and
874           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
875           oriented documentation.
876         - README changed accordingly
877         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
878         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
879           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
880         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
881           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
882           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
883       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
884         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
885       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
886         ill-formed documentation sections.
887       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
888
889 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
890       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
891       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
892         un*ces with sh-utils test utility.
893       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
894       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
895       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
896       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
897       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
898
899 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
900       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
901       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
902
903 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
904       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
905       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
906       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
907       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
908         compilation work.
909       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
910       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
911
912 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
913       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
914         hence the user doesn't need this explicit call.
915         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
916           i.e. LoadElements() call removed.
917       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
918         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
919       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
920         for adding user defined new tags.
921         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
922         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
923           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
924
925 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
926       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
927         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
928         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
929         with the autotools, included the python wrappers part.
930       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
931
932 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
933       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
934
935 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
936       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
937         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
938         for usage).
939       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
940         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
941         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
942       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
943         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
944
945 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
946       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
947         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
948         value of GDCM_DICT_PATH.
949       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
950
951 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
952       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
953       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
954       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
955         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
956         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
957
958 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
959       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
960         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
961         gdcmHeader.h
962       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
963         (as opposed to gdcm.h)
964       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
965       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
966         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
967       * autogen.sh removed history related references to crea package.
968
969 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
970       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
971         bug.
972
973 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
974       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
975         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
976         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
977         of hidding away the python related distutils specific files
978         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
979         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
980         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
981         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
982
983 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
984       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
985       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
986         among the list of sources.
987
988 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
989       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
990       * modifications in MSVC projects
991
992 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
993       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
994         looks like we can move back to original usage of exception within
995         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
996         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
997       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
998         README file for usage added.
999       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1000         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1001         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1002         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1003       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1004       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1005         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1006           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1007           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1008           instance of class gdcmHeader.
1009         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1010           require no instances at all to be invocated.
1011         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1012           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1013           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1014       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1015         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1016       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1017         the above to be effective.
1018       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1019         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1020       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1021         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1022         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1023         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1024         (for python dectection).
1025       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1026         now avoids publishing the empty entries.
1027
1028 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1029       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1030         ExtraPath reused :-P
1031       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1032
1033 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1034       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1035       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1036       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1037         and links
1038
1039 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1040       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1041         method. Doxygenation.
1042       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1043
1044 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1045       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1046         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1047         when using "python setup.py install".
1048       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1049         reexports the working classes.
1050       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1051         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1052         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1053         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1054         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1055         subdir (see the README file). This problem probably due to
1056         an combination of g++ and dynamic loading.
1057       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1058
1059 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1060       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1061         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1062         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1063         again in a python subdir, but the package itself is now in
1064         python/gdcmPython.
1065       * setup.py was cleaned up:
1066         - pythonIncludePath removed
1067         - python setup.py bdist target is now functional.
1068       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1069         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1070         accordingly.
1071
1072 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1073       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1074       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1075         distutils installer is operational.
1076       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1077           shadow classes (from gdcm.py).
1078         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1079           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1080         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1081
1082 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1083       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1084         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1085         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1086         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1087         dictionary.
1088         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1089           are now in the "???" group.
1090         - python/gdcm.i changed accordingly,
1091         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1092           of the above new functionalities in Python.
1093
1094 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1095       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1096         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1097           were definitively removed.
1098         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1099       * src/gdcmElValSet.cxx:
1100         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1101         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1102         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1103         - Added GetElementByName(string).
1104       * src/gdcmHeader.cxx: added
1105         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1106         - GetPubElValRepByName(string)
1107         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1108         - GetShaElValRepByName(string)
1109         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1110         - GetShaElValRepByName(string)
1111         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1112         - GetElValRepByName(string)
1113         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1114         - GetElValRepByName(string)
1115       * Doc/requirements.txt added.
1116
1117 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1118       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1119       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1120         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1121         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1122         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1123       * python/testSuite.py changed accordingly.
1124
1125 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1126       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1127         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1128              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1129               cannot be exported. [...]
1130               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1131               be exported. [...]
1132               This is caused by a designed limitation that once a template
1133               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1134               exported."
1135         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1136         limitation" of VC++ is a pitfall.
1137         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1138         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1139         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1140         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1141         library.
1142         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1143       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1144          dll under windows !!!!)
1145       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1146       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1147         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1148       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1149         (one) of image(s).
1150       * removed glib references
1151       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1152
1153 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1154       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1155         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1156         the files of the testsuite without using unittest.
1157       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1158       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1159       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1160         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1161
1162 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1163       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1164         values, but limits itself to values which are below a user specified
1165         size (by default 1024 bytes).
1166       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1167         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1168         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1169         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1170       * python/testSuite.py
1171         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1172         - two new examples added.
1173       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1174
1175 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1176       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1177         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1178       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1179       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1180       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1181
1182 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1183       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1184         the vr was also RET.
1185       * python/testSuite.py more tests added.
1186
1187 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1188       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1189       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1190       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1191         7.18 Integer types (see stdint.h)
1192         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1193       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1194         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1195         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1196         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1197         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1198         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1199         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1200         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1201
1202 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1203       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1204         VR files.
1205       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1206
1207 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1208       * Adaptation for porting to VC++:
1209         - src/gdcm.h
1210           o forced to use std namespace (for string to be known)
1211           o all class use __declspec export style on WIN32
1212         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1213           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1214       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1215         variable GDCM_DICT_PATH.
1216       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1217
1218 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1219       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1220         to native Python dictionary.
1221       * python/demo/test.py:
1222         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1223         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1224       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1225         PubElVals hashing table.
1226       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1227
1228 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1229       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1230         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1231       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1232       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1233       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1234         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1235       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1236
1237 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1238       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1239         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1240         that we can import de shadow classes without errors].
1241
1242 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1243       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1244       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1245       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1246       * src/Makefile prepared for python wrapping
1247
1248 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1249       * src/gdcmHeader.cxx :
1250         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1251           (see gdcmHeader::LoadElements).
1252         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1253           ReadInt16 and ReadInt32)
1254
1255 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1256       * src/gdcmHeader.cxx :
1257         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1258           method.
1259         - SetLgrElem renamed to SetLength
1260         - GetLgrElem renamed to GetLength
1261         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1262       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1263       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1264         due to IdoDude was cleaned out.
1265
1266 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1267       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1268         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1269         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1270         returning the unecessary skL (skipped length).
1271         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1272         it was redundant with the File position internals (by using
1273         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1274         jajun.
1275       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1276         on the libido specificities which are handled through class
1277         inheritance.
1278       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1279         added.
1280
1281 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1282       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1283         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1284
1285 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1286       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1287
1288 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1289       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1290         and _IdDcmSWAP_LONG.
1291
1292 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1293       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1294         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1295